Name: A Whole Dağı In Situ Hibridizasyon Yöntemi Lymnaea stagnalis (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-03-15T15:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 33 s
Description: Öğrenin, Lymnaea stagnalis embriyo ve larvalarında gen ifade desenlerini görselleştirmek için yüksek verimli dekapsülasyon ve whole mount in situ hibridizasyon yöntemini. Bu protokol, gelişim biyolojisi ve evo-devo araştırmalarında gen etkileşimlerini incelemeyi kolaylaştırır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma DFG projesi # JA2108 / 2-1 ile DJJ için fon tarafından desteklenmiştir.

NOT: Aşağıdaki adımlar L. embriyonik ve larva aşamaları situ deneyde bir iletken için bir yöntem özetlemektedir Bir adım, bu kelime &#39;DİKKAT&#39; ve tüm uygun güvenlik prosedürleri ile gösterilir tehlikeli kimyasal kullanımını içerir stagnalis. benimsenmelidir. Tehlikeli kimyasallar için temsili MSDS yaprak Linkler Ek Dosya 1&#39;de verilmiştir. Tüm reaktifler için Tarifler Ek Dosya 2&#39;de verilmektedir. Kapsülden çıkarma Aparatı 1. Meclis <ol><li> Bunu yapmak için, Şekil 2A&#39;da gösterildiği gibi, bir uygun uzunlukta bir P1,000 ucu kesilmiş kullanılarak (1 mm&#39;lik bir iç çap ve 3 mm arasında bir dış çapa sahip) silikon boru, bir 20 ml&#39;lik atılabilir bir şırınga bağlayın. </li><li> ters bir büyük Petri kabı standart bir mikroskop lamı bantlayın. Şekilde gösterildiği gibi bir mikroskop lamı hemen bitişik silikon boru bantlayın60, 2C ve 2D. </li><li> Mikroskop lamı üzerine çekilmiş bir cam iğne istirahat ve hafifçe iğnenin ucu boru iç çapı boyunca bir şekilde yaklaşık% 20 çıkana kadar silikon tüp içine yerleştirin (Şekil 2C ve 2D bakınız). İğne Petri kabı pozisyon bant aşağı getirildikten sonra. </li><li> silikon boru serbest ucu Decapsulated malzeme toplayacak bir Petri kabındaki dinlenmeye bırakın. </li></ol> 2. Örnek Toplama, Fiksasyon ve kapsülden çıkarma NOT: Aksi belirtilmedikçe tüm adımları, oda sıcaklığında gerçekleştirilmektedir. <ol><li> Dikkatle bir akvaryum duvarlarında yumurta dizeleri toplamak. Bunu yapmak için, substrat kapalı yumurta dize kazımak için bir spatula olarak esnek plastik düz bir parça kullanımı ve suyun dışında yüzen yumurta dize balık plastik çay süzgeci kullanın. Sahne ve Şekil sağlanan kılavuzunu kullanarak bir mikroskop altında malzeme sıralamak1. </li><li> Bir kağıt havlu üzerine yumurta dize yerleştirin ve tüy forseps kullanarak yumurta kütlesi boyunca uzunlamasına bir kesi yapmak. Yumurta dize dışında yumurta kapsüllerini rulo ve tüy forseps kullanarak kağıt havlu etrafında onları iterek, her kapsül mümkün olduğunca jöle malzeme kadar kaldırın. </li><li> tüy forseps kullanarak, musluk suyu 5 ml içeren bir Petri kabı içine yumurta kapsülleri aktarın. Bu yemeğin içine istenen gelişim evreleri de-jöleli yumurta kapsülleri toplamaya devam. Planlanan WMISH Deney daha sonra bir sonraki adıma geçin için tüm gelişim aşamalarında yeterince kapsüller toplayın. </li><li> daha gelişmiş larva çalışırken tespitin önce onları uyuşturan (5 gün ilk bölünme (dpfc) ve eski sonrası). NOT: Bu çok zor in situ boyanma yorumunu yapan taahhüt kasları önleyecektir. <ol><li> kendi capsu ise hala (larva Sakinönceden tespit için 30 dakika • 6H 2 O MgCl2% 2 w / v solüsyonda Les). </li><li> fiksatif çözüm kendi yumurta kapsüller içinde hala birkaç larva süre daldırarak ve mikroskop altında tepki izleyerek 30 dakika sonra gevşeme derecesini değerlendirmek. tamamen rahat larvaları yanıt vermez ise eksik rahat larvaları, kendi kabukları içine çekilecektir. Bu larvalar rahat edildikten sonra bir sonraki adıma geçin. </li></ol></li><li> Yumurta kapsül hacminin 10 katı sağlayan bir kapatılabilir bir tüp içine geniş delikli pipet ile yumurta kapsüller aktarın (örn., Yerleşmiş kapsüller 1 ml 10 + ml tüp gerektirir). </li><li> Aspire kadar borunun mümkün sıvı ve yerleşmiş yumurta kapsül hacmi 10 kat olan sabitleyici çözeltisinin bir hacmi ile değiştirin. Yavaşça her gelişim aşamasında (Şekil 1 e bakınız) için uygun bir süre için oda sıcaklığında sabitleyici yumurta kapsüller döndürün. </li><li> Discontinue rotasyon ve kapsüller lavabo ve uygun bir atık kabına fiksatif solüsyonu aspire izin verin. </li><li> 5 dakika boyunca oda sıcaklığında% 0.1 Tween-20 (PBTw) Fosfat Tamponlu Tuz çözeltisi sabitleyici değiştirilmesi ve döndürerek yumurta kapsüller yıkayın. PBTw aspire ve iki kez tekrarlayın. </li><li> Embriyoların ve aparatları kullanarak kapsüllerden larvaları çıkarın tüp aracılığıyla ve cam iğne dışarı içine geçmiş kapsül tüp takmak ve daha sonra gidermek. Şekil 2&#39;de gösterilmiştir (ayrıntılar için bakınız bölüm 1) 20 ml şırınga içine kapsül çizin toplama çanak. NOT: Normalde, her kapsül çoğunluğu (&gt;% 90) cihaz üzerinden tek bir geçiş gerekir gerekir. Birçok durumda kapsül zarı hasar, ancak embriyo ve larva rüptüre kapsülün içinde kalır. sadece şırınga içine hazırlanması ve tekrar dispelling bu malzemeyi yeniden işleyin. </li><li> bir mikrofon kullanarak bir 1.5 ml tüp içine decapsulated embriyolar ve larvaları toplayınropipette (0 için P20 - 3 gün eski larva, ve bahşiş sonunda yaşlı larva P200 kesti). NOT: Bu aşamada yapılabilir protokolde (birkaç ay kadar için) bir duraklama. Eğer bu gerekli ise, decapsuled malzemenin depolanması için 1.5 ml&#39;lik bir tüp (bir sonraki adıma) içine alınmalıdır. Aksi takdirde Protokolün 3 hemen devam ediyor. </li><li> Embriyolar ve larvalar tüpün dibine çöker ve süpernatant aspire izin verin. PBTw% 33 Etanol (EtOH) ile değiştirin ve 5 bekletin - 10 dk. PBTw% 66 EtOH ve% 100 EtOH ile tekrar edin. Oda sıcaklığında% 100 EtOH içinde iki kez larvaları yıkayın. % 100 EtOH içinde -20 ° C&#39;de malzemenin saklayın. </li><li> 10 dakika - hazır devam zaman, yeniden hidrat% 100 EtOH kaldırılması ve PBTw% 66 EtOH ile değiştirerek numuneler, 5 bekletin. 10 dakika - 5 bekletin, PBTw% 33 EtOH ile tekrarlayın. Son olarak, tüm EtOH kaldırılır sağlamak için PBTw 3x 5 dk yıkama ile yıkayın. </li></ol> 3. Proteinaz-K, TEA ve Post-fifiksasyon NOT: Biz hızlı bir şekilde zaman kritik çözümler alışverişi için bir örgü zemin ile en verimli ve nazik bir yöntem küçük sepetlerde aşağıdaki adımları uygulayarak bulabilirsiniz. Bu ev yapılabilir, biz INTAVIS InSituPro -Vsi sıvı taşıma robotu (www.intavis.de/products/automated-ish-and-ihc) ile uyumlu sepetleri (orta boy) kullanın. Bu sepet, hızlı ve kolay değişimi çözeltiler için bir 12 yuvalı doku kültürü çanağı (TCD) oyuklarına arasında hareket edebilir, veya çözelti de bir pipet kullanılarak aspire edilebilir. Alternatif olarak, tüm çözüm borsaları sadece larva süpernatant aspire bu sepet olmadan yapılabilir. Bu durumda, hafif bir girdap hareketi yüzer de kenarından kaldırılacak sağlayan çanağın merkezine tüm embriyolar ve larvaları yoğunlaşacaktır. Aşağıdaki kullanıcı çözüm alışverişi için sepetleri istihdam olduğunu varsayar. <ol><li> bir pipet kullanılarak, PBTw 2 ml ile 12 kuyu TCD oturan bir sepet içine embriyo transferi ve larva. NOT:. Eklenen gelişim aşamasına bağlıdır olabilir embriyoları ve / veya larva sayısı ancak başparmak genel bir kural embriyolar / larvaların (yani serbest taban alanı en az 25% muhafaza etmektir, araştırılmaktadır, yok ) sepeti fazla kalabalık. </li><li> Uygun proteinaz-K çözeltisi (Şekil 1 e bakınız), 2 ml, 2 mi% 0.2 glisin her biri başka bir 2 kuyucuklu de bitişik hazırlayın. Proteinaz-K iyi içeren uygun konsantrasyonda her bir sepet taşımak ve hemen zamanlama başlar. </li><li> 10 dakika sonra iyi olarak ihtiva eden% 0.2 Glisin her bir sepet taşımak ve 5 dakika için inkübe edilir. Daha sonra% 0.2 glisin ile ikinci oyuk her bir sepet taşımak ve 5 dakika için inkübe edilir. 