Name: Aracı Olarak Etilen serbest Bileşik, 2-chloroethylphosphonic acid, kullanan Bakterilerin Etilen Yanıtı Eğitim için (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2016-11-10T14:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 51 s
Description: Öğrenin, bakterilerin etilen yanıtını 2-chloroethylphosphonic acid kullanarak güvenli şekilde nasıl inceleyeceğinizi. Bu yöntem, bitki-mikrop etkileşimlerinde etilenin rolünü araştırmak için özel ekipman gerektirmeden laboratuvar ortamında uygulanabilir.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Yazarlar, Arabidopsis thaliana tohumlarını sağladığı ve üçlü yanıt tahlili ile ilgili teknik yardım için Dr. Dario Bonetta'ya ve FT-IR ile ilgili yardım için Simone Quaranta'ya teşekkür eder. Bu çalışma, JLS'ye Kanada Doğa Bilimleri ve Mühendislik Araştırma Konseyi Keşif Hibesi (NSERC-DG), RVA'ya Ontario Yüksek Lisans Bursu (OGS) ve AJV'ye Bilim ve Teknoloji Yüksek Lisans Bursu (QEII-GSST) tarafından desteklenmiştir.

1. Kimyasallar <ol><li> 500 mM NaH 2 PO 4 · asitleştirildi içinde H2O (137,99 g / Mol) (pH 500 mM CEPA (144.49 gr / mol) ihtiva eden bir çözelti, ve her ikisi de, 500 mM NaCI (58.44 g / mol) &#39;den oluşan bir çözelti hazırlamak 2.5) ultra saf su ve 0.1 N HCI. çözümler açıktır kadar vorteks ile karıştırın. </li><li> Seri olarak 5 mM ve 50 mM stok elde etmek için aynı çözücü (10 x) 500 mM seyreltik çözeltiler. </li><li> Ultra saf su içinde 1-aminosiklopropan karboksilik asit (101.1 g / mol ACC) içindeki bir 10 mM çözelti hazırlayın. </li><li> -Filtre sterilize -20 ° C&#39;de stok çözümleri ve mağaza alikotları. </li><li> Filtre sterilize selülaz. 4 ° C&#39;de saklayın alikotları. </li></ol> 2-chloroethylphosphonic acid Ayrışma 2. doğrulanıyor Etilen Üretimi: Üçlü Tepki Testi <ol><li> Buhar fazlı Yöntemiyle Ekotip Columbia tohumları thaliana Arabidopsis Yüzey sterilize: DİKKAT: Aşağıdaki adımı t üretiroksik klor gazı. Davlumbaz tohum sterilizasyon kuralları. <ol><li> Tohum sterilizasyon için 250 ml cam beher karşılamak ve davlumbaz yerleştirmek yeterince derin bir yapışmalı kabı alın. </li><li> A. ekle thaliana bir mikrosantrifüj tüp tohum ve rafa tüp yerleştirin. yapışmalı kabın içine açık tüp içeren raf yerleştirin. Not: klor gazı daha düşük tohum nüfuz sağlamak için yarısı dolu üzerinde bireysel tüpleri doldurmak etmeyin. </li><li> sızdırmaz kapta ticari ağartıcı, 100 ml içeren 250 ml&#39;lik bir beher yerleştirin. Dikkatle ağartıcıya konsantre HCI 3 ml ilave edilir ve derhal kapaklı konteyner mühür. DİKKAT: Ağartıcı ve HCl tohumları, yüzey sterilize edilmesi işlevini görürler toksik klorin gazı üretmek için reaksiyona girer. </li><li> fumehood 4 saat boyunca klor gazı varlığında tohumları inkübe edin. Not: Daha uzun sterilizasyon süreleri çimlenme etkinliğini azaltacaktır. </li><li> Sterilizasyon sonrasında, c izinhlorine gaz daha sonra en az 1 saat süre ile duman davlumbazında havalandırma mikrosantrifüj tüpü mühür. atılmadan önce en az 24 saat boyunca fumehood