Elektroakupunktur, kronik kalp yetmezliği olan sıçanlarda kalp fonksiyonlarını iyileştirir ve miyokardiyal hasarı azaltır
EA'nın CHF üzerindeki etkilerini değerlendirmek için, LAD koroner arter ligasyonu aracılığıyla sıçır modeli oluşturulmuş, ardından spesifik EA veya Sham EA müdahaleleri uygulanmıştır. Ekokardiyografi, biyokimyasal analizler ve histolojik boyama dahil olmak üzere sistematik değerlendirmeler yapılmıştır (Şekil 2A). Fonksiyonel olarak, CHF grubu ventrikül dilatasyonu ve kontraktilite bozulması göstermiştir. EA tedavisi, CHF sıçanlarında gözlenen LVEF ve LVFS azalmalarını iyileştirirken, Sham EA grubu CHF grubuyla karşılaştırılabilir kalp fonksiyon seviyeleri sergilemiştir (Şekil 2B ve Şekil 2C).
Ayrıca, EA serum NT-proBNP ve cTnT seviyelerini düşürerek kardiyak yükün azaldığını ve miyokardiyal hasarın hafifletildiğini göstermiştir. Buna karşın, Sham EA grubu, CHF grubu ile benzer biyokimyasal parametreler sergilemiştir (Şekil 2E,F). Histolojik analiz, CHF grubunda miyokardiyal yapısal hasar ve fibrozis olduğunu ortaya koymuştur. EA tedavisi miyokardiyal mimariyi iyileştirmiş ve CVF'yi azaltmışken, Sham EA grubu CHF grubuna benzer patolojik değişiklikleri ve CVF seviyelerini korumuştur (Şekil 2D). Genel olarak EA, CHF'ye karşı kardiyoprotektif etkiler göstermiş, Sham EA müdahalesi ise benzer terapötik sonuçlar üretmemiştir.
Elektroadakupunktur, kronik kalp yetmezliği olan sıçanların nucleus tractus solitariusundaki nöronları aktive eder
NTS'nin EA tedavisine verilen merkezi yanıtta rol oynayıp oynamadığını belirlemek için, nöral eksitasyon belirteci olan c-Fos boyaması yapılarak nöronal aktivasyon değerlendirildi. İmmünofloresan görüntüleme (Şekil 3A) ve kantitatif hücre sayımları (Şekil 3B), NTS'deki c-Fos pozitif nöron sayısının Sham grubuna kıyasla CHF grubunda daha düşük olduğunu ortaya koydu. Bununla birlikte, EA tedavisi c-Fos ekspresyonunu Sham baseline seviyeleriyle karşılaştırılabilir düzeylere yükseltti. Periferik fonksiyonel sonuçlarla paralel olarak, Sham EA grubu, CHF grubu ile benzer c-Fos ekspresyon seviyeleri sergiledi.
Bu NTS nöronlarının fonksiyonel durumunu değerlendirmek için in vivo elektrofizyolojik sinyaller kaydedilmiştir. Spike boşalma izleri (Şekil 3C) ve kantitatif ortalama ateşleme hızı (Şekil 3D), histolojik bulgularla uyumluydu. NTS nöronlarının spontan ateşleme frekansı, CHF koşulları altında azalmıştır. Buna karşılık, EA müdahalesi nöronal ateşleme hızını artırırken, Sham EA prosedürü böyle bir elektrofizyolojik değişiklik oluşturmamıştır.
Bu nöral aktivasyon örüntüsü, lokal alan potansiyeli analizi ile desteklenmiştir. 2D LFP renk ölçekli spektrogramlarda ve 3D güç spektral yoğunluk haritalarında (Şekil 3E) gösterildiği üzere, NTS içindeki nöral osilatuar enerji CHF durumunda azalmıştır. EA tedavisi sonrasında, nöral frekans spektrumu genelinde güç yoğunluğunda bir artış gözlemlenmiş olup, bu durum Sham EA kohortunda görülmeyen bir ağ aktivasyonuna işaret etmektedir.
