Name: Kurbağalar ve Salamanderler Yaşayan Oositlerinin Dev Lampbrush Kromozomların İzolasyonu (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-12-05T12:30:00.000+00:00
Duration: 10 min 7 s
Description: Öğrenin, kurbağa ve semender oositlerinden dev lamba fırçası kromozomlarını izole etme yöntemini. Bu teknik, transkripsiyon ve RNA dinamiklerini canlı hücrelerde incelemek için kullanılır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu yayında bildirilen araştırma, Ulusal Sağlık Enstitüleri Ulusal Genel Tıp Bilimleri Enstitüsü tarafından R01 GM33397 ödül numarasıyla desteklenmiştir. İçerik yalnızca yazarların sorumluluğundadır ve Ulusal Sağlık Enstitüleri'nin resmi görüşlerini temsil etmek zorunda değildir. J.G.G., Amerikan Kanser Derneği Gelişimsel Genetik Profesörüdür.

Genel kurbağalar ve semenderler hakkında bilgi yanı sıra hayvanların kaynakları, aşağıdaki web sitelerinden bulunabilir: Xenbase (http://www.xenbase.org) ve Sal-site (http://www.ambystoma.org). Bu protokol Bilim Carnegie Kurumu Embriyoloji Anabilim Dalı hayvan bakım kuralları takip eder. 1. Çözümler <ol><li> Karıştırılarak 1 M NaHCO 3 deiyonize ya kloru giderilmiş H2O L 10, 1 M CaCl2 ve 10 ml 10 ml ekleyin: 10 L &quot;kurbağa suyu&quot; emin olun. </li><li> 1 L% 20 paraformaldehid Üyeler: 4 mM Na 2 1 L CO 3 yapın. Kimyasal bir kaput çözünmesi yaklaşık 80 o C toz paraformaldehid ve ısı 200 g ekleyin. filtre kağıdı ile serin ve filtre edin. Dikkat: paraformaldehit toksik ve dikkatle ele alınması gerekir. Alternatif olarak, ticari paraformaldehit çözümü satın. </li><li> 1 L amfibi anestezik çözüm olun: etil 3-aminoben 1.5 g ekleyin1 L kurbağa suya zoate metansülfonat. Oda sıcaklığında saklayınız. </li><li> Yap 1 L oosit kültür ortamı OR2 14: 82.5 mM NaCI, 2.5 mM KCI, 1 mM CaCl2, 1 mM MgCl2, 1 mM Na 2 HPO 4, 5 mM HEPES (500 mM stok, pH 8.3). Nihai pH yaklaşık pH 7.8 olacaktır. bakteri gelişimini önlemek için 100 mg ampisilin ve 100 mg streptomisin ekleyin. </li><li> 1 L GV yalıtım çözeltisi yapmak: 83 mM KCI, 17 mM NaCI, 6.5 mM Na-2 HPO 4, 3.5 mM KH 2 PO 4, 1 mM MgCl2, 1 mM ditiotreitol (DTT). pH 7.0 ayarlayın. </li><li> 100 mL GV dispersiyon çözeltisi yapmak: 20.7 mM KCI, 4.3 mM NaCI, 1.6 mM Na-2 HPO 4, 0.9 mM KH 2 PO 4, 1 mM MgCl2, 1 mM ditiotreitol (DTT),% 0.1 paraformaldehit. pH 7.0 ayarlayın. Nükleer jel daha hızlı dağılmasını kolaylaştırmak için, 10-50 uM CaCl2 ilave edin. </li><li> 500 mL subbing çözüm olun. 2 ticari jelatinin Şişme 0.5 g10 dakika - 5 0 mL H2O. 500 mL kaynar H 2 O ekleyin ve dikkatlice jelatin çözmek için girdap. Serin ve ekleme 50 mg crk (SO 4) 2 · 12 H 2 O 4 o C&#39;de emme ve mağaza ile Filtre </li><li> orta montaj 10 ml olun. 5 ml PBS içerisinde 10 mg fenilendiamin çözülür (135 mM NaCI, 2.5 mM KCI, 4.3 mM Na 2 HPO 4, 1.5 mM KH 2 PO 4, pH 9&#39;a ayarlanmıştır). 5 ml gliserol ekleyin. C o -80 250 ul alikotları saklayın </li></ol> 2. Malzemeler <ol><li> Altyazılı slaytlar için, yer 3 inç x 1 inç cam mikroskop ticari bir deterjan çözeltisi içinde kayar ve herhangi bir kirleri çıkarmak için onları ovmak. slayt rafa yerleştirilir ve daha sonra deiyonize su içinde musluk suyu ile durulayın. , Subbing çözeltide slaytlar daldırma bir açıyla drenaj ve 60 o C&#39;de gece boyunca fırında </li><li> Plastik kareler için, 1 mm kalınlığında poli (metil metakrilat) bir tabaka 25 mm&#39;lik kareler kesilir. Matkap birHer bir karenin merkezinde 5 mm yuvarlak delik. Kum yüzleri ve meydanda yanı sıra deliğin çevresi kenarları hem. Not: bir sonraki paragrafta tarif edildiği gibi, plastik kareler ve de slaytlar yapımı için bir başka seçenek olarak, in situ, PCR ve hibridizasyon odaları (25 uL) ticari bir yapıştırıcı kullanır. Bu iyice henüz test edilmemiş olmasına rağmen bir olasılıkla da, hücre kültürü için yeniden kullanılabilir silikon izolatörleri kullanabilirsiniz. </li><li> Sıcak bir plaka üzerinde 50 ml bir cam beher içinde - (57 o C 56) parafın balmumu 30 g - de slaytlar için 20 eritebilir. Bir 20 uL pipet ile, altyazılı slayt merkezinin her iki tarafında parafin biri 5 uL damla yayıldı. parafin içine plastik bir kare basın ve sıcak plaka üzerine slayt yerleştirin. parafin eriyecek ve plastik meydanda altında yayılır gerekir. <ol><li> Sıcak plaka slayt çıkarın ve soğumaya bırakın. sürgünün her iki ucunda küçük bir destek yer, çok kayar tabl temas etmezsoğutma işlemi sırasında ETOP. parafin çok hızlı soğur, o uzakta merkezi delikten çekebilir. 