çamaşır suyu ve HCl karışımı bırakın. Not: Sterilize edilmiş tohumlara, acil kullanım için oda sıcaklığında saklanabilir. </li><li> Uzun süreli depolama boyunca 4 ° C &#39;de tohum tutun. yoğunlaşmayı önlemek için ependorf tüp açmadan önce oda sıcaklığına kadar tohum getirin. karanlıkta saklayın tohumları. </li></ol></li><li> 4-sektör Petri Yemekleri (90 x 15 mm) Agar Plakaları hazırlayın: <ol><li> A. büyüme ortamı 110 ml hazırlanması thaliana fidanları: 1 x Murashige ve% 1 ihtiva eden Skoog (MS) bazal ortam 15 (4.33 gr / lt) (ağ / hac) sakroz ve% 0.8 (ağ / hac) ağar. NaOH ile pH 6&#39;ya MS ortamı ayarlayın. </li><li> CEPA&#39;nın ayrışma bakteriyel büyüme ortamı 100 ml hazırlayın: Schramm ve Hestrin 16% 1.5 ihtiva eden (SH) ortamı (ağırlık / hacim) ağar. NaOH ile pH 7&#39;ye SH ortamı ayarlayın. </li><li> otoklav ve tempe tarafından medya sterilize55 ° C su banyosu içinde R. </li><li> MS agar katkılı sonra, steril bir şişeye 40 mi ekleyin. A. pozitif kontrol büyüme ortamı hazırlamak için thaliana fideler, 10 uM ACC bir son konsantrasyon elde etmek üzere, 10 mM ACC 40 ul MS agar 40 ml kısım tamamlar. </li><li> Sektörlü Petri kapları (Şekil 1), uygun kadran ortamın 5 ml ilave edilir ve Ağarı katılaştırmak için bir olanak sağlar. üç nüsha olarak tüm tabak hazırlayın. Not: CEPA sonra protokolde kadar büyüme ortamına ilave edilmez. </li></ol></li></ol><img alt="Şekil 1" src="/files/ftp_upload/54682/54682fig1.jpg" /> Şekil 1:. CEPA üçlü müdahale analizi için kullanılan agar plakaları Kur şematik (negatif kontrol (A), pozitif kontrol (B) belirli bir kadran ve deney plakaları görüntülemektedirC). Bu rakam Augimeri ve Askı 9 modifiye edilmiştir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54682/54682fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.</a> <ol start="3"><li> Tabakalandırmak A. thaliana Tohumlar Senkron Çimlenme sağlamak için: <ol><li> Yaklaşık elli A. ekle MS veya MS + ACC agar içeren her kadranda üzerine thaliana tohumları. Emin olun tohumlar eşit fide çıkarılmasını ve analizi kolaylaştırmak için dağıtılır. </li><li> Plakalar 4 ° C&#39;de karanlıkta tohumlarının inkübe 3-4 gün ° C. </li></ol></li><li> Üçlü Tepki Testi Bakteriyel Büyüme Medium üzerinde CEPA (SH) ayrıştırmak ve uygulayın: <ol><li> tabakalaşma sonra, 2 saat boyunca floresan ışık tohumları maruz. </li><li> SH agar içeren deney levhaları çeyrek üzerine 500 mM İEKB stok çözeltisinin 10 ul yay (pH 7, Şekil 1) bir son konsantrasyon elde etmek için CEPA&#39;nın1 mM. </li><li> laboratuvar film ile plakaları mühür ve tohum için karanlık bir ortam yaratmak için folyo ile kaplayın. </li><li> Aşağı agar yüzü 3 gün boyunca 23 ° C&#39;de karanlıkta plakaları inkübe edilerek de tohumlar çimlenmeye. Not: Tabaklar yığılmış olabilir, ancak etilen havadan daha hafif olduğu için negatif kontroller altına konulmalıdır. </li></ol></li><li> Üçlü Tepki Testi Verileri Analiz: <ol><li> Alev sterilize forseps ile, bir diseksiyon veya dijital USB mikroskop altında her tedavi ve