Name: Yetişkin Zebra Balığının Bireysel ve Sürülerini Kaydetmek için Otomatik Bir 3D İzleme Sistemi Kullanma (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2013-12-05T16:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 3 s
Description: Keşfedin 3D otomatik izleme sistemini kullanarak Danio rerio'nun bireysel ve sürü davranışlarını analiz etmeyi. Bu yöntem, ilaç etkilerini ve genetik mutasyonların davranışsal sonuçlarını araştırmak için güvenilir bir araç sunar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Yazarların hiçbir teşekkürü yok.

<ol><li>Brennan, C. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+behavioural+assays+of+translational+relevance+for+the+study+of+psychiatric+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Rev.+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Zebrafish behavioural assays of translational relevance for the study of psychiatric disease.</a> Rev. Neurosci. 22, 37-48 (2011).</li>
<li>Kabashi, E., Brustein, E., Champagne, N., Drapeau, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+models+for+the+functional+genomics+of+neurogenetic+disorders%5BTitle%5D)+AND+%22Biochim.+Biophys.+Acta%22%5BJournal%5D)">Zebrafish models for the functional genomics of neurogenetic disorders.</a> Biochim. Biophys. Acta. 1812, 335-345 (2011).</li>
<li>McCollum, C. W., Ducharme, N. A., Bondesson, M., Gustafsson, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Developmental+toxicity+screening+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Birth.+Defects.+Res.+C.+Embryo+Today%22%5BJournal%5D)">Developmental toxicity screening in zebrafish.</a> Birth. Defects. Res. C. Embryo Today. 93, 67-114 (2011).</li>
<li>Kurta, A., Palestis, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+ethanol+on+the+shoaling+behavior+of+zebrafish+%28Danio+rerio%29%5BTitle%5D)+AND+%22Dose-Response%22%5BJournal%5D)">Effects of ethanol on the shoaling behavior of zebrafish (Danio rerio).</a> Dose-Response. 8, 527-533 (2010).</li>
<li>Sison, M., Gerlai, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Behavioral+performance+altering+effects+of+MK-801+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29%5BTitle%5D)+AND+%22Behav.+Brain+Res%22%5BJournal%5D)">Behavioral performance altering effects of MK-801 in zebrafish (Danio rerio).</a> Behav. Brain Res. 220, 331-337 (2011).</li>
<li>Delcourt, J., Denoël, M., Ylieff, M., Poncin, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Video+multitracking+of+fish+behaviour%3A+a+synthesis+and+future+perspectives%5BTitle%5D)+AND+%22Fish+Fish%22%5BJournal%5D)">Video multitracking of fish behaviour: a synthesis and future perspectives.</a> Fish Fish. 14, 186-204 (2013).</li>
<li>Zhu, L., Weng, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Catadioptric+stereo-vision+system+for+the+real-time+monitoring+of+3D+behavior+in+aquatic+animals%5BTitle%5D)+AND+%22Physiol.+Behav%22%5BJournal%5D)">Catadioptric stereo-vision system for the real-time monitoring of 3D behavior in aquatic animals.</a> Physiol. Behav. 91, 106-119 (2007).</li>
<li>System for 3D monitoring and analysis of motion behavior of targets. US patent. , 8306260 (2012).</li>
<li>Cachat, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-dimensional+neurophenotyping+of+adult+zebrafish+behavior%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Three-dimensional neurophenotyping of adult zebrafish behavior.</a> PLoS ONE. 6, e17597(2011).</li>
<li>Maaswinkel, H., Zhu, L., Weng, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+immediate+and+the+delayed+effects+of+buspirone+on+zebrafish+%28Danio+rerio%29+in+an+open+field+test%3A+a+3-D+approach%5BTitle%5D)+AND+%22Behav.+Brain+Res%22%5BJournal%5D)">The immediate and the delayed effects of buspirone on zebrafish (Danio rerio) in an open field test: a 3-D approach.</a> Behav. Brain Res. 234, 365-374 (2012).</li>
<li>Maaswinkel, H., Le, X., He, L., Zhu, L., Weng, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dissociating+the+effects+of+habituation%2C+black+walls%2C+buspirone+and+ethanol+on+anxiety-like+behavioral+responses+in+shoaling+zebrafish.+A+3D+approach+to+social+behavior%5BTitle%5D)+AND+%22Pharmacol.+Biochem.+Behav%22%5BJournal%5D)">Dissociating the effects of habituation, black walls, buspirone and ethanol on anxiety-like behavioral responses in shoaling zebrafish. A 3D approach to social behavior.</a> Pharmacol. Biochem. Behav. 108, 16-27 (2013).</li>
<li>Maaswinkel, H., Zhu, L., Weng, W. The advantages of a 3D-automatic recording system for the study of shoaling behavior in zebrafish. 10th International Conference Zebrafish Development and Genetics, Madison, , (2012).</li>
<li>Maaswinkel, H., Zhu, L., Weng, W. An automatic recording system to quantify antagonistic interactions between zebrafish. Abstract. 10th International Conference Zebrafish Development and Genetics, Madison, , (2012).</li>
<li>Spence, R., Gerlach, G., Lawrence, C., Smith, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+behaviour+and+ecology+of+the+zebrafish%2C+Danio+rerio%5BTitle%5D)+AND+%22Biol.+Rev.+Camb.+Phil.+Soc%22%5BJournal%5D)">The behaviour and ecology of the zebrafish, Danio rerio.</a> Biol. Rev. Camb. Phil. Soc. 83, 13-34 (2008).</li>
<li>Krause, J., Hartmann, N., Pritchard, V. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+influence+of+nutritional+state+on+shoal+choice+in+zebrafish%2C+Danio+rerio%5BTitle%5D)+AND+%22Anim.+Behav%22%5BJournal%5D)">The influence of nutritional state on shoal choice in zebrafish, Danio rerio.</a> Anim. Behav. 57, 771-775 (1999).</li>
<li>Speedie, N., Gerlai, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Alarm+substance+induced+behavioral+responses+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29%5BTitle%5D)+AND+%22Behav.+Brain+Res%22%5BJournal%5D)">Alarm substance induced behavioral responses in zebrafish (Danio rerio).</a> Behav. Brain Res. 188, 168-177 (2008).</li>
<li>Gebauer, D. L., Pagnussat, N., Piato, A. L., Schaeffer, I. C., Bonan, C. D., Lara, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+anxiolytics+in+zebrafish%3A+similarities+and+differences+between+benzodiazepines%2C+buspirone+and%5BTitle%5D)+AND+%22%22%5BJournal%5D)">Effects of anxiolytics in zebrafish: similarities and differences between benzodiazepines, buspirone and.</a> 99, 480-486 (2011).</li>
<li>Paull, G. C., Filby, A. L., Giddins, H. G., Coe, T. S., Hamilton, P. B., Tyler, C. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dominance+hierarchies+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29+and+their+relationship+with+reproductive+success%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">Dominance hierarchies in zebrafish (Danio rerio) and their relationship with reproductive success.</a> Zebrafish. 7, 109-117 (2010).</li>
<li>Engeszer, R. E., Ryan, M. J., Parichy, D. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Learned+social+preference+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Curr.+Biol%22%5BJournal%5D)">Learned social preference in zebrafish.</a> Curr. Biol. 14, 881-884 (2004).</li>
<li>Mathur, P., Guo, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+zebrafish+as+a+model+to+understand+mechanisms+of+addiction+and+complex+neurobehavioral+phenotypes%5BTitle%5D)+AND+%22Neurobiol.+Dis%22%5BJournal%5D)">Use of zebrafish as a model to understand mechanisms of addiction and complex neurobehavioral phenotypes.</a> Neurobiol. Dis. 40, 66-72 (2010).</li>