10 veya daha fazla kuyu slaytlar hazırlayın: Her GV hazırlığı yeni bir kuyu slayt kullanır. </li></ol></li><li> santrifüj için slayt taşıyıcıları için, özel olarak kullanılan rotor için taşıyıcılar inşa kullanın. iyi plastik plakalar - Çeşitli üreticilerin 96 için taşıyıcılarla santrifüjler sağlar. Bu firmalar mikroskop slaytlar tutmak için oldukça kolay adapte edilebilir. </li></ol> Oosit 3. İzolasyon <ol><li> Tamamen hayvan karşılamak için yeterli anestezi çözelti içinde Yetişkin bir dişi kurbağa (Xenopus laevis veya Xenopus tropicalis) ya da semenderleri (Ambystoma mexicanum) yerleştirin. hayvan hareketlerini kesildiğinde, o uygun bir kaba yontma buz bir yatakta karın-up yerleştirin. </li><li> cerrahi makas 2 yapmak ile - alt karın bölgesinde 3 cm&#39;lik bir kesi orta hat lateral. (Th kesi tarafında yumurtalık bulmak için yavaşça kenara iç organları Taşıere iki Yumurtalıklar, karnın her iki tarafında bir) bulunmaktadır. Planlanan deneyler için yeterli oosit ile yumurtalığın bir kısmını kesip. oosit binlerce her yumurtalıkta olduğu için, yumurtalık, nispeten küçük bir parça (1-3 cm), genellikle yeterli olacaktır. </li><li> bir ya da daha, oda sıcaklığında büyük bir petri (100 mm) OR2 tuz yumurtalığın birkaç parça yerleştirin. zarar oositin çıkarılması durumunda Oositler, birkaç gün boyunca iyi durumda saklanabilir ve OR2 çözeltisi günlük olarak değiştirildi. </li><li> cerrahi ipek ile kesi dikin ve kurtarma için tek bir cam kase hayvan dönün. bu bilinç (yaklaşık 15 dk) kavuşur kadar hayvan karşılamak için yeterli &quot;kurbağa suyu&quot; ekleyin. Hayvan istemli hareketlerin gösterir sonra, su ile kase doldurun. tatlı su kullanılmalıdır rağmen amfibi ameliyat sonrası enfekte neredeyse asla, kısırlık, gerekli değildir. Arzu edildiği takdirde, neomisin dikiş uygulanabilir. Yara genellikle fe sonra tamamen iyileşirw günler ve aynı hayvan yaklaşık 2 ay sonra tekrar kullanılabilir. </li></ol> Bir torbacığı (GV) 4. Yalıtım <ol><li> OR2 solüsyonu içeren küçük bir petri (35 x 10 mm) - (20 büyük oosit 10) yumurtalık bir kısmını yerleştirin. </li><li> yumurtalık duvara oosit bağlayan doku ince sapı gözyaşı 5. kuyumcu forseps iki çift kullanarak yumurtalıktan bir oosit çıkarın. GV izolasyon ortamı içeren başka bir küçük petri oosit yerleştirin. NOT: LBCs devlet oosit büyüklüğü (vade) bağlıdır. LBCs tam boyutunda biraz daha az olan oosit belirgin döngüler ile maksimum uzunluğa ulaştıracak. en olgun oosit genellikle sözleşmeli döngüler ile kısa kromozom içerir. </li><li> bir diseksiyon mikroskobu (- 20 mm alan çapı yaklaşık 10) düşük büyütme altında aşağıdaki adımları uygulayın. <ol><li> hayvan kutup (koyu yarıküre) yakın forseps iki çift ile oosit kavramak ve bir sm yapmakTüm gözyaşı. şeffaf oosit çekirdeğinde için çekilmiş sarısı bak, ayrıca germinal vezikül veya GV denir. </li><li> Alternatif olarak, forseps bir çift ile hayvan kutbuna yakın büyük bir delik kurcalamak ve yavaşça sarısı (Şekil 2) ile birlikte GV sıkmak. </li><li> Nazikçe sarısı kütlesinden GV yuvarlayın. Genellikle GV sıkıca yapışık sarısı küçük bir miktar olacaktır. </li></ol></li></ol> Nükleer Zarf 5. Kaldırma <ol><li> X. laevis ve X tropicalis için, hala biraz yapışkan sarı olsa bile, izolasyon 60 saniye içinde yayılma ortamına izolasyon ortamından GV aktarın. Not: İzolasyon ortamı içinde ayrıldı ve daha sonraki kademelerde yayılmamış eğer GV, bu iki türün yaklaşık 60 saniye içinde &quot;sertleşmeye&quot;. Xenopus GV içeriğini inceleyerek nedenle hız büyük önem taşımaktadır. <ol><li> bir çift ile GV üst kısmına yakın nükleer zarf kavramakkuyumcu forseps, özen aşağı basmamaya. mümkün olduğunca ilk olarak yakın forseps ikinci bir çift ile zarfı kavrayın. Birbirlerinden uzakta ve GV içerikleri bir veya her iki forseps sıkıca yapışır zarf, dışarı özgür &quot;pop&quot; yapacaklarını forseps iki çift çekin. </li><li> bir cam pipet GV içeriklerini veya ayarlanabilir 20 uL mikropipet Pick up. ayarlanabilir bir pipet kullanarak ise, 10 ul pipet ayarlamak ve jilet plastik ucunun ucu kesilmiş. Kalan 5 uL GV çekme önce sıvı 5 ul çizin. </li><li> Daha önce çözüm yayılan dolu bir kuyu slayt merkezine hala jölelenmişti nükleer içeriğini aktarmak. Lamel eklendiğinde bir baloncuk tuzak değildir, böylece