Etik beyan:
Tüm katılımcılar deneyimizin amacı hakkında tam olarak bilgilendirilmiş ve bilgilendirilmiş onam formunu imzalamıştır. Bu araştırma, Fujian Tıp Üniversitesi Longyan Birinci Bağlı Hastanesi etik kurulu tarafından onaylanmıştır (Onay numarası LYREC2023-k007-01). Tüm prosedürler ilgili kılavuzlara, düzenlemelere ve Helsinki Deklarasyonu'na uygun olarak gerçekleştirilmiştir.
Katılımcı Alımı, Uygunluk Kriterleri ve Örnek Toplama
Ocak 2023 ile Mayıs 2025 tarihleri arasında, Fujian Tıp Üniversitesi Longyan Birinci Bağlı Hastanesi'nin kulak burun boğaz polikliniğinden AR tanısı konmuş toplam 211 birey ve 180 sağlıklı katılımcı (AR olmayan) alınmıştır. AR tanı kriterleri, Çin Alerji Derneği'nin Alerjik Rinit Tanı ve Tedavi Kılavuzları'ndan17 benimsenmiştir. Hastaların burun kaşıntısı, hapşırma, burun tıkanıklığı veya burun akıntısı dahil olmak üzere en az iki klinik AR semptomu göstermesi şart koşulmuştur. Ek olarak, burun mukoza muayenesinde solukluk ve ödem görülmesi ve Deri Prick Testi (SPT) sonucunun veya serum IgE testi sonucunun pozitif olması gerekmiştir. Doğruluğu ve tutarlı sonuçları garanti etmek amacıyla SPT, poliklinik alerjen test odasında uzman personel tarafından gerçekleştirilmiştir. Tüm AR hastaları, tıbbi personelin yardımıyla Rino konjonktivit Yaşam Kalitesi Anketi (RQLQ) ve Toplam Nazal Semptom Skoru (TNSS) değerlendirmelerine tabi tutulmuş ve skorlar sonraki analizler için kaydedilmiştir.
Hastanede rutin fiziksel muayeneden geçen sağlıklı gönüllüler, AR olmayan grup olarak çalışmaya dahil edilmiştir. Uygun katılımcıların kişisel veya ailesel AR öyküsü, astım veya diğer alerjik hastalık öyküsü, kronik sinüzit veya burun boşluğunun diğer inflamatuar hastalıkları bulunmamaktaydı ve önceki ay içerisinde herhangi bir solunum yolu enfeksiyonu geçirmemişlerdi. Ayrıca, ciddi kardiyak, hepatik, pulmoner veya renal hastalık öyküsü olanlar ya da herhangi bir malign tümörü bulunan bireyler çalışma dışı bırakılmıştır.
İki gönüllü grubundan periferik venöz kan örnekleri toplandı. Antikoagüle edilmiş venöz kanın bir kısmı DNA ekstraksiyonu ve plazma RNA ekstraksiyonu için kullanıldı. Venöz kanın diğer bir kısmı, serumla ilişkili faktörlerin (immünoglobulin E (IgE), interlökin-4 (IL-4), IL-6 ve IL-10) tespiti için kullanılmak üzere serum elde etmek amacıyla ayrıştırıldı.
DNA Ekstraksiyonu:
Tam kan genomik DNA ekstraksiyon kiti kullanılarak 200 µL periferik venöz kan örneklerinden DNA ekstraksiyonu yapılmıştır (Materyaller Tablosu'na bakınız). Kan örnekleri lityum heparin antikoagülan tüplere toplanmış, ardından alikotlanarak saklama için -20 °C'de dondurulmuştur. Spesifik uygulama prosedürleri, kitin talimatlarına kesinlikle uyulmalıdır. Son olarak, DNA'yı elüye etmek için 100 µL elüsyon tamponu kullanılmıştır. Ekstrake edilen DNA örneğinin saflığı, nükleik asit/protein analizörü (Spektrofotometre) ile belirlenmiştir (OD₂₆₀/OD₂₈₀ oranı 1,8 ile 2,0 arasındaydı). Tespit sonrası DNA örnekleri, sonraki genotipleme deneylerinde kullanılmak üzere -20 °C'de saklanmıştır.
