Araştırma makalesi

Diyabetik nefropatide mitokondriyal araştırmaların bibliyometrik ve görselleştirilmiş analizi

DOI:

10.3791/72274

⸱

11 Ağustos 2026

 ,  ,  , 
1Third Affiliated Hospital, Beijing University of Chinese Medicine, 2Dongzhimen Hospital, Beijing University of Chinese Medicine

* These authors contributed equally

Bu makalede

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu bibliyometrik analiz, diyabetik nefropatide (DN) mitokondriyal araştırmaların manzarasını tanımlar ve önemli tematik değişiklikleri ile ortaya çıkan konuları özetler.

Özet

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu bibliyometrik çalışma, 2016'dan 2025'e kadar DN'de mitokondriyal araştırmaların küresel manzarasını sistematik olarak haritalamaktadır. Çalışma başlığı ve arama odaklarıyla tutarlılığı korumak için DN birincil terim olarak kullanılırken, diyabetik böbrek hastalığı (DKD) yalnızca arama terimleri, tarama kriterleri veya orijinal yazar anahtar kelimeleri tanımlanırken tutulur. Web of Science Core Collection (WoSCC) içindeki Science Citation Index Expanded (SCI-EXPANDED) ve Social Sciences Citation Index (SSCI)'den toplamda 1.342 yayın alındı ve CiteSpace, VOSviewer ile Scimago Graphica kullanılarak analiz edildi. Yıllık yayın üretimi 2016'da 63'ten 2025'te 239'a neredeyse dört kat arttı ve veri seti düzeyinde atıf görünürlüğü de arttı. Çin yayın hacminde lider olurken, Avustralya ve Amerika Birleşik Devletleri makale başına ortalama atıf oranlarının daha yüksek olduğunu gösterdi; bu da çıktı ile atıf temelli görünürlük arasında bir ayrışma olduğunu gösteriyor. Central South Üniversitesi, gösterilen kurumlar arasında kurumsal çıktı ve toplam atıf açısından birinci sırada yer aldı, ancak işbirliği bağlantıları Shanghai Jiao Tong Üniversitesi ve Zhejiang Üniversitesi'nden daha düşüktü. Anahtar kelime ve referans analizleri, yüksek glukozla indüklenen oksidatif stres ve apoptozdan mitofagi, ferroptoz, mitokondriyal dinamik, mitokondri ilişkili endoplazmik retikulum membranları (MAM) ve NLRP3 inflammazomuna zamansal bir genişleme gösterdi. SGLT2 inhibitörleri, MitoQ, kalori kısıtlama, Mendel randomizasyonu ve metabolomikler dahil olmak üzere müdahale ile ilgili ve metodolojiyle ilgili konular da belirlendi. Genel olarak, DN'de mitokondriyal araştırmalar mitokondriyal kalite kontrolü, düzenlenmiş hücre ölümü, çoklu omik yaklaşımlar ve müdahaleyle ilgili konulara genişlemiştir. Bu bibliyometrik kalıplar, doğrudan mekanik veya klinik kanıt değil, konu belirginliğini ve kaynak görünürlüğünü gösterir ve daha fazla doğrulama gerektiren yönleri belirlemeye yardımcı olabilir.

Giriş

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

DN, diyabetin en şiddetli mikrovasküler komplikasyonlarından biridir ve dünya genelinde son evre böbrek hastalığının başlıcanedenlerinden biridir 1,2. Glikoz kontrolü, kan basıncı yönetimi ve renin-anjiyotensin sistem blokadasında önemli ilerlemelere rağmen, DN görülmesi artmaya devam etmekte ve hastaların önemli bir kısmı geri dönüşü olmayan böbrekyetmezliğine devam etmekte 3. Bu karşılanmamış klinik ihtiyac, yeni patofizyolojik mekanizmalar ve terapötik hedefler için yoğun bir arayışa yol açmıştır. Mitokondriler, hücresel enerji metabolizması, redoks homeostazı ve apoptozun merkezi merkezi olarak hizmet verir ve DN 4,5 patogenezinde kritik düğümler olarak ortaya çıkmıştır. Son yirmi yıldaki çalışmalar, hiperglisemi kaynaklı mitokondriyal disfonksiyonun doğrudan podosit hasarı, tübüler epitel hücre hasarı, mezangial genişleme ve interstisialfibroz'a katkıda bulunduğunu ortaya koymuştur 6,7. Bu işlev bozukluğu, aşırı reaktif oksijen türleri üretimi, oksidatif fosforilasyonun bozulması, mitokondriyal parçalanma, kusurlu mitofaji ve düzensiz mitokondriyalbiyogenezle karakterize edilir 8,9. Sonuç olarak, SIRT3, PGC1α, Drp1, PINK1, Parkin ve NLRP3 inflammazomunu içeren mitokondri ile ilgili sinyal yolları temel araştırmaodakları haline gelmiştir 10,11. Son zamanlarda, ferroptoz, MAM'ler ve mitokondriyal metabolik yeniden programlama gibi ortaya çıkan kavramlar, DN12,13,14'ün mekanik dünyasını daha da genişletmiştir. DN'de mitokondriyal araştırmalar üzerine yayınların hacmi önemli ölçüde artmış ve zengin ama giderek daha karmaşık ve parçalanmış bir bilgi birikimi oluşturmuştur.

Literatürün hızla yayılması göz önüne alındığında, geleneksel anlatı incelemeleri, bu alanın gelişen entelektüel manzarasını, işbirlikçi ağlarını ve gelişmekte olan sınırlarını sistematik olarak yakalamak için yetersizdir15. Bibliyometrik analiz, nicel ve görselleştirmeye dayalı bir yaklaşım olup, bilimsel çıktıları haritalandırmak, etkili makaleleri, yazarları, kurumları ve ülkeleri belirlemek ve araştırma konularının zaman içindeki dinamiklerini tespit etmek için nesnel bir yöntemsunar (16,17,18,19,20). Diyabetik nefropati, DKD, mitokondri ile ilgili böbrek araştırmaları veya oksidatif stresle ilgili konuları inceleyen çeşitli bibliyometrikçalışmalar 21,22,23,24 olmuştur. Buna rağmen, DN'deki mitokondriyal araştırmaların güncellenmiş ve konu odaklı bibliyometrik sentezi, bu özel alandaki son araştırma faaliyetlerini, iş birliği kalıplarını, tematik evrimi ve ortaya çıkan konuları netleştirmeye yardımcı olabilir. Bu çalışmada, ilgili tüm yayınlar 2016'dan 2025'e kadar olan dönemi kapsayan SCI-EXPANDED ve SSCI WoSCC'den alınmıştır. CiteSpace, VOSviewer ve Scimago Graphica sistematik bir bibliyometrik ve görselleştirme analizi yapmak için kullanıldı. Bu çalışma, mevcut araştırma ortamını tanımlar ve mitofagi, ferroptoz, mitokondriyal dinamikler ve müdahale ile ilgili araştırmalar gibi başlıca konuların evrimini özetlerek, böylece daha fazla deneysel ve klinik doğrulamayı gerektiren yönleri belirlemek için bibliyometrik bir temel sağlar.

Protokol

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Veri toplama ve arama stratejisi

Tüm bibliyometrik kayıtlar, 30 Nisan 2026'da WoSCC içindeki SCI-EXPANDED ve SSCI'den alınmıştır. SCI-EXPANDED, biyomedikal ve yaşam bilimleri literatürü yakalamak için kullanıldı, SSCI ise potansiyel olarak ilgili disiplinlerarası kayıtları içermek üzere tutuldu. Arama stratejisi, Tıbbi Konu Başlıkları (MeSH) veritabanına referans olarak oluşturuldu. "Diyabetik nefropatiler" ve "Mitokondriler" MeSH'de ayrı ayrı aranmış ve ilgili MeSH terimleri, giriş terimleri ve ilgili alt başlıklar anahtar kelime seçimi ve eşanlamlı genişletme için incelenmiştir. Web of Science doğrudan MeSH indekslemesini kullanmadığı için, MeSH'den türetilen terimler konu alanı arama terimlerine çevrilmiştir. Son arama aşağıdaki Boolean ifadesi kullanılarak yapıldı: TS=(("diyabetik nefropati" VEYA "diyabetik nefropati" VEYA "diyabetik böbrek hastalığı" YA da "diyabetik böbrek hastalıkları" YA da "diyabetik böbrek" VEYA "diyabetik böbrek") VE (mitokondri* VEYA mitokondriyel* YA da mitofaji VEYA "mitokondriyal disfonksiyon" VEYA "mitokondriyal dinamik" YA da "mitokondriyal fisyon" YA da "mitokondriyal füzyon" YA da "mitokondriyal biyogenez" YA da "mitokondriyal kalite kontrolü")). Belge türleri yalnızca makaleler ve inceleme makaleleriyle sınırlıydı ve yayın süresi 1 Ocak 2016'dan 31 Aralık 2025'e kadar belirlendi. Bu dönem, arama sırasında mevcut olan en son tam 10 yıllık aralık olduğu için seçildi; bu da analizin DN'de mitokondriyal araştırmalardaki güncel gelişmelere odaklanmasını sağlarken, eksik 2026 yayın yılından kaynaklanabilecek olası önyargılardan kaçınmasını sağladı.