3 ml PBTw 3x 5 dk alışverişi ile Glisin yıkayın. </li><li> PBTw çözüm çıkarın ve taze hazırlanmış Triethanolamine (TEA) sol ile bir kez numune tedavi5 dk DİKKAT Katkı! tahrik etmeyin. 5 dakika için taze hazırlanmış çay çözeltisine 3 ml değiştirin. karıştırılmaz. numune çay çözeltisine çoğunluğu aspire. Asetik Anhidrit (TEAAA) çözümü ile taze hazırlanmış trietanolamin ekleyin ve 5 dakika. DİKKAT boyunca inkübe! Tahrik etmeyin. </li><li> İSTEĞE BAĞLI - Yukarıdaki adım kuluçka iken, TEAAA çözümün başka taze bir parti hazırlamak ve yukarıdaki adımı tekrarlayın. Not: TEAAA bu ikinci tedavi isteğe bağlıdır ancak tamamen arka üretilmesi eğilimli problar tüm arka plan ortadan kaldırmak için yararlı olabilir. </li><li> kuyudan o aspire TEAAA çözeltisi çıkarın ve PBTw 3 ml ile değiştirin. karıştırılmaz. PBTw çıkarın ve PBTw içinde% 3.7 formaldehit 3 ml uygulanır. Yavaşça 30 dakika inkübasyon sırasında zaman zaman girdap. </li><li> kuyudan o aspire Fiksatif çıkarın ve PBTw 3 ml ile değiştirin. 1.5 ml tüp içine malzemeyi aktarın. Rhibridizasyon tampon maddesi ile PBTw eplace ve oda sıcaklığında 5 dakika inkübe - dikkatli olun. </li><li> Oda sıcaklığında sıcak bir blok içine tüpler yerleştirin ve istenen hibridizasyon sıcaklığı sıcaklığını ayarlamak. NOT: melezleme sıcaklığı belirli prob ve ampirik optimize edilmesi gerekecektir, ancak biz 55 ° C iyi bir sıcaklık başlangıçta deneme için buluyorum. Blok melezleme sıcaklığına gelmesi ve numuneler yaklaşık 15 dakika boyunca önceden melezleşme izin izin (yani, daha uzun, riboprobes hazırlamak için gereken süre gerekli değildir). Yeterli hacimleri seyreltilmiş riboprobes (normalde 100 ul) hazırlayın. Biz ilk aralık olarak 100 ve 500 ng / ml arasında, genellikle test prob konsantrasyonu. Biz 12&#39;ye göre riboprobes hazırlar. </li><li> örneklerden hibritleme tamponu çıkarın ve örnekleri hibridizasyon tamponu içinde probu ekleyin. 100 ul (ya da yeterli miktarda Overlay melezleştirme Buffe üzerinde bir faz oluşturmak içinr) Mineral yağ elde edilmiştir. NOT: Mineral yağ uzun hibridizasyon adımı sırasında oluşturacak kapsamlı yoğunlaşmayı önler. Kapsamlı yoğunlaşma önemli ölçüde hibridizasyon çözüm kimyasını ve prob konsantrasyonu hem de değiştirecektir. </li><li> prob ve 10 dakika boyunca 75 ° C&#39;ye kadar numunelerin ısıtılmasıyla hedef RNA&#39;yı denatüre, daha sonra arzu edilen melezleştirme sıcaklığına ısısını düşürür. (- 48 saat 24) melezleştirme 12 saat (O / N) ya da daha fazla en az devam etmesine izin verir. </li><li> melezleme sırasında, ısı bloğu tek bir tüp kaldırmak yağ fazının bozmadan larvaları askıya başparmak ve işaret parmağı arasında hızla döndürün ve ısı bloğu değiştirin. 12 saat ya da öylesine - bu kez her 6 tekrarlayın. </li></ol> 4. Sıcak Yıkayıcı ve İmmuno Not: aşağıdaki adımlar için bir sıvı kotarma robotu kullanımı da, bu da kolayca manuel olarak yapılabilir. Bu durumda, embriyolar ve larvalar ShoULD. onlar hibritlenmiştir 1.5 ml tüpler içinde tutulması Bütün takip eden çözelti, Değişimleri aspire edildi ve bir P1,000 pipet ile eklenir. elle yapıldığında aşağıdaki adımlardan her biri, her çözeltinin 1 ml istihdam etmelidir. <ol><li> Isı ile yeterli miktarda 4x, 2x (3 mi, her numune için her biri) ve hibridizasyon sıcaklığı 1x yıkama çözeltileri. </li><li> melezleştirme sıcaklığında 15 dakika her biri için tüm örnekler 4x yıkama tamponunda üç kez yıkayın. melezleştirme sıcaklığında 15 dakika her biri için tüm örnekler 2x yıkama tamponu içinde üç kez yıkayın. melezleştirme sıcaklığında 15 dakika her biri için tüm örnekler 1x yıkama tamponu içinde üç kez yıkayın. </li><li> melezleştirme sıcaklığında 1x Sodyum Klorür sodyum sitrat tamponu +% 0.1 Tween (SSC +% 0.1 Tween) ile bir kez tüm örnekler yıkayın. Numuneler oda sıcaklığına kadar soğumasını bekleyin. </li><li> W MAB tekrar Maleik asit tampon maddesinde (mAb) ile 1 x SSC çözeltisi yerine 15 dakika boyunca 1 x SSC +% 0.1 Tween iki kez tüm örnekler yıkayın ve 10 dakika bekletinkül. Blok çözeltisi ile MAB takın ve 1.5 saat süre ile inkübe edilir. </li><li> (1: blok çözeltisi içinde antikorun 10,000 seyreltme) antikor çözeltisi blok çözeltisi değiştirin ve yumuşak çalkalama ile oda sıcaklığında 12 saat (O / N) inkübe edilir. </li></ol> 5. Renk Gelişimi ve Montaj <ol><li> Antikor çözeltisi aspire edilir ve 10 dakika için her PBTw 15 kez yıkayın. 1x Alkalen Fosfataz Tampon (AP) ile PBTw değiştirin ve 10 dakika inkübe edilir. </li><li> DİKKAT - Yukarıdaki inkübasyon adım ilerler, AP boyama çözüm hazırlarken (Ek Dosya 2&#39;ye bakınız). iyi bir TCD içine malzemeyi aktarın ve AP boyama solüsyonu ile 1x AP çözüm değiştirin. süre renk reaksiyonu kaydedilebilir için yer alır, böylece artık zaman not edin. Arka plan oranı sinyal optimum kadar boyanma paterni gelişimini izlemek. </li><li> renk gelişimini durdurmak için, uygun idin içinde elden (1x AP boyama çözüm kaldırmake konteyner) ve PBTw 2 ml uygulamak ve şimdi zamanı not edin. 5 dakika her biri için iki kez daha PBTw ile durulayın. 1.5 ml tüp içine malzemeyi aktarmak için, bu durulama birini kullanabilirsiniz. </li><li> (Bu, O / N yapılabilir) PBTw çıkarın ve PBTw% 3.7 formaldehit 1 ml uygulamak ve ajitasyon ya da oda sıcaklığında en az 30 dakika döndürün. </li><li> PBT 3 yıkama (uygun bir atık konteynerine atık fiksatif elden) ile fiksatif yıkayın. deiyonize su içinde, 50 ° C &#39;de numuneler 3 kez yıkayın. NOT: Bu yıkar takas ve görselleştirme adımları sırasında görünür hale gelebilir tuzlarının çökelmesini ortadan kaldırır. </li><li> Benzil Alkol (BB: Ayrıca Murray Clear olarak bilinen BA) veya gliserol örnekleri benzil benzoat monte edilmelidir karar verir. NOT: Daha güçlü temizleme maddesi BB tercih: BA L. olarak stagnalis embriyolar biraz opak. Numuneler BB monte edilmek üzere: BA ilk bir etanol serisi ile susuz gerekecektir. Numuneler,% 60 monte edilecek olangliserol hemen monte edilebilir. </li><li> Bir pipet kullanarak: (BA veya% 60 gliserol BB) montaj çözelti içine örnekleri aktarın. BB monte ederken: NOT BA bu iyi bir bardak yapılmalıdır (BB: BA polikarbonat plastik eriyecek). </li><li> 10 dakika ve daha sonra ayırıcılar olarak yığılmış lamelleri uygun sayıda (örneklerin &lt;1 dpfc, numuneler için 2 lamelleri&gt; 1 dpfc için 1 lamel) kullanarak bir slayt üzerine takar - numuneler için 5 temizlemek için izin verin. NOT: Tüm bağlar artık DIC optik ile bileşik mikroskobu kullanılarak görüntülü olabilir. </li></ol>

