Name: Uzun süreli Kalsiyum Görüntüleme için Agaroz microchambers Caenorhabditis elegans (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2015-06-24T15:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 51 s
Description: Öğrenin Caenorhabditis elegans'ta davranış ve sinir aktivitesini agaroz mikroakışkan odacıklarla uzun süreli kalsiyum görüntüleme yöntemiyle izlemeyi. Bu teknik gelişimsel değişiklikleri yüksek kaliteli görüntüleme ile takip eder.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Max Planck Kurumu ve HB için Göttingen Enstitüsü Genç Grubu stipend bu işi finanse.

1. Göstergeler, Kültür Medya ve Yemekleri <ol><li> Odak numune tutma kapasitesine sahip olan ve bir otomatik aşama ile donatılmış bir mikroskop kullanarak. Bir ısmarlama kapak ısıtıcı kurmak veya ticari bir çözüm satın alın. Kameranın poz üreticinin talimatlarına kullanarak TTL sinyali ile LED aydınlatma tetikler hangi bir LED-EMCCD kamera sistemi kurun. Not: Ayrıntılar için tartışma bakın. </li><li> Polydimethylsiloxan (PDMS) pulları: <ol><li> Bir Mikroakiskan tesisinde PDMS pulları Üretiyor ya da ticari bir dökümhane tarafından üretilen PDMS pul var. Ticari bir dökümhane kullanmak için, cihazın (örneğin 15 um) derinliği şirkete AutoCAD dosya göndermek ve belirtin. Dökümhaneden Doğumdan sonra, bir neşter kullanarak 16 pulları içine PDMS çip kesti. </li><li> Hava plazma kullanarak bir bardak slayt her damga Bond. Yapıştırma için, PDMS damga ve hava plazmaya cam slayt hem maruznöbeti 1 dakika (0.5 mbar, en yüksek plazma ayarlarını kullanarak). Yapıştırılması için yüzeyleri plazma tedavisi sırasında yukarı doğru baktığından emin olun. Ardından, cam slayt üzerine PDMS damga yerleştirin. </li></ol></li><li> 3,5 cm alt çanak alın ve dikey freze makinesi ve keskin döner kesiciler kullanarak çanak alt merkezine 18 x 18 mm kare alana kesip. Sürtünme tarafından üretilen ısı nedeniyle erimesi ile ilgili plastik önlemek için kesici ve yavaş besleme düşük dönme hızı kullanın. Aynı anda birkaç yemekler hazırlayın. Not: Alt çanak deney sonrasında birçok kez tekrar kullanılabilir saf etanol O / N ıslatıldıktan sonra temizlenir eğer. </li><li> Agaroz: <ol><li> 100 ml 3 g, yüksek erime noktalı agaroz eritilir S-Bazal (5.85 g NaCI, 1 g K 2 HPO 4, 6 gr KH 2 PO 4 etanol, 1 mi kolesterol (5 mg / ml), H2 O, 1 L, kaynatarak) otoklavlanarak sterilize edin. 2 ml Eppendorf tüpleri ve stor agaroz eritilir hacimde yapmake. Ayrıca, yüksek erime noktalı agaroz ile tam olarak aynı şekilde, düşük erime noktalı agaroz toplu hazırlar. </li><li> 98 ° C - kullanmayın agaroz 95 bir ısıtma bloğu üzerine yüksek erime noktası 3 bölüntülerin yerleştirmek için önce. 35 ° C - 30 ° C&#39;de bir ısıtma bloğu üzerine daha sonra eritilip kadar 98 ° C - 95 ile agaroz bir ısıtma bloğu üzerinde, kullanımı, düşük erime noktasına sahip olan bir kısım yer önce. </li></ol></li></ol> Hayvanların 2. Seçimi <ol><li> Temiz hayvanları elde etmek için seribaşı NGM plakalar üzerinde düşük yoğunlukta solucanlar büyütün. Gıda ve sadece birkaç hayvanların bol plaka üzerinde olduğundan emin olun. </li><li> Görüntüleme L1 larvaları için, taze bir numaralı seribaşı NGM plaka üzerine simit aşamasında embriyoları içeren yaklaşık 30 yumurta transferi. Daha sonra larva aşamalarını veya yetişkin C aktarmak için elegans, taze numaralı seribaşı NGM plaka üzerine yaklaşık 30 solucanlar aktarın. </li></ol> Agaroz microchambers 3. hazırlanması <ol><li> Yemeğin hazırlanması: <ol><li>Altındaki 18 x 18 mm kare bir açıklığı olan bir plastik tabak almak ve ters yukarı bakacak şekilde açılması ile yerleştirin. Deliğin üzerine 20 x 20 mm çift taraflı yapışkan bant parçası koyarak ağzını kapatınız. Yapışkan bant altta olacak şekilde çanak Arkanı dön ve sert bir yüzeye çanak yerleştirin. Ücretsiz neşter kullanılarak açılış kesin. </li><li> P1000 pipet kullanarak, çanak içine S-bazal içinde% 3 yüksek erime noktalı agaroz 2 ml doldurun. Açılış çevreleyen alan üzerine agaroz yerleştirin ve katılaşmaya edelim. Agaroz katı kadar bekleyin. </li><li> Çanak Arkanı dön ve yapışkan garnitür kalır ve maruz kalacağı ve böylece çift taraflı yapışkan bant kaplayan koruyucu filmi soyulabilir. Not: Sonuç olarak, yapışkan bant ince bir halka açma dışında saracaktır. Agaroz sonra numuneyi çevreleyen bir nem deposu olarak hizmet vermektedir. </li></ol></li><li> Microchambers dökümü: <ol><li> Th Açığa60 saniye - 20 hava plazma ile kalıplama e PDMS yüzeyi. Not: Bu plazma tedavisi hava kabarcıkları yakalama engeller ve daha keskin baskılar üretir, PDMS hidrofil yüzey oluşturur. </li><li> 9 cam slaytlar - 5 istifleme eşit yükseklikte iki ayırıcılar oluşturun. Yeri, uzun tarafı, ilk aralama yığını daha sonra tek bir cam slayt, sonra tekrar bir boşluk yığınına paralel olarak. Aralama karşısında dik PDMS damga içeren cam slayt yerleştirin. PDMS damga kalıp yüzeyi ve tek cam slayt arasında yaklaşık 1.5 mm&#39;lik bir boşluk var ki aralama yüksekliğini ayarlayın. </li><li> PDMS sıvı agaroz içine dikey olarak damga slayt hızla PDMS damga yakın tek cam slayt üzerine sıcak sıvı yüksek erime