Name: Aip1p Dynamics Aktin de R256H Mutasyon tarafından Altered Hazır (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-07-30T14:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 57 s
Description: Öğrenin, maya hücrelerinde Aip1p proteininin hareketini TIRF mikroskobu ile nasıl görselleştireceğinizi. Bu yöntem, aktin mutasyonlarının sitoskelet dinamikleri üzerindeki etkilerini incelemek için kullanılır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Yazarlar orijinal PB1996 klon için yararlı bir tartışma ve teknik danışmanlık için Peter Rubenstein ve David Pellman teşekkür ederim. Bu çalışma Dimes Mart hibe ve Çocuklar için Ride fon tarafından desteklenmiştir.

1.. PB1996 plazmide Klonlama <ol><li> Tasarım ve DNA sırası hedef sekansını kuşatan ve seçilen ana plasmidde tek restriksiyon sitelerini içeren bir oligonükleotid imalatçı şirketten primerler. Not: Bu durumda, primerler, Aip1 dizisinin 5 &#39;ucunda 400 baz çifti yükseltmek için tasarlanmıştır. Xhol kısıtlama alanı, yaklaşık 20 bp dizisi Aip1 önce primerin içerisine dahil edildi, ve Xmal, hedef dizinin Aip1 sonra yaklaşık 20 bp&#39;lik dahil edilmiştir. Klonlama için kullanılan plazmid floresan bir 3XGFP etiket, maya suşu için bir seçim geni, bir URA ve bakteriyel seçim için bir ampisilin direnç genini ihtiva PB1996, oldu. </li><li> Bir Ura-maya haploid suşundan genomik DNA arındırın. Not: klonlama sürecinin bir diyagram için Şekil 1&#39;e bakınız. </li><li> Ya da en üzerindeki kısıtlama siteleri ile Aip1p genini çoğaltmak için iki primer ve maya genomik DNA kullanılarak, standart bir PCR reaksiyonud. PCR ürünü sindirimi ve üretici için ayrı reaksiyonlarda kısıtlama enzimleri ile PB1996 plazmid protokolleri tavsiye edilir. Bu durumda, Xmal ve Xhol 1 saat boyunca 37 ° C &#39;de, ekteki tamponu ile kullanıldı. </li><li> Sindirilmiş DNA fragmanlarının ayrılması için% 0.8 agaroz jel elektroforez çalıştırın. Bir kuyu, düşük bir kütle DNA merdiveni yük ve, ayrı kuyularda, her bir sindirimden olan bütün reaksiyon yükleyin. Boyanın önü jelin sonuna kadar, yaklaşık 1 saat boyunca 100 voltta jel çalıştırın. Bir UV ışık altında jel görselleştirme ve protein segmente karşılık gelen segmenti ile kesilmiş plazmid üzerinden saflaştırılması. </li><li> Sindirilmiş Aip1 segment ve PB1996 plazmid Arter. Kültür plakaları üzerine ve plaka (2, 37 ° C de saat boyunca SOC ortamında büyür, 2 dakika boyunca 42 ° C &#39;de buz, ısı şoku 30 dakika boyunca 100 ul hücre 10 ul DNA) üretici protokolleri kullanarak DH5a hücrelerine ürünü Transform bu durumda LB + olarak, seçim için antibiyotik içerirAmp plakaları. Seçip sıvı kültür içinde bir koloni büyür. Yeni tasarlanan plazmid arındırmak. </li></ol> 2.. Mutant Maya Gerilme Üretimi <ol><li> Aktin alel bir mutant maya suşu oluşturmak için silinmiş olduğu bir haploid maya suşu kullanın. Not: Bu soy kromozomal aktin geni yoktur ve yabani tip maya kodlayan bir plasmidi ihtiva eden bu durumda, ana suş Dr Peter Rubenstein (University of Iowa) bir cömert bir hediye idi ve inşaat Cook et al, 20 tarafından tarif edilmiştir. aktin ve urasil. </li><li> 21 mutagenez için temel plazmiti gibi bir Trp + seçim ile plazmid kodlayan pRS yabani tip maya aktin kullanın. </li><li> Aktin içine yanlış anlamlı mutasyonun mühendis pRS plazmid üzerinde yer yönlendirmeli mutagenez gerçekleştirin. <ol><li> Aktin R256H mutasyonu için, astar 5 O&#39;nun 256 Arg 256 değiştirmek için &#39;ggtaacgaaagattccatgccccagaagc 3&#39; yapmak. Standart mutajenezini çalıştırınAdım 2.2 &#39;den plazmidi ile PCR reaksiyonu. </li><li> DH5a hücreleri içine PCR gelen mutant aktin plazmid dönüşümü. Plazmid DNA izole ve mutasyon doğrulamak için aktin geni sırası. </li></ol></li><li> Adım 2.1 &#39;den haploid mutant maya suşu içine maya aktin kodlayan plazmid dönüşümü. </li><li> Kültür Trp-plakalar üzerinde dönüştürülmüş hücreler mutant maya aktin plazmidi içeren Trp + içeren bira mayası için seçin. </li><li> Hücreler 5-fluoroorotik asit (5-FOA) içeren plakalar üzerinde Trp-plakalardan alt-kültür hücreleri tarafından yabani tip aktin ve urasil (2.1 &#39;de tarif edilmiştir) kodlayan orijinal plazmid eksik için seçin. 