YTHDC1, m6A ile modifiye edilmiş Rab27A'nın sitoplazmik ihracatını teşvik ederken, IGF2BP2 sitoplazmada Rab27A'yı stabilize ederek osteoklast farklılaşmasını artırır ve osteoporoza katkıda bulunur.
Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.
Araştırma makalesi
* These authors contributed equally
YTHDC1, m6A ile modifiye edilmiş Rab27A'nın sitoplazmik ihracatını teşvik ederken, IGF2BP2 sitoplazmada Rab27A'yı stabilize ederek osteoklast farklılaşmasını artırır ve osteoporoza katkıda bulunur.
Osteoporoz için yeni tedavilerin geliştirilmesi giderek daha fazla ilgi çekmiştir. Rab27A, osteoklast farklılaşma sırasında yukarı regülasyonla hareket eder ve N6-metiladenozin (m6A) modifikasyonu ortopedik hastalıklarda önemli bir epigenetik düzenleyici olarak ortaya çıkmıştır. Biyoinformatik analizler, Rab27A'nın birden fazla m6A modifikasyon noktası içerdiğini ve birkaç m6A ile ilişkili proteinle etkileşime girdiğini öngördü. Rab27A'nın osteoklast farklılaşma ve osteoporozdaki rolü, yumurtalıktomlu (OVX) fare modeli kullanılarak değerlendirilmek için knockdown deneyleri yapıldı. OVX farelerinde Rab27A tükenmesi osteoporozu azalttı ve kemik oluşum yüzdesini %14,73'ten %28,13'e (P < 0,05) yükseltti. Western blotting ve nicel PCR, Rab27A'nın knockdown'un, osteoklast belirteçleri TRAP, NFATc1 ve c-FOS olarak protein ve mRNA ekspresyonunu azalttığını, böylece makrofaj kolonisi uyarıcı faktör (M-CSF) ve nükleer faktör-κB ligandının (RANKL) reseptör aktivatörü tarafından indüklenen kemik iliği kaynaklı makrofajların (BMM) osteoklast farklılaşmasını bastırdığını gösterdi. TRAP boyama ayrıca M-CSF ve RANKL indüksiyonundan sonra Rab27A tükenmesinin TRAP aktivitesini %24,1'den %12,9'a (P < 0,01) anlamlı şekilde azalttığını gösterdi. RNA immünopresipitasyon testleri, Rab27A ile m6A okuyucu proteinleri YTHDC1 ve IGF2BP2 arasındaki etkileşimleri doğruladı. Nükleer ve sitoplazmik fraksiyonlaşma, YTHDC1'in m6A ile modifiye Rab27A'nın sitoplazmik ihracatını kolaylaştırdığını göstermiştir. Buna ek olarak, q-PCR ve western blot analizleri, YTHDC1 veya IGF2BP2 etkisinin Rab27A ekspresyonunu azalttığını ve TRAP, NFATc1 ve c-FOS ekspresyonunu azalttığını, böylece M-CSF ve RANKL tarafından indüklenen osteoklast farklılaşmasını bastırdığını gösterdi. Bu bulgular birlikte, YTHDC1 aracılı sitoplazmik ihracatın ve m6A ile modifiye Rab27A'nın IGF2BP2 aracılı stabilizasyonunun osteoklast farklılaşmasını teşvik ettiğini ve OVX fare modelinde kemik kaybına katkıda bulunduğunu göstermektedir.
Osteoporoz (OP), kemik mikromimarisinin bozulması ve kemik mineral yoğunluğunun azalmasıyla karakterize edilen yaygın bir iskelet rahatsızlığıdır ve bu da dünya çapında kırık riskini artırır 1,2,3. Osteoporotik kırıklar en sık ön kol, humerus, kalça ve omurgada görülür ve özellikle yaşlı yetişkinlerde yaygındır. Bu çatlaklar yaşam kalitesini önemli ölçüde düşürür ve hastalar, aileleri ve sağlık sistemleri üzerinde önemli fiziksel, psikolojik ve sosyoekonomik yükler yükleroluşturur 3. Sonuç olarak, osteoporozun önlenmesi, yönetimi ve tedavisi klinik ve halk sağlığı öncelikleri olarak kalmaktadır.