görünümüne tekabül eden bir plakadan tek fidan kaldırın. fide alt hizalanmış ve fotoğrafı emin olun. </li><li> Her kadranda 30 fideleri (biyolojik çoğaltmak başına 60 fide ve tedavi başına 180 fidan) çıkarın. bir cetvel ile siyah bir arka plan ve fotoğraf ile bir yüzey üzerinde aynı hizaya getirin. </li><li> ImageJ yazılımı 17 kullanarak çoğaltmak fidelerin hipokotil uzunluğu (mm) ölçün. tıklayıp * düz sürükleyerek ölçeği ayarlama *aracı 10 mm uzunluğunda seçin. &quot;Analiz&quot; sekmesi altında &quot;Set Ölçeği&quot; i seçin ve * Parçalı aracını kullanarak 10&#39;a bilinen mesafeyi ayarlamak, tıklayın ve sürükleyin mesafeyi ölçmek için hipokotil ve basın M uzunluğunu seçmek için kullanılır. Tukey çoklu karşılaştırma testi ile tek-yönlü ANOVA kullanılarak biyolojik çoğaltır araçlarını karşılaştır. Farklılıklar &lt;0.05 anlamlı eğer p olarak kabul edilir. </li></ol></li></ol> Bakteriyel Büyüme boyunca pH 3. Analiz <ol><li> Üç nüsha olarak xylinus Starter Kültürler büyümek ve Ölçmek Komagataeibacter: <ol><li> K. tek bir koloni İnokülasyon xylinus% 0.2 (h / h) filtre ile sterilize selülaz ile takviye edilmiş SH ortamı, 5 ml (pH 5) içinde. 0.4, 0.3, 600 ulaşıldığında bir OD (yaklaşık 72 saat) kadar 150 rpm&#39;de çalkalanarak 30 ° C&#39;de kültürler inkübe edin. </li><li> santrifüj ile hasat başlatıcı kültürleri (2000 x g, 4 ° C, 10 dakika). 5 ml steril% 0.85 ile NAC (w / v)l Çözelti hücreler iki kez yıkama ve hücre pelletini. hücreleri buz üzerinde tutun. </li><li> Bir Petroff-Hausser sayma odasını kullanarak hücrelerin ölçmek. </li></ol></li><li> pH Analiz için Kültürleri aşılamak: <ol><li> folyo kapak ile on iki adet 500 ml&#39;lik şişelere% 0.2 (h / h) filtre ile sterilize selülaz ile takviye edilmiş SH suyu (pH 7), 150 ml ilave edilir. K. ile şişeler aşılamak 10 5 hücre / ml&#39;lik bir konsantrasyonda xylinus başlangıç kültürleri. Üç starter kültür kullanılarak, tedavi başına üç biyolojik çoğaltır hazırlamak. </li><li> 5, 50 veya 500 mM İEKB stok çözeltileri 300 ul Ek kültürleri, sırasıyla, 1.0 mM, 0.01, 0.1 nihai CEPA konsantrasyonlar elde, ve. Cepa çözmek için kullanılan çözücü, 300 ul muamele edilmemiş kontrol kültürleri Supplement. </li><li> sıkı şişelere folyo kapak bantlayarak şişeler kapatılır ve 150 rpm&#39;de çalkalanarak 30 ° C&#39;de 14 gün boyunca kültür inkübe edin. </li></ol></li><li> Her gün, aseptically (10 dakika;, 4 ° C 2,000 x g) santrifüj ile, her şişe ve topak hücrelerinden 5 mi örnek alabilir. temiz bir tüpe süpernatantlar aktarın ve bir pH ölçer kullanılarak her bir biyolojik tekrarında pH&#39;ı ölçülür. </li><li> biyolojik çoğaltır ortalama pH değeri grafik ile zaman ders verileri analiz edin. Not: kültür pH 3.5&#39;in altında düşmemesine önemlidir; 5 bir kültür pH değerinin önemli ölçüde CEPA etilen salınımını azaltan ve 3.5&#39;in altında bir pH değeri, tamamen etilen salınımını inhibe eder. </li><li> , Klorin ve fosfat seviyeleri kontrol, 0.01, 0.1 ile aynı deney sonuçlarını ve sırasıyla 5, 50 ve 500 mM stoklar