Name: Yetişkin Drosophila melanogaster Locomotion Yüksek Çözünürlüklü Video Takip (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2009-02-20T00:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 8 s
Description: Öğrenin, Drosophila melanogaster yetişkin sineklerde lokomosyon davranışlarını anestezi kullanmadan yüksek çözünürlüklü video takip sistemiyle nasıl nicelendireceğinizi. Bu yöntem davranışsal nörobilim araştırmalarını geliştirir.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma, Sağlık Hibe R01 GM54408 LC Griffith verilen Ulusal Sağlık Enstitüleri tarafından da desteklenmiştir. Fred Wolf Biz bizim kare odasının tasarımı ve tayini, Frank Mello, Odamızın, bina ve analiz konularla ilgili yararlı konuşmalar için Dan Valente ve Tim Lebestky Brandeis Üniversitesi makine atölyesi kurma tüm yardımlarından dolayı teşekkür etmek istiyorum.

Bölüm 1: sinek Besleme ve Yönetim <ol><li> Sinekler, maya-standart medya içeren şişelerde yetiştirilen olmalıdır. Bu sinekler çok sayıda ihtiyaç, bu yüzden haçlar buna göre ayarlanması gerekir. 25 º C&#39;de karanlık döngüsü: Sinekler, 12 saat ışık altında yetiştirilen olmalıdır </li><li> Sinekler, kısa bir süre eclosion sonra (1-3 gün) alınmalıdır. Sinekler Bu aşamada az karbondioksit difüzör ile birlikte çalıştı ve otoklav veya maya-medya içeren test tüpleri içine sıralanır olmalıdır. Biz, sadece, saklı erkeklerde 10 bir test tüpünde kullanın. </li><li> Davranışsal deneyler çalıştırmadan önce karbon dioksit kullanımdan sonra en az bir veya iki gün izin verin. Biz ECLOSION takiben 3-5 gün bizim davranış tahlil sinek çalıştırın. </li><li> Tahliller sirkadiyen ritim sorunları önlemek için her zaman aynı 2-3 saatlik zaman penceresi her gün içinde yapılmalıdır. </li></ol> Bölüm 2: kontrollü bir ortamda izleme sistemi kurma <ol><li> Bütün deneyler,% 70 nem oranı ile 25 º C sabit sıcaklık sağlayan bir ortam odada yapılır. </li><li> Askıya alma (kamera aşağı bakacak şekilde) kayıt altına alan üzerinde bir dijital video kamera. Bizim izleme yazılımı kontrast tabanlı olduğu için, bir ışık kutusu üzerinde kamera askıya aldı. Kamera kayıtları videoların doğrudan bir firewire bağlantısı üzerinden bir Dell bilgisayar üzerine. Biz bir Dell bilgisayar, Windows MovieMaker ile bağladım video edinimi için bir Sharp dijital video kamera, (Vista sürümü) kullanın. </li><li> Hava bakliyat bu protokolü uygulanmalıdır, hava akışı için bir kaynak odasında mevcut olmalıdır. Kauçuk borular kullanarak, hava filtreleme için bir karbon filtre hava kaynağı bağlamak. </li><li> Daha fazla kauçuk borular kullanarak, içi boş bir lastik tıpa ile bir Erlenmeyer şişesinin karbon filtresi diğer tarafında bağlanmak ve su yaklaşık bir buçuk inç şişeyi doldurun. Bu hava nemlendirme. </li><li> Balon tabancası, kauçuk borular aracılığı ile Y-şekilli kapak bağlanmak olmalıdır. </li><li> Y-valf bir dal, bir debimetre bağlı olmalıdır. Diğer şube kare lokomosyon odasına hava ulaştırmaları gerekmektedir. </li></ol> Bölüm 3: lokomosyon odasına sinek teslim <ol><li> Kare lokomosyon odası, Wolf ve ark tasarım 2002 1, odanın içinde uçan sinek önlemek için küçük bir damla tepsiler ilavesi ile . Odasının dışında alınacak ve tüm bileşenleri,% 70 etanol ile iyice sildi ve kullanmadan önce kurutulmuş olmalıdır. </li><li> Anestezi, hemen davranışsal analiz yapmadan önce potansiyel performansı bozabilir. Bunu önlemek için, sinek küçük bir çıkış ile bir huni kullanarak odasına yavaşça serdi. Doğru büyüklükte bir çıkış yapmak için, bir huni sonuna kadar mavi pipet ucu (P1000) ekleyebilirsiniz. Geçmesi için yeterli bir sinek açılış büyük yapmak için pipet ucu sonuna kesmek için makas kullanın. </li><li> Odamızın üst kenarlarında vida ile sabitlenir pleksiglas küçük bir parça. Vidaları çıkarılır, delikler sinekler odasına teslim etmek için kullanılabilir. Vida deliği bir vida normal oturur yerine doğrudan iç haznesi üzerinde oturur böylece pleksiglas üst konumda. Sineklerin içeren bir test tüpü alın ve sonra vida deliği konulmalıdır huni üzerinde baş aşağı