<li>Tropepe, V., Sive, H. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Can+zebrafish+be+used+as+a+model+to+study+the+neurodevelopmental+causes+of+autism%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Brain+Behav%22%5BJournal%5D)">Can zebrafish be used as a model to study the neurodevelopmental causes of autism.</a> Genes Brain Behav. 2, 268-281 (2003).</li>
<li>Echevarria, D. J., Hammack, C. M., Pratt, D. W., Hosemann, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+behavioral+test+battery+to+assess+global+drug+effects+using+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Int.+J.+Comp.+Psychol%22%5BJournal%5D)">A novel behavioral test battery to assess global drug effects using zebrafish.</a> Int. J. Comp. Psychol. 21, 19-34 (2008).</li>
<li>Seibt, K. J., Piato, A. L., Luz Oliveira, da, Capiotti, R., Vianna, K. M., R, M., Bonan, C. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Antipsychotic+drugs+reverse+MK-801+induced+cognitive+and+social+interaction+deficits+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29%5BTitle%5D)+AND+%22Behav.+Brain.+Res%22%5BJournal%5D)">Antipsychotic drugs reverse MK-801 induced cognitive and social interaction deficits in zebrafish (Danio rerio).</a> Behav. Brain. Res. 224, 135-139 (2011).</li>
<li>Zou, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Low+dose+MK-801+reduces+social+investigation+in+mice%5BTitle%5D)+AND+%22Pharmacol.+Biochem.+Behav%22%5BJournal%5D)">Low dose MK-801 reduces social investigation in mice.</a> Pharmacol. Biochem. Behav. 90, 753-757 (2008).</li>
<li>Ng, M. C., Hsu, C. P., Wu, Y. J., Wu, S. Y., Yang, Y. L., Lu, K. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+MK-801-induced+impairment+of+inhibitory+avoidance+learning+in+zebrafish+via+inactivation+of+extracellular+signal-regulated+kinase+%28ERK%29+in+telencephalon%5BTitle%5D)+AND+%22Fish+Physiol.+Biochem%22%5BJournal%5D)">Effect of MK-801-induced impairment of inhibitory avoidance learning in zebrafish via inactivation of extracellular signal-regulated kinase (ERK) in telencephalon.</a> Fish Physiol. Biochem. 38, 1099-1106 (2012).</li>
<li>Sison, M., Gerlai, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Associative+learning+performance+is+impaired+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29+by+the+NMDA-R+antagonist+MK-801%5BTitle%5D)+AND+%22Neurobiol.+Learn.+Mem%22%5BJournal%5D)">Associative learning performance is impaired in zebrafish (Danio rerio) by the NMDA-R antagonist MK-801.</a> Neurobiol. Learn. Mem. 96, 230-237 (2011).</li>
<li>Swain, H. A., Sigstad, C., Scalzo, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+dizocilpine+%28MK-801%29+on+circling+behavior%2C+swimming+activity%2C+and+place+preference+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29%5BTitle%5D)+AND+%22Neurotox.+Teratol%22%5BJournal%5D)">Effects of dizocilpine (MK-801) on circling behavior, swimming activity, and place preference in zebrafish (Danio rerio).</a> Neurotox. Teratol. 26, 725-729 (2004).</li>
<li>Vezzani, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kinetics+of+MK-801+and+its+effect+on+quinolinic+acid-induced+seizures+and+neurotoxicity+in+rats%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Pharmacol.+Exp.+Ther%22%5BJournal%5D)">Kinetics of MK-801 and its effect on quinolinic acid-induced seizures and neurotoxicity in rats.</a> J. Pharmacol. Exp. Ther. 249, 278-283 (1989).</li>
<li>Green, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Automated+high-throughput+neurophenotyping+of+zebrafish+social+behavior%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Neurosci.+Methods%22%5BJournal%5D)">Automated high-throughput neurophenotyping of zebrafish social behavior.</a> J. Neurosci. Methods. 210, 266-271 (2012).</li>
<li>Rung, J. P., Carlsson, A., Rydén Markinhuhta, K., Carlsson, M. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((+%28%2B%29-MK-801+induced+social+withdrawal+in+rats%3B+a+model+for+negative+symptoms+of+schizophrenia%5BTitle%5D)+AND+%22Prog.+Neuro-psychopharmacol.+Biol.+Psych%22%5BJournal%5D)"> (+)-MK-801 induced social withdrawal in rats; a model for negative symptoms of schizophrenia.</a> Prog. Neuro-psychopharmacol. Biol. Psych. 29, 827-832 (2005).</li>
<li>Gururajan, A., Taylor, D. A., Malone, D. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cannabidiol+and+clozapine+reverse+MK-801-induced+deficits+in+social+interaction+and+hyperactivity+in+Sprague-Dawley+rats%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Psychopharmacol%22%5BJournal%5D)">Cannabidiol and clozapine reverse MK-801-induced deficits in social interaction and hyperactivity in Sprague-Dawley rats.</a> J. Psychopharmacol. 226, 1317-1332 (2012).</li>
<li>Burket, J. A., Cannon, W. R., Jacome, L. F., Deutsch, S. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MK-801%2C+a+noncompetitive+NMDA+receptor+antagonist%2C+elicits+circling+behavior+in+the+genetically+inbred+Balb%2Fc+mouse+strain%5BTitle%5D)+AND+%22Brain+Res.+Bull%22%5BJournal%5D)">MK-801, a noncompetitive NMDA receptor antagonist, elicits circling behavior in the genetically inbred Balb/c mouse strain.</a> Brain Res. Bull. 83, 337-339 (2010).</li>
<li>Saunders, J. A., Gandal, M. J., Roberts, T. P., Siegel, S. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((NMDA+antagonist+MK801+recreates+auditory+electrophysiology+disruption+present+in+autism+and+other+neurodevelopmental+disorders%5BTitle%5D)+AND+%22Behav.+Brain+Res%22%5BJournal%5D)">NMDA antagonist MK801 recreates auditory electrophysiology disruption present in autism and other neurodevelopmental disorders.</a> Behav. Brain Res. 234, 233-237 (2012).</li>
<li>Brosda, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pharmacological+and+parametrical+investigation+of+prepulse+inhibition+of+startle+and+prepulse+elicited+reactions+in+Wistar+rats%5BTitle%5D)+AND+%22Pharmacol.+Biochem.+Behav%22%5BJournal%5D)">Pharmacological and parametrical investigation of prepulse inhibition of startle and prepulse elicited reactions in Wistar rats.</a> Pharmacol. Biochem. Behav. 99, 22-28 (2011).</li>
<li>Wong, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analyzing+habituation+responses+to+novelty+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29%5BTitle%5D)+AND+%22Behav.+Brain+Res%22%5BJournal%5D)">Analyzing habituation responses to novelty in zebrafish (Danio rerio).</a> Behav. Brain Res. 208, 450-457 (2010).</li>
<li>Maximino, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Parametric+analyses+of+anxiety+in+zebrafish+scototaxis%5BTitle%5D)+AND+%22Behav.+Brain+Res%22%5BJournal%5D)">Parametric analyses of anxiety in zebrafish scototaxis.</a> Behav. Brain Res. 210, 1-7 (2010).</li>
<li>Blaser, R. E., Rosemberg, D. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measures+of+anxiety+in+zebrafish+%28Danio+rerio%29%3A+dissociation+of+black%2Fwhite+preference+and+novel+tank+test%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+One%22%5BJournal%5D)">Measures of anxiety in zebrafish (Danio rerio): dissociation of black/white preference and novel tank test.</a> PloS One. 7, e36931(2012).</li>
</ol>