Bu merkezi aktivasyonun fizyolojik ilişkisini incelemek için, periferik kardiyak metrikler ile merkezi NTS nöronal aktivitesi entegre edilerek Pearson korelasyon analizi gerçekleştirilmiştir (Şekil 3F). Analiz, NTS içindeki ortalama ateşleme hızının ve c-Fos ekspresyonunun LVEF ile pozitif korelasyon gösterdiğini kanıtlamıştır. Aksine, bu merkezi nöral aktivite göstergeleri, serum kalp yetmezliği belirteci NT-proBNP ile negatif bir korelasyon sergilemiştir. Bu korelasyonlar, EA tarafından modüle edilen NTS'nin nöral aktivasyonunun, periferik kardiyoprotektif etkinliği ile bağlantılı olduğunu göstermektedir.
Elektroakupunktur, nucleus tractus solitarius'taki global proteomik profili değiştirir
Önceki fonksiyonel değerlendirmeler sırasında Sham EA grubunda terapötik etkinlik gözlemlenmemesi nedeniyle, proteomik aşamasına yalnızca Sham, CHF ve EA grupları dahil edilmiştir. Doku toplamadan önce, EA'nın terapötik etkilerini değerlendirmek amacıyla grup başına 12 sıçan ekokardiyografik değerlendirmeye tabi tutulmuş ve bu sonuçlar Ek Şekil 1A'da sunulmuştur. Bu değerlendirmenin ardından, her gruptan 6 biyolojik replikat kütle spektrometrisi tabanlı kantitatif proteomik analize tabi tutulmuştur.
Proteomik verilerin güvenilirliğini ve genel dağılımını değerlendirmek için kalite kontrol ve çok değişkenli analizler gerçekleştirilmiştir. Tanımlanan toplam protein sayısı Sham grubunda 5.914, CHF grubunda 5.980 ve EA grubunda 5.836 olarak belirlenmiş olup, bu durum üç deneysel grup arasında karşılaştırılabilir protein tespitine işaret etmektedir (Şekil 4A ve Ek Tablo 1). Kısmi en küçük kareler diskriminant analizi; Sham, CHF ve EA grupları arasında net bir ayrım olduğunu göstermiş ve hastalık durumu ile EA müdahalesiyle ilişkili belirgin küresel proteomik profiller olduğunu ortaya koymuştur (Şekil 4B).
İkili ortogonal kısmi en küçük kareler diskriminant analizi, Sham ve CHF grupları (Şekil 4C) ile CHF ve EA grupları (Şekil 4D) arasındaki ayrımı daha da belirginleştirmiştir. İlgili permütasyon testleri, söz konusu modellerin güvenilirliğini desteklemiştir. Ayrıca, Pearson korelasyon ısı haritası, proteomik örnekler arasında yüksek grup içi korelasyonlar ve belirgin gruplar arası modeller göstererek biyolojik tekrarların tekrarlanabilirliğini desteklemiştir (Şekil 4E). Toplu olarak, bu kalite kontrol ve çok değişkenli analizler, proteomik veri setinin, farklı şekilde eksprese edilen proteinlerin sonraki tanımlamaları ve biyoinformatik analizleri için yeterince sağlam olduğunu göstermiştir.
Elektroakupunktur, nucleus tractus solitarius'taki temel farklı şekilde ifade edilen proteinleri ve sinyal yolaklarını modüle eder
EA'nın moleküler hedeflerini araştırmak için protein değişiklikleri analiz edilmiştir. Volkan grafikleri, Sham'a karşı CHF ve CHF'ye karşı EA karşılaştırmalarında yukarı regüle edilen ve aşağı regüle edilen proteinlerin dağılımını göstermiştir (Şekil 5A, Ek Tablo 2 ve Ek Tablo 3). Terapötik hedefleri belirlemek için bir kesişim analizi gerçekleştirilmiştir. Venn diyagramlarında gösterildiği üzere, CHF grubunda yukarı regüle olan ancak EA tedavisi sonrası aşağı regüle olan 58 protein ile CHF grubunda aşağı regüle olan ve EA müdahalesiyle yukarı regüle olan 27 protein belirlenmiştir (Şekil 5B ve Ek Tablo 4). Bu tarama sonucunda toplam 85 temel diferansiyel ekspresyon gösteren protein elde edilmiştir. Hiyerarşik kümeleme ısı haritası, EA müdahalesinin bu 85 proteinin anormal ekspresyon modellerini modüle ederek profillerini Sham baz hattına doğru kaydırdığını göstermiştir (Şekil 5C).
