Name: İnşaat ve İkili veya Üçlü Amonyum trifenilasetatlar ile Supramoleküler Kümeleri Bir Seri Sistematik Simetrik Çalışmaları (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-02-15T13:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 35 s
Description: Keşfedin hidrojen bağlı supramoleküler kümelerin kristallerde seçici yapılandırılmasını ve simetrik özelliklerinin karakterizasyonunu. Bu yöntem, bileşen yapılarından süpermoleküllerin simetrisini öngörme yeteneği ile supramoleküler kimyada ileri düzeyde çalışmalara olanak tanır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma, MEXT ve JSPS, Japonya'dan Bilimsel Araştırma için Yardım Hibesi (24350072, 25288036) ve Yenilikçi Alanlarda Bilimsel Araştırma için Yardım Hibesi (24108723) tarafından mali olarak desteklenmiştir. TS, JSPS Fellows (25763), Osaka Üniversitesi GCOE Programı ve Mükemmel Lisansüstü Okullar için Hibeler, MEXT, Japonya'yı kabul eder.

İlköğretim Amonyum trifenilasetatlar oluşan Tek Kristallerinin 1. Hazırlık <ol><li> Organik tuzlar, primer amonyum trifenilasetatlar (Şekil 1a) hazırlayın. <ol><li> Trifenilasetik asit (TPAA, 0.10 g, 0.35 mmol) ve primer amin çözülür: n-butilamin (n Bu, 2.5 x 10 2 g, 0.35 mmol) izobutilamin (isoBu, 2.5 x 10 2 g, 0.35 mmol), t -butilamin, veya metanol içinde bir araya t -amylamine (t Am, 3.0 x 10 2 g, 0.35 mmol), (20 mi) TPAA bölgesindeki (bu, 2.5 x 10 2 g, 0.35 mmol t): amini = 1: ikili organik tuzların hazırlanması için, 1 mol oranı. </li><li> Üçlü organik tuzların durumunda, TPAA (0.10 g, 0.35 mmol) ve birincil aminlerin iki çeşit çözülür: n Bu (1.3 x 10 2 g, 0.17 mmol) - tBu (1.3 x 10 2 g, 0.17 mmol ) n Bu (1.3 x 10 2 g, 0.17 mmol) - t Am (1.5 x 10 2 g, 0.17 mmol), izoBu (1.3 x 10 2 g, 0.17 mmol) - tBu (1.3 x 10 2 g, 0.17 mmol), ve isoBu (1.3 x 10 2 g, 0.17 mmol) - t Am (1.5 x 10 2 g , 0.17 mmol), birlikte, metanol TPAA (20 mi) &#39;de: amin 1: amin-2 = 2: 1: 1 arasındadır. </li><li> Organik tuzlar verecek şekilde döner buharlaştırıcılar (40 ° C, 200 Torr) tarafından tüm çözümleri buharlaştırılmakta: TPAA- n Bu, TPAA-isoBu, TPAA- t Bu, TPAA- t Am TPAA- n Bu- t Bu, TPAA- Bu- t Am, TPAA-isoBu- t Bu ve TPAA-isoBu- t Am n. </li></ol></li><li> supramoleküler kümelerin oluşan tek kristalleri hazırlayın. <ol><li> supramoleküler kümeleri, tercihan, polar olmayan ortamda inşa edilir, çünkü, seçilen bir polar olmayan iyi bir çözücü olarak toluen içinde, bir cam şişe içinde, organik tuzlar (5.0 mg) (0.30 mi), her çözündürülür. Organik tuzlar TPAA- t Bu, TPAA- t Am, TPAA-isoBu- t Bu ve TPAA-isoBu- t Am ısı toluen kadar t40 ° C o bunları çözmek için. </li><li> Heksan ekleyin: 0.5 ml, 0.5 mL, 0.5 mL, 2 mL, 2 mL, 1 mL, 0.5 mL, TPAA- n bu, TPAA-isoBu, TPAA- t Am TPAA- n organik tuzların çözeltiye Bu- t Bu, TPAA- n Bu - t Am TPAA-isoBu- t Bu ve TPAA-isoBu- t Am sırasıyla organik tuz çözeltisi haricinde organik tuzunun çözünürlüğünü