Hans Maaswinkel, Liqun Zhu ve Wei Weng, bu makalede kullanılan izleme sistemini üreten xyZfish, Ronkonkoma NY'nin çalışanlarıdır.

Burada gösterilen deneysel prosedür, tek tek zebra balığının, zebra balığı çiftlerinin (örneğin çiftleşme veya saldırganlığı incelemek için) ve zebra balığı sürülerinin (temsili örnekte gösterildiği gibi) kaydedilmesine izin verir. Sistem özellikle 3D (dikey ve yatay) dağılım, kinematik özellikler (örn. hız, ivme, dönüş açısı) ve sosyal parametreler (örn. sosyal uyum) hakkında aynı anda bilgi elde etmek için uygundur. Aşağıda, deneyleri planlarken göz önünde bulundurulması gereken birkaç önemli konuyu listeliyoruz.
Deneysel prosedüre bağlı olarak, farklı davranış sistemleri incelenebilir. Örneğin, neofobiyi (yani yeni ortamlar için korku) keşfetmek için, zebra balığını gözlem tankına soktuktan hemen sonra (gürültüyü azaltmak için suyun çökmesi için sadece birkaç saniye bekledikten sonra), önceden alışkanlık olmadan kayıt başlatılmalıdır11,17,37. Öte yandan, bazı araştırma konuları, örneğin alarm feromonlarının etkilerini incelerken zebra balığının iyi alışmasını gerektirebilir16. Zebra balığı gruplarını incelerken, deneyci, yazılımın etiketlerin değiştirilmesini en aza indirmesine rağmen, şu anda tek tek zebra balıklarını baştan sona takip etmenin mümkün olmadığının farkında olmalıdır. Bu, sosyal uyumun vurgulandığı sığlık çalışmaları için de önemli değildir, ancak saldırganlık veya çiftleşmeyi araştırırken çok önemli olacaktır. Etiketlerin manuel olarak yeniden atanması bir seçenektir, ancak çok zaman alabilir.
Gözlem kabının ve gözlem odasının duvarlarının rengi, zebra balığının davranışı üzerinde büyük etkiye sahip olabilir. Örneğin, beyaz duvarların tiksinti tepkilerini tetiklediği tanımlanmıştır36, 37. Farklı renkleri denerken iki şeyi aklınızda bulundurun: 1) ön duvarın (yani kameraya en yakın duvarın) şeffaf kalması ve bir kapağın (kullanılıyorsa) da şeffaf olması önemlidir; 2) Daha önce hiç kullanılmamış bir renk seçerken, önce zebra balığı ile arka plan arasındaki kontrastın kayıt için uygun olup olmadığını belirleyin. Bir test çalıştırması yapın. Kayıt için kamera ayarlarının (2.5 ve 2.6. adımlarda açıklandığı gibi Kazanç, Deklanşör, Kırmızı ve Mavi) ve yörünge yeniden yapılandırma ayarlarının (örn. 3.3, 3.5, 3.11 ve 3.12. adımlarda açıklandığı gibi renk ve boyut eşikleri) değiştirilmesi büyük bir fark yaratabilir. Yine, sistemle ilgili deneyim, neyin mümkün olduğuna karar vermek için uzun bir yol kat edecektir.
Deneyin amacına bağlı olarak, farklı özelliklere (örn. spektrum, yoğunluk) sahip bir ışık kaynağı istenebilir. LED çubuklar kolayca değiştirilebilir. Işığın kabın her yerine ulaştığından emin olun.
Deney, zebra balığının gözlem kabında birkaç saat kalmasını gerektiriyorsa, havalandırma sağladığınızdan emin olun. Bir klips kullanılarak sağ arka köşeye bir hava tüpü takılabilir. Bilgisayar ekranında klibin kaydı engellemediğini kontrol edin, yani. zebra balığının hiçbir zaman gözden gizlenmediğini. Şekil 2A ve 2B'de siyah klips üstten görünümde görülebilir. İdeal olarak, gürültüyü önlemek için kayıtlardan önce veya kayıtlar arasında havalandırma sağlanmalı, ancak kayıt sırasında havalandırma sağlanmamalıdır. Ayrıca, güçlü havalandırmayı açıp kapatmanın zebra balığını ürkütebileceğini unutmayın.
Deney, zebra balığının gece boyunca kapta tutulmasını gerektiriyorsa, zebra balığının dışarı sıçramasını önlemek için gözlem odasını şeffaf bir kapakla kapatmakta fayda vardır (ki bu çok yaygın bir durumdur). Kayıttan önce kapak çıkarılmazsa (zebra balığını rahatsız etmemek için), aşağıdaki iki noktayı göz önünde bulundurun: 1) ışık kaynaklarının ayna görüntülerinin kaydı engellemediğinden emin olun (örneğin, ışık kaynaklarını kaydırarak veya ışığı yalnızca minimum düzeyde yansıtan bir kapak seçerek); 2) gece boyunca kullanıldığında kapağın buğulanabileceğini göz önünde bulundurun, özellikle bu durumda havalandırmanın da sağlanması gerektiğinden; Bunu azaltmanın bir yolu, içinde küçük delikler olan bir kapak seçmektir.
Bazı deneyler için, bir ilacı uygulamadan önce zebra balığının temel davranışını belirlemek gerekli olabilir. Bu durumda, ilaç seanslar arasında bir tüp yoluyla eklenebilir (yukarıda tartışılan havalandırma tüpüne benzer).
Burada odak noktası zebra balığı (Danio rerio) kaydı olsa da, diğer balık türleri de elbette sistemle kaydedilebilir. (Genç) Japon balığı (Carassius auratus), kaplan dikeni (Barbus tetrazona) ve yeşil kılıçkuyruk (Xiphophorus helleri) davranışlarını incelemek için kullanılmıştır.
Son olarak, gözlem tanklarının diğer boyutlarının da prensip olarak mümkün olduğunu belirtmek gerekir. Ancak, çok daha büyük gözlem kapları kullanıldığında sistemin yeniden yapılandırılmasını ve uzamsal ve zamansal çözünürlük arasında iyi bir denge bulunmasını gerektirecektir. Ayrıca, kabın şekli küboid olmalıdır. Zebra balığı veya diğer deneysel deneklerin sayısı teorik olarak sınırsızdır; ancak etiket değişimi denek sayısı arttıkça artar.