yayılan çözeltisi dışbükey bir yüzeye sahip olmalıdır. </li><li> Bir lamel (18 mm) ekleyin ve nemli bir odada slayt yerleştirin. Nükleer jel yavaş yavaş önümüzdeki 10 üzerinde dağılacaktır - 60 dakika böylece kromozomlar ve nükleer organelleri cam slayt yüzeyinde yalan geliyor. NOT: semenderlerin A. mexicanum ve GV ve N. viridescens haksız yere izolasyon ortamında &quot;sertleşmesine&quot; yoktur. Bu nedenle bir Xenopus ile bir can daha nükleer zarfın kaldırılması ile daha yavaş devam edebilirsiniz. </li></ol></li><li> Bölüm 5.1.1 de tarif edildiği gibi bir semender GV nükleer zarfı kaldırma fakat izolasyon ortamında yaparlar. <ol><li> Bir pipet yardımıyla hafifçe jölelenmişti GV içeriğini Pick up ve yayılma çözeltisi içeren bir petri transfer. </li><li> Çabuk, yayma çözeltide pipet yıkayın nükleer jel pick up ve daha önce çözüm yayılan dolu bir kuyu slayt ortasına yerleştirin. 18 mm&#39;lik bir örtücü cam ekleyin ve nemli bir odada bütün slayt yerleştirin. Nükleer özsuyu yavaş yavaş önümüzdeki 10 üzerinde dağılacaktır - 60 dakika ve kromozomlar ve nükleer organelleri cam yüzeye yalan gelecektir. </li> &lt;/ Ol&gt; </li></ol> LBCs ve Organellerin 6. Ön Gözlem <ol><li> yayma odasında nükleer içeriğinin dağıtılması sonrasında düşük büyütme faz kontrast (konvansiyonel dik mikroskop) tarafından LBCs ve nükleer organelleri görüntüleyin. (- 10X 5X) odası yaklaşık 1 mm derinliğinde ve nükleer içeriği altta olduğundan, uzun bir çalışma mesafesi ile düşük büyütmeli objektif kullanın. NOT: Şu anda hazırlık incelenmesi için başlıca nedeni sonraki adımlarda taşıyan değer olup olmadığını tespit etmektir. İyi bir hazırlık içinde kromozomlar kırılmamış ve odasının tabanına yerleşmiştir. Bu slayt lampbrush kromozom döngüler optimal eki sağlayacak şekilde, hazırlık yapma bir saat içinde santrifüj adıma geçin. </li></ol> Nükleer İçindekiler 7. Santrifüj <ol><li> lamel filtre bir parça kağıt yerleştirin ve bastırınbölmeden fazla sıvının çıkması için. </li><li> Lamel her iki tarafında vazelin yaklaşık olarak 1 mm3 koyun. Altta yatan plastik kare üzerine lamel mühür 80 o C - 70 ısıtılmış bir metal çubuk ile vazelin eritin. </li><li> Yeri santrifüj için slayt taşıyıcılarında slaytlar, yapım emin zıt taşıyıcılar dengelenmiştir. 1 saat - 30 dakika için yaklaşık 4800 xg&#39;de slaytlar santrifüj. 4 o C Kullanımı santrifüj yavaş start özelliği de. </li></ol> 8. Nükleer İçeriği Tespit <ol><li> En sonraki prosedürler için, paraformaldehid ile nükleer içeriğini düzeltmek. </li><li> Standart bir mikroskop lamı boyama çanak içine bir slayt rafa koymak ve daha sonra rafa ayrı ayrı slaytlar yerleştirin. (- OR2 veya PBS içinde% 4 paraformaldehid 2) slaytlar karşılamak için yeterli fiksatif ekleyin. </li><li> Künt forseps bir çift ile yanal lamel itin pick up ve uygun cam çöpe atın.30 dakika - en az 15 için sabitleştirici slaytlar bırakın. In situ hibridizasyon ve en antikor lekeleri, tespitin daha uzun süreler (h veya d) izin verilir. </li><li> plastik kare çıkarmak için, bir yerde bir boyama çanak buz içine bir seferde soğuk OR2 veya PBS bir tane slaytlar. plastik meydanın kenarında keskin bir jilet bıçağı yerleştirin ve Çıkarmak. NOT: İdeal plastik, temiz dökülmek slayt tüm parafin bırakarak olacaktır. Balmumu yararlı bir amaca hizmet eder: nükleer içeriği slayt bağlı olan küçük orta alanı çevreleyen beri, bu küçük hacimleri ile çalışmaya olanak sağlayan bir baraj gibi davranır - vb immün, için ayıraç (5 10 uL). Slaytlar soğuk OR2 veya PBS içinde süresiz yapılabilir. </li></ol> LBCs ve Nükleer Organellerin 9. immün <ol><li> OR2 veya PBS depolama sabit GV hazırlık çıkarın. nemli bir odaya destekler üzerinde aşırı sıvı ve yeri silin. Uygun bir odacıklıer nemli filtre kağıdı 90 mm daire içeren bir 90 x 15 mm petri olduğunu. NOT: Bu noktada, çekirdek içindeki sıkı parafin mumu bilgilerini 5 mm dairesel bir alanda sürgüye bağlıdır. mum su itici olduğundan, bir ekleme ve 20 uL pipet ile orta alanda kenarına sıvı küçük miktarlarda kaldırarak çözüm değiştirebilirsiniz. büyük önlem pipet ile balmumu içermeyen alana dokunmamak için olduğunu. </li><li> reaktiflerin - (20 uL 10), küçük hacimleri ile immün yürütmek. kromozomlar ve nükleer organelleri çok küçük ve ilave edilen belirteçlerle veya hemen temas içinde olduğu için, boyama protokolleri kısa olabilir. Primer ve sekonder antikor