Name: Antikor boyamasında C. Elegans Freeze-Cracking kullanma (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2013-10-14T21:15:00.000+00:00
Duration: 13 min 10 s
Description: Öğrenin, C. elegans'ta protein lokalizasyonu için freeze-cracking yöntemiyle antikor boyaması yapmayı. Bu teknik, kimyasal işlemi en aza indirerek yarı bütün nematodlarda etkili boyama sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Fonlama NSF CCLI # 0633618 ve Ohio Üniversitesi tarafından sağlandı. Bazı suşları Caenorhabditis Genetiği Merkezi tarafindan temin edilmiştir. Lisansüstü öğrenci Reetobrata Basu video görüntülenir.

NOT: Birden fazla protokol adımları set-up ve deney özel koşullarına bağlı olarak hazırlanması için seçenekleri ile sunulmaktadır. Bu gibi durumlar için, alternatif adımlar alternatif adımlar Protokol, Şekil 1 &#39;de ana hatları ile A, B, C, vb olarak sunulmuştur. 1.. Polilisin Kaplı Slaytlar hazırlanması Slaytlar üç farklı hazırlama, göreceli yapışma ve antikorun spesifik olmayan bağlanma kolaylığı arasında arzu edilen ticaret-off bağlı olarak kullanılabilmektedir. Slayt hazırlama alternatifleri Detaylar yapışma ve karmaşıklığı artan sırayla adımları 1A-1C aşağıda verilmiştir. Bu farklı yöntemlerle hazırlanan slaytlar bir deneme için birlikte kullanılabilir. 1A. Hayır slayt hazırlama Ticari olarak temin edilebilen polilizin kaplı slaytlar düşük yapışma ve düşük arka plan sağlamak. 1B. Slayt prmetanol-aseton fiksasyonu Ayırma optimum Orta yapışma ve düşük arka plan. <ol><li> Slaytlar daldırma için bir polilisin çözelti hazırlayın: Çok yüksek moleküler ağırlığa sahip 400 mg ekleme - iki kez damıtılmış su, 200 ml (150,000 300,000 D), poli-L-lizin. Koruyucu madde olarak 2 ml% 10 sodyum azid stokları (nihai konsantrasyon% 0.1) eklenir. DİKKAT: kuru sodyum azid reaktiftir ve her türlü zehirlidir. Ağırlığında toz çift distile su içinde% 10 stok yapmak için ise maske ve eldiven giyin. </li><li> Tüy bırakmayan mendil, kaldırma leke ve partikülleri ile tek uç buzlu cam slaytlar silin. Bu atama ile satın slaytlar bile yapılmalıdır &quot;önceden temizlenir.&quot; </li><li> Yeri back-to-back slayt tutucu, coplin kavanoz veya diğer slayt boyama kap, (daha sonra ayırma kolaylaştırmak için) kadar ve oldukça mükemmel hizalanır buzlu kenarlarını tutmak kayar. % 70 etanol ile (reaktif derecesi alkol gerekli değildir) di% 1 HCI ile ile çanak içinde dilim tutucu yerleştirinsu dindirdi veya buzlanma seviyesine boyama kavanoza doldurun. 5 dk arasında, en az bir çözüm slaytlar sallayın. DİKKAT: Bu çözüm yıpratıcıdır, eldiven giyin. Not: Bu çözelti, (birkaç ay kadar) birkaç kez tekrar edilebilir. </li><li> 1 dakika için damıtılmış su içinde çalışan slaytlar durulayın. </li><li> 30-60 dakika boyunca 40-60 ° C fırın içine koyarak ya da oda sıcaklığında gece boyunca tutarak ya da bir toz ortamda tamamen kuru kayar. </li><li> 15 dakika rocker (unfrosted bölümlerini kapsayan) polilizin çözüm slaytlar inkübe. </li><li> Slaytlar kurumasını tekrarlayın. </li><li> Polilizin çözüm inkübasyon ve kurutma adımları tekrarlayın. </li><li> Böyle ince bir tartı spatula gibi bir ince metal bir nesne kullanarak slaytlar ayırın. Bu şekilde yapıştırılmış, bunlar ayırmak zordur. Uygun güvenlik ekipmanları (gözlük) giyin ve slaytlar ayrılmış küçük cam bit gevşek uçabilirsiniz beri, (kullanım sonrası atılmalıdır) tezgah üst kağıt üzerinde çalışır. </li><li> Temiz mağaza slaytlar4 ° C (tozsuz) slayt kutusu kadar gerekli. </li></ol> 1C. Formaldehit tespiti için hazırlık optimumu Slide En yüksek yapışma ancak yüksek arka plan. <ol><li> (Hava kurutma için) (fırında kurutma), tozsuz, fırın güvenli tabak veya düz bir tozsuz bir yüzeye yöntem 1B düz ile hazırlanan yer slaytlar. </li><li> Her slaytın ortasında polilizin çözümün bir 20-60 ul damla yerleştirin. </li><li> Tamamen bir fırında ya da oda sıcaklığında kuru kayar. Buharlaşır gibi polilizin soluk oval geride bırakacaktır. Bu oval çok yapışkan vardır. Ne yazık ki, bu aynı zamanda da bloke edildikten sonra, birincil ve ikincil antikorlar ile bağlanır. </li><li> 4 ° C&#39;de temiz (tozsuz) slayt kutusuna mağaza slaytlar kadar gerekli. </li></ol> 2. Dondurulmuş Nematod Slaytlar hazırlanması Tamamen (nematod plakaları) yöntemi 2A kullanılarak bakteri ya da ile durulanarak boyanması için nematod hazırlanması2B (bireysel nematodlara). 