Tüm kayıtlar, "Tam Kayıt ve Atıflanan Kaynaklar" seçeneği seçilerek düz metin formatında dışa aktarıldı. Keywords Plus üzerinden alınabilecek alakasız kayıtların dahil edilmesini azaltmak için, alınan tüm kayıtların başlıkları, özetleri ve yazar anahtar kelimeleri manuel olarak tarandı. Yalnızca DN veya DKD'de mitokondriyal araştırmalarla ilgili esasen ilgili kayıtlar tutuldu. DN veya DKD yalnızca birkaç diyabetik komplikasyondan biri olarak veya arka plan bilgisi olarak bahsedilmişse, böbrekle ilgili sonuçlar, böbrek hücresi modelleri, böbrek dokusu kanıtı, nefropatiye özgü mekanizmalar veya DKD'ye birincil odaklanma olmadan yayınlar hariç tutuluyordu. Önceden tanımlanmış dahil etme ve dışlama kriterlerine göre tekrarlanan eleme ve manuel taramadan sonra, nihai analizde 1.342 uygun yayın dahil edilmiştir.

Analitik araçlar ve haritalama iş akışı

Temel istatistiksel analizler ve geleneksel grafikler, örneğin çubuk grafikler, çizgi grafikler, pasta grafikleri ve baloncuk grafikleri WPS Excel 2023 ve GraphPad Prism 10.1 kullanılarak oluşturuldu. Yıllık yayın çıktısı yayın yılına göre özetlendi. Veri seti düzeyinde yıllık Times Cited sayıları, WoSCC atıf raporundan alınmış ve her takvim yılında dahil edilen 1.342 kayıt tarafından alınan atıflar olarak tanımlanmıştır; aynı yıl için yıllık yayın kohortlarına veya alan genelinde yıllık atıf toplamlarına değil. Ülke/bölge düzeyindeki analizler için, makale başına ortalama atıf sayısı her ülke/bölge için yayın sayısına bölünerek hesaplandı. Bu metrik, alınan veri setinde atıf görünürlüğünün düzeltilmemiş tanımlayıcı bir göstergesi olarak yorumlandı. Ulusal araştırma kalitesinin veya akademik etkinin doğrudan bir ölçütü olarak kabul edilmedi; çünkü atıf sayıları yayın yılı, atıf süresi, dergi platformu, makale türü, çalışma tasarımı ve alana özgü atıf uygulamalarından etkilenebilir.

Bilgi haritalama, VOSviewer 1.6.19, CiteSpace 6.4.R1 ve Scimago Graphica 1.0.25 kullanılarak gerçekleştirildi. Literatür arama, bibliyometrik analiz, görselleştirme ve dergi metrik bulgusu için kullanılan veritabanları, yazılımlar ve çevrimiçi kaynaklar Materyaller Tablosu'nda listelenmiştir. Ağ analizleri tam sayım yöntemiyle gerçekleştirildi. WoSCC düz metin dosyaları, ülke/bölge, kurum ve yazar seviyelerinde ortak yazarlık ağları ile anahtar kelime ortak sıkıntı ve dergi ortak kaynak ağları oluşturmak için VOSviewer'a aktarıldı. Coğrafi görselleştirme için, VOSviewer'da oluşturulan ülke/bölge ortak yazarlık ağı bir Grafik Modelleme Dili (GML) dosyası olarak dışa aktarılıyor ve Scimago Graphica'ya aktarılıyor; burada bir coğrafi düzen ve arka plan olarak dünya haritası uygulanıyordu. Bu haritada, düğüm boyutu yayın hacmini, bağlantı kalınlığı ise iş birliği yoğunluğunu gösteriyordu. Aynı WoSCC veri seti, anahtar kelime-zaman çizelgesi kümeleme, referans ortak kaynak kümeleme ve atıf patlaması tespiti için CiteSpace'e aktarıldı; böylece alanın zamansal evrimi ve entelektüel yapısını karakterize etti.

CiteSpace ve VOSviewer'da parametre yapılandırması

CiteSpace'te zaman aralığı 2016'dan 2025'e kadar belirlenmiş, her zaman dilimi 1 yıl olarak belirlenmiş ve toplamda 10 dilim elde edilmişti. Düğüm tipleri analitik amaca göre seçildi; anahtar kelime zaman çizelgesi ve patlama analizleri için Anahtar Kelime, referans ortak alıntı ve patlama analizleri için Referans kullanıldı. Düğüm seçimi kriteri, sabit bir En Üst N veya En Üst N %eşik yerine k = 10 ölçeklendirme faktörüyle g-indeksine ayarlandı; böylece düğüm seçimi yıllık atıf veya gerçekleşme dağılımlarına uyum sağlayacak şekilde yorumlanabilirağ boyutu 25,26 korundu. Zaman dilimli ağlar ve birleştirilmiş ağlar için Pathfinder budama uygulanmış, oysa Minimum Spanning Tree algoritması kullanılmamıştır. Patlama tespiti için, γ bozulma faktörü 0.5 olarak ayarlandı. Referans ortak alıntı kümeleme analizinde, modülerlik Q ve ağırlıklı ortalama siluet değerleri, budanmış ağın genel yapısını ve küme tutarlılığını tanımlamak için hesaplandı.

VOSviewer 1.6.19 sürümünde, tüm WoSCC düz metin dosyaları "Bibliyografik verilere dayalı bir harita oluştur" ve "Bibliyografik veritabanı dosyalarından veri okuma" seçenekleriyle içe aktarılırdı ve dosya türü Web of Science olarak belirlenirdi. Tam sayma yöntemi kullanıldı. Ortak yazarlık ağları için, ülkeler/bölgeler ve kurumlar için minimum yayın eşiği 5, yazarlar için ise 3 olarak belirlendi.

Kurum düzeyinde analizler için, kurumsal isimler ağ inşasından önce WoSCC üyelik kayıtlarına göre manuel olarak kontrol edilip uyumlandırıldı. Her kurum için atıf sayısı, alınan veri setinde o kuruma atfedilen toplam WoSCC Times Cited sayısı olarak tanımlanmıştır. VOSviewer'da oluşturulan kısaltılmış düğüm etiketleri, belirsizliği önlemek için ilgili tam kurumsal isimlerle ayrıca kontrol edildi. Ülke/bölge analizi için WoSCC ülke/bölge adres alanı kullanılmıştır. Ülke/bölge isimleri, yazım varyantları ve kısaltmalar için elle uyumlu hale getirildi. İngiltere, İskoçya, Galler ve Kuzey İrlanda Birleşik Krallık'a dahil edildi ve Çin Halk Cumhuriyeti kısaltıldı. Ana Çin Çin olarak rapor edilirken, Hong Kong Özel İdari Bölgesi (Hong Kong SAR), Macao SAR ve Tayvan, WoSCC tarafından ayrı indekslendiğinde ayrı bölgeler olarak tutuldu; Ülke/bölge düzeyinde ağ analizi için sonradan birleştirme yapılmadı. Anahtar kelime ortak oluş analizi için, analiz birimi WoSCC kayıtlarından çıkarılmış anahtar kelimeleri yazar olarak ayarlandı ve minimum oluşma eşiği 5 olarak ayarlandı; Bu eşikte, kriterleri karşılayan 89 anahtar kelime vardı. Ağ oluşturulmadan önce, yazar-anahtar kelime listesinde tanımlanan eşanlamlı terimler ve kısaltmalar manuel olarak standartlaştırılmıştı; örneğin, DN ve reaktif oksijen türlerinin kısaltmaları tam terimlerine dönüştürülmüştür. Dergi ortak kaynak analizi için, analiz birimi olarak kaynak kullanıldı ve 53 dergiden oluşan yorumlanabilir ağı korumak için bir atıf eşiği uygulandı. Düzen LinLog/modülerlik olarak ayarlanmıştı; Attraction 2, Repulsion ise -1 olarak ayarlanmıştı. Düğüm büyüklüğü, yayın sayısı, atıf sıklığı, anahtar kelime belirtisi sıklığı veya ortak alıntı gücü ile belirli analizlere göre ağırlıklandırıldı. Tüm ağ oluşturma prosedürleri, sonuçların kararlılığını doğrulamak için birinci ve ikinci yazarlar tarafından aynı veri seti ve parametre ayarları kullanılarak iki kez bağımsız olarak gerçekleştirilmiştir. Belirgin tutarsızlıklar olduğunda, ham veri ve parametre ayarları yeniden analiz edilmeden önce tekrar kontrol edilmiştir.