azaltmak için zayıf bir çözücü olarak TPAA- t Bu. </li><li> Bir gün içinde, tek kristaller elde edilir, bir cam şişe içinde oda sıcaklığında çözelti, bir arada tutabilmek. </li></ol></li><li> Fourier organik tuz oluşumu kızılötesi (FT-IR) spektrumları 35,36 dönüşümü onaylayın. <ol><li> 1 potasyum bromür (KBr) organik bir tuzunun, tek kristaller karıştırılır: 100 ağırlık oranı. </li><li> homojen toz karışım haline gelene kadar bir agat havanda karışımı öğütmek. </li><li> yuvarlak kalıp (çap: 5 mm) doldurmak toz karışımı ile ve p bir pelet yapmakBir pelet basın ile basım ile. </li><li> Bir FT-IR spektrometresi içine pelet koyun ve ölçümleri gerçekleştirmek (kümülatif sayısı: 16, çözünürlük: 1 cm-1). </li></ol></li></ol> 2. Kristalografik Çalışmaları <ol><li> Bir cam plaka üzerine parafin içine şişeyi camdan organik tuz TPAA- t Am yüksek kaliteli tek kristal Pick up. kristal kristal birden kristaller ancak tek kristal meclisleri değil yani, bir stereomikroskop altında üniforma görünüyor ve çatlak olmadan 0,3 ila 1 mm çapında bir kristal boyutu vardır. </li><li> Bir döngü tek kristal koyun. </li><li> Tek kristal X-ışını kırınım ekipman tek kristali ile döngü ayarlayın. </li><li> Bir kolimatör seçin: 0.3, 0.5, 0.8 ya da 1 mm, tek kristal maksimum boyutuna bağlı olarak değişebilir. </li><li> Tek c kullanarak tek kristal X-ışını kırınım desenleri 37,38 toplamak için tek kristal X ışını kırınımının bir hazırlık ölçümü başlatmarystal X-ışını kırınım donanımı (radyasyon kaynağı: grafit monokrome Cu K α (λ = 1,54187 A), pozlama süresi: kristal boyutuna göre 30 sn (belirlemek), dedektör: örneğin görüntüleme plaka, kristal-dedektör mesafesi: 127,40 mm, sıcaklık: 213.1 K, kare sayısı: 3). </li><li> Mümkün kristal parametreleri belirlemek ve koşulları ayarlayın: Yukarıdaki hazırlık ölçüm sonucuna göre ölçümü aşağıdaki için, kare ω, χ ve φ ve sayı: pozlama süresi, X-ışını maruziyeti açıları. </li><li> (Koşullar altında tek bir kristal X-ışını kırınım ekipmanı kullanılarak, tek kristallerden 37,38 X-ışını kırınım desenleri toplamak için radyasyon kaynağı tek bir kristal X ışını kırınımı düzenli bir ölçümü başlatma: grafit, Cu vektörünün monokrome (λ = 1,54187 Å), dedektör: örneğin görüntüleme plaka, kristal-dedektör distAnce: 127,40 mm, sıcaklık: 213.1 K). </li><li> Doğrudan yöntemlerle SIR2004 39 veya SHELXS97 40 difraksiyon &#39;den bir kristal yapısını çözmek ve F2 dayalı tüm gözlenen yansıma kullanılarak tam matrisli en küçük kareler prosedürünü ölçütü. anizotropik yer değiştirme parametreleri ile bütün hidrojen olmayan atomuna rafine etmek ve bağlanan hidrojen olmayan atomuna göre ve rafine izotropik yer değiştirme parametreleri ile idealize edilmiş pozisyonlarda hidrojen atomlarını yerleştirin. Böyle CrystalStructure 41 gibi bir yazılım kullanarak bu hesaplamaları gerçekleştirmek. </li><li> Χ, ω ve φ ve kare sayısı: collimator boyutu, hazırlık