2A. Nematod slaytların plakalarından hazırlanması <ol><li> Prechill kuru buz üzerinde yassı bir metal parça yerleştirin. </li><li> Bir 1.5 ml mikrofüj tüpe bakterilerle NGM levhadan solucanlar durulamak için damıtılmış su ve bir cam pipet (solucanlar kayıplarını azaltır) veya mikropipet kullanın. Plakalar yaşları senkronize ya da karışık olabilir; gerekli olmadıkça (kırılması zor) birçok dauers ya da açlıktan solucanlar (artmış otofloresansı) ile tabak kullanmayın. </li><li> Bakteri ücretsiz kadar distile su ile Worms 3-4x durulayın. (Solucan kaybını azaltmak için aynı cam pipet kullanın.), Ya solucanlar pelet onları (tüpün dibinde çoğunlukla yetişkin toplamak için) 3-5 dakika bankta oturmak ya ~ 1,000 rpm&#39;de 30 saniye dönmeye izin vermek için (~ 500 Bir masaüstü santrifüj g) () yetişkin, larva ve embriyoların toplamak. </li><li> Solucanlar gibi suyun yaklaşık iki katı hacmi bırakarak, solucanlar ile borusundan su en çıkarın (ama en az 25 ul toplam hacmi). </li><li&gt; (1. adımda muamele) &quot;alt&quot; Etiket buzlu yan tezgahın üzerine silinmez mürekkep ve yer slaytlar ile polilizin slaytlar yanında kuru buz, etiket tarafı yukarı konteynere. </li><li> Mevcut düzenli (sildi temiz ama polilizin tedavi değil) &quot;top&quot; slaytlar eşit sayıda var. </li><li> Yer ~ &quot;alt&quot; yapışkan slayt ve pipet ucu yan kullanarak slaydın orta kısmı boyunca solucanları içeren sıvıyı yaymak su içinde 25 ul solucanlar. </li><li> Solucanlar 30 sn dk 2 için halledelim. Slayt uygun yapışkan ise, onlar slayt temasa olarak, solucanlar uçları sopa olacak. </li><li> Bir yandan alt slayt tutun ve buzlu parça ama tüm örtüşen böylece alt slayt üzerinde üst slayt yerleştirin. Solucanlar hala biraz hareket, böylece sıvı, biraz ayrı slaytlar tutmalı slaytlar birbiri üzerinde kaymasına izin vermeyin -. Bu solucanlar katlanmış. </li><li> Dikkatle s düz bastırınhafifçe üst slaytta, her elin başparmak ve işaret parmağı ile. Basınç ideal miktarda, slaytlar kenarında büyük çift cinsiyetli bir kaç yetişkin ve larvaların çoğu her slayt irtibata olurken, kırılacak ama sağlam kalacak. </li><li> Hemen ve dikkatlice (kaymadan) kuru buz üzerinde metal parçası üzerinde slaytları koydu. Slaytlar bir dakika içinde dondurulur görünmelidir. Iyice donmuş kadar 5 dakika boyunca kuru buz üzerinde tutmak. </li><li> Bu noktada, slaytlar birkaç gün boyunca -80 ° C&#39;de bir etiketli kutuda saklanabilir. (Onlar -80 ° C&#39;de hafta tutulursa, su uzak yüce başlayacak ve solucanlar gibi leke olmayacak). Slaytlar -80 ° C&#39;de saklanır, bunları çatlama önce 10 dakika boyunca kuru buz &#39;ısınmak&#39; let. </li><li> 3 (fiksasyon) adıma geçin. </li></ol> 2B. Bireysel nematod slaytların hazırlanması <ol><li> Çökeltmek için kuru buz üzerinde yassı bir metal parça yerleştirintepe. </li><li> Bakterilerden onları özgür bir NGM plaka üzerinde bir damla su bireysel nematod aktarmak için bir solucan cımbızı kullanın. Nematod (ler) eğer mümkünse, otoflüoresanı azaltmak için iyi beslenmiş olması gerekir. Gerektiği gibi solucan (ler) bakteri özgür olana kadar suya yeni noktalar transfer tekrarlayın. </li><li> Sonraki kuru buz, etiket tarafı yukarı konteyner için tezgahın üzerine silinmez mürekkep ve yer slaytlar ile &quot;alt&quot; polilizin slaytlar buzlu tarafını etiketleyin. Daha az yapışkan &quot;top&quot; eşit sayıda mevcuttur (işlenmemiş) slaytlar var. </li><li> Polilisin ile iki muamele edilmiş alt sürgünün bölgeye su 5-10 ul damla yerleştirin. Daha solucanlar transfer eğer tamamlanmadan önce buharlaşan su önlemek için, daha büyük bir hacmi kullanın. </li><li> Solucanlar yapışkan slayt yüzeyine dokunmak doğru batarken izlemek için mikroskop kullanarak, solucan almak ile su damlasına solucan (ler) aktarın. Damla başına birçok + 20 olarak solucanlara kadar az bir solucan aktarın. </li><li> Alt s tutunbir yandan lide ve buzlu parça ama tüm örtüşen böylece alt slayt üzerinde üst slayt yerleştirin. </li><li> Hemen ve dikkatlice (kayma veya sıkıştırma olmadan) kuru buz üzerinde metal parçası üzerinde slaytları koydu. 