5-FOA evetler fonksiyonel URA3 geni ifade suşları, toksik formu, 5-fluorourasil dönüştürülür. Adım adım seçimden sonra büyüme Hücreler sadece mutant aktin plazmidi içerecektir. </li><li> Yeni maya suşunda gelen plazmid DNA arındırın. Mutant aktin geninin mevcut olduğundan emin olmak için plazmidi dizisi. Bu s kullanınBundan sonraki çalışmalarda, tren. Bu işlem, Şekil 2&#39;de diyagram olarak. </li></ol> 3.. Maya Hücre içine plasmidi Dönüşümü <ol><li> Maya kromozomu içine entegrasyon sağlamak üzere bir sınırlandırma enzimi ile Aip1p-GFP plazmidi Digest. Not: kısıtlama alanı floresan etiket, ilgi konusu geni, seçim işaretleyicisini içeren sekans bloğunun dışında olması gerekir. Bu durumda, 37 ° C de 8 ul DNA ve 1 saat boyunca birlikte 10x tampon 1 ul Hpal restriksiyon enzimi 1 ul kullanımı </li><li> Kültür S. 30 ° C de bir tekerlek üzerinde YPD ortamı içinde, 5 ml (% 1 maya özü,% 2 pepton ve% 2 dektroz) içinde gece boyunca urasil (Ura-soyu) sentezleme yeteneğine sahip değillerdir (aşama 2.5 &#39;dan itibaren) cerevisiae hücreleri 1,000 x g de aşağı 5 dakika için hücreler 1 ml Spin. </li><li> PLAKA karışım yapmak. GKD 2 O&#39;dan 43 ml 1 M Tris pH 7.5, 5 ml 250 mM etilendiamintetraasetik asit (EDTA) içinde bir 2 ml eklenerek 10XTE olun Ekle 00,204 1X TE 20 ml polietilen glikol, daha sonra 8 g (PEG) (MW ~ 3300) ve filtre ile sterilize lityum asetat g. </li><li> Adım 3.2 &#39;de döndürülmüştür hücrelerden süpernatant süzün ve kalan sıvı içinde tekrar süspansiyon hücreleri. Süspansiyon hücreleri için, 10 mg / ml salmon testis taşıyıcı DNA, 2 ul ekle. Adım 3.1 ve girdap gelen sindirilmiş plasmid DNA 10 ul ekle. PLAKA ve vorteks 0.5 ml ekleyin. 1 M DTT ve vorteks 20 ul ekle. </li><li> 25 ° C&#39;de 6-8 saat süreyle inkübe karışımı Sıcaklık 10 dakika boyunca 42 ° C&#39;de bir su banyosu içinde hücreleri şok. Onlar-Ura plaka üzerine yerleşmiştir mikrosantrifüj tüp dibinden hücrelerin plaka 100 ul. 2-3 gün boyunca veya koloniler oluşana kadar 30 ° C&#39;de inkübe edin. </li><li> Bir-Ura plaka üzerine tek tek koloniler ve çizgi seçin. NOT: Bu hücreler büyüme sağlayan, kromozoma entegre Aip1-GFP ve Ura gen ile plazmid içerir. Bu hücreler daha sonra microsco kullanılacakpy. </li></ol> 4. Toplam İç Yansıma floresan mikroskobu kullanarak Aip1p Protein Hareketi görselleştirme <ol><li> 30 ° C de bir gece bir tekerlek üzerinde YPD dahil Aip1p-GFP ile maya hücre kültür büyütün Of-Ura ortam 9 ml, gece boyunca kültürün Alt kültür 1 mi. Bu log büyüme fazında olduğundan emin olmak için 30 ° C sıcaklıkta bir çalkalayıcı üzerinde ilave bir 3-4 saat boyunca hücrelerin büyümesine. </li><li> Cam mikroskop lamı hücrelerinin 3 ul ekleyin ve bir lamel ekleyin. Hücreler 5 dakika boyunca slayt üzerinde yerleşmek için izin verin. Sahne plaka dilimindeki slayt yerleştirin. </li><li> Nesnel bir yağ daldırma 100X TIRF ve dijital CCD kamera kullanarak bir toplam iç yansıma floresan (TIRF) mikroskop (488 nm) ile Aip1p-GFP proteini gözlemlemek. Slidebook 5.0 yazılımı kullanılarak, (elde edilen görüntülerin bireysel çerçeveleri Şekil 2A&#39;da sunulmuştur) 5 kare / sn &#39;lik bir hızda 20 saniye boyunca görüntüler elde. <ol><li> C odaklanmakarşın, açık Slidebook 5.0 yazılım ve odak kontrolleri erişmek için araç çubuğundaki Odak Penceresi düğmesini tıklatın. Kapsam sekmesini seçin ve 100X-TIRF hedefi seçin. Lambayı açın ve% 15 lamba çubuğunu kaydırın. 2 x 2 Bin ayarı değiştirin. Parlak alanına filtresini değiştirin. </li><li> Mikroskop, bilgisayar ekranında görüldüğü gibi odak noktası haline hücreleri getirmek için ince odak düğmesini kullanın. </li><li> Odak Penceresi içinde denetimlerini kullanarak, lambayı kapatmak Canlı filtreyi değiştirmek ve TIRFM düğmesini tıklatın. </li><li> Mikroskop sağ tarafında noktasına bağlı TIRFM aydınlatıcı, Açık, lazer emisyonu çevirin. </li><li> Odak Penceresi içinde Akış sekmesini seçin, bir sonraki Kaydı başlatın ve sonra parlak bir alan düğmesini tıklatın onay kutusunu. </li><li> TIRFM ışığını, lazer olay açısını ayarlamak için mikrometre açmak. Bu Aip1-GFP odaklarından fluoresans emisyonunun optimize etmek ve gelen arka plan floresan en aza indirmek için kullanılırhücreleri ve slayt. </li><li> İstenen görüntü görüntülendiği zaman, Başlat düğmesine basın. 20 sn, basın Durdur sonra. Görüntüleri kaydedin. Ana menü çubuğunda Dosya sekmesinde, Kaydet Slayt seçeneğini seçin ve dosya konumu ve adını girin. </li></ol></li><li> Görüntüleri analiz etmek ImageJ yazılımı kullanın. Floresan Aip1p odaklarının hareketini ve hızını izlemek için makro eklenti &quot;Manuel Tracker&quot; kullanın. 0.2 saniye zaman aralığı parametresini değiştirin. <ol><li> Eklenti parça seçimi kullanarak, seçmek ve 4-8 bağ çerçeveler aracılığıyla bireysel floresan proteini izleyebilirsiniz. Uç parça komutunu kullanın ve her kare arası protein hareketin hızı bir sonuç penceresinde görüntülenir. </li><li> Microsoft Excel kullanarak her çerçeve arasındaki ortalama hızını belirleyin. Ilgi her hücre türü için Aip1p hareketinin ortalama hızının hesaplanması için değerleri kullanın. Not: Aip1p hareket ve ortalama doğrusal olmayan hız oranının bir saçılma grafiğidir Figu gösterilmektedir2B yeniden. </li></ol></li></ol>