ölçümler ve düzenli ölçümler için X-ray pozlama süresi ve X-ray pozlama açıları: adımlar, bazı koşullar değişikliklerle 2.8 2.1 den prosedürleri tekrarlayın organik tuzların tek kristaller için: TPAA- n Bu- t Bu, TPAA- n Bu- &lt;em&gt; t Am, TPAA-isoBu- t Bu ve TPAA-isoBu- t Am kristal yapılar ortaya çıkarmak için. </li><li> TPAA- n Bu (refcode: MIBTOH) organik tuzların kristal yapılarını Al 22 TPAA-isoBu (refcode: GIVFEX) 24 ve TPAA- t Bu (refcode: GIVFIB) bir yazılım kullanılarak Cambridge Yapısal Veri 42 23, fetih 43, ya da bir istek formu 44. </li><li> Böyle Mercury 45-48 ve pirol 49 gibi yazılımları kullanarak bilgisayar grafikleri ile kristal yapılarda supramoleküler kümeleri araştırmak; Daha önce sınıflandırılmış olanlar (Şekil 1b) ve l veya ö (Şekil 1a) olarak tritil grupları kiral yerleşimleriyle elde edilen desen karşılaştırarak supramoleküler kümeler halinde hidrojen bağlayıcı desen noktası grup simetri belirleyin. </li><li> kristal yapılarının her supramoleküler kümelerin polihedral özelliklerini karakterizeorganik tuzların. <ol><li> bileşen karboksilat anyon ve amonyum katyonların karbon ve nitrojen atomları hariç supramoleküler kümeler atomların hepsi silin. </li><li> Orijinal karboksilat ve amonyum katyonları, hidrojen bağları ile bağlı olduğu karbon ve nitrojen atomları arasındaki bağları olun. </li><li> Karbon-karbon ve azot-azot atomu ve daha fazla bağları (Bu çalışmada, sırasıyla karbon-karbon ve azot-azot mesafeler, 5.3 ve 4.1), yapmak için sınırları arasında mesafe ölçülür. </li><li> mesafeleri sırasıyla en az 5.4 ve 4.2 olan karbon-karbon ve azot-azot atomları arasında başka bağlar sağlayın. </li><li> Organik tuzların sonuçtaki çokyüzlüleri belirlenmesi: TPAA-isoBu, TPAA- t Bu, TPAA- t Am TPAA-isoBu- t Bu ve TPAA-isoBu- t Am, trans -bicapped oktahedron olarak (t BO), üçgen dodecahedron (td) göz önüne alınarak, sırasıyla, td, td ve td,g dönme ekseni (C3 ya da Cı-2) yanı sıra, Çokyüzlülerde iki sayısı. </li><li> Supramolecular kümeler halinde taraftan, simetri elemanları ve moleküller arası etkileşimlerin sayısını dikkate alınarak TPAA- n Ayşe, TPAA- n Bu- t Ayşe ve TPAA- n Bu- t Am: organik tuzların sonuçlanan polihedronlarına ek bağları yapmak td, t bo, ve kare antiprizma (sa): onlar İdeal olanlardan daha az tarafı var çünkü. </li><li> Nedeniyle C 2 simetri ve 14 orijinal tahvil iki ilave bağları yaparak sa olarak TPAA- n Bu tuz çokyüzlüler belirleyin. Bu- t Bu ve TPAA- n Bu- t Am n td olarak C 2 simetri ve supramoleküler küme etrafında tritil grupları &quot;bantları&quot; dayalı TPAA- organik tuzların diğer çokyüzlüleri belirleyin. Yani, üçlü organik tuzların supramoleküler kümelerde tritil grupları oluştururlar4; onların üç fenil halkasını ve polihedron TD birbirine geçmesi grupları &quot;, dört asitleri (Şekil 1c, (ii)), yani, benzer yapısal özelliklere sahip bağlantı tarafı vardır. </li></ol></li></ol>