Genotip Belirleme
miR-146a rs2910164 genotiplerinin dağılımını belirlemek için TaqMan SNP genotiplendirme kiti kullanılmıştır. Kit bilgileri sarf malzemeleri listesine eklenmiştir. Toplam PCR reaksiyon hacmi; 5 µL Master Mix, 0,5 µL tipleme probu primer karışımı, 10 ng kalıp DNA ve RNase-free su içeren 10 µL olarak belirlenmiştir. DNA amplifikasyonu, Roche LightCycler 480 II gerçek zamanlı floresan kantitatif PCR cihazı ile gerçekleştirilmiştir. Reaksiyon koşulları: 95 °C'de 10 dk ön-denatürasyon; 40 döngü (95 °C'de 15 saniye, 60 °C'de 1 dk) ve FAM/VIC floresansı 60 °C'de okunmuştur. Amplifikasyon tamamlandıktan sonra, toplanan FAM/VIC çift floresan sinyalleri LightCycler 480 Yazılımı kullanılarak analiz edilmiş ve genotip verileri istatistiksel olarak işlenmiştir. Tek bir FAM sinyali homozigot bir genotipi, tek bir VIC sinyali diğer homozigot genotipi ve her iki sinyalin varlığı ise heterozigot bir genotipi temsil eder. Anormal sinyallere sahip olan veya tekrarlandığında tutarsız sonuçlar veren örnekler yeniden test edilecektir. Her deney, kalite kontrol amacıyla hem kalıp içermeyen kontrol hem de pozitif kontrol ile yürütülmüştür. Tüm örnekler üç teknik tekrara tabi tutulmuştur.
RT-qPCR
Toplam plazma miRNA ekstraksiyonu, özel bir miRNA ekstraksiyon kiti kullanılarak 100 µL plazmadan gerçekleştirilmiştir. Kit bilgileri sarf malzemeleri listesine girilmiştir. RNA konsantrasyonu bir spektrofotometre kullanılarak belirlenmiştir. Ekstraksiyonu yapılmış kaliteli miRNA örneklerinin OD₂₆₀/OD₂₈₀ oranı 1,8 ile 2,0 arasında değişmiştir. cDNA sentezlemek için ters transkripsiyonda 200 ng RNA kullanılmış ve reaksiyon prosedürü kitin standart talimatlarına uygun olarak yürütülmüştür. Ters transkripsiyon, 42 °C'de 60 dk inkübasyon ve 85 °C'de 5 dk inaktivasyon dahil olmak üzere toplam 20 µL hacimde gerçekleştirilmiştir. qPCR reaksiyonu, toplam 20 µL hacimle belirlenmiş protokole uygun olarak hazırlanmıştır. Reaksiyon karışımı şu şekilde düzenlenmiştir: 10 µL qPCR pre-mix, 0,4 µL ileri primer, 0,4 µL ters primer, 1 µL cDNA kalıbı ve 8,2 µL RNaz-free su. miR-146a ve dahili referans gen U6 için spesifik primerler kullanılmıştır. Amplifikasyon, Roche LightCycler 480 II gerçek zamanlı floresan kantitatif PCR cihazı kullanılarak tamamlanmıştır. qPCR termal döngü koşulları şu şekildeydi: 30 s boyunca 95 °C'de ön-denatürasyon, ardından 40 döngü boyunca 5 s 95 °C'de denatürasyon ve 30 s 60 °C'de bağlanma ve uzama. Tüm örnekler üç teknik tekrara tabi tutulmuştur. Deneysel veriler LightCycler 480 Yazılımı kullanılarak analiz edilmiştir. Örnekler arası varyasyonu düzeltmek için dahili referans olarak U6 kullanılarak, önce ΔCt (miR-146a Ct değeri - U6 Ct değeri) hesaplanmış, ardından ΔΔCt (deney grubunun ΔCt değeri - kontrol grubunun ΔCt değeri) hesaplanmış ve son olarak miR-146a'nınle göreceli ekspresyon seviyesi 2⁻ΔΔCt ile elde edilmiştir.