<ol><li>Lehtonen, H. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Segregation+of+a+missense+variant+in+enteric+smooth+muscle+actin+gamma-2+with+autosomal+dominant+familial+visceral+myopathy%5BTitle%5D)+AND+%22Gastroenterology%22%5BJournal%5D)">Segregation of a missense variant in enteric smooth muscle actin gamma-2 with autosomal dominant familial visceral myopathy.</a> Gastroenterology. 143, e1483 1482-1491 (2012).</li>
<li>Matsson, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Alpha-cardiac+actin+mutations+produce+atrial+septal+defects%5BTitle%5D)+AND+%22Hum+Mol+Genet%22%5BJournal%5D)">Alpha-cardiac actin mutations produce atrial septal defects.</a> Hum Mol Genet. 17, 256-265 (2008).</li>
<li>Zhu, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mutations+in+the+gamma-actin+gene+%28ACTG1%29+are+associated+with+dominant+progressive+deafness+%28DFNA20%2F26%29%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Hum+Genet%22%5BJournal%5D)">Mutations in the gamma-actin gene (ACTG1) are associated with dominant progressive deafness (DFNA20/26).</a> Am J Hum Genet. 73, 1082-1091 (2003).</li>
<li>Nowak, K. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mutations+in+the+skeletal+muscle+alpha-actin+gene+in+patients+with+actin+myopathy+and+nemaline+myopathy%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Mutations in the skeletal muscle alpha-actin gene in patients with actin myopathy and nemaline myopathy.</a> Nat Genet. 23, 208-212 (1999).</li>
<li>Olson, T. M., Michels, V. V., Thibodeau, S. N., Tai, Y. S., Keating, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Actin+mutations+in+dilated+cardiomyopathy%2C+a+heritable+form+of+heart+failure%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Actin mutations in dilated cardiomyopathy, a heritable form of heart failure.</a> Science. 280, 750-752 (1998).</li>
<li>Riviere, J. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((De+novo+mutations+in+the+actin+genes+ACTB+and+ACTG1+cause+Baraitser-Winter+syndrome%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">De novo mutations in the actin genes ACTB and ACTG1 cause Baraitser-Winter syndrome.</a> Nat Genet. 44, S441-442 440-444 (2012).</li>
<li>Guo, D. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mutations+in+smooth+muscle+alpha-actin+%28ACTA2%29+lead+to+thoracic+aortic+aneurysms+and+dissections%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Genet%22%5BJournal%5D)">Mutations in smooth muscle alpha-actin (ACTA2) lead to thoracic aortic aneurysms and dissections.</a> Nat Genet. 39, 1488-1493 (2007).</li>
<li>Sparrow, J. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Muscle+disease+caused+by+mutations+in+the+skeletal+muscle+alpha-actin+gene+%28ACTA1%29%5BTitle%5D)+AND+%22Neuromuscul+Disord%22%5BJournal%5D)">Muscle disease caused by mutations in the skeletal muscle alpha-actin gene (ACTA1).</a> Neuromuscul Disord. 13, 519-531 (2003).</li>
<li>Kruth, K. A., Rubenstein, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two+deafness-causing+%28DFNA20%2F26%29+actin+mutations+affect+Arp2%2F3-dependent+actin+regulation%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Two deafness-causing (DFNA20/26) actin mutations affect Arp2/3-dependent actin regulation.</a> J Biol Chem. 287, 27217-27226 (2012).</li>
<li>Amberg, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-dimensional+imaging+of+the+yeast+actin+cytoskeleton+through+the+budding+cell+cycle%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">Three-dimensional imaging of the yeast actin cytoskeleton through the budding cell cycle.</a> Mol Biol Cell. 9, 3259-3262 (1998).</li>
<li>Pelham, R. J., Chang, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Role+of+actin+polymerization+and+actin+cables+in+actin-patch+movement+in+Schizosaccharomyces+pombe%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Role of actin polymerization and actin cables in actin-patch movement in Schizosaccharomyces pombe.</a> Nat Cell Biol. 3, 235-244 (2001).</li>
<li>Vavylonis, D., Wu, J. Q., Hao, S., O'Shaughnessy, B., Pollard, T. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assembly+mechanism+of+the+contractile+ring+for+cytokinesis+by+fission+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Assembly mechanism of the contractile ring for cytokinesis by fission yeast.</a> Science. 319, 97-100 (2008).</li>
<li>Bertin, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three-dimensional+ultrastructure+of+the+septin+filament+network+in+Saccharomyces+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">Three-dimensional ultrastructure of the septin filament network in Saccharomyces cerevisiae.</a> Mol Biol Cell. 23, 423-432 (2012).</li>