<ol><li>Smith, S. A., Wilson, N. G., Goetz, F. E., Feehery, C., Andrade, S. C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Resolving+the+evolutionary+relationships+of+molluscs+with+phylogenomic+tools%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Resolving the evolutionary relationships of molluscs with phylogenomic tools.</a> Nature. 480 (7377), 364-367 (2011).</li>
<li>Brusca, R. C., Brusca, G. J. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBrusca%2C+RC+%22Invertebrates%22">Invertebrates</a>. , Sinauer. Sunderland. (2002).</li>
<li>Food and Agriculture Organisation of the United Nations. Global Aquaculture Production 1950-2013. , Available from: 
 <a target="_blank" href="http://www.fao.org/fishery/statistics/global-aquaculture-production/query/en">http://www.fao.org/fishery/statistics/global-aquaculture-production/query/en</a> (2013).</li>
<li>World Health Organization. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Schistosomiasis%3A+number+of+people+treated+in+2011%5BTitle%5D)+AND+%22Week.+Epi.+Rec%22%5BJournal%5D)">Schistosomiasis: number of people treated in 2011.</a> Week. Epi. Rec. 88, 81-88 (2013).</li>
<li>Henry, J. Q., Collin, R., Perry, K. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+slipper+snail%2C+Crepidula.%3A+an+emerging+lophotrochozoan+model+system%5BTitle%5D)+AND+%22Biol.+Bull%22%5BJournal%5D)">The slipper snail, Crepidula.: an emerging lophotrochozoan model system.</a> Biol. Bull. 218 (3), 211-229 (2010).</li>
<li>Perry, K. J., Henry, J. Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((CRISPR%2FCas9-mediated+genome+modification+in+the+mollusc%2C+Crepidula+fornicata%5BTitle%5D)+AND+%22Genesis%22%5BJournal%5D)">CRISPR/Cas9-mediated genome modification in the mollusc, Crepidula fornicata.</a> Genesis. 53 (2), 237-244 (2015).</li>
<li>Kandel, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+molecular+biology+of+memory+storage%3A+a+dialog+between+genes+and+synapses%5BTitle%5D)+AND+%22Bio.+Rep%22%5BJournal%5D)">The molecular biology of memory storage: a dialog between genes and synapses.</a> Bio. Rep. 24, 475-522 (2004).</li>
<li>Jackson, D. J., Ellemor, N., Degnan, B. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Correlating+gene+expression+with+larval+competence%2C+and+the+effect+of+age+and+parentage+on+metamorphosis+in+the+tropical+abalone+Haliotis+asinina%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Biol%22%5BJournal%5D)">Correlating gene expression with larval competence, and the effect of age and parentage on metamorphosis in the tropical abalone Haliotis asinina.</a> Mar. Biol. 147, 681-697 (2005).</li>
<li>Carter, C. J., Farrar, N., Carlone, R. L., Spencer, G. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Developmental+expression+of+a+molluscan+RXR+and+evidence+for+its+novel%2C+nongenomic+role+in+growth+cone+guidance%5BTitle%5D)+AND+%22Dev.+Biol%22%5BJournal%5D)">Developmental expression of a molluscan RXR and evidence for its novel, nongenomic role in growth cone guidance.</a> Dev. Biol. 343 (1-2), 124-137 (2010).</li>
<li>Rittschof, D., McClellan-Green, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Molluscs+as+multidisciplinary+models+in+environment+toxicology%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Pollut.+Bull%22%5BJournal%5D)">Molluscs as multidisciplinary models in environment toxicology.</a> Mar. Pollut. Bull. 50 (4), 369-373 (2005).</li>
<li>Liu, M. M., Davey, J. W., Jackson, D. J., Blaxter, M. L., Davison, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+conserved+set+of+maternal+genes%3F+Insights+from+a+molluscan+transcriptome%5BTitle%5D)+AND+%22Int.+J.+Dev.+Biol%22%5BJournal%5D)">A conserved set of maternal genes? Insights from a molluscan transcriptome.</a> Int. J. Dev. Biol. 58 (6-8), 501-511 (2014).</li>
<li>Hohagen, J., Herlitze, I., Jackson, D. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+optimised+whole+mount+in+situ.+hybridisation+protocol+for+the+mollusc+Lymnaea+stagnalis%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Dev.+Biol%22%5BJournal%5D)">An optimised whole mount in situ. hybridisation protocol for the mollusc Lymnaea stagnalis.</a> BMC Dev. Biol. 15 (1), 19(2015).</li>
<li>Raven, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+development+of+the+egg+of+Limnaea+stagnalis.+L.+from+oviposition+till+first+cleavage%5BTitle%5D)+AND+%22Arch.+Neth.+J.+Zool%22%5BJournal%5D)">The development of the egg of Limnaea stagnalis. L. from oviposition till first cleavage.</a> Arch. Neth. J. Zool. 1 (4), 91-121 (1946).</li>
<li>Raven, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+development+of+the+egg+of+Limnaea+Stagnalis.+L.+from+the+first+cleavage+till+the+troghophore+stage%2C+with+special+reference+to+its%27+chemical+embryology%5BTitle%5D)+AND+%22Arch.+Neth.+J.+Zool%22%5BJournal%5D)">The development of the egg of Limnaea Stagnalis. L. from the first cleavage till the troghophore stage, with special reference to its' chemical embryology.</a> Arch. Neth. J. Zool. 1 (4), 353-434 (1946).</li>
<li>Raven, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphogenesis+in+Limnaea+stagnalis.+and+its+disturbance+by+lithium%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Exp.+Zool%22%5BJournal%5D)">Morphogenesis in Limnaea stagnalis. and its disturbance by lithium.</a> J. Exp. Zool. 121 (1), 1-77 (1952).</li>
<li>Raven, C. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+nature+and+origin+of+the+cortical+morphogenetic+field+in+Limnaea%5BTitle%5D)+AND+%22Dev.+Biol%22%5BJournal%5D)">The nature and origin of the cortical morphogenetic field in Limnaea.</a> Dev. Biol. 7, 130-143 (1963).</li>
<li>Morrill, J. B., Blair, C. A., Larsen, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulative+development+in+the+pulmonate+gastropod%2C+Lymnaea+palustris.%2C+as+determined+by+blastomere+deletion+experiments%5BTitle%5D)+AND+%22J+Exp+Zool%22%5BJournal%5D)">Regulative development in the pulmonate gastropod, Lymnaea palustris., as determined by blastomere deletion experiments.</a> J Exp Zool. 183 (1), (1973).</li>
<li>Van Den Biggelaar, J. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Timing+of+the+phases+of+the+cell+cycle+during+the+period+of+asynchronous+division+up+to+the+49-cell+stage+in+Lymnaea%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Emb.+Exp.+Morph%22%5BJournal%5D)">Timing of the phases of the cell cycle during the period of asynchronous division up to the 49-cell stage in Lymnaea.</a> J. Emb. Exp. Morph. 26 (3), 367-391 (1971).</li>
<li>Verdonk, N. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gene+expression+in+early+development+of+Lymnaea+stagnalis%5BTitle%5D)+AND+%22Dev.+Biol%22%5BJournal%5D)">Gene expression in early development of Lymnaea stagnalis.</a> Dev. Biol. 35 (1), 29(1973).</li>
<li>Gall, J. G., Pardue, M. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Formation+and+Detection+of+Rna-Dna+Hybrid+Molecules+in+Cytological+Preparations%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+Of+The+National+Academy+Of+Sciences+Of+The+United+States+Of+America%22%5BJournal%5D)">Formation and Detection of Rna-Dna Hybrid Molecules in Cytological Preparations.</a> Proceedings Of The National Academy Of Sciences Of The United States Of America. 63 (2), 378-383 (1969).</li>
<li>Iijima, M., Takeuchi, T., Sarashina, I., Endo, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+patterns+of+engrailed+and+dpp+in+the+gastropod+Lymnaea+stagnalis%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Genes+Evol%22%5BJournal%5D)">Expression patterns of engrailed and dpp in the gastropod Lymnaea stagnalis.</a> Dev Genes Evol. 218 (5), 237-251 (2008).</li>