Zebra balığı biyolojik ve farmakolojik araştırmalar için önemli bir model haline gelmiştir1-3. Bireysel zebra balıklarının ve zebra balığı sürülerinin hareket ve mekansal dağılım modellerinin izlenmesi paha biçilmezdir. Daha eski çalışmalar, kaydedilen görüntülere dayalı olarak manuel niceleme uygular4. Şimdi, 2D otomatik video izleme sistemleri yaygın olarak kullanılmaktadır5. Bununla birlikte, zebra balığı ve diğer birçok suda yaşayan ve olmayan hayvan üç boyutlu bir uzayda hareket ettiğinden, 3D sistemlere olan ilgi artmaktadır6. Açıklanan 3D sistem ilk olarak 2007 yılında yayınlanmıştır7. Teknik detaylar ve diğer sistemlerle karşılaştırmalar için bakınız8. Bu sistemin diğer sistemlere kıyasla temel avantajı, bir yansıtma sistemi kullanarak iki (isteğe bağlı olarak üç) senkron ve bağımsız görünüm elde etmesi ve iki aşamalı bir kalibrasyon protokolü kullanmasıdır. İlk adımda, stereo sistemin 3D geometrisi (kamera ve aynalar tarafından oluşturulan) kalibre edilir. İkinci adımda, ışık kırılmasının neden olduğu doğrusal olmayan hatalar düzeltilir. Suda yaşayan hayvanları incelerken, ışık kırılmasının etkisi düzeltilmeden bırakıldığında önemli olabilir. Şimdiye kadar yayınlanan diğer sistemler (hatta daha yeni gelişmeler9) iki aşamalı kalibrasyon prosedürünü atlıyor. Nesne tanımlama, çoklu nesne izleme ile oklüzyon, jigging gürültüsü vb. hakkında teknik ayrıntılar için. Okuyucu orijinal yayınlarayönlendirilir 8,9. Sistem, kaygı benzeri davranışsal tepkilerin10,11, sürü8,11,12 incelenmesi ve bir ön çalışmada zebra balığı13'te antagonistik davranış için doğrulanmıştır. Ayrıca diğer balık türleri (Japon balığı8, kılıçkuyruk, kaplan dikeni) ve fareler9 için test edilmiştir.
Aşağıda, kalibrasyon ve sistemin kullanımı için protokoller açıklanmış ve NMDA-reseptörü rekabetçi olmayan antagonist MK-801'in sürü zebra balığı üzerindeki etkilerini test eden bir deneyin sonuçları, sistemle elde edilebilecek veri türünü göstermek için temsili bir örnek olarak sunulmuştur.
Hem doğal ortamda hem de akvaryumlarda, zebra balığı genellikle sürüler halinde yüzer14. Sürü tercihleri, yetiştirme, cinsiyet ve yiyecek mevcudiyeti gibi çeşitli faktörlere bağlı gibi görünmektedir14,15. İlginç bir şekilde, bir sürüdeki tek tek zebra balığı arasındaki mesafe, alarm feromonları16 veya yenilik11 gibi potansiyel tehlike sinyalleri mevcut olduğunda küçülür. Bu nedenle sığlaşma paradigması, anksiyolitik ilaçları test etmek için de kullanılmaktadır17. Baskınlık hiyerarşileri18 ve sosyal öğrenme19, zebra balığı davranışının büyüleyici yönüdür. Oldukça gelişmiş sosyal davranışsal karakteri nedeniyle, zebra balığı otizm araştırmaları için de ilgi çekici hale gelmiştir20,21.
MK-801'in zebra balığı5,22,23'te sosyal davranışı değiştirdiği bildirilmiştir, bu da memeliler üzerindeki etkilerini anımsatır24. Bununla birlikte, MK-801'in diğer davranışlar üzerinde başka birçok etkisi de vardır (yüzme davranışı, engelleyici kaçınma ve yer tercihi25-27 gibi). Bu nedenle, ilk deneylerde temel gözlemlerden mümkün olduğunca fazla bilgi elde etmek çok önemlidir. Bu, daha hedefli deneyler tasarlamak için temel sağlayacaktır.
Kayıt cihazı ve yazılımının incelenmesi
Mevcut konfigürasyonunda, zebra balığını tutan gözlem kabı (25 cm x 25 cm x 18 cm, U x G x Y), gözlem odasına (91 cm x 46 cm x 56 cm, U x G x Y) yerleştirilmiştir. Haznede ayrıca bir kamera, kabın üzerinde yaklaşık >45° açıyla asılı duran bir ayna ve LED ışık çubukları bulunur. Şekil 1'de basitleştirilmiş bir diyagram gösterilmektedir. Kamera, zebra balığının x, y ve z koordinatlarını belirleyerek 3 boyutlu yörüngelerini oluşturmak için hem önden görünümü hem de üstten görünümü (ayna) kaydeder. Oryantasyon amacıyla, koordinat vektörleri, Yol Yeniden Yapılandırma Modülü tarafından oluşturulan 3B görünümlerde (örn. Şekil 15) sunulan vektörlere karşılık gelen gözlem kabının sol ön köşesinde (kameraya göre konum) sunulur (aşağıya daha fazla bakın). Örnekleme hızı fotoğraf makinesine ve bilgisayara bağlıdır. Deneylerimizde yaklaşık olarak 40 kare/sn'dir (fps). Kaydedilen karelerin uzamsal çözünürlüğü 640 x 480 pikseldir (bu konfigürasyon, uzamsal ve zamansal çözünürlük arasında en uygun denge olarak seçilmiştir). Windows XP veya üstü gereklidir.
İlk kayıttan önce, sistemin konteynerin duvarlarının ve su yüzeyinin konumlarını belirlemek, kaydedilen karelerin ölçekleme faktörünü belirlemek ve sudan havaya geçerken ışığın kırılmasından kaynaklanan büyük hatayı ayarlamak için kalibre edilmesi gerekir. Prensip olarak, kalibrasyon yalnızca ilk kurulum sırasında ve kurulumun kamera veya ayna gibi parçaları taşındıktan veya değiştirildikten sonra yapılmalıdır. Bununla birlikte, zaman zaman kalibrasyonun hala doğru olup olmadığını kontrol etmek ve gerekirse yeniden kalibre etmek iyi bir uygulamadır.
Yazılım üç modülden oluşmaktadır. Kayıt Modülü kareleri kaydeder (Şekil 2'de iki örnek çerçeve gösterilmiştir). Yörünge Modülü, her zebra balığı için yolları yeniden oluşturur. Veri İşleme Modülü, bir dizi standart kinematik ve uzamsal parametreyi hesaplar. Daha fazla analiz amacıyla, veriler elektronik tabloya veya istatistiksel yazılıma aktarılabilir.