Bu temel hedeflerin biyolojik fonksiyonlarını belirlemek için, iki farklı protein alt kümesi için ayrı ayrı GO ve KEGG zenginleştirme analizleri gerçekleştirilmiştir. EA tarafından aşağı regüle edilen 58 proteinlik alt küme için GO kabarcık grafiği; hücre dışı matris organizasyonu ve hücre dışı yapı organizasyonu dahil olmak üzere biyolojik süreçlerin yanı sıra, dış kapsülleyici yapı ve kolajen trimer gibi hücresel bileşenlerin ve kolajen bağlanması ile glutamat reseptör bağlanması dahil olmak üzere moleküler fonksiyonların önemli ölçüde zenginleştiğini göstermiştir (Şekil 5D ve Ek Tablo 5). Kiriş ve Sankey diyagramları kullanılarak görselleştirilen sonraki KEGG yolak analizi, bu 58 proteinin protein sindirimi ve emilimi, kas hücrelerindeki hücre iskeleti ve TGF-β sinyal yolu dahil olmak üzere kaskadlara katıldığını ortaya koymuştur (Şekil 5E ve Ek Tablo 6). Bu topolojik görselleştirmeler, COL3A1, COL14A1, MYH11, DCN ve DPF2 dahil olmak üzere belirli proteinleri, birden fazla patolojik yolağı birbirine bağlayan belirgin düğümler olarak vurgulamıştır.
Buna karşılık, EA müdahalesi ile yukarı regüle edilen 27 proteinlik alt küme için fonksiyonel anotasyon gerçekleştirilmiştir. GO zenginleştirme analizi, hücre büyümesinin düzenlenmesi ve DNA şablonlu transkripsiyon elongasyonunun pozitif düzenlenmesi gibi biyolojik süreçlerin yanı sıra, kalsiyuma bağımlı protein bağlanması ve tetrapirol bağlanması gibi moleküler fonksiyonların yer aldığını göstermiştir (Şekil 5F ve Ek Tablo 7). İlgili KEGG kord ve Sankey diyagramları, bu proteinleri ATP-bağımlı kromatin yeniden şekillenmesi ve polikomb baskılayıcı kompleks dahil olmak üzere kritik yolaklarla eşleştirmiştir (Şekil 5G ve Ek Tablo 8). Özellikle, bu ağ haritalaması; YY1, E2F2 ve ENTPD5 gibi, bu merkezi sinyal ağları arasında köprü kuran anahtar proteinleri belirlemiştir. Bu kapsamlı fonksiyonel katmanlandırma, sonraki temel hedef doğrulaması için yapısal temeli oluşturmuştur.
Ağ topolojisi ve ekspresyon profilleme, YY1'i elektroakupunktur müdahalesinin etkileriyle ilişkili bir aday hedef olarak tanımlar
85 diferansiyel eksprese edilen protein arasından hub geni belirlemek için bir protein-protein etkileşim ağı oluşturulmuştur. Topolojik analiz, yüksek bağlantı skorlarına sahip 18 düğüm belirlemiştir (Şekil 6A ve Ek Tablo 9). Ardından, özellikle bu 18 hub protein için KEGG yolak analizi gerçekleştirilmiştir. İlgili kord ve Sankey diyagramları; bu hublar ile ATP bağımlı kromatin yeniden düzenleme, polikomb baskılayıcı kompleks ve TGF-β sinyal yolu dahil olmak üzere zenginleşmiş sinyal kaskadları arasındaki karmaşık ilişkileri haritalandırmıştır (Şekil 6A ve Ek Tablo 10). Bu fonksiyonel profillemeye dayanarak, daha ileri tarama için en belirgin şekilde zenginleşmiş ilk 10 protein seçilmiştir. EA'nın terapötik hedefi merkezi sinir sisteminde yer aldığından, bu 10 aday GTEx insan dokusu ekspresyon veritabanı kullanılarak değerlendirilmiştir (Şekil 6B ve Ek Şekil 1B–J). Sonuçlar, beyin dokularında yalnızca YY1 (Şekil 6B), DMAP1 (Ek Şekil 1C) ve DPF2'nin (Ek Şekil 1D) eksprese edildiğini göstermiştir.