<li>Senning, E. N., Marcus, A. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Actin+polymerization+driven+mitochondrial+transport+in+mating+S.+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U.S.A%22%5BJournal%5D)">Actin polymerization driven mitochondrial transport in mating S. cerevisiae.</a> Proc Natl Acad Sci U.S.A. 107, 721-725 (2010).</li>
<li>Breitsprecher, D., Kiesewetter, A. K., Linkner, J., Faix, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+actin+assembly+by+in+vitro+TIRF+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">Analysis of actin assembly by in vitro TIRF microscopy.</a> Methods Mol Biol. 571, 401-415 (2009).</li>
<li>Popp, D., Narita, A., Iwasa, M., Maeda, Y., Robinson, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molecular+mechanism+of+bundle+formation+by+the+bacterial+actin+ParM%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem+Biophys+Res+Commun%22%5BJournal%5D)">Molecular mechanism of bundle formation by the bacterial actin ParM.</a> Biochem Biophys Res Commun. 391, 1598-1603 (2010).</li>
<li>Trache, A., Lim, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live+cell+response+to+mechanical+stimulation+studied+by+integrated+optical+and+atomic+force+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Live cell response to mechanical stimulation studied by integrated optical and atomic force microscopy.</a> J Vis Exp. (44), (2010).</li>
<li>Spira, F., Dominguez-Escobar, J., Muller, N., Wedlich-Soldner, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualization+of+cortex+organization+and+dynamics+in+microorganisms%2C+using+total+internal+reflection+fluorescence+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Visualization of cortex organization and dynamics in microorganisms, using total internal reflection fluorescence microscopy.</a> J Vis Exp. (63), e3982(2012).</li>
<li>Manneville, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Use+of+TIRF+microscopy+to+visualize+actin+and+microtubules+in+migrating+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Enzymol%22%5BJournal%5D)">Use of TIRF microscopy to visualize actin and microtubules in migrating cells.</a> Methods Enzymol. 406, 520-532 (2006).</li>
<li>Cook, R. K., Sheff, D. R., Rubenstein, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unusual+metabolism+of+the+yeast+actin+amino+terminus%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Unusual metabolism of the yeast actin amino terminus.</a> J Biol Chem. 266, 16825-16833 (1991).</li>
<li>Feng, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescence+probing+of+yeast+actin+subdomain+3%2F4+hydrophobic+loop+262-274.+Actin-actin+and+actin-myosin+interactions+in+actin+filaments%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Fluorescence probing of yeast actin subdomain 3/4 hydrophobic loop 262-274. Actin-actin and actin-myosin interactions in actin filaments.</a> J Biol Chem. 272, 16829-16837 (1997).</li>
<li>Lin, M. C., Galletta, B. J., Sept, D., Cooper, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Overlapping+and+distinct+functions+for+cofilin%2C+coronin+and+Aip1+in+actin+dynamics+in+vivo%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">Overlapping and distinct functions for cofilin, coronin and Aip1 in actin dynamics in vivo.</a> J Cell Sci. 123, 1329-1342 (2010).</li>
<li>Malloy, L. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Thoracic+Aortic+Aneurysm+%28TAAD%29-causing+Mutation+in+Actin+Affects+Formin+Regulation+of+Polymerization%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Thoracic Aortic Aneurysm (TAAD)-causing Mutation in Actin Affects Formin Regulation of Polymerization.</a> J Biol Chem. 287, 28398-28408 (2012).</li>
<li>Smyth, J. W., Shaw, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualizing+ion+channel+dynamics+at+the+plasma+membrane%5BTitle%5D)+AND+%22Heart+Rhythm%22%5BJournal%5D)">Visualizing ion channel dynamics at the plasma membrane.</a> Heart Rhythm. 5, S7-S11 (2008).</li>
<li>Bhattacharya, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recruitment+of+vimentin+to+the+cell+surface+by+beta3+integrin+and+plectin+mediates+adhesion+strength%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">Recruitment of vimentin to the cell surface by beta3 integrin and plectin mediates adhesion strength.</a> J Cell Sci. 122, 1390-1400 (2009).</li>
<li>Hetheridge, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+formin+FMNL3+is+a+cytoskeletal+regulator+of+angiogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">The formin FMNL3 is a cytoskeletal regulator of angiogenesis.</a> J Cell Sci. 125, 1420-1428 (2012).</li>
<li>Bergeron, S. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Allele-specific+effects+of+thoracic+aortic+aneurysm+and+dissection+alpha-smooth+muscle+actin+mutations+on+actin+function%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Allele-specific effects of thoracic aortic aneurysm and dissection alpha-smooth muscle actin mutations on actin function.</a> J Biol Chem. 286, 11356-11369 (2011).</li>
</ol>

