Genomik DNA 5-hydroxymethylcytosine seçici Yakalama

Bu prosedürün genel amacı, yeni keşfedilen bir DNA modifikasyonu olan beş hidroksietil sitokini etiketlemek ve yakalamak, önce genomik DNA'yı sonikasyonla parçalamak, ardından azid glikoz kısımlarını Qlik kimyası kullanarak DNA üzerindeki beş hidroksietil sitidin kalıntısına aktarmak için bir beta gluk glikoz transferaz reaksiyonu gerçekleştirmektir. Biyotinillenmiş DNA üretmek için Azid grubuna bir salit biyotin bağlayıcısı takın. Daha sonra, streptavidin boncukları üzerinde yoğunluktan bağımsız bir şekilde DNA fragmanları içeren beş hidroksietil sitidin seçici olarak yakalayın.

Saflaştırılmış beş hidroksietil sitidin ile zenginleştirilmiş DNA fragmanı, yeni nesil dizileme de dahil olmak üzere sonraki analizler için kullanılabilir. Bu tekniğin antikor antikor bazlı yaklaşım gibi mevcut yaklaşıma göre en büyük avantajı, phy hidroksietil sitozinin yakalanmasının PHY C yoğunluğundan bağımsız olmasıdır. Laboratuvarda kıdemli bir araştırma görevlisi olan Eugene Lee bu protokolü gösterecek.