noktası agaroz bir damla koyun ve. Agaroz katılaşmaya edelim. Genellikle yaklaşık 2 dakika sürer opak bir görünüm, alır emin olun. Tek hareket ile dikey damgasını çekin. Not: gl için uygundurue bırakıcı çift taraflı yapışkan bant ile birlikte slaytlar. damganın dikey hareketi agaroz sıkışıp gelen hava kabarcıkları önler. </li></ol></li><li> Ince bir platin tel çekme kullanarak agaroz üzerine OP50 bakteri ile birlikte yumurta veya solucanlar aktarın. Bir kirpik kullanan gıda ile birlikte bir yumurta ya da odasının başına bir solucan dağıtın. Tek agaroz ped üzerine yaklaşık 30 yumurta doldurun. </li><li> Bu yemeğin ağzına güzel uyuyor ki yaklaşık 15 x 15 mm kare içine doldurulan microchambers içeren agaroz levha kesti. Forseps ile kare agaroz levha Pick up ve 20 x 20 mm cam lamel üzerine baş aşağı yerleştirin. Bir kez düştü, tekrar yukarı kaldırın veya bu bakteri ve solucanlar kendi odalarının dışına itti neden olabilir, çünkü etrafta kaydırın yok. </li><li> Yemeğin Meclisi: <ol><li> Plastik tabak açılması üzerine cam lamel yerleştirin. Yavaşça çift taraflı yapışkan bant yapılmış halkası üzerine cam lamel bastırın.Camı kırmak için özen gösterin. </li><li> Baş aşağı çevirin ve çanak yaklaşık 30 ° C&#39;ye kadar soğutulur microchambers içeren agar levha ve sıvı düşük erime noktası agaroz ile agaroz rezervuar arasındaki boşluğu doldurmak için P1000 pipet kullanın. Agaroz katılaşmış kadar bekleyin. </li><li> Bir kapak ile çanak mühür. Ters mikroskoplar için ısıtmalı kapak kullanın. Dik mikroskoplar için normal bir kapak kullanımı ve Parafilm çanak mühür. </li></ol></li><li> Microchambers hazırlanmasını bitirdikten sonra, bir stereo mikroskop altında onları kontrol edin. Doğru dolgu çok önemlidir. Ayrıntılar için tartışma bakın. </li></ol> 4. Kalsiyum Görüntüleme <ol><li> Böyle HBR16 27 ([PNÖH&#39;ün-1 :: SL1-GCaMP3.35-SL2 :: unc-54-3&#39;UTR, unc-119 (+)] goeIs5) olarak genetik olarak kodlanmış kalsiyum sensörleri ifade transgenik suşları kullanın. </li><li> Geniş alan Epifloresans için donatılmış bir bileşik mikroskop kullanın. Için EMCCD kameranın TTL çıkışını bağlayınKamera örneği yanar bir çerçeve kaydeder her zaman böylece LED TTL girişi. Yaklaşık 5 msn bir pozlama süresi kullanın. 50-300 aralığında EM kazanç kullanın. </li><li> Her 15 görüntülü her solucanı 24 saat bir patlama film çalışan belirtin - daha sonra ilk 30 dakika DIC ile 20 saniye boyunca, GCaMP kaydetmek ve sonra mKate2 sinyalinin son görüntüyü çekmek için bir GFP floresan ile 20 sn alınır sentezleme seviyeleri için kontrolü. Her patlama sırasında 2 / sn kare hızı kullanın. </li><li> Görsel veri denetimi için, floresan küçük değişiklikler görünürlüğünü artırmak için yanlış renk haritası kullanın. F floresan ortalama başlangıç ​​değeri olan ile mesafe kadar taşınmış / F olarak arsa floresan veri. Kalsiyum veri analizi ayrıntılı bir açıklaması literatüründe 20 bulunabilir. </li></ol> Çoklu Worms 5. Paralel AMI <ol><li> , Mikroskop üzerine microchambers içeren çanak yerleştirin örnek üzerinde odaklanmak ve autofo meşgulcus. Kamera solucan başına 1.920 kare, verilerin makul bir miktarın neden olacaktır 24 saat, 20 saniye içinde her yarım saatte 40 resim karelerinin bir patlama kazanır, böylece bir yazılım protokolünü ayarlayın. Bu sahne kullanarak her solucanı ziyaret böylece tarama ayarlayın. Tek vadede yaklaşık 30 solucanlar film hedefleyin. </li><li> Daha düşük büyütme kullanılarak, yani uzaklaştırma Image birden solucanlar. Kamera çip ile birkaç microchambers kapsayacak ve aynı anda birden fazla bitişik microchambers film düşük büyütme kullanın. Görüntü elde etme sonunda, bir hayvan kapsayan bir ilgi bölge kırpma yoluyla her odası için verileri ayırın. </li><li> Hızlı hareketlilik verilerini değerlendirmek için, çerçeve çıkarma 28-32 kullanın. </li></ol> C. 6. Görüntüleme Farklı Yaşam Evreleri elegans <ol><li> C. tüm yaşam evrelerinde agaroz microchambers kullanın elegans L1 yetişkin ve dahil dauers için. Dif için uygun odacık boyutlarını kullanınTablo 1 &#39;de gösterilmiştir ferent ömrü aşamaları. </li></ol><table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td> Hayat aşaması </td><td> Oda boyutu </td><td> Kamara derinliği </td><td> Normal kayıt süresi </td><td> Büyütme </td></tr><tr><td> L1 </td><td> 190 x 190 mm </td><td> 10-15 um </td><td> Yumurta - orta L2 </td><td> 400X </td></tr><tr><td> L2 </td><td> 370 x 370 mm </td><td> 15 um </td><td> Yumurta - L3 </td><td> 200X </td></tr><tr><td> Dauer larva </td><td> 370 x 370 mm </td><td> 25 mikron </td><td> 4 gün </td><td> 200X </td></tr><tr><td> L3 </td><td> 700 x 700 mm </td><td> 45 mikron </td><td> L2 - L4 </td><td> 200X </td></tr><tr><td> L4 </td><td> 700 x 700 mm </td><td> 45 mikron </td><td> Genç L4 - genç erişkin </td><td> 100X </td></tr><tr><td> Genç erişkin </td><td> 700 x 700 mm </td><td> 45 mikron </td&gt; <td> 12-24 saat </td><td> 100X </td></tr></tbody></table> Farklı yaşam evrelerinde Tablo 1. Odası boyutları. Gösterildi vardır 8 x 8 mm kamera çipi için optimize çeşitli aşamalarında için yararlıdır odası boyutları ve büyütme.