Yazarlar ifşa hiçbir şey yok.

Patojenik mutasyonlara araştırmalarda iskeleti ve yarar dinamiklerini görselleştirmek için etkili bir strateji burada tarif edilmiştir. Gelişmiş görüntüleme yöntemleri, hücre zarı yakın proteinlerin hücre içi hareketini anlamak için yeni fırsatlar yaratmıştır. Toplam iç yansıma floresan mikroskobu (TIRF) canlı hücrelerin fonksiyonel çalışmalar için hassas bir tekniktir. TIRF lamel ve sulu ortamın kırılma indeksleri arasındaki fark nedeniyle genliği azalan bir alan yaratan bir açılı bir uyarım lazer kullanır. Fani alanın...

Aktin hücre iskeletinin içeren dominant protein ve hücre bölünmesi, organel hareketi, hücre hareketi, kasılma, ve sinyalizasyon gibi kritik hücresel süreçleri katılır. Geçtiğimiz on yıl içinde, aktin hastalığa neden olan mutasyonlar miyopatiler koroner arter hastalığı 1-7 için, hastalıkların bir dizi yol açan altı insan aktin izoformlarının her keşfedilmiştir. Aktin mutasyonları hastalığa yol hangi süreçlerin araştırılmasına devam etmektedir. Maya modeli tek temel aktin izoformuna, genetik tractability ve aktin dizi ve fonksiyon yüksek koruma avantajları sayesinde aktin fonksiyonu üzerindeki mutasyonların biyokimyasal etkilerini incelemek için altın standart olmaya devam etmektedir. Çalışmalar bireysel aktin mutasyonları baskın olumsuz etkileri 8 ile moleküler belirli disfonksiyonlara yol olduğunu göstermektedir. Örneğin, Lys-118 artık madde etkiler γ-non-kas aktin sağırlık neden olan mutasyonlar tarafından düzenleme değiştirebiliraktin bağlayıcı protein Arp2 / 3 9. Çalışmalar sıklıkla in vitro olarak istihdam protein analiz: protein etkileşimleri. Mutasyon üzerine, hücre biyolojisi, aktin ve, özellikle de, hücre içinde bağlayıcı protein lokalizasyonu aktin etkisine araştırmalar sınırlıdır. In vivo olarak maya hücre iskeletinin çalışmalar geleneksel bir ters flüoresan mikroskop 10 sabit hücre görüntüleri kullanır. Bu deneyler, aktin hücre iskeletinin morfolojisi hakkında temel girdi sağlamıştır. Araştırmalar bu yana karmaşık sitoskeletal ağı 11, 12, görselleştirmek için üç boyutlu konfokal görüntüleme dahil etmişlerdir. Bu görüntüleme aktin yamalar ve filamentler bolluğu ve göreli konumu kantifikasyonunu izin verir. Ince kesit elektron tomografi korunmuş hücre içi yapılarda 13 göreli olarak yoğun lifli ağların morfolojisi görüntü için kullanılmıştır. Kalabalık hücresel sküçük bir kesit ile adım bu tekniği ile ince ayrıntılı incelenebilir. Görüntüleme çalışmaları zaman atlamalı floresan mikroskopi kullanılarak canlı hücreler için uzatılmıştır. Beyazlatma fotoğraf ve arka plan floresan yönetilir olabilir zaman, zaman atlamalı görüntüleme incelemeleri sitoskeletal proteinlerin dinamikleri ve çevre koşulları 11, 14 yanıt olarak verir. Ayrı, in vitro aktin filamentler dinamikleri görselleştirme toplam iç yansıma floresan (TIRF) mikroskopi tanıtımı tarafından ortaya atılmıştır. Geniş alan mikroskobu ile karşılaştırıldığında, TIRF azalmış eşiğe yararlanmak ve bireysel filamanlar 15, 16 izlemek için geliştirilmiş kontrast vardır. Bu nitelikleri ile, TIRF mikroskopi plazma zarı 17, 18, ​​hücresel yapıları izlemek için hücre biyologlar tarafından adapte edilmiştir. Hücre iskeletinin değişiklikler dahil olmak üzere hücresel olaylar, canDüşük fototoksisite, maksimum kontrast ve en az arka plan çiçeklenme 19 gerçek zaman görünür. Daha iyi hareket, lokalizasyonu ve hücre, TIRF mikroskopi ve protein etiketleme hücre iskeleti proteinleri ciro aktin mutasyonların etkisini anlamak için kullanılmıştır. Burada, Saccharomyces cerevisiae &#39;de hücre iskeleti dinamikleri üzerinde aktin klinik olarak anlamlı bir mutasyon etkilerini incelemek için yöntemler tarif edilmiştir. Özel olarak, aktin bağlayıcı proteinin, Aip1p lokalizasyonu ve hareket, görsel ve aktin R256H mutasyonu ifade eden hücrelerde ölçülmüştür. Bu teknikler vitro biyokimyasal araştırmalarda tamamlayıcı ve protein etkileşimleri ve fonksiyonları daha iyi anlaşılması için izin verir.