Sonuçlar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yıllık yayın eğilimleri ve veri seti düzeyinde atıf görünürlüğü

2016'dan 2025'e kadar DN'de mitokondriyal araştırmalarla ilgili yıllık yayın sayısı 63'ten 239'a yükseldi. Sabit veri seti için yıllık Times Cited sayıları 2016'da 49'dan 2025'te 12.516'ya yükseldi. Bu metrik, dahil edilen tüm kayıtlar tarafından her takvim yılında alınan atıfları temsil eder; aynı yıl yıllık yayın kohortlarına veya alan genelinde atıf toplamlarına değil. Bu atıf ölçüsü sabit veri setinin tamamı için hesaplandığı için, yıllık atıf sayıları yayın yaşı, birikmiş maruz kalma süresi ve dahil edilen kayıtlar arasındaki eşit olmayan atıf aralıklarından etkilenir. Bu nedenle, Şekil 1'deki yukarı yönlü atıf eğrisi, araştırma etkisinin zamanla arttığına dair doğrudan kanıt yerine veri seti düzeyinde atıf görünürlüğü olarak yorumlanmalıdır. 2022'den 2025'e kadar 754 yayın kaydedildi ve bu, Şekil 1'de gösterilen toplam yayın sayısının %56,2'sini oluşturdu.

Ülke/bölge iş birliği ağlarının bölgesel kalıpları ve atıf görünürlüğü

Ülke/bölge analizi, diyabetik nefropatide mitokondriyal araştırmalarda yayın çıktısını, atıf temelli göstergeleri ve iş birliği kalıplarını özetledi. Çin 775 yayınla birinci sıradaydı, ardından Amerika Birleşik Devletleri 235 yayınla; bu iki ülke birlikte bu alandaki toplam literatür çıktısının %70'inden fazlasını katkıda bulundu (Tablo 1). Ortalama makale başına atıf sayısı açısından Avustralya 98 atıfla birinci sırada yer aldı; ardından Amerika Birleşik Devletleri 69 ve Çin 30 ile geldi. Bu değerler, doğrudan araştırma kalitesi ölçümü yerine tanımlayıcı atıf görünürlüğü göstergeleri olarak yorumlanmıştır. Avustralya, toplam yayın sayısında sekizinci sırada yer aldı ancak nispeten yüksek ayarlanmamış atıf görünürlüğü ve Avrupa ile Amerika Birleşik Devletleri'ndeki ekiplerle çoklu iş birliği bağlantıları gösterdi. İşbirliği ağı, Birleşik Krallık, Almanya ve Amerika Birleşik Devletleri ile bağlantılar gösteriyordu (Şekil 2A). İşbirliği yoğunluğu açısından, Amerika Birleşik Devletleri 140 ile en yüksek toplam bağlantı gücüne sahipken, Çin 82 ile onu takip ediyor. Şekil 2B, yayın hacmi, atıf sayıları ve toplam bağlantı gücünü üç boyut boyunca entegre eden bir balon grafiki sunmaktadır. Bu grafikte, Çin en yüksek yayın hacmi ve yüksek toplam atıf sayısına sahipken, Amerika Birleşik Devletleri yüksek atıf sayısı ve en yüksek iş birliği yoğunluğu gösterdi. Makale başına ortalama atıf değerlendirildiğinde, Avustralya ve İtalya bu veri setinde yüksek sıralarda yer aldı.

Ülke/bölge iş birliği ağının daha ayrıntılı incelenmesi, beş ana iş birliği kümesini ortaya koymuştur (Şekil 2A). Akor diyagramı, ülkeler/bölgeler arasındaki iş birliği bağlantılarını daha da göstermiştir (Şekil 2C). En büyük küme Çin, Amerika Birleşik Devletleri, Japonya ve Güney Kore'yi içeriyordu ve bu ülkeler arasında birden fazla iş birliği bağlantısı bulunuyordu. Avrupa içinde, İtalya, İspanya, Hollanda ve Danimarka merkezli bir alt ağ ortaya çıktı; ayrıca Almanya, Fransa ve İsveç'i birbirine bağlayan başka bir iş birliği ekseni de kuruldu. Mısır, Hindistan, İsrail ve Suudi Arabistan gibi Orta Doğu ve Güney Asya ülkeleri, Avrupa ve Amerika ile daha zayıf bağlantılara sahip nispeten bağımsız bir küme oluşturdu. Avustralya, Birleşik Krallık ve Almanya arasında bölgelerarası bağlantılar da gözlemlendi.

Kurumsal araştırma çıktısı ve iş birliği ağı özellikleri

VOSviewer tarafından oluşturulan kurumsal ortak yazarlık ağı, dokuz küme oluşturan 51 kurumu içeriyordu (Şekil 3A). Şekil 3A'daki kısaltılmış düğüm etiketi "China Med Univ" Çin Tıp Üniversitesi'ni ifade eder. Central South Üniversitesi, gösterilen kurumlar arasında en yüksek yayın verimini ve en yüksek toplam atıf sayısını gösterdi, ancak iş birliği bağlantıları en güçlü değildi. Genel olarak, çoğu kurum ağırlıklı olarak yerli veya Doğu Asyalı ortaklarla iş birliği yaparken, Amerika Birleşik Devletleri ve Avustralya'daki kurumlarla sınırlı bölgelerarası bağlantılar da gözlemlenmiştir. Yayın hacmi açısından, en iyi 10 kurumun tamamı Çin'dendi (Şekil 3B). Central South Üniversitesi 56 yayınla birinci sırada yer aldı, ardından Wuhan Üniversitesi 35 yayınla, Zhengzhou Üniversitesi ve Shanghai Jiao Tong Üniversitesi ise 30 yayınla geldi (Tablo 2). Ancak, Central South Üniversitesi'nin toplam bağlantı gücü 20 idi; bu, Shanghai Jiao Tong Üniversitesi ve Zhejiang Üniversitesi'nden daha düşüktür; bu da yüksek yayın üretiminin en güçlü kurumsal iş birliği bağlantısına mutlaka karşılık gelmediğini gösterir. Toplam atıf sayısı bakımında, Central South Üniversitesi 2.999 toplam atıfla birinci sırada yer alırken, onu 1.713 atıfla Monash Üniversitesi takip etti. Çin, Amerika Birleşik Devletleri ve Avustralya'dan diğer kurumlar da toplam atıf sayısına göre ilk 10'da yer aldı (Şekil 3C).