5-30 dakika boyunca kuru buz üzerinde tutun. (Slaytlar kolayca kurumasına gibi, bu slaytların uzun süreli tutmayın.) </li><li> 3 (fiksasyon) adıma geçin. </li></ol> 3. Tespit Sabitleyici iki çökeltilmesiyle &quot;düzeltme&quot;, hücrede yer antijen (&quot;hafif tespit&quot;) ya da çapraz bağlama (&quot;sert tespit&quot;) antijen için gereklidir. Fixation antijenitesini bozabilir; en bilinen antikorlar belirli bir sabitleme koşulu ile iyi çalışır. Yeni antikorlar için, sabitleme koşulları, bir dizi test edilmelidir. Herhangi bir tespit için ilk aşama, fosfat tamponlu tuzlu su çözeltisi yapmaktır. Yöntemi A (ışık kullanarak antikor boyama nematod ile sonraki düzeltme slaytlarmetanol ve aseton) veya B (formaldehit ya da glutaraldehit kullanılarak sert düzeltme) sabitleyin. <ol><li> 80 g NaCl, 2.0 g KCI, 27.2 g 2 HPO 4 • H Na ekleyerek steril 10x PBS (fosfat tamponlu tuzlu su) bir stok çözelti hazırlayın 2 0, 2.4 g KH 2 PO 4, 20 ml% 10 sodyum azid hazır. Bu stok solüsyonu yapmak için, iki kere damıtılmış su içinde% 10 çözelti yapmak için sodyum azid toz tartmak. Çözülene kadar yumuşak ısı ile tuzlu su karıştırın. DİKKAT: kuru sodyum azid reaktiftir ve her türlü zehirlidir. Kuru sodyumazid veya çözümleri ile çalışırken maske ve eldiven giyin. </li><li> 1-10 M NaOH ile 7.2 &#39;ye tuzlu serin (Tris pH duyarlı sıcaklığı) alalım, sonra pH. Çift distile su ve sterilize etmek için otoklav ile 1 L Top. Oda sıcaklığında saklayın ve steril çift distile su ile gerektiği gibi 1x sulandırmak. DİKKAT: NaOH kostik - Kullanım sırasında eldiven giyin. </li></ol> 3A. Metanol-aseton kullanılarak ışık düzeltme <ol><li> En az 10 dakika boyunca buz üzerinde prechill boyama kavanoz içinde% 100 metanol,% 100 aseton ve 1 x fosfat tamponlu tuzlu su (PBS) koyun. DİKKAT: Metanol ve aseton, toksik eldiven giyin. </li><li> , Kuru buz alt ve üst slaytlar bir çift almak hızla onları ayrı büküm ve hemen 2 dakika süreyle buz soğuk metanol &quot;alt&quot; slayt batırmak. &quot;Top&quot; slayt atılabilir. </li><li> 4 dakika boyunca soğuk aseton buz metanolden slaytlar aktarın. Slaytlar çok solucanlar olsaydı, (% 90) en çok bile iyi hazırlanmış slaytlar ile, düzeltme kapalı düşecek. Tek solucan slaytlar düzgün hazırlanmış olsaydı, solucanlar yapışık kalmalıdır. </li><li> Yerleştirin veya PBS (fiksatif durulayın) ile kavanoza slaytlar daldırma ve 4 (lekelenme) adıma geçin. </li></ol> 3B. Formaldehit ya da glutaraldehit kullanılarak sert düzeltme <ol><li> % 0.5-4 nihai konsantrasyona kadar 1x PBS içinde reaktif dereceli formaldehit veya glutaraldehit çözeltisi ile seyreltilir. Bu süspansiyonun tam bölenleri (1.5 mi) may sıkıca -20 ila -30 ° C&#39;de şapkalı saklanabilir, sadece kullanmadan önce buz üzerinde hacimde defrost. NOT: formaldehit çözeltiler, zaman içinde ve havaya maruz kalma ile bozulmasına yol açar. DİKKAT: formaldehit ve glutaraldehit eldiven ve kaputu çalışmak, zehirlidir. </li><li> , Kuru buz alt ve üst slaytlar bir çift almak hızla onları ayrı büküm ve hemen kapaklı düz çanak solucanlar ile &quot;alt&quot; slayt yerleştirin. (Üst slayt atılabilir). </li><li> Hemen solucanlar ile slayt alanının merkezi üzerinde 200 ul toksik Fiksatif pipetle. Sabitleştirici kısmen slayt daha büyük bir bölgeyi kapsayacak şekilde eritmek, sonra yerde dondurdu. </li><li> Solucanlar tamamen fiksatif ile kaplı değilse, derhal ve dikkatli bir mikropipet kullanarak daha fazla fiksatif ekleyin. Sabitleştirici slayt kenarına akmasına izin vermeyin. </li><li> Bir kapak ile çanak Kapak ve 10 dakika için oda sıcaklığında bir gece bekletin. Uzun inkubasyon ar eğer çanak nemlendirilir emin olunkullanılan e - Bu yemeğin katlanmış ıslak tüy bırakmayan bir mendil ekleyerek yapılabilir. Mendiller slaytlar dokunmasına izin vermeyin. </li><li> Tespit işlemi tamamlandıktan sonra, dikkatli bir şekilde 1.5 ml tüp içine gevşek solucanlarla fiksatif pipet ve PBS ile bir boyama kavanoza slayt daldırma. </li><li> Pelet 30 saniye boyunca yüksek hızda gevşek geldi solucan ile tüp dönerler. PBS ile iki kez solucanlar durulayın, daha sonra slaytlar üzerinde solucanlar (yerine slaytlar üzerinde daha mikrofuj tüpler, adımları yapıyor) ile paralel olarak işlemek. </li><li> 4 (lekelenme) adıma geçin. </li></ol> 4. Antikor Boyama Antikor boyama protokolü slaytlar üzerinde herhangi bir doku için, standart protokollere benzer. Bu protokol, bağımsız olarak 1-3 adımlar olarak hazırlanması tüm slaytlar için aynıdır. <ol><li> 700 ml iki defa damıtılmış su karıştırılarak antikor tamponu hazırlayın, 100 ml 10x PBS, 5 ml Triton X-100 (% 0.5 nihai), 2 ml 0.5 M EDTA, pH 8 (1 mM nihai), 1 g BSA (% 0.1 nihai), 5 ml% 10 sodyum azide çözeltisi (son% 0.05). HCI ile pH 7.2 &#39;ye, daha sonra 1 L iki kez damıtılmış su ekleyin; 4 ° C de saklamak </li><li> 45 ml antikor tamponu (son% 10 serum) 5 ml serum eklenmesi, daha sonra iki kez damıtılmış su ile yeniden oluşturulması ile hazırlanmıştır eşek serumu ile Block hazırlayın. </li><li> Antikor tamponu artı% 1 BSA içinde antikor seyreltilmesi ile primer ve sekonder antikor Çözümleri hazırlayın. Tavsiye edilen seyreltme sekonder antikor (birinci antikor yükseltmek için kullanılan türlere karşı Cy3or OG488 konjüge edilmiş eşek antikorlar) için primer antikorlar için 1:50-1:2,000 ve 1:1,000-1:5,000 bulunmaktadır. </li><li> Iki kere damıtılmış su içinde 2.5 mg / ml DAPI stokları karıştırılarak hazırlanması; -30 ° C de donduruldu 8 ul alikolar içinde depolamak DİKKAT: DAPI, zehirli bir DNA bağlayıcı boya olup tartım ve alikotlara Dağıtım sırasında eldiven giyin. </li><li> 200 mg n-propil gallat, karıştırılarak 10 ml montaj orta hazırlanması 0.3 ml 1 M Tris pH 9, 15 ml konik bir tüp içinde 2.7 ml iki kez damıtılmış su. Yaklaşık 10 dakika boyunca 65 ° C&#39;de ısı çözülene kadar.De 7 ml gliserol ve DAPI 8 ul alikot ve girdap ekleyin. Tümbölen orta 1.5 ml tüpler içine folyo ile sarın ve 4 ° C&#39;de karanlıkta saklayın (hava ve ışık hem de orta aşağılamak - o daha sarı olursa, Biohazard atık atmak). DİKKAT: n-propil galat ağırlığında iken eldiven aşınma, reaktif bir anti-oksidan olan. </li><li> 4 ° C (sert düzeltme için bir gecede tercih) oda sıcaklığında 1 saat veya gece boyunca Blok ile bir boyama kavanoz slaytlar aktarın. Kaybetme solucanları önlemek için sallayarak kaçının. </li><li> Transfer nemlendirilmiş çanağı ve üst 100-500 ul primer antikor ile her düz birincil antikor veya yer slaytlar ile kavanoz boyama slaytlar. Çalkalamadan 4 ° C&#39;de gece boyunca kuluçkaya bırakın. </li><li> Primer antikor inkübasyon sonunda, transfer PBS kavanoz boyama slaytlar. </li><li> 4 ° C&#39;de bir filtre kağıdı ile kaplı ve mağaza huniden filtre Block, steril filtre edilir, her 1-2 haftada ise, blok 1 ya da daha fazla ay için yeniden kullanılabilir. Benzer şekilde, filtre ve tasarruf(boyanma kadar 10 veya daha fazla tur için) yeniden kullanım için 4 ° C &#39;de primer antikor. </li><li> Durulama antikor tamponu içinde üç kez (~ 20 dk) kayar. </li><li> Bir ışık geçirmez bir kap içinde boyama ikincil antikor slaytlar koyun ve 4 ° C&#39;de ya da gece boyunca oda sıcaklığında, 4 saat inkübe </li><li> Transferi PBS kavanoz boyama slaytlar. Filtre ve (boyanma kadar 10 veya daha fazla tur için) yeniden kullanım için 4 ° C&#39;de ikincil antikor kaydedin. </li><li> Durulama antikor tamponu içinde üç kez (~ 20 dk) kayar. </li><li> Transferi PBS slaytlar ve montaj için hazır kadar (dakika gecede 4 ° C) PBS içinde bırakın. </li><li> Slayt önündeki solucanlar ıslak kalmak böylece, tek tek slaytlar hızla çalışın. Bir tüy bırakmayan silin geri slayt kuru, PBS itibaren bir slayt çıkarın ve kağıt havlu üzerinde bir yer. </li><li> Yeri ~ slayt ve yavaşça iki çözüm karıştırmak için tilt slayt üzerinde orta ve PBS yaklaşık olarak eşit parçalar vardır ki solucanlar üzerinde montaj orta 20 ul. CautION: Montaj orta toksiktir. </li><li> Tilt slayt yani buzlu kenarı alt ve çözüm buzlanma yakın toplar, sonra çözüm üzerinde 24 x 60 mm lamel bir kenarını yerleştirin. </li><li> Yavaşça (ağartma artırmak ve görüntüleme bozabilir) hava kabarcıklarını minimize etmek lamel indirin. Kabarcıklar oluşturur, daha sonra solucanlar üzerinde lamel kayma olmadan relower, yavaşça lamel kenarını kaldırın. </li><li> Dikkatli bir tüy bırakmayan silin ile kenarları sıkıştırarak, lamel hareket ettirmeden slayt kenarından kurulayın. Sürgünün nispeten kuru kenar tüm lamel kenarında görülebilmelidir </li><li> Oje 2-3 katmanları ile lamel mühür. Slaytlar hazırlanması ve ışıktan korumak için depolama esnasında düz bir slayt tutucu yerleştirilebilir. Slayt iyi mühürlü ve kuru sonra, slayt lamel ve geri temizleyin. </li><li> Iyi-kapatılmış slaytlar -20 ° C &#39;de 4 ° C veya haftada gün boyunca karanlıkta tutulabilir Uzun süreler üzerinde, DAPI staDNA ve en yeşil boyalarla (örneğin 488 nm uyarma) fade adencilik. Herhangi bir yağ daldırma lens kullandıktan sonra gerekirse daha fazla oje, örneğin ile lamel kapatın. </li></ol>

