Name: Vitronectin bakteriyel yapışma ve Serum direnç rolü eğitim için deneyleri (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-10-16T12:30:00.000+00:00
Duration: 10 min 55 s
Description: Öğrenin bakteriyel dış membran proteinleri ile vitronektin arasındaki etkileşimleri karakterize etme yöntemlerini. Akış sitometrisi ve ELISA kullanarak konak-patojen etkileşimlerini inceleyin.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

playerTrialDesktop

Bu eser hibe Anna Vakfı ve Edwin Berger, Lars Hierta, O.E. ve Edla Johansson Vakfı, İsveçli Tıbbi Araştırma Konseyi tarafından desteklenmiştir (sayı K2015-57 X-03163-43-4, vermek www.vr.se), kanser Vakfı Üniversitesi'nde Malmö, Physiographical toplum (Forssman'ın Vakfı) ve Skåne County Konseyi araştırma ve Geliştirme Vakfı hastanede.

1. bir bakteri yüzey Protein Ligand olarak Vn Analizi
<ol><li>
Vn-bağlama kullanarak akış sitometresi bakteriyel yüzeyde tespiti Not: akış sitometresi yan dağılım ve ileri dağılım olumlu olaylar kapı yapardık. Yalıtan Vn ile etkileşimleri incelemek için kurulan klinik (n = 10)7 E. coli BL21 ile birlikte seçildi (DE3) negatif kontrol (Şekil 1A) olarak.<ol>
<li>Kültür kurulan klinik beyin-kalp infüzyon (BHI) orta 10 µg/mL NAD ve 200 devir / dakikada sallayarak ile hemin 37 ° C'de ile takıma izole ediyor. Luria-Bertani orta E. coli14kültür için kullanın. Hasat kurulan orta günlük aşamasında (OD600 0,3 =)15ve fosfat tamponlu tuz (PBS), %1 (w/v) Sığır serum albumin (BSA) (engelleme arabellek; içeren pH 7.2, bakterilerde resuspend PBS-BSA). Süspansiyon 10 ayarlamak9 CFU/mL.</li>
		<li>5 x 10-6 CFU 5 mL polistren yuvarlak alt tüpler (12 x 75 mm2) içeren aliquots aktarmak ve engelleme arabellek 1 mL ekleyin. Süspansiyon 3500 × g oda sıcaklığında (RT)16 5 min için de bakteri cips santrifüj kapasitesi, sonra dikkatlice süpernatant Pelet bozmadan kaldırmak için Aspire edin.</li>
		<li>Bakteriyel granül 50 μL engelleme arabelleği içeren 250 ile resuspend nM Vn ve sallayarak olmadan örnekleri RT, 1 h için kuluçkaya. Kuluçka sonra bakteri tarafından Santrifüjü 3.500 x g 5 min için de cips sonra granül üç PBS ve benzer aralıklarla adımları kullanarak kez yıkayın.</li>
		<li>Bakteriyel Pelet için 1: 100 seyreltme PBS-BSA içinde 50 μL birincil koyun anti-insan Vn poliklonal antikorlar (pAbs) ekleyin. RT, 1 h için süspansiyon kuluçkaya sonra bakteri ilişkisiz antikorlar (1.1.3. adımda anlatıldığı gibi) kaldırmak için üç kez PBS ile yıkayın.</li>
		<li>Sonra PBS-BSA içeren floresein isothiocyanate (FITC) 50 μL ekleyin-Birleşik eşek Anti-koyun pAbs (1: 100 seyreltme) ve RT karanlıkta 1 h için kuluçkaya.</li>
		<li>Boş bir denetim sadece tampon ve pAbs Vn olmadan engelleme ile bakteri kuluçka tarafından hazırlayın.</li>
		<li>Üç kez engelleme arabelleği 1 mL ile bakteri yıkama ve süspansiyon Santrifüjü tarafından 1.1.2 bölümünde açıklandığı gibi cips. Son olarak, bakteriyel Pelet PBS 300 µL ile resuspend ve akış sitometresi7tarafından analiz.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Rekombinant PH ve Vn arasındaki etkileşimi ELISA Analizi Not: Denetimleri nonspesifik bağlama dışlamak için dahil edilmesi gerekiyor. İnsan faktörü H (FH) veya C4b bağlayıcı protein (C4BP) sırasıyla pozitif ve negatif denetimleri kullanılır.<ol>
<li>Her biri ayrı ayrı 50'ye insan proteinler (Vn, FH ve C4BP) seyreltik nM Tris-HCl, pH 9.0 (kaplama arabellek) içinde. 100 µL protein çözüm Polysorp microtiter plaka her kuyuya dağıtmak. Plakalar kapak ile kapatın ve microtiter plaka wells 4 ° protein immobilizasyon kolaylaştırmak için C bir gecede (16 h) saklayın.</li>
		<li>Baş aşağı lavabo üzerinde eğerek microtiter plaka çözümden atın ve wells üç kez PBS/iyi 300 µL ile yıkayın. RT %2.5 (w/v) BSA (PBS-BSA) içeren PBS ile 1 h için kaplamalı wells engelleyin.</li>
		<li>Engelleme çözüm kaldırdıktan sonra wells üç kez 300 µL % 0.05 (v/v) ara 20 (PBST) iyi ücret içeren PBS ile yıkayın. O'nun öğesini PH her örnek için iyi ve RT. 1 h için kuluçkaya 50 nM rekombinant 100 µL Ekle Denetim wells, PBS-BSA sadece 100 µL ekleyin. Not: PH üzerinden kurulan kodlama lph gen PCR tarafından güçlendirilmiş ve ifade protein C-terminus adlı bir His 6 × etiketi ekler pET26b ifade vektör içine klonlanmış. Rekombinant vektör E. coli BL21(DE3) ifade için dönüştü. Ni-NTA reçine Rekombinant protein15arındırmak için kullanılmıştır.</li>
		<li>Protein çözüm atın ve ilişkisiz proteinler wells üç kez PBST 300 µL iyi ücret ile yıkayarak çıkarın. PBS-BSA içeren horseradish peroksidaz (HRP) 100 µL eklemek-Anti-O'nun pAbs (1:10, 000 seyreltme) Birleşik ve RT. 1 h için kuluçkaya</li>