Dergi ortak atıf ağı ve yayın özellikleri

Dergi ortak kaynak ağı, beş küme oluşturan 53 seçilmiş dergiyi içeriyordu (Şekil 4A). Küme 1, Redox Biology, Cell Death & Disease ve Metabolism-Clinical and Experimental ile temsil edilen 14 dergi içeriyordu ve oksidatif stres, mitofaji ve metabolik yeniden programlama ile ilgili dergileri içeriyordu. Küme 2, nefroloji ve Kidney International, JCI Insight, Nature Reviews Nephrology, Diabetes ve Nature Communications gibi disiplinlerarası dergileri içeriyordu. Küme 3 ve 4, Antioxidants, Frontiers in Pharmacology, Biomedicine & Pharmacotherapy, Scientific Reports ve PLOS ONE gibi dergileri kapsadı. Küme 5, Free Radical Biology and Medicine, Renal Failure ve Phytomedicine gibi dergileri içeriyordu. Yayın hacmi açısından Frontiers in Pharmacology 54 makaleyle birinci sırada yer aldı; ardından International Journal of Molecular Sciences (45 makale) ve Scientific Reports (29 makale) geldi (Şekil 4B, Tablo 3). Frontiers in Pharmacology 4,8 ve 1.379 atıf ile etki faktörüne sahipken, International Journal of Molecular Sciences 4,9 ve 1.885 atıf ile Free Radical Biology and Medicine 8,2 ve 1.362 atıf ile impact faktörüne sahipti. Atıf hacmi açısından, Nature Reviews Nephrology 2.455 toplam atıfla birinci sırada yer aldı; ardından International Journal of Molecular Sciences 1.885 atıfla, Redox Biology 1.452 atıfla, Frontiers in Pharmacology 1.379 atıfla, Free Radical Biology and Medicine 1.362 atıfla, Kidney International 1.338 atıfla ve Cell Death & Disease 1.268 atıfla geldi (Şekil 4C).

Yazar ortak yazarlık ağı ve yayın/atıf göstergeleri

Yazar ortak yazarlık ağında, 24 üretken yazar beş kümeye ayrılmıştır (Şekil 5A). Ağ, Sun Lin, Yang Ming, Xiao Li, Han Yachun, Liu Fuyou, Chen Wei, Gao Peng, Danesh Farhad R., Galvan Daniel L. ve Li Li'nin bu iş birliği gruplarında önemli düğümler olarak yer aldığı birkaç nispeten farklı yazar ekiplerini gösterdi. Danesh Farhad R. ve Galvan Daniel L. de toplam atıf sayısına göre ilk 10 yazar arasında yer aldı. Yayın hacmi açısından Sun Lin 24 makaleyle birinci sırada yer aldı, ardından Yang Ming 20 makale ve Li Ping 17 makale ile geldi. En üretken 10 yazar arasında sekiz kişi Çin'den, ikisi ise Amerika Birleşik Devletleri'nden (Şekil 5B).

Toplam atıf açısından Sun Lin 1.775 atıfla birinci sırada yer aldı, ardından Xiao Li 1.341 atıfla, Yang Ming 1.288 atıfla ve Liu Fuyou 1.236 atıfla geldi (Şekil 5C). Amerika Birleşik Devletleri'nden yazarlar; Danesh Farhad R. 1.097 atıfla, Galvan Daniel L. 1.081 atıf ile ve Sharma Kumar 852 atıf ile ayrıca Avustralya'dan Cooper Mark E. 1.091 atıf ile toplam atıf sayısına göre ilk 10 arasında yer almıştır. Li Ping yayın sayısına göre üçüncü sırada yer aldı ancak toplam atıf sayısına göre ilk 10 yazar arasında yer alamadı. Alınan veri setinde Sun Lin hem yayın hacmi hem de toplam atıf sayısı açısından birinci sırada yer aldı.

Anahtar kelime ortak ortaya çıkışı ve araştırma sıcak noktalarının evrimi

Yazar-anahtar kelime birlikte oluş analizi, diyabetik nefropati üzerine mitokondriyal araştırmalarda anahtar kelimelerin sıklığı ve aralık merkeziyetini özetlemiştir. Yüksek frekanslı anahtar kelimeler arasında, "diyabetik nefropati" en yüksek sıklıkta 573 karşılaşma ile izlendi, ardından "oksidatif stres" (449 görülür), "diyabetik böbrek hastalığı" (292) ve "mitokondriyal disfonksiyon" (235 görülür) geldi (Tablo 4). "Diyabetik nefropati" ve mitokondri ile ilgili terimler arama stratejisinin ve çalışma kapsamının merkezi bileşenleri olduğundan, yüksek sıklıkları beklenirdi ve bağımsız ortaya çıkan bir sıcak nokta olarak değil, konu tutarlılığının kanıtı olarak yorumlanmıştır. Diğer sıkça kullanılan anahtar kelimeler arasında "aktivasyon" (197), "yaralanma" (194) ve "apoptoz" (140) yer almaktadır. Anahtar kelime ortak oluşum ağında, yüksek glikoz, reaktif oksijen türleri, glikoz, diyabetik nefropati, mitokondriyal disfonksiyon ve mitokondriyal homeostaz, belirgin birbirine bağlı düğümler olarak ortaya çıkmış; bu da oksidatif stres, metabolik bozulma ve mitokondriyal bozulmanın bu alanın temel ortak oluşum yapısını oluşturduğunu göstermektedir (Şekil 6A). "Mitophagy" Tablo 4'te sıklık olarak ilk 10 anahtar kelime arasına girmese de, anahtar kelime ortak oluşumu ve zaman çizelgesi görselleştirmelerinde görünür bir konu olarak yer almış ve DN'deki mitokondriyal araştırmaların tematik evrimiyle ilgisini göstermektedir. Aralık merkezilik açısından "böbrek" (0.35) ve "mezangial hücreler" (0.33) en yüksek merkezilik değerlerine sahipti, onları "pathway" (0.30), "reaktif oksijen türleri" (0.27), "NF-κB" (0.25), "endoplazmik retikülum stresi" (0.22), "akut böbrek hasarı" (0.22), "glikoz" (0.21), "mitokondri" (0.19) ve "kardiyovasküler hastalık" (0.19) takip etti (Tablo 4). Tablo 4'ün sıralanmış anahtar kelimeleri sıklık ve aralık merkezilik açısından özetlediği, Şekil 6B ve Şekil 6C'nin ise algoritmik olarak oluşturulan kümeleri ve onların zamansal aktivitelerini sunduğu belirtilmelidir; bu nedenle, Şekil 6'daki küme etiketlerinin Tablo 4'teki sıralanmış anahtar kelime listesini tam olarak yeniden üretmesi beklenmez.

Anahtar kelime zaman çizelgesi haritalaması, 2016'dan 2025'e kadar anahtar kelime kümelerinin zamansal etkinliğini görselleştirmiştir (Şekil 6C). Erken aktif konular esas olarak yüksek glikoz, reaktif oksijen türleri, kronik böbrek hastalığı, akut böbrek hasarı, insülin direnci, glikoz ve mitokondriyal fonksiyonla ilgiliydi. İlerleyen yıllarda, fisyon, mitofagi, mitokondriyal homeostaz, yağ asitleri oksidasyonu ve tip 2 diyabet sürekli veya gelişmekte olan zaman çizelgesi konuları olarak ortaya çıktı. Anahtar kelime kümelendirmesi, kronik böbrek hastalığı, koruyucular, iskelet kasları, kardiyovasküler hastalıklar, diyabetik nefropati, lipid peroksidasyon, diyabet mellitus, DKD, fisyon, geleneksel Çin tıbbı, endoplazmik retikulum stresi, fareler ve yağ asidi oksidasyonu gibi 13 tematik küme oluşturdu (Şekil 6B). Bu küme etiketleri algoritmik olarak oluşturulmuş ve yüksek frekanslı anahtar kelimelerin sıralanmış listesi olarak değil, anahtar kelime birlikte oluşma desenlerinin tanımlayıcı etiketleri olarak yorumlanmalıdır. Böbrekle ilgili kümeler arasında esas olarak diyabetik nefropati, DKD, kronik böbrek hastalığı, lipid peroksidasyon, fisyon, endoplazmik retikülum stresi, geleneksel Çin tıbbı, fareler ve yağ asitleri oksidasyonu yer alıyordu. Özellikle, iskelet kası ve kardiyovasküler hastalık gibi bazı algoritmik olarak oluşturulan etiketler, çekirdek DN-spesifik mitokondriyal mekanizmalar yerine çevresel veya sistemik diyabetle ilgili terimleri yansıtıyor gibi görünüyordu. Bu nedenle, bu çevresel kümeler bu çalışmada büyük araştırma noktaları olarak yorumlanmamıştır. Zaman çizelgesi görselleştirmesi, fisyon, mitofagi ve yağ asidi oksidasyonu ile ilgili konuların 2019'dan sonra aktif kaldığını gösterdi (Şekil 6C).

