Name: Bluetongue Virüs karşı Roman Antiviraller belirlenmesi için Tahliller (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2013-10-11T23:00:00.000+00:00
Duration: 12 min 2 s
Description: Keşfedin, Bluetongue virüsüne karşı küçük moleküllü antiviralleri CPE tabanlı hücre canlılığı testi, doz-yanıt testi ve ToA testi kullanarak belirleme yöntemlerini. Bu hassas ve tekrarlanabilir teknik, yeni antiviral ilaç keşfi için güvenilir bir çerçeve sunar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu proje hibe 1R03MH08127-01 ve NIH S. Li 7R03MH08127-02 tarafından desteklenen ve UAB Tıp Bölümü&#39;nden IMPACT fonları tarafından S. Li edildi. Molette Fonu ve Auburn Üniversitesi desteği takdir edilmektedir. Biz de işin sırasında Bayan Pulin Che ve Sayın Volodymyr Musiienko gelen teknik yardımların teşekkür ederim.

1.. Hücreler, virüs ve antiviral bileşikleri <ol><li> BSR hücreleri,% 5 fetal buzağı serumu (FCS) ihtiva eden bebek hamster böbrek bir türevi, Dulbecco&#39;nun modifiye edilmiş Eagle ortamında (BHK) hücreleri, 10, (DMEM) korumak, 100U/ml penisilin ve 100 ug / ml streptomisin. </li><li> Üç analizi için,% 1 FCS, 100U/ml penisilin ve 100 ug / ml streptomisin ile DMEM içerisinde plaka hücreleri, 5, daha önce optimize edilmiş olarak. Bu ortam, her üç deneyleri için deney ortamı olarak adlandırılır. </li><li> % 5 CO2 ve% 80-95 nem ve 37 ° C&#39;de inkübatör içinde tüm hücreleri inkübe edin. </li><li> Plak-saflaştırılması ve daha önce tarif edildiği gibi, 8 tipi 10 BTV (BTV-10) yayılır. Her belirlenen deneyleri için deney ortamında BTV-10 seyreltin. </li><li> 10 mM&#39;lik bir konsantrasyon ile bir stok oluşturmak için DMSO içinde tüm test bileşikleri çözülür. -20 ° C&#39;de stokları Mağaza </li><li> Adayı için deney ortamı kullanılarak arzu edilen konsantrasyonlara bileşikler seyreltind deneyleri 2. </li></ol> 2. CTG Kiti kullanılması CPE temelli Assay <ol><li> MicroFlo seçme dağıtıcı aracılığıyla, bir 384 çukurlu mikrolevhanm (16 x 24 kadar bir biçimde siyah) içine tohum BSR hücreleri. Tohum yoğunluğu da 5000 hücre / ve tohumlama hacim antiviral etkinliği analizi için 20 ul. </li><li> Hücreler iyice plakasına yapışık gidene kadar 2-3 saat boyunca inkübe hücreleri. </li><li> Her bir oyuğa 10 uM bir nihai konsantrasyonuna sahip bir antiviral bileşiği ilave edin. Tamamen karıştırın. </li><li> İstenen bir tirenin BTV&#39;ye seyreltilir ve her bir oyuğa gösterilen MOI ile 5 ul BTV&#39;ye ekleyin. Kontrolü için iyi, tahlil medya 5 ul ekleyin. % 5 CO2 ve% 80-95 nem ve 37 ° C&#39;de 72 saat için enfekte olmuş hücreleri inkübe edin. </li><li> 72 HPI, çözülme ve kullanılmadan önce oda sıcaklığına CTG tampon ve liyofilize CTG tabakayı dengeye At. Th göre olan liyofilize enzim / alt-tabaka ve tampon reaktif karıştırılarak homojen CTG madde çözeltisini sulandırınE üreticinin talimatları. </li><li> 15 dakika boyunca oda sıcaklığına kadar deney plakaları dengelenmesi. </li><li> Bir dağıtıcı ile her bir kuyucuğa CTG reaktiflerin eşit bir hacmi (25 ul) ilave edin. Karanlıkta, oda sıcaklığında 15 dakika boyunca kuluçkaya bırakıldıktan sonra 0.1 saniye bir entegrasyon süresi ile, bir multi-mod okuyucusu kullanılarak ışık yayılması sinyalleri ölçer. </li></ol> 3. Doz-yanıt Deneyi <ol><li> Sırasıyla / oyuk anti-viral etkinliği tahlili için 20 ul ve sitotoksisite analizi için 25 ul bir hacim içinde ekim 5000 hücre bir çekirdek yoğunluğu olan bir dağıtıcı ile, (16 x 24 ile biçim siyah), bir 384-çukurlu Tohum BSR hücreleri . </li><li> % 5 CO2 ve% 80-95 kadar hücreleri nem, 37 ° C&#39;de 2-3 saat boyunca hücrelerin inkübe iyi levhaya eklenir. </li><li> Tablo 1 &#39;de gösterildiği gibi, (bir 96-çukurlu plaka eşdeğeri), her bir bileşik için 384 oyuklu plakanın çeyrek bölgesinde işlem deneyi. Her bir konsantrasyon için sekiz çoğaltır tahsisTek bir deneyde gösterilebilir. Sadece bileşikler olmadan virüs ekleyerek negatif kontrol olarak bileşik ve virüs eklemeden Pozitif kontrol olarak, ilk sütun ve son kolon (12 th) düzenleme. </li><li> Deney ortamı içinde 50 uM bileşikleri seyreltilmiş ve 20 ul / oyuk anti-viral etkinlik tahlili için de, 2. sütuna ekleyin. 