<ol><li>Brenner, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+genetics+of+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">The genetics of Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 77, 71-94 (1974).</li>
<li>Husson, S. J., Costa, W. S., Schmitt, C., Gottschalk, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Keeping+track+of+worm+trackers%5BTitle%5D)+AND+%22WormBook%22%5BJournal%5D)">Keeping track of worm trackers.</a> WormBook. , 1-17 (2012).</li>
<li>Yemini, E., Jucikas, T., Grundy, L. J., Brown, A. E., Schafer, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+database+of+Caenorhabditis+elegans+behavioral+phenotypes%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">A database of Caenorhabditis elegans behavioral phenotypes.</a> Nature Methods. 10, 877-879 (2013).</li>
<li>Likitlersuang, J., Stephens, G., Palanski, K., Ryu, W. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((C.+elegans+tracking+and+behavioral+measurement%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Visualized+Experiments+%3A+JoVE%22%5BJournal%5D)">C. elegans tracking and behavioral measurement.</a> Journal of Visualized Experiments : JoVE. , e4094(2012).</li>
<li>Yemini, E., Kerr, R. A., Schafer, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tracking+movement+behavior+of+multiple+worms+on+food%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harbor+Protocols%22%5BJournal%5D)">Tracking movement behavior of multiple worms on food.</a> Cold Spring Harbor Protocols. 2011, 1483-1487 (2011).</li>
<li>Swierczek, N. A., Giles, A. C., Rankin, C. H., Kerr, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+behavioral+analysis+in%5BTitle%5D)+AND+%22C.+elegans.+Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput behavioral analysis in.</a> C. elegans. Nature Methods. 8, 592-598 (2011).</li>
<li>Ramot, D., Johnson, B. E., Berry, T. L., Carnell, L., Goodman, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Parallel+Worm+Tracker%3A+a+platform+for+measuring+average+speed+and+drug-induced+paralysis+in+nematodes%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">The Parallel Worm Tracker: a platform for measuring average speed and drug-induced paralysis in nematodes.</a> PLoS One. 3, e2208(2008).</li>
<li>Larsch, J., Ventimiglia, D., Bargmann, C. I., Albrecht, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+imaging+of+neuronal+activity+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+U+S+A%22%5BJournal%5D)">High-throughput imaging of neuronal activity in Caenorhabditis elegans.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences U S A. 110, E4266-E4273 (2013).</li>
<li>Bringmann, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Agarose+hydrogel+microcompartments+for+imaging+sleep-+and+wake-like+behavior+and+nervous+system+development+in+Caenorhabditis+elegans+larvae%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Neuroscience+Methods%22%5BJournal%5D)">Agarose hydrogel microcompartments for imaging sleep- and wake-like behavior and nervous system development in Caenorhabditis elegans larvae.</a> Journal of Neuroscience Methods. 201, 78-88 (2011).</li>
<li>Yu, C. C., Raizen, D. M., Fang-Yen, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multi-well+imaging+of+development+and+behavior+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Neuroscience+Methods%22%5BJournal%5D)">Multi-well imaging of development and behavior in Caenorhabditis elegans.</a> Journal of Neuroscience Methods. 223, 35-39 (2014).</li>
<li>Luke, C. J., Niehaus, J. Z., O'Reilly, L. P., Watkins, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Non-microfluidic+methods+for+imaging+live%5BTitle%5D)+AND+%22C.+elegans.+Methods%22%5BJournal%5D)">Non-microfluidic methods for imaging live.</a> C. elegans. Methods. 68, 542-547 (2014).</li>
<li>San-Miguel, A., Lu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microfluidics+as+a+tool+for+C.+elegans+research%5BTitle%5D)+AND+%22WormBook%22%5BJournal%5D)">Microfluidics as a tool for C. elegans research.</a> WormBook. , 1-19 (2013).</li>
<li>Shi, W., Qin, J., Ye, N., Lin, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Droplet-based+microfluidic+system+for+individual+Caenorhabditis+elegans+assay%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">Droplet-based microfluidic system for individual Caenorhabditis elegans assay.</a> Lab Chip. 8, 1432-1435 (2008).</li>
<li>Krajniak, J., Lu, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Long-term+high-resolution+imaging+and+culture+of+C.+elegans+in+chip-gel+hybrid+microfluidic+device+for+developmental+studies%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">Long-term high-resolution imaging and culture of C. elegans in chip-gel hybrid microfluidic device for developmental studies.</a> Lab Chip. 10, 1862-1868 (2010).</li>
<li>Chalfie, M., Tu, Y., Euskirchen, G., Ward, W. W., Prasher, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Green+fluorescent+protein+as+a+marker+for+gene+expression%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Green fluorescent protein as a marker for gene expression.</a> Science. 263, 802-805 (1994).</li>
<li>Kerr, R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+imaging+of+calcium+transients+in+neurons+and+pharyngeal+muscle+of%5BTitle%5D)+AND+%22C.+elegans.+Neuron%22%5BJournal%5D)">Optical imaging of calcium transients in neurons and pharyngeal muscle of.</a> C. elegans. Neuron. 26, 583-594 (2000).</li>
<li>Suzuki, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+imaging+of+C.+elegans+mechanosensory+neurons+demonstrates+a+specific+role+for+the+MEC-4+channel+in+the+process+of+gentle+touch+sensation%5BTitle%5D)+AND+%22Neuron%22%5BJournal%5D)">In vivo imaging of C. elegans mechanosensory neurons demonstrates a specific role for the MEC-4 channel in the process of gentle touch sensation.</a> Neuron. 39, 1005-1017 (2003).</li>
<li>Hilliard, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vivo+imaging+of+C.+elegans+ASH+neurons%3A+cellular+response+and+adaptation+to+chemical+repellents%5BTitle%5D)+AND+%22EMBO+Journal%22%5BJournal%5D)">In vivo imaging of C. elegans ASH neurons: cellular response and adaptation to chemical repellents.</a> EMBO Journal. 24, 63-72 (2005).</li>
<li>Frokjaer-Jensen, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effects+of+voltage-gated+calcium+channel+subunit+genes+on+calcium+influx+in+cultured+C.+elegans+mechanosensory+neurons%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Neurobiology%22%5BJournal%5D)">Effects of voltage-gated calcium channel subunit genes on calcium influx in cultured C. elegans mechanosensory neurons.</a> Journal of Neurobiology. 66, 1125-1139 (2006).</li>
<li>Kerr, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+the+activity+of+neurons+and+muscles%5BTitle%5D)+AND+%22WormBook%22%5BJournal%5D)">Imaging the activity of neurons and muscles.</a> WormBook. , 1-13 (2006).</li>
<li>Miyawaki, A., Griesbeck, O., Heim, R., Tsien, R. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamic+and+quantitative+Ca2%2B+measurements+using+improved+cameleons%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Dynamic and quantitative Ca2+ measurements using improved cameleons.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences U S A. 96, 2135-2140 (1999).</li>
<li>Nakai, J., Ohkura, M., Imoto, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+high+signal-to-noise+Ca%282%2B%29+probe+composed+of+a+single+green+fluorescent+protein%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">A high signal-to-noise Ca(2+) probe composed of a single green fluorescent protein.</a> Nature Biotechnology. 19, 137-141 (2001).</li>
<li>Akerboom, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetically+encoded+calcium+indicators+for+multi-color+neural+activity+imaging+and+combination+with+optogenetics%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Molecular+Neuroscience%22%5BJournal%5D)">Genetically encoded calcium indicators for multi-color neural activity imaging and combination with optogenetics.</a> Frontiers in Molecular Neuroscience. 6 (2), (2013).</li>
<li>Tian, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+neural+activity+in+worms%2C+flies+and+mice+with+improved+GCaMP+calcium+indicators%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Imaging neural activity in worms, flies and mice with improved GCaMP calcium indicators.</a> Nature Methods. 6, 875-881 (2009).</li>
<li>Edwards, S. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+molecular+solution+for+ultraviolet+light+detection+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biology%22%5BJournal%5D)">A novel molecular solution for ultraviolet light detection in Caenorhabditis elegans.</a> PLoS Biology. 6, e198(2008).</li>
<li>Ward, A., Liu, J., Feng, Z., Xu, X. Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Light-sensitive+neurons+and+channels+mediate+phototaxis+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Neurosci%22%5BJournal%5D)">Light-sensitive neurons and channels mediate phototaxis in C. elegans.</a> Nat Neurosci. 11, 916-922 (2008).</li>
<li>Turek, M., Lewandrowski, I., Bringmann, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+AP2+transcription+factor+is+required+for+a+sleep-active+neuron+to+induce+sleep-like+quiescence+in%5BTitle%5D)+AND+%22C.+elegans.+Current+Biology%22%5BJournal%5D)">An AP2 transcription factor is required for a sleep-active neuron to induce sleep-like quiescence in.</a> C. elegans. Current Biology. 23, 2215-2223 (2013).</li>
<li>Singh, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((C.+elegans+Notch+Signaling+Regulates+Adult+Chemosensory+Response+and+Larval+Molting+Quiescence%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">C. elegans Notch Signaling Regulates Adult Chemosensory Response and Larval Molting Quiescence.</a> Current Biology. 21, 825-834 (2011).</li>
<li>Raizen, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lethargus+is+a+Caenorhabditis+elegans+sleep-like+state%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Lethargus is a Caenorhabditis elegans sleep-like state.</a> Nature. 451, 569-572 (2008).</li>
<li>Iwanir, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+microarchitecture+of+C.+elegans+behavior+during+lethargus%3A+homeostatic+bout+dynamics%2C+a+typical+body+posture%2C+and+regulation+by+a+central+neuron%5BTitle%5D)+AND+%22Sleep%22%5BJournal%5D)">The microarchitecture of C. elegans behavior during lethargus: homeostatic bout dynamics, a typical body posture, and regulation by a central neuron.</a> Sleep. 36, 385-395 (2013).</li>
<li>Nagy, S., Raizen, D. M., Biron, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measurements+of+behavioral+quiescence+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">Measurements of behavioral quiescence in Caenorhabditis elegans.</a> Methods. , (2014).</li>
<li>Nagy, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+longitudinal+study+of+Caenorhabditis+elegans+larvae+reveals+a+novel+locomotion+switch%2C+regulated+by+Galphas+signaling%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">A longitudinal study of Caenorhabditis elegans larvae reveals a novel locomotion switch, regulated by Galphas signaling.</a> eLife. 2, e00782(2013).</li>
<li>Cassada, R. C., Russell, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+dauerlarva%2C+a+post-embryonic+developmental+variant+of+the+nematode+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">The dauerlarva, a post-embryonic developmental variant of the nematode Caenorhabditis elegans.</a> Developmental Biology. 46, 326-342 (1975).</li>
<li>Schwarz, J., Lewandrowski, I., Bringmann, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reduced+activity+of+a+sensory+neuron+during+a+sleep-like+state+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Reduced activity of a sensory neuron during a sleep-like state in Caenorhabditis elegans.</a> Current Biology. 21, R983-R984 (2011).</li>
<li>Schwarz, J., Spies, J. P., Bringmann, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reduced+muscle+contraction+and+a+relaxed+posture+during+sleep-like+Lethargus%5BTitle%5D)+AND+%22Worm%22%5BJournal%5D)">Reduced muscle contraction and a relaxed posture during sleep-like Lethargus.</a> Worm. 1, 12-14 (2012).</li>
<li>Schwarz, J., Bringmann, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reduced+sleep-like+quiescence+in+both+hyperactive+and+hypoactive+mutants+of+the+Galphaq+Gene+egl-30+during+lethargus+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Reduced sleep-like quiescence in both hyperactive and hypoactive mutants of the Galphaq Gene egl-30 during lethargus in Caenorhabditis elegans.</a> PLoS One. 8, e75853(2013).</li>
</ol>