<ol><li>Harlow, E., Lane, D. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHarlow%2C+E+%22Antibodies%3A+A+Laboratory+Manual%22">Antibodies: A Laboratory Manual</a>. , Cold Spring Harbor Laboratory Press. New York City, New York. (1988).</li>
<li>Mello, C., Fire, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+Transformation%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">DNA Transformation.</a> Methods Cell Biol. 48, 451-482 (1995).</li>
<li>Boulin, T., Etchberger, J. F., Hobert, O. Reporter gene fusions. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBoulin%2C+T+%22WormBook%22">WormBook</a>. , WormBook. (2006).</li>
<li>Duerr, J. S. Immunohistochemistry. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDuerr%2C+JS+%22WormBook%22">WormBook</a>. , WormBook. (2006).</li>
<li>Finney, M., Ruvkun, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+unc-86+gene+product+couples+cell+lineage+and+cell+identity+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">The unc-86 gene product couples cell lineage and cell identity in C. elegans.</a> Cell. 63, 895-905 (1990).</li>
<li>Garriga, G., Desai, C., Horvitz, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+interactions+control+the+direction+of+outgrowth%2C+branching+and+fasciculation+of+the+HSN+axons+of+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Cell interactions control the direction of outgrowth, branching and fasciculation of the HSN axons of Caenorhabditis elegans.</a> Development. 117, 1071-1087 (1993).</li>
<li>Miller, D. M., Shakes, D. C. Immunofluorescence microscopy. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMiller%2C+DM+%22Caenorhabditis+elegans%3A+Modern+Biological+Analysis+of+an+Organism%22">Caenorhabditis elegans: Modern Biological Analysis of an Organism</a>. Epstein, H. F., Shakes, D. C. , Academic Press. San Diego, California. 365-394 (1995).</li>
<li>Crittenden, S. L., Troemel, E. R., Evans, T. C., Kimble, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((GLP-1+is+localized+to+the+mitotic+region+of+the+C.+elegans+germ+line%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">GLP-1 is localized to the mitotic region of the C. elegans germ line.</a> Development. 120, 2901-2911 (1994).</li>
<li>Strome, S., Wood, W. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Immunofluorescence+visualization+of+germ-line-specific+cytoplasmic+granules+in+embryos%2C+larvae%2C+and+adults+of+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.S.A%22%5BJournal%5D)">Immunofluorescence visualization of germ-line-specific cytoplasmic granules in embryos, larvae, and adults of Caenorhabditis elegans.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79, 1558-1562 (1982).</li>
<li>Albertson, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Formation+of+the+first+cleavage+spindle+in+nematode+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Dev.+Biol%22%5BJournal%5D)">Formation of the first cleavage spindle in nematode embryos.</a> Dev. Biol. 101, 61-72 (1984).</li>
<li>Harlow, E. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHarlow%2C+E+%22Using+Antibodies%3A+A+Laboratory+Manual%22">Using Antibodies: A Laboratory Manual</a>. , Cold Spring Harbor Laboratory Press. New York City, New York. (1999).</li>
<li>Ahringer, J. Reverse Genetics. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aAhringer%2C+J+%22WormBook%22">WormBook</a>. , WormBook. (2006).</li>
</ol>