Osteoporoz için çeşitli tedavi stratejileri geliştirilmiştir ve genellikle iki kategoriye ayrılır: kemik oluşturan ajanlar ve anti-rezorpsiyontedavileri 4,5. Geleneksel anti-rezorpsiyon ilaçlar arasında bifosfonatlar, raloksifen ve stronsiyum ranelat bulunurken, yeni ajanlar denosumab, odanacatib ve saracatinib gibi maddelerdir. Kemik oluşturan tedaviler arasında paratiroid hormonu (PTH 1–84) bulunurken, MK-5442, AMG 785 ve BHQ 880 gibi birkaç ek aday da klinik geliştirme sürecindedir. 5. Bu tedaviler etkili olabilse de, birçoğu önemli yan etkiler, sınırlı uzun vadeli etkinlik veya uzun süreli kullanım kısıtlamalarıile ilişkilidir 4,6,7,8,9. Örneğin, aminobisfosfonatlar ve denosumabın uzun süreli uygulanması normal kemik remodelasyonunubozabilir 5. Bu nedenle, osteoporoz araştırmalarında daha güvenli ve etkili terapötik hedeflerin belirlenmesi önemli bir hedef olmaya devam etmektedir.
Rab proteinleri, hücre içi vezikül taşımacılığı ve hücre sinyalinin önemli düzenleyicileridir ve viral enfeksiyon, otofaji ve sitoskelet organizasyonu gibi çeşitli biyolojik süreçlerekatılırlar 10. Son yıllarda, Rab ailesi proteinlerinin kemik metabolizması ve osteoporozdaki rollerine giderek daha fazla dikkat çekilmiştir. Rab44'ün, nükleer faktör-κB ligandı (RANKL) ile işlenmiş makrofajların reseptör aktivatöründe hücre içi Ca2⁺ sinyalini modüle ederek ve aktive T hücreleri 1'in (NFATc1) nükleer faktörünü aktive ederek osteoklast farklılaşmasını düzenlediğibildirilmiştir. Osteoklastlar, makrofaj soyunun öncüllerinden türetilen çok çekirdekli hücrelerdir ve kemik rezorpsiyonu ile iskelethomeostazında temel roller oynarlar 12,13,14,15,16,17,18,19. Bu nedenle, osteoklast farklılaşmasını yöneten moleküler mekanizmaları anlamak, osteoporoz için yeni terapötik yaklaşımlar geliştirmek için kritik öneme sahiptir.
Rab27A, Rab GTPaz ailesinin önemli bir üyesidir ve sekretor ve bağışıklık hücrelerinde yaygın olarak eksprese edilir. Vezikül taşını, ekzositoz ve hücre içi sinyalgöndermede kritik roller oynar 20,21,22,23,24,25,26,27. Önceki çalışmalar, Rab27A'nın hava yolu iltihabı sırasında eozinofil degranülasyonunu düzenlediğini ve aktive makrofajlarda NADPH oksidaz aktivitesiyle ilişkili veziküler mobilizasyonu kontrol ettiğinigöstermiştir 20.23. Özellikle, biriken kanıtlar osteoklast farklılaşma sırasında Rab27A ifadesinin önemli ölçüde artırıldığını göstermektedir. Shimada-Sugawara ve ark., kemik iliği kaynaklı makrofajların (BMM) osteoklastlara ayrılması sırasında Rab27A ekspresyonunun arttığını bildirmiştir; bu da osteoklastogenezde potansiyel bir rol olduğunugöstermektedir 28. Bu bulgular toplamda, Rab27A'nın veziküler taşımayı ve hücre içi sinyal yollarını düzenleyerek osteoklast oluşumunu ve işlevinietkileyebileceğini göstermektedir 28,29.
N6-metiladenosin (m6A), ökaryotik haberci RNA'larda ve kodlamayan RNA'larda en çok bulunan iç RNA modifikasyonudur ve RNA metabolizması ile gen ifadesinin kritik bir düzenleyicisi olarak hizmet eder. Memelilerde tanımlanan ilk mRNA modifikasyonu olan m6A, RNA stabilitesi, ekleme, taşıma ve çeviri gibi birçok biyolojik süreçte rol oynamıştır. Wang ve ark. korunan dizi motiflerinde yaygın olarak görülen m6A modifikasyonlarının, YTH alan içeren proteinler tarafından tanındığını ve mRNA stabilitesi ilemetabolizmasının düzenlenmesine katkıda bulunduğunu göstermiştir 30. Ayrıca, m6A modifikasyonu genom kararlılığı, transkripsiyonel düzenleme, kromatin organizasyonu, kanser ilerlemesi ve bağışıklık yanıtları gibi çeşitli biyolojik fonksiyonlarda rol oynamıştır31. Son çalışmalar, kemik kaynaklı hastalıklar ve osteoporozda m6A sinyalizasyonununönemli rollerini de ortaya koymuştur 32.