		<li>20 mM çözüm A tetramethylbenzidine %5 aseton ve % 45 metanol bir çözümde çözülerek hazırlayın. Çözüm B hazırlamak için 19.2 g sitrik asit H2O 1000 ml geçiyoruz, KOH ekleyerek 4,25 için pH ayarlayın, daha sonra 230 µL % 30 H2O2ekleyin. Her iki çözüm de RT. kararınca saklayın Sadece kullanmadan önce B çözeltinin 500 µL 9.5 mL çözeltisi ELISA algılama reaktif hazırlamak için A ile karıştırın.</li>
		<li>Wells üç kez ile PBST 300 µL başına iyi yıkama ve her şey için 100 µL ELISA algılama reaktif ekleyerek antijen-antikor kompleksleri algılamak.</li>
		<li>Yani 1 M H250 µL eklemek4/well reaksiyonu durdurmak için. Kuyu 450 de optik yoğunluğunu ölçmek Mikroplaka Okuyucu kullanarak nm.</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Etkileşim kinetik rekombinant PH ve saçınıza kullanarak Vn incelenmesi
	<ol>
<li>İnsan Vn kullanarak yöntemi, kaplin amin amin-reaktif sensörlerimizde üreticinin yönergeleri11göre hareketsiz.</li>
		<li>PBS kullanarak, seri olarak 4 µM için 0 (rekombinant PH) ligand sulandırmak ve elde edilen çözümler bir 96-şey siyah, düz-alt microtiter tabağa aktarın. Deneme 30 ° C'de bir BLI enstrüman17kullanarak çalıştırın.</li>
		<li>ALMA verileri analiz yazılımı veri klasörü yükleyin. 'Sensör seçimi' seçeneğini belirleyin. O zaman, seçme 'iyi '(Vn kaplı sensör PBS) için referans çıkarma.</li>
		<li>'Temel y ekseni Hizala' ve 'düzeltme interstep ve derneğe Hizala'seçin. Basın 'otomatik olarak analiz sekmesi açılır işlem veri'.</li>
		<li>Analiz sekmesi altında eğri uydurma 'Derneği ve ayrılma' seçeneğini belirleyin. Modeli seçin ' 1:1 bağlama ve genel montaj '. 'Eğrisi Sığdır' ve ihracat verileri17uygun tuşuna basın.</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. bakteriyel uyum içinde Vn rolü karakterizasyonu
<ol><li>
Vn kaplı cam yüzeyler bakteriyel bağlılık incelenmesi
	<ol>
<li>Vn içinde PBS ve damlalıklı 10 µL üzerine cam mikroskop bu çözümün tek bir damla slayt 2 µg/mL çözeltisi hazırlamak. İnsan serum albumin (HSA) ile bir slayt dik kat, 30 dk için slayt üzerinde kurumaya bırakma negatif bir denetim sağlar.</li>
		<li>Protein kaplı cam slaytları slaytlar iki saniyeliğine aşırı kaplamasız protein kaldırmak için PBS içeren bir ölçek daldırma tarafından üç kez yıkayın. Yeni kurulan Kültür (1.1.1. adımda açıklanan) 20 mL steril plastik petri kabına ekleyin ve Vn - daldırın / HSA kaplı cam slaytlar kültür ortamında. Yemekler için 1 h 37 ° C'de 20 devir / dakikada sallayarak ile kuluçkaya. Not: Kurulan M10 ve kurulan M10Δlph sıvı BHI orta veya çikolata ağar kaplamalar yetiştirilmiştir. Orta lph mutant için 10 µg/mL sefaloridin15ile desteklenmiş.</li>
		<li>Kuluçka sonra üç kez bir ölçek PBS ile dolu slaytlar batış tarafından ilişkisiz herhangi bir bakteri kaldırın. Bakteri Gram boyama tarafından açıklandığı gibi gözünde canlandır.<ol>
<li>Aşırı PBS Bu yatırma ve doku kağıt üzerine kenar dokunmadan her slayttan çıkarın. 3-5 dk RT az slaytlarını kurumasına ve bir alev üzerinde üç kez her slayt geçirerek yapıştırılır bakteri düzeltin.</li>
			<li>İki parmak ile kenarları tarafından slayt boyama bir tepsi üzerinde tutun, sonra 3-4 damla (200 – 300 µL) % 2,3 kristal violet çözüm ekleyin. Bekle 60 s, daha sonra 3-4 sn için slaytları dokunun yumuşak akışı altında su yıkama.</li>
			<li>%0,33 iyot çözeltisi slaytlar üzerine 3-4 damla ekleyin. 1 dakika bekleyin sonra slayt musluk suyu nazik akışı altında durulayın. Dikkatle slayt Bloting kağıt tarafından kuru.</li>
			<li>Decolorizing çözüm % 75 izopropil alkol ve % 25 aseton bir slayda içeren 3-4 damla ekleyin. 5 – 10 s sonra slayt musluk suyu nazik akışı altında yıkayın.</li>
			<li>3-4 damla (200 – 300 µL) temel carbolfuchsin çözüm ekleyin. 1 dakika bekleyin sonra slaytları musluk suyu nazik akışı altında durulayın. Bloting kağıt kullanarak slaytları kuru.</li>
			<li>Bir petrol-daldırma objektif lens 100 X büyütme18seçerek bir ışık mikroskop altında bakteri görselleştirin. Bağlılık kurulan WT ve mutant bakteri Vn ve HSA kaplı cam yüzeylerde karşılaştırın.</li>
		</ol>
</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Bakterilerin Vn-bağımlı bağlılığı epitel hücreleri çalışma Not: Bu verimli bağlılık tahlil bizim önceki çalışmalar4,7' kullanıldı.<ol>
<li>Kültür A549 hücrelerinde (tip II alveoler epitel hücreleri) 75 cm2 doku kültürü şişesi ile F12 orta % 10 (vol/vol) fetal buzağı serum (FCS) (tam orta) ve 5 µg/mL gentamisin ile desteklenmiştir. 3 gün öncesine kadar % 80 birleşmesi için bir kuluçka 37 ° C'de % 5 CO2 şişeye kuluçkaya (confluency tahmini ters mikroskop kullanarak hücreleri tarafından yüzey kapsama görselleştirme tarafından). Aşağıdaki dört adım epitel hücreleri için tahlil19,20hazırlamak nasıl açıklar.<ol>