boyama süreleri 1 saat ya da daha az gibi kısa olabilir. Bu hazırlık hasara neden olur gibi herhangi bir aşamada deterjan dahil etmeyin. LBCs eksenleri vurgulamak için 20 dakika - Arzu edildiği takdirde, 10 DAPI ile hazırlanması (1 ug / mL) boyanır. </li><li> gliserol Mount veya ticari montajimmünofloresan orta uygun ing. Montaj aşaması sırasında hava kabarcığı yakalama önlemek için, aşağıdaki gibi devam edin. <ol><li> 20 mcL pipet ucu içine montaj orta 15 mcL çekin. (# 1 filtre kağıdı bir 90 mm daireden çok ince üçgen şeklinde kesilmiş) filtre kağıt parçası ile kapalı &quot;esneklik&quot; hemen nükleer yayılma çevresi itibaren çok sıvı mümkün olduğunca kaldırın. </li><li> Nükleer yayılma alanını dokunmamaya dikkat ederek, hazırlık üzerine montaj orta çoğu pipetle. son 1 mcL yerleştirin veya 22 mm lamel (kalınlık # 1.5) merkezinde montaj orta böylece. hazırlık üzerine lamel ters çevirin ve yerine dikkatlice bırakın. </li><li> Geçici bağlar için, bir kaç güne kadar,% 50 gliserol içinde 1 mg / ml fenilendiamin kullanımı. Kalıcı bağlar için, özellikle de superresolution çalışmaları için yaklaşık 1.46 bir kırınım indisi için sertleştirilen bir düşük floresan ortamını kullanmak. </li></ol></li></ol> Situ Hibridizasyon (FISH) LBCs ve Nükleer Organellerin 10. Floresan <ol><li> BALIK protokolleri genellikle yüksek bir sıcaklıkta bir adım gerektirdiğinden, preparattan parafin çıkarın. prosedür sıkıcı ve hazırlık kazara hasarlara yol açabilir, ancak dikkatli bir jilet ile kazımak. Bir elmas noktası ile arka yüze hazırlama alanı işaretlemek için yararlıdır. <ol><li> Seçenek olarak ise, ksilen, parafin mumu çözülür. Coplin kavanoz veya içeren boyama yemekleri bir dizi ayarlama:% 30,% 50,% 70,% 95, ve% 100 etanol; ksilen 3 kaplar; % 100 etanol ve bir aseton 2 daha fazla konteyner. </li><li> (Ajite ise kısa süreler) 5 dakika, her konsantrasyonda - slayt taşıyıcı slaytlar yerleştirin ve 3 slaytlar bırakarak, etanol serisinde bunları kurutmak. </li><li> ksilen 3 kapların içinden slaytlar geçirerek parafin çözülür, yaklaşık 5 dakika her ajite ise. Kaldırİki% 100 etanoller geçirilerek ksilen ve son olarak da aseton ile etanol çıkarıldı. aseton slaytları alın ve kuruması için onları eğin. </li></ol></li><li> Herhangi bir standart protokolü kullanılarak in situ melezleme yürütmek. 15,16 </li></ol> Petrol altında GV 11. İzolasyonu <ol><li> Mümkün olduğunca az çevreleyen dokuda da dahil olmak üzere, kuyumcu forseps ile OR2 çözümünden bir oosit pick up. # 1 filtre kağıdı küçük bir parça üzerinde oosit yerleştirin. Aşırı OR2 çözüm sıvının neredeyse serbest oosit bırakarak, filtre kağıdına aktarılır. &quot;Kuru&quot; oosit pick up ve küçük bir petri (35 x 10 mm) hafif mineral yağ (parafin yağı) yüzeyinin altına yerleştirin. <ol><li> ince bir tungsten iğne veya forseps bir tine ile, karanlık hayvan kutup yakın oosit küçük bir delik açmak. (Ipuçları kaçınarak) forseps bir çift ile oosit pick up ve yavaşça sıkın. GV daha küçük veya l ile birlikte a&#39;ya olacakYüzeyinde sarısı Arger miktarı (Şekil 3). </li><li> yavaşça forseps yüzü GV süpürülerek mümkün olduğu kadar çok yumurta sarısı çıkarın. Çoğu durumda sarısı kaldırmak için zor olur. Bununla birlikte, bir çok amaç için sarısı bir miktar bir sorun değildir. </li></ol></li><li> GV içeriğini gözlemlemek için, az ya da çok ölçüde GV dümdüz. <ol><li> iyi slayt plastik kare çıkarın ve parafin yağı için sığ bir kap olarak kalan parafin kullanın. 10 20 uL pipet parafin yağı ile birlikte GV Pick up ve parafin alanının merkezine transfer. lamel ekleyin ve kısmen düzleşmiş GV içeriğini inceleyin. Bu teknik LBCs zarar vermez. </li></ol></li><li> Alternatif olarak, nükleer organellerin gözlem için yaklaşık 10 mikron kalınlığına GV dümdüz. <ol><li> keskin bir jilet ile bir plastik pipet son 1 mm kesti. içine GV Suckmineral yağ tam 5 uL ile birlikte ucu. 22 mm cam lamel merkezi üzerine GV ve tüm yağ a&#39;ya. </li><li> Sadece petrol damla temas edene kadar yavaşça standart 3 &quot;x 1&quot; cam slayt indirin. damla ve lamel kılcallık yoluyla kalkacak ve petrol lamel kenarlarına yayılacak. damla tamamen yayıldı, petrol yaklaşık 10 mikron kalınlığında olacaktır. LBCs hasar görecek ve büyük nükleol hafifçe sıkıştırılır, ancak sağlam GV (Şekil 3) mevcut gibi küçük nükleer organellerin çoğu az ya da çok görünür. </li></ol></li></ol>