Referans ortak alıntı kümeleri ve atıf patlaması analizi

Referans ortak kaynak analizi, Pathfinder tarafından budanmış ağda modülerlik Q = 0.867 ve ağırlıklı ortalama siluet değeri = 0.9587 olan 18 küme oluşturdu (Şekil 7A,B). Ancak, Pathfinder budama zayıf çapraz bağlantıları azaltabildiğinden, bu kümeler temalardaki literatürde tematik yoğunlaşmalar olarak yorumlanmıştır; temaların tamamen bağımsız olduğuna dair kanıt olarak değil. Başlıca referans kümeleri arasında ferroptoz, NLRP3 inflammazom, PINK1, MAM'ler, SGLT2 inhibitörleri, MitoQ, kalori kısıtlama, Mendel randomizasyonu ve metabolomikler yer aldı. En güçlü erken referans patlamaları Dugan ve ark. (2016-2018 arasında güç 24.52), Sharma ve ark. (2016-2018 arasında güç 20.58), Kang ve ark. (2016-2020 arasında güç 18.91) ve Zhan ve ark. (2016-2020 arasında güç 16.91) oldu.

Temsilci sonraki patlama referansları arasında Coughlan ve ark. (güç 12.02, 2017'den 2021'e kadar), Ayanga ve ark. (güç 10.71, 2017'den 2021'e kadar), Qi ve ark. (güç 14.31, 2018'den 2022'ye kadar), Xiao ve ark. (güç 12.43, 2018'den 2022'ye), Bhargava ve ark. (2019'dan 2022'ye kadar güç 20.52), Galvan ve ark. (2019'dan 2022'ye kadar güç 13.07), yer aldı. Forbes ve ark. (2020-2023 arasında güç 20.53) ve Wei ve ark. (2021-2023 arasında güç 10.75) (Şekil 7C). Bu patlama referanslar ve ortak alıntı kümeleri, alınan veri setindeki atıf literatürünün zamansal dağılımını ve tematik bileşimini karakterize etmiştir.

VERİ ERIŞILEBILIRLIĞI:

Bu çalışmanın bulgularını destekleyen ham veriler, "Diyabetik nefropatide Mitokondriyal Araştırmaların Bibliyometrik ve Görselleştirilmiş Analizi" başlıklı veri seti altında kamu deposu Science Data Bank'a (ScienceDB) depo edilmiştir. Veri setine aşağıdaki bağlantı üzerinden erişilebilir: https://www.scidb.cn/s/2aiiYj. Depoya yatırılan veriler, Protokol bölümünde tanımlanan arama stratejisi kullanılarak 30 Nisan 2026'da WoSCC'den alınan tam bibliyografik kayıtlar setini ve bibliyometrik ve görselleştirme analizleri için kullanılan ara veri dosyalarını içermektedir. Veri seti, bu çalışmanın tekrarlanabilirliğini daha da desteklemek için CC BY-NC 4.0 lisansı altında sunulmaktadır.

figure-results-1
Şekil 1: 2016'dan 2025'e kadar DN'de mitokondriyal araştırmaların yıllık yayın çıktısı ve WoSCC veri seti seviyesinde atıf görünürlüğü. Turuncu çubuklar, sol y eksenine karşılık gelen yıllık yayın sayısını temsil eder. Kırmızı çizgi, sağ y eksenine karşılık gelen WoSCC veri seti düzeyindeki yıllık Times Cited sayımlarını temsil eder. Bu sayımlar, dahil edilen 1.342 kayıt tarafından her takvim yılında alınan atıfları gösterir ve doğrudan araştırma etkisinin arttığı kanıtı yerine veri seti düzeyinde atıf görünürlüğü olarak yorumlanmalıdır. Kısaltmalar: WoSCC = Web of Science Çekirdek Koleksiyonu. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-2
Şekil 2: Ülke/bölge iş birliği ağları ve bibliyometrik göstergeler. (A) Dünya haritası üzerinde yer alan küresel iş birliği ağı, burada düğüm boyutu yayın hacmini ve bağlantı kalınlığını iş birliği yoğunluğunu gösterir. (B) En iyi 10 ülke/bölge için yayın hacmi, atıf sayısı ve toplam bağlantı gücünü gösteren balon grafiki. (C) Ülkeler/bölgeler arasındaki iş birliği bağlantılarını gösteren akor diyagramı. Kısaltmalar: ABD = Amerika Birleşik Devletleri; Birleşik Krallık = Birleşik Krallık, İngiltere, İskoçya, Galler ve Kuzey İrlanda birleştirilmiştir. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-3
Şekil 3: Kurumsal iş birliği ağları ve araştırma çıktısı. (A) Dokuz küme halinde organize edilmiş 51 kurumdan oluşan ortak yazarlık ağı. (B) Yayın hacmine göre en iyi 10 kurumun bar grafiği. (C) Toplam atıf sayısına göre ilk 10 kurumun bar grafı. Panel A'daki kısaltılmış düğüm etiketi "China Med Univ" Çin Tıp Üniversitesi'ni ifade eder. Kısaltmalar: Univ = Üniversite; Med = Tıbbi; Coll = Kolej; Sch = Okul; Mt = Dağ; ABD = Amerika Birleşik Devletleri. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-4
Şekil 4: Dergi ortak kaynak ağı ve yayın özellikleri. (A) Beş küme oluşturan 53 seçilmiş dergiden oluşan ortak alıntı ağı. (B) Yayın hacmine göre en iyi 10 derginin yayın hacmi ve etki faktörü. (C) Toplam atıf sayısına göre en iyi 10 derginin dörtlüğünü ve Dergi Atıf Raporları (JCR) oranında yer alır. Kısaltmalar: IF = Çarpım faktörü; JCR = Dergi Atıf Raporları; Q1 = Dörtlü 1. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-5
Şekil 5: Yazar ortak yazarlık ağı ve yayın/atıf göstergeleri. (A) Beş küme oluşturan 24 yüksek çıktılı yazardan oluşan ortak yazarlık ağı. (B) Yayın hacmine göre ilk 10 yazar. (C) Toplam atıf sayısına göre ilk 10 yazar. Kısaltmalar: ABD = Amerika Birleşik Devletleri. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-6
Şekil 6: Araştırma sıcak noktalarının yazar-anahtar kelime ortak oluşumu ve evrimi. (A) Anahtar kelime ortak oluşum ağı. (B) 13 tematik küme gösteren anahtar kelime küme haritası. (C) 2016'dan 2025'e kadar zamansal küme aktivitesini gösteren anahtar kelime zaman çizelgesi görselleştirmesi. Küme etiketleri algoritmik olarak oluşturulmuş ve tüm kümelerin diyabetik nefropatiye özgü temel araştırma temalarını temsil ettiğine dair doğrudan kanıt yerine anahtar kelime ortak oluşum desenlerinin tanımlayıcı etiketleri olarak yorumlanmalıdır. Sıralanmış anahtar kelime sıklığı ve aralık merkezilik sonuçları Tablo 4'te ayrı ayrı özetlenirken, Şekil 6 anahtar kelime ortak oluşum yapısı, tematik kümeleme ve zamansal aktiviteyi vurgular. Kısaltmalar: ER = endoplazmik retikulum; NLRP3 = NOD benzeri reseptör ailesi pirin alanı içeren 3; NF-κB = nükleer faktör kappa B; PPAR α = peroksisom proliferatör tarafından aktive edilen reseptör alfa. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

figure-results-7
Şekil 7: Referans ortak alıntı ve bilgi evrimi. (A) Referans ortak alıntı ağı. (B) 18 bilgi kümesini gösteren referans kümeleme haritası. (C) Patlama gücü ve patlama süresi dahil olmak üzere en güçlü atıf patlamalarına sahip ilk 20 referans. Kısaltmalar: NLRP3 = NOD benzeri reseptör ailesi pirin domaini içeren 3; PINK1 = PTEN kaynaklı kinaz 1; SGLT2 = sodyum-glukoz kotransporteri 2; MitoQ = mitokondri hedefli ubiquinone; SIRT3 = sirtuin 3; AMPK = AMP ile aktive edilmiş protein kinaz; DOI = dijital nesne tanımlayıcısı. Bu figürün daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayın.