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.

Kapalı hidrojen bağlayıcı ağları ile supramoleküler kümelerin bir dizi başarıyla inşa edilmiş ve bir tritil grubuna sahip TPAA, ve çeşitli ve birincil aminler kombinasyonlarının organik tuzlar kullanılarak kiralite bakış açıları ve çok yüzlü özelliklerden karakterize edildi. Bu yöntemde, kritik adımlar polar olmayan çözücülerden molekül ve karşı iyon oluşan organik tuzların hacimli tritil grubu ve yeniden kristalleştirme ile bir molekülün bir giriş vardır. supramoleküler kümesinin bir ters-misel yapısı vardır, çünkü bu,...

Supramoleküller gibi supramoleküler mimarileri yapı olarak kendilerine özgü işlevlerinin etkileyici ve önemli araştırma hedefi, iyonlar ve / veya molekülleri ve şiral ayrılmaların algılama esnek kovalent olmayan bağlar 1-11 kullanılarak moleküler tanıma yetenekleri kaynaklanmıştır. Moleküler tanınma sürecinde, supramoleküler meclislerinin simetri en önemli faktörlerden biridir. önemine rağmen, bu rakam ve bileşenlerin türlü yanı sıra açıları ve kovalent olmayan bağların mesafelerde esnekliği nedeniyle istenen simetrileri ile Supramoleküller tasarlamak hala zor. sistematik çalışmalara dayanarak Supramoleküller ve bileşenlerinin simetrilerinin arasındaki korelasyon netleştirilmesi istenen Supramoleküller yapımını gerçekleştirmek için yararlı bir stratejidir. bu bileşenler arasında, sınırlı sayıda oluşur, bu amaçla, supramoleküler kümeleri araştırma hedefleri olarak seçilend teorik 12-14 değerlendirilebilir vardır. Ancak, metal kompleksleri aksine, supramoleküler yapılar 15,16 sürdürülmesi nedeniyle kovalent olmayan bağların düşük istikrar supramoleküler kümeleri oluşturarak raporların sınırlı sayıda vardır. Bu düşük istikrar da yapıların aynı çeşit var supramoleküler meclisleri bir dizi elde bir sorun haline gelir. Bu çalışmada, en güçlü kovalent olmayan bağlar 17-20 bir organik tuzların yükü destekli hidrojen bağları, esas olarak, belirli supramoleküler montajları, tercihen 21-32 oluşturmak için kullanılır. Organik tuzlar, asitler ve bazlar ve organik tuzların ve böylece bir çok çeşit oluşan kolayca sadece asitlerin ve bazların farklı kombinasyonları karıştırılması ile elde edilir bu da dikkat çekicidir. karşı iyonların çeşitli ile bir komponentin kombinasyonları supramo aynı tip neden olduğundan, özellikle, organik tuzlar sistematik çalışmalar için yararlıMolecular meclisleri. Nedenle, bu, karşı iyon çeşitleri göre supramoleküler birleşmelerin yapısal farkları karşılaştırmak mümkündür. Önceki çalışmalarda, (0-D) 0-boyutlu 1-boyutlu (1-D), ve 2-boyutlu ile Supramoleküller (2-D) Birincil amonyum karboksilatlar tarafından hidrojen bağlayıcı ağları teyit ve kiralite bir bakış açısıyla karakterize edildi 32. Bu çok boyutlu Supramoleküller kendi boyutluluk istismar önemli araştırma hiyerarşik kristal tasarım 27 hedefler yanı sıra uygulamalardır. Buna ek olarak, hidrojen bağlayıcı ağ karakterizasyonu için, bütün amino asitlerin, biyolojik moleküllerin rolleri hakkında önemli bilgiler verecek amonyum ve karboksilik grupları vardır. Bu Supramoleküller elde etmek için yönergeleri sağlanması ayrı ayrı uygulamalarda onlara daha fazla fırsat verir. Bu Supramoleküller ise, 0-D hidrojen bağlayıcı ağları ile supramoleküler kümelerin inşaat göreceli olarak azdırZor y istatistiksel çalışmada 28 gösterildiği gibi. Bununla birlikte, supramoleküler kümeler oluşturmak için faktörlerin açıklama sonra, seçici olarak inşa edilmiş ve supramoleküler kümelerin bir dizi 21-25,32 elde edildi. Bu çalışmalar mümkün supramoleküler kümelerin bileşeni bağımlı simetrik özelliklerini açıklamak supramoleküler kümeleri sistematik simetrik çalışma yapılması olun. Bu amaç için, birincil amonyum trifenilasetatlar arasında supramoleküler kümeleri ilginç özelliklere sahip, yani bunların simetrik özelliklerin yanı sıra, bileşen tritil grupları şiral konformasyona (Şekil 1a yansıtacak hidrojen bağlayıcı ağları 24,32 kendi topolojik çeşitli ve 1b). şeytanlar burada birincil amonyum trifenilasetatlar kullanarak supramoleküler kümelerin bir dizi oluşturmak için ve supramoleküler kümelerin simetrik özelliklerini karakterize etmek için metodolojileri vardırtrated. supramoleküler kümeleri yapımı için anahtarları polar olmayan çözücüler, organik tuzların büyük tritil gruplarının eklenmesi ve yeniden kristalizasyon. İkili ve üçlü primer amonyum trifenilasetatlar supramoleküler kümelerin inşası için hazırlanmıştır. Hidrojen bağlayıcı ağlar 24,32, topografyaları tritil grupları 33,34 arasında (konformasyonları) ve octacoordinated çokyüzeylilerin 12 (Şekil 1c) analogları gibi moleküler düzenlemeleri arasında topolojileri açılarından kristallografik araştırmalar, supramoleküler kümelerin bileşeni bağımlı simetrik özelliklerini ortaya 25.