<ol><li>Purkinje, J. E. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aPurkinje%2C+JE+%22Symbolae+ad+ovi+avium+historiam+ante+incubationem%22">Symbolae ad ovi avium historiam ante incubationem</a>. , Leopold Vossi. (1830).</li>
<li>Rückert, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zur+Entwickelungsgeschichte+des+Ovarialeies+bei+Selachiern%5BTitle%5D)+AND+%22Anat.+Anz%22%5BJournal%5D)">Zur Entwickelungsgeschichte des Ovarialeies bei Selachiern.</a> Anat. Anz. 7, 107-158 (1892).</li>
<li>Callan, H. G. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aCallan%2C+HG+%22Lampbrush+Chromosomes%22">Lampbrush Chromosomes</a>. 36, Springer-Verlag. (1986).</li>
<li>Gall, J. G., Callan, H. G., Wu, Z., Murphy, C. Lampbrush chromosomes. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aGall%2C+JG+%22Xenopus+laevis%3A+Practical+Uses+in+Cell+and+Molecular+Biology%22">Xenopus laevis: Practical Uses in Cell and Molecular Biology</a>. Kay, B. K., Peng, H. B. Vol. 36 Methods in Cell Biology , Academic Press. 149-166 (1991).</li>
<li>Gall, J. G., Wu, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Examining+the+contents+of+isolated+Xenopus+germinal+vesicles%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">Examining the contents of isolated Xenopus germinal vesicles.</a> Methods. 51, 45-51 (2010).</li>
<li>Penrad-Mobayed, M., Kanhoush, R., Perrin, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tips+and+tricks+for+preparing+lampbrush+chromosome+spreads+from+Xenopus+tropicalis+oocytes%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">Tips and tricks for preparing lampbrush chromosome spreads from Xenopus tropicalis oocytes.</a> Methods. 51, 37-44 (2010).</li>
<li>Morgan, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Working+with+oocyte+nuclei%3A+cytological+preparations+of+active+chromatin+and+nuclear+bodies+from+amphibian+germinal+vesicles%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol.+Biol%22%5BJournal%5D)">Working with oocyte nuclei: cytological preparations of active chromatin and nuclear bodies from amphibian germinal vesicles.</a> Methods Mol. Biol. 463, 55-66 (2008).</li>
<li>Paine, P. L., Johnson, M. E., Lau, Y. T., Tluczek, L. J., Miller, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+oocyte+nucleus+isolated+in+oil+retains+in+vivo+structure+and+functions%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechniques%22%5BJournal%5D)">The oocyte nucleus isolated in oil retains in vivo structure and functions.</a> Biotechniques. 13, 238-246 (1992).</li>
<li>Handwerger, K. E., Cordero, J. A., Gall, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cajal+bodies%2C+nucleoli%2C+and+speckles+in+the+Xenopus+oocyte+nucleus+have+a+low-density%2C+sponge-like+structure%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Biol+Cell%22%5BJournal%5D)">Cajal bodies, nucleoli, and speckles in the Xenopus oocyte nucleus have a low-density, sponge-like structure.</a> Mol Biol Cell. 16, 202-211 (2005).</li>
<li>Patel, S., Novikova, N., Beenders, B., Austin, C., Bellini, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live+images+of+RNA+polymerase+II+transcription+units%5BTitle%5D)+AND+%22Chromosome+Res%22%5BJournal%5D)">Live images of RNA polymerase II transcription units.</a> Chromosome Res. 16, 223-232 (2008).</li>
<li>Gall, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Octagonal+nuclear+pores%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Biol%22%5BJournal%5D)">Octagonal nuclear pores.</a> J Cell Biol. 32, 391-399 (1967).</li>
<li>Löschberger, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Super-resolution+imaging+visualizes+the+eightfold+symmetry+of+gp210+proteins+around+the+nuclear+pore+complex+and+resolves+the+central+channel+with+nanometer+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22J+Cell+Sci%22%5BJournal%5D)">Super-resolution imaging visualizes the eightfold symmetry of gp210 proteins around the nuclear pore complex and resolves the central channel with nanometer resolution.</a> J Cell Sci. 125, 570-575 (2012).</li>
<li>Gottfert, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coaligned+dual-channel+STED+nanoscopy+and+molecular+diffusion+analysis+at+20+nm+resolution%5BTitle%5D)+AND+%22Biophys+J%22%5BJournal%5D)">Coaligned dual-channel STED nanoscopy and molecular diffusion analysis at 20 nm resolution.</a> Biophys J. 105, L01-L03 (2013).</li>
<li>Wallace, R. A., Jared, D. W., Dumont, J. N., Sega, M. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+incorporation+by+isolated+amphibian+oocytes%3A+III.+Optimum+incubation+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Exp.+Zool%22%5BJournal%5D)">Protein incorporation by isolated amphibian oocytes: III. Optimum incubation conditions.</a> J. Exp. Zool. 184, 321-333 (1973).</li>
<li>Bridger, J. Fluorescence in situhybridization to DNA. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBridger%2C+J+%22Cells%3A+A+Laboratory+Manual%22">Cells: A Laboratory Manual</a>. Spector, D. L., Goldman, R. D., Leinwand, L. A. 3, Cold Spring Harbor Press. 111.111-111.136 (1998).</li>
<li>Singer, R. H. In situ hybridization to RNA. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSinger%2C+RH+%22Cells%3A+A+Laboratory+Manual%22">Cells: A Laboratory Manual</a>. Spector, D. L., Goldman, R. D., Leinwand, L. A. 3, Cold Spring Harbor Press. 111-116 (1998).</li>
<li>Gardner, E. J., Nizami, Z. F., Talbot, C. C. Jr, Gall, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stable+intronic+sequence+RNA+%28sisRNA%29%2C+a+new+class+of+noncoding+RNA+from+the+oocyte+nucleus+of+Xenopus+tropicalis%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+Dev%22%5BJournal%5D)">Stable intronic sequence RNA (sisRNA), a new class of noncoding RNA from the oocyte nucleus of Xenopus tropicalis.</a> Genes Dev. 26, 2550-2559 (2012).</li>
<li>Talhouarne, G. J., Gall, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lariat+intronic+RNAs+in+the+cytoplasm+of+Xenopus+tropicalis+oocytes%5BTitle%5D)+AND+%22RNA%22%5BJournal%5D)">Lariat intronic RNAs in the cytoplasm of Xenopus tropicalis oocytes.</a> RNA. 20, 1476-1487 (2014).</li>
<li>Duryee, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Isolation+of+nuclei+and+non-mitotic+chromosome+pairs+from+frog+eggs%5BTitle%5D)+AND+%22Arch.+Exp.+Zellforsch%22%5BJournal%5D)">Isolation of nuclei and non-mitotic chromosome pairs from frog eggs.</a> Arch. Exp. Zellforsch. 19, 171-176 (1937).</li>
</ol>