Yazar o hiçbir rakip mali çıkarlarını sahip olduğunu beyan eder.

Dondurularak-kırma protokol C antikor lekelemesi için çeşitli yöntemlerden biridir elegans. Bu solucanlar leke için nispeten basit bir yol sağlar, ancak belirli reaktifler gerektiren ve optimum sonuçlar için pratik yapar. (Şekil 1&#39;de) Kritik adımlar şunlardır: 1) slayt hazırlama () adım 3 (bkz. adım 2 ve 3) hızlı tespiti (bkz. adım 1 ve nematod 2) elle sıkıştırma bkz. İlk olarak, slaytlara nematodların yapışmasını en üst düzeye çıkarmak için, bunun yerine ticari olarak hazırlanan s...

Proteinlerin hücre ve hücre içi lokalizasyonu belirlemek için, bilim adamları, belirli geleneksel özellikle 1 proteinleri tanıyan seçilmiş antikorlar ile dokuların etiketli var. C gibi bazı model organizmalar elegans, antikor boyama, genellikle daha hızlı sonuç moleküler genetik teknikler ile değiştirilmiştir. Bunlar, promotör ve ilgi ve yeşil floresan protein geninin kodlama bölgeleri arasında gen füzyonlarının oluşan yapıları ile transforme organizmaları içerir. Bununla birlikte, moleküler teknikler doğru promotör ve yüksek kopya sayısında (C. elegans alışılmış teknikler) 2,3 at yapıları ifadesindeki değişiklikler bilerek ile ilgili sorunlar gibi eşyaların, bir dizi tabidir. Bu nedenle, antikorlarla boyama in vivo protein işlevi araştırmalarında pek çok bilim adamı için bir hedef olmaya devam etmektedir. Antikorları ile dokular boyandığında, zor olabilir çünkü birantikorlarının verilmesinin sadece belirli bir konformasyonda 1 kendi antijeni tanıyabilir. Örneğin, antikorlar belirli bir şekilde sabit, sadece denatüre ya da sağlam antijeni tanıyabilir ve yerinde antijeni tanımayabilir. Nematod antikor lekelenme problemi nematodun kütikül dokulara antikor erişimi engelleme, nispeten geçirimsiz bir bariyer oluşturur gerçeği ile daha da artmaktadır. C. antikor lekeleme için kullanılan birkaç farklı yöntem vardır elegans (önceki çalışmaları gözden 4). Sağlam leke &#39;solucan&#39; yöntemleri donma ve nispeten sert sabitleştirici (formaldehit ya da glutaraldehit) olarak çözülme geliştirildi; donma-çözülme döngüleri sabitleyici 5 hızlı nüfuz etmesini sağlamak için manikür çatlamak yardımcı. Yöntem maddeler, kolajenaz ya da her ikisi 5-7 azaltılması ile tedavisi dahil, tespit edildikten sonra, kütikül antikorun girmesine izin vermek üzere permeabilize edilmiştir. Bu treatments morfolojisi korunmuş, ancak genellikle antikor tanınmasını azalır ya da yok. Alternatif yöntemler, antikor girmesine izin vermek üzere diseksiyon 8 içerir. &quot;Freeze-kırma&quot; Antikor 9-10 boyama sağlamak için yarı sağlam solucan iç kısmına erişmek için bir yoldur. Kollajenaz ve azaltma tedavisini kaçınarak Freeze-çatlama tespit çeşitli koşullar ile yapılabilir. Nematodlar, iki yapıştırıcı slaytlar arasında yerleştirilmiş dondurulur ve daha sonra slaytlar ayrılır, alt slayt üzerinde nematod çoğu ve üst kızak üzerindeki kütikül çok ayrılıyor. Alt sürgü sabitleyici yerleştirilebilir ve yapışık nematodlar ile tüm kaydırma antikor lekeleme prosedürü aracılığıyla aktarılır. Yöntem mevcut iki büyük zorluklar yok. İlk olarak, bu ciddi bunları deforme olmadan nematod bölmek için gerekli olan basınç, doğru miktarda uygulamak zordur. İkinci olarak, solucanların çok s olmazya slayt kene ve sabitleştirici veya durular kaybolur. Ancak, uygun slaytlar ve uygulama ile, yöntem, hızlı bir şekilde tespit ediciler ve antikorların çeşitli kullanılabilir makul bir morfolojisi olan nematodlar verecektir. Yöntem, deneyci amacına bağlı olarak, biraz değiştirilebilir. Tek bir nematod boyama (örneğin, tek bir transformant antikoru boyamasını değişmiş olup olmadığını belirlemek için) isteniyorsa, o zaman maksimum yapışma ile slaytlar (ancak yüksek bir arka plan boyaması) (aşağıya bakınız) bu tür ilave polilisin ile laboratuarda hazırlanmış slaytlar olarak kullanılabilir. Nematodlar, bu tespitler sonra polilisin daha zayıf bağlı Başlangıcı formaldehid veya glutaraldehid tespit için, daha yüksek bir yapışma slaytlar (laboratuar hazırlanan slaytlar polilisin) kullanılmalıdır. Vahşi tip nematodları, metanol ve / veya aseton ile tespit edilmektedir, daha sonra daha düşük bir yapışma özelliğine sahip slaytlar ve alt arka plan boyaması kullanılmalıdır (ticari veya l) slaytlar aboratory hazırlanmış. Antikorlar ve fiksatif çeşitli laboratuarda kullanılıyorsa, slaytlar bir seçim vaktinden önce hazırlanabilir ve gerekli olana kadar saklanır. Nematod dokuya erişim elde edilmiştir sonra, antikor, boyama işlemleri (daha uzun dokuların karakteristik inkubasyon yerine hücreleri 1,11) ile standart yöntemler takip edin.

<table><tbody><tr><td>poli-L-lizin slayt (ESCO markası)</td> <td>Fisher</td><td>12-545-78</td><td>Sigma marka slaytlar da uygun</td></tr><tr><td>poli-L-lizin hidrobromür</td><td>Sigma</td><td>P1524</td> <td>< güçlü > ÖNEMLİ: < / güçlü> Polilisin kritik tek buzlu kenar slaytlarının markası ve yüksek moleküler ağırlığı</td></tr><tr><td></td><td>Fisher</td><td>48312-002</td><td>Diğer markalar uygun</td></tr><tr><td>sodyum azid</td><td>Sigma</td><td>S2002-25G</td><td>ZEHİRLİ,% 10 stok yapmak için tozu tartarken eldiven ve maske giyin. Stok çözeltisini pipetlerken eldiven giyin</td></tr><tr><td>coplin boyama kavanozu</td><td>VWR</td><td>47751-792</td><td>Diğer markalar uygundur</td></tr><tr><td>5 slaytlı posta gönderici Elektron</td><td>Mikroskobu Bilimi</td><td>71549-01</td> Paraformaldehit VWR MK262159 <td>boyamaya uygun birçok farklı küçük kayar tutucu markasından biri</td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td><güçlü>ÖNEMLİ: </güçlü> Düzenli formalin çözeltileri (% 37 formaldehit) uygun DEĞİLDİR. Ya 1) Krisatlali paraformaldehiti fosfat tamponunda çözün ve donmuş küçük alikotlarda saklayın. Veya 2) alikotlarda elektron mikroskobu dereceli paraformaldehit satın alın. ZEHİRLİ -eldiven giyin; Fazla lavaboyu suyla atın.</td></tr><tr><td>Gluteraldehit çözeltisi, suda %25</td><td>Sigma</td><td>G 5882</td><td><güçlü>ÖNEMLİ:</güçlü> ampullerde elektron mikroskobu dereceli glutaraldehit satın alın; ZEHİRLİ -eldiven giyin; Fazla lavaboyu suyla atın.</td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>VWR</td><td>EM-9410</td><td>Diğer markalar uygundur</td></tr><tr><td>Sığır Serumu Albümin</td><td>Fisher</td><td>ICN820451</td><td>Diğer markalar uygundur</td></tr><tr><td>Eşek Serumu, liyofilize</td><td>Jackson Immunoresearch</td><td>017-000-121</td><td>Diğer markalar uygundur</td></tr><tr><td>Cy3 Eşek anti-Fare IgG çoklu etiketleme</td><td>Jackson Immunoresearch</td><td>715-165-150</td><td>Bu şirket, yüksek kaliteli çok etiketli (afinitesi tükenmiş) antikorlar için önerilir. Uygun boya ve antijeni seçin (birincil antikoru yükseltmek için kullanılan hayvan). </td></tr><tr><td>n-propil gallat</td><td>Fisher</td><td>ICN10274750</td><td>Diğer markalar DAPI</td></tr><tr><td>, 4 ', 6'-diamidino-2-fenilindol dihidroklorür</td><td>Sigma</td><td>D 9542</td><td>TOKSİK uygundur. Eldiven giyin ve maruziyeti en aza indirmek için küçük alikotlara ve feeze'ye dağıtın</td></tr><tr><td>Whatman #1 15 cm çaplı filtreler</td><td>Fisher</td><td>09805G</td><td></td></tr><tr><td>Lamel #1 1/2 dikdörtgen 24 x 60 mm</td><td>VWR</td><td>48393-252</td>#<td>1 1/2 kalınlık optik olarak en iyisidir</td></tr><tr><td>Mikroskop slayt klasörü</td><td>VWR</td><td>48429-092</td><td>Diğer markalar uygundur</td></tr></tbody></table>