25 uM bir konsantrasyona kadar 8 kanallı yarı otomatik pipet kullanılarak bileşik beş kez karıştırın. </li><li> 8 kanallı yarı otomatik pipet kullanılarak, 12.5 uM bir konsantrasyon elde etmek için iyice karıştırın, bir sonraki sütuna (3.) 2 nci sütunda 20 | il karışımı aktarın. 6.25 uM&#39;lik bir konsantrasyon ile bir iki-kat seyreltme oluşturulması için bir sonraki sütuna (4.) 3 rd sütundan 20 ul karışım aktarılması ile bu işlemi tekrar edin. 11. sütun kadar bu iki kat seri seyreltme tekrarlayın. Aspire ve comp ekleme ve karıştırma sonrası 11. sütundaki karışımı 20 ul atmakound. </li><li> 5 ul / göz hacminde ile sütun 11 den sütun 2 her bir göze, BTV&#39;ye-10, 0.01, MOI göre ekleyin. Virüsü ilave edildikten sonra, her sütun içinde son bileşik konsantrasyonu olması gerekir: 2. sütunda 20 uM, sütun 3&#39;te 10 uM ve 0.04 uM&#39;lik nihai bir konsantrasyon ile sütun 11 aşağı iki kat seyreltme ile devam etti. </li><li> Sütun 1, orta ve 5 ul hücre yalnızca (pozitif) kontrol ve BTV enfeksiyon olarak kolon 12 BTV 5 ul / göz tek kontrol (negatif) elde edildi. </li><li> Sitotoksisite deneyi için 200 uM &#39;lik bir başlangıç ​​konsantrasyonuna bileşikleri seyreltin. Benzer şekilde, 100 uM bir konsantrasyona 8 kanallı yarı otomatik pipet ile sütun 2 ve karışık 5x 25 ul / kuyucuk bileşik ekleyin. BTV katmayın. </li><li> Komşu sütuna 3 sütun 2 25 ul aspire tarafından iki kat serisi seyreltme yürütmek ve son sütununda (12.) kadar devam etti. Kolon 12 de karıştırıldıktan sonra, aspirat ve m, 25 ul atmakkanşımı,. Sütun 2 de nihai konsantrasyon 100 uM olmalı ve 12. sütun 0.2 uM olmalıdır. Sütun 1, hücre tek kontrolüdür. </li><li> Her ikisi de anti-viral etkinliği ve sitotoksisite analizi için,% 5 CO2 ve 72 saat sonra muamele için% 80-95 nem ve 37 ° C&#39;de inkübe edin. (Protokol 2,5-2,7 adım) yukarıda tarif edildiği gibi CTG kiti kullanılarak hücre canlılığı ölçülür. </li></ol> 4. Time-of-ilavesi (TOA) Deneyi <ol><li> 5000 hücre / oyuk bir dağıtıcı ve tohum hacmi ile 15 ul / oyuk olan, bir 384-çukurlu bir mikrolevhadaki sütun 1-24 (x 24, 16 ile biçim siyah) elde edilen tohumlar BSR hücreleri. </li><li> Her bir bileşik için, 384 oyuklu plakanın (Tablo 2) bir yarısında, her zaman noktası için sekiz kopyaları tüm yirmi dört sütun kullanır. 10 ul / oyuk deney ortamı ilave ederek hücreler sadece kontrol olarak sütun 1 atama. Mark sütun 24 5 ul / oyuk deney ortamı, bir ekleyerek BTV enfeksiyonu tek kontrol (negatif kontrol) ve25 ul / oyuk bir son hacme 0.01 MOl&#39;de d 5 ul / kuyu virüs. </li><li> Sütunda 2-22 farklı saat sonrası enfeksiyon (HPI) itibariyle antiviral etkinlik değerlendirme kolon, çift sayılı sütunları seçin. Bu sütunlar, 0.01 MOl&#39;de 5 ul / oyuk ile BTV hücreleri enfekte etmektedir. HPI farklı olarak, ayrıca 25 ul / lik nihai bir hacim oluşturmak üzere her bir oyuğa 5 ul / göz miktarında seyreltilmiş bileşik ekleyin. Için belirtilen -2 ve -1 HPI önce BTV olduğu enfeksiyona BSR hücreleri bileşik ekleyin. 0 HPI için, aynı anda kültüre bileşik ve BTV&#39;ye ekleyin. </li><li> Bileşiği, sadece kontrol olarak Buna paralel olarak, (-2, -1, 0, 1, 2, 4, 8, 16 belirlenmiş bu bileşik, farklı zaman noktalarında ilave edildi, sütun 3-23 arasındaki tek sayılı sütun tayin 24, 48 HPI). Bu sütunlar, 5 ul / oyuk deney ortamı ilave edin ve 5 ul / göz de 25 ul / lik nihai bir hacim oluşturmak için bileşik seyreltilmiştir. </li><li> Tedaviden sonra, 37 ° C,% 5 CO2 ile% 80-95 nemde hücreleri inkübe. </li><li> Daha önce (protokol 2,5-2,7 adımları) tarif edildiği gibi CellTiter-Glo kiti kullanılarak 72 HPI hücre canlılığı belirler. </li></ol> 5. Veri Analizi <ol><li> Çok modlu okuyucu yoluyla elde ışıldayan sinyallerine dayanan uygun içi yazılımı kullanarak önce tüm verileri işlemek. % 10 daha fazla bir değer gerektirir ortalama değeri (ortalama), her bir muamele için standart sapma (STDEV&#39;leri) yanı sıra katsayı varyasyonu (CV), belirler. </li><li> Bir biostatik ve grafik yazılım aracı için yukarıdaki yazılım işlenen verileri aktarın. EC 50 ve CC 50 değerlerini belirlemek için non-lineer regresyon analizi yürütmek. </li></ol>