ELISA
IgE, IL-4, IL-6 ve IL-10 serum düzeyleri ELISA kitleri ile tespit edildi. Deneysel prosedürler için kullanım kılavuzuna başvuruldu. Spesifik adımlar şu şekildedir: İlk olarak, konsantre yıkama solüsyonu seyreltildi ve standart eğrisi için çalışma solüsyonlarını hazırlamak amacıyla standartlar gradyanlı olarak seyreltildi. İkinci olarak, kuyucuklara 50 µL dilüent, standart solüsyon ve test edilecek örnek eklendi ve 37 °C'de 60 dk inkübe edildi. İnkübasyon sonrası kuyucuklar, yıkama tamponu ile üç kez yıkandı. Ardından, 50 µL enzim-konjuge antikor çalışma solüsyonu eklendi ve plaklar 37 °C'de 30 dk inkübe edildi. İnkübasyon tamamlandıktan sonra sıvı atıldı ve kuyucuklar tekrar yıkandı; ardından kromojenik solüsyon eklendi ve karanlıkta 37 °C'de 15 dk inkübe edildi. Durdurma solüsyonu eklendikten sonra, bir mikroplaka okuyucu kullanılarak 450 nm'de absorbans ölçüldü. Örnek konsantrasyonları standart eğrisine göre hesaplandı. Her örnek üç kez test edildi. Varyasyon katsayısı %10'dan küçük olan veriler geçerli kabul edildi. Kalite kontrol için deney sırasında boş kuyucuklar ve kontrol kuyucukları oluşturuldu. Kitin tespit aralığı ve hassasiyeti, üretici kılavuzunda belirtilen yönetmeliklere uygundu.
Veri istatistikleri
Deneysel veriler SPSS ve GraphPad Prism 9 yazılımları kullanılarak analiz edilmiştir. Veriler ortalama ± standart sapma (ortalama ± SD) olarak sunulmuştur. Sürekli değişkenlerin normalliğini değerlendirmek için Shapiro-Wilk testi, varyans homojenliğini değerlendirmek için ise Levene testi uygulanmıştır. İki grup arasındaki sürekli değişkenlerin karşılaştırması bağımsız örneklem t-testi kullanılarak analiz edilmiştir. Çoklu grup karşılaştırmaları için tek yönlü ANOVA ve ardından Tukey post-hoc testi uygulanmış, iki bağımsız faktörün ana etkilerini ve etkileşim etkilerini değerlendirmek için ise iki yönlü ANOVA uygulanmıştır. Aykırı değerler, 3 standart sapma kuralına göre belirlenmiş ve hariç tutulmuştur. Bu çalışmada eksik veri tespit edilmemiştir. miR-146a'nın AR için tanısal etkinliğini analiz etmek amacıyla alıcı işletim karakteristik (ROC) eğrisi kullanılmıştır. İlgili ROC parametreleri ve %95 güven aralıkları, yerleşik istatistiksel algoritmalar kullanılarak hesaplanmıştır. miR-146a ekspresyonu ile serumla ilişkili faktörlerin seviyeleri arasındaki doğrusal korelasyonu ölçmek için Pearson korelasyon analizi kullanılmıştır. AR için risk faktörlerini taramak amacıyla tek değişkenli ve çok değişkenli lojistik regresyon analizleri yapılmıştır. Tek değişkenli analizde p < 0.05 olan değişkenler, çok değişkenli lojistik regresyon modeline dahil edilmiştir. p < 0.05 değeri istatistiksel olarak anlamlı kabul edilmiştir.