<table><tbody><tr><td>Trifenilasetik asit</td><td>Aldrich</td><td>T81205-10G</td><td></td></tr><tr><td>n-Butilamin</td><td>TCI</td><td>B0707</td><td></td></tr><tr><td>İzobetilamin</td><td>TCI</td><td>I0095</td><td></td></tr><tr><td>tert-Butilamin</td><td>TCI</td><td>B0709</td><td></td></tr><tr><td>tert-Amilamin</td><td>TCI</td><td>A1002</td><td></td></tr><tr><td>Metanol</td><td>Wako</td><td>131-01826</td><td>tehlikeli madde</td></tr><tr><td>Toluene</td><td>Wako</td><td>204-01866</td><td>tehlikeli madde</td></tr><tr><td>Hexane</td><td>Wako</td><td>085-00416</td><td></td></tr><tr><td>KBr</td><td>Wako</td><td>165-17111</td><td></td></tr></tbody></table>

İnşaat ve İkili veya Üçlü amonyum trifenilasetatlar ile supramoleküler kümeleri bir seri sistematik simetrik Çalışmaları

Construction and Systematical Symmetric Studies of a Series of Supramolecular Clusters with Binary or Ternary Ammonium Triphenylacetates

nano veya alt nano ölçekte kümelerin Fonksiyonları önemli ölçüde bileşenlerin sadece kendi bileşenleri türlü değil, aynı zamanda düzenlemeler, ya da simetri bağlıdır. Bu nedenle, kümelerdeki düzenlemeler tam olarak özellikle metal kompleksleri için, karakterize edilmiştir. Bunun aksine, organik moleküllerin oluşan supramoleküler kümelerde moleküler düzenlemelerin karakterizasyonu bazı durumlarda sınırlıdır. Özellikle supramoleküler kümeleri bir dizi elde supramoleküler kümeleri, inşaat nedeniyle tahvil kovalent karşılaştırmak kovalent olmayan bağların düşük istikrarı zor olmasıdır. Bu bakış açısından, organik tuzların kullanımı en yararlı yöntemlerden biridir. Supramoleküller bir dizi çeşitli karşı iyon olan belirli organik molekülün kombinasyonları ile imal edilebilir. Özellikle, primer amonyum karboksilatlar karboksilik asitlerin çeşitli için Supramoleküller tipik örnekleri olarak uygundurlarve primer aminler ticari olarak temin edilebilir, ve bunların kombinasyonları değiştirmek kolaydır. Daha önce, bu primer amonyum trifenilasetatlar özellikle polar olmayan çözücüler elde edilen kristaller, şarj destekli hidrojen bağları ile bir araya dört amonyumlar dört trifenilasetatlar oluşan supramoleküler kümeleri, yapı birincil aminlerin çeşitli kullanılarak gösterilmiştir. Bu çalışma, moleküler Supramoleküller düzenlemeler ve çeşitleri ve bunların bileşenleri sayıları arasındaki korelasyon açıklama sistematik simetrik çalışma yapılması için bir strateji olarak supramoleküler kümelenmelerin özel yapım bir uygulama göstermektedir. İkili trifenilasetatlar oluşan tuz ve birincil amonyumlar bir tür, trifenilasetatlar oluşan üçlü organik tuzlar ve amonyumlar iki çeşit ile aynı şekilde bileşenlerin çeşitli ve numaraları ile supramoleküler kümelerin bir dizi karşılayabilme, supramoleküler kümeleri oluşturmak.

TPAA ve primer aminlerin organik tuz oluşumu FT-IR ölçümleri ile teyit edildi. organik tuzların kristal yapıları, tek kristal X ışını difraksiyon ölçümleri ile analiz edilmiştir. Bunun bir sonucu olarak, dört amonyumlar ve şarj destekli hidrojen bağları (Şekil 1a) dört trifenilasetatlar oluşan supramoleküler kümeleri, aynı türde, çeşitleri ve sayısı ne olursa olsun, organik tuzların tek kristaller tüm doğrulanmıştır bileşeni amonyum (Tablo 1, Şek...