Yazarlar hiçbir rakip mali çıkarlarını olduğunu beyan ederim.

Donanım Bir mikroskop odak noktası genellikle uzun süreli görüntü alımı sırasında sürüklenir. Bileşik Mikroskop, odak tutma sistemleri önemli mikroskop üreticilerden satın alınabilir. Odak kontrolü ile bir bileşik mikroskop çok pahalı durumda, basit bir alternatif Stereomikroskopta kullanmak olacaktır. Bileşik mikroskoplar yüksek sayısal açıklık (NA) ile hedeflerin kullanımına izin ve kolayca otomatik hale getirilebilir. 40X petrol hedefleri uygundur. Suya daldırma lensler nedeniyle uzun süreli görüntüleme sırasında buharlaşma ideal değildir. Diferansiyel girişim kontrast (DIC) morfolojik ve davranışsal değişiklikleri takip için yardımcı hoş bir kontrast oluşturur, ama basit parlak alan görüntüleme de kullanılabilir. DIC veya parlak bir alan görüntüleme için, mikroskop dia-aydınlatma yoluna bir kırmızı ışık filtresi koyarak kırmızı ışık kullanın. Birkaç microchambers taranması için otomatik sahne gereklidir. En iyi performans acbir sahne doğrusal olmayan hızlanma ve yavaşlama vardır ve tarama sırasında hayvanların rahatsız engellemek için düşük tarama hızı ayarlanabilir olduğu kullanıldığında hieved. Biz solucanın mechanosensitive sistemini aktive değil aslında o yavaş tarama düşündüren davranışsal tepkiler ya da tarama sırasında mechanosensitive nöronların (ALM ve PLM) kalsiyum artışı gözlenen değil (veriler gösterilmemiştir). Ticari LED sistemler kullanılabilir. Birçok şirket, farklı dalga boylarında LED&#39;ler dahil hazır kullanımlı çözümleri sunuyoruz. LED dışarıdan bir TTL sinyali ile LED tetikleme seçeneği olmalıdır. Bir çok duyarlı kamera hayvanlar hareketli kalsiyum görüntüleme için gereklidir. EMCCD kameraları piyasadaki en hassas kameralar. Kamera pozlama sırasında bir TTL çıkışı (aynı zamanda sözde &quot;ateş&quot; çıkışı) olması gerekir. Bir kapak ısıtıcı, bir ters mikroskop kullanılarak, eğer kapak üzerinde yoğunlaşmasını önlemek için gereklidir. Dik bir mikroskop, çanak alınacaktır böylece kapak wialtta olacak ve ll böylece yoğuşma önlenir ve hiçbir kapak ısıtma gereklidir. kapak uzun süreli görüntüleme sırasında suyun buharlaşmasını önlemek için çanak yakın sıkıca gerekir. PDMS pulları agaroz kalıplama için yapısını içeren PDMS damga yüzeyi uzak PDMS damga destekleyen cam slayt, gelen karşı karşıya. Özel mikroakışkan cips sunan şirketlerle bir liste Wikipedia&#39;da (bulunabilir <a href="http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_microfluidics_related_companies" target="_blank">http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_microfluidics_related_companies</a> ). Onların odalarına nematodların Dolum Bu protokolde en kritik adımdır ve aşağıdaki noktalar dikkate alınmalıdır: A) agaroz nemlilik solucanlar aktarmak için ve görüntüleme için çok önemlidir. Agaroz, yani çok nemli ise, bir sıvı cov varBirkaç microchambers bir alanı ering, sıvı bakteri akıp yapacak çünkü kontrollü bir şekilde bakteriyel gıda ve solucanlar dağıtılması mümkün olmayacaktır. Agaroz çok kuru ise, bakteri ve solucanlar artan kuvvet kolayca agaroz zarar verir solucanlar ve bakteri damla kullanılması ihtiyacı var demektir kolayca seçim kurtulmak olmayabilir. Solucanlar bir sürü doldururken agaroz kadar kuru olabilir. En kötü durumda agaroz odaları çökecek sonunda çok kuru olacak. Agaroz çok kuru ise hiçbir solucanlar vardır çip yüzüne küçük bir damla S-Bazal (yaklaşık 2 ul) koyarak rehidre edilebilir. Sonra sıvı içine almak platin tel daldırma ve hatta odaları solucanlar ile doldurulur alana sıvı bazı çekin. B) Gıda miktarı uzun vadede başarılı görüntüleme için kritik önem taşımaktadır. Yeterli yiyecek yoksa, solucanlar dışarı çalıştırabilir. Aşırı gıda bölmesi boşluğu varsabir sıvı gibi değil, bir katı gibi davranmaz ve solucanlar bakterileri iterek odasına kaçmak için izin verecektir. Tüm odasını dolduran bir bakteri süspansiyonu elde etmek hedefliyoruz. solucanlar deney sırasında kendi uzunluğunun büyük bir kısmı boyunca agar ve cam yüzeyi ile fiziksel olarak sürekli temas halindedir ve tarama davranışı sıvıda dayak bir plaka üzerinde hareket benzer ve farklı gibi görünmektedir. Denemeyi berbat edebilir agaroz zararlı C) Mekanik. İnce seçim esastır. Bu keskin köşeleri olmamalıdır. Bir pipet ucuna bağlı bir seçenek kirpik platin çekme kullanmak yerine bölmelerine bakteri veya solucan hareket ettirmek için kullanılabilir. Çoğu durumda, bununla birlikte, fazla kurutulmuş agaroz hasarı nedeni budur. seçim veya kirpik, ideal olarak, sadece zar zor solucanlar ve bakterileri çekip gereken agaroz yüzeyinde agaroz kendisi ve su filmi temas etmelidir. Odaları sızdırmazlık zaman, yine, agaroz nem gereklidir. Orada olmamalıBu mühürleme sırasında bakteri ve solucanlar yıkayacak çünkü agaroz yüzey üzerinde herhangi bir serbest sıvı olabilir. Büyük kabarcıklar yavaşça agar kütüğün bir köşe kaldırarak uzaklaştırılabilir. Genellikle odaların içinde sıkışıp olsun odasının daha küçüktür Küçük kabarcıklar. Bu kabarcıklar bir sorun değildir ve emilim yoluyla kaybolur. Çanak montaj sonra, agaroz çok kuru ya da çok ıslak olmadığını tekrar kontrol edin. odaları güzel mühürlü olmalı ve odacıklar arasında herhangi bir sıvı akışı olmamalıdır. Agaroz çok ıslak ise, odaları düzgün mühür olmaz. Solucanlar kaçabilir ya da yiyecek arınacak. Numune çok nemli ise, basit kapağı açın ve bir iki dakika için agaroz kurumaya bırakın. Agaroz çok kuruysa, odalar çökebilir ve solucanlar kaçacaktır. Uzaklaştırma tarafından ölçeklendirme Floresan görüntüleme için, uzaklaştırma, düşük büyütmede elde edilen ışığın düşük miktarı ile sınırlıdır. Ayrıca, EMCCD kameralar duyarlılık için optimize edilmiş ve genellikle nispeten düşük çözünürlüğe sahiptir. Ancak, görüntüleme dört kat yukarı ölçeklendirme de mümkündür. 140x (20X Amaç ve 0.7X kamera montaj kullanılarak elde) büyütme ve 512 x 512 piksel, 8 x 8 mm kamerayı kullanırken Örneğin, 190 um x 190 um dört odaları tek bir kare üzerine sığabilecek. (Örneğin sCMOS kameralar, 16.6 mm x 14 mm yonga, 2560 x 2560 piksel = 5,5 Megapiksel gibi) büyük bir çip ile yüksek çözünürlüklü kamera DIC ve parlak saha görüntüleme ölçeklendirme optimize. Bir 100x büyütme kullanırken Örneğin, 190 mikron 30 L1 solucanlar kadar x 190 mikron odaları (bakınız Şekil 3) Bu kameranın her kare üzerine sığabilecek. Prensip olarak, uzaklaştırma ve tarama da hayvanların daha büyük sayıda elde etmek için kombine edilebilir. Sadece bir odak düzlemi görüntülü gerektiğini, böylece çoğu nöronlar, odakta oldukça iyi muaftır. Nöronlar piezo sürücüsü kullanarak taramayı AZ, odak dışına taşımak için tespit edilirse her zaman p alınabiliroint. Farklı davranışları Uyum Bu protokol uzun zaman ölçeklerinde karşısında davranış iyi bir fikir verir. Açıktır ki, patlamaların zamanlaması farklı davranış ve yaşam evrelerinde adapte edilmesi gerekmektedir. Tekniğin Sınırlamalar Çeşitli faktörler görüntüleme süresini sınırlamak. En önemli gıda miktarıdır. Gıda tüketilen sonra, larvalar gelişmekte durdurmak. Böylece, küçük odacıklarda (190 x 190 mm) solucanlar L3 aşamasına kadar gelişebilir ve ardından tutuklama. Uzun görüntüleme zamanı gerekli ise, daha büyük bölümler kullanılması gerekir. 3 gün - Uzun süreli görüntüleme maksimum süresi 2.5 aralığındadır. Uzun görüntüleme gerekli ise, solucanlar geri kazanılır ve yeni odalarına yerleştirilmesi gerekir. Erişkin solucanlar görüntüleme yaparken, başka bir sınırlama bu solucanların yavru kaynaklanır. Yetişkin solucanlar hangi larva yumurtadan yumurta yatıyordu. Bu larvalar da odasının içine kalacak, Gıda tüketmek ve görüntü analizi rahatsız edebilir. Yavrular bir sorun varsa, çözüm steril yetişkin kullanmak ya da taze odalarına solucanlar defalarca yerleştirmektir. Solucanlar kurtarmak için, odacık içeren agaroz kütük bir bisturi ile kesilip olup, lamel çekilir ve solucanlar elde edilebilir olan bir NGM plaka üzerine yerleştirilir. Başka bir sınır nispeten küçük alanlara solucanlar kısıtlamadır. Uzun menzilli hareketi analiz edilmesi gerekir, bu bir sorun olabilir. Odalarına hayvanlar mekanik ve optogenetically 21,27,34,35 stimüle edilebilir olsa da, odanın mühürlü doğası zor çözünür veya uçucu uyarıcılar uygulamak için yapacaktır. Bu oksijen veya karbon dioksit gibi Biyolojik olarak önemli gazlar agar serbestçe yayılabilir. çanak büyük hava deposu deneyleri için gerekli zaman içinde sabit odalarına gaz konsantrasyonlarını tutmalı. Ancak, zihin yerel oksijen konsantrasyon içinde tutulmalıdırn odasında daha plaka üzerinde kültürden daha sıvı kültüründe bulunan koşulları benzeyebilir. Mevcut yöntemlere göre önemi Mikroakışkan cihazlar büyük ölçüde C okudu davranışsal ve gelişimsel gelişmiş elegans. Çoğu zaman, mikro-akışkan yapı PDMS 12 yapılmıştır. Burada agaroz yapılan mikroakışkan kültür odaları oluşturmak için bir protokol açıklar. Bu tekniğin mukavemetli, yüksek görüntü kalitesi, fizyolojik ölçümler, uzun vadeli bir görüntüleme ve oldukça yüksek bir verimlilik ile davranış korelasyon birleşimidir. Yüksek görüntü kalitesi yüksek NA hedeflerini kullanarak cam lamel sayesinde görüntüleme elde edilir. Bunun bir sonucu olarak, örneğin kalsiyum görüntüleme ve hücre içi yapıların konfokal görüntüleme gibi floresan görüntüleme gerçekleştirilebilir. Hayvanlar, diğer sistemlerde olduğu gibi hareketsiz olmadığından, fizyolojik ölçümler davranış bir korelasyon verir. Because hayvanlar bol gıda var, onlar uzun vadeli görüntüleme izin gelişmekte devam. Bu sistem hayvanların belirlenen odalarına bir vadede görüntü pek çok solucan kısıtlanır çünkü. Böylece, bu yöntem kolayca 9,27,34-36 kadar ölçeklendirilebilir. Gelecekteki uygulamalar Şimdiye kadar, bu sistem, C uyku davranışı incelemek için ağırlıklı olarak kullanılmaktadır elegans L1 larvaları. Bununla birlikte, tüm aşamalarında uyum mümkün da dauers ve yetişkinlerde davranışlarının geniş bir çalışma için yapacaktır. Davranışları geniş bir dizi çiftleşme gelen yumurtlama kadar bu teknikle ele alınabilir.