<ol><li>Hemati, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bluetongue+virus+targets+conventional+dendritic+cells+in+skin+lymph%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Bluetongue virus targets conventional dendritic cells in skin lymph.</a> J. Virol. 83, 8789-8799 (2009).</li>
<li>Gu, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Novel+Virostatic+Agents+against+Bluetongue+Virus%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Novel Virostatic Agents against Bluetongue Virus.</a> PLoS ONE. 7, e43341(2012).</li>
<li>Meiswinkel, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+2006+outbreak+of+bluetongue+in+northern+Europe--the+entomological+perspective%5BTitle%5D)+AND+%22Prev.+Vet.+Med%22%5BJournal%5D)">The 2006 outbreak of bluetongue in northern Europe--the entomological perspective.</a> Prev. Vet. Med. 87, 55-63 (2008).</li>
<li>Szmaragd, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mortality+and+case+fatality+during+the+recurrence+of+BTV-8+in+northern+Europe+in+2007%5BTitle%5D)+AND+%22Vet.+Rec%22%5BJournal%5D)">Mortality and case fatality during the recurrence of BTV-8 in northern Europe in 2007.</a> Vet. Rec. 161, 571-572 (2007).</li>
<li>Li, Q., Maddox, C., Rasmussen, L., Hobrath, J. V., White, L. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assay+development+and+high+throughput+antiviral+drug+screening+against+Bluetongue+virus%5BTitle%5D)+AND+%22Antiviral+Research%22%5BJournal%5D)">Assay development and high throughput antiviral drug screening against Bluetongue virus.</a> Antiviral Research. 83, 267-273 (2009).</li>
<li>Noah, J. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+cell-based+luminescence+assay+is+effective+for+high-throughput+screening+of+potential+influenza+antivirals%5BTitle%5D)+AND+%22Antiviral+Res%22%5BJournal%5D)">A cell-based luminescence assay is effective for high-throughput screening of potential influenza antivirals.</a> Antiviral Res. 73, 50-59 (2007).</li>
<li>Che, P., Wang, L., Li, Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+development%2C+optimization+and+validation+of+an+assay+for+high+throughput+antiviral+drug+screening+against+Dengue+virus%5BTitle%5D)+AND+%22Int.+J.+Clin.+Exp.+Med%22%5BJournal%5D)">The development, optimization and validation of an assay for high throughput antiviral drug screening against Dengue virus.</a> Int. J. Clin. Exp. Med. 2, 363-373 (2009).</li>
<li>Li, Q., Li, H., Blitvich, B. J., Zhang, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Aedes+albopictus+inhibitor+of+apoptosis+1+gene+protects+vertebrate+cells+from+bluetongue+virus-induced+apoptosis%5BTitle%5D)+AND+%22Insect+Mol.+Biol%22%5BJournal%5D)">The Aedes albopictus inhibitor of apoptosis 1 gene protects vertebrate cells from bluetongue virus-induced apoptosis.</a> Insect Mol. Biol. 16, 93-105 (2007).</li>
<li>Petty, R. D., Sutherland, L. A., Hunter, E. M., Cree, I. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparison+of+MTT+and+ATP-based+assays+for+the+measurement+of+viable+cell+number%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biolumin.+Chemilumin%22%5BJournal%5D)">Comparison of MTT and ATP-based assays for the measurement of viable cell number.</a> J. Biolumin. Chemilumin. 10, 29-34 (1995).</li>
<li>Buchholz, U. J., Finke, S., Conzelmann, K. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Generation+of+bovine+respiratory+syncytial+virus+%28BRSV%29+from+cDNA%3A+BRSV+NS2+is+not+essential+for+virus+replication+in+tissue+culture%2C+and+the+human+RSV+leader+region+acts+as+a+functional+BRSV+genome+promoter%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Generation of bovine respiratory syncytial virus (BRSV) from cDNA: BRSV NS2 is not essential for virus replication in tissue culture, and the human RSV leader region acts as a functional BRSV genome promoter.</a> J. Virol. 73, 251-259 (1999).</li>
<li>Phillips, T., Jenkinson, L., McCrae, C., Thong, B., Unitt, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+a+high-throughput+human+rhinovirus+infectivity+cell-based+assay+for+identifying+antiviral+compounds%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol.+Methods%22%5BJournal%5D)">Development of a high-throughput human rhinovirus infectivity cell-based assay for identifying antiviral compounds.</a> J. Virol. Methods. 173, 182-188 (2011).</li>