Bu makale, polar olmayan çözücülerden yeniden kristalize edilen birincil amonyum trifenilasetatlar kullanılarak kristallerde bir dizi hidrojen bağlayıcı supramoleküler kümenin inşasını açıklamaktadır. Supramoleküler kümelerin bu seçici yapısı, supramoleküler kümeler ve bileşenleri arasındaki korelasyon hakkında etkili sistematik simetrik çalışmalara yol açar.

İnşaat ve İkili veya Üçlü Amonyum trifenilasetatlar ile Supramoleküler Kümeleri Bir Seri Sistematik Simetrik Çalışmaları

Functions of clusters in nano or sub-nano scale significantly depend on not only kinds of their components but also arrangements, or symmetry, of their ...

Bu deneyin genel amacı, seçici bir şekilde benzersiz süper moleküler kümeler oluşturmak ve bunların simetrik özelliklerini karakterize etmektir. Bu yöntem, belirli simetriye sahip süper moleküllerin tasarlanması gibi süper moleküler kimyanın karşı karşıya olduğu temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Bu tekniğin temel avantajı, herhangi bir süper molekülün yapısının veya simetrisinin, bileşenlerinin yapılarından öngörülebilir olmasıdır.İkili organik tuzlar hazırlamak için, trifenilasetik asit veya TPAA ile primer amini (n-butilamin, izobutilamin, t-butilamin veya t-amilamin), bir ila bir TPAA/amin molar oranında 20 mililitre metanol içinde birlikte çözün. Üçlü organik tuzların hazırlanmasıyla ilgili detaylar için metin protokolüne bakınız. Tüm çözeltileri döner buharlaştırıcılar ile evaporate ederek organik tuzları elde edin.Süper moleküler kümelerden oluşan tek kristaller hazırlamak için, organik tuzların her birinden 5.0 mg'ı, polar olmayan iyi bir çözücü olarak 0.30 mL toluen içinde bir cam şişede çözün. Süper moleküler kümelerin tercihen polar olmayan bir ortamda oluşması nedeniyle toluen seçilmiştir. Organik tuzları çözmek için tolueni 40 °C'ye kadar ısıtın.TPAA t-bütilamin organik tuz çözeltisi hariç, diğer organik tuz çözeltilerine, organik tuzun çözünürlüğünü azaltmak için kötü bir çözücü olarak heksan ekleyin. Çözeltiyi cam şişe içerisinde oda sıcaklığında sabit tutarak bir gün içerisinde tek kristaller elde edin. Metin protokolünde açıklandığı üzere, organik tuz oluşumunu doğrulamak için Fourier dönüşümlü kızılötesi spektrumlarını ölçün.Stereomikroskop altında homojen görünen, çatlakları olmayan, yaklaşık 0,3 ila 1 mm boyutunda, yüksek kaliteli bir TPAA t-amilamin organik tuz tek kristali seçin. Homojen bir kristal, birden fazla kristalin birleşimi değil, tek bir kristaldir. Kristali cam şişeden alarak cam plaka üzerindeki parafine aktarın.Tek kristali bir loop üzerine yerleştirin. Tek kristalin bulunduğu loop'u tek kristal X-ışını kırınımı cihazına yerleştirin. Metin protokolünde açıklandığı şekilde, tek kristal X-ışını kırınımı cihazını kullanarak X-ışını kırınımı desenlerini toplamak için tek kristal X-ışını kırınımı ön ölçümlerini başlatın.Ardından, metin protokolünde açıklandığı şekilde tek kristal x-ışını kırınımı ekipmanını kullanarak benzer x-ışını kırınımı desenlerini toplamak için düzenli tek kristal x-ışını kırınımı ölçümüne başlayın. Kristal yapısını metin protokolünde açıklandığı şekilde çözdükten sonra, Mercury yazılımını kullanarak bilgisayar grafikleri aracılığıyla kristal yapılardaki süper moleküler kümeleri inceleyin. Elde edilen desenleri daha önce sınıflandırılmış olanlarla karşılaştırarak süper moleküler kümelerdeki hidrojen bağı desenlerinin nokta grup simetrilerini belirleyin.Organik tuzların her bir kristal yapısındaki süper moleküler kümelerin polihedral özelliklerini karakterize edin. Öncelikle, süper moleküler kümelerdeki bileşen karboksilat anyonlarının ve amonyum katyonlarının karbon ve azot atomları dışındaki tüm atomları silin. Ardından, Pimal Yazılımı kullanarak orijinal karboksilat ve amonyum katyonlarının hidrojen bağlarıyla bağlı olduğu karbon ve azot atomları arasında bağlar oluşturun.Karbon-karbon ve azot-azot atomları arasındaki mesafeleri ölçün ve yeni bağlar kurmak için sınırlar belirleyin. Mesafeleri 5.4 angstrom'dan küçük olan karbon-karbon atomları ve mesafeleri 4.2 angstrom'dan küçük olan azot-azot atomları arasında yeni bağlar kurun. Polihidronun kenar sayısının yanı sıra dönme eksenini de göz önünde bulundurarak organik tuzlardan kaynaklanan sonuç polihidronları belirleyin.Burada, TPAA izobütilamin trans iki kapaklı bir oktahedron oluştururken; TPAA t-bütilamin, TPAA amilamin, TPAA izobütilamin t-bütilamin ve TPAA izobütilamin t-amilamin üçgen dodekahedronlar oluşturur. Süper moleküler kümelerdeki kenar sayısı, simetri elemanları ve moleküller arası etkileşimleri göz önünde bulundurarak, organik tuzlardan kaynaklanan sonuç polihedronlara ek bağlar ekleyin. TPAA n-bütilamin tuzunun polihedronunu, C-2 simetrisi ve 14 orijinal bağı nedeniyle iki ek bağ oluşturarak kare antiprizma olarak belirleyin.TPAA n bütilamin t-bütilamin ve TPAA n bütilamin t-amilamin organik tuzlarının diğer polihedronlarını, C-2 simetrileri ve süpermoleküler küme etrafındaki trityl grubu bantlarına dayanarak üçgen dodekaedron olarak belirleyin. Tek kristal X-ışını analizinin temsili sonuçları burada gösterilmiştir. Süpermoleküler kümeler üzerindeki simetri analizi, bunların yapısal özelliklerinin sekiz koordinasyonlu polihedronların analogları olduğunu ortaya koymaktadır.Bu videoyu izledikten sonra, süper moleküllerin simetri açısından nasıl karakterize edileceği konusunda iyi bir anlayışa sahip olmalısınız.