EA'nın yüksek düzeyde yanıt veren aday hedefini izole etmek için, NTS dokularının kullanıldığı in vivo moleküler deneyler gerçekleştirilmiştir. Beyinle zenginleşmiş 3 adayın transkripsiyonel yanıt verebilirliğini değerlendirmek için kantitatif gerçek zamanlı PCR kullanılmıştır. YY1'in mRNA ekspresyonu CHF koşullarında azalmış ve EA tedavisi sonrası artmışken, DPF2 ve DMAP1'in mRNA ekspresyon seviyeleri deneysel gruplar arasında istatistiksel olarak anlamlı bir değişiklik göstermemiştir (Şekil 6C). Bu transkripsiyonel tarama, DPF2 ve DMAP1'i daha ileri doğrulama aşamalarının dışında bırakmış ve YY1'i birincil yanıt veren aday olarak desteklemiştir. Ardından yapılan Western blot analizi, YY1 protein seviyelerinin Sham baz çizgisine kıyasla CHF grubunda azaldığını, EA müdahalesinin ise bu eğilimi tersine çevirerek YY1 protein ekspresyonunu artırdığını göstermiştir (Şekil 6D ve Şekil 6E). Bu deneysel sonuçlar, EA'nın NTS içerisinde YY1 ekspresyonunu yukarıye düzenlediğini göstermektedir.
YY1 ekspresyonunu yöneten upstream düzenleyici mekanizmaları araştırmak için, bununla ilişkili histon modifikasyonları ve transkripsiyon faktörleri analiz edilmiştir. Bu bulguların yalnızca Cistrome Data Browser'dan elde edilen hesaplamalı biyoinformatik öngörülere dayandığını ve doğrudan deneysel ChIP-seq doğrulamasını temsil etmediğini belirtmek önemlidir. Epigenetik öngörüler; H3K27ac, H3K27me3 ve H3K4me3 dahil olmak üzere, YY1 lokusu için yüksek düzenleyici potansiyel skorlarına sahip olan histon modifikasyonlarını öne çıkarmıştır (Şekil 6F). Eş zamanlı olarak, düzenleyici potansiyel skorlaması; CDK9, PRDM1 ve ELL2 gibi transkripsiyon faktörlerini YY1'in upstream düzenleyicileri olarak tanımlamıştır (Şekil 6G). Bu biyoinformatik öngörüler, NTS'de YY1 ekspresyonunu kontrol eden potansiyel epigenetik ve transkripsiyonel ağları ana hatlarıyla belirtmektedir.
Özetle, sunulan veriler, EA müdahalesinin CHF farelerinde sistemik kalp fonksiyonlarını etkili bir şekilde iyileştirdiğini ve miyokard hasarını hafiflettiğini göstermektedir. Bu periferik kardiyoprotektif etkiler, merkezi düzeyde NTS içindeki nöronal ateşleme aktivitesinin ve nöral osilatuar enerjinin geri kazanımıyla birlikte seyretmektedir. Ayrıca, kantitatif proteomik tarama 85 temel diferansiyel eksprese protein tanımlamış ve transkripsiyon faktörü YY1'i oldukça duyarlı bir aday hedef olarak öne çıkarmıştır. Toplu olarak bu bulgular, EA'nın CHF'ye karşı terapötik etkinliğinin NTS nöral fonksiyonunun geri kazanımı ile yakından ilişkili olduğunu ve YY1'in yukarı regülasyonunun bu merkezi nörobiyolojik sürece dahil olabileceğini göstermektedir.
Veri Kullanılabilirliği
Bu çalışmanın bulgularını desteklemek için üretilen ve analiz edilen tüm veriler, makalede ve makalenin Ek Dosya 1'inde yer almaktadır. Kamuya açık veri erişilebilirliği gerekliliğine uymak amacıyla, bu araştırmanın temelini oluşturan tüm mevcut ham veriler Zenodo kamu deposuna aktarılmış olup şu bağlantı üzerinden ücretsiz olarak erişilebilir durumdadır: https://doi.org/10.5281/zenodo.22030720. Ek destekleyici veriler, makul talep üzerine sorumlu yazarlardan temin edilebilir.