<table><tbody><tr><td>AABT-3D İzleme Donanımı</td><td>xyZfish</td><td>AABT II</td><td>Kamera, ekran kartı, aynalı ve aydınlatmalı gözlem bölmesi içerir</td></tr><tr><td>AABT-3D Kalibrasyon ekipmanı</td><td>xyZfish</td><td>calib</td><td>Kalibrasyon paneli ve yan ayna içerir</td></tr><tr><td>AABT-3D Gözlem kapları</td><td>xyZfish</td><td>küpleri</td><td>&nbsp;</td></tr><tr><td>AABT-3D İzleme yazılımı</td><td>xyZfish</td><td>v.1.0</td><td>&nbsp;</td></tr><tr><td>Bilgisayar</td><td>isteğe bağlı</td><td>Yok</td><td>Windows XP veya üstü</td></tr> <tr><td>(+) - MK-801 hidrojen maleat</td><td>Sigma</td><td>M107</td> <td>&nbsp;</td></tr><tr><td>Hava pompası</td><td>Fusion</td><td>500</td><td>&nbsp;</td></tr><tr><td>Hava hattı borusu 3/16"</td><td>Lee' s Akvaryum ve Evcil Hayvan Ürünleri</td><td>14508</td><td>&nbsp;</td></tr><tr><td>Orta Bağlayıcı Klipsler</td><td>OfficeDepot</td><td>561339</td><td>Havayolunu gözlem kabına bağlamak için</td></tr></tbody></table>

yetişkin zebra balığının bireysel ve sürülerini kaydetmek için otomatik bir 3d İzleme sistemi kullanma

Using an Automated 3D-tracking System to Record Individual and Shoals of Adult Zebrafish

Birçok su hayvanı gibi, zebra balığı (Danio rerio) da 3B bir alanda hareket eder. Bu nedenle, davranışını incelemek için bir 3D kayıt sisteminin kullanılması tercih edilir. Sunulan otomatik video izleme sistemi, bunu bir ayna sistemi ve ışığın sudan havaya geçişinin neden olduğu önemli hatayı düzelten bir kalibrasyon prosedürü kullanarak gerçekleştirir. Bu sistem ile yetişkin zebra balıklarının hem tek hem de grup halinde kayıt altına alınması mümkündür. Kullanmadan önce sistemin kalibre edilmesi gerekir. Sistem üç modülden oluşur: Kayıt, Yol Yeniden Yapılandırma ve Veri İşleme. Kalibrasyon ve üç modülün kullanımı için adım adım protokoller sunulmaktadır. Deney düzeneğine bağlı olarak, sistem neofobi, beyaz nefreti, sosyal uyum, motor bozukluklar, yeni nesne keşfi vb. test etmek için kullanılabilir. İlaçların veya mutasyonların temel davranış kalıpları üzerindeki etkilerini incelemek için ilk adım bir araç olarak özellikle umut vericidir. Sistem, zebra balığının dikey ve yatay dağılımı, kinematik parametrelerin xyz bileşenleri (hareket, hız, ivme ve dönüş açısı gibi) hakkında bilgi sağlar ve sürüleri test ederken sosyal uyum parametrelerini hesaplamak için gerekli verileri sağlar.

