Uygun bir mutant alel seçimini örneklendirmek için spook (spo) FlyBase gen rapor sayfası sunulmuştur. spo, steroid hormon biyosentezinde yer alan enzimleri kodlayan “Halloween” genlerinden biridir21,22 ve miyoblast füzyonunu desteklediği gösterilmiştir23. spo FlyBase gen rapor sayfasının “Alleles” (Aleller) bölümü, literatürde bildirilen 12 spo mutant alelini listeler; bunlardan dördü BDSC'ye kaydedilmiştir (Şekil 2A) ve kolayca temin edilebilir. İstenen alel BDSC aracılığıyla temin edilemiyorsa, mutant hattı ilk bildiren araştırma grubundan doğrudan talep edilebilir.
BDSC'den temin edilebilen dört mutant alel arasından, spo1 bir missense mutasyon (G481E) taşırken, spoMI06810 kodlama dizisi içinde, Y341 amino asidinde çerçeve kaymasına (frameshift) neden olan bir MiMIC insersiyonu içerir (Şekil 2B,C). Spo proteini 543 amino asitten oluştuğu için, spoMI06810 (Y341fs)'nin toplam uzunluğunun yaklaşık %40'ı eksik, kısalmış bir protein üreteceği öngörülmektedir ve bu nedenle muhtemelen güçlü bir fonksiyon kaybı (loss-of-function) alelini temsil etmektedir. Bu sebeple, miyoblast füzyonunun fenotipik analizi için spoMI06810, spo1 aleline tercih edilir.
Miyoblast füzyonu, embriyonik evre 12'de (yumurta yumurtlamasından [AEL] 7.3−9.3 saat sonra) başlar ve büyük ölçüde evre 15'in sonunda (11.3−13.3 saat AEL) tamamlanır24. Bu nedenle füzyon fenotipleri; somatik kas paterninin oluştuğu ve çoğu füzyon olayının tamamlandığı evre 15'in geç aşamasındaki embriyolarda değerlendirilir.
Evre 15 embriyoları iki belirgin morfolojik özellik ile tanımlanabilir: dorsal kapanmanın tamamlanması ve orta bağırsağın karakteristik kalp şeklindeki morfolojisinin kazanılması (Şekil 3A–C)19. Evre 14 embriyoları devam eden baş involüsyonu ile ayırt edilebilirken (Şekil 3A), evre 15 embriyoları karakteristik kalp şeklinde orta bağırsak sergiler (Şekil 3B). Evre 16 embriyoları, orta bağırsak daralması ve dört odacığın (gastrik sekumlar; Şekil 3C) oluşumu ile tanımlanabilir19. Ek olarak, MHC protein ekspresyonu evre 14 dahil daha erken evrelerde saptanamazken, evre 15 ve sonraki evrelerde güçlü hale gelir (Şekil 3A–C).
Geç embriyonik 15. evrede, vahşi tip (w1118) embriyolarda vücut duvarı kas yapısı tamamen şekillenmiştir ve çoğu abdominal hemisegment lateral görünümde özdeş, stereotipik bir kas paterni sergiler (Şekil 3B). Bu stereotipik kas paterni, tavşan veya sıçan anti-MHC antikorları kullanılarak görselleştirilebilir (Şekil 3B,D). Buna karşılık, embriyolar dorsal veya ventral yönde görüntülendiğinde daha az kas lifi görülür (Şekil 3E,F). Bu nedenle, embriyoların lateral yönde görüntülenmesi, tüm vücut duvarı kas yapısının görselleştirilmesine olanak tanır ve miyoblast füzyon kusurlarının değerlendirilmesini kolaylaştırır.
Miyoblast füzyon kusurlarını incelemek için, homozigot mutant embriyoların vücut duvarı kas yapısının lateral oryantasyonda görüntülemesi yapılır. Homozigot mutantlar, GFP veya YFP gibi floresan bir dengeleyici (balancer) markörün yokluğu ile tanımlanır. Örneğin, spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP ebeveynlerden türetilen homozigot spo mutant embriyolar GFP negatiftir; öte yandan, dengeleyiciyi taşıyan kardeş embriyolar mezodermde GFP ekspres eder (Şekil 4B,C). Yabanıl tip ve GFP pozitif kardeş embriyolarla karşılaştırıldığında, spo mutant embriyolar, çok sayıda birleşmemiş füzyon yetenekli miyoblastın (FCM'ler; Şekil 4A–C) varlığı ile karakterize edilen bir miyoblast füzyon kusuru sergiler.