Şekil 1: Deneysel tasarım, kronik kalp yetmezliği sıçan modelinin oluşturulması ve elektroakupunktur müdahalesi. (A) İki bağımsız deneysel seri için zaman çizelgesi ve grup dağılımını içeren genel deneysel akış şeması. (B) LAD koroner arter ligasyonu öncesi ve sonrası temsilci elektrokardiyogram kayıtları; oklar, miyokardiyal iskemiyi doğrulayan ST-segment yükselmesini göstermektedir. (C) Başarılı modellemeyi doğrulamak için cerrahiden 4 hafta sonra yapılan LVEF nicel analizi (biyolojik tekrarlar n = 6, ortalama ± SD). ***p < 0.001, Sham grubuyla karşılaştırıldığında. (D) Bilateral HT7 akupunktur noktalarına uygulanan EA müdahalesi. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 2: Elektroakupunktur, kronik kalp yetmezliği olan sıçanlarda kardiyak fonksiyonları iyileştirir ve miyokardiyal hasarı azaltır. (A) 4 deneysel grup boyunca miyokardiyal dokuların hematoksilin-eosin ve Masson trikrom boyama görüntülerinin yanı sıra temsili M-mod ekokardiyogramlar (ölçek çubuğu = 50 µm). (B) Gruplar arasında LVEF'nin kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 6, ortalama ± SD). ***p < 0.001 Sham grubuna kıyasla; ###p < 0.001 CHF grubuna kıyasla; ns, CHF grubuna kıyasla anlamlı değil. (C) Gruplar arasında LVFS'nin kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 6, ortalama ± SD). ***p < 0.001 Sham grubuna kıyasla; ###p < 0.001 CHF grubuna kıyasla; ns, CHF grubuna kıyasla anlamlı değil. (D) Gruplar arasında CVF'nin kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 3, ortalama ± SD). ***p < 0.001 Sham grubuna kıyasla; ##p < 0.01 CHF grubuna kıyasla; ns, CHF grubuna kıyasla anlamlı değil. (E) Gruplar arasında serum NT-proBNP seviyelerinin kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 6, ortalama ± SD). ***p < 0.001 Sham grubuna kıyasla; ###p < 0.001 CHF grubuna kıyasla; ns, CHF grubuna kıyasla anlamlı değil. (F) Gruplar arasında serum cTnT seviyelerinin kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 6, ortalama ± SD). ***p < 0.001 Sham grubuna kıyasla; ###p < 0.001 CHF grubuna kıyasla; ns, CHF grubuna kıyasla anlamlı değil. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 3: Elektroakupunktur, kronik kalp yetmezliği olan sıçanlarda nucleus tractus solitarius'taki nöronal aktiviteyi geri kazandırır. (A) Gruplar genelinde NTS'deki c-Fos ekspresyonunun temsili immünofloresan görüntüleri. Çekirdekler DAPI ile karşı boyanmıştır ve c-Fos pozitif hücreler yeşil boyanmıştır. Kesikli çizgiler anatomik bölgeyi belirler ve beyaz ok uçları temsili c-Fos pozitif nöronları gösterir (ölçek çubuğu = 30 µm). (B) Gruplar genelinde c-Fos pozitif hücre sayılarının kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 3, ortalama ± SD). ***p < 0.001 Sham grubuna göre; ###p < 0.001 CHF grubuna göre; ns, CHF grubuna göre anlamlı değil. (C) Gruplar genelinde NTS'nin temsili in vivo elektrofizyolojik spike boşalma izleri. (D) Gruplar genelinde ortalama nöronal ateşleme hızının kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 3, ortalama ± SD). ***p < 0.001 Sham grubuna göre; ###p < 0.001 CHF grubuna göre; ns, CHF grubuna göre anlamlı değil. (E) NTS içindeki nöral osilatuar enerjiyi gösteren temsili 2D lokal alan potansiyeli spektrogramları ve 3D güç spektral yoğunluk topografileri. (F) Periferik kardiyovasküler fenotipler ile santral nöral aktivite parametreleri arasındaki ilişkileri değerlendiren korelasyon matrisi. Kırmızı ve mavi daireler sırasıyla pozitif ve negatif korelasyonları gösterir. **p < 0.01; ***p < 0.001. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 4: Nucleus tractus solitarius'taki proteomik profillerin kalite kontrolü ve çok değişkenli istatistiksel değerlendirmesi. (A) 3 deneysel grup genelinde tanımlanan proteinlerin kantitatif genel görünümü (biyolojik tekrarlar n = 6). (B) Gruplar arasındaki genel uzaysal dağılımı ve ayrımı gösteren kısmi en küçük kareler ayrım analizi skor grafiği. (C) Sham ile CHF karşılaştırması için model güvenilirliğini doğrulayan ortogonal kısmi en küçük kareler ayrım analizi skor grafiği ve ilgili permütasyon testi (200 permütasyon). (D) CHF ile EA karşılaştırması için model güvenilirliğini doğrulayan ortogonal kısmi en küçük kareler ayrım analizi skor grafiği ve ilgili permütasyon testi (200 permütasyon). (E) Tüm proteomik örnekler genelinde grup içi tekrarlanabilirliği ve gruplar arası varyansı değerlendiren Pearson korelasyon katsayılarının hiyerarşik kümeleme ısı haritası. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 5: Nucleus tractus solitarius'ta elektroakupunktur ile modüle edilen temel diferansiyel eksprese proteinlerin tanımlanması ve fonksiyonel zenginleştirme analizi. (A) Sham ile CHF ve CHF ile EA karşılaştırmalarında yukarı regüle ve aşağı regüle proteinlerin dağılımını gösteren volkan grafikleri. (B) EA müdahalesi sonrası aşağı regüle ve yukarı regüle temel proteinleri belirlemek için kesişim analizini haritalandıran Venn diyagramları. (C) Temel diferansiyel eksprese proteinlerin ekspresyon profillerine ait hiyerarşik kümeleme ısı haritası. (D) Aşağı regüle protein alt kümesi için zenginleştirilmiş biyolojik süreçleri, hücresel bileşenleri ve moleküler fonksiyonları detaylandıran GO baloncuk grafikleri. (E) Aşağı regüle proteinler tarafından zenginleştirilen sinyal yolaklarını haritalandıran KEGG koro ve Sankey diyagramları. (F) Yukarı regüle protein alt kümesi için zenginleştirilmiş biyolojik süreçleri, hücresel bileşenleri ve moleküler fonksiyonları detaylandıran GO baloncuk grafikleri. (G) Yukarı regüle proteinler tarafından zenginleştirilen sinyal yolaklarını haritalandıran KEGG koro ve Sankey diyagramları. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 6: Ağ topolojisi, doku ekspresyon profili ve moleküler doğrulama, YY1'in elektroakupunktur ile ilişkili bir aday hedef olduğunu belirler. (A) Belirlenen hub proteinlerin protein-protein etkileşim ağı, akor diyagramı ve Sankey diyagramı. (B) GTEx veritabanından türetilen YY1'in insan doku ekspresyon profili; kırmızı kutu beyin dokularını vurgulamaktadır. (C) Gruplar genelinde NTS'deki YY1, DPF2 ve DMAP1 mRNA ekspresyonlarının kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 6, ortalama ± SD). **p < 0.01, ***p < 0.001 Sham grubuna kıyasla; ###p < 0.001 CHF grubuna kıyasla; ns, CHF grubuna kıyasla anlamlı değil. (D) Gruplar genelinde NTS'deki YY1 ve β-actin'in temsili Western blot bantları. (E) Gruplar genelinde YY1 protein ekspresyonunun kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 3, ortalama ± SD). ***p < 0.001 Sham grubuna kıyasla; #p < 0.05 CHF grubuna kıyasla. (F) Düzenleyici potansiyel skorlarına dayalı olarak YY1 lokusunu düzenleyen epigenetik histon modifikasyonlarının biyoinformatik tahmini. (G) Düzenleyici potansiyel skorlarına dayalı olarak YY1 lokusunu düzenleyen yukarı akış transkripsiyon faktörlerinin biyoinformatik tahmini. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.