Caenorhabditis elegans, davranışı incelemek için model bir sistem olarak kurulmuştur1. Genetik olarak uygunluğu nedeniyle, davranışın altında yatan moleküler ve hücresel mekanizmalar incelenebilir. Birçok davranış uzun zaman ölçeklerinde ortaya çıkar. Hareketli hayvanları uzun zaman ölçeklerinde gözlemlemek için iki temel yaklaşım kullanılabilir. İlk yaklaşım, otomatik bir sahne veya kamera2-8 kullanarak hareket sırasında hayvanı takip etmektir ve ikincisi, hareketi en azkamera 9-14'ün görüş alanı kadar küçük bir aralıkla sınırlamaktır. Her iki yöntemin de avantajları vardır. İzleme, bir hayvanı uzun uzamsal aralıklarda takip etmeye izin verir, ancak bir deneyde ayırt edilebilecek hayvan sayısını sınırlar. Hayvanların hareketini kısıtlamak, kısıtlı bölme dizileri kullanarak gözlemin aynı anda birçok bireye ölçeklendirilmesine izin verir. 
Nematod şeffaf olduğu için non-invaziv olarak canlı floresan görüntüleme yapılabilir15. Kalsiyum görüntüleme, uyarılabilir hücrelerin aktivitesi için fonksiyonel bir okuma sağlar ve C. elegans16-20 için kurulmuştur. Kalsiyum, depolarizasyon üzerine açılan plazma zarındaki kanallar yoluyla hücreye girer. Bu nedenle, kalsiyum nöral aktivite için bir vekil görevi görür. Kalsiyum sensörler, oransal ve orantısız sensörler olmak üzere iki ana sınıfta toplanabilir. Her iki sınıf da kalsiyumun bağlanması üzerine indüklenen kalsiyum bağlayıcı proteinlerin konformasyonel değişikliklerini kullanır. Oransal sensörler iki floresan proteini içerir. Düşük dalga boylu floresan proteini uyarıldığında, ışık enerjisinin bir kısmı, Floresan Rezonans Enerji Transferi veya Förster Rezonans Enerji Transferi (FRET)21 adı verilen bir işlemle mesafelerinin bir fonksiyonu olarak daha yüksek dalga boylu floresan proteine iletilir. Oransal olmayan sensörler, dairesel olarak permütasyonlu GFP'ye dayanır ve kalsiyum bağlanması22'nin neden olduğu floroforun söndürülmesini kullanır. Her sınıfın kendine göre avantajları vardır. Oransal sensörler harekete veya ifade artefaktlarına karşı daha az hassas olsa da, oransal olmayan sensörler tipik olarak daha yüksek bir dinamik aralığa sahiptir. Hem oransal hem de oransal olmayan sensörler, C. elegans16-20,23,24'teki uyarılabilir hücrelerin aktivitesini incelemek için yararlı olmuştur. 
Uzun süreli floresan görüntüleme yaparken, deneyci birkaç potansiyel zorlukla uğraşmak zorunda kalacaktır: 1. Uyarma ışığı yoluyla davranışın bozulması: Solucanlar, kısa dalga boylu floresan uyarma ışığına duyarlıdır ve kalsiyum görüntüleme için kullanılan mor ila mavi aralığındaki ışıktan kaçınır25,26. Solucanlar geriye veya ileriye kaçış tepkisi ile yanıt verir25,26. Bu nedenle, ışık miktarının kontrol edilmesi gerekir. 2. Floresan sensör proteininin ağartılması: Genellikle, floresan proteinin ağartılması uzun süreli görüntülemeyi engeller. Bununla birlikte, tipik olarak, ağartmayı gözlemlemek için gereken ışık yoğunlukları, hayvanların davranışları üzerinde rahatsız edici etkilere neden olan ışık yoğunluklarından daha yüksektir. Bu nedenle, bu tip kalsiyum görüntülemesinde beyazlatma sadece teorik bir sorundur. 3. Mikro odacıkların içindeki solucanlar sabit değildir ve uyandırma davranışı sırasında sürekli hareket ederler ve solucan hareketsiz hale getirilmezse görüntüler bulanık görünebilir. Tüm bu zorluklar, düşük ışık yoğunluğu ile son derece kısa pozlama süreleri kullanılarak çözülebilir. Bu, kısa pozlama sürelerine ve bir ışık yayan diyotun (LED) harici olarak tetiklenmesine sahip son derece hassas bir EMCCD kamera kullanılarak gerçekleştirilebilir. Solucanları aydınlatma ışığına mümkün olduğunca kısa bir süre maruz bırakmak için (yalnızca kameranın pozlama süresi boyunca), LED, kameranın pozlama sırasında yaydığı bir transistör-transistör mantığı (TTL) sinyali kullanılarak harici olarak tetiklenir ve bu da solucanın tam olarak kamera çipinin maruz kaldığı süre boyunca aydınlanmasına neden olur. Bu aynı zamanda EMCCD çipinin veri okuma sırasında karanlık olacağı anlamına gelir, bu da bu çipin okuma performansı için en uygunudur. 
Daha önce, C. elegans larvaları 9'un uzun süreli floresan görüntülemesi için agaroz mikroodaları geliştirilmiştir. Burada, agaroz mikro odacıklarının C. elegans'ın herhangi bir yaşam evresi için uzun süreli kalsiyum görüntüleme için nasıl kullanılabileceği, kalsiyum görüntülemenin nasıl yapılabileceği ve bu yöntemin paralel olarak birçok bireysel solucanı test etmek için nasıl yükseltilebileceği açıklanmaktadır.