<li>Shimizu, K., Sarashina, I., Kagi, H., Endo, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Possible+functions+of+Dpp+in+gastropod+shell+formation+and+shell+coiling%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Genes+Evol%22%5BJournal%5D)">Possible functions of Dpp in gastropod shell formation and shell coiling.</a> Dev Genes Evol. 221 (2), 59-68 (2011).</li>
<li>Koop, D., Richards, G. S., Wanninger, A., Gunter, H. M., Degnan, B. M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+role+of+MAPK+signaling+in+patterning+and+establishing+axial+symmetry+in+the+gastropod+Haliotis+asinina%5BTitle%5D)+AND+%22Dev.+Biol%22%5BJournal%5D)">The role of MAPK signaling in patterning and establishing axial symmetry in the gastropod Haliotis asinina.</a> Dev. Biol. 311 (1), 200-212 (2007).</li>
<li>Lartillot, N., Lespinet, O., Vervoort, M., Adoutte, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+pattern+of+Brachyury+in+the+mollusc+Patella+vulgata+suggests+a+conserved+role+in+the+establishment+of+the+AP+axis+in+Bilateria%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Expression pattern of Brachyury in the mollusc Patella vulgata suggests a conserved role in the establishment of the AP axis in Bilateria.</a> Development. 129 (6), 1411-1421 (2002).</li>
<li>Jackson, D. J., Wörheide, G., Degnan, B. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Dynamic+expression+of+ancient+and+novel+molluscan+shell+genes+during+ecological+transitions%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Evol.+Biol%22%5BJournal%5D)">Dynamic expression of ancient and novel molluscan shell genes during ecological transitions.</a> BMC Evol. Biol. 7 (1), 160(2007).</li>
<li>Jackson, D. J., Meyer, N. P., Seaver, E., Pang, K., McDougall, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Developmental+expression+of+COE.+across+the+Metazoa+supports+a+conserved+role+in+neuronal+cell-type+specification+and+mesodermal+development%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Genes+Evol%22%5BJournal%5D)">Developmental expression of COE. across the Metazoa supports a conserved role in neuronal cell-type specification and mesodermal development.</a> Dev Genes Evol. 220, 221-234 (2010).</li>
<li>Perry, K. J., Lyons, D. C., Truchado-Garcia, M., Fischer, A. H. L., Helfrich, L. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Deployment+of+regulatory+genes+during+gastrulation+and+germ+layer+specification+in+a+model+spiralian+mollusc%5BTitle%5D)+AND+%22Dev.+Dyn%22%5BJournal%5D)">Deployment of regulatory genes during gastrulation and germ layer specification in a model spiralian mollusc.</a> Dev. Dyn. , (2015).</li>
<li>Iijima, M., Takeuchi, T., Sarashina, I., Endo, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+patterns+of+engrailed+and+dpp+in+the+gastropod+Lymnaea+stagnalis%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Genes+Evol%22%5BJournal%5D)">Expression patterns of engrailed and dpp in the gastropod Lymnaea stagnalis.</a> Dev Genes Evol. 218 (5), 237-251 (2008).</li>
<li>Shimizu, K., Iijima, M., Setiamarga, D. H. E., Sarashina, I., Kudoh, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Left-right+asymmetric+expression+of+dpp+in+the+mantle+of+gastropods+correlates+with+asymmetric+shell+coiling%5BTitle%5D)+AND+%22EvoDevo%22%5BJournal%5D)">Left-right asymmetric expression of dpp in the mantle of gastropods correlates with asymmetric shell coiling.</a> EvoDevo. 4 (1), 15(2013).</li>
<li>Christodoulou, F., Raible, F., Tomer, R., Simakov, O., Trachana, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ancient+animal+microRNAs+and+the+evolution+of+tissue+identity%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Ancient animal microRNAs and the evolution of tissue identity.</a> Nature. 463, (2010).</li>
<li>Koga, M., Kudoh, T., Hamada, Y., Watanabe, M., Kageura, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+new+triple+staining+method+for+double+in+situ+hybridization+in+combination+with+cell+lineage+tracing+in+whole-mount+Xenopus+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Growth+Differ%22%5BJournal%5D)">A new triple staining method for double in situ hybridization in combination with cell lineage tracing in whole-mount Xenopus embryos.</a> Dev Growth Differ. 49 (8), 635-645 (2007).</li>
<li>Lauter, G., Söll, I., Hauptmann, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Two-color+fluorescent+in+situ+hybridization+in+the+embryonic+zebrafish+brain+using+differential+detection+systems%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Dev.+Biol%22%5BJournal%5D)">Two-color fluorescent in situ hybridization in the embryonic zebrafish brain using differential detection systems.</a> BMC Dev. Biol. 11 (1), 43(2011).</li>
<li>Davison, A., Frend, H. T., Moray, C., Wheatley, H., Searle, L. J., Eichhorn, M. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mating+behaviour+in+Lymnaea+stagnalis.+pond+snails+is+a+maternally+inherited%2C+lateralized+trait%5BTitle%5D)+AND+%22Biol.+Lett%22%5BJournal%5D)">Mating behaviour in Lymnaea stagnalis. pond snails is a maternally inherited, lateralized trait.</a> Biol. Lett. 5 (1), 20-22 (2009).</li>
<li>Kuroda, R., Endo, B., Abe, M., Shimizu, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chiral+blastomere+arrangement+dictates+zygotic+left-right+asymmetry+pathway+in+snails%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Chiral blastomere arrangement dictates zygotic left-right asymmetry pathway in snails.</a> Nature. 462 (7274), 790-794 (2009).</li>
<li>Shibazaki, Y., Shimizu, M., Kuroda, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Body+handedness+is+directed+by+genetically+determined+cytoskeletal+dynamics+in+the+early+embryo%5BTitle%5D)+AND+%22Curr.+Biol%22%5BJournal%5D)">Body handedness is directed by genetically determined cytoskeletal dynamics in the early embryo.</a> Curr. Biol. 14 (16), 1462-1467 (2004).</li>
<li>Lu, T. Z., Feng, Z. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+sodium+leak+current+regulates+pacemaker+activity+of+adult+central+pattern+generator+neurons+in+Lymnaea+stagnalis%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">A sodium leak current regulates pacemaker activity of adult central pattern generator neurons in Lymnaea stagnalis.</a> PLoS One. 6 (4), e18745(2011).</li>
<li>Dawson, T. F., Boone, A. N., Senatore, A., Piticaru, J., Thiyagalingam, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Gene+Splicing+of+an+Invertebrate+Beta+Subunit+%28LCav-beta%29+in+the+N-Terminal+and+HOOK+Domains+and+Its+Regulation+of+LCav1+and+LCav2+Calcium+Channels%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Gene Splicing of an Invertebrate Beta Subunit (LCav-beta) in the N-Terminal and HOOK Domains and Its Regulation of LCav1 and LCav2 Calcium Channels.</a> PLoS ONE. 9 (4), e92941(2014).</li>
<li>Smith, S. A., Wilson, N. G., Goetz, F. E., Feehery, C., Andrade, S. C. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Resolving+the+evolutionary+relationships+of+molluscs+with+phylogenomic+tools%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Resolving the evolutionary relationships of molluscs with phylogenomic tools.</a> Nature. 480 (7377), 364-367 (2011).</li>
<li>Gregory, T. R., Nicol, J. A., Tamm, H., Kullman, B., Kullman, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Eukaryotic+genome+size+databases%5BTitle%5D)+AND+%22Nuc.+Acids.+Res%22%5BJournal%5D)">Eukaryotic genome size databases.</a> Nuc. Acids. Res. 35 (Database issue), D332-D338 (2007).</li>
</ol>