M6A okuyucu proteinleri arasında YTHDC1, RNA işleme ve nükleer ihracatı düzenleyen nükleer okuyucu olarak çalışırken, insülin benzeri büyüme faktörü 2 mRNA bağlayıcı protein 2 (IGF2BP2) sitoplazmada m6A modifiye edilmiş transkriptleri stabilize eder. Chen ve ark. YTHDC1'in, m6A modifiye circNSUN2'nin nükleer ihracatını teşvik ettiğini, bunun ardından HMGA2 mRNA'yı stabilize etmek ve kolorektal kansermetastazını teşvik etmek için IGF2BP2 ile etkileşime girdiğini göstermiştir. Bu bulgular, YTHDC1 ve IGF2BP2 tarafından koordineli düzenlemenin m6A modifiye transkriptlerin kaderini kontrol eden genel bir mekanizmayı temsil edebileceğini göstermektedir.
Mevcut çalışma, Rab27A mRNA'daki tahmin edilen m6A modifikasyon bölgelerini incelemiş ve YTHDC1 ile IGF2BP2 ile etkileşimlerini incelemiştir. YTHDC1'in, m6A modifiye Rab27A transkriptlerinin nükleer ihracatını kolaylaştırdığı bulundu; IGF2BP2 ise sitoplazmada Rab27A ile etkileşime girerek stabilitesini artırdı. Bu düzenleyici mekanizma sayesinde Rab27A, osteoklastın farklılaşmasını teşvik etti ve osteoporozun ilerlemesine katkıda bulundu. Bulgular, osteoklast farklılaşmasında YTHDC1, IGF2BP2 ve Rab27A'yı içeren daha önce tanınmamış m6A'ya bağlı bir düzenleyici yol tanımlamaktadır. Bu sonuçlar, osteoporozun moleküler patogenezi hakkında yeni bilgiler sağlar ve Rab27A'nın m6A aracılı regülasyonunu hedefleyen yeni terapötik stratejilerin geliştirilmesini kolaylaştırabilir.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Tüm hayvan prosedürleri, Southwest Medical University Bağlı Hastanesi'nin Hayvan Koruma ve Kullanım Komitesi tarafından onaylandı (Onay No. 2024-Etik-042). Tüm deneyler, ARRIVE yönergeleri, Birleşik Krallık Hayvanlar (Bilimsel İşlemler) Yasası 1986 ve ilgili yönergeler, AB Direktifi 2010/63/EU ile Laboratuvar Hayvanlarının Bakımı ve Kullanımı için Ulusal Sağlık Enstitüleri Rehberi (NIH Yayın No. 8023, revize 1978) doğrultusunda gerçekleştirildi. Fareler deneysel gruplara rastgele atandı ve tahsis dizisi araştırmacıdan gizlendi. Histolojik değerlendirme, mikro-bilgisayarlı tomografi (mikro-BT) görüntü analizi ve istatistiksel analizler dahil olmak üzere tüm veri toplama ve analizler, grup dağılımı körlüğüne bağlı araştırmacılar tarafından gerçekleştirildi. Analizlerden hayvan veya örnek hariç tutulmadı. Bu protokolde kullanılan tüm reaktifler, ekipmanlar, yazılımlar ve diğer kaynaklar Materyaller Tablosu'nda listelenmiştir.
1. Yumurtalıktomi (OVX) modelinin inşası
8 haftalık yirmi dört dişi vahşi tip C57BL/6 faresi osteoporoz modeli oluşturmak için kullanıldı. 1 haftalık bir aklimatlaşma döneminden sonra, fareler rastgele olarak Sham veya OVX grubuna atandı. OVX modeli, daha önce tanımlandığı gibi çift taraflı ovariektomiile kuruldu 34,35. Sahte ameliyat edilen fareler, yumurtalıkları ameliyatla maruz bırakıldı ve alınmadı.