Şekil 7: HT7 noktasındaki elektroakupunktur, YY1 yukarı regülasyonu, nucleus tractus solitarius'taki nöronal aktivitenin geri kazanılması ve kronik kalp yetmezliğinin iyileşmesi arasındaki ilişkiye dair önerilen model. (Sol) Patolojik Durum: LAD koroner arter ligasyonu ile indüklenen CHF modelinde, NTS içindeki nöronal aktivite azalır ve buna transkripsiyon faktörü YY1'in baskılanması eşlik eder. Bu merkezi nöral inhibisyon; LVEF'de azalma, miyokardiyal fibroziste artış ve serum kalp yetmezliği belirteçlerinde yükselme olarak kendini gösteren patolojik kardiyak remodelingle ilişkilidir. (Sağ) EA Tedavisi: HT7 akupunktur noktasındaki EA müdahalesi, NTS'de YY1 ekspresyonunu yukarı regüle eder ve nöronal ateşlemeyi geri kazandırır. Bu merkezi nöromodülasyon, patolojik remodelingi hafifleterek ve sistemik kardiyak fonksiyonu iyileştirerek kardiyoprotektif etkiler gösterir. Bu şeklin daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Şekil 1: Proteomik kohortun kardiyak fonksiyon değerlendirmesi ve aday hub genlerin insan dokusu ekspresyon profilleri. (A) Gruplar genelinde LVEF ve LVFS'nin kantitatif analizi (biyolojik tekrarlar n = 12, ortalama ± SD). ***p < 0.001 Sham grubuyla karşılaştırıldığında; ###p < 0.001 CHF grubuyla karşılaştırıldığında. (B-J) GTEx veri tabanından türetilen; COL3A1 (B), DMAP1 (C), DPF2 (D), FMOD (E), MYH11 (F), E2F2 (G), LUM (H), DCN (I) ve COL14A1 (J) dahil olmak üzere aday hub genlerin insan dokusu ekspresyon profilleri.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Tablo 1: Nukleus traktus solitarius'taki global proteomun kapsamlı tanımlama ve nicelik matrisi.Bu tablo, tüm deneysel kohortlardaki eksiksiz kantitatif proteomik veri setini sunmaktadır. Önemli sütunlar arasında Protein ID (UniProt erişim numarası), Gene (gen sembolü), First.Protein.Description (fonksiyonel açıklama) ve Sham, CHF ve EA gruplarındaki (grup başına n = 6) her bir biyolojik replika için normalize edilmiş protein yoğunluk değerleri yer almaktadır.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Tablo 2: Sham ve CHF karşılaştırmasındaki proteinler için OPLS-DA değişken önem projeksiyon skorları.Bu tablo, OPLS-DA modeline göre Sham ve CHF gruplarını ayıran özellikleri listelemektedir. Temel sütunlar arasında özellik (belirli protein/genin tanımlayıcısını temsil eder) ve her bir özelliğin grup ayrımına katkısını belirten VIP_değeri (Değişken Önem Projeksiyonu) (eşik değer VIP > 1.0) yer almaktadır.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Tablo 3: CHF ile EA karşılaştırmasındaki proteinler için OPLS-DA değişken önem projeksiyon skorları.Bu tablo, OPLS-DA modeline dayanarak CHF ve EA gruplarını ayıran özellikleri listelemektedir. Tablo S2'ye benzer şekilde, özellik sütununu ve karşılık gelen VIP_value değerini içererek EA müdahalesine en duyarlı özellikleri vurgulamaktadır.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Tablo 4: Elektroakupunktur tarafından modüle edilen, diferansiyel olarak eksprese edilen 85 temel proteinin detaylı listesi.Bu tablo, CHF ile önemli ölçüde değişen ve ardından EA müdahalesiyle geri döndürülen proteinlerin kesişimini sunmaktadır. Önemli sütunlar arasında Protein_ID, Gen, ekspresyon varyasyonunu belirten log2FC (log2 Kat Değişimi), istatistiksel anlamlılık için P_value (eşik değer p < 0,05) ve model katkısını değerlendiren VIP_value yer almaktadır.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Tablo 5: Downregüle edilen çekirdek protein alt kümesinin Gen Ontolojisi zenginleştirme analizi.Bu tablo, EA tarafından downregüle edilen 58 protein için Gen Ontolojisi (GO) fonksiyonel anotasyonunu göstermektedir. Önemli sütunlar arasında ONTOLOGY (Biyolojik Süreç [BP], Hücresel Bileşen [CC] ve Moleküler Fonksiyon [MF] olarak kategorize edilmiştir), fonksiyonel Açıklama, p.adjust (çoklu testler için düzeltilmiş p-değeri) ve her terimde zenginleşen spesifik genlerle eşleşen geneID yer almaktadır.Lütfen bu dosyayı indirmek için buraya tıklayın.