<table><tbody><tr><td>Yüksek erime noktalı agaroz</td><td>Fisher Bioreagents</td><td>BP(E)164-1000</td><td></td></tr><tr><td>Üstten Görüş düşük erime noktalı agaroz</td><td>Thermo Scientific</td><td>R0801</td><td></td></tr><tr><td>LED sistemi</td><td>CoolLED</td><td>pE-2</td><td></td></tr><tr><td>Bileşik mikroskop</td><td>Nikon</td><td>TiE</td><td></td></tr><tr><td>Stereomikroskop</td><td>Leica</td><td>M5</td><td></td></tr><tr><td>EMCCD kamera</td><td>Andor</td><td>iXon 897</td><td>şimdi iXon Ultra 897</td></tr><tr><td>sCMOS kamera</td> olarak satılıyor <td>Andor</td><td>Neo</td><td></td></tr><tr><td>Plazma temizleyici</td><td>Harrick</td><td>PDC-23G2</td><td></td></tr><tr><td>Kapaklı ısıtıcı</td><td>MPI atölyesi</td><td>ısmarlama</td><td></td></tr><tr><td>Plastik tabak</td><td>Falcon</td><td>08-757-100A</td><td></td></tr><tr><td>Mikroskop için Z-aşaması</td><td>Önceki</td><td>Nano Tarama Z</td><td></td></tr><tr><td>XY aşaması için mikroskop</td><td>Önceki</td><td>Proscan III</td><td></td></tr><tr><td>PDMS damgası</td><td>Abbott Laboratuvarları</td><td>özel yapım</td><td></td></tr><tr><td>Kırmızı ışık filtresi</td><td>Chroma</td><td>ET660/50m</td><td></td></tr><tr><td>35 mm Petri kabı</td><td>Falcon</td><td>Falcon Tek Kullanımlık Petri Kapları, Steril, Corning</td><td></td></tr><tr><td>Çift taraflı yapışkan bant</td><td>Sellotape/Henkel</td><td>çift taraflı 25 mm x 33 m</td><td>alternatif olarak, Rubance Yapıştırıcılarından gelişmiş çift taraflı yapışkan bant kullanılabilir.</td></tr></tbody></table>

uzun süreli kalsiyum görüntüleme için agaroz microchambers<em&gt; caenorhabditis elegans</em

Agarose Microchambers for Long-term Calcium Imaging of Caenorhabditis elegans

Davranış sinir sistemi tarafından kontrol edilir. Kalsiyum görüntüleme Caenorhabditis çeşitli davranışları sırasında nöron aktivitesinin ölçülmesi için elegans şeffaf bir nematod basit bir yöntemdir. Davranışı ile sinir aktivitesi ilişkilendirmek için, hayvan immobilize olmamalı taşımak gerekir. Birçok davranış değişiklikleri, uzun zaman ölçeklerinde sırasında meydana ve davranış birçok saat boyunca kayıt gerektirir. Bu aynı zamanda, kültür gerekli gıda mevcudiyetinde solucanlar yapar. Nasıl solucanlar kültüre ve sinirsel aktivite uzun zaman ölçeklerinde üzerinden görüntülü olabilir? Agaroz Microchamber Görüntüleme (AMI) daha önce kültür geliştirilmiştir ve küçük larvaları gözlemlemek ve şimdi C. yetişkin aşamasına kadar erken L1 tüm yaşam evrelerini incelemek için adapte edilmiştir edildi elegans. AMI C. çeşitli yaşam evrelerinde yapılabilir elegans. Uzun vadeli kalsiyum görüntüleme com kısa dışarıdan tetiklenen pozlama kullanarak hayvanları hareketsiz olmadan elde edilirşarj çiftli cihaz (EMCCD) kamera kaydını çarparak bir elektron ile kombine. Uzaklaştırma veya tarama paralel 40 solucanlar kadar görüntü bu yöntemi kadar ölçeklendirilebilir. Böylece, bir yöntem C. tüm yaşam evrelerinde uzun zaman ölçeklerinde üzerinde görüntü davranış ve sinirsel aktivite açıklanan elegans.

Agaroz microchambers C arasında herhangi bir yaşam aşamasında uygulanabilir elegans. Şekil 1A&#39;da görüldüğü gibi, L1 lethargus sırasında larva gelişimi ve uyku davranışı görülmektedir. Derin 190 x 190 mm, 10 mm olan bölme boyutları Gösterildi. Daha uzun bir zaman ölçekleri gerekliyse, daha büyük odaları kullanılabilir. Daha büyük boyutlu (370 x 370 um, 25 um derinliğinde) olan bir odacığı kullanılarak, Şekil 1B&#39;de görüldüğü gibi C geliştirilmesini sağlar elegans yumurtadan yetişkin kadar. Şekil 1C yetişkin kadar yumurtadan bir odasında yetişen bir solucanın çerçeve çıkarma kullanarak davranışı uzun vadeli değişikliklerin analizini göstermektedir. Sonrasında ve lethargus sırasında seçilen patlamaları için çerçeve çıkarma sonrası ortalama şiddetleri gösterilir vardır. solucanın hareketlilik alt çerçeve çıkarma değerleri sonrası ortalama yoğunluğudur düşük. Gösterilen bir uyandırma durumu ve larva dönemi başına bir lethargus durumundan patlama izleri seçilir.gelişimi sırasında ortalama yoğunluk gözlenen artış hayvanın artan kontrast ve büyüklüğü çoğunlukla kaynaklanmaktadır. Şekil 1D bir Dauer larva, olumsuz çevre koşulları 33 sırasında devreye girer alternatif yaşam aşamasını gösterir. Oda boyutu 370 x 370 mm, 15 mm derin. Dauer larva aşamasından çıkmak neden olur ki, Dauer larva bakteriyel gıda olmadan odasına konuldu unutmayın. Şekil 1E zaten odasına birçok yumurta atmıştır yetişkin bir solucan göstermektedir. Yetişkin için kullanılan Kazan boyutları derin 700 x 700 mm, 45 mm idi. Son olarak, Şekil 1F yetişkin hermafrodit ve yetişkin bir bölme içinde bir erkek çiftleşme göstermektedir. Hareketli solucanlar Kalsiyum görüntüleme. GCaMP kalsiyum sensörleri ile mümkündür 2A, L1 larva 27 komut interneuron AVA B gösterisi kalsiyum görüntüleme Rakamlar. 2C sa kalsiyum faaliyet gösterecek D, RakamlarBir yetişkin hayvan nöron beni türü. Uzun vadeli görüntüleme ölçeklendirme tarayarak ve uzaklaştırma ile mümkündür. 3A, 5 megapiksel kamera ile tek kamera çip 30 solucanlar eşzamanlı görüntüleme görüntü kalitesini gösterir. Şekil 3B aynı anda görüntülü 4 solucanlar kalsiyum görüntü kalitesini göstermektedir. <img alt="Şekil 1" src="/files/ftp_upload/52742/52742fig1highres.jpg" width="700" /> C. tüm yaşam evrelerine AMI 1. Adaptasyon Şekil 190 x 190 mm ​​odalarına erken L2 aşamasına kadar erken L1 görüntülü elegans. (A) Larva. 370 x 370 mm odasında yetişkin kadar yumurtadan (B) geliştirilmesi. Bir solucanın (C) Hareketlilik çerçeve çıkarma kullanılarak değerlendirildi. Her larva sta için bir seçili patlama film için çerçeve çıkarma sonra görüntünün tüm resimlerin ortalama yoğunluğu Gösterildisonrasında ve lethargus davranış ge. 370 x 370 um odası içinde gıda olmadan (D) bir Dauer larva. 700 x 700 mikron odasına koydu birçok yumurta (E) Yetişkin hermafrodit. (F) bir erkeğin Çiftleşme ve 700 x 700 mikron odasının içine bir hermafrodit. YA genç yetişkin anlamına gelmektedir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/52742/52742fig1highres.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt="Şekil 2," src="/files/ftp_upload/52742/52742fig2highres.jpg" width="700" /> AMI Şekil 2. Kalsiyum görüntüleme. AVA nmr-1 promotör kullanarak L1 larvaların komuta interneuron içinde GCaMP3 ile (A) Kalsiyum görüntüleme. İki yanlış renkli görüntüler gösterilir vardır. Sol resimde, AVA aktivitesi düşüktür ve solucan bir geriye hareketi yapmıyor. Sağ resimde AVA aktivitesidir<html> yüksek ve solucan geriye hareket ediyor. L1 solucanı için zamanla (B) Kalsiyum geçici. (C, D) yetişkin hayvan Kalsiyum transientler. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/52742/52742fig2highres.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <img alt="Şekil 3," src="/files/ftp_upload/52742/52742fig3highres.jpg" width="700" /> Yakınlaştırıp uzaklaştırarak paralel Şekil 3. Görüntüleme birden solucanlar. (A) Eşzamanlı 190 x 190 mikron odaları kullanarak kare başına 30 L1 solucanlar görüntüleme ve 100X büyütme (10X objektif kullanılarak) ve 16,6 x 14 mm kamera çipi. (B) 370 x 370 mm odaları ve 100X büyütme ve 16,6 x 14 mm kamera çip ilgi bir bölge kullanarak çerçeve başına dört L3 solucanlar Simultane görüntüleme.et = &quot;_ blank&quot;&gt; bu rakamın daha büyük bir versiyonunu görmek için lütfen buraya tıklayınız.