Intrafemoral gen teslimatı için, sh-Rab27A veya sh-NC ifade eden lentiviral vektörler, OVX ameliyatından 7 gün sonra enjekte edildi (daha önce bildirildiği gibi) 36,37. Kısa süreliğine, konsantre lentiviral partiküller (1 ×10 6 transdüksiyon birimi/mL) anestezi altında 22 gauge iğne kullanılarak patellar yol yoluyla femura enjekte edildi. Her fare 20 μL lentiviral süspansiyon aldı. Kesi daha sonra dikildi ve hayvanlar iyileşme boyunca izlendi.
Tüm hayvan deneyleri belirli patojensiz koşullar altında gerçekleştirildi. Femoral örnekler ameliyattan 8 hafta sonra alındı. Histolojik analizler ve RNA veya protein ekstraksiyonu için her grup başına en az altı fare kullanıldı.
2. Canlı mikro-BT görüntüleme
Trabeküler kemik morfolojisini değerlendirmek için mikro-bilgisayarlı tomografi (mikro-BT) gerçekleştirildi. Her farenin sağ tibiası, 14 haftalıkken OVX ameliyatından önce in vivo tarandı. Takip taramaları 22 haftaya kadar haftalık olarak yapıldı. Mikro-BT analizine her grup başına en az altı fare dahil edildi.
Fareler intraperitoneal sodyum pentobarbital (50 mg/kg vücut ağırlığı) ile anestezi edildi. Yeterli anestezi, parmak sıkıstırma refleksinin olmaması ve solunum hızının sürekli izlenmesiyle doğrulandı ve görüntüleme işlemi boyunca korundu. Tüm ötenazi prosedürleri, onaylanmış hayvan protokolü, kurumsal hayvan refahı yönergeleri ve laboratuvar hayvanı ötenazi ulusal düzenlemelerine uygun olarak gerçekleştirilmiştir.
24 haftalıkken, fareler derin anestezi sonrası servikal dislokasyon ile ötenazi edildi ve her iki tibiae aynı görüntüleme protokolü kullanılarak ex vivo tarama için alındı. Tarama parametreleri arasında 10,4 μm voxel boyutu, 55 kV voltaj, 145 μA akım, 32 mm görüş alanı, projeksiyon başına 1500/750 örnek ve 100 ms entegrasyon süresi bulunuyordu.
Görüntüler, 1200 mg HA/cm3 fantomla kalibre edilmiş üçüncü dereceden polinom ışın sertleştirme düzeltme algoritması kullanılarak işlendi. Kemik hacmi fraksiyonu (BV/TV), trabeküler kalınlık (Tb.Th) ve trabeküler sayı (Tb.N), büyüme plakasına 1,0 mm proksimal konumda bulunan distal femoral metafizde nicelendirildi.
3. Plazmid transfeksiyonu
sh-Rab27A ve sh-NC plazmidleri üretilip lentivirüs üretiminde kullanıldı. Lentiviral ambalaj plazmidleri ve shRNA yapıları, üreticinin talimatlarına göre HEK293T hücrelere birlikte transfekte edildi. Viral titrer, daha önce tanımlandığı gibi intrafemoral uygulamadan öncebelirlenmiştir 36. Üç bağımsız biyolojik kopya gerçekleştirildi.
4. Hematoksilin ve eozin (HE) boyama
Femoral örnekler %4 paraformaldehit ile 24 saat sabitlenmiş, %10 EDTA ile 4 hafta kalsifiye edilmiş, %30 sukroz/PBS ile kriyokorumalı hale getirilmiş, parafine gömülü ve 5 μm kalınlıkta kesitlenmiştir. Doku kesitleri hematoksilin ve eosin ile boyanmış ve ışık mikroskobu ile incelenmiştir. Her grup için en az altı fare analiz edildi.
5. Tartrat dirençli asit fosfataz (TRAP) boyama
Femoral kesitlerin TRAP boyaması üreticinin talimatlarınagöre yapıldı 38. Kemik iliği kaynaklı makrofajlarda (BMM) TRAP aktivitesi, bir TRAP boyama testi kullanılarak değerlendirildi. Olgun osteoklastlar, en az üç çekirdek içeren TRAP pozitif çok çekirdekli hücreler olarak tanımlandı. Her biri üç teknik kopya içeren üç bağımsız biyolojik kopya gerçekleştirildi.