<li>Harvey, T. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tetracycline-inducible+packaging+cell+line+for+production+of+flavivirus+replicon+particles%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol%22%5BJournal%5D)">Tetracycline-inducible packaging cell line for production of flavivirus replicon particles.</a> J. Virol. 78, 531-538 (2004).</li>
<li>Puig-Basagoiti, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+assays+using+a+luciferase-expressing+replicon%2C+virus-like+particles%2C+and+full-length+virus+for+West+Nile+virus+drug+discovery%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrobial+Agents+and+Chemotherapy%22%5BJournal%5D)">High-throughput assays using a luciferase-expressing replicon, virus-like particles, and full-length virus for West Nile virus drug discovery.</a> Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 49, 4980-4988 (2005).</li>
<li>Puig-Basagoiti, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Triaryl+pyrazoline+compound+inhibits+flavivirus+RNA+replication%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob.+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">Triaryl pyrazoline compound inhibits flavivirus RNA replication.</a> Antimicrob. Agents Chemother. 50, 1320-1329 (2006).</li>
<li>Duan, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+and+in+vivo+protection+against+the+highly+pathogenic+H5N1+influenza+virus+by+an+antisense+phosphorothioate+oligonucleotide%5BTitle%5D)+AND+%22Antivir.+Ther%22%5BJournal%5D)">In vitro and in vivo protection against the highly pathogenic H5N1 influenza virus by an antisense phosphorothioate oligonucleotide.</a> Antivir. Ther. 13, 109-114 (2008).</li>
<li>Ray, D., Shi, P. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recent+advances+in+flavivirus+antiviral+drug+discovery+and+vaccine+development%5BTitle%5D)+AND+%22Recent+Pat.+Antiinfect.+Drug+Discov%22%5BJournal%5D)">Recent advances in flavivirus antiviral drug discovery and vaccine development.</a> Recent Pat. Antiinfect. Drug Discov. 1, 45-55 (2006).</li>
<li>Severson, W. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+screening+of+a+100%2C000-compound+library+for+inhibitors+of+influenza+A+virus+%28H3N2%29%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biomol.+Screen%22%5BJournal%5D)">High-throughput screening of a 100,000-compound library for inhibitors of influenza A virus (H3N2).</a> J. Biomol. Screen. 13, 879-887 (2008).</li>
<li>Severson, W. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+and+validation+of+a+high-throughput+screen+for+inhibitors+of+SARS+CoV+and+its+application+in+screening+of+a+100%2C000-compound+library%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Biomol.+Screen%22%5BJournal%5D)">Development and validation of a high-throughput screen for inhibitors of SARS CoV and its application in screening of a 100,000-compound library.</a> J. Biomol. Screen. 12, 33-40 (2007).</li>
<li>Bolken, T. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+and+characterization+of+potent+small+molecule+inhibitor+of+hemorrhagic+fever+New+World+arenaviruses%5BTitle%5D)+AND+%22Antivir.+Res%22%5BJournal%5D)">Identification and characterization of potent small molecule inhibitor of hemorrhagic fever New World arenaviruses.</a> Antivir. Res. 69, 86-97 (2006).</li>
<li>Van Loock, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+high-throughput+cellular+screening+assay+for+the+discovery+of+HIV-1+integrase+inhibitors%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Virol.+Methods%22%5BJournal%5D)">A novel high-throughput cellular screening assay for the discovery of HIV-1 integrase inhibitors.</a> J. Virol. Methods. 179, 396-401 (2012).</li>
<li>Kampmann, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+silico+screening+of+small+molecule+libraries+using+the+dengue+virus+envelope+E+protein+has+identified+compounds+with+antiviral+activity+against+multiple+flaviviruses%5BTitle%5D)+AND+%22Antiviral+Res%22%5BJournal%5D)">In silico screening of small molecule libraries using the dengue virus envelope E protein has identified compounds with antiviral activity against multiple flaviviruses.</a> Antiviral Res. 84, 234-241 (2009).</li>
<li>Kirchmair, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+anti-viral+agents+using+molecular+modeling+and+virtual+screening+techniques%5BTitle%5D)+AND+%22Infect.+Disord.+Drug+Targets%22%5BJournal%5D)">Development of anti-viral agents using molecular modeling and virtual screening techniques.</a> Infect. Disord. Drug Targets. 11, 64-93 (2011).</li>
</ol>