RütbeCountryBelgelerAtıflarMakale başına ortalama atıfToplam bağlantı gücü
1Çin775230343082
2ABD2351632069140
3Japonya8031293943
4Güney Kore4716063415
5İtalya3621856121
6Almanya3415124439
7Hindistan3412793811
8Avustralya3332469835
9İspanya3217685524
10Birleşik Krallık2816676032

Tablo 1: Yayın çıktısına göre sıralamada ilk 10 ülke/bölge, atıf sayısı, makale başına ortalama atıf ve toplam bağlantı gücü ile sıralanmıştır. Diyabetik nefropati üzerine mitokondriyal araştırmalarda en üretken on ülke/bölgenin yayın çıktısını, atıf temelli göstergelerini ve iş birliği gücünü özetler. Kısaltmalar: Birleşik Krallık = Birleşik Krallık; ABD = Amerika Birleşik Devletleri.

RütbeOrganizasyonBelgelerAtıflarToplam bağlantı gücüCountry
1Cent South Üniversitesi56299920Çin
2Wuhan Üniversitesi359343Çin
3Zhengzhou Üniversitesi30100611Çin
4Şanghay Jiao Tong Üniversitesi3096326Çin
5Hebei Med Üniversitesi288936Çin
6Southern Med Üniversitesi2773219Çin
7Shandong Üniversitesi2579216Çin
8Zhejiang Üniversitesi2572823Çin
9Pekin Üniversitesi Çin Medi2538519Çin
10Nanjing Med Üniversitesi2263817Çin

Tablo 2: Yayın çıktısına göre sıralamaya göre ilk 10 kurum, WoSCC toplam Atıf Zamanı sayısı, toplam bağlantı gücü ve ülke. Önde gelen kurumları yayın çıktılarına, atıf performanslarına, iş birliği gücüne ve üye ülkelerine göre sunar. Kurumsal isimler, kısa tablo sunumu için standartlaştırılmış kısaltılmış etiketler olarak sunulur ve WoSCC üyelik kayıtlarındaki ilgili tam kurumsal isimlerle karşılaştırıldığında kontrol edilmiştir. Kısaltmalar: WoSCC = Web of Science Çekirdek Koleksiyonu; Univ = Üniversite; Med = Tıbbi.

RütbeKaynakBelgelerAtıflarToplam bağlantı gücüEĞERJCR
1Farmakolojide Sınırlar5413793384.8S1
2Uluslararası Moleküler Bilimler Dergisi4518852534.9S1
3Bilimsel Raporlar2911321293.9S1
4Amerikan Fizyoloji Dergisi-Böbrek Fizyolojisi2510781963.4S1
5Antioksidanlar2112231416.6S1
6Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi217661552.2S1
7Biyomedikal ve Farmakoterapi21581967.5S3
8Endokrinolojide Sınırlar213791614.6S1
9Hücre Ölümü ve Hastalık1712681049.6S1
10Serbest Radikal Biyoloji ve Tıp1713621978.2S1

Tablo 3: Yayın hacmi ile birlikte ilk 10 dergi, atıf sayısı, toplam bağlantı gücü, etki faktörü ve Dergi Atıf Raporları dörtlüğü ile sıralanmıştır. Alınan veri setindeki en verimli on derginin yayın özelliklerini, atıf performansını ve dergi etki metriklerini özetler. Atıf sayısı, her dergide yayımlanan dahil kayıtların toplam WoSCC Times Cited sayısını ifade eder. IF ve JCR dörtlükleri Dergi Atıf Raporlarından elde edilmiştir. Kısaltmalar: IF = Çarpım faktörü; JCR = Dergi Atıf Raporları; Q1 = Dörtlü 1; Q3 = Dörtlü 3; WoSCC = Web of Science Çekirdek Koleksiyonu.

RütbeAnahtar KelimelerKontAnahtar KelimelerMerkeziyet
1Diyabetik nefropati573Böbrek0.35
2oksidatif stres449mezangial hücreler0.33
3diyabetik böbrek hastalığı292Yol0.30
4Mitokondriyal disfonksiyon235Reaktif oksijen türleri0.27
5Aktivasyon197NF-κB0.25
6Sakatlık194Endoplazmik retikülum stresi0.22
7nefropati189Akut Böbrek Yaralanması0.22
8Fonksiyon187Glikoz0.21
9İfade152mitokondriler0.19
10Apoptoz140Kardiyovasküler hastalıklar0.19

Tablo 4: Sıklık ve aralık merkeziyeti açısından en iyi 10 anahtar kelime. En sık duş gelen anahtar kelimeleri ve en yüksek aralık merkezi konumuna sahip anahtar kelimeleri listeler; diyabetik nefropati üzerine mitokondriyal araştırmalarda başlıca araştırma temalarını ve etkili konuları vurgular. Kısaltmalar: NF-κB = nükleer faktör kappa B.

Tartışma

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Bu bibliyometrik çalışma, 2016'dan 2025'e kadar DN'de mitokondriyal araştırmaların küresel araştırma alanına ve tematik evrimine sistematik bir bakış sunmaktadır. Sonuçlar, özellikle 2021 sonrasında son on yılda bu alandaki araştırma faaliyetlerinin arttığını göstermektedir. Bu dönemde, araştırma odağı oksidatif stres ve mitokondriyal işlev bozukluğundan mitokondriyal kalite kontrolü, metabolik adaptasyon, düzenlenmiş hücre ölümü, organel etkileşimleri ve translasyonal odaklı terapötik araştırmalara doğru yavaş yavaş genişledi. Bu eğilimler, DN'de mitokondriyal araştırmaların mitokondriyal yaralanmanın betimleyici karakterizasyonundan daha çok mekanizma odaklı ve bütünleşici araştırmaya doğru ilerlediğini göstermektedir.

Yayın çıktısı ile atıf temelli görünürlük arasında ülkeler/bölgeler ve kurumlar arasında belirgin bir ayrışma gözlemlendi, ancak bu kalıp sadece araştırma miktarı ile araştırma kalitesi arasındaki bir zıtlık olarak yorumlanmamalıdır. Çin'den gelen yayınların hızlı artışı, diyabet ve kronik böbrek hastalığının artan ulusal yükü, biyomedikal araştırmalara sürekli yatırım, lisansüstü eğitim ve üniversite tabanlı araştırma platformlarının genişletilmesi ve nefroloji araştırmalarında kamuya açık transkriptomik ve deneysel veri setlerinin artan kullanımı gibi çeşitli bağlamsal faktörlerle bağlantılı olabilir. Bu faktörler, geniş ve hızla büyüyen bir araştırma tabanını teşvik etmiş olabilir. Ancak, bu alandaki birçok Çin yayını nispeten yeni olup, daha kısa atıf süreleri ve makale başına ortalama atıf oranlarının potansiyel olarak daha düşük olmasına yol açtı. Buna karşılık, Amerika Birleşik Devletleri, Avustralya, İtalya ve Birleşik Krallık gibi ülkeler, daha düşük yayın sayısına rağmen daha yüksek atıf tabanlı görünürlük gösterdi; bu da kısmen DKD, mitokondriyal biyoloji, redoks biyolojisi ve translasyonel nefroloji alanlarındaki daha uzun köklü akademik kökenleri yansıtabilir. Bu ülkelerden çok alıntılanan çalışmalar, mitofagi, mitokondriyal dinamikler ve mitokondri hedefli müdahaleler gibi kavramsal veya metodolojik olarak etkili konularla sıkça ilişkilendirilmiştir. Bu nedenle, gözlemlenen coğrafi desen, doğrudan ulusal araştırma üstünlüğünün kanıtı olmaktan ziyade, araştırma olgunluğu, konu konumlandırması, yayın zamanlaması, iş birliği yapısı ve bilgi yayılımı farkı olarak daha iyi anlaşılır. Kurumsal düzeyde, Central South Üniversitesi, alınan veri setinde gösterilen kurumlar arasında en üretken ve en çok atıf alan kurumdu, ancak iş birliği profili, büyük bir uluslararası iş birliği merkezi olmaktan ziyade daha ulusal odaklı bir ağ olduğunu gösteriyor. Buna karşılık, Monash Üniversitesi, Harvard Tıp Fakültesi ve Michigan Üniversitesi gibi kurumlar mitokondriyal kalite kontrolü, SIRT3 aracılı antioksidan koruma, mitokondri hedefli teslimat ve mitokondriyal dinamik görüntüleme konularında atıf görünürlüğü göstermiştir. Bu bulgular, kurumsal kaynak göstergesi görünürlüğünün ve bu alandaki ağ rollerinin yalnızca yayın hacmine değil, aynı zamanda kurumların uluslararası bağlantılı, kavramsal olarak etkili veya çeviri odaklı araştırma alanlarına katılıp katılmadığına da bağlı olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, ülke ve kurumsal analizler, bilimsel kaliteyi sıralamak yerine bilginin dağılımı ve yayılımını haritalandıran olarak yorumlanmalıdır.