6. q-PCR
Toplam RNA, üreticinin talimatlarına göre TRIzol reaktifi kullanılarak izole edildi. Tamamlayıcı DNA, ters transkriptaz kullanılarak sentezlendi ve SYBR Green kimyası kullanılarak nicel gerçek zamanlı PCR'ye tabi tutuldu. Her biri üç teknik kopya içeren üç bağımsız biyolojik kopya gerçekleştirildi.
Giriş dizileri şu şekildeydi:
Rab27A: F, TTCCTGCTTCTCTTTCGACCT; R, GGCAGCACTGGTTTCAAAAT
TUZAK: F, TGTTGACAGGGTCCTCCATCTA; R, CCTCCTTCTTAACCCGAAGC
NFATc1: F, GGTGCTGTCTGGCCATAACT; R, GCGGAAAGGTGGTATCTCAA
C-FOS: F, TACTACCATTCCCCAGCCAGCCGA; R, GCTGTCACCGTGGGGATAAA
YTHDC1: F, GAAGTGGAAGCTCTGCATCAG; R, TTGATCTTTTCGGACAGCACG
IGF2BP2: F, GACTACCCCGACCAGAACTG; R, GAGGCGGGATGTTCCGAATC
β-aktin: F, GGGAAATCGTGCGTGACATTAAG; R, TGTGTTGGCGTACAGGTCTTTG
7. Western blotting
Hücreler veya dokular, proteaz inhibitörleriyle desteklenen RIPA tamponu kullanılarak liz edildi. Protein konsantrasyonları Bradford testi kullanılarak belirlendi. Eşit miktarda protein (20 μg) SDS-PAGE ile ayrılarak poliviniliden florür (PVDF) veya nitroselüloz membranlarına aktarıldı. Zarlar, oda sıcaklığında %5 yağsız sütle 1 saat boyunca bloklandı ve TRAP, NFATc1, c-FOS, Rab27A, YTHDC1, IGF2BP2 veya β-aktine karşı birincil antikorlarla 4 °C'de gece boyunca kuluçka altına alındı. Yıkamadan sonra, zarlar uygun ikincil antikorlarla oda sıcaklığında 1 saat kuluçka edildi. Protein bantları standart tespit prosedürleriyle görselleştirildi. Üç bağımsız biyolojik kopya gerçekleştirildi.
8. Hücre kültürü
Kemik iliği kaynaklı makrofajlar (BMM) daha önce tanımlandığı gibi izoleedildi 39. Fare uyluk kemiğinden alınan kemik iliği hücreleri, %10 fetal sığır serumu, 30 ng/mL makrofaj koloni uyarıcı faktör (M-CSF) ve %1 penisillin/streptomisin ile desteklenen minimum α minimum ortamda, %5 CO₂ içeren nemli atmosferde 37 °C'de gece boyunca kültürlendi. Yapışmayan hücreler, 30 ng/mL M-CSF IÇEREN STROMAL HÜCRESIZ BIR SISTEMDE TOPLANARAK KÜLTÜRLENDI. 3 gün sonra, yapışkan hücreler BMM olarak toplandı ve osteoklast farklılaşmasını sağlamak için 30 ng/mL M-CSF ve 50 ng/mL nükleer faktör-κB ligandı (RANKL) reseptör aktivatörü varlıklarında 72 saat boyunca kültürlendi.
9. RNA girişimi (RNAi)
Küçük interferens eden RNA'lar (siRNA'lar), üreticinin talimatlarına göre lipid bazlı transfeksiyon reaktifi kullanılarak sentezlenip transfekte edildi. Hücreler, transfeksiyondan önce altı kuyu plakalarında 2 ×10-4 hücre yoğunluğunda tohumlanmıştır. Üç bağımsız biyolojik kopya gerçekleştirildi.
Hedef dizileri şu şekildeydi:
si-Rab27A: GGACUUAAUCAUCTAAGAGAAUGGAA
si-YTHDC1: GCAAGGAGUGUGUUAUCUUAATT
si-IGF2BP2: CCGUUAACCAACAAGCCAATT
10. İmmünoflüoresans
Hücreler 20 dakika boyunca %4 paraformaldehit ile sabitlendi ve %0,1 Triton X-100 ile 10 dakika geçirimlileştirildi. %5 sığır serum albümini ile 30 dakika blok edildikten sonra, hücreler 4 °C'de gece boyunca primer antikorlarla inkübe edildi.