<table><tbody><tr><td>Agaroz</td><td>rpi</td><td>9012-36-6</td><td></td></tr><tr><td>Bromofenol Mavisi</td><td>Amresco</td><td>115-39-9</td><td></td></tr><tr><td>BSA</td><td>NEB</td><td>B9001S</td><td></td></tr><tr><td>Change-IT Çoklu Mutasyon Bölgesi Yönlendirilmiş Mutajenez Kiti</td><td>USB Corporation</td><td>4166059</td><td></td></tr><tr><td>CutSmart Tampon</td><td>NEB</td><td>B7204S</td><td></td></tr><tr><td>DNA, somon testislerinden</td> <td>tek sarmallıSigma</td><td>9007-49-2</td><td></td></tr><tr><td>EDTA pH 7.4</td><td>Sigma</td><td>93302</td><td></td></tr><tr><td>Etidyum bromür</td><td>Invitrogen</td><td>15585-011</td><td>Uyarı! Zararlı tahriş</td></tr><tr><td>Mantar/Bakteriyel DNA Kiti</td><td>Symo Research</td><td>D6005</td><td></td></tr><tr><td>HpaI</td><td>NEB</td><td>R0105S</td><td></td></tr><tr><td>Lityum asetat</td><td>AlfaAesar</td><td>6108-17-4</td><td></td></tr><tr><td>Düşük DNA Kütle Merdiveni</td><td>İnvitrojen</td><td>10068-013</td><td></td></tr><tr><td>NE Tampon #4</td><td>NEB</td><td>B7004S</td><td></td></tr><tr><td>Platinum PCR SuperMix Yüksek Sadakat</td><td>İnvitrojen</td><td>12532-016</td><td></td></tr><tr><td>Miniprep Kiti</td><td>Qiagen</td><td>27106</td><td>Herhangi bir kit işe yarayacak</td></tr><tr><td>Hızlı Ligasyon Kiti</td><td>NEB</td><td>M2200S</td><td></td></tr><tr><td>Sodyum azid</td><td>Sigma</td><td>26628-22-8</td><td></td></tr><tr><td>PBS</td><td>Invitrogen</td><td>10010-023</td><td></td></tr><tr><td>PEG</td><td>Amresco</td><td>25322-68-3</td><td></td></tr><tr><td>Tris Base Ultra saf</td><td>rpi</td><td>77-86-1</td><td></td></tr><tr><td>Wizard SV Jel ve PCR Temizleme Sistemi</td><td>Promega</td><td>1/6/2015</td><td></td></tr><tr><td>XhoI</td><td>NEB</td><td>R0146S</td><td></td></tr><tr><td>XmaI</td><td>NEB</td><td>R0180S</td><td></td></tr><tr><td>YPD media</td><td>LabExpress</td><td>3011-URA</td><td></td></tr> <tr><td>Media</td><td>LabExpress</td><td>3010</td><td></td></tr><tr><td>PCR Makinesi</td><td>Canlandırıcı</td><td>4359659</td><td>Herhangi bir PCR makinesi çalışacaktır</td></tr><tr><td>TIRF Mikroskobu</td><td>Olympus IX81</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Hamamatsu ORCA-R kamera</td><td>Hamamatsu</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