kullanıldığında NaCl NaH 2 PO 4 çözeltinin 1.0 mm&#39;dir. </li></ol> 4. Koloni Morfolojisi <ol><li> K. büyümek üç kopya halinde xylinus Başlangıç Kültürleri: <ol><li> K. tek bir koloni İnokülasyon xylinus% 0.2 (h / h) filtre ile sterilize selülaz ile takviye edilmiş SH ortamı, 5 ml (pH 5) içinde. doğmuş iyileşmesini0.4, 0.3 OD 600 kadar, 150 rpm&#39;de çalkalanarak 30 ° C&#39;de te kültürleri (yaklaşık 72 saat) ulaşılır. </li><li> santrifüj ile hasat başlatıcı kültürleri (2000 x g, 4 ° C, 10 dakika). Steril tuzlu su, 5 ml hücre, yıkama ve daha sonra hücre pelletini. hücreleri buz üzerinde tutun. </li></ol></li><li> % 1.5 SH 25 ml içeren 24 agar plakaları (pH 7) orta hazırlayın (a / h) agar. </li><li> Agar katılaşmış sonra, sırasıyla 0.01, 0.1, ve 1.0 mM nihai CEPA konsantrasyonları elde edilmesi için 5, 50, 50 ul ve agar üzerinde, 500 mM CEPA stok solüsyonları yayıldı. herhangi bir değişiklik meydana ve çözücünün 50 ul yayılan ayarlama muamele edilmemiş ve çözücü kontrol plakaları, test bileşiklerini çözmek için kullanılan. </li><li> K. bir döngü dolu (~ 5 ul) ile izole edilmiş koloniler için şerit tabakalar xylinus starter kültür ve parafin film ile onları mühür. üç nüsha olarak tüm plakaları aşılamak. 30 ° C&#39;de beş gün süreyle inkübe edin. </li><li> fotniteliksel bir dijital USB mikroskop kullanarak ve 20X büyütmede ograph koloniler katı ortam üzerinde koloni morfolojisi ve selüloz üretimi değerlendirmek. Not: Selüloz koloni kenarı boyunca puslu bir madde olarak görünür. </li><li> , Klorin ve fosfat seviyeleri kontrol, 0.01, 0.1 ile aynı deney sonuçlarını ve sırasıyla 5, 50 ve 500 mM stoklar kullanıldığında NaCl NaH 2 PO 4 çözeltinin 1.0 mm&#39;dir. </li></ol> 5. zar Tahliller <ol><li> Büyümek ve Ölçmek K. üç kopya halinde xylinus Başlangıç Kültürleri: <ol><li> Üç nüsha olarak, K. tek bir koloni aşılamak xylinus% 0.2 (h / h) filtre ile sterilize selülaz ile takviye edilmiş SH ortamı, 5 ml (pH 5) içinde. 0.4, 0.3, 600 ulaşıldığında bir OD (yaklaşık 72 saat) kadar 150 rpm&#39;de çalkalanarak 30 ° C&#39;de kültürler inkübe edin. </li><li> santrifüj ile hasat başlatıcı kültürleri (2000 x g, 4 ° C, 10 dakika). Steril tuzlu su, 5 ml, t yıkamao hücreler iki kez ve hücre pelletini. hücreleri buz üzerinde tutun. </li><li> Bir Petroff-Hausser sayma odasını kullanarak hücrelerin ölçmek. </li></ol></li><li> 24 oyuklu plakaların aşılanması için ana karışımlarını hazırlamak: <ol><li> sırasıyla 0.01, 0.1, ve 1.0 mM nihai CEPA konsantrasyonları elde edilmesi için 5, 50, 120 ul ve 500 mM İEHB stokları SH ortamı 60 ml (pH 7) Supplement. Cepa çözmek için kullanılan çözücü, 120 ul SH ortamı (pH 7) arasında bir 60 ml Supplement. Vortex karıştırın. </li><li> dört adet 14 ml&#39;lik miktarlar halinde İEHB içeren bir maddenin her birinden 60 ml bölün. 