<li>İki kez PBS 20 mL ile balonun içinde hücre monolayer yumuşak swirling tarafından yıkayın. Hücreleri şişesi yüzeyinden ayırmak için hücre dekolmanı enzim çözümü 2 mL ekleyin ve şişeye 37 ° C'de 5 min için kuluçkaya Şişeye plastik yüzey hücrelerin tümünü ayırmak için palmiye ile dokunun. Yukarı ve aşağı birkaç kez-pipet hücre kümeleri dağıtmak.</li>
			<li>Şişesi için F12 tam orta 18 mL ekleyin ve tüm hücre süspansiyon 50 mL steril Falcon tüp aktarın. Hücre süspansiyon için de RT 200 x g , 5 dk santrifüj kapasitesi ve süpernatant atın. Hücre Pelet F12 tam orta 10 mL resuspend.</li>
			<li>Hücre süspansiyon 10 µL kaldırmak ve bir Eppendorf tüp yerleştirin, sonra 90 µL Trypan mavi çözüm ekleyin. Örnek bir hemasitometre yük (derinlik 0,1 mm) coverslip koyarak sonra.</li>
			<li>Alanlarda A, B, C ve D tüm hücrelerin sayısı (her alan 16 kareler oluşur ve her bir kare 0.0025 mm2lik bir alana sahiptir), hücrelerin ortalama sayısını hesaplamak ([A + B + C + D] / 4). Aşağıdaki denklemi kullanarak mililitre başına hücre sayısını hesaplar: Geçerli hücre/mL = ortalama hücre sayısı × 104 × seyreltme faktörü20. Not: Burada, 10 seyreltme faktörü.</li>
			<li>5. 0 x 103 hücre/mL tam orta içeren 5 µg/mL gentamisin kullanarak hücre süspansiyon sulandırmak. Hücre süspansiyon, 500 μL 24-şey hücre kültür plaka her kuyuya dağıtmak. Hücreleri % 90 birleşmesi kadar % 5 CO2 37 ° C'de plaka kuluçkaya.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Bakteriyel enfeksiyon önce Orta kuyulardan kaldırın ve F12 Orta (FCS) olmadan eklemek sonra gecede 37 ° C'de kuluçkaya</li>
		<li>Plaka buz üzerinde dik yerde üç kez PBS 500 µL ile hücre monolayer yıkayın ve Vn. Incubate plaka 1 h için 4 ° C'de 10 µg/mL içeren önceden soğutulmuş F12 orta 100 µL ekleyin. Denetim kuyular için sadece F12 orta ekleyin.</li>
		<li>Kuluçka sonra çözüm pipetting tarafından atmak ve hücre katmanı iki kez PBS 1 mL ile dik Resuspend taze yetişkin kurulan M10 kültürünün yıkayın (adım 1.1.1) F12 Orta (2 × 108 CFU/mL). Her şey için bu bakteriyel süspansiyon, 100 µL ekleyin ve 37 ° C'de 2 h plaka kuluçkaya Not: Her şey yaklaşık 2 x 105 A549 hücreler içerir. Enfeksiyon için 2 x 107 bakteriyel CFU ilave edilmiştir, enfeksiyon 100 çeşitliliği için karşılık gelen.</li>
		<li>Pipetting tarafından orta kaldırmak ve A549 epitel hücreleri üç kez PBS ile yıkayın. 50 µL/iyi hücre dekolmanı çözüm ekleyin ve 37 ° C'de 5 min için plaka kuluçkaya</li>
		<li>Sonra 50 µL F12 tam orta iyi enzimatik reaksiyon durdurmak için ücret ekleyin. Epitel hücreleri (≈100 μL [yani, birimin tümü]) dört cam boncuk içeren bir 6-mL Cam tüp her kuyudan aktarın. RT, hücreleri tarafından vortexing 2 min için koşullar.</li>
		<li>100-fold hücre lysate 10 µL sulandırmak için F12 orta 990 µL lysate, 10 µL ekleyerek. Bir çikolata agar plaka üzerine seyreltilmiş örnek 10 µL plaka.</li>
		<li>Çikolata agar plaka 37 ° C'de gecede kuluçkaya sonra kolonilerin sayımı. Her koloni bir CFU temsil eder.</li>
	</ol>
</li>
</ol>3. analiz insan serumu bakterisidal etkinlik Vn-bağımlı direnç
<ol><li>Satınalma NHS ticari bir kaynaktan. VDS yukarıda açıklanan12olarak hazırlayın. VDS 180 ile doldurmak nM Vn NHS içinde mevcut eşdeğerdir Vn.</li>
	<li>Isı inaktive serum (HIS) tarafından Isıtma NHS için 30 dk 56 ° C'de kompleman proteinleri devre dışı bırakabilirsiniz için hazırlayın. Not: Optimum serum konsantrasyonu (% 5) ve kuluçka süresi (15 dk) açıklanan adımları 3.3-3.7 tahlil için kurulan15için ampirik olarak belirlenmiştir; bu parametreler için diğer bakteriyel patojenler değişebilir.</li>
	<li>Kültür bakteriler (Bu durumda, kurulan M10 ve mutant kurulan M10Δlph) orta log fazı (OD600 0,3 =). Santrifüjü 3.500 x g 10 dk de tarafından bakteri cips.</li>
	<li>Bakteriyel Pelet Dekstroz Jelatin ilacı arabellek (DGVB++; pH 7.3) içeren % 2.5 (w/v) glikoz, 2 mM MgCl2, 0.15 mM CaCl2ve % 0.1 (wt/vol) jelatin 1 hacmi ile resuspend.</li>
	<li>1.5 x 10 Ekle3 CFU bakteri DGVB++ 100 µL için %5 serum içeren (NHS, onun, VDS, veya VDS + 180 nM Vn). 300 devir / dakikada sallayarak ile örnek 15 dakika 37 ° C'de kuluçkaya.</li>
	<li>10 µL aliquot 0 dk (T0 örnek) ve 15 dk (Tt örnek) ve çikolata agar tabağa tepki karisimin kaldırın. 37 ° C'de plaka gecede kuluçkaya.</li>
	<li>Kuluçka sonra plaka üzerinde görünen koloniler sayılır. Bakteri yüzdesi öldürdü12 aşağıdaki eşitliği kullanarak hesaplar: (CFU Tt)/ (T0, CFU) × 100.</li>
</ol>