construction-systematical-symmetric-studies-series-supramolecular

Research

JoVE Journal

Chemistry

Kimya

Bu deneyin amacı, belirlemek ve su içerisinde kendi kendine monte diskotik amfifiler büyüklüğü, şekli ve stabilite kontrol etmektir. Su bazlı supramoleküler polimerler için bu kontrol seviyesi çok zordur. Biz itici ve çekici etkileşimleri hem kullanarak bir strateji uygulamak. Bu sistem karakterize etmek için uygulanan deney yöntemleri genel olarak uygulanabilir.

Su Supramoleküler Polimerlerin Boyut, Şekil ve Stabilite Kontrolü

Bu çalışma, kendi kendine düzeneğinin kendiliğinden işlemi ile yüksek sıralı peptit bazlı yapıların oluşumunu tarif eder. Yöntem, ticari olarak temin edilebilen ve bilinen peptidler laboratuar ekipmanları kullanır. Bu teknik, peptidlerin büyük bir çeşitlilik uygulanabilir ve yeni peptid-bazlı düzeneklerinin keşfine yol açabilir.

Kısa Peptidlerinin Self-meclisi tarafından Sıralı Biyomoleküler Yapıların Oluşumu

Supramoleküler kısımlarla kaplanmış kolloidlerin sentezi ve karakterizasyonu için bir protokol açıklanmıştır. Bu supramoleküler kolloidler, yüzeye sabitlenmiş moleküller arasındaki hidrojen bağlarının UV ışığı ile aktivasyonu üzerine kendi kendine birleşir.

