T hücreleri, patojenlere ve tümörlere karşı koruyucu bağışıklık yanıtları için vazgeçilmezdir. Naif T hücreleri, uzun vadeli hayatta kalmalarını ve kalıcılıklarını korumak için aktif olarak durgun bir durumda tutulurlar1. Antijen stimülasyonu üzerine T hücreleri durgunluktan çıkar, klonal ekspansiyona ve efektör farklılaşmaya uğrarlar2. T hücresi reseptörü (TCR) sinyalleri, adaptif bağışıklık yanıtlarının başlatılması ve düzenlenmesi için temel süreç olarak hizmet eder3. Antijen sunan hücrelerin (APC'lerin) yüzeyinde sunulan peptid-majör histokompatibilite kompleksi (pMHC) moleküllerinin spesifik olarak tanınmasıyla birlikte, bir sinyalizasyon olayları kaskadı tetiklenir ve böylece T hücrelerinin klonal ekspansiyonu ve fonksiyonel farklılaşması sağlanır4,5,6.
Antijen afinitesi, aviditesi ve konsantrasyonu gibi temel faktörler tarafından belirlenen TCR stimülasyonunun yoğunluğu; T hücresi aktivasyonunun büyüklüğünün, efektör fonksiyonların kazanılmasının ve farklı efektör veya bellek T hücresi alt kümelerine doğru farklılaşma yörüngesinin yönetilmesinde kritik bir rol oynar7,8,9. TCR bağımlı T hücresi aktivasyonunu incelemek için kullanılan mevcut in vitro modeller, ağırlıklı olarak hem TCR ligasyonunu hem de ko-stimülatör sinyalleri eş zamanlı olarak sağlayan plaka bağlantılı veya boncuk konjuge anti-CD3 ve anti-CD28 antikorlarını kullanmaktadır10,11. Bu sistemler yaygın olarak kullanılsa da, genellikle yalnızca tek bir ve çoğunlukla doyurucu anti-CD3 antikoru konsantrasyonu kullanırlar; bu durum, titre edilmiş bir stimülasyon gradyanı ile ulaşılabilir olan TCR sinyal güçlerinin dinamik aralığını yakalamak yerine, yalnızca T hücresi aktivasyonunun hep ya da hiç şeklinde ikili bir karşılaştırmasına izin verir12,13.
Burada açıklanan protokol, titrasyonlu anti-CD3 gradyanları (0.1–10 µg/mL) ve sabit anti-CD28 (1 µg/mL) kullanarak, dereceli TCR sinyal güçlerinin primer fare CD8+ T hücrelerinin aktivasyonunu, proliferasyonunu ve fonksiyonel fenotiplerini nasıl modüle ettiğini sistematik olarak değerlendirmek için standardize edilmiş ve tekrarlanabilir bir in vitro sistem sunmaktadır. Bu yaklaşım, 6 ila 48 saatlik bir zaman seyri boyunca hem mTORC1 (mechanistic target of rapamycin complex 1) aktivitesinin bir okuması olarak hücre içi fosforile S6 ribozomal protein (p-S6) aracılığıyla gerçekleşen yukarı akış sinyalleşmesini hem de CTV dilüsyonu ile izlenen proliferasyon, aktivasyon yüzey belirteçleri (CD69, CD25, indüklenebilir T-hücresi kostimülatörü [ICOS], programlanmış hücre ölümü proteini 1 [PD-1]) ve efektör molekül ekspresyonu (Granzyme B, tümör nekroz faktör-alfa [TNF-α]) dahil olmak üzere aşağı akış hücre sonuçlarını yakalayan çok parametreli akış sitometrisine odaklanmaktadır.
Protokolümüz, stimülasyon yoğunluğunu hassas bir şekilde modüle etmek için plakka bağlanmış anti-CD3 antikorlarının gradyan konsantrasyonunu kullanarak, böylece fizyolojik koşullar altında gözlemlenen farklı TCR bağlanma aviditesini taklit eder. Bu yöntem, TCR çapraz bağlanmasında yüksek verimlilik ve primer dinlenme halindeki T hücrelerinin güçlü aktivasyonunu sağlar. Standartlaştırılmış kaplama prosedürü, plak yüzeyinde üniform antikor dağılımı sağlayarak aynı partideki hücreler arasında tutarlı bir stimülasyona ve mükemmel deneysel tekrarlanabilirliğe yol açar. Bu format, T hücresi aktivasyonu için maliyet etkin ve operasyonel olarak basit bir yaklaşım sunar.
Ancak, bu yaklaşımın belirli kısıtlamaları kabul edilmelidir. Anti-CD3/CD28 antikorları aracılığıyla yapılan stimülasyon, in vivo fizyolojik bağlamdan belirgin şekilde farklıdır. T hücresi aktivasyonunu değerlendirmek için yalnızca agonistik anti-CD3 ve anti-CD28 antikorlarını kullanan deneysel yöntemler, aktivasyonun etkili okumalarını sağlayabilse de, antijen sunan hücreler ile T hücreleri arasındaki etkileşimleri ve fizyolojik koşullar altında meydana gelen ko-stimülatör mikroçevreyi tam olarak yeniden canlandırmakta yetersiz kalırlar14.
Bu sınırlamalara rağmen, bu protokol, TCR sinyal gücüne bağlı T hücresi yanıtlarını incelemek için değerli ve erişilebilir bir araç görevi gören sistematik ve tekrarlanabilir bir platform sunmakta olup daha karmaşık antijenle özgü modelleri tamamlayabilmektedir.