Dergi ve yazar analizleri, bu araştırma alanının yayın platformları ve katkı ağları arasında nasıl organize edildiğini daha da göstermektedir. Dergi dağılımı ise, DN'deki mitokondriyal araştırmaların doğası gereği disiplinlerarası olduğunu, nefroloji, redoks biyolojisi, metabolizma, farmakoloji, hücre ölümü ve nanotıp gibi alanları kapsaydığını göstermektedir. İnceleme odaklı veya yüksek etkili dergilerin yüksek atıf sayısı, kavramları entegre etme ve araştırma gündemlerini şekillendirmedeki rollerini yansıtabilirken, yüksek yayın hacmine sahip dergiler daha çok deneysel ve farmakolojik kanıtların biriktirilmesi için platform olarak işlev görebilir. Bu nedenle, dergi düzeyinde yayın hacmi ile alıntı sayısı arasındaki farklar, dergi kapsamı, makale türü, okuyucu kitlesi ve yayımlanan konuların olgunluğu ile ilişkilendirilmelidir. Kidney International, Redox Biology, Cell Death & Disease ve Free Radical Biology and Medicine gibi dergiler, oksidatif stres, mitokondriyal disfonksiyon, mitofaji ve böbrek hasarı üzerine mekanik çalışmaları ortaya çıkan translasyonel sorularla ilişkilendiriyor. Bu arada, Farmakoloji ve Antioksidantlarda Sınırlar, mitokondriyal biyolojiy, redoks düzenlemesi ve farmakolojik müdahale arasındaki artan kesişimi yansıtmaktadır. Yazar düzeyinde, verimlilik ve atıf görünürlüğü de tamamen örtüşmemişti. Yüksek yayın sayısına sahip yazarlar, genişleyen araştırma tabanına aktif katkıda bulunanları temsil ederken, daha az ama çok atıf alan yayınlara sahip yazarlar etkili kavramsal çerçevelere, hastalık modellerine veya müdahale ile ilgili çalışmalara katkıda bulunmuş olabilir. Örneğin, Sun Lin hem yüksek verimlilik hem de atıf görünürlüğü gösterdi; Danesh Farhad R., Galvan Daniel L., Sharma Kumar ve Cooper Mark E. ise daha düşük yayın sayılarına rağmen çok atıf alan yazarlar arasında yer aldı. Bu desen, yazar düzeyindeki bibliyometrik göstergelerin iş birliği ağları, yayın zamanlaması, makale türü ve konu merkeziyeti tarafından şekillendirildiğini göstermektedir. Buna göre, bu göstergeler, doğrudan bireysel bilimsel kalite veya klinik önem ölçütleri olarak değil, alınan veri seti içindeki görünürlük ve entelektüel bağlantı ölçütleri olarak yorumlanmalıdır.

Anahtar kelime ve referans analizleri, bu alanın entelektüel yapısının zamansal evrimine dair içgörüler sağlar. Erken patlama referansları esas olarak oksidatif stres, mitokondriyal reaktif oksijen türleri, mitokondriyal disfonksiyon ve metabolik stresle ilişkilendirilmişti ve bu da erken bibliyometrik görünürlüğün büyük ölçüde diyabetik böbreklerdeki oksidatif ve metabolik hasar üzerineodaklandığını gösteriyor 8,27. Sonraki referanslar ve anahtar kelime kümeleri kademeli olarak mitokondriyal kalite kontrolüne kaydı; bunlar arasında otofaji, mitofaj, mitokondriyal biyogenez ve mitokondriyalhomeostazın 9,28,29'u sürdürmesinde rol alan düzenleyici yollar da yer aldı. Son dönemde, patlama referansları ve ortak alıntı kümeleri giderek düzenlenmiş hücre ölümü, organel etkileşimleri, müdahaleyle ilgili konular ve nedensel çıkarım veya omik odaklı yaklaşımları içeriyordu; temsilci konular arasında ferroptoz, NLRP3 inflamasom, MAM'ler, SGLT2 inhibitörleri, MitoQ ve Mendel randomizasyona dayalıyaklaşımlar yer aldı 30,31,32,33,34 ,35,36,37. Son mekanistik ve müdahale ile ilgili çalışmalar da bu aktif temalara karşılık gelen örnekler sunar; örneğin, HIF-1α/MIOX ekseni üzerinden mitofaji ve ferroptozun metformin aracılı regülasyonu, Drp1'e bağlı mitokondriyal fisyonun P110 aracılı inhibisyonu ve Baoshentongluo formülü veya dapagliflozin 38,39,40,41 ile PINK1/Parkin ile ilişkili mitofaji düzenlemesi . Bu değişim, alanın mitokondriyal yaralanmayı tanımlamaktan, mitokondriyal kalite kontrol ağlarını, düzenlenmiş hücre ölüm yolları, organel etkileşimlerini, müdahaleyle ilgili konuları ve nedensel veya omik odaklı yaklaşımları araştırmaya doğru ilerlediğini gösteriyor. Bu desenler, ferroptoz, NLRP3 inflamazom, MAM'ler, SGLT2 inhibitörleri, MitoQ ve Mendel randomizasyonu ile ilgili yaklaşımların erişilen literatürde giderek daha görünür bir konu haline geldiğini göstermektedir.

Ancak, algoritmik olarak oluşturulan anahtar kelime kümesi etiketlerinin yorumlanması dikkatli olunmalıdır. İskelet kası ve kardiyovasküler hastalık gibi etiketler, temel diyabetik nefropatiye özgü mitokondriyal mekanizmalar yerine, periferik veya sistemik diyabetle ilgili terimleri veya daha geniş komorbiditelerle ilgili bağlamları yansıtıyor gibi görünüyordu. Bu nedenle, bu çevresel etiketler bu çalışmada birincil ortaya çıkan sıcak noktalar olarak ele alınmadı. Bunun yerine, hotspot yorumu esas olarak anahtar kelime sıklığı, patlama terimleri, zaman çizelgesi aktivitesi ve referans ortak alıntı kalıplarından alınan uyumlu kanıtlara dayanıyordu. Buna uygun olarak, ferroptoz, NLRP3 inflamazom aktivasyonu ve MAM gibi mekanik terimler, ayrı bir mini inceleme olarak detaylandırılmak yerine, anahtar kelime ve ortak alıntı kalıplarıyla tanımlanan yeni araştırma cepheleri olarak ele alınmaktadır. Gelecekteki çalışmalar, yüksek bibliyometrik görünürlüğe sahip bu konuların, klinik örneklerde deneysel doğrulama, tek hücre analizi, mekânsal transkriptomik ve prospektif translasyonel çalışmalar yoluyla insan DKD'sinde tekrarlanabilir biyolojik mekanizmalara karşılık gelip etmediğini belirlemelidir. HDAC9 ile ilişkili mitokondriyal disfonksiyon ve yaşlanmaya bağlı iltihap gibi hesaplamalı olarak belirlenen hedefler, terapötik hedefler olarak yorumlanmadan önce fonksiyonel doğrulama gerektirir42. Bu çalışmanın yerleşik bir bibliyometrik çerçeve kullandığı göz önüne alındığında, katkısı öncelikle DN'de mitokondriyal araştırmaların güncellenmiş, konu odaklı bir sentezi olarak anlaşılmalıdır; metodolojik bir yenilik olarak değil.