Özellikle, spo mutant embriyolarının yüzey kesitine (Z1) kıyasla, daha derin optik kesitlerde (Z3 ve Z4) daha fazla kaynaşmamış FCM gözlemlenmektedir (Şekil 4B). Bu dağılım, embriyonik miyoblast kaynaşması sırasında kurucu hücrelerin ve FCM'lerin mekansal organizasyonunu yansıtmaktadır. Kurucu hücreler ve büyüyen miyotüpler öncelikle mezodermin yüzeysel tabakasında yer alırken, FCM'ler büyüyen miyotüplere doğru göç edip onlarla kaynaşmadan önce daha derin tabakalarda bulunur25. Sonuç olarak, kaynaşmamış miyoblastlar, özellikle kısmi kaynaşma kusurları olan embriyolarda, daha derin konfokal kesitlerde daha boldur. Bu nedenle, kaynaşma fenotipinin şiddetinin olduğundan az tahmin edilmesini önlemek için vücut duvarı kaslığının tüm derinliğini kapsayan z-yığınlarının alınması gereklidir.
Lateral oryantasyonda genel vücut duvarı kaslığının görselleştirilmesi, miyoblast füzyon defektlerinin fenotipik değerlendirmesine olanak tanısa da, DA1 kasının dorsal oryantasyonda görselleştirilmesiyle kantitatif analiz gerçekleştirilebilir. Yabanı tip embriyolarda, DA1 kası tamamen oluşmuştur ve 13,03 ± 0,60 Eve-pozitif çekirdek içerir (Şekil 5A,C). spo mutant embriyolarda, DA1 kasındaki Eve-pozitif çekirdek sayısı 8,16 ± 0,54'e düşmüştür (Şekil 5B,C); bu durum, daha az sayıda FCM'nin DA1 kurucu hücresiyle kaynaştığı bir füzyon defektine işaret eder. Tutarlı ve tekrarlanabilir bir kantifikasyon için, aynı abdominal hemisegmentlerin (A2−A5) DA1 kaslarındaki Eve-pozitif çekirdekler sayılır ve embriyo başına ortalaması alınır; her embriyodan elde edilen ortalama, istatistiksel analiz için tek bir veri noktası olarak kullanılır (Şekil 5C).

Şekil 1: Drosophila embriyolarında miyoblast füzyonunun genetik, fenotipik ve kantitatif analizi için iş akışı. İş akışı; uygun mutant stoklarının seçimi, embriyo toplama ve fiksasyonu, tüm vücut immün boyama ve montaj, embriyo evreleme ve görüntüleme işlemlerini içerir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: FlyBase kullanılarak mutant alellerin seçimi. (A) spo için FlyBase gen rapor sayfasının ekran görüntüsü. Mutant aleller “Alleles” bölümünde listelenmiştir. Stocks sütunu (kutulu), mevcut stok sayısını belirtirken, Refs sütunu (kutulu) ilişkili referans sayısını belirtmektedir. (B,C) İki temsilci spo mutant alelinin, spo1 (B) ve spoMI06810 (C), moleküler lezyonları. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: Drosophila embriyonik kas yapısı. (A–C) 14, 15 ve 16. evrelerdeki yabani tip (WT) embriyoların faz-kontrast görüntüleri, MHC boyalı z-projeksiyon konfokal görüntüleri ve birleştirilmiş görüntüleri. 14. evre embriyoda (A) baş involüsyonu belirgindir (ok uçları). 15. evre embriyoda (B) karakteristik kalp şeklinde bir orta bağırsak (kesikli çizgi) gözlemlenirken, 16. evre embriyoda (C) orta bağırsak dört ayrı bölmeye (kesikli çizgiler) ayrılmıştır. MHC protein ekspresyonu 14. evrede (A) saptanamaz ancak 15. (B) ve 16. (C) evrelerde belirgin hale gelir. Embriyolar; ön taraf sol, arka taraf sağ, dorsal taraf yukarı ve ventral taraf aşağı olacak şekilde yan görünümde gösterilmiştir. Torasik (T1–T3) ve abdominal (A1–A8) hemisegmentler belirtilmiştir. (D) 15. evre WT embriyoda kas yapısının rat anti-MHC antikoru kullanılarak görselleştirilen yan görünüm konfokal görüntüsü. Diğer panellerdeki görüntüler için rabbit anti-MHC antikoru kullanılmıştır. (E,F) 15. evre WT embriyolarda kas yapısının dorsal (E) ve ventral (F) görünümlerinin z-projeksiyon konfokal görüntüleri. Dorsal ve ventral yönelimlerde, yan yönelime kıyasla daha az kas lifi görülmektedir. Ölçek çubuğu = 50 µm. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 4: Yaban tip ve spo mutant embriyolar arasındaki kas yapısının karşılaştırılması. (A) Geç evre 15 WT embriyosunun yan görünümündeki vücut duvarı kas yapısına ait temsili konfokal z-yığın görüntüleri. Miyoblast füzyonu tamamlanmıştır ve kaynaşmamış miyoblast gözlenmemektedir. MHC yeşil renkte gösterilmiştir. (B) spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP ebeveynlerden elde edilen GFP-negatif bir spo mutant embriyosunun yan görünümündeki vücut duvarı kas yapısına ait temsili konfokal z-yığın görüntüleri. GFP floresanının (kırmızı) yokluğu, embriyonun spoMI06810 için homozigot olduğunu gösterir. Ok uçları temsili kaynaşmamış miyoblastları belirtmektedir. Embriyo yüzeyine (Z1) kıyasla daha derin optik kesitlerde (Z3 ve Z4) daha fazla kaynaşmamış miyoblast gözlenmektedir. MHC yeşil renkte gösterilmiştir. (C) Aynı spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP ebeveynlerden elde edilen GFP-pozitif kardeş embriyonun yan görünümüne ait konfokal görüntüler. TM3 balansla üzerindeki twi>UAS-GFP transgeni tarafından yönlendirilen mezodermal GFP ekspresyonu (kırmızı), GFP-pozitif kardeş embriyoları GFP-negatif homozigot spo mutant embriyolardan ayırır. MHC yeşil renkte gösterilmiştir. Ölçek çubuğu = 20 µm. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 5: DA1 kaslarının temsili konfokal z-yığın görüntüleri ve nicelendirmesi. (A,B) Anti-MHC (yeşil) ve anti-Eve (kırmızı) ile işaretlenmiş geç evre 15 WT (A) ve spo mutant (B) embriyolarının dorsal görünümlerine ait konfokal z-yığın görüntüleri. Kas içindeki tüm çekirdekleri yakalamak için konfokal z-yığınları, Eve-pozitif DA1 kasının tüm derinliği boyunca elde edilmiştir. Eve-pozitif çekirdekler, MHC sinyali içinde boyanmamış bölgeler olarak görünmektedir. Temsili bir DA1 kası kesikli çizgi ile çevrelenmiş ve DA1 kası içindeki Eve-pozitif çekirdekler numaralandırılmıştır. (C) WT ve spo mutant embriyoların DA1 kaslarındaki Eve-pozitif çekirdeklerin nicelendirmesi. Her genotip için sekiz embriyo nicelendirilmiştir. Her bir veri noktası, tek bir embriyonun A2–A5 hemisegmentlerindeki DA1 kaslarındaki ortalama çekirdek sayısını temsil eder. Veriler ortalama ± SD (kırmızı çubuklar) olarak sunulmuştur. İstatistiksel anlamlılık, iki yönlü Student's t-testi kullanılarak belirlenmiştir; p < 0.0001. Ölçek çubuğu = 20 µm. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
| BDSC stok numarası | Genotip | Amaç |
| 6873 | N1/FM7c, twi>UAS-GFP | Mezodermal GFP ekspresyonu, GFP-negatif, homozigot mutant embriyoların tanımlanmasına olanak tanır. |
| 6662 | wgGla-1/CyO, twi>UAS-GFP |
| 6663 | Dr.Mio/TM3, twi>UAS-GFP |
| 23229 | baz4/FM7c, Dfd-YFP | Başa özgü YFP ekspresyonu, YFP-negatif, homozigot mutant embriyoların tanımlanmasına olanak tanır. |
| 23230 | SNA (Sodyum-Potasyum Adenozin Trifosfataz)Kapsam/ CyO, Dfd-YFP |
| 23232 | Dr.1/TM6B, Dfd-YFP |
Tablo 1: Balansör kromozomlar üzerinde floresan marker geni taşıyan Drosophila stokları.