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.

Kurbağalar ve salamanders el-izole GVs gelen &quot;yaşam&quot; LBCs ilk gözlemler floresan immün önce ve FISH önce, Amerikan biyolog William Duryee, faz kontrast ve DIC mikroskopi giriş önce 19 tarafından yaklaşık 80 yıl önce yapılmıştır. gerçekçi bir şekilde bunları düzeltmek için, ve temel morfolojisi bozmadan moleküler teknikler uygulamak için, cam slaytlar LBCs takmak için teknikler bireysel gen düzeyinde gerekli gelişimini kromozom yapısı ve transkripsiyon detaylarını araştırmak için LBCs avantajları. Bu...

Çoğu omurgalıların, keseliler ve plasentalı memelilerin önemli hariç, büyük yolky yumurta üretmek. onların bazen muazzam boyutlarına rağmen, bu yumurtalar dişi yumurtalıkta ise hala nihai bir boyut ulaşmak tek hücrelerdir. Yumurtalık yumurta oosit denir ve her biri tipik sadece germinal vezikül veya GV gibi erken 19. yüzyıldan beri bilinen tek ve dev bir çekirdeğe içerir. Ortak laboratuvar kurbağalar, Xenopus laevis ve Xenopus tropicalis 1 Oositler, 1.2 mm ve 0.8 mm sırasıyla (Şekil 1) bir maksimal çapı ulaşır. Çapı 0.4 mm (Şekil 2, 3) - Bu iki kurbağa olgun oosit gelen GV 0.3 vardır. Salamanders genellikle daha büyük oosit ve GVS var. Meksika Axolotl, Ambystoma mexicanum Tamamen olgun oosit, çapı en fazla 2 mm ve GV 0.5 mm&#39;dir. Bu durumda, bu çekirdekler çıplak göz ve kutu kolaylıkla görebilirTipik somatik hücre çekirdekleri ile imkansız birçok yönden manipüle edilebilir. Eşit olağanüstü GV, 19. yüzyılın sonunda zaten tanınan bir gerçeği içinde kromozomların dev boyutudur. Ambystoma ve diğer semender Bireysel kromozom uzunluğu en fazla 1 mm (Şekil 4, 5) olabilir. 100 um veya daha fazla uzunluğa sahip, en organizmaların normal somatik kromozom cüce, ancak Xenopus olanlar, daha küçük önemli bulunmaktadır. Eşleştirilmiş yanal döngüler yüzlerce (Şekil 5) - oosit kromozom önemli bir özelliği onların en karakteristik morfolojik özelliklerinden biri neden olağanüstü transkripsiyonel aktivite vardır. Her döngü aktif RNA sentez, bir ya da bir kaç transkripsiyon birimi içerir. döngüler oosit onların yüzeysel sonra adı &quot;lampbrush&quot; kromozomun yol açan bir bulanık bir görünüm, kromozom vermekgaz lambası bacaları temizlemek için önceki zamanlarda kullanılan fırçalara benzerliği. 2 Bu çalışmanın odak LBCs ve nükleer organelleri (nükleol, histon eğrisi organları ve benekleri) incelemek için izole GVs kullanımı üzerindedir. İki oldukça farklı teknikler tarif edilecektir. İlk olarak, daha yaygın teknikte, GVs kısa yapışık sarısı uzaklaştırılması için yıkanır, takı forseps kullanılarak bir tuzlu su çözeltisi içinde izole edilmiştir ve çekirdek zarı takı forseps ile tekrar çıkartılır. LBCs ve nükleer organelleri içeren jelatinli içeriği, bir cam mikroskop lamı veya lamel üzerine yerleşmek için izin verilir. Bu gibi terkipler, faz kontrastı ya da DIC mikroskop ile doğrudan incelenebilir. Seçenek olarak ise, preparatlar slayt veya lamel LBCs ve organeller takmak için santrifüj olabilir. Bu gibi preparasyonlar, başta, bağışıklık ve flüoresan olarak, nükleik asitlerin ve proteinlerin ayrıntılı moleküler analiz için işlenebilirin situ hibridizasyon (FISH) t. 3-7 İkinci bir teknik, mineral yağ içinde GV izole edilmesini gerektirmektedir. 8 Yağ izole GVs saatlerce transkripsiyonal olarak aktif kalır ve bir çekirdek içindeki mümkün olduğu kadar gerçekçi olmasını isteyen çalışmalar için potansiyel olarak yararlıdır. Nükleer &quot;sap&quot; kırılma indeksi LBCs ve diğer nükleer organellerin (Şekil 3) birbirine çok yakın olduğu için 9,10, mikroskobik teknikler yağ izole GVs ile bir sorun olabilir. Son olarak, çünkü boyutu ve manipülasyon kolaylığı, GVs çekirdek zarfına ilgili çalışmalar için ideal bir malzemedir. Nükleer gözenek kompleksi ilk amfibi GV zarf 11 ve daha yeni superresolution gözlemlere elektron mikroskobik çalışmalar açıklanan aynı malzemeyi kullandık. 12,13