Yıkamadan sonra, florofor ile konjuge edilmiş ikincil antikorlar oda sıcaklığında 30 dakika uygulandı. Çekirdekler DAPI ile karşı boyanmış ve görüntüler konfokal mikroskopi kullanılarak alınmıştır. Üç bağımsız biyolojik kopya gerçekleştirildi.
11. Nükleer ve sitoplazmik ayrım
Nükleer ve sitoplazmik fraksiyonlar, üreticinin talimatlarına göre izole edildi. Hücreler 10 dakika boyunca buzda lizlendi ve 4 °C'de 3 dakika boyunca 500 × g sıcaklıkta santrifüjlendi. Sitoplazmik bileşenleri içeren süpernatant toplanırken, çekirdekleri içeren pelet ayrı ayrı yıkanıp işlenirdi.
12. RNA bağlayan protein immünopresipitasyonu (RIP)
RNA immünopresipitasyon (RIP) testleri üreticinin talimatlarına göre gerçekleştirildi. Kısa bir süreliğine, hücreler 30 dakika boyunca buzda lizizlendi. Santrifüjlemeden sonra, süpernatanlar gece boyunca antikorlar ve Protein A/G agaroz boncuklarıyla kuluçka edildi. Yıkamadan sonra, imimönüm presipitli proteinler western blotting ile analiz edildi ve ko-immünopresipitli RNA ise nicel gerçek zamanlı PCR ile analiz edildi. Üç bağımsız biyolojik kopya gerçekleştirildi.
13. Rab27A mRNA stabilite testi
Toplam RNA, devre IGF2BP2 ardından belirtilen zaman noktalarında çıkarıldı. Daha sonra ters transkripsiyon ve nicel gerçek zamanlı PCR yapıldı. Rab27A mRNA seviyeleri 0 saatte karşılık gelen si-NC grubuna normalleştirildi. Üç bağımsız biyolojik kopya gerçekleştirildi.
14. İstatistiksel analiz
Tüm deneyler en az üç biyolojik kopya kullanılarak bağımsız olarak gerçekleştirildi. Q-PCR, RNA girişimi, TRAP boyama, western blotting ve diğer hücre tabanlı testler için, her biyolojik replikasyon aksi belirtilmedikçe üç teknik kopya içeriyordu. Veriler, ortalama ± standart sapma (SD) olarak sunulur.
İstatistiksel analizler GraphPad Prism sürüm 9.0 ve SPSS yazılımı kullanılarak gerçekleştirildi. İki grup arasındaki karşılaştırmalar, iki kuyruklu Öğrenci t-testi kullanılarak yapıldı. Birden fazla grup arasındaki karşılaştırmalar, iki yönlü varyans analizi (ANOVA) kullanılarak analiz edildi ve ardından Tukey'nin çoklu karşılaştırma sonrası testi çoklu karşılaştırmaları ayarlamak için yapıldı. P değeri < 0.05 istatistiksel olarak anlamlı olarak kabul edildi.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Rab27A'nın etkisi osteoporozu in vivo azalttı.
Rab27A'nın osteoporozdaki rolünü araştırmak için, daha önce bildirilen yöntemler34,40 kullanılarak kurulan bir ovariektomize (OVX) fare modelinde Rab27A knockdown gerçekleştirildi. Genel çalışma tasarımı Şekil 1'de özetlenmiştir. Mikro-bilgisayarlı tomografi analizi, OVX farelerinde kemik mineral yoğu...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Osteoklast farklılaşması, kemik remodelasyonu, kemik rezorpsiyonu, kırık onarımı ve iskelet homeostazında temel roller oynar(12˒15˒17˒18˒42˒43). Aşırı osteoklast aktivitesi osteoporozun önemli bir nedenidir ve osteoklast farklılaşmasını kontrol eden düzenleyici yolların belirlenmesini önemli bir araştırma hedefi haline getirir. Osteoklast fonksiy...
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
Yazarlar, rekabet eden finansal çıkarlar veya çıkar çatışmaları belirtmemektedir.
Bu çalışma, Pengzhou Halk Hastanesi ile Güneybatı Tıp Üniversitesi arasında Lian Tang'a sağlanan Bilimsel ve Teknolojik Stratejik İşbirliği Projesi (Hibe No. 2023PZXNYD01) tarafından maddi olarak desteklendi.