10 5 hücre / ml&#39;lik bir konsantrasyonda başlatıcı kültür biyolojik çoğaltır 14 ml alikotlar üç inoküle. selüloz üretimi önlemek için buz üzerinde hücreleri ile tüpler tutun. Not: Geri kalan 14 ml bir örnek steril kontrol kuyuları için kullanılacaktır. </li></ol></li><li> 24 oyuklu plakaların aşılanması: <ol><li> Üç biyolojik çoğaltır satır ve kendi plaka her tedaviyi testSteril kontrollerin bir satır (Şekil 2). </li></ol></li></ol><img alt="şekil 2" src="/files/ftp_upload/54682/54682fig2.jpg" /> Şekil 2:. Zar tahlilinde ve analiz Hazır İEHB-desteklenmiş, pH 7 SH ortamı (60 mi) için kullanılan protokol gösteren bir akış şemasıdır, üç ayrı biyolojik suret aşılamalar ve steril bir kontrol (14 mL) ekstrakte edildi için örnek olarak alındı. Bu kültürler daha sonra bir 24 yuvalı plaka içine altı teknik çoğaltır (2 mi) içine bölüştürülmüştür ve parafın bir film ile kaplanmıştır. 30 ° C&#39;de 7 gün beklettikten sonra, zarlarına hasat edilir ve FT-IR ile ıslak ağırlık, kalınlık, kuru ağırlığı, ve kristal belirlenmesi ile karakterize. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/54682/54682fig2large.jpg" target="_blank">Bu rakamın büyük halini görmek için tıklayınız</a> <ol start="2" style="margin-left: 40px;"><li> 14 ml ana karışımı kullanarak, EAC içine 2 ml ekleyinsteril 24 oyuklu plaka altı kuyu H. Üç biyolojik çoğaltır ve steril kontrol (Şekil 2) için tamamlayın. Her tedavi için tekrarlayın. </li><li> parafın film kapatma plakaları ve 30 ° C &#39;de 7 gün süre ile, statik inkübe edin. </li></ol><ol start="4"><li> Hasat ve Tedbir pelikül Islak Ağırlığı, Kalınlığı, kuru Ağırlık (Selüloz Verim) ve kristal yapıdaki (Şekil 2): <ol><li> Rakip zar kenarı yükseltmek ve forseps ile bireysel zarlarına kaldırmak için ince tabakanın bir tarafını basınız. kavrama koruyarak, kendi ıslak ağırlıkları belirlemek için tartım önce aşırı orta kaldırmak için 3 sn taze kağıt havlu üzerine koyun. </li><li> yüksek çözünürlüklü bir dijital kamerayı kullanarak taraftan bir cetvel ve fotoğraf bitişik zarlarına hizalayın. </li><li> ImageJ yazılımı kullanma 17, sol omuz, sağ omuz ve her ince tabakanın ortasına pelikül kalınlığını ölçmek. Her biyolojik RepliCat için tüm teknik çoğaltır ortalamae. </li><li> Ayrı ayrı 6-çukurlu bir plaka gözlerine zarlarına transfer. 20 dakika hücreleri lize etmek için, 80 ° C de, 0.1 N NaOH 12 ml zarlarına tedavi edin. </li><li> NaOH çıkarın ve ajitasyon ile 24 saat boyunca ultra saf su ile yıkanarak zarlarına nötralize eder. suya her 6 saat değiştirin. Not: ince zarlar yıkama aşamasının tamamlanması üzerine beyaz olmalıdır. </li><li> Talep silikon tabakaları üzerindeki ince zarlar ve sabit bir ağırlığa kadar 48 saat boyunca 50 ° C&#39;de kurutulur. Kuru kez, bakteriyel selüloz verimi belirlemek için analitik bir ölçekte pelikül ağırlıkları paspaslar kaldırmak ve ölçün. </li><li> 4.000 650 cm aralığında kızılötesi spektroskopisi (FT-IR) 32 taramaları kullanılarak ve 4 sm bir çözünürlük -1 Fourier dönüşümü kullanılarak ince tabaka kristal analiz -1. A 1437 / A 895 kullanarak, kristallik endeksi, CI (IR) hesaplayın; &quot;kristal bant&quot; ve &quot;amorf band&quot; absorbansı oranı daha önce 18 nitelendirdi. </li></ol&gt; </li><li> , Klorin