Ek Tablo 6: Azalmış ekspresyona sahip çekirdek protein alt kümesinin Kyoto Gen ve Genom Ansiklopedisi (KEGG) yol zenginleştirme analizi.Bu tablo, ekspresyonu azalmış 58 protein için zenginleşmiş sinyal yolaklarını göstermektedir. Temel sütunlar arasında yolak Terimi, zenginleşmenin istatistiksel anlamlılığını belirten Düzeltilmiş p-değeri ve her bir yolakta yer alan spesifik kesişen Genler bulunmaktadır.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Tablo 7: Yukarı yönlü regüle edilen çekirdek protein alt kümesinin Gen Ontolojisi zenginleştirme analizi.Bu tablo, EA tarafından yukarı yönlü regüle edilen 27 proteinin Gen Ontolojisi (GO) fonksiyonel açıklamasını göstermektedir. Format ve sütun tanımları (ONTOLOGY [BP, CC, MF], Açıklama, p.adjust, geneID), Tablo S5'te detaylandırılanlarla aynıdır.Lütfen bu dosyayı indirmek için buraya tıklayın.
Ek Tablo 8: Yukarı regüle edilen çekirdek protein alt kümesinin Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes yolak zenginleştirme analizi.Bu tablo, yukarı regüle edilen 27 protein için zenginleştirilmiş sinyal kaskadlarını göstermektedir. Format ve sütun tanımları (Terim, Düzeltilmiş p-değeri, Genler), Tablo S6'da ayrıntıları verilenlerle aynıdır.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Tablo 9: Protein-protein etkileşim ağından türetilen 18 hub proteinin topolojik bağlantı skorları.Bu tablo, temel hub genleri belirlemek için kullanılan ağ topolojik parametrelerini özetlemektedir. Ana sütunlar arasında gen adı ile her bir düğümün biyolojik ağ içindeki bağıl önemini ve bağlantısını nicelleştiren Derece (Degree), Arasındalık Merkeziyeti (Betweenness Centrality) ve Yakınlık Merkeziyeti (Closeness Centrality) gibi merkezi ağ metrikleri yer almaktadır.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Tablo 10: 18 ağ merkez proteininin Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes yol zenginleştirme analizi.Bu tablo, tanımlanan 18 merkez protein tarafından özel olarak zenginleştirilen spesifik sinyal yollarını sunmaktadır. Temel sütunlar arasında yol Terimi, anlamlılık için Düzeltilmiş p-değeri ve fonksiyonel zenginleştirmeyi sağlayan ilgili Genler yer almaktadır.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.
Ek Dosya 1: Veri analizi ve görselleştirme için kullanılan R betikleri ve kırpılmamış Western blot görüntüleri. Ek dosya; Pearson korelasyon analizi, çift volkan grafiği oluşturma ve EA ile tersine dönen proteinlerin belirlenmesi, Gen Ontolojisi (GO) zenginleştirme analizi, hiyerarşik kümeleme ısı haritası oluşturma, Kyoto Gen ve Genom Ansiklopedisi (KEGG) zenginleştirme görselleştirmesi, ortogonal kısmi en küçük kareler ayrım analizi (OPLS-DA) ve permütasyon testi, kısmi en küçük kareler ayrım analizi (PLS-DA), proteomik örnek korelasyon ısı haritası oluşturma ve Venn diyagramı analizi için kullanılan R betiklerini içermektedir.Bu dosyayı indirmek için lütfen buraya tıklayın.