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.
| Ad | Şirket | Katalog numarası | Yorumlar |
|---|---|---|---|
| 4% Paraformaldehyde | Thermo Fisher Scientific | A5818101 | Tissue and cell fixation |
| Alexa Fluor 488 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-11001 | Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534069 |
| Alexa Fluor 546 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-11035 | Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534093 |
| Bovine serum albumin (BSA) | Merck | A2153 | Blocking reagent |
| Bradford Protein Assay | Merck | B6916 | Protein quantification |
| C57BL/6JSlac mice | Shanghai SLAC Laboratory Animal Co., Ltd. | — | Female, 8 weeks old; RRID: MGI:2159769 |
| c-FOS antibody | Abcam | ab222699 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2891049 |
| Confocal laser scanning microscope (SP8) | Leica Microsystems | SP8 | Immunofluorescence image acquisition; RRID: SCR_018169 |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | Nuclear counterstain for immunofluorescence; RRID: AB_2307445 |
| EDTA | Merck | V900081-500G | Tissue decalcification reagent |
| Eosin | Solarbio | G1100 | Histological cytoplasmic stain |
| Fetal bovine serum (FBS) | Thermo Fisher Scientific | A5669701 | Cell culture supplement |
| GraphPad Prism | GraphPad Software | Version 9.0 | Statistical analysis software; RRID: SCR_002798 |
| Hematoxylin | Cell Signaling Technology | #14166 | Histological nuclear stain |
| IBM SPSS Statistics | IBM | Windows version | Statistical analysis software; RRID: SCR_016479 |
| IGF2BP2 antibody | Proteintech | 11601-1-AP | Primary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_2122672 |
| Inverted light microscope (DMi8) | Leica Microsystems | DMi8 | Histological image acquisition; RRID: SCR_026672 |
| Lentiviral titer quantification kit | Takara Bio | 631235 | Lentiviral titer determination |
| Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 | Plasmid transfection reagent |
| Lipofectamine RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | 13778150 | siRNA transfection reagent |
| M-CSF | MedChemExpress | HY-P7085 | Osteoclast differentiation factor |
| Micro-computed tomography system | Scanco Medical | VivaCT80 | Bone morphometric analysis |
| M-MLV Reverse Transcriptase | Promega | M1701 | cDNA synthesis |
| NFATc1 antibody | Santa Cruz Biotechnology | sc-7294 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2152503 |
| PARIS Kit | Thermo Fisher Scientific | AM1556 | Nuclear and cytoplasmic fractionation |
| Penicillin/Streptomycin | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | Antibiotic supplement for cell culture |
| Power SYBR Green Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4367659 | Quantitative real-time PCR |
| Protease inhibitor cocktail | Thermo Fisher Scientific | 78429 | Prevention of protein degradation |
| Protein A/G agarose beads | Merck | IP05 | Immunoprecipitation |
| PVDF membrane | Thermo Fisher Scientific | 88520 | Protein transfer membrane for western blotting |
| Rab27A antibody | Abcam | ab55667 | Primary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_945112 |
| RANKL | MedChemExpress | HY-P7425 | Osteoclast differentiation factor |
| Real-time PCR system | Applied Biosystems | ABI7900HT | Quantitative real-time PCR instrument |
| RIPA buffer | Thermo Fisher Scientific | 78501 | Protein extraction buffer |
| RNA Immunoprecipitation (RIP) Kit | Millipore | RIP-12RXN | RNA immunoprecipitation assay |
| SDS-PAGE reagents | Thermo Fisher Scientific | BT041210BOX | Protein electrophoresis |
| shRNA plasmids | RiboBio | — | Gene silencing by RNA interference |
| Small interfering RNAs (siRNAs) | GenePharma | — | Gene silencing by RNA interference |
| SRAMP | Online resource | — | Prediction of m6A modification sites; RRID: SCR_024500 |
| StarBase (ENCORI) | Online resource | — | RNA interaction prediction database; RRID: SCR_016303 |
| TRAP antibody | Abcam | ab2391 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_303034 |
| TRAP staining kit | Merck | 387A | Detection of osteoclast activity |
| Triton X-100 | Thermo Fisher Scientific | 85111 | Cell permeabilization reagent |
| TRIzol Reagent | Thermo Fisher Scientific | 15596026CN | Total RNA isolation |
| YTHDC1 antibody | Abcam | ab122340 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_11128253 |
| α-MEM | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 139-15651 | Cell culture medium |
| β-Actin antibody | Merck | A5441 | Loading control for western blotting; RRID: AB_476744 |
Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.