Bu bulgular ayrıca gelecekteki araştırmalar için birkaç önceliğe işaret ediyor. Birincisi, mitofajiya, mitokondriyal dinamikler, ferroptoz, MAM'ler ve inflamasom aktivasyonu literatürde giderek daha görünür hale gelse de, insan diyabetik böbrek dokularından elde edilen kanıtlar sınırlı kalır. Son zamanlarda yapılan birçok mekanik veya hesaplamalı örnek, mitofaji ve ferroptoz, Drp1 bağımlı mitokondriyal fisyon, PINK1/Parkin aracılı mitofaji ve HDAC9 ile ilişkili mitokondriyal disfonksiyon gibi deneysel modellere veya biyoinformatik analizlere dayanmaktadır 38,39,40,41,42. Bu nedenle, bu bulgular insan örneklerinde ve böbrek hücre tipine özgü bağlamlarda daha fazla doğrulama gerektirir. İkinci olarak, MitoQ, SGLT2 inhibitörleri, antioksidanlar ve organellere yönelik veya yol yönlendirilmiş stratejiler dahil olmak üzere mitokondri hedefli müdahaleler ve metabolizmaya bağlı yaklaşımlar, özellikle biyoyararlanıllık, böbrek hedefleme etkinliği, uzun vadeli güvenlik ve klinik etkinlik açısından daha titiz translasyonel değerlendirme gerektirir 30,31,32,33,33,34,35. 36,37. İnsan diyabetik böbrek dokularını, tek hücreli veya mekansal teknolojileri, çoklu omik analizleri ve prospektif translasyonel tasarımları entegre eden gelecekteki çalışmalar, diyabetik nefropatide hangi mitokondri ile ilgili yolların tekrarlanabilir ve klinik olarak önemli olduğunu belirlemeye yardımcı olabilir.

Birkaç sınırlama kabul edilmelidir. İlk olarak, tüm kayıtlar WoSCC'den alındı. Bu veritabanı standartlaştırılmış atıf meta verileri sağlasa ve yaygın olarak bibliyometrik çalışmalarda kullanılsa da, seçici kapsamı yalnızca diğer veritabanlarında, bölgesel dergilerde, İngilizce olmayan kaynaklarda veya yakın zamanda güncellenmiş kayıtlarda indekslenen yayınları hariç tutmuş olabilir. MeSH'den türetilen terimler ve manuel tarama arama stratejisini geliştirmek için kullanılsa da, ilgili çalışmaların eksik olarak bulunması tamamen önlenemez. İkinci olarak, bu çalışmadaki atıf temelli göstergeler düzeltilmemiş tanımlayıcı ölçütlerdi. Atıf sayıları, yayın yaşı, atıf süresi, dergi görünürlüğü, makale türü, veritabanı kapsamı, kendi atıf ve alana özgü atıf uygulamaları tarafından etkilenebilir. Bu nedenle, yüksek atıf alan yayınlar, doğrudan üstün araştırma kalitesi, özgünlük, metodolojik titizlik veya klinik öneme dair doğrudan kanıt olarak değil, alınan veri setinde daha fazla atıf görünürlüğüne veya daha geniş bilgi yayılımına sahip olarak yorumlanmalıdır. Ayrıca, Şekil 1'de sunulan WoSCC veri seti düzeyindeki Times Cited sayıları, veri alımı zamanındaki 30 Nisan 2026'da statik bir anlık görüntüyü temsil etmektedir; Bu atıf sayıları dinamiktir ve aynı analiz daha sonra yapılırsa farklılık gösterebilir. Daha da önemlisi, Şekil 1'deki yukarı atıf eğrisi, yayın yaşı, birikmiş maruz kalma süresi ve dahil edilen kayıtlar arasındaki eşit olmayan atıf aralıklarından etkilenmektedir. Bu nedenle, bu eğilim yıl yıl doğrudan araştırma etkisi, bilimsel kalite, metodolojik titizlik veya klinik önem artışı olarak yorumlanmamalıdır. Bu nedenle, atıfla ilgili sonuçlar sabit mutlak değerler olarak değil, geriye dönük bir anlık görüntü olarak yorumlanmalıdır. Üçüncü olarak, anahtar kelime ve ağ analizleri veri işleme ve parametre ayarlarına duyarlıdır. Eşanlamlı terimler ve kısaltmalar manuel olarak uyumlaştırılmış olsa da, standart olmayan yazar anahtar kelimeleri ve algoritmik olarak oluşturulan küme etiketleri yine de belirsizlik yaratabilir. Ayrıca, g-index kriteri, Pathfinder budama ve VOSviewer eşikleri dahil olmak üzere eşik seçimi ve budama algoritmaları, zayıf veya çevresel bağlantıları azaltabilir ve görünürdeki kümeleme yapısını, düğüm bağlantısını ve iş birliği kalıplarını etkileyebilir. Özellikle, referans ortak kaynak ağının nispeten yüksek modülerlikli Q değeri 0.867 ve ağırlıklı ortalama siluet değeri 0.9587, kısmen Pathfinder budama etkisini yansıtabilir; Bu nedenle, ilgili kümeler esas olarak tematik yoğunlaşmaları tanımlamak için kullanıldı ve araştırma temalarının tamamen bağımsız olduğuna dair kanıt olarak yorumlanmamalıdır. Bu nedenle, oluşturulan ağlar, alandaki tüm ilişkilerin tam temsilleri yerine alınan veri setinin analitik basitleştirmeleri olarak değerlendirilmelidir. Son olarak, 2016 ile 2025 arasındaki zaman aralığı son gelişmeleri vurgular, ancak önceki temel çalışmaları yeterince temsil etmeyebilir ve arama tarihinden sonra indekslenen yeni yayınları tam olarak kapsayamayabilir. Gelecekte birden fazla veritabanını, daha geniş dil kapsamını ve belge türlerini, güncellenmiş arama tarihlerini ve ağ parametrelerinin hassasiyet analizlerini içeren bibliyometrik çalışmalar, bu alana daha kapsamlı bir bakış açısı sunabilir.

Son on yılda, DN'de mitokondriyal araştırmalar, oksidatif stresin betimleyici bir incelemesinden, kalite kontrol mekanizmaları, metabolik uyum ve nedensel çıkarım metodolojilerini kapsayan karmaşık çok boyutlu bir alana evrilmiştir. Çin toplam yayın hacminde lider olmasına rağmen, atıf görünürlüğü ülkeler, kurumlar ve araştırma temaları arasında farklılık gösterdi. Ferroptoz, MAM'ler, Mendel rastgeleleştirme ve çoklu omik yaklaşımların ortaya çıkışı, alınan veri setinde aktif araştırma yönlerini göstermektedir. Bu bibliyometrik desenler, gelecekteki deneysel ve klinik çalışmaların, belirli böbrek hücre tiplerinde, hastalık evrelerinde ve terapötik bağlamlarda hangi mitokondri ile ilişkili yolların tekrarlanabilir olduğunu daha da netleştirebileceğini öne sürmektedir.

Açıklamalar

$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Yazarlar çıkar çatışması belirtmemektedir.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
Web of Science Core CollectionClarivatehttps://www.webofscience.com/Not applicable
VOSviewerLeiden Universityhttps://www.vosviewer.com/1.6.19
CiteSpaceDrexel Universityhttps://citespace.podia.com/6.4.R1
Scimago GraphicaScimago Laboratoryhttps://www.scimagographica.org/1.0.25
WPS ExcelKingsoft Corporationhttps://www.wps.com/2023
GraphPad PrismGraphPad Softwarehttps://www.graphpad.com/10.1
Journal Citation ReportsClarivatehttps://jcr.clarivate.com/Not applicable
Medical Subject Headings databaseNational Library of Medicinehttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/Not applicable

Yeniden basım ve izinler

Bu JoVE makalesinin metnini veya şekillerini yeniden kullanmak için izin iste

İzin iste

Etiketler

Bibliyometrik AnalizMitokondriyal DinamiklerOksidatif StresMitofajiFerroptozNLRP3 nflamazomuSGLT2 nhibit rleriMetabolomik

İlgili makaleler