Zebra balığının tek tek ve gruplarını izleyebilen bir 3D otomatik video sisteminin kullanımı anlatılmaktadır. Uygulama örneği olarak, NMDA reseptör antagonisti MK-801'in zebra balığı sürüleri üzerindeki etkilerini araştırıyoruz.

Yetişkin Zebra Balığının Bireysel ve Sürülerini Kaydetmek için Otomatik Bir 3D İzleme Sistemi Kullanma

Like many aquatic animals, zebrafish (Danio rerio) moves in a 3D space. It is thus preferable to use a 3D recording system to study its behavior. The ...

Bu prosedürün genel amacı, zebra balıklarının veya diğer sucul hayvanların üç boyutlu hareket modellerini incelemek ve bunların kinematik, mekânsal ve sosyal özelliklerini analiz etmektir. Bu sayede genetik mutasyonlar ya da kimyasal ve çevresel faktörler nedeniyle meydana gelen davranış değişikliklerinin tespit edilmesi mümkün olur. Bu işlem, öncelikle sistemin kalibre edilmesiyle gerçekleştirilir; bu adım aynı zamanda kırılma nedeniyle oluşan belirgin görüntü bozulmalarını da düzeltir.İkinci adım, nispeten yüksek zamansal çözünürlükte video karelerini aynı anda en az iki farklı açıdan kaydetmektir. Ardından, yazılım balıkların yörüngelerini yeniden oluşturur. Gürültü etkisini azaltmak ve örtüşme veya kümelenme meydana geldiğinde balığın konumunu belirlemek için gelişmiş algoritmalar uygulanır.Son adım, verilerin analiz edilmesi ve hızlanma, dönüş açısı, gözlem kabındaki yatay ve dikey dağılım, bireyler arası mesafeler ve ilgi duyulan diğer parametreler için istatistiksel analizlerin gerçekleştirilmesidir. Nihayetinde, yüksek hızlı kalibre edilmiş 3D takip, mutant zebrafish'lerdeki davranışsal eksiklikleri ve ilaçların çeşitli davranışsal sistemler üzerindeki etkilerini incelemek için yararlıdır. İlaç keşfi amacıyla, sistemin bir avantajı, balıkların davranışlarının 3D olarak incelenmesine olanak tanımasıdır.Balıkların doğal olarak üç boyutta hareket etmeleri ve birden fazla balığın aynı anda kaydedildiği durumlarda, grubun uzamsal konfigürasyonlarını incelerken 2D kaydın oldukça yanıltıcı olabilmesi nedeniyle bu durum önemlidir. Sistemin bir diğer avantajı ise, düzeltilmediği takdirde mevcut konfigürasyonunda önemli ölçüm hatalarına yol açabilen ışık kırılmasını düzeltmesidir. Zebra balıklarını içeren gözlem kabı, gözlem odasına yerleştirilmiştir.Hazne ayrıca bir kamera, kabın üzerinde yaklaşık 45 derecelik açıyla asılı duran bir ayna ve LED ışık çubukları içerir. Kayda başlamadan önce, kap duvarı ve su yüzeyi konumlarını ve kaydedilen karelerin ölçeklendirme faktörünü belirlemek için sistemi kalibre edin; ayrıca ışığın sudan havaya geçerken oluşturduğu kırılma hatasını da düzeltin. Kalibrasyon tamamlandıktan sonra, cansız bir balıkla deneme çalışması yapılmalıdır.Ayna veya kamera konumları kaymışsa ya da izleme ile ilgili sorunlar yaşanıyorsa yeniden kalibrasyon yapılmalıdır. Bir kayıt oturumuna başlamak için, işaretlere kadar suyla doldurulmuş gözlem kabını gözlem haznesine yerleştirin. Kabın ayakları hizalama deliklerine yerleştirilmelidir.Yarı şeffaf veya opak duvarlar, kamera bakış açısına göre uzak tarafa ve sağa bakacak şekilde kapları yerleştirin. Ardından, bölmedeki ışıkları açın, balıkları kabın içine koyun ve perdeleri kapatın. Kayıt modülünü açtığınızda, kabın ön ve üstten görünüm görüntüleri ekranda belirecektir.Başlangıçta, elde edilen görüntü ideal olmayabilir ve bu nedenle balık ile arka plan arasında yeterli kontrast sağlamak için bazı ayarlamalar gerekebilir. Görüntüyü ayarlamak için kamera kontrolünü seçin ve ardından açılan genel ayarlar penceresinde burada gösterilen kutucukların işaretini kaldırın; ardından görüntünün aşırı pozlanmaması için perde hızını (shutter) ve kazancı (gain) ayarlayın. Sonra, kamera kontrol penceresinin sol tarafında beyaz dengesi rengini seçin ve yeni pencerede otomatik (auto) kutucuğunun işaretini kaldırarak hem ön hem de üst görünümde en iyi renk kontrastını elde etmek için kırmızı ve mavi değerlerini ayarlayın.Ayarlamalar tamamlandıktan sonra birden fazla düzeltme yapılması gerekebilir. Kayıt modülünün ana menüsünden, bir klasör oluşturmak veya seçmek için veri konumunu seçin. Her kaydın, deney klasörünün bir alt klasörü olması gereken kendine ait bir klasörü olmalıdır.Şimdi kaydı başlat düğmesine basın ve kayıt süresi için dakika cinsinden bir tam sayı girin, ardından tamam düğmesine basın; böylece deneysel kayıt oturumu başlayacaktır. Kayıtlar tamamlandığında, yol yeniden yapılandırmasını başlatmak için kalibrasyon klasöründeki hayvan konteyner verilerini ve yazışma verileri alt klasörlerini, daha önce kayıt sırasında oluşturulan klasörlere kopyalayıp yapıştırın. Ardından yazılımın trajektori modülünü açın. Daha sonra, kayıt modülü ile oluşturulan klasörü seçmek için veri konumu düğmesine basın.Ardından, önce parametreler penceresini açmak için sistem kurulum düğmesine basın ve üst uç alt görünüm renk eşiklerini ayarlayın. 