Yazarlar, hiçbir rakip mali çıkarlarını olmadığını beyan ederim.

Antiviral hit ilk tanımlanması için, antiviral ilaç keşfi ve geliştirilmesi için önemli adımlardan biri, ölçülebilir bir işaretleyici seçerek basit bir protokol geliştirme, yeterli sinyalleri ve daha az 10% CV elde içeren, sağlam deneyleri geliştirmektir. En çok biyokimyasal veya hücre bazlı ekranlar nedeniyle tarama işleminde gerekli tekrarlanabilirlik ve taranması için moleküllerinin potansiyel olarak çok sayıda, en sağlam, basit ve ucuz bir deneyde, dayanan kimyasal bir başlangıç ​​noktası temin etmek üzere dizayn ed...

BTV Orbivirüs soyu, Reoviridae ailesi içinde bir prototip çift sarmallı bir RNA virüsüdür. BTV çapında 1,2 3000000000 $ / yıl kaybı, koyun, keçi, sığır ve diğer evcil hayvanlar da dahil olmak üzere evcil hayvanların en önemli hastalıklar, biridir. Egzotik BTV serotipi listelenen önemli bir hayvan patojen olan &quot;USDA Ciddiyeti Yüksek Hayvancılık Patojenlerinin.&quot; Son zamanlarda, yeniden ortaya çıkan BTV Kuzey Avrupa&#39;da 3,4 genelinde birçok ülkede önemli bir sığırlarda hastalık salgını ve koyunları neden oldu. , Ekonomik önem taşıyan bir sonucu olarak ve bir model sistem olarak, BTV geniş, moleküler genetik ve yapısal çalışmaların konusu olmuştur ve çeşitli aşılar geliştirilmiştir. Ancak, antiviral ilaç keşfi için tahlillerin uygun olmaması nedeniyle, BTV karşı hiçbir antiviral vardır. Model sistem olarak BTV&#39;ye kullanarak yeni yüksek verimli tarama (HTS) kampanyası, biz d, eveloped optimize edilmiş ve Arbovirüsler 5 karşı potansiyel geniş spektrumlu antiviral belirlemek için bir CPE-bazlı analiz valide. CPE-tabanlı tahlil, hızlı ve gözlemlenebilir CPE / apoptoz 5-7 virüslerin neden olduğu bir dizi karşı antiviral ilaç keşfi kullanılmıştır iyi bilinen bir deneyidir. Bizim sistemde, post BTV enfeksiyon, CPE HeLa, DUY ve HEK 293T 8 dahil omurgalı hücrelerinde açıktır. BTV kaynaklı CPE CellTiter Glo hücre canlılığı reaktif kiti (CTG kit) 9 dahil olmak üzere çeşitli hücre canlılığı algılama yöntemleri kullanılarak izlenebilir ve nicelendirilebilir. Bu kit, metabolik olarak aktif canlı hücrelerin varlığını işaret eder hücresel ATP miktarının göre kültür içinde canlı hücre sayısını sunulmuştur belirler. Optimum şartlarda, burada sunulan CPE-bazlı analiz &quot;mix ve ölçmek&quot; bir adım protokol ve istikrarlı Işıklı sinyalleri ile esneklik ile fizibilite gösterdi. Bu arada, toksik bileşikler gdrmhücre canlılığı cing bu CPE bazlı deneyde dışı bırakılacaktır. CPE-bazlı analiz ile sağlamlık ve BTV karşı antiviral ilaç keşfi için güvenilirlik göstermiştir, ve potansiyel antiviral talebi bileşik (ler altı yeni kümesinin tanımlanması için yol NIH Molecular Kütüphane Küçük Molekül Depo (MLSMR) taranması için kullanılmıştır ) 5. Potansiyel antiviral bileşiği, CPE-bazlı analiz ile tespit edilmiştir, bu antiviral etkinliği ve sitotoksisite 2 aralığını belirlemek için on-konsantrasyon doz-yanıt deneyine tabi olması gerekir. Antiviral etkinlik,% 50 inhibe edici konsantrasyon (IC50) ya da% 50 etkili konsantrasyon (EC 50) olarak temsil edilen, esas-çizgi ve maksimum arasındaki virüs kaynaklı CPE yarım önleyen bir ilacın konsantrasyonudur. Antiviral sitotoksisitesi,% 50 sitotoksisite konsantrasyonu (CC 50), yani konsantrasyonudurtaban çizgisi ile en arasında sitotoksisitedeki% 50 uyaran bir ilacın. % 50 SI (SI 50) olarak ifade seçici endeksi (SI), virüs kaynaklı CPE karşı antiviral özgünlüğünü belirleyen CC 50 / IC50 hesaplanmaktadır. IC 50 (ya da EC 50), 50 CC ve SI değerleri, 50 bir antiviral bileşiği, kuvvetli ve daha fazla ilaç geliştirme için seçici olup olmadığını belirlemek için kritik ölçülerdir. Bir in vitro antiviral herhangi bir aşikar toksisite göstermiştir, ancak önlenebilir virüs CPE ve üretken viral yaşam döngüsü neden olduğunda, onun Moa 2 karakterize etmek için önemlidir. Biz antiviral etkilenen viral yaşam-döngüsü olası adım (lar) belirlemek ÖY tahlilini yaparak böyle karakterizasyonu başlattı. Genel olarak, antiviral bileşiği, farklı zamanlarda öncesi ya da sonrası virüs enfeksiyonu hücrelere ilave edildi. Antiviral enfekte hücrelere ilave edildi durumunda hedef s göndermekönceki aşamada ilave edildi birine göre tep enfeksiyonun seyri sırasında, daha düşük aktiviteye sebep olur. Bu nedenle, TOD çalışma ya da viral yaşam döngüsü ya da viral yaşam çevriminde yer alan ana makine üzerinde, bir bileşiğin anti-viral etkinlik ve potansiyel hedef belirlemek için çok önemlidir. Üç tahlilleri için, hücre canlılığı, üretici talimatlarına 5 ardından CTG kiti kullanılarak belirlenmiştir. Bu algılama sistemi çeşitli in-house yazılımı kullanılarak analiz edilebilir yeterli lüminesans sinyalleri verir. Her bir deney en az sekiz kopyaları ile üç nüsha olarak doğrulanmış ve uygulandı. Elde edilen tüm veriler için, ortalama değer (AVE), standart sapma (STDEV&#39;leri) ve varyasyon katsayısı (CV) olmak üzere üç parametre, tahlilin sağlamlığını belirlemek için analiz edilmiştir. Tahlilin sağlamlığı belirlendikten sonra, bundan başka, veri analizi ve grafik olarak ve çeşitli biyoistatistiksel kullanılarak çizilirc aletleri 2.