antikor boyamasında<em&gt; c. elegans</em&gt; &quot;freeze-cracking kullanma&quot;

Antibody Staining in C. Elegans Using &quot;Freeze-Cracking&quot;

C leke antikorlar ile elegans, nispeten geçirimsiz manikür kimyasal veya mekanik yöntemlerle atlanmalıdır. &quot;Freeze-çatlama&quot; fiziksel, iki yapışık slaytlar arasındaki nematod sıkıştırarak onları dondurma, ve ayrı slaytlar çekerek nematodlardan manikür çekmek için kullanılan bir yöntemdir. Dondurarak çatlama kimyasal muamele olmadan dokulara erişmek için basit ve hızlı bir yol sağlar ve fiksatif çeşitli kullanılabilir. Ancak, bu örneklerin birçok kaybına yol açar ve gerekli sıkıştırma mekanik olarak örnek deforme eder. Pratikte iyi bir morfolojisi olan numunelerin kurtarma en üst düzeye çıkarmak için gereklidir. Dondurarak çatlama özel sabitleme koşulları, numune kazanımı veya düşük spesifik olmayan boyama için optimize edilmiş, ancak tüm parametreler için aynı anda olabilir. Çok sert sabitleme koşulları gerektiren ve kimyasal manikür permeabilize için gerekli kimyasal tedaviler, Arıtma tahammül antikorlarınçözelti içinde sağlam nematodların t tercih edilebilir. Antikor hafif bir düzeltme gerektiren veya optimum sabitleme koşulları bilinmediği takdirde, dondurularak çatlama hızlı bir antikor ve tahlil, ilgi konusu antijen için spesifik hücre içi ve hücre lokalizasyonu bilgi verebilir çok yararlı bir şekilde kalmasını sağlar.

Solucanlar düzgün, sıkıştırılmış kırık ve hafif sabit tutulduğunda, hemen hemen tüm solucan (bkz. Şekil 2) antikor boyama için erişilebilir olabilir. DAPI lekelemesi ile gösterildiği gibi çekirdek konumu solucanın parçaları solucanlar formaldehit gibi daha sert bir sabitleyici, tâbi tutulduğu zaman en doğal olmayan dalgalı görünümü ile görüldüğü gibi, solucan morfolojisi (bozulabilir sağlam olduğu gösterilmektedir Şekil 3A-D kas). Başka bir yaygın sorun düzensiz sabitleme ya da belirli ...

&quot;Freeze-kırma,&quot; nematod C iç dokuları sergilemek için bir yöntem protein lokalizasyonu için antikorlara elegans, gösterilmiştir.

Antikor boyamasında<em&gt; C. Elegans</em&gt; &quot;Freeze-Cracking kullanma&quot;

To stain C.  elegans with antibodies, the relatively impermeable cuticle must be  bypassed by chemical or mechanical methods.  "Freeze-cracking" is one ...

Bu prosedürün genel amacı, C. elegans üzerinde antikor boyaması gerçekleştirmektir. Bunu yapmak için nematodlar durulanır, lamlar üzerine yayılır ve ardından kuru buz üzerinde dondurulan iki yapışkan lam arasında dikkatlice sıkıştırılır. Sonrasında, nematodları çatlatmak için lamlar birbirinden ayrılır ve hemen tespit çözeltisine yerleştirilir.Nematodlar daha sonra standart antikor boyama teknikleri kullanılarak boyanır; floresan mikroskobu ile yapılan analiz, yarı bütün nematodların başarılı bir şekilde antikorla boyandığını ortaya koyar. Bu tekniğin, bütün nematodların fiksasyonu gibi mevcut yöntemlere göre temel avantajı, örneğin kimyasal işlemini minimize etmesidir. Genellikle, bu yöntemde yeni olan kişiler, slaytların ve nematodların hazırlanmasının gösterilmesinin oldukça zahmetli olması nedeniyle zorluk yaşayacaklardır.Prosedür, şahsım ve laboratuvarımdan lisansüstü öğrencisi RTO Basu tarafından gerçekleştirilecektir. Boyama için nematod plakaları hazırlamaya, soğutmak amacıyla kuru buz üzerine yerleştirilmiş düz bir metal parçası kullanarak başlayın; distile su ve cam pipetle durulayın. Bakterili tek bir 60 milimetrelik NGM plakasında yetiştirilen solucanları 1,5 mililitrel

antibody-staining-in-c-elegans-using-freeze-cracking

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Biz elektron mikrograflarında fluoresan ışığı ile işaretlenmiş proteinler yerelleştirmek için bir yöntem açıklanmaktadır. Floresans ilk ince kesitler üzerinde fotoğraf ile aktive localisation mikroskopi kullanılarak yerelleştirilmiştir. Bu görüntüler daha sonra aynı bölümde elektron mikroskop ile hizalanır.