<ol><li>Singh, B., Su, Y. C., Riesbeck, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Vitronectin+in+bacterial+pathogenesis%3A+a+host+protein+used+in+complement+escape+and+cellular+invasion%5BTitle%5D)+AND+%22Mol.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Vitronectin in bacterial pathogenesis: a host protein used in complement escape and cellular invasion.</a> Mol. Microbiol. 78 (3), 545-560 (2010).</li>
<li>Hallstrom, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Conserved+Patterns+of+Microbial+Immune+Escape%3A+Pathogenic+Microbes+of+Diverse+Origin+Target+the+Human+Terminal+Complement+Inhibitor+Vitronectin+via+a+Single+Common+Motif%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+one%22%5BJournal%5D)">Conserved Patterns of Microbial Immune Escape: Pathogenic Microbes of Diverse Origin Target the Human Terminal Complement Inhibitor Vitronectin via a Single Common Motif.</a> PloS one. 11 (1), 0147709(2016).</li>
<li>Su, Y. C., Hallstrom, B. M., Bernhard, S., Singh, B., Riesbeck, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Impact+of+sequence+diversity+in+the+Moraxella+catarrhalis.+UspA2%2FUspA2H+head+domain+on+vitronectin+binding+and+antigenic+variation%5BTitle%5D)+AND+%22Micro.+Infect%22%5BJournal%5D)">Impact of sequence diversity in the Moraxella catarrhalis. UspA2/UspA2H head domain on vitronectin binding and antigenic variation.</a> Micro. Infect. 15 (5), 375-387 (2013).</li>
<li>Singh, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+fine-tuned+interaction+between+trimeric+autotransporter+haemophilus+surface+fibrils+and+vitronectin+leads+to+serum+resistance+and+adherence+to+respiratory+epithelial+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Infect.+Immun%22%5BJournal%5D)">A fine-tuned interaction between trimeric autotransporter haemophilus surface fibrils and vitronectin leads to serum resistance and adherence to respiratory epithelial cells.</a> Infect. Immun. 82 (6), 2378-2389 (2014).</li>
<li>Kohler, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Binding+of+vitronectin+and+Factor+H+to+Hic+contributes+to+immune+evasion+of+Streptococcus+pneumoniae.+serotype+3%5BTitle%5D)+AND+%22Thromb.+haemostasis%22%5BJournal%5D)">Binding of vitronectin and Factor H to Hic contributes to immune evasion of Streptococcus pneumoniae. serotype 3.</a> Thromb. haemostasis. 113 (1), 125-142 (2015).</li>
<li>Onelli, E., Citterio, S., O'Connor, J. E., Levi, M., Sgorbati, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Flow+cytometry%2C+sorting+and+immunocharacterization+with+proliferating+cell+nuclear+antigen+of+cycling+and+non-cycling+cells+in+synchronized+pea+root+tips%5BTitle%5D)+AND+%22Planta%22%5BJournal%5D)">Flow cytometry, sorting and immunocharacterization with proliferating cell nuclear antigen of cycling and non-cycling cells in synchronized pea root tips.</a> Planta. 202 (2), 188-195 (1997).</li>
<li>Al-Jubair, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Haemophilus+influenzae+Type+f+Hijacks+Vitronectin+Using+Protein+H+To+Resist+Host+Innate+Immunity+and+Adhere+to+Pulmonary+Epithelial+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Immunol%22%5BJournal%5D)">Haemophilus influenzae Type f Hijacks Vitronectin Using Protein H To Resist Host Innate Immunity and Adhere to Pulmonary Epithelial Cells.</a> J. Immunol. 195 (12), 5688-5695 (2015).</li>
<li>Martinez-Martin, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Technologies+for+Proteome-Wide+Discovery+of+Extracellular+Host-Pathogen+Interactions%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Immunol.+Res%22%5BJournal%5D)">Technologies for Proteome-Wide Discovery of Extracellular Host-Pathogen Interactions.</a> J. Immunol. Res. 2017, 2197615(2017).</li>
<li>Boleij, A., Laarakkers, C. M., Gloerich, J., Swinkels, D. W., Tjalsma, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Surface-affinity+profiling+to+identify+host-pathogen+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Infect.+Immun%22%5BJournal%5D)">Surface-affinity profiling to identify host-pathogen interactions.</a> Infect. Immun. 79 (12), 4777-4783 (2011).</li>
<li>Abdiche, Y., Malashock, D., Pinkerton, A., Pons, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determining+kinetics+and+affinities+of+protein+interactions+using+a+parallel+real-time+label-free+biosensor%2C+the+Octet%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Biochem%22%5BJournal%5D)">Determining kinetics and affinities of protein interactions using a parallel real-time label-free biosensor, the Octet.</a> Anal. Biochem. 377 (2), 209-217 (2008).</li>
<li>Sultana, A., Lee, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Measuring+protein-protein+and+protein-nucleic+Acid+interactions+by+biolayer+interferometry%5BTitle%5D)+AND+%22Cur.+Prot.+Prot.+Sc%22%5BJournal%5D)">Measuring protein-protein and protein-nucleic Acid interactions by biolayer interferometry.</a> Cur. Prot. Prot. Sc. 79, 11-26 (2015).</li>
<li>Su, Y. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Haemophilus+influenzae+acquires+vitronectin+via+the+ubiquitous+Protein+F+to+subvert+host+innate+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Mol.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Haemophilus influenzae acquires vitronectin via the ubiquitous Protein F to subvert host innate immunity.</a> Mol. Microbiol. 87 (6), 1245-1266 (2013).</li>
<li>Ronander, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nontypeable+Haemophilus+influenzae+adhesin+protein+E%3A+characterization+and+biological+activity%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Infect.+Dis%22%5BJournal%5D)">Nontypeable Haemophilus influenzae adhesin protein E: characterization and biological activity.</a> J. Infect. Dis. 199 (4), 522-531 (2009).</li>
<li>Sezonov, G., Joseleau-Petit, D., D'Ari, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Escherichia+coli+physiology+in+Luria-Bertani+broth%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Bact%22%5BJournal%5D)">Escherichia coli physiology in Luria-Bertani broth.</a> J. Bact. 189 (23), 8746-8749 (2007).</li>
<li>Fleury, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+a+Haemophilus+influenzae+factor+H-Binding+lipoprotein+involved+in+serum+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Imunol%22%5BJournal%5D)">Identification of a Haemophilus influenzae factor H-Binding lipoprotein involved in serum resistance.</a> J. Imunol. 192 (12), 5913-5923 (2014).</li>
<li>Abdiche, Y., Malashock, D., Pinkerton, A., Pons, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Determining+kinetics+and+affinities+of+protein+interactions+using+a+parallel+real-time+label-free+biosensor%2C+the+Octet%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Biochem%22%5BJournal%5D)">Determining kinetics and affinities of protein interactions using a parallel real-time label-free biosensor, the Octet.</a> Anal. Biochem. 377 (2), 209-217 (2008).</li>
<li>Rich, R. L., Myszka, D. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Higher-throughput%2C+label-free%2C+real-time+molecular+interaction+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Biochem%22%5BJournal%5D)">Higher-throughput, label-free, real-time molecular interaction analysis.</a> Anal. Biochem. 361 (1), 1-6 (2007).</li>
<li>McNamara, G., Difilippantonio, M. J., Ried, T. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18428379">Microscopy and image analysis.</a> Current protoc. Hum. Genet. , Chapter 4 Unit 4 4(2005).</li>
<li>Lieber, M., Smith, B., Szakal, A., Nelson-Rees, W., Todaro, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+continuous+tumor-cell+line+from+a+human+lung+carcinoma+with+properties+of+type+II+alveolar+epithelial+cells%5BTitle%5D)+AND+%22International+J.+Canc%22%5BJournal%5D)">A continuous tumor-cell line from a human lung carcinoma with properties of type II alveolar epithelial cells.</a> International J. Canc. 17 (1), 62-70 (1976).</li>
<li>Foster, K. A., Oster, C. G., Mayer, M. M., Avery, M. L., Audus, K. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+the+A549+cell+line+as+a+type+II+pulmonary+epithelial+cell+model+for+drug+metabolism%5BTitle%5D)+AND+%22Exp.+Cell+Res%22%5BJournal%5D)">Characterization of the A549 cell line as a type II pulmonary epithelial cell model for drug metabolism.</a> Exp. Cell Res. 243 (2), 359-366 (1998).</li>
<li>Su, Y. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Haemophilus+influenzae+P4+Interacts+With+Extracellular+Matrix+Proteins+Promoting+Adhesion+and+Serum+Resistance%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Infect.+Dis%22%5BJournal%5D)">Haemophilus influenzae P4 Interacts With Extracellular Matrix Proteins Promoting Adhesion and Serum Resistance.</a> J. Infect. Dis. 213 (2), 314-323 (2016).</li>
<li>Singh, B., Al-Jubair, T., Morgelin, M., Thunnissen, M. M., Riesbeck, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+unique+structure+of+Haemophilus+influenzae+protein+E+reveals+multiple+binding+sites+for+host+factors%5BTitle%5D)+AND+%22Infect.+Immun%22%5BJournal%5D)">The unique structure of Haemophilus influenzae protein E reveals multiple binding sites for host factors.</a> Infect. Immun. 81 (3), 801-814 (2013).</li>
<li>Vellaiswamy, M., Campagna, B., Raoult, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transmission+electron+microscopy+as+a+tool+for+exploring+bacterial+proteins%3A+model+of+RickA+in+Rickettsia+conorii%5BTitle%5D)+AND+%22New+Microbiolog%22%5BJournal%5D)">Transmission electron microscopy as a tool for exploring bacterial proteins: model of RickA in Rickettsia conorii.</a> New Microbiolog. 34 (2), 209-218 (2011).</li>
<li>Pinne, M., Haake, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Immuno-fluorescence+assay+of+leptospiral+surface-exposed+proteins%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Vis.+Exp.+JoVE%22%5BJournal%5D)">Immuno-fluorescence assay of leptospiral surface-exposed proteins.</a> J. Vis. Exp. JoVE. (53), (2011).</li>
</ol>