<table><tbody><tr><td>DMEM ortamı</td><td>Gibco</td><td>1134218</td><td>Hücre kültürü için</td></tr><tr><td>FBS</td><td>Gibco</td><td>16000044</td><td>Hücre kültürü için</td></tr><tr><td>% 0.05 Tripsin-EDTA</td><td>Gibco</td><td>1000185</td><td>Hücre kültürü için</td></tr><tr><td>DPBS</td><td>Gbico</td><td>1049769</td><td>Hücre kültürü için</td></tr><tr><td>CellTiter-Glo (CTG) kiti</td><td>Promega</td><td>TB288</td><td>Hücre canlılığı ölçümü için</td></tr><tr><td>% 70 etanol</td><td>Fisher</td><td>S25309B</td><td>% 95</td></tr> <tr><td>Antiviral huashilcompound</td><td>NIH MLSMR ve de novo sentezinden</td><td></td><td></td></tr> seyreltilmiş <tr><td>BTV-10</td><td>ATCC</td><td>VR-187</td><td></td></tr><tr><td>BSR hücresi</td><td>Evde</td><td></td><td></td>geliştirildi</tr><tr><td>Synergy-II çok modlu mikroplaka okuyucu</td><td>BioTek</td><td></td><td>Lüminesan sinyal okuma için</td></tr><tr><td>MicroFlo select dağıtıcı</td><td>BioTek</td><td></td><td>Hücrelerin, virüslerin ve reaktiflerin eklenmesi</td></tr><tr><td>384 kuyulu düz tabanlı mikroplaka</td><td>CORNING</td><td>28908031</td><td>Hücre kültürü için</td></tr><tr><td>Gen. 5 yazılımı</td><td>BioTek</td><td></td><td>Synergy-II çok modlu mikroplaka okuyucu GraphPad Prism 5'ten gelen okuma çıktılarının analizi için</td></tr><tr><td>GraphPad Sürüm</td><td>5</td><td>Biyostatik analiz ve çizim için</td><td></td></tr></tbody></table>