Supramoleküler Kolloidlerin Sentezi ve Karakterizasyonu

Burada, biz hazırlamak ve ikincil yapılar görselleştirmek için bir protokol mevcut (örneğin, lifler, toroid mimariler ve nano-küreler) sarmal polikarbodiimidler türetilmiş. Her iki atomik kuvvet mikroskobu (AFM) ve taramalı elektron mikroskobu (SEM) ile karakterize morfoloji moleküler yapı, konsantrasyon ve seçim çözücü bağlı olduğu gösterilmiştir.

Sarmal polikarbodiimidden Kopolimer ve Bunların Triazole Türevleri elde edilen kendinden montaj morfolojileri

Mesogens, yeni bir tür sentezi için bir protokol tabanlı üzerinde halojen gümrüklü supramolecular anyon [CnFolmak üzere 2n + 1-I··· I··· -CnFolmak üzere 2n + 1]−, rapor.

Malzemeler molekülleri üzerinden: yeni iyonik sıvı kristaller halojen yoluyla mühendislik

Supramolecular protein derlemeler atomik çözünürlükte yüksek alaka nedeniyle çok önemli rolleri biyolojik olayları çeşitli yapılardır. Burada, biz bir protokol tarafından magic-açı katı hal Nükleer manyetik rezonans spektroskopisi (MAS SSNMR) iplik çözünmez ve kristal makromoleküllerin protein derlemeler üzerinde yüksek çözünürlüklü yapısal çalışmalar gerçekleştirmek için mevcut.

Atomik yapısal çalışmaların makromoleküllerin meclisleri tarafından katı hal Nükleer manyetik rezonans spektroskopisi

1,2-dithiolane sentezi için bir protokol peptid ve peptid kendinden montajlı kaynaklanan supramolecular yapıları karakterizasyonu değiştiren.

1,2-Dithiolane malzemelerin ve kendi kendine montaj peptidler değiştirilme tarihi

Bir protokol bilgi kodlanmış peptoid oligomers sentezi için ve dinamik kovalent reaktan çiftleri ve Lewis asidik nadir toprak olarak aminler ve aldehitler kullanarak moleküler merdivenler içine bu peptoidlerin dizi yönelimli kendini montaj için sunulmaktadır metal çok rol reaktifler olarak triflates.

Bilgi taşıyan Peptoidlerin sentezi ve Dizi yönelimli Dinamik Kovalent Öz-montaj

Zayıf bağlı moleküler kümelerin atmosferik konsantrasyonları, genetik algoritma ve yarı ampirik ve ab initio kuantum kimyası kullanan çok aşamalı konfigürasyonel örnekleme metodolojisi ile bulunan düşük enerjili yapıların termokimyasal özelliklerinden hesaplanabilir.

Ab initio Termochemistry'den Moleküler Kümelerin Atmosferik Konsantrasyonlarının Hesaplanması

Bu makalede, ilgili üçlü metal komplekslerinin ayrışmasının nispi termokimyasını ölçmek için elektrosprey-iyon hareketliliği-kütle spektrometrisi, yarı ampirik kuantum hesaplamaları ve enerji çözümlü eşik çarpışma kaynaklı ayrışma kullanan deneysel bir protokol açıklanmaktadır.

İyon Hareketliliği-Kütle Spektrometrisi Kullanılarak Ni(II) ve Zn(II) Üçlü Komplekslerinin Termokimyasal Çalışmaları

Kurucu DNA oligonükleotidlerinden başlayarak amfifilik DNA nanoyıldızlarından oluşan sentetik biyomoleküler kondensatların hazırlanması için bir protokol sunuyoruz. Kondensatlar, tek bir nanostar bileşeninden veya iki bileşenden üretilir ve gömülü bir DNA şablonundan RNA'nın in vitro transkripsiyonunu sürdürmek için modifiye edilir.

Amfifilik DNA Nanoyapılarından Sentetik Kondensatlar ve Hücre Benzeri Mimariler

Keşfedin hidrojen bağlı supramoleküler kümelerin kristallerde seçici yapılandırılmasını ve simetrik özelliklerinin karakterizasyonunu. Bu yöntem, bileşen yapılarından süpermoleküllerin simetrisini öngörme yeteneği ile supramoleküler kimyada ileri düzeyde çalışmalara olanak tanır.

İnşaat ve İkili veya Üçlü Amonyum trifenilasetatlar ile Supramoleküler Kümeleri Bir Seri Sistematik Simetrik Çalışmaları

Daha fazla video keşfet