Nano-fem: Foto-aktif Yerelleştirme Mikroskobu ve Elektron Mikroskop Kullanarak Protein Yerelleştirme

Kavşaklarda bulunan kümelenmiş nörotransmitter reseptörlerinin bolluğu güçlü sinaptik gücü etkiler. Bu yöntem tek-sinaps çözünürlükte üç boyutlu olarak floresan etiketli nörotransmitter reseptörleri...

Içinde Synaptic florasan Otomatik Sayısallaştırma<em&gt; C. elegans</em

Bu videoda, kütikülü bozarak C. elegans dokularını antikor boyaması için erişilebilir hale getirme yöntemi olan donarak kırma işlemi açıklanmaktadır.

Nematodların Donarak Parçalanması: İç Solucan Dokularını Boyama İçin Açığa Çıkarmak İçin Bir Yöntem

Tekrarlayan dizileri gözlemlemek ve ölçmek için Caenorhabditis elegans'ın gonadında ve embriyolarında kısa bir floresan in situ hibridizasyon (FISH) prosedürü rapor ediyoruz. Telomer tekrarları ve telomerlerin alternatif uzama şablonu (TALT) olmak üzere iki farklı tekrarlayan diziyi başarıyla gözlemledik ve ölçtük.

Gözlem ve telomer Niceleme ve Tekrarlayan Diziler kullanma Floresan<em&gt; In Situ</emPNA Sondalar&gt; ile hibridizasyon (FISH)<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Biz disseke C. aktif ERK mekansal ve zamansal lokalizasyonu için immünofloresan görüntüleme bazlı yöntem mevcut elegans gonad. Burada açıklanan protokol C herhangi bir sinyal görüntülenmesi veya yapısal protein için uyarlanabilir elegans yumurtalık, uygun bir antikor reaktifi kullanılabilir sağladı.

Aktif ERK Mekansal ve Zamansal Analizi<em&gt; C. elegans</em&gt; Germline

Saydam C. elegans bağırsak "sırasında çok hücreli tubulogenesis apicobasal membran ve Lümen Biyogenez tek hücre ve hücre altı düzeyde çalışmak için birvivo içinde doku odası" olarak hizmet edebilir. Bu protokolü nasıl standart etiketleme birleştirmek için işlev kaybı genetik/RNAi ve moleküler düzeyde bu işlemleri incelemek için mikroskobik yaklaşımları açıklar.

C. elegans bağırsak olarak bir Model hücreler arası Lumen morfogenez ve In Vivo polarize membran Biyogenez tek hücre düzeyinde için: etiketleme antikor boyama, işlev RNAi kaybı çözümleme ve görüntüleme

Bu iletişim kuralı bir protein nükleer translocation ısı stres altında bir yeşil floresans protein (GFP) füzyon proteini bir işaretleyici olarak ve 4', 6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) kullanarak izlemek gösterilmiştir boyama. İletişim kuralı boyama DAPI hızlı ve GFP ve protein hücre altı yerelleştirme sinyalleri korur.

Protein hücre altı yerelleştirme yeşil floresans Protein etiketleme ve 4', 6-Diamidino-2-phenylindole Caenorhabditis elegans içinde boyama tarafından tespit

Bu protokol, C. elegans germline yerinde protein-protein etkileşimleri için prob yakınlık ligasyon test kullanımını göstermektedir.

Yakınlık Ligasyon Tayini kullanılarak C. elegans Germline Ribonükleoprotein Kompleksi Montaj Yerinde Algılama

Aşağıdaki protokol, proteostazdaki değişikliklerin bir değerlendirmesi olarak poliglutamin agregalarını ölçmek için solucan kültürleme, floresan görüntüleme ve otomatik görüntü işleme için yüksek verimli bir iş akışının geliştirilmesini ve optimizasyonunu açıklamaktadır.

Caenorhabditis elegans'ta Agrega Niceliğinin Otomatikleştirilmesi

Bu, C. elegans gonad diseksiyonu ve ardından antikor boyama yoluyla immünofloresan için germline örnekleri üreten donma çatlağı veya DNA'yı görselleştirmek için basit DAPI boyama için yaygın olarak kullanılan bir yöntemdir. Bu protokol, bir araştırma laboratuvarında ve ders tabanlı bir lisans araştırma deneyiminde lisans öğrencileri için başarılı olmuştur.

C. elegans · İmmünofloresan ve DAPI Boyama için Gonad Diseksiyonu ve Dondurucu Çatlak

Süper çözünürlüklü mikroskopi, mayozdaki sinaptonemal kompleks içindeki bileşenlerin organizasyonu hakkında ayrıntılı bir fikir verebilir. Burada, Caenorhabditis elegans synaptonemal kompleksinin bireysel proteinlerini çözmek için bir protokol gösteriyoruz.

Caenorhabditis elegans Germline İçindeki Sinaptonemal Kompleksin Süper Rezolüsyonlu Mikroskopisi

Öğrenin, C. elegans'ta protein lokalizasyonu için freeze-cracking yöntemiyle antikor boyaması yapmayı. Bu teknik, kimyasal işlemi en aza indirerek yarı bütün nematodlarda etkili boyama sağlar.

Antikor boyamasında

Daha fazla video keşfet