bluetongue virüs karşı roman antiviraller belirlenmesi için tahliller

Assays for the Identification of Novel Antivirals against Bluetongue Virus

BTV karşı potansiyel antiviral belirlemek için, biz geliştirdik optimize edilmiş ve burada sunulan üç deneyleri geçerliliği var. CPE-tabanlı tahlil, bir bileşiğin bir anti-viral etkinlik gösteren ve büyük bir bileşik librarisinin elenmesi için kullanılmıştır olup olmadığını değerlendirmek için geliştirilen ilk deney oldu. Bu arada, antiviral sitotoksisitesi da CPE temelli test kullanılarak değerlendirilebilir. Doz-yanıt deney seçilen antiviral etkinlik için aralığını belirlemek için dizayn edilmiştir,% 50 inhibitör konsantrasyonunu (IC50) ya da etkili bir konsantrasyonu (EC50), hem de sitotoksisite yelpazesini (CC 50), yani. ÖY tahlil BTV viral yaşam döngüsü veya ana hücresel makine üzerindeki olası etkisi sırasında yeni antiviral yatan mekanizmasını belirlemek için ilk MoA çalışma için kullanılmıştır. Bu deneyler, bir hücre kültürü sisteminde antiviral etkinliğinin değerlendirilmesi için çok önemli olan ve bizim yeni araştırmalara yol kullanılmaktadırBTV karşı yeni antiviral bir dizi tanımlanmasına ing.

1.. Bileşik Antiviral etkinliği Hücre bazlı CPE deneyi, geliştirilen en iyi ve daha önce tarif edildiği gibi 2,5 BTV karşı yeni antiviral belirlemek için ışık saçan tabanlı CTG kiti kullanılarak in vitro olarak doğrulanmıştır. On doz yanıt deney canlı hücreler 5,11 sunulan hücresel ATP miktarının göre kültür içinde metabolik olarak yaşayan hücrelerin sayısı ölçülerek belirlenmiş bir kurşun bileşiğinin antiviral etkinliği ve sitotoksisite yansıtmak için kullanılmış...

Sitopatik etki (CPE)-bazlı analiz, doz-yanıt tahlil ve Time-of-adisyonu (TOA) deneyi de dahil olmak üzere üç deneyleri yanı sıra, gelişmiş optimize edilmiş, doğrulanmış ve Bluetongue virüsüne karşı yeni antiviraller (BTV) tanımlamak için kullanılmıştır yeni tespit antiviraller için olası Mekanizması-of-Eylem (MoA) belirlemek gibi.

Bluetongue Virüs karşı Roman Antiviraller belirlenmesi için Tahliller

To identify potential antivirals against BTV, we have  developed, optimized and validated three assays presented here. The CPE-based  assay was the first ...

Bu prosedürün genel amacı, CPE bazlı hücre canlılığı testini kullanarak mavi dil virüsüne veya BTV'ye karşı küçük moleküllü antiviralleri tanımlamak ve karakterize etmektir. Bu, ilk olarak hücre titresi kızdırma reaktifi ile Sitopatik etki veya CPE bazlı test kullanılarak bir antiviral bileşik kütüphanesinin taranmasıyla gerçekleştirilir. Daha sonra, antiviral etkinlik doğrulanır ve seçilen antivirallerin sitotoksisitesi, doz yanıt testi kullanılarak değerlendirilir.Son olarak, olası etki mekanizmalarına yol açan seçilmiş antivirallerin olası viral yaşam döngüsü aşamasını belirlemek için ekleme zamanı testi gerçekleştirilir. Sonuç olarak, doz yanıt testine ve ekleme testinin zamanına bağlı olarak güçlü antiviral CIE ve düşük sitotoksisiteye sahip yeni antiviralleri gösteren sonuçlar elde edilebilir. Bu nedenle, bu tekniğin bir plak tahlilinde TCI D 50 testi gibi mevcut yöntemlere göre ana avantajı, bu tekniğin, enfekte hücre hücrelerinde ölçülebilir CP'yi indükleyen glüten virüsü de dahil olmak üzere belirli bir virüse karşı antivirüsü taramak ve kategorize etmek için ölçülebilir yöntemde hassas, sağlam ve yüksek oranda üreme sağlamasıdır. Kuyu başına 5.000 hücrede 20 mikrolitre hü

assays-for-identification-novel-antivirals-against-bluetongue

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

İmmünoloji ve Enfeksiyon

En korunmuş dizileri biyoinformatik analizleri ile tespit hedefleyen evrensel bir antikor kullanarak influenza virüs hemaglutinin ve nöraminidaz miktarının tayini için basit bir yuva blot yöntemi geliştirilmiştir. Bu yenilikçi yaklaşım, tüm viral hemaglutinin ve nöraminidaz kantitatif tayini için kullanışlı bir alternatif sunabilir.

Tüm Influenza Kantitatif Analiz Basit Slot Blot Tahliller Evrensel Antikorlar kullanarak Viral Hemagglutinins ve nöraminidaz yazın

Burada, yeni antiviral ajanları tanımlamak ve değerlendirmek için viral girişin belirli adımlarını inceleyen bir protokol sunuyoruz.