Yazarlar ifşa hiçbir şey yok.

Burada tarif edilen yöntem, Lymnaea stagnalis tüm gelişim aşamalarında olan muhtemelen farklı sentezleme seviyelerine sahip RNA transkriptlerinin etkin olarak gösterebilir. Onların kapsüller embriyolar ve larvaları çıkarmak için diğer encapsulated- için bildirilen kimyasal, ozmotik şok ve fiziksel tedaviler çeşitli trialed model organizmalar geliştirmek. Ancak, bizim elimizde biz burada açıklamak yöntemi embriyolar ve larvaları zarar vermeden sert kapsül zarı kaldırır sadece yüksek verimli bir teknikti...

Yumuşakçalar bilimsel disiplinlerin geniş bir çeşitlilik ilgi tutmak hayvanların bir grup vardır. Morfolojik çeşitlilik 1 rağmen, tür, 3 ticari tıbbi 4 ve bilimsel konularda 5-8 geniş bir yelpazede ve alaka (tür sayısı 2 bakımından sadece Arthropodlara ikinci) zenginliği, iddia edebilir görece az sayıda yumuşakça türü vardır iyi donanımlı bilimsel model ve laboratuar ortamında bakımı kolay hem olacak. Çok böyle nörobiyoloji 9, ekotoksikoloji 10 ve daha yakın evrimsel biyoloji 11,12 olarak disiplinler tarafından kullanılan bir yumuşakça, öncelikle çünkü yaygın dağıtım ve bakım aşırı kolaylığı, Lymnaea stagnalis olduğunu. Bir &#39;model&#39; organizma olarak popülerlik ve L. mevcut gelişimsel biyologlar 13-19, moleküler araçlar aralığı ve güç kullanımı onun uzun geçmişine rağmen stagnalis bilimsel topluluk çok daha geleneksel hayvan modellerinde (Drosophila, fare, deniz kestanesi, nematodlar) o arkasında yatıyor. Bir moleküler modeli kabuk oluşumunu rehberlik moleküler mekanizmalar bir ilgi kaynaklanıyor gibi bizim arzu Lymnaea geliştirmektir. Bu Lymnaea &#39;ın gelişimi sırasında gen ifadesinin, verimli, tutarlı ve duyarlı görselleştirme için izin verecek teknikleri bir dizi rafine bizi motive etti. In situ hibridizasyon bütün montaj (WMISH) yaygın model organizmaların çeşitli kullanılır ve 40 yılı aşkın 20 kullanımda olmuştur. Farklı guises, ISH mekansal kromozomlar, rRNA, mRNA ve mikro-RNA&#39;lar belirli loci lokalize etmek için kullanılabilir. Zorluklardan biri, önceki L. için WMISH yöntemi rafine hitap için gerekli stagnalis nazikçe ve etkin ayıklanması embriyo ve t değişen aşamaları larvalarının sorun olduO depolandıkları yumurta kapsüller. Bu özütleme, ya da &#39;kapsülden çıkarma&#39;, yeterli malzeme toplamak için etkili bir şekilde elde edilmesi gerekmektedir, aynı zamanda, morfolojik ve hücresel bütünlüğü muhafaza edilirken, in situ deneyde verilen. Diğer model organizmalar da kapsüllü gelişime tabi iken, elimizde bu türler için bildirilen yöntemlerden hiçbiri başarılı L. istihdam edilebilir stagnalis. Bu yöntemin genel amaçları bu nedenle: L. ayıklamak için stagnalis yüksek verimli bir şekilde kendi kapsüller, embriyolar ve larvalar görüntüleme için tatmin edici bir WMISHsignals embriyo ve larvaları hazırlamak için, WMISH sinyali iyileştirir ön hibridizasyon tedaviler uygulamak.