<table><tbody><tr><td>Paraformaldehit (reaktif sınıfı, kristalli)</td> <td>Sigma-Aldrich</td><td>P6148-500G</td><td>Birçok protokoldeki uyarılara rağmen, konsantre bir çözelti RT'de süresiz olarak saklanabilir</td></tr><tr><td>Etil 3-aminobenzoat metansülfonat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A5040-100G</td><td>Bazen MS-222</td></tr><tr><td>Ethicon RB-1 1/2 daire konik nokta 3-0 sütürler</td><td>VWR ve nbsp olarak</td> anılır;<td>95057-000</td><td></td></tr><tr><td>Paraplast (parafin mumu)</td> <td>Sigma-Aldrich</td><td>P3558-1KG</td><td></td></tr><<tr><td>em>p-Fenilendiamin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P6001</td><td></td></tr><tr><td>Jelatin</td><td>Bakkal</td><td></td><td>Ticari Knox jelatin iyi çalışıyor</td></tr><tr><td>ProLong Gold antifade mountant</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>P10144</td><td></td></tr><tr><td>Altın Mühür kapak camı&nbsp; 22 x 22 mm # 1 1/2 (0.16 - 0.19 mm kalınlık)</td> <td>Elektron Mikroskobu Bilimleri</td><td>63786-01</td><td>Bu lameller süper çözünürlüklü mikroskopi için önerilen kalınlıktır</td></tr><tr><td>Dumont forseps #5</td><td>Elektron Mikroskobu Bilimleri</td><td>72700-D</td><td>http://www.emsdiasum.com/microscopy/products/tweezers/dumont_positive_action.aspx</td></tr><tr><td>Parafin yağı (hafif)&nbsp;</td><td>EMD Chemicals</td><td>PX0047-1</td> Yağ Yapıştırıcı in situ PCR ve hibridizasyon odalarında <td>GV'leri izole etmek için</td></tr><tr><td>(25 & L)</td> <td>BioRad</td><td>Frame-Seal Kaydırma Odaları #SLF0201</td><td>http://www.bio-rad.com/en-us/sku/slf0201-frame-seal-slide-chambers</td></tr><tr><td>Silikon izolatörler</td><td>Grace-Biolabs</td><td>katalog bağlantısından seçin</td><td>http://www.gracebio.com/life-science-products/microfluidics/silicone-isolators.html</td></tr><tr><td>Coplin kavanozları ve boyama kapları</td><td>Elektron Mikroskobu Bilimleri</td><td>katalog bağlantısından</td> <td>seçinhttp://www.emsdiasum.com/microscopy/products/histology/staining.aspx</td></tr></tbody></table>

kurbağalar ve salamanderler yaşayan oositlerinin dev lampbrush kromozomların İzolasyonu

Isolation of Giant Lampbrush Chromosomes from Living Oocytes of Frogs and Salamanders

Biz kurbağa ve semender ve oosit ya da unlaid yumurta, bulunan dev transkripsiyonel olarak aktif lampbrush kromozom (LBCs) çalışmak için yöntemler açıklanmaktadır. Bağımsız LBCs uzunluğu en fazla 1 mm olabilir ve çapı 0.5 mm, dev bir çekirdekte kendisini bulunur. kromozomların büyük boyutlu ışık optik mikroskop ile aktif genlerin eşsiz gözlemleri izin, ama aynı zamanda özel teknikler, çekirdeğin izole nükleer zarfı kaldırarak ve bir mikroskop lamı üzerine kromozom yaymak için gereklidir. Ayrıca, germinal vesicle (GV) olarak adlandırılan oosit çekirdeği, çekirdek aktin kısmi jelleşme izin verir ve LBCs hassas yapısını koruyan bir ortamda izole edilir. Bu adım kuyumcuya forseps kullanarak bir mikroskop altında elle yapılır. Sonraki nükleer zarf kuyumcu forseps ile tekrar el kaldırılır. çekirdek içindeki hızlı bir şekilde dağılma, bir ortama transfer ediliraktin jel RBDÖ ve hasarsız LBCs bir mikroskop lamı üzerine yerleşmek için izin verir. ince ayrıntılar Brown hareketi tarafından gizlenmiş olmasına rağmen bu noktada LBCs ve diğer nükleer organeller, faz kontrast veya diferansiyel girişim kontrast mikroskobu ile görülebilir. yüksek çözünürlüklü mikroskobik gözlem veya moleküler analiz için, tüm hazırlık slayt sıkıca hassas LBCs takmak için santrifüj edilir. Paraformaldehid kısa tespit sonra immunofluorescent boyama ya da in situ hibridizasyon takip edilir. LBCs bir transkripsiyonel olarak aktif durumda olan ve onların büyük boy konfokal ya da süper çözünürlük mikroskopi kullanılarak bireysel gen düzeyinde moleküler analiz izin verir.

Dev lampbrush kromozomlarını inceleyen bir kurbağa ya da semender oosit izole ederek başlar. Şekil 1, kurbağa, Xenopus överden çıkarıldıktan sonra tamponlu tuzlu su çözeltisi içinde, olgun oosit, bir grubu gösterir. Bu oositler, oda sıcaklığında gün iyi durumda kalır. Çekirdeği (ya da germinal vesicle) daha sonra ya bir tuz çözeltisi (Şekil 2) ya da yağ içinde, takı forsepsle bir oosit (Şekil 3) çıkarılır. yağ izole çekirdeğin n...

Biz kurbağa ve semender ve oosit yaşayan dev transkripsiyonel olarak aktif lampbrush kromozomları izole etmek için basit teknikleri sunuyoruz. Biz faz kontrast ya da diferansiyel girişim kontrast ve nasıl situ hibridizasyon veya immunofluorescent boyama floresan için bunları düzeltmek için tarafından &quot;canlı&quot; bu kromozom gözlemlemek açıklanmıştır.

Kurbağalar ve Salamanderler Yaşayan Oositlerinin Dev Lampbrush Kromozomların İzolasyonu

We describe methods for studying the giant transcriptionally active lampbrush chromosomes (LBCs) found in the oocyte, or unlaid egg, of frogs and ...