1000 iyi bir başlangıç değeridir. Daha sonra, üst uç, alt görünüm boyut eşiklerini seçin.Orta büyüklükteki bir zebra balığı için uygun bir başlangıç boyutu 10'dur; büyük bir balık için 20, küçük bir balık için ise 5 kullanın. Bu eşik değerleri ne kadar yüksek olursa, yazılımın gürültüyü algılama olasılığı o kadar azalır. Ancak, değer çok yüksek olduğunda, yazılım balığı tespit edemeyebilir.Deneyin ilerleyen aşamalarında bu eşik değerlerini yeniden ayarlamak gerekebilir. Üst boyut eşiği için genellikle 3000 değeri yeterlidir. Özgül uzunluk için ise 220 olan ön ayarlı değeri koruyun.Balık sayısı, gözlem tankındaki balık sayısını ifade eder. Maksimum nokta sayısı, toplam kare sayısını ifade eder; bu sayıyı kaydedin veya aklınızda tutun ve Tamam'a basın. Ardından, arka planı edin seçeneğini belirleyin.Bir sonraki pencerede iki alanın doldurulması istenecektir. Arka plan yüklendikten sonra, farenizi kullanarak üç kırmızı kutuyu ayarlayın; bu kutular, yazılımın balıkları aradığı alanları belirler. Soldaki kutuyu küçültün.Yan görünüm yalnızca kalibrasyon için kullanıldığından, şimdi yörüngeleri oluşturmaya başla düğmesine basın ve yol yeniden yapılandırması başlayacaktır. İdeal olarak, etiket balığın görüntüsü üzerine yerleştirilmelidir; eğer etiket sıklıkla yanlış yerleştiriliyorsa, bilgi penceresini açın. Burada, yalnızca balığın ana hatlarının görüldüğü ideal bir durumu görüyoruz.Aşırı gürültü oluşması durumunda, ana menüden durdur düğmesine basın ve yeni renk ve boyut eşik değerleri seçin. Ayrıca, kırmızı kutucukların hafifçe küçültülüp küçültülemeyeceğini kontrol edin. Örneğin, üst kısımda su hareketlerinin oluşturduğu gürültüyü hariç tutmak için 3D ekrandaki yörüngeyi izleyin.Fare ile sağ tıklayarak, araştırmacı 3B konfigürasyonun döndürülmesi veya ötelenmesi arasında seçim yapabilir. Veri işlemeye başlamak için veri işleme modülünü açın, araç çubuğundan projeyi seçin ve ardından açılır menüden yeniyi seçip bir deney adı girin. Ardından, projeyi düzenle seçeneğini seçin.Ardından projeye ekleyin, ardından yeni grup seçeneğini seçin ve deneysel grup için bir isim girin. Şimdi sağ penceredeki deneysel grubu seçin. Araç çubuğunun değişeceğini unutmayın.Düzenleme grubunu seçin, ardından gruba ekle ve sonrasında yeni ölçümler seçeneklerini belirleyin. Bu işlem bir tarayıcı penceresi açacaktır. Ardından, kayıt sırasında oluşturulan klasörü açın, trajectories alt klasörünü seçin ve ardından point smoothened dosyasını seçin.Burada grup A için sunulan örnekte altı dosya, grup B için ise dört dosya yüklenmiştir. Analize başlamak için sağ penceredeki düzleştirilmiş nokta dosyasını seçin. Ardından açılır menüden veri işlemeyi ve tek değerli uç noktaları seçin.Örnekleme amacıyla, süreye bağlı dondurma (duration freezing) seçeneğini belirleyin. Programa aşina olmanız için hız eşiği ve süre eşiği cinsinden dondurma ayarlarını belirtmenizi sağlayacak bir pencere açılacaktır. Derinlik seviyesi sayısının ve burst frekansının belirlenmesine olanak tanıyan yol katetme mesafesi derinlik dağılımı (travel distance depth distribution) gibi diğer örnekleri deneyin.Bu seçenek seçildiğinde, varsayılan yaklaşık 200 uç nokta eşiği kullanılarak toplu işlem hesaplamaları gerçekleştirilecektir. Varsayılan ifadesi, sınırlandırıcıların belirlenmiş olduğu anlamına gelir. Örneğin, şu anda derinlik dağılımı üç derinlik seviyesi için ve açısal dağılım dört bölüm için hesaplanmaktadır.Parametreler oluşturulduktan sonra, oluşturulacak dosyanın konumunu ve adını isteyen yeni bir pencere açılacaktır. Bunlar CSV formatında kaydedilecek ve diğer yazılımlara aktarılabilecektir. Burada, Şekil A kontrol için tipik bir örnek kareyi göstermektedir.Zebra balığı, şekil B ise sabah oturumu sırasında kaydedilen, MK 801 ile işlem görmüş zebra balıkları için tipik bir örnek kareyi göstermektedir. Kontrol grubundaki zebra balıklarının tabana yakın ve birbirlerine yakın oldukları görülmektedir. Buna karşılık, MK 801 uygulanan zebra balıkları üst kısma yakın konumdaydılar ve birbirlerinden önemli ölçüde uzak yüzdüler.Burada, kontrol grubu zebra balıkları ile 10 µM MK 801 ile tedavi edilen zebra balıkları için bir sabah oturumu ve bir öğleden sonra oturumuna ait iki temsilci yörünge sunulmuştur. Bu şekilde, kontroller ve 10 µM MK 801 ile tedavi edilen balıklar için her iki oturuma ait ortalama sosyal mesafeler sunulmakta olup, burada her iki grup için ortalama bireyler arası mesafelerin zaman çizelgeleri verilmiştir.Şekil A'da, sabah oturumu için zebra balığının 10 eşit derinlik seviyesindeki dağılımını ve B'de, öğleden sonraki oturum için dağılımı görüyoruz. Deney gruplarının dört radyal zon üzerindeki zamansal dağılımı burada görülmektedir. Küçük resim, bu zonların merkezden çevreye doğru konumlarını göstermekte olup, burada deney gruplarının dört kadran üzerindeki zamansal dağılımını görüyoruz.Küçük resim kadranların konumunu göstermektedir. Çift çizgiler beyaz duvarları, tek çizgiler ise şeffaf duvarları temsil eder. Kamera, küçük resmin solunda, yani birinci ve dördüncü kadranlara en yakın konumda yer almaktadır.Siyah yıldızlar sabah oturumundaki gruplar arasındaki karşılaştırmaları, gri yıldızlar ise öğleden sonraki oturumlardaki karşılaştırmaları belirtmektedir. Son olarak, zebra balığının sabah ve öğleden sonraki oturumlardaki katettiği mesafenin X, Y, Z bileşenleri burada gösterilmiştir. Ortalama ve standart hata ortalaması sunulmuştur.Sistemle çalışırken, verilerin kalitesinin kayıt kalitesine bağlı olduğunu unutmayın; bu nedenle sistemin iyi kalibre edildiğinden ve kamera ayarlarının optimal olduğundan emin olun. Geri kalanı kolaydır ve yalnızca farklı adımlara aşina olma meselesidir.