Yazarlar hiçbir maddi çıkar çatışması var.

Bakteriyel patojenler Vn hücre yüzeyine için recruit ve kompleman faktörler birikimi ve membran saldırı karmaşık2tamamlanmasını önlemek için bu tamamlayıcı regülatör kullanmaktadır. VN aynı zamanda bakteri yüzey proteinleri ve konak hücre yüzey reseptörlerinin, arasında bir köprü molekül olarak böylece patojenler epitel hücrelerinin yüzeyine uygun ve daha sonra içselleştirilmesi arabuluculuk etkinleştirme çalışır. Bu çalışmada serum direnci ve enhancement-in sağlanmasında Vn i) bağlama bakteri hüc...

Vitronectin (Vn) önemli bir insan glikoprotein homeostazı, düzenleme, fibrinolitik sistem üzerinden sürdürmek için yer var. VN da C5b6-7 karmaşık oluşumu ve C9 polimerizasyon sırasında terminal tamamlayıcı yolu engelleyerek bir tamamlayıcı regülatör işlev görür. Birçok bakteriyel patojenler Vn hücre yüzeyine karşı kompleman birikimi1,2,3aracı olarak işe gösterilmiştir. Buna ek olarak, bakteri ve ana bilgisayar epitel hücre reseptörleri, böylece teşvik bağlılık ve patojenler2,4,5içselleştirilmesi arasında bir "sandviç" molekül Vn görür. Vn bağlama bakteri hücre yüzeyine Şu anda kimliği belirsiz diğer proteinler tarafından aracılık ettiği. Vn-hortum bağışıklık yanıtının kaçakçılığı bağlamasında işlevsel rolü tam olarak elucidating bu nedenle kimlik Vn-işe proteinlerin gerektirir.
Vn bağlanıcı proteinler belirlenmesinde ilk adım bir patojen ilgi arıtılmış Vn. akış sitometresi bağlayabilirsiniz olup olmadığını sınamak için Vn patojen hücrelere bağlı olup olmadığını belirlemek için uygun ve basit bir yöntem olmasıdır. Bu çalışmada, Vn bağlamaya çeşitli Haemophilus influenzae tip f (kurulan) klinik yalıtır6değerlendirildi. Burada açıklanan yöntemi kantitatif ve çok çeşitli bakteri suşları bağlama kapasitesi ayırt etmek için kullanılabilir. Bir önceki çalışmada, protein H (PH) kurulan bir Vn bağlayıcı protein7olarak karakterize. Bu nedenle, mevcut çalışmada, yaban tipi (WT) kurulan ve kurulan M10Δlph mutantlar Vn-bağlama potansiyelini karşılaştırıldığında açıklanan protokolleri kullanarak.
Bir patojen Vn bağlar belirlendikten sonra olası Vn bağlanıcı proteinler tanımlamak için yüzey Proteom karakterize ikinci adımıdır. Yaklaşımlar çeşitli bu amaç8,9için kullanılabilir, ancak bu metodolojileri bu raporda açıklanan değildir. Protein-protein etkileşimlerinin incelenmesi için en uygun recombinantly E. coli seçilen bakteri yüzey proteinleri hızlı ve benzeşme Kromatografi tarafından arındırmak için yöntemidir. Burada, PH ve moleküler etkileşim Vn ile belgili tanımlık yöntem göstermek için kullanırız. Rekombinant PH ve Vn arasındaki etkileşimler bir enzim bağlı immunosorbent assay (ELISA)7 ve biyo-katman Interferometry (BLI)10,11bilinen son zamanlarda gelişmiş bir etiket içermeyen tekniği kullanılarak karakterize. ELISAs protein-protein etkileşimleri onaylamak için kullanılan ise saçınıza etkileşimlerin kinetik parametreleri ile ilgili ayrıntılı verileri sağlar.
Vn işlevsel rolü bakteriyel uyum içinde çalışmak için iki farklı deneyleri yararlı olabilir. Burada açıklanan ilk tahlil Vn kaplı cam yüzeyler, bakteriyel bağlılık doğrudan ölçülmesi ise ikinci tahlil yüzey epitel hücrelerinin bağlılığı inceliyor. İlk tahlil için cam slaytlar Vn ile kaplı ve bağlama WT veya mutant kurulan suşları Gram boyası ve mikroskopi tarafından değerlendirildi. Bu teknik kolayca bakterileri Vn12bağlama yeteneği göre ayırt eder. Memeli hücre bakteriyel yapışma o zaman kültürlü bakteri türü II alveoler epitel hücresi monolayer üzerine ekleyerek analiz edildi; bakteriyel eki değerlendirildi koloni oluşturan sayısını sayarak birimleri (CFUs). Yapıştırılan ve içselleştirilmiş bakteri Vn4,13içinde ayırt edici olabilir.
Bakteriyel serum direnç Vn edinme rolünün bir serum öldürme tahlil (yani, serum bakterisidal etkinlik) kullanılarak değerlendirilmiştir. Serum direnç www.cdc.gov/drugresistance Vn edinme önemini değerlendirmek için Vn tükenmiş bir serum (VDS) bakterisidal etkinlik bu normal insan serumu (NHS) ile karşılaştırıldı. Kolayca kullanılan yöntem Vn-bağlama karşı bağlayıcı bakterileri serum direnci üzerinde göre ayırt eder. Vn rolde birkaç bakteriyel patojenler4,12serum direnç eğitim için bu yöntemi kullandık.
Ana bilgisayar-patojen etkileşimleri eğitimi için çok sayıda yöntem bildirilmiştir. Burada, kolayca herhangi bir patojen çalışma odasına Vn rol patogenezinde değerlendirmek için adapte edilebilir iletişim kuralları kümesi açıklar. Bu protokoller çeşitli patojenler kullanarak test ettik ve kurulan bu rapor için bir örnek olarak seçildi.