aip1p dynamics aktin de r256h mutasyon tarafından altered hazır

Aip1p Dynamics Are Altered by the R256H Mutation in Actin

Aktin mutasyonlar, sık sık hücre iskeleti işlevini değiştirebilir spesifik moleküler değişiklikleri nedeniyle insan hastalıklarının bir dizi yol açar. Bu çalışmada, Floresan görüntüleme toplam iç floresan (TIRF) mikroskopi sitoskeletal dinamikleri değişiklikleri görselleştirmek ve ölçmek için kullanılan kullanılarak proteinler etiketledi. TIRF mikroskopi ve floresan etiketleri kullanımı da aktin mutasyonların neden sitoskeletal dinamikleri değişikliklerin ölçümü sağlar. Bu teknik kullanılarak, canlı hücrelerde hücre iskeleti fonksiyonun ölçümü rıyla protein fonksiyonunun in vitro çalışmalarda tamamlar. Bir örnek olarak, aktin tortu, R256 etkileyen yanlış anlamlı mutasyonlar, bu amino asit düzenleyici etkileşimlerinde önemli bir rol oynadığı öne üç insan aktini izoformu tespit edilmiştir. Sitoskeletal hareketlere aktin mutasyon R256H etkileri maya modeli kullanılarak incelenmiştir. Aktin depolimerizasyon in cofilin yardımcı olmak için bilinen protein, Aip1, olduN-terminalinde, yeşil floresan proteini (GFP) ile etiketlendi ve TIRF mikroskopi kullanılarak in vivo takip etti. Vahşi tip ve mutant suşları hem de Aip1p hareketinin hızı ölçülmüştür. R256H mutant aktin eksprese eden hücrelerde, Aip1p hareket sınırlı ve hareketin hızı 1,60 ile karşılaştırıldığında R256H hücrelerde 0.88 ± 0.30 mm / saniye (vahşi tür hücrelerinde ölçülen yaklaşık yarısı hızda olduğunu ± 0.42 vahşi tür hücrelerinde mm / sn, p &lt;0.005).

Görüntünün bir yöntem olup, bir hücrede hücre iskeleti proteinlerin dinamikleri sunulmuştur. Aktin bağlayıcı protein, Aip1p, GFP ile etiketlendi. Etiketli ürününü kodlayan plazmidin için tasarım, Şekil 1 &#39;de gösterilmiştir. Plazmit daha sonra, maya hücreleri içine transforme edildi. Floresan ekspresyonu Aip1p hücrede protein davranış gözlenmesine imkan etiketli. Aip1p tipik endositozun 22 sahalarında aktin yamalar lokalize. Şekil 2A&#39;da gösterildiği gibi, Aip1p hareket...

Aktin hastalığa neden olan mutasyonların sitoskeletal işlevini değiştirebilir. Sitoskeletal dinamikleri toplam iç floresan mikroskobu kullanarak floresan etiketli proteinlerin görüntülenmesi ile ölçülür. Bir örnek olarak, hücre iskeleti protein, Aip1p, mutant aktin izoformu, R256H ifade eden hücrelerde lokalizasyonu ve hareket değişmiş bulunmaktadır.

Aip1p Dynamics Aktin de R256H Mutasyon tarafından Altered Hazır

Mutations in actin cause a range of human diseases due to specific molecular changes that often alter cytoskeletal function. In this study, imaging of ...

Bu prosedürün genel amacı, mutant bir aktin izoformi eksprese eden mayalarda aktin bağlayan proteinin hareketini görselleştirmektir. Bu işlem, öncelikle bir plazmit hazırlanarak ve aktin ile etkileşime giren protein veya bir IP one P geni üç x yeşil floresan protein Fluor four ile etiketlenerek gerçekleştirilir. İkinci adım ise yalnızca yabanı tip veya mutant aktin eksprese eden bir maya suşunun üretilmesidir.Ardından, GFP etiketli A IP one P plazmidi yabanı tip veya mutant maya suşuna transforme edilir. Son adım, yabanı tip ve mutant maya hücrelerindeki etiketli A IP one P'nin hareketini görüntülemek ve analiz etmektir. Nihayetinde total internal refleksion.A IP one P'nin, R 2 56 H mutant aktini eksprese eden mayada vahşi tip aktine göre daha yavaş hareket ettiğini göstermek için floresan veya turf mikroskopisi kullanılır. Bu yöntem, bağlanma ortaklarının göreceli zamansal hareketleri gibi hücre iskeleti alanındaki temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Bu yöntemle ilgili ilk fikrimiz, mutant maya suşunda A IP one P'nin silinmesinin, vahşi tip suşun aksine ölümcül olduğunu keşfettiğimde ortaya çıkmıştı.Bu tekniğin konfokal mikroskopi gibi mevcut yöntemlere göre temel av

aip1p-dynamics-are-altered-by-the-r256h-mutation-in-actin

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Proteinler, farklı aktin bağlayıcı modüller aracılığıyla ipliksi aktin (F-aktin) bağlanır. Bu video in vitro testinin rutin olarak, F-aktin bağlayan proteinler ya da belirli etki analiz etmek için kullanılan bir co-sedimantasyon, aktin prosedürü göstermektedir.