yerleştirin. </li><li> Bu sinekler zarar veya zarar verebilir, huni hareket yapmayın. Bütün sinekler odasının içine kadar yerine yavaşça, tüm, tüm oda bang huni ve. Bu çalıyor bu beceriyor şok absorbe etmek için bir mouse pad yapılmalıdır. Sinekler içinde iken, huni kaldırmak ve pleksiglas üst vida yatakları üzerinde yeniden konumlandırın. Yerleştirin sonra yeniden pleksiglas üst vida. </li></ol> Bölüm 4: lokomotor Testi Koşu <ol><li> Sinekler düzgün bir şekilde yüklendikten sonra, onlara 30 dakika boyunca odasına gelmesini sağlar. Bu aklimasyonundan süre kontrollü bir ortamda (25 º C,% 70 nem) yer almalı ve odanın ışık kutusunun üstünde yer almalıdır (açık olmalıdır). Diğer oda ışıkları kapatın. </li><li> Aklimasyonundan döneminin ardından, hava debimetre akacaktır, hava akış sistemi Y-valf geçiş. Hava açın ve istenilen hızı (4,0-6,0 L / dk) hava kadar rampa. Biz genellikle 5.0-5.5 L / dk, ancak bu aralıktaki herhangi bir hızda çalışacak kullanın. </li><li> İstenen boranasi elde sonra hava lokomosyon odasına akar, böylece, Y-valf geçin. Zaman bu hava 15 saniye boyunca nabız ve sonra aniden hava kapatmak. Hava kapatmak, kamera kayıt moduna geçiş yapın. (Bu bölüm, tek seferde her şeyi pratik gerektirir). </li><li> Kaydı durdurmak ve istenilen süre sonra SAKLAYIN. Biz, saniyede 10 kare (genotip için en az 8 çalışma) 30 saniyelik çalışmalarda kayıt. </li></ol> Bölüm 5: Video Analizi <ol><li> Biz kullanımıDinamik Görüntü Analiz Sistemi (DİAS) 2 hareketi izleme yazılımı 3.2. Bu yazılımı kullanmak için, öncelikle Quicktime 7.5.5 ile videolarınızı AVI dosya biçimi dönüştürmek. </li><li> Kontrast dayalı sinekler izlemek için, fonksiyon &quot;Eşik tarafından autotrace&quot; kullanın. Daha sonra bu izleri dijital ortama aktarmak için fonksiyon &quot;İzleme olun Yol&quot; kullanabilirsiniz. </li><li> Her sineğin anlık hızları çıkış için, bir veritabanı dosyası (DİAS özel) üretmek için &quot;Compute Parametreleri&quot; fonksiyonunu kullanabilirsiniz. Bu işlevi kullanarak, biz de bir &quot;5,15,60,15,5&quot; Tukey Smoothing Pencere kullanarak veri pürüzsüz. </li><li> Bu bilgileri bir veritabanı dosyası olarak outputted sonra, Microsoft Excel&#39;de açılabilir. Biz excel içinde anlık hızları derlemek ve hareket dinamiklerini ve butik yapısını anlamak için gerekli ek parametreleri hesaplamak için bir Matlab komut dosyası kullanabilirsiniz. </li></ol> Temsilcisi Sonuçlar: Şekil 1, vahşi tip Kanton G organizmalar (Şekil 1, sol panel) temsilcisi izlerini gösterir ve iki büyük örtüşen silmeler (Df (3R) x307 ve Df (3R) x313) (Şekil 1 geçerek oluşturulan dCASK gen için null uçar , sağ panel). dCASK boş sinekler daha önce Kanton S ile karşılaştırıldığında, Buridan Kullanıcı Paradigma 3 kullanarak lokomotor sorunlar var, ve bir paradigma olmuştur, bunlar büyük ölçüde hareketlilik azalma göstermektedir . Biz her zaman koşullar ve davranış, belirli bir günde normal aralık içinde olduğundan emin olmak için ilk vahşi tip organizmalar çalıştırmak. Biz test gün% 5&#39;inden az, standart tepkileri sapmalar gözlemledik. Söz konusu farklılıklar genellikle bizim kontrollü bir ortamda parametreleri ile ilgili sorunlar isnat edilebilir. <img src="/files/ftp_upload/1096/figure_1.png" alt="" width="600" height="298" /> Şekil 1 DİAS oluşturulan Kanton G vahşi tür sinek (üstte, solda) ve üst üste silmeler (üstte, sağda) ile oluşturulan lokomotor eksikliği dCASK Boş uçar hem de izleri. Izleri kaydedilen videoları görülür temsil eder. 8-10 sinekler iki resim contrain bir hava darbesinin izlerini aşağıdaki video izleme tayininde 30 saniye boyunca çalışır. <img src="/files/ftp_upload/1096/figure_2.png" alt="" width="600" height="438" /> Şekil 2 Wild tip sinekler, bir hava nabız (mor çubuklar) lokomotor assay (üstte) ve bir hava darbesi (mavi) olmadan çalıştırmak . Analiz programı tarafından hesaplanan tüm parametreler, bu iki durum arasında anlamlı bir fark (iki kuyruklu Student t-testi ile belirlenen) vardı. Bu, kurulum normal bir hava darbe sonrasında locomote uçar göstermektedir.