Bu prosedürün genel amacı, bir amfibi oositinden dev çekirdeği veya germinal vezikülü izole etmek ve fırça tipi (lampbrush) kromozomlar ile diğer nükleer organelleri; immünboyama, in situ hibridizasyon ve diğer moleküler teknikler için bir mikroskop lamı üzerine yaymaktır. Bu yöntem; kromozomların, nukleolusların ve diğer nükleer organellerin temel yapısının yanı sıra transkripsiyon, splicing ve RNA ihracının moleküler detaylarına ilişkin temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Bu tekniğin temel avantajı, kromozom yapısının ve transkripsiyonun; immunofloresan, in situ hibridizasyon ve diğer moleküler teknikler kullanılarak geleneksel ışık mikroskopisi ile kolayca incelenebilmesidir.Prosedürü, laboratuvarımdan bir doktora sonrası araştırmacı olan Dr. Zehra Nizami gerçekleştirecek. Gerekli tüm çözeltiler hazırlandıktan sonra, metin protokolünde tartışıldığı üzere, plastik kuyucukların parafinle yapıştırıldığı buzlu cam lamlar kullanılarak kuyu lamlarını hazırlayın. Ardından, daha önce yetişkin bir dişi kurbağadan veya semenderden toplanmış over dokusunu alın ve küçük bir Petri kabını oosit kültür ortamı ile doldurun.İzole edilen dokunun, yaklaşık 10 ila 20 oosit içeren bir

isolation-giant-lampbrush-chromosomes-from-living-oocytes-frogs

Research

JoVE Journal

Genetics

Genetik

Gübrelenmesi Xenopus oositleri Host Transfer Yöntemi kullanılarak

Xenopus embriyonik epitel, epitel morfolojilerinden sırasında kutup geliştirme ve şekil değişikliği gibi hücre davranışlarını incelemek için ideal bir model sistem . Geleneksel sabit örnekleri histoloji giderek canlı hücre konfokal görüntüleme tarafından tamamlanmaktadır. Burada, kurbağa dokularda izole ve canlı hücre konfokal mikroskopi kullanılarak canlı epitel hücreleri ve hücre iskeletinin görselleştirmek için yöntemler göstermektedir.

Canlı hücre Görüntüleme ve Kantitatif Analiz Embriyonik Epitel Hücreleri Xenopus laevis</em

Biz tek hücreleri üzerinde floresan kullanarak yapı değişiklikleri siteye özgü analizi ile birlikte membran proteinlerinin iyon taşıma kinetiği ölçen bir yöntem anlatacağım. Bu teknik, iyon kanalları ve iyon pompaları uyarlanabilir ve protein altbirimden arasındaki mesafe sınırlamaları belirlemek için kullanılabilir.

Membran Proteinleri Konformasyonel Dynamics incelenmesi In situ Site Floresan Etiketleme

Bu video embriyonik primer kültürlerinde büyümek için kullanılan prosedürleri...

Eşzamanlı Öncesi ve Sonrası-sinaptik Elektrofizyolojik Recording<em&gt; Xenopus</em&gt; Sinir-kas Co-kültürlerin

Üretimi<em&gt; Xenopus tropicalis</em&gt; Yumurta Mikrotubul ilişkili RNA&#39;lar tanımak ayıklar

Xenopus laevis immatür oositlerini manipüle etme, oositlerin yumurtalara in vitro olgunlaşması ve intrasitoplazmik sperm enjeksiyonu yöntemlerini açıklıyoruz. Bu protokol, bazı maternal proteinlerin bozulmasına ve döllenmede ilgilenilen genlerin aşırı ekspresyonuna izin verir ve bu nedenle erken embriyonik gelişimde spesifik faktörlerin rollerini incelemek için değerlidir.

Manipülasyon ve<em&gt; İn Vitro</emVe&gt; Olgunlaşma<em&gt; Xenopus laevis</emIntrasitoplazmik sperm enjeksiyonu izledi&gt; oositler, Embriyonik Geliştirme Çalışması

Protein sentezi kontrolü esas olarak translasyon başlatma adımında gerçekleşir, eksiklikler çeşitli bozukluklarla bağlantılıdır. Etiyolojilerini daha iyi anlamak için, burada translasyon başlatma faktörü eIF4G1'in bir mutantının varlığında mos transkriptinin translasyonunu değerlendiren Xenopus laevis oositlerini kullanan bir protokol tanımladık.

Ksenopus Translation Düşüklüğü Belirlemek için Bir Model Olarak laevis

Yüksek derecede sıkıştırılmış mitotik kromatinin deyoğunlaşmasının moleküler mekanizmaları tam olarak tanımlanmamıştır. HeLa hücrelerinden izole edilen mitotik kromatin kümelerine ve in vitro dekondensasyon sürecini aslına uygun olarak yeniden oluşturan Xenopus laevis yumurta ekstraktına dayanan hücresiz bir test sunuyoruz.

Hücre Testi Mitoz Sonu Kromatin dekondenzasyon Eğitim için

Biz petrol su microemulsions içinde Xenopus laevis yumurta özleri Kapsüllenen tarafından vitro kendini sürekli mitotik salınımlarını tek hücre düzeyinde nesil için bir yöntem mevcut.

Microemulsions boş hücre Xenopus yumurtanın hücre döngüsü salınımlarını sulandırma ayıklar

Bir yüksek verimlilik, otomatik, tütün protoplast üretim ve dönüşüm metodolojisi açıklanmıştır. Robotik sistem dışı bir model ürünlere çevrilebilir olmalıdır modeli BY-2 sistemde güçlü paralel gen ifadesi ve keşif sağlar.

Yüksek verim Protoplast İzolasyonu ve Dönüşüm için Robotik Platformu

Öğrenin, kurbağa ve semender oositlerinden dev lamba fırçası kromozomlarını izole etme yöntemini. Bu teknik, transkripsiyon ve RNA dinamiklerini canlı hücrelerde incelemek için kullanılır.

Kurbağalar ve Salamanderler Yaşayan Oositlerinin Dev Lampbrush Kromozomların İzolasyonu

Daha fazla video keşfet