<table><tbody><tr><td>Tüy siklet forseps</td><td>Ehlert & İş Ortağı</td> <td># 4181119</td><td></td></tr><tr><td>Silikon boru</td><td>Glasger & auml; tebau OCHS GmbH</td><td>760070</td><td></td></tr><tr><td>Cam kılcal damarlar</td><td>Hilgenberg</td><td>1403547</td><td></td></tr><tr><td>12 kuyulu doku kültürü kapları</td><td>Carl Roth</td><td>CE55.1</td><td></td></tr><tr><td>%37 Formaldehit</td><td>Carl Roth</td><td>P733.1</td><td>DİKKAT - Kansere neden olabilir. Solunduğunda, cilt ile temas ettiğinde ve yutulduğunda toksiktir. Toksik: Solunması halinde, cilt ile temasında ve yutulması halinde çok ciddi geri dönüşü olmayan etki tehlikesi.</td></tr><tr><td>Etilendiamin tetraasetik asit</td><td>Carl Roth</td><td>CN06.3</td><td>DİKKAT - GÖZ TAHRİŞİNE NEDEN OLUR. SOLUNUM YOLLARI VE CILT TAHRIŞINE NEDEN OLABILIR. Toz solumaktan kaçının. Göz, cilt ve giysilerle temasından kaçının. Sadece yeterli havalandırma ile kullanın</td></tr><tr><td>Magnezyum Klorür</td><td>Carl Roth</td><td>2189.1</td><td></td></tr><tr><td>Tween-20</td><td>Carl Roth</td><td>9127.1</td><td>DİKKAT - Solunması halinde zararlı olabilir. Solunum yolu tahrişine neden olabilir. Cilt yoluyla emilirse zararlı olabilir. Cilt tahrişine neden olabilir. Göz tahrişine neden olabilir. Yutulması halinde zararlı olabilir.</td></tr><tr><td>Sodyum Klorür</td><td>Carl Roth</td><td>3957.1</td><td></td></tr><tr><td>Ficoll type 400</td><td>Carl Roth</td><td>CN90.1</td><td></td></tr><tr><td>polivinilpirolidon K30 (MW 40)</td><td>Carl Roth</td><td>4607.1</td><td>DİKKAT - Solunması halinde zararlı olabilir. Solunum yolu tahrişine neden olabilir. Cilt yoluyla emilirse zararlı olabilir. Cilt tahrişine neden olabilir. Göz tahrişine neden olabilir. Yutulması halinde zararlı olabilir.</td></tr><tr><td>Nükleaz içermezSığır Serum Albümini</td><td>Carl Roth</td><td>8895.1</td><td></td></tr><tr><td>Somon spermi</td><td>Carl Roth</td><td>5434.2</td><td></td></tr><tr><td>Heparin</td><td>Carl Roth</td><td>7692.1</td><td>DİKKAT - YAN ETKILER ARASINDA KANAMA, LOKAL TAHRIŞ BULUNUR. SOLUNMASI, YUTULMASI/TEMAS EDILMESI HALINDE OLASI ALERJIK REAKSIYON. GÖZLER/CILT/SOLUNUM YOLU TAHRIŞ EDICI. OLASI AŞIRI DUYARLILIK. HAMİLELİK SIRASINDA ÖLÜ DOĞUM RİSKİNİ ARTIRDIĞI BİLDİRİLMİŞTİR</td></tr><tr><td>Proteinaz-K</td><td>Carl Roth</td><td>7528.1</td><td></td></tr><tr><td>Glisin</td><td>Carl Roth</td><td>3790.2</td><td></td></tr><tr><td>Deiyonize formamid</td><td>Carl Roth</td><td>P040.1</td><td>DİKKAT - Gözleri ve cildi tahriş eder. Solunması, cilt ile teması halinde ve yutulması halinde zararlı olabilir. Doğmamış çocuğa zarar verebilir. Higroskopik.</td></tr><tr><td>Standart formamid</td><td>Carl Roth</td><td>6749.3</td><td>DİKKAT - Gözleri ve cildi tahriş eder. Solunması, cilt ile teması halinde ve yutulması halinde zararlı olabilir. Doğmamış çocuğa zarar verebilir. Higroskopik.</td></tr><tr><td>Trietanolamin</td><td>Carl Roth</td><td>6300.1</td><td>DİKKAT - Buhar veya buğu solumaktan kaçının. Göz ile temasından kaçınınız. Cilt ile uzun süreli veya tekrarlanan temastan kaçının. Kullandıktan sonra iyice yıkayın.</td></tr><tr><td>Asetik anhidrit</td><td>Carl Roth</td><td>4483.1</td><td>DİKKAT - CİDDİ CİDDİ CİLT VE GÖZ YANIKLARINA NEDEN OLUR. SU ILE ŞIDDETLI REAKSIYONA GIRER. YUTULMASI HALINDE ZARARLIDIR. GÖZLERİ VE SOLUNUM YOLLARINI TAŞİREN BUHAR</td></tr><tr><td>Maleik asit</td><td>Carl Roth</td><td>K304.2</td><td>DİKKAT - Gözle teması (tahriş edici), yutulması durumunda çok tehlikelidir. Cilt teması (tahriş edici), soluma (akciğer tahriş edici) durumunda tehlikelidir. Cilt teması halinde hafif tehlikelidir (geçirgen). Gözleri ve cildi aşındırır.</td></tr><tr><td>Benzil benzoat</td><td>Sigma</td><td>B6630-250ML</td><td>DİKKAT - Solunması halinde zararlı olabilir. Solunum yolu tahrişine neden olabilir. Cilt yoluyla emilirse zararlı olabilir. Cilt tahrişine neden olabilir. Göz tahrişine neden olabilir. Yutulması halinde zararlıdır.</td></tr><tr><td>Benzil alkol</td><td>Sigma</td><td>10,800-6</td><td>DİKKAT - Yutulması halinde zararlıdır. Solunması halinde zararlıdır. Ciddi göz tahrişine neden olur.</td></tr><tr><td>Gliserol</td><td>Carl Roth</td><td>3783.1</td><td></td></tr><tr><td>Bloke edici toz</td><td>Roche</td><td>11096176001</td><td></td></tr><tr><td>Anti DIG Fab parçaları AP konjuge</td><td>Roche</td><td>11093274910</td><td></td></tr><tr><td>Tris-HCl</td><td>Carl Roth</td><td>9090.3</td><td></td></tr><tr><td>Dimetilformamid içinde 4-Nitro mavi tetrazolyum klorür ve nbsp;</td><td>Carl Roth</td><td>4421.3</td><td>DİKKAT - Doğmamış çocuğa zarar verebilir. Solunması ve cilt ile teması halinde zararlıdır. Gözleri tahriş eder.</td></tr><tr><td>5-bromo-4-kloro-3-indolil-fosfat</td><td>Carl Roth</td><td>A155.3</td><td>DİKKAT - Yutulması halinde potansiyel olarak zararlıdır. Cilde, gözlere veya giysilere temas ettirmeyin. Potansiyel cilt ve göz tahriş edici.</td></tr><tr><td>N-asetil sistein</td><td>Carl Roth</td><td>4126.1</td><td></td></tr><tr><td>Dithiothreitol</td><td>Carl Roth</td><td>6908.1</td><td>DİKKAT - Göz ve cilt tahrişine neden olabilir. Solunum ve sindirim sistemi tahrişine neden olabilir. Bu malzemenin toksikolojik özellikleri tam olarak araştırılmamıştır.</td></tr><tr><td>Tergitol</td><td>Sigma</td><td>NP40S</td><td>DİKKAT - Solunması halinde zararlı olabilir. Solunum yolu tahrişine neden olabilir. Cilt yoluyla emilirse zararlı olabilir. Cilt tahrişine neden olabilir. Göz tahrişine neden olabilir. Yutulması halinde zararlı olabilir.</td></tr><tr><td>Sodyum dodesil sülfat</td><td>Carl Roth</td><td>CN30.3</td><td>DİKKAT - Yutulması halinde zararlıdır. Cilt ile temasında toksiktir. Cilt tahrişine neden olur. Ciddi göz hasarına neden olur. Solunum yolu tahrişine neden olabilir.</td></tr><tr><td>Potasyum Klorür</td><td>Carl Roth</td><td>6781.1</td><td></td></tr><tr><td>di-Sodyum hidrojen fosfat dihidrat (Na2HPO4&#8226; 2H<alt>2</alt>O)</td><td>Carl Roth</td><td>4984.1</td><td></td></tr><tr><td>Potasyum dihidrojen fosfat (KH<alt>2</alt>PO<alt>4</alt>)</td><td>Carl Roth</td><td>3904.1</td><td></td></tr><tr><td>Trisodyum sitrat dihidrat (C<alt>6</alt>H<alt>5</alt>Na<alt>3<alt>O<alt>7<alt>&#8226; 2H2O)</td><td>Carl Roth</td><td>3580.1</td><td>DİKKAT - Göz, cilt ve solunum yolu tahrişine neden olabilir. Bu malzemenin toksikolojik özellikleri tam olarak araştırılmamıştır.</td></tr><tr><td>Mineral yağ&nbsp;</td><td>Carl Roth</td><td>HP50.2</td><td></td></tr><tr><td>InSituPro-Vsi&nbsp;</td><td>Intavis</td><td></td><td>www.intavis.de/products/automated-ish-and-ihc</td></tr></tbody></table>

a whole dağı<em&gt; in situ</emgastropoda yumuşakça için&gt; hibridizasyon yöntemi<em&gt; lymnaea stagnalis</em