<ol><li>Wolf, F. W., Rodan, A. R., Tsai, L. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-Resolution+Analysis+of+Ethanol-Induced+Locomotor+Stimulation+in+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22J+Neurosci%22%5BJournal%5D)">High-Resolution Analysis of Ethanol-Induced Locomotor Stimulation in Drosophila.</a> J Neurosci. 22 (24), 11035-11044 (2002).</li>
<li>Soll, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+use+of+computers+in+understanding+how+animal+cells+crawl%5BTitle%5D)+AND+%22International+review+of+cytology%22%5BJournal%5D)">The use of computers in understanding how animal cells crawl.</a> International review of cytology. 163, 43-104 (1995).</li>
<li>Martin, J. R., Ollo, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+new+Drosophila+Ca2%2B%2Fcalmodulin-dependent+protein+kinase+%28Caki%29+is+localized+in+the+central+nervous+system+and+implicated+in+walking+speed%5BTitle%5D)+AND+%22The+EMBO+journal%22%5BJournal%5D)">A new Drosophila Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase (Caki) is localized in the central nervous system and implicated in walking speed.</a> The EMBO journal. 15 (8), 1865-1876 (1996).</li>
<li>Levine, J. D., Funes, P., Dowse, H. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Resetting+the+Circadian+Clock+by+Social+Experience+in+Drosophila+melanogaster%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Resetting the Circadian Clock by Social Experience in Drosophila melanogaster.</a> Science. 298, 2010-2012 (2002).</li>
</ol>

Kurulumda, orta derecede güçlü bir hava nabız geçici fly hareketini durdurur. Hava darbe sona erdiğinde, sinekler, Şekil 2&#39;de gösterildiği gibi, bu durağan durum ve normal locomote serbest bırakılır. Bu hava darbe etkili nüfusun lokomosyon senkronize Çünkü, biz, biz de bir ivme kıran uyaranı takiben hareket başlangıcında çalışma böylece deneme başlamak için de kullanabilirsiniz. Başlanmasının ardından, lokomotor parametreleri hava darbesi (Şekil 2) etkilenmez beri tahlil, ancak, bir hava darbe olmadan yapılabilir. <...

<table><tbody><tr><td>Kare Hazne</td><td>Araç</td><td>Machine Shop</td><td>YOK</td><td>Wolf &lt;em&gt;et al.&lt;/em&gt; 2002&lt;sup&gt;1&lt;/sup&gt; tasarımından</td></tr><tr><td>Dijital Kamera</td><td>Kamera</td><td>Sharp</td><td>ViewcamZ VL-23</td><td></td></tr><tr><td>Akışölçer</td><td>Araç</td><td>Cole-Parmer</td><td>SY-32003-12</td><td></td></tr><tr><td>Işık Kutusu</td><td>Araç</td><td>DNASTAR</td><td>Seq-Easy</td><td></td></tr><tr><td>Kömür Filtre</td><td>Araç</td><td>Fisher Scientific</td><td>09-744-37</td><td></td></tr><tr><td>DIAS 3.2</td><td>Yazılım</td><td>Soll technologies</td><td>YOK</td><td>www.solltechnologies.com</td></tr></tbody></table>