<table><tbody><tr><td>1,5 mL termomiksleyici</td><td>Eppendorf</td><td>5355</td><td>kuru blok ısıtma ve soğutma çalkalayıcı</td></tr><tr><td>5 mL polistiren yuvarlak tabanlı tüp&nbsp;</td><td>BD Falcon</td><td>60819-138</td><td>12 > 75 mm stil</td></tr><tr><td>%5 CO2 verilen inkübatör&nbsp;</td><td>Termo Bilimsel&nbsp;</td><td></td><td></td>BBD6220</tr><tr><td>6 mL polistiren yuvarlak tabanlı tüp&nbsp;</td><td>VWR</td><td>89000-478</td><td>12 > 75 mm stil, kapaklı</td></tr><tr><td>24 oyuklu plakalar</td><td>BD Falcon</td><td>08-772-1H</td><td>Hücre kültürü sınıfı</td></tr><tr><td>% 30 Hidrojen peroksit (H2O2) çözeltisi</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>H1009-100ML</td><td>Laboratuvar analiz sınıfı</td></tr><tr><td>75 cm2 doku kültürü şişesi</td><td>BD Falcon</td><td>BD353136</td><td>Bacalı</td></tr><tr><td>96 kuyulu siyah düz tabanlı plaka</td><td>Greiner Bio-One</td><td>655090</td><td>Doku kültürü ile tedavi edilmiş ve mikro; Şeffaf siyah plakalar</td></tr><tr><td>A549 Hücre Hattı insan</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>86012804-1VL</td><td></td></tr><tr><td>Hücre ayrılma enzimi (Accutase)&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A6964-500ML</td><td>Hücre Kültürü Sınıfı</td></tr><tr><td>AR2G sensörleri</td><td>Pall Life Science</td><td>18-5095</td><td>Amino birleştirme ile hareketsiz proteine sensör&nbsp;</td></tr><tr><td>Aseton</td><td>VWR</td><td>97064-786</td><td>Analiz sınıfı</td></tr><tr><td>Sığır Serum Albüminleri (BSA)</td> <td>Sigma-Aldrich</td><td>A2058</td><td>Hücre kültürü için uygun</td></tr><tr><td>Kabarcıklı kağıt&nbsp;</td><td>VWR</td><td>28511-007</td><td></td></tr><tr><td>Biyo-katman interferometre</td><td>Pall Life Science</td><td>FB-50258</td><td>Çift katmanlı interferometri ölçüm cihazları</td></tr><tr><td>Kristal viyole çözeltisi</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>HT90132-1L</td><td></td></tr><tr><td>C4BP (C4b bağlayıcı protein)</td><td>Complement Technology, Inc.</td><td>A109</td><td>Dondurulmuş sıvı form olarak satın alındı</td></tr><tr><td>Kalsiyum klorür (CaCl2)</td> <td>Sigma-Aldrich</td><td>C5670-500G</td><td></td></tr><tr><td>Carbol-fuchsin çözeltisi</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>HT8018-250ML</td><td></td></tr><tr><td>Sitrik asit</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>251275-500G</td><td>Amerikan Kimya Derneği (ACS) sınıfı</td></tr><tr><td>Renk Giderici çözüm</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>75482-250ML-F</td><td></td></tr><tr><td>E. coli konakçı (E. coli BL21)</td><td>Novagen</td><td>69450-3</td><td>Protein ekspresyon konakçısı</td></tr><tr><td>F12 ortamı</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>D6421</td><td>Hücre Kültürü Dereceli</td></tr><tr><td>Akış sitometresi&nbsp;</td><td>BD Biosciences</td><td>651154</td><td>Araştırma uygulamaları için hücre analizi notu&nbsp;</td></tr><tr><td>Fetal Buzağı Serumu (FCS)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>12003C</td><td>Hücre kültürü için uygundur</td></tr><tr><td>Normal insan serumu (NHS)</td><td>Kompleman Teknolojisi, Inc.</td><td>NHS</td><td>Havuzlanmış insan serumu</td></tr><tr><td>FITC konjuge eşek anti-koyun antikorları&nbsp;</td><td>AbD Serotec</td><td>STAR88F</td><td>Poliklonal</td></tr><tr><td>Gentamisin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G1397</td><td>Hücre kültürü sınıfı</td></tr><tr><td>Glikoz</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G8270-1KG</td><td></td></tr><tr><td>Jelatin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G9391</td><td>Hücre kültürü için uygun</td></tr><tr><td>Hemositometre</td><td>Marienfeld</td><td>640210</td><td></td></tr><tr><td>HRP konjuge anti-His tag antikorları</td><td>Abcam</td><td>ab1269</td><td>Poliklonal</td></tr><tr><td>İnsan Faktörü H</td><td>Kompleman Teknolojisi, Inc.</td><td>A137</td><td>Dondurulmuş sıvı form</td></tr><tr><td>C4BP</td><td>Complement Technology, Inc.</td> olarak satın alındı.<td>A109</td><td>Dondurulmuş çözelti</td></tr><tr><td>İnsan serum albümini</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A1653-10G</td><td>liyofilize toz</td></tr><tr><td>Histidin afinite reçine sütunu (HisTrap HP)</td><td>GE Health Care Life Science</td><td>17-5247-01</td><td>Ni Sefaroz ile önceden paketlenmiş sütunlar</td></tr><tr><td>His etiketli PH</td><td></td><td></td><td>Laboratuvarımızda rekombinant olarak eksprese edilir ve saflaştırılır</td></tr><tr><td>İyot çözeltisi</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>HT902-8FOZ</td><td></td></tr><tr><td>Metanol</td><td>VWR</td><td>BDH1135-1LP</td><td>Analiz sınıfı</td></tr><tr><td>&nbsp; Mikroskop</td><td>Olympus</td><td>IX73</td><td>Ters mikroskop</td></tr><tr><td>Mikroskop slaytları</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S8902</td><td>düz, boyut 25 mm ve kez; 75 mm&nbsp;</td></tr><tr><td>Magnezyum klorür (MgCl2)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M8266-1KG</td><td></td></tr><tr><td>Plazmid içeren C terminali 6x Omurga üzerindeki His-tag (pET26(b))</td><td>Novagen</td><td>69862-3</td><td>DNA vektörü</td></tr><tr><td>Polisorb mikrotitre plakaları&nbsp;</td><td>ELISA</td>Potasyum hidroksit (KOH) için <td>Sigma-Aldrich</td><td>M9410</td></tr> <tr><td></td><td>Sigma-Aldrich</td><td>6009</td><td>Amerikan Kimya Derneği (ACS) sınıfı</td></tr><tr><td>Koyun anti-insan Vn antikorları</td><td>AbD Serotec</td><td>AHP396</td><td>Poliklonal</td></tr><tr><td>Çalkalayıcı&nbsp;</td><td>Stuart Scientific</td><td>STR6</td><td>Platform çalkalayıcı</td></tr><tr><td>Doku kültürü şişesi</td><td>BD Falcon</td><td>3175167</td><td>75 cm2</sup</td></tr><tr><td>>&nbsp; Termomikser&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T3317</td><td>Kuru blok ısıtma ve soğutma çalkalayıcı</td></tr><tr><td>Tetrametilbenzidin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>860336-100MG</td><td>ELISA sınıfı</td></tr><tr><td>İnsan plazmasından Vitronektin (Vn)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>V8379-50UG</td><td>hücre kültürü sınıfı</td></tr></tbody></table>