Erken Viral Giriş Tespiti için Tahliller ve Antiviral Bileşiklerin Değerlendirilmesi

Burada, Abdovirüs çoğaltma ve Abdovirüs çoğaltma kısıtlamak 2) ökaryotik ana faktörler teşvik 1) virüs kodlanmış immunomodulators tanımlamak için protokolleri mevcut. Floresan ve ışıldama dayalı yöntemlerin araştırmacılar hızla düşük sinyal noise oranları ile basit deneyleri Abdovirüs çoğaltma nicel veriler elde etmek için izin verir.

Araçlar Viral Immunomodulators ve ana bilgisayar Antiviral faktörler tanımlanması için eleme olarak Abdovirüs enfeksiyonlar

Bu protokol Tayvan yarasalar lyssavirus antijenlerin tanısal test için standart bir laboratuvar işletim prosedürü tanıttı.

Tayvan'da Yarasa Popülasyonunun Lyssavirus Gözetimi için Standart Çalışma Prosedürü

Bir Pan-Lyssavirus iç içe Ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu özellikle tüm bilinen lyssaviruses algılamak için geliştirilmiştir. Farklı hayvan türlerinin kuduz beyin örneklerini kullanarak doğrulama Bu yöntemin altın standart floresan antikor testi için bir duyarlılık ve özgüllük eşdeğer olduğunu gösterdi ve rutin kuduz tanısı için kullanılabilir.

Lyssaviruses tespiti için evrensel Iç Içe Ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu değerlendirilmesi

Burada kuduz aşılarında immünojenik glikoprotein içeriğini belirlemek için dolaylı bir ELISA sandviç immünoyakalama açıklar. Bu test glikoprotein düzelticileri tanıyan nötralize monoklonal antikor (mAb-D1) kullanır. Üretim sırasında aşı potens tutarlılığını takip etmek için in vivo NIH testine alternatiftir.

In Vitro ELISA Testi Kuduz Aşısı Potens Değerlendirmek için

DsDNA enterkalasyon boya kullanarak bu gerçek zamanlı RT-PCR Lissavirüse enfeksiyonları teşhis etmek için uygundur. Yöntem, kuduz şüpheli ante-mortem veya post-mortem örneklerinden çıkarılan RNA ile başlar, ana karışım hazırlama, RNA ilavesi, gerçek zamanlı makinenin kurulumu ve sonuçların doğru yorumlanması hakkında ayrıntı.

Pan-Lyssavirus gerçek zamanlı RT-PCR Rabies tanı için

Protokol amacı, aday viral giriş inhibitörleri tanımlamak için kullanılabilecek viral giriş ile ilgili farklı deneyleri göstermek için.

Coxsackievirus 'a karşı antiviral adayların tanımlanması için viral giriş analizinin kullanımı ve moleküler yerleştirme Analizi A16

Beyin biyopsisi örneklemesinden son yoruma kadar hızlı immünokromattografik tanı testi (RIDT) ile alan koşullarında hayvan kuduzlarının postmortem tanısı için tam bir protokol salıyoruz. Ayrıca moleküler analiz ve viral genotipleme için cihazı kullanarak daha fazla uygulama açıklar.

Field Postmortem Kuduz Hızlı İmmünromatografik Tanı Testi Kaynak Sınırlı Ayarlar için Diğer Moleküler Uygulamalar ile

Bu çalışmada, Zika virüsü replikasyonunun inhibitörlerini yüksek verimli bir tarama formatında taramak için replikon bazlı ve viral enzim bazlı tahlillerde kullanılan protokolleri açıklıyoruz.

Zika Virüs Replikasyonunun inhibitörlerini taramak için yüksek verimli Antiviral Tahliller

Bu makale, luciferaz raporlayıcı sistemi kullanarak SARS-CoV-2 sahtetipli parçacıkların üretilmesi metodolojisini ve giriş inhibitörlerini tanımlamada kullanımını açıklamaktadır. Bu protokoller, rekombinant insan ACE2-Fc füzyon proteini ve küçük moleküllü bileşik arbidol olmak üzere iki farklı giriş inhibitörü kullanılarak gösterilmiştir.

MLV tabanlı psödovirüsler kullanılarak SARS-CoV-2 giriş inhibitörlerinin potansiyel antiviral olarak tanımlanması için prosedürler

Keşfedin, Bluetongue virüsüne karşı küçük moleküllü antiviralleri CPE tabanlı hücre canlılığı testi, doz-yanıt testi ve ToA testi kullanarak belirleme yöntemlerini. Bu hassas ve tekrarlanabilir teknik, yeni antiviral ilaç keşfi için güvenilir bir çerçeve sunar.

Bluetongue Virüs karşı Roman Antiviraller belirlenmesi için Tahliller

Daha fazla video keşfet