Hayvanın hareketsiz hale getirilmeden uzun zaman ölçeklerinde davranışı ve nöral aktiviteyi görüntülemek, davranışı anlamak için bir ön koşuldur. Agaroz mikroakışkan odacıkların görüntülenmesi (), Caenorhabditis elegans'ın tüm yaşam evreleri için nöral aktivite ve davranışı görüntülemek için kullanılabilir.

Uzun süreli Kalsiyum Görüntüleme için Agaroz microchambers<em&gt; Caenorhabditis elegans</em

Behavior is controlled by the nervous system. Calcium imaging is a straightforward method in the transparent nematode Caenorhabditis elegans to measure ...

Bu deneyin genel amacı, birden fazla yaşlı *C. elegans*'ın davranış gelişimini ve nöral aktivitesini izlemektir. Bu, solucanların besin dolu aros mikroakışkan odacıklarda kültüre edilmesiyle gerçekleştirilir. Uzun süreli kalsiyum görüntüleme, bir EMCCD kamera ve TTL tetiklemeli kısa pozlama süreleri kullanılarak yapılır.Prosedür, birden fazla haznenin sırayla taranması veya birkaç haznenin aynı anda filme alınması yoluyla ölçeklendirilebilir. Sonuçlar, komut ara nöronlarının kalsiyum geçişlerinin yanı sıra larva ve ergin davranışlarını göstermektedir. Bu mikro hazne tekniğinin temel avantajı, davranışın ve gelişimin yüksek kaliteli görüntüleme ile uzun bir süre boyunca takip edilebilmesidir.Mikro odacıkların doğru miktarda besin ve sıcaklıkla doldurulmasının öğrenilmesi zor olduğundan, bu yöntemin görsel gösterimi kritik öneme sahiptir. Başlamak için, kapak ısıtıcılı, otomatik tablalı ve E-M-C-C-D kamera sistemli bir mikroskop düzeneği kurun. Polimetil siloksan damgaları bir mikroakışkan tesiste veya ticari bir dökümhane kullanarak üretin.PDMS çipini bir skalpel kullanarak 16 ayrı damgaya bölün. Ardından, damgayı lam üzerine yapıştırmadan önce hem damgayı hem de cam lamı yaklaşık bir dakika boyunca hava plazmasına maruz bırakın. Plastiğin erimesini önlemek için yavaş çalışın.3,5 santimetrelik bir petri kabının tabanından kare şeklinde bir alan kesin. Aynı anda birkaç kap hazırlayın. Kullanımdan önce hem yüksek hem de düşük erime noktalı agarın steril alikotlarını hazırlayın.Yüksek erime noktalı aerosun üç alikvotunu bir ısıtma bloğuna yerleştirin. Ek olarak, düşük erime noktalı bir aero elokuasını, ayrı bir ısıtma bloğuna aktarmadan önce eritin. İlk olarak, daha önce oluşturulan kare açıklıklı plastik kabı alın ve açıklığı yukarı bakacak şekilde ters çevirerek yerleştirin.Açıklığı kapatmak için bir parça çift taraflı yapışkan bant kullanın. Yapışkan bant alt kısma gelecek şekilde kabı ters çevirin ve kabı sert bir yüzeyin üzerine yerleştirin. Bir skalpel kullanarak açıklığı kesin.Ardından, açıklığı çevreleyen alanı iki mililitre yüksek erime noktalı agar ile doldurun. Agar katılaşana kadar bekleyin. Katılaştıktan sonra, diğer taraftaki çift taraflı yapışkan bandı örten koruyucu filmi çıkarın.Bu işlem, açıklığın dış kısmını çevreleyen ince bir yapışkan bant halkası ile sonuçlanır. Agar, daha sonra örneği çevreleyecek olan bir nem rezervuarı görevi görür. Mikro odacıkları oluşturmadan önce, PDMS damga yüzeyini 20 ila 60 saniye boyunca hava plazmasına maruz bırakarak hazırlayın.Beş ile dokuz arasında lam slayt üst üste dizerek eşit yükseklikte iki ara parça oluşturun. İki ara parça yığınının arasına tek bir lam slayt yerleştirin. Ardından, PDMS damgasını içeren lam slaytı ara parçaların üzerine yerleştirin.Kalıplama yüzeyi ile lam arasında 1,5 mm boşluk kalacak şekilde ara parçaların yüksekliğini ayarlayın. Hazır olduğunuzda, PDMS damgasının yanındaki lama bir damla sıcak, yüksek erime noktalı aros damlatın ve damgayı hızlıca yatay olarak sıvı arosun içine kaydırın. Aros katılaşıp opak göründüğünde, damgayı tek bir hareketle dikey olarak yukarı çekin.İnce bir platin tel uç yardımıyla yumurtaları veya solucanları OP 50 bakterileriyle birlikte aros üzerine aktarın. Her bir bölmeye besinle birlikte bir yumurta veya bir solucan dağıtmak için bir kirpik cımbızı kullanın. Bir aros pedi yaklaşık 30 solucan içermelidir.Mikro odacıkları içeren aros plakasını, kabın açıklığına tam oturacak şekilde kare formunda kesin. Plakayı kaldırmak için pens kullanın ve bir cam lamel üzerine ters çevirerek yerleştirin; lamel yerleştirildikten sonra onu kaldırmayın veya kaydırmayın. Bu, içeriklerin odacıkların dışına itilmesini önlemek içindir.Hazneler şu anda mühürlenmiş durumdadır. Ardından, lamelini plastik kabın açıklığına yerleştirin. Lameli, çift taraflı yapışkan banttan yapılmış halkanın üzerine nazikçe bastırın.Camın kırılmamasına dikkat edin. Kabı ters çevirin ve agar blok ile agar rezervuarı arasındaki boşluğu, agar katılaştığında dolduracak şekilde düşük erime noktalı agar ile doldurun. Kabı bir kapak ve parafilm ile mühürleyin.Mikro odacıkların hazırlığını tamamladıktan sonra, bunları bir stereo mikroskop altında doğru şekilde kontrol edin. Odacıkların doldurulması ve nem kontrolü, işlemin başarısı için kritik öneme sahiptir. Başlamak için, mikro odacıkları içeren kabı mikroskoba yerleştirin ve numuneye odaklanın. 24 saat boyunca, her yarım saatte bir 20 saniyede 40 görüntü karesi kaydedin.Ardından, sahne kullanılarak her bir solucuğun ziyaret edileceği şekilde taramayı ayarlayın. Bir oturumda yaklaşık 30 solucuğu görüntülemeyi hedefleyin. Uzaklaştırma yaparak birden fazla solucuğun görüntüsü alınabilir.Birden fazla mikro hücreyi kapsamak için düşük büyütme kullanın ve birkaç bitişik mikro hücreyi aynı anda görüntüleyin. Görüntüleme işlemi sona erdikten sonra, tek bir hayvanı kapsayan bir ilgi alanı kırparak her bir hücre için verileri ayırın. Mobilite verilerini hızlıca değerlendirmek için kare çıkarma yöntemi kullanılabilir.Görüntülemenin ardından, geniş alan epi-floresans için donatılmış bir bileşik mikroskopta kalsiyum görüntüleme gerçekleştirilir. Işığa maruz kalmayı sınırlamak için, örneği aydınlatmak üzere bir LED'i tetikleyen bir transistör-transistör mantığı (TTL) sinyali kullanın. Aynı anda, kamera bir kare kaydeder.24 saat boyunca burst movie çekimi gerçekleştirin. Bu işlem, her solucanı her 15 ila 30 dakikada bir görüntüler. İlk olarak DIC ile 20 saniye kayıt yapın.Ardından, GFP floresansı ile 20 saniye boyunca görüntüleme yapın. Ve son olarak, kontrol ekspresyon seviyeleri için MK iki sinyalinin bir görüntüsünü alın. Görsel veri incelemesi için, floresan yoğunluğundaki küçük değişimlerin görünürlüğünü artırmak amacıyla yalancı renk haritası kullanın.Son olarak, standart prosedürleri kullanarak kalsiyum veri analizini gerçekleştirin. Bu örnek larval davranışı göstermektedir. Daha geniş boyutlara sahip bir hazne, yumurtadan erginliğe kadar olan uzun süreli gelişime olanak tanır; davranışlardaki değişiklikler burada gösterilmiştir.Buradaki dower larva tohumu, elverişsiz çevre koşulları sırasında devreye giren alternatif bir yaşam evresidir. Bu yetişkin solucan, odacığın içine çok sayıda yumurta bırakmıştır. Son olarak, bu görüntü bir yetişkin hermafrodit ve bir erkeğin yetişkin odacığı içinde çiftleşmesini göstermektedir.L1 larvası için komut inter nöron A VA'nın kalsiyum görüntülemesi burada gösterilmiştir. Bu görüntüler, yetişkin bir hayvandaki aynı nöron tipine ait kalsiyum aktivitesini göstermektedir. Uzun süreli görüntülemenin ölçeklendirilmesi, tek bir kamera çipinde 30 solucanın görüntülenmesine olanak tanır.Bu prosedür uygulanırken, odacıkların doğru miktarda besinle doldurulması ve agarro'nun doğru hareketlerinin sağlanması önemlidir. Bu videoyu izledikten sonra, sea elegance'ın çeşitli yaşam evrelerinde aros mikro odacık görüntülemesinin nasıl kullanılacağı konusunda iyi bir anlayışa sahip olmalısınız.