A Whole Mount In Situ Hybridization Method for the Gastropod Mollusc Lymnaea stagnalis

In situ hibridizasyon bütün montaj (WMISH) ilgili (örneğin, bir embriyo veya larva gibi) bir &quot;bütün montaj &#39;doku terkibi olan bir nükleik asit molekülü (genellikle mRNA&#39;lar) uzamsal çözünürlük veya gelişimsel aşamada sağlayan bir tekniktir. önemli ölçüde karmaşık metazoan genomları fonksiyonel karakterizasyonu, yeni nesil dizi verilerinin tufan ile bir darboğaz haline gelmektedir bir meydan okuma katkıda bulunabilir çünkü WMISH son derece güçlüdür. çok zaman genellikle yeni model sistemler için WMISH deneylere doğasında çeşitli parametrelerini optimize için gereken tekniğin kavramsal basitliğine rağmen; doku tipleri ve gelişim aşamaları arasındaki hücresel ve biyokimyasal ince farklar tek WMISH yöntemi tüm durumlar için uygun olmayabilir anlamına gelir. Biz tutarlı üretmek ve yeniden ortaya çıkan gastropod modeli Lymnaea stagnalis için WMISH yöntemler kümesi geliştirdikgenlerin ve tüm gelişim aşamaları arasında bir aralık için açık WMISH işaretleri. Bu yöntemler, bir ontogenetik pencereye bilinmeyen kronolojik yaş larva atama, onların yumurta kapsüllerden verimli embriyoların kaldırılmasını ve larvaları, her ontogenetik pencere için uygun bir proteinaz-K tedavisinin uygulanmasını ve hibridizasyon sonrası hibridizasyon ve İmmuno dahil adımlar. Bu yöntemler, belirli bir RNA transkripti için ortaya çıkan sinyal prob özel ayarlamalar (öncelikle konsantrasyon ve melezleme sıcaklığı prob) ile daha da rafine olabilen bir zemin oluşturmaktadır.

Şekil 3&#39;te gösterildiği gibi Örnek WMISH boyanma, yukarıda tarif edilen teknik kullanılarak üretilebilir, ve kabuk oluşumu arasında değişen moleküler bir dizi işlem katılan genlerin mekansal ekspresyonu, çeşitli yansıtırlar (yeni bir gen, 1, 2, 3 ve 4), gelişim aşamaları bir dizi genelinde transkripsiyon regülasyonu (Brachyury) hücre-hücre sinyal (DPP) için. Biz onlar da olur bekliyoruz bu genlerin ifade seviyeleri...

Bu protokolün amacı, kullanıcılara Lymnaea stagnalis embriyolarının ve larvalarının yüksek verimli dekapsülasyonu için bir dizi yöntem sağlamaktır.

A Whole Dağı<em&gt; In Situ</emGastropoda yumuşakça için&gt; Hibridizasyon Yöntemi<em&gt; Lymnaea stagnalis</em

Whole mount in situ hybridization (WMISH) is a technique that allows for the spatial resolution of nucleic acid molecules (often mRNAs) within a ...

Bu protokolün genel amacı, tatlı su gastropodu Lymnaea stagnalis'in embriyonik ve larval bütün montajlarında (whole mount) münferit genlerin uzaysal ekspresyon modellerini verimli bir şekilde görselleştirmektir. Bu yöntem; genlerin nerede ve ne zaman eksprese olduğu, birbirleriyle nasıl etkileşime girdikleri ve potansiyel fonksiyonlarının neler olabileceği gibi Evo-Devo ve gelişim biyolojisi alanlarındaki temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Bu tekniğin temel avantajı, embriyonik ve larval materyallerin yumurta kapsüllerinden çıkarılmasının hızlı, kolay ve etkili olmasıdır.Bu materyal daha sonra ek materyallerde sunduğumuz bir gelişim yol haritasına göre kategorize edilir ve ardından evreye özgü pre-hibritleme adımlarından geçirilir. Bu prosedüre başlamak için, 20 mililitrelik tek kullanımlık bir şırıngayı silikon bir hortuma bağlayın. Ardından, standart bir mikroskop lamını ters çevrilmiş büyük bir Petri kabına bantla sabitleyin.Ardından, silikon tüpü mikroskop lamına hemen bitişik olacak şekilde bantlayın. Bundan sonra, mikroskop lamı üzerine çekilmiş bir cam iğne yerleştirin. İğnenin ucu, tüpün iç çapının yaklaşık %20'si kadar dışarı çıkana kadar iğneyi nazikçe silikon tüpün içine yerleştirin.İğne konumlandığında, onu Petri kabına bantla sabitleyin. Silikon tüpün boşta kalan ucunun, dekapsüle edilen materyalleri toplayacak olan başka bir Petri kabının içinde durmasını sağlayın. Akvaryum duvarlarından yumurta suşlarını toplamak için, yumurta suşunu substrattan kazımak amacıyla spatula olarak düz ve esnek bir plastik parça kullanın.Su yüzeyindeki yumurta kümesini toplamak için plastik bir çay süzgeci kullanın. Ardından, materyali bu kılavuza göre mikroskop altında evreleyin ve ayıklayın. Yumurta kümesini bir kağıt havlu üzerine yerleştirin ve ince uçlu pens kullanarak yumurta kütlesi boyunca boyuna bir kesik açın.Ardından, yumurta kapsüllerini yumurta süzgecinden dışarı yuvarlayın ve her bir kapsülü kağıt havlu üzerinde hareket ettirerek mümkün olduğunca fazla jöle materyalini uzaklaştırın. Sonra, ince uçlu pens kullanarak yumurta kapsüllerini 5 milliliters musluk suyu içeren bir Petri kabına aktarın. İstenilen gelişim aşamalarındaki jölesi alınmış yumurta kapsüllerini bu kaba toplamaya devam edin.Bir sonraki adıma geçmeden önce, planlanan WMISH deneyi için tüm gelişim evrelerinden yeterli sayıda kapsül toplayın. Şimdi, ilk bölünmeden sonra beş günden daha yaşlı olan larvaları, fiksasyondan önce 30 dakika boyunca %2 ağırlık/hacim oranındaki magnezyum klorür hekzahidrat çözeltisinde rahatlatın. 30 dakika sonra, birkaç larvayı hâlâ yumurta kapsülleri içindeyken fiksatif çözeltiye daldırarak ve mikroskop altında tepkilerini izleyerek rahatlama derecesini değerlendirin.Yeterince gevşememiş larvalar kabuklarının içine çekilecektir. Tamamen gevşemiş larvalar ise tepki vermeyecektir. Larvalar gevşetildikten sonra, yumurta kapsüllerini geniş ağızlı plastik bir pipet kullanarak, yumurta kapsüllerinin hacminin 10 katı kadar yer sağlayan kapatılabilir bir tüpe aktarın.Ardından, tüpteki sıvının mümkün olduğu kadarını aspire edin ve bunu çöken yumurta kapsüllerinin hacminin 10 katı kadar fiksasyon çözeltisi ile değiştirin. Yumurta kapsüllerini, oda sıcaklığında, her gelişim evresi için uygun süre boyunca fiksasyon çözeltisi içinde nazikçe döndürün. Daha sonra döndürme işlemini durdurun ve kapsüllerin dibe çökmesini bekleyin.Fiksatif çözeltiyi uygun bir atık konteynerine aspire edin. Fiksatif çözeltiyi PBTw ile değiştirerek yumurta kapsüllerini yıkayın ve oda sıcaklığında beş dakika boyunca döndürün.PBTw'yi aspire edin ve iki kez daha yıkayın. Ardından, embriyoları ve larvaları aparat kullanarak kapsüllerinden çıkarın. Kapsülleri 20 mililitrelik bir şırıngaya çekin.Ardından şırıngayı tübe bağlayın. Kapsülleri tüp ve cam iğne aracılığıyla toplama kabına boşaltın. Sonrasında, dekapsüle edilmiş embriyoları ve larvaları bir mikro pipet kullanarak 1.5-milliliter tüpe toplayın.Ardından, fikse edilmiş materyali yalehidre edip saklayın ya da Proteinaz K, TEA ve post-fiksasyon adımlarını uygulayın. Bu adımlar tamamlandıktan sonra, materyali kısaca ön-hibritize edin ve riboprobları ekleyin. Lymnaea stagnalis için in situ deneyinin nihai sonuçlarında uygun bir Pro K işleminin önemi hayati derecede fazladır.Bu durum, 0 ile 500 µg/ml arasında değişen ve farklı gelişim aşamaları için gereken geniş bir Pro K konsantrasyonu yelpazesinde görülmektedir. Hibritleme sırasında, ısıtıcı bloktan tek bir tüp çıkarın. Yağ fazını bozmadan larvaları süspansiyona getirmek için tüpü başparmağınız ve işaret parmağınız arasında hızla döndürün ve tekrar ısıtıcı bloğa yerleştirin.Bu prosedürü her altı ila 12 saatte bir tekrarlayın. Burada gösterilen gen ekspresyon modelleri, çeşitli gelişim evrelerindeki larvalar kullanılarak oluşturulmuştur. Tüm örnekler Murray's Clear ile monte edilmiş ve görüntülenmiştir.Yaklaşık yaşlar her görüntünün sağ üst köşesinde belirtilmiştir. Görünümün yönü sağ alt köşede, gen ortolojisi ise sol alt köşede gösterilmiştir. Bu sonuçlar, kabuk oluşumundan transkripsiyona ve hücreler arası sinyale kadar çeşitli moleküler süreçlerde yer alan genlerin ekspresyon modellerini örneklendirmektedir.Tüm durumlarda, benzersiz ve net bir hücresel boyama paterni görülmektedir; sonuçlar bir deney içindeki bireysel larvalar arasında oldukça tutarlı ve deneyler arasında yüksek düzeyde tekrarlanabilirdir. Uzmanlaşıldığında, bu tekniğin toplam uygulama süresi iki günden azdır. Sürenin çoğu, hibridizasyon için embriyonik ve larva materyallerinin toplanması ve hazırlanması ile sonuçların görüntülerinin alınmasıyla geçmektedir.Bu prosedür uygulanırken, her riboprobun hibritleme sıcaklığı, prob konsantrasyonu ve hibritleme süresi gibi önemli parametrelerde muhtemelen küçük ayarlamalar gerektireceğini hatırlamak önemlidir. Geliştirilmesinin ardından bu teknik, önceki transkriptomik ve proteomik taramalarla tanımlanan kabuk oluşumunda yer alan bir dizi genin oldukça iyi şekilde karakterize edilmesine olanak sağlamıştır.