vitronectin bakteriyel yapışma ve serum direnç rolü eğitim için deneyleri

Assays for Studying the Role of Vitronectin in Bacterial Adhesion and Serum Resistance

Bakteri tamamlayıcı düzenleyiciler konak immün yanıt evading bir araç olarak kullanmaktadır. Burada, biz rol vitronectin edinme bakteri hücre yüzey çalış, direnç ana bağışıklık sistemi için değerlendirmek için protokol tanımlamak. Akış Sitometresi deneyler insan plazma vitronectin Haemophilus influenzae tip f bakteriyel reseptör dış membran protein H için bir ligand olarak teşhis etti. Bir enzim bağlı immunosorbent assay saflaştırılmış Rekombinant protein H ve vitronectin arasındaki protein-protein etkileşimler karakterize etmek için istihdam edildi ve benzeşme bağlama biyo-katman Interferometry kullanarak değerlendirildi. Vitronectin protein H Ana bilgisayar bağışıklık yanıtının kaçakçılığı bakteri hücre yüzeyinde bağlama biyolojik önemi bir serum direnç tahlil normal ve vitronectin tükenmiş insan serumu ile kullanarak teyit edildi. Vitronectin bakteriyel uyum içinde önemi ve vitronectin kaplama, Gram boyama tarafından takip olmadan cam slaytlar kullanılarak analiz. Son olarak, insan alveoler epitel hücre monolayers için bakteriyel yapışma araştırılmıştır. Burada açıklanan protokoller faiz bakteriyel herhangi bir tür çalışma odasına kolayca adapte edilebilir.

VN-bağlama bakteri yüzeyine Akış Sitometresi tarafından tespit edilmiştir. Tüm kurulan klinik yalıtır Bu çalışmada test Vn hücre yüzeyine işe. Vn etkileşimi ile hücre yüzeyine E. coli negatif kontrol zorlanma (Şekil 1A) gözlenmiştir. Şekil 1' deBgösterildiği gibi PH kurulan hücre yüzeyinde büyük Vn-bağlayıcı protein olur. Oysa kurulan M10Δlph Vn bağlanamadı ve denetimine benzer ...

Bu rapor bakteriyel dış membran proteinlerinin ve insan tamamlayıcı regülatörü vitronectin arasındaki etkileşimler karakterize için iletişim kurallarını açıklar. İletişim kurallarını bağlama reaksiyonlar ve biyolojik fonksiyonu herhangi bir bakteri türlerinde vitronectin eğitim için kullanılabilir.

Vitronectin bakteriyel yapışma ve Serum direnç rolü eğitim için deneyleri

Bacteria utilize complement regulators as a means of evading the host immune response. Here, we describe protocols for evaluating the role vitronectin ...