agarose-microchambers-for-long-term-calcium-imaging-caenorhabditis

Research

JoVE Journal

Neuroscience

Sinirbilim

Bu video, kalsiyum görüntülemenin arkasındaki kavramları tanıtır ve kalıplanmış agaroz kuyularında bulunan solucanların hızlandırılmış görüntülemesi için örnek bir protokol içerir.

Kalsiyum Görüntüleme: Canlı C. elegans'ta Nöral Aktiviteyi Görselleştirmek İçin Bir Yöntem

Bu video, genetik olarak kodlanmış floresan raportör proteinleri kullanarak Caenorhabditis elegans gibi davranan bireysel nöronlarda kalsiyum görüntüleme tekniğini göstermektedir. Hücre içi kalsiyum seviyelerini nöronal aktivite ve yumurtlama sırasındaki davranış değişiklikleri ile ilişkilendirmek için solucan hareketinin görüntülenmesinde ve nöronlardan gelen raportör floresan oranlarının ölçülmesinde yer alan adımları ana hatlarıyla belirtir.

Caenorhabditis elegans'ta Yumurtlama Davranışını Düzenleyen Bireysel Nöronlarda Kalsiyum Görüntüleme

Kaynak: Doser, R., et al. Nöronal Kalsiyum İşleminin In Vivo Hücre Altı Görüntülenmesi. J. Vis. Uzm. (2023)Bu video, transgenik Caenorhabditis elegans suşlarının ventral sinir kordonu nöronlarındaki hücre altı kalsiyum akışının in vivo görüntülemesini göstermektedir. İki farklı kalsiyum indikatörü kullanılır: bir suşta bir sitoplazmik indikatör ve diğerinde bir mitokondriyal indikatör kullanılır. Nöronlar, nöronal sitoplazma ve mitokondri içindeki floresan yoğunluğundaki gerçek zamanlı...

Caenorhabditis elegans Nöronlarında Hücre Altı Kalsiyum Dinamiğinin Görüntülenmesi

Onun küçük şeffaf gövde, iyi belgelenmiş nöroanatomi ve müsait genetik teknikler ve reaktiflerin bir dizi...

C. vivo Nöronal Kalsiyum Imaging&#39;de elegans

Bu iletişim kuralı Caenorhabditis elegans solucanlar davranışlar içinde sinirsel aktivite içinde genetik olarak kodlanmış Ca2 + gazetecilere kayıt değişiklikleri açıklar.

Ratiometric kalsiyum görüntüleme Caenorhabditis Elegans davranışlar içinde bireysel nöronların

Bu makalede, biz bireysel Worms özel mikrosıvısal aygıt istihdam canlı görüntüleme göstermek. Cihazda, birden çok solucanlar chambers, çeşitli biyolojik süreçlerin çoğaltılmış boyuna gözetim sağlayan ayrı ayrı ayrı sınırlı.

Boyuna Imaging'de Caenorhabditis elegans için bir mikrosıvısal Platform

Bu yöntem çift optogenetik ve genetik olarak kodlanmış kalsiyum sensörleri görüntü bazal sitosolik kalsiyum düzeyleri ve model organizma C. elegansvücut duvarı kasları uyarılmış kalsiyum geçici değişiklikler için bir yol sağlar.

In Vivo Kalsiyum Görüntüleme C. elegans Vücut Duvar Kasları

Burada iyi kontrol edilen, lokalize olmayan titreşime sahip serbestçe davranan Caenorhabditis elegans'ta kalsiyum görüntüleme için bir sistem bildirilmiştir. Bu sistem, araştırmacıların nano ölçekli yer değiştirmede iyi kontrol edilen özelliklere sahip lokalize olmayan titreşimleri uyandırmalarını ve C. elegans'ın titreşimlere tepkileri sırasında kalsiyum akımlarını ölçmelerini sağlar.

İyi Kontrollü, Lokalize Olmayan Titreşimli Serbest Davranan Caenorhabditis elegans'ta Kalsiyum Görüntüleme

Protokol, 36 saate kadar sürekli bir gıda arzı varlığında C. elegans yetiştirmek için kullanılan basit bir mikroakışkan çip tasarımını ve mikrofabrikasyon metodolojisini açıklamaktadır. Büyüme ve görüntüleme cihazı ayrıca, birkaç gün boyunca geliştirme sırasında hücresel ve hücre altı süreçlerin aralıklı uzun süreli yüksek çözünürlüklü görüntülenmesini sağlar.

Caenorhabditis elegans'ın Uzun Süreli Büyümesi ve Görüntülenmesi için Basit Bir Mikroakışkan Çip

Mevcut yöntemler, kolayca bulunabilen genetik olarak kodlanmış kalsiyum göstergelerini kullanarak Caenorhabditis elegans'ta in vivo olarak yüksek çözünürlüklü, sub-kompartmanlı kalsiyum görüntüleme için orantılı olmayan bir yaklaşımı tanımlamaktadır.

Nöronal Kalsiyum Kullanımının In Vivo Subsellüler Görüntülemesi

Burada, model nematod C. elegans'ın germ hattında eksprese edilen genetik olarak kodlanmış bir kalsiyum raportörü kullanarak döllenme ve erken embriyogenez sırasında kalsiyumu görselleştirmek için protokoller ve araçlar sunuyoruz.

C. elegans'ta Döllenme ve Erken Gelişim Sırasında Kalsiyum Geçişlerinin İn Vivo Olarak Görüntülenmesi

Öğrenin Caenorhabditis elegans'ta davranış ve sinir aktivitesini agaroz mikroakışkan odacıklarla uzun süreli kalsiyum görüntüleme yöntemiyle izlemeyi. Bu teknik gelişimsel değişiklikleri yüksek kaliteli görüntüleme ile takip eder.

Uzun süreli Kalsiyum Görüntüleme için Agaroz microchambers

Daha fazla video keşfet