yetişkin drosophila melanogaster locomotion yüksek Çözünürlüklü video takip

High-Resolution Video Tracking of Locomotion in Adult Drosophila Melanogaster

Sinekler, bu alandaki araştırmacılar genetik araçları bolluğu nedeniyle karmaşık davranışlar eğitim için önemli bir model sağlar. Lokomotor davranışlarının incelenmesi<em&gt; Drosophila melanogaster</em&gt; Hareket sırasında ya da belirli bir görev için yanıt değişiklikleri ölçmek için mümkün yeteneğine dayanıyor. Bu nedenle, biz bu yazıda tarif eden biri olarak bir yüksek çözünürlüklü video izleme sistemi, gerçek zamanlı olarak lokomosyon ölçmek için değerli bir araçtır. Protokol, kare bir odasında 1 / 32 filme dönemi takip eden sinekler momentum, kırmak için bir başlangıç ​​hava darbe kullanımını gerektirir. Bir izleme programı daha sonra 10 milisaniye aralıklarla odanın içinde her sineğin anlık hızını hesaplamak için kullanılır. Analiz yazılımı daha sonra bu verileri derler ve anesthetization veya immobilizasyon olmaksızın sinekler işleme Bu protokol, davranışsal görevler için uygun beslenme ve sinek yönetimi ele alacak, ortalama hız, maksimum hız, hareket için harcanan zaman, ivme, vb gibi çeşitli parametrelerin çıkışları kontrollü bir ortamda oluşturulması, ve tahlil çalışan baştan sona.

Karmaşık lokomotor davranış çalışma<em&gt; Drosophila melanogaster</em&gt; Yeteneği belirli bir sineğin hareket değişiklikleri ölçmek için bağımlı. Bu makale, yüksek çözünürlüklü bir izleme sistemi ile bunun nasıl yapılacağını gösteriyor.

Yetişkin Drosophila melanogaster Locomotion Yüksek Çözünürlüklü Video Takip

Sinekler, bu alandaki araştırmacıların erişebildiği çok sayıda genetik araç nedeniyle karmaşık davranışların incelenmesi için önemli bir model sunmaktadır. ... incelemek

Video takip analizinde, sinekler anestezi kullanılmadan kare bir gözlem odasına yerleştirilmelidir. Bunun için, sinekleri odanın içine düşürmek amacıyla küçük bir huni, odadaki vida delikleriyle hizalanmalıdır. Bu huni kullanıldıktan sonra, vidalar odanın deliklerini kapatır ve lokomosyonu başlatmak için hava menfezleri aracılığıyla bir hava darbesi uygulanır.Hazeranın üzerine asılmış bir video kamera, bu lokomosyonu yakalar ve sineklerin izlediği yolların takip edilip analiz edildiği bir bilgisayara gönderir. Merhaba, ben Brandeis Üniversitesi Biyoloji Bölümü'ndeki Griffith Laboratuvarı'ndan Justin Slawson. Bugün sizlere lokomosyonun yüksek çözünürlüklü video takibi için bir prosedür göstereceğiz.Yetişkin sineklerde lokomotor davranışı incelemek için laboratuvarımızda bu prosedürü uygulayacağız. Öyleyse başlayalım. Deneye başlamak için, sinekleri maya içermeyen standart besiyeri içeren şişelerde yetiştirin.Bu protokol çok sayıda sinek gerektirdiğinden, çaprazlamaların buna göre kurulması gerekir. Sinekler 25 °C'de, 12 saatlik ışık-karanlık döngüsünde yetiştirilmelidir. Sinekleri Aus'tan bir ila üç gün sonra toplayın; sinekleri maya içermeyen besiyerli test tüplerine ayırmak için b

high-resolution-video-tracking-locomotion-adult-drosophila

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Bu videoda, genel hareket kabiliyetlerini değerlendirmek için serbestçe yürüyen sineklerin nasıl izleneceği açıklanmaktadır. Öne çıkan protokol, video izleme yazılımı kullanarak tahlilin kurulumunu ve veri analizini gösterir.

Serbestçe Yürüyen Sineklerin İzini Sürmek: Drosophila'da Hareketi Değerlendirmek İçin Bir Yöntem

Drosophila melanogaster gibi spontan lokomotor aktivite gibi davranışları etkileyen genetik veya çevresel manipülasyonlar okuyan yararlıdır. Burada kızılötesi ışınları ve spontan lokomotor aktivitesini ölçmek için veri analiz yazılımı ile monitör kullanan bir protokol açıklar.