using-an-automated-3d-tracking-system-to-record-individual-shoals

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Bir Otomatik 3D-izleme Sistemini Kullanarak Yetişkin Zebra Balıklarının Bireysel ve Sürülerinde Kayıt Yapılması

VisioTracker göz hareketlerinin kayıt dayalı larva ve küçük yetişkin balık görsel performans kantitatif analizi için otomatik bir sistemdir. Bu tür görsel sistem gelişimi ve işlevi, farmakoloji, nöral devre çalışmaları ve sensorimotor entegrasyon gibi alanlarda yüksek verimli araştırma sağlayarak, görsel uyarana özellikleri ve gerçek zamanlı analiz üzerinde tam denetime sahiptir.

VisioTracker, Okülomotor Analizi Yenilikçi Otomatik Yaklaşım

Video, zebra balığı larvalarının kaçınma ve timotaksis testini anlatıyor. Video, zebra balığı larvalarının görsel caydırıcı uyarana yanıt olarak davranışlarını inceler.

Zebra Balığı Kaçınma ve Timotaksis Deneyi: Caydırıcı Görsel Uyarana Yanıt Olarak Larva Davranışını İncelemek İçin Yüksek Verimli Bir Yöntem

Laboratuvarımız 7 günlük eski Zebra balığı larvaları birkaç farklı davranışların tespiti için yararlı bir yeni yüksek verimli otomatik görüntüleme sistemi geliştirdi. Sistem, larva çevresel toksik ya da eczacılık maruz kalmış sonra davranış ince değişiklikleri tespit etmek için kullanılabilir.

Zebra balığı Larva otomatik Yüksek verim Davranış Analizleri

Zebra balığı, kas fonksiyonlarını ve hastalıklarını incelemek için mükemmel bir modeldir. Erken embriyogenez sırasında zebra balığı düzenli kas kasılmalarına başlar ve ritmik yüzme davranışı üretir ve bu da kas bozulduğunda değişir. Burada, yüzme performansını kas fonksiyonunun bir ölçüsü olarak incelemek için dokunma ile uyarılmış bir tepki ve hareket testini açıklıyoruz.

Dokunmatik uyarılmış Yanıt ve Hareket Deneyleri kullanarak Zebra balığı kas Performans ve fonksiyonunu değerlendirmek için

Burada, tasarım ve yüksek işlem hacmi zebra balığı embriyo bir 96-şey plaka diziliyor için böyle şablon kullanımı ayrıntılı yordam tarafından ardından arraying bir zebra balığı embriyo imal için bir protokol mevcut.

3 boyutlu (3D)-yüksek işlem hacmi zebra balığı diziliyor embriyo için şablon basılı

Burada, davranışları ve hayati bir mechanosensory sistem boyama yöntemleri için yüksek üretilen iş çalışma Meksika cavefish bir dizi mevcut. Bu yöntemler davranışları çalışmaları için pratik ve düşük maliyetli bir yöntem sağlayan ücretsiz yazılım ve özel komut dosyalarını kullanın.

Davranışsal izleme ve Meksika Cavefish Neuromast görüntüleme

Zebra balığı'nın kişilikleri onların yanıt-e doğru su akıntıları ve zayıf manyetik alan etkisi nasıl değerlendirmek için tasarlanmış bir davranış protokol açıklar. Aynı kişilikleri balıklarla yönler davranışlarını göre ayrılır. Sonra rheotactic yönlendirme davranışlarını bir yüzme tünelde bir düşük Debi ile ve farklı manyetik koşullar altında görülmektedir.

Zebra balığı manyetik alanlara hassasiyeti kişiliği olan etkisinin değerlendirilmesi

Omurilik yaralanmasından sonra fonksiyonel iyileşme yeteneğine sahip olan yetişkin zebra balığı, doğuştan gelen nöral rejenerasyon mekanizmalarını aydınlatmak için önde gelen bir model sistemidir. Burada, yüzme dayanıklılığını ve yüzme davranışı testlerini omurilik rejenerasyonunun fonksiyonel okumaları olarak tanımlıyoruz.

Yetişkin Zebra Balıklarında Yüzme Dayanıklılığı ve Yüzme Davranışının Değerlendirilmesi

Bu protokol, zebra balığı larvalarında kardiyak kasılma fonksiyonunu araştırmak ve hücre izleme ve etkileşimli analiz yoluyla kalp mekaniği hakkında bilgi edinmek için ışık tabakası görüntülemeyi kullanır.

Zebra Balığı Kardiyak Kasılmasının 4D Işık Sayfası Görüntüleme

Çok odalı sosyal tercih görevleri, kemirgenlerden zebra balıklarına uyarlanmış ve model organizmalarda sosyal davranışın incelenmesini kolaylaştırmıştır. Bu protokol, web kameraları ve açık kaynak yazılımları kullanarak zebrafishin sosyal tercihlerini ölçmek için düşük maliyetli 3 odalı açık tank görevini doğrularak lisans araştırma ve öğretimine erişilebilir hale getirir.

Zebrabalıkta (Danio rerio) 3 odalı açık tankta serbest yüzme görevi kullanılarak sosyal tercihi incelemek için düşük maliyetli alternatif

Keşfedin 3D otomatik izleme sistemini kullanarak Danio rerio'nun bireysel ve sürü davranışlarını analiz etmeyi. Bu yöntem, ilaç etkilerini ve genetik mutasyonların davranışsal sonuçlarını araştırmak için güvenilir bir araç sunar.

Yetişkin Zebra Balığının Bireysel ve Sürülerini Kaydetmek için Otomatik Bir 3D İzleme Sistemi Kullanma

Daha fazla video keşfet