Aktin Co-Sedimantasyon Testi; F-Aktin Bağlayıcı Protein Analizi

Işık tarafından küçük GTPaz aktivitesinin yerleşim-zaman kontrolü için bir yöntem tarif edilmiştir. Bu yöntem, rapamisin indüklenen FKBP-FRB heterodimerization ve foto-kafes sistemleri dayanmaktadır. Işık ışınlama Optimizasyonu Subselüler düzeyindeki küçük GTPases bir uzay-zamansal olarak kontrollü aktivasyon sağlar.

Yaşayan hücreler içinde Subselüler Düzeyinde ve Seconds Zaman ölçeği üzerinde Küçük GTPaz Faaliyet uzay-zamansal Manipülasyon

Filamentli aktin (F-aktin), spinogenez, sinaptik plastisite ve sinaptik stabilitede önemli bir rol oynar. F-aktin punkta'nın miktar tayini bu nedenle sinaptik yapıların bütünlüğünü incelemek için yararlı bir araçtır. Bu protokol, düşük yoğunluklu primer kortikal nöronal kültürlerde Phalloidin ile etiketlenmiş F-aktin punktasının miktar tayini prosedürlerini açıklar.

Rat Kortikal Nöronlar Filamentli Aktin (F-aktin) puncta Niceleme

Kemirgenlerin ve insan deneklerin beyin dokularından alınan ex vivo biyolojik örneklerde aksin filamentlerinin nicelleştirilmesi için basit, zaman verimli ve yüksek verimli floresan spektroskopi tabanlı bir tahlil rapor ediyoruz.

Kemirgen ve İnsan Beyin Dokularında Aktüer Polimerizasyon Durumunu Değerlendirmek için Zaman Verimli Floresan Spektroskopi Tabanlı Bir Tahlil

Basit aktin filament mikroakışkan tahlilleri için, floresan mikroskobu ile birlikte, bireysel aktin filamentlerini gerçek zamanlı olarak doğru bir şekilde izlemeyi ve sırayla farklı protein çözeltilerine maruz bırakmayı sağlayan protokoller sunuyoruz.

Tek Aktin Filamentlerin ve Demetlerin Montaj Dinamiğini İncelemek için Mikroakışkanlar ve Floresan Mikroskobu Kullanma

Bu protokol, in vitro toplam iç floresan (TIRF) mikroskopi testi kullanarak dinamik aktin ve mikrotübülleri görselleştirmek için bir kılavuzdur.

Aktin ve Mikrotübül Eşleşme Dinamiğinin In Vitro Total İç Yansıma Floresan (TIRF) Mikroskobu ile Görselleştirilmesi

Bu protokol, ticari olarak temin edilebilen protein bileşenlerini kullanarak boncukların yüzeylerinde aktin kuyruklu yıldızlarının nasıl üretileceğini açıklamaktadır. Bu tür sistemler, hücrelerde bulunan çıkıntılı yapıları taklit eder ve kuvvet üretiminin fizyolojik mekanizmalarını basitleştirilmiş bir şekilde incelemek için kullanılabilir.

Aktin bazlı hareketliliğin ticari olarak temin edilebilen proteinlerle yeniden yapılandırılması

Seçimi, mikroenjeksiyon ve görüntüleme floresan ile F-aktin floresan etiketli (FSM) mikroskopi speckle.

Floresan üzerinden F-aktin Dynamics Canlı Hücre Görüntüleme speckle Mikroskopi (FSM)

Küçük Hayvan Kas Aşı dinamiği ile Takip In Vivo Floresan Görüntüleme

Biz Photobleaching sonra Floresan Kurtarma (sıkı bağlamak) ve embriyonik kök hücreleri (ES) kromatin protein dinamiklerini izlemek için (FLIP) Photobleaching Floresan kaybı da dahil olmak üzere photobleaching yöntemleri açıklanmaktadır. Kromatin plastisite çalışma araçlarının biri olarak kabul edilir Kromatin protein dinamiği, pluripotent hücreler geliştirilmiş.

Embriyonik Kök Hücreler Yaşayan Kromatin Protein Dynamics Tedbir Tahliller (sıkı bağlamak ve FLIP) Photobleaching

Öğrenin, maya hücrelerinde Aip1p proteininin hareketini TIRF mikroskobu ile nasıl görselleştireceğinizi. Bu yöntem, aktin mutasyonlarının sitoskelet dinamikleri üzerindeki etkilerini incelemek için kullanılır.

Aip1p Dynamics Aktin de R256H Mutasyon tarafından Altered Hazır

Daha fazla video keşfet