Olarak spontan lokomotor aktivitenin belirlenmesi<em&gt; Drosophila melanogaster</em

Burada bir yanal bakış açısıyla Drosophila yetişkin ve larva mutant fenotip yüksek kaliteli dijital video elde etmek için basit ve yaygın olarak erişilebilir mikroskopi tekniği açıklar.

Yüksek-Kalite Dijital Video Edinme Drosophila Bir Yanal Perspektifinden Larva ve Yetişkin Davranışları

Otomatik izleme sistemi Flywalk Drosophila melanogaster koku güdümlü davranış yüksek çözünürlüklü ölçümü için kullanılır.

Koku kılavuzluğunda Davranış Yüksek çözünürlüklü Niceleme<em&gt; Drosophila melanogaster</emKullanma&gt;<em&gt; Flywalk</em&gt; Paradigma

Biz FLLIT, serbestçe Drosophila melanogaster ve diğer böcekler hareket bacak pençe hareketi izleme için tam otomatik bir makine öğrenme yöntemi kullanmak için ayrıntılı protokoller açıklar. Bu protokoller, vahşi sinekler, mutant sinekler ve nörodejenerasyon modelleri sinek ince yürüyüş hareketleri nicel ölçmek için kullanılabilir.

Özellik Öğrenme Bacak Segmentasyon ve İzleme (FLLIT) kullanarak Serbestçe Hareket Eden Böceklerde Tam Otomatik Bacak Takibi

Bu protokol, basit bir yetişkin Drosophila davranış gözlem odasının nasıl yapılır ve gözlem odasındaki farklı meyve sineklerinin morfolojisinin veya davranışının yüksek çözünürlüklü fotoğraflarının / videolarının nispeten basit ve uygun fiyatlı yöntemlerle nasıl çekılacağını açıklar.

Drosophila Yetişkinlerinin Davranışsal Çalışmaları için Ayarlanabilir Yüksek Çözünürlüklü Görüntüleme Sistemi

Mevcut protokol, Drosophila'nın lokomotor aktivitesini, hız, mesafe vb. parametreleri hesaplamak için yüksek tanımlı video kaydına dayalı olarak her karenin piksellerini segmentlere ayırmak için eklentilerle uyumlu açık kaynaklı yazılım Fiji'yi kullanarak el yapımı bir arenada sineklerin hareketini izleyerek ve analiz ederek değerlendirir.

Drosophila'da Lokomotor Aktiviteyi Test Etmek İçin Basit Bir Teknik

Burada, pupa evresinde Drosophila bacağının uzun süreli canlı görüntülenmesi için pupariumun tamamen çıkarılmasını içeren bir protokol sunulmaktadır. Bu protokol diğer dokulara da uygulanabilir.

Puparium çıkarıldıktan sonra Drosophila pupa bacak gelişiminin uzun süreli canlı görüntülenmesi

Protokol, geleneksel memeli modellerine bir alternatif olarak lokomotor disfonksiyonun nicelleştirilmesi yoluyla meyve sineğindeki nörotoksisiteyi değerlendirmek için yüksek verimli, uygun maliyetli bir yöntem sunar. Farmasötik bileşiklerin, çevresel ajanların veya genetik modifikasyonların nörotoksik etkilerini hassas, tekrarlanabilir ve etik açıdan uygun bir model kullanarak değerlendirmeyi amaçlar.

Drosophila melanogaster'de Lokomotor Disfonksiyonun Nörotoksisite için Bir Okuma Olarak Davranışsal Analizi

Atmosfer basıncında zararsız görünen gazlar, hiperbarik koşullarda narkoz gibi davranışlara yol açabilir. Geleneksel hiperbarik basınç odaları maliyetli ve emek yoğundur. Bu çalışma, ksenonun Drosophila melanogaster üzerindeki etkilerini, 4 atm'nin altındaki orta basınçlarda incelemek için basit ve düşük maliyetli bir yöntem sunmaktadır.

Drosophila melanogaster için Xenon Anestezi ile Hiperbarik Basınç Sisteminin Doğrulanması

Öğrenin, Drosophila melanogaster yetişkin sineklerde lokomosyon davranışlarını anestezi kullanmadan yüksek çözünürlüklü video takip sistemiyle nasıl nicelendireceğinizi. Bu yöntem davranışsal nörobilim araştırmalarını geliştirir.

Yetişkin Drosophila melanogaster Locomotion Yüksek Çözünürlüklü Video Takip

Daha fazla video keşfet