a-whole-mount-situ-hybridization-method-for-gastropod-mollusc-lymnaea

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Tüm Dağı<em&gt; In situ</emE11.5 fare embriyolarına E8.5 ve&gt; Hibridizasyon

Bu videoda, gelişimsel olarak senkronize bir steril yetişkin C. elegans popülasyonu üretme yöntemini gösteriyoruz. Örnek protokol, canlı hayvanlarda oksijen tüketim oranlarını incelemek için solucanları senkronize eder.

Nematod Senkronizasyonu: Aynı Gelişim Aşamalarında Solucan Popülasyonları Elde Etmek İçin Bir Yöntem

RNA<em&gt; Yerinde</emTüm Dağı Embriyolar ve Hücre histolojisi&gt; Hibridizasyon Deniz Elasmobranchs İçin Uyarlanmış

Böyle Amerikan ıstakoz balıkçılık gibi sömürülen kabuklu balıkçılık için balıkçılık kaynaklı değişimler, potansiyel çiftleşme başarısında düşüşe neden üreme dinamiklerini etkileyebilir. Bu çalışmanın amacı, fizyolojik veya işlevsel olgun olabilir dişi ıstakoz çiftleşme başarısını tespit etmek için non-invaziv bir yöntem geliştirmek için oldu.

A Noninvaziv Yöntemi<em&gt; In situ</em&gt; Kadın American Istakoz&#39;ların çiftleşme Başarı (Belirlenmesi<em&gt; Homarus americanus</em&gt;)

Bu video protokolü, hermafrodit tatlı su salyangozu Lymnaea stagnalis kullanarak gastropodlarda seminal sıvının etkilerini incelemek için bir yöntem göstermektedir.

Gastropod Molluskların Yumurta döflenmesi erkek Aksesuar Bezi Ürünlerinin Etkisi

Tavuklarda Eimeria enfeksiyonu teşhisi zorlu olmaya devam etmektedir. Parazit morfolojisi ve konak patolojisi odaklı yaklaşımlar genellikle sonuçsuz kalırken, PCR'ye dayalı moleküler yaklaşımların maliyet ve uzmanlık açısından zorlu olduğu kanıtlanmıştır. Bu protokolün amacı, eimerian enfeksiyonu için basit bir moleküler tanı olarak döngü aracılı izotermal amplifikasyonu (LAMP) oluşturmaktır.

Türler özgü Algılama Loop-aracılı İzotermal Amplifikasyon (LAMP) Tahliller<em&gt; Eimeria</em&gt; Tavuklar bulaştırmak ki

Bu iletişim kuralı embriyonik Astyanax cavefish gen ifadesinde görselleştirme sağlar. Bu yaklaşım belirsiz arka plan boyama en aza indirerek gen ifade sinyal, en üst düzeye çıkarma amacı ile geliştirilmiştir.

İn Situ hibridizasyon Astyanax embriyo için Wholemount

Bu protokolün amacı, embriyo ödün vermeden gastrasyon sırasında deniz anemone nematostella vectensis genotip etmektir.

Erken gelişim sırasında deniz anemon Genotipleme

Tatlı su midyesinin korunması türlerin üreme kalıplarının ve süreçlerinin izlenmesine bağlıdır. Bu çalışma, solungaç içeriğini örneklemek, larva gelişimini karakterize etmek ve toplanan veriler için dijital bir depo sağlamak için öldürücü olmayan bir protokolü standartlaştırır. Bu protokol-veritabanı paketi, tehlike altındaki türlerin kurtarılmasında midye araştırmacıları için önemli bir araç olacaktır.

Tatlı Su Midyelerinin Üreme Durumunu ve Larval Gelişimini Karakterize Etmek Için Ölümcül Olmayan Bir Yöntemin Standartlaştırılması (Bivalvia: Unionida)

Makale, gastropod Crepidula fornicata'nın larva kültürü için yöntemleri küçük hacimli laboratuvar ölçekli bir sistemde ve sahada konuşlandırılabilen bir ortam-deniz suyu mezokozm sisteminde sunmaktadır.

Terlik Limpeti (Crepidula fornicata) Larvalarının Laboratuvar ve Saha Kültürü

Öğrenin, Lymnaea stagnalis embriyo ve larvalarında gen ifade desenlerini görselleştirmek için yüksek verimli dekapsülasyon ve whole mount in situ hibridizasyon yöntemini. Bu protokol, gelişim biyolojisi ve evo-devo araştırmalarında gen etkileşimlerini incelemeyi kolaylaştırır.

A Whole Dağı

Daha fazla video keşfet