Bu yöntem, insan proteinlerini kullanarak bakteriyel patojenlerin insanlarda hastalığa nasıl yol açtığı gibi konak-patojen etkileşim alanındaki temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Bu tekniğin en büyük avantajı, herhangi bir patojenkonak enfeksiyonu oluşturmak için Vitronectin kullanabilirsiniz eğer cevap verebilir. Biz Vitronectin üzerinde durulacak, ekstrasellüler matris yer alan bir konak protein, ama aynı zamanda kompleman aktivasyonu belirleyici bir yol kompleman inhibitörü olarak işlev.Bu gerçekler çok önemli ve insanlarda hastalığa neden patojenler için son derece çekici. Akış sitometrisine hazırlanmak için, 250 nanomolar Vitronectin içeren 50 mikrolitre bloke edici tampon içeren bakteriyel peletleri yeniden askıya alın. Daha sonra, titremeden oda sıcaklığında bir saat boyunca örnekleri kuluçkaya yatırın.Kuluçkadan sonra bakterileri santrifüj ile 3, 500 g'da beş dakika peletleyin. Daha sonra PBS ve benzeri santrifüj adımlarını kullanarak peletleri üç kez yıkayın. Yıkamadan sonra, PBS BSA'da 1 ila 100 seyreltmede bakteriyel pelete 50 mikrolitre birincil koyun antihuman Vitronektin poliklonal antikor ekleyin.Süspansiyonu oda sıcaklığında bir saat kuluçkaya yatırın

assays-for-studying-role-vitronectin-bacterial-adhesion-serum

Research

JoVE Journal

Immunology and Infection

İmmünoloji ve Enfeksiyon

Bu protokol, kültür hücreleri üzerine yapıştırılır birimler oluşturan bakteri kolonisi sayısının sayma oluşan basit bir bakteriyel yapışma testtir. Testin sağlam, adhesin bağımsız olarak okudu ve çeşitli varyasyonlar bakteriyel patogenezi üzerinde çalışan çoğu laboratuvarlarda kullanılır.

Bakteriyel Yapışma Memeli Epitel Hücreleri üzerine In Vitro Testi

Bu videoda, ikinci proteinin hareketsiz hale getirilmiş birinci proteine bağlanmasını ölçerek iki protein arasındaki protein-protein etkileşimlerini tespit eden ELISA tabanlı bir teknik açıklanmaktadır. Bağlı ikinci protein, yaban turpu peroksidaz gibi bir enzim ile etiketlenmiş spesifik antikorlar kullanılarak tespit edilir.

Yem ve Av Proteinleri Arasındaki Etkileşimleri Analiz Etmek için ELISA Tabanlı Yöntem

Bu videoda, Haemophilus influenzae'nin konak epitel hücrelerine yapışmasında vitronektinin rolünü incelemek için bir test gösteriyoruz.

Vitronektinin konakçı epitel hücrelerine bakteri yapışmasındaki rolünü incelemek için bir test

Bu video, bir insan serum glikoproteini olan vitronektinin bakteri direnci üzerindeki rolünü göstermektedir. Serumdaki antikorlar, bakteriyel yüzey proteinleri ile etkileşime girerek kompleman proteinlerini aktive eder ve membran saldırı kompleksini oluşturarak bakteriyel hücre lizisine neden olur. Bakteri zar proteini üzerindeki vitronektin bağlanması, zar saldırı kompleksi oluşumunu önleyerek bakteri sağkalımı ile sonuçlanır.

İnsan serumunun bakterisidal aktivitesine karşı bakteriyel dirençte vitronektinin rolünün belirlenmesi

Bu videoda, kanser hücrelerinin nötrofil hücre dışı tuzaklara (NET'ler) yapışmasını tespit etmek için floresan mikroskobu kullanan bir testi gösteriyoruz. Test kuyucuklarında, NET'lere yapışan floresan işaretli kanser hücrelerinin sayısında kayda değer bir artış olurken, DNaz ile muamele edilen kuyucuklar, NET'lere kanser hücresi yapışmasında azalma sergilemektedir.

Kanser Hücrelerinin Nötrofil Hücre Dışı Tuzaklara Yapışmasını Tespit Etmek için İn Vitro Yapışma Testi

Bu video, vitronektinin bakteriyel yüzey proteinleri ile etkileşiminin tespitini göstermektedir. Akış sitometrisi analizi, vitronektine bağlı floresan etiketli antikorların floresan sinyalini ölçer ve bakteri yüzeyindeki varlığını doğrular. Bu teknik, konak-patojen etkileşimleri ve potansiyel bakteriyel enfeksiyon tedavileri hakkında bilgi sağlar.

Vitronektinin Bakteri Yüzeylerine Bağlanmasının Flow Sitometri Kullanılarak Tespiti

Enfeksiyon bölgelerinde aktif endotele nötrofil bağlılık konağın inflamatuvar yanıt ayrılmaz bir bileşenidir. Için izin veren bir nötrofil bağlayıcı bir testtir Bu raporda...

Nicel<em&gt; In vitro</emStatik Koşullarında Account İlköğretim İnsan mikrovasküler endotel hücreleri için Nötrofil yapışma Tedbir&gt; Testi

Bakterilerin kesme gerilimi altındaki kan damarları ile etkileşimini incelemek için, vasküler yapışmaya katkıda bulunan bakteri ve konak faktörlerini incelemeye izin veren bir akış odası ve in vivo mezenterik intravital mikroskopi modeli tanımlanmıştır.

In Vitro ve İn Vivo Modeli Gemi Duvar Altında Akış Koşulları Bakteriyel Yapışma Eğitim için

Konak hücrelere bakteri bağlanması, konak kolonizasyonu ve enfeksiyonu sırasında önemli bir adımdır. Bu protokol, diğer bakteriyel faktörlerden bağımsız olarak, bireysel adezinlerin bu süreçlere katkısının analizine izin veren biyomimetik malzemeler olarak polimere bağlı rekombinant adezinlerin üretilmesini tanımlar.

Bakteri-konak Etkileşimleri karakterize etmek Biyomimetik Malzemeler

Burada, virüs bulaşmış HeLa hücre tek katmanlarına yapışma için Krallıklar arası ilişki ve rekabetin (bakteri ve mantar) belirlenmesi için bir yöntem açıklanmaktadır. Bu protokol, prokaryotlar, ökaryotlar ve virüslerin çoklu kombinasyonlarına genişletilebilir.

Bakteri ve mantar virüsle enfekte olmuş hücreler üzerinde Biyofilm Başlatma Belirlenmesi

Ayarlanabilir yoğunluğa sahip RGD ile işlevselleştirilmiş avidin-biyotin bağları kullanılarak tek göç eden trombositlerin görüntülenmesi için ayrıntılı bir protokol sağlanır ve trombositlerin avidin-biyotin bağını koparmak için yeterli kuvvet ürettiğini ortaya çıkarır.

RGD İşlevselleştirilmiş Avidin-Biotin Bağları Kullanarak Trombosit Migrasyonunu İncelemek İçin Bir İn Vitro Test

Öğrenin bakteriyel dış membran proteinleri ile vitronektin arasındaki etkileşimleri karakterize etme yöntemlerini. Akış sitometrisi ve ELISA kullanarak konak-patojen etkileşimlerini inceleyin.

Vitronectin bakteriyel yapışma ve Serum direnç rolü eğitim için deneyleri

Daha fazla video keşfet