ve fosfat seviyeleri kontrol, 0.01, 0.1 ile aynı deney sonuçlarını ve sırasıyla 5, 50 ve 500 mM stoklar kullanıldığında NaCl NaH 2 PO 4 çözeltinin 1.0 mm&#39;dir. </li><li> Zar Verileri Analiz: <ol><li> zar ıslak ağırlığı ve kuru ağırlığı arasındaki farkı belirleyerek pelikül hidrasyon hesaplayın. </li><li> İstatistiksel analiz için her bir biyolojik çoğaltmak için tek bir değer elde etmek için tüm teknik çoğaltır değerlerinin ortalamasını alın. Tukey çoklu karşılaştırma testi ile tek-yönlü ANOVA ile tedavi karşılaştır. Farklılıklar p eğer &lt;0.05 anlamlı bulunmaktadır. </li><li> Tedavi edilmeyen kontrollerin yüzdesi olarak veri normalleştirmek ve biyolojik çoğaltır araçları arsa. </li></ol></li></ol>

<ol><li>Guzmán, P., Ecker, J. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Exploiting+the+triple+response+of+Arabidopsis+to+identify+ethylene-related+mutants%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell%22%5BJournal%5D)">Exploiting the triple response of Arabidopsis to identify ethylene-related mutants.</a> Plant Cell. 2 (6), 513-523 (1990).</li>
<li>Bakshi, A., Shemansky, J. M., Chang, C., Binder, B. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((History+of+research+on+the+plant+hormone+ethylene%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Plant+Growth+Regul%22%5BJournal%5D)">History of research on the plant hormone ethylene.</a> J. Plant Growth Regul. 34 (4), 809-827 (2015).</li>
<li>Schaller, G. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ethylene+and+the+regulation+of+plant+development%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biol%22%5BJournal%5D)">Ethylene and the regulation of plant development.</a> BMC Biol. 10 (1), (2012).</li>
<li>Hua, J., Sakai, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((EIN4+and+ERS2+are+members+of+the+putative+ethylene+receptor+gene+family+in+Arabidopsis%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Cell%22%5BJournal%5D)">EIN4 and ERS2 are members of the putative ethylene receptor gene family in Arabidopsis.</a> Plant Cell. 10 (8), 1321-1332 (1998).</li>
<li>Bleecker, A. B., Estelle, M. A., Somerville, C., Kende, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Insensitivity+to+ethylene+conferred+by+a+dominant+Mutation+in+Arabidopsis+thaliana%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Insensitivity to ethylene conferred by a dominant Mutation in Arabidopsis thaliana.</a> Science. 241 (4869), 1086-1089 (1988).</li>
<li>Hamilton, A. J., Bouzayen, M., Grierson, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+a+tomato+gene+for+the+ethylene-forming+enzyme+by+expression+in+yeast%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci%22%5BJournal%5D)">Identification of a tomato gene for the ethylene-forming enzyme by expression in yeast.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. 88 (16), 7434-7437 (1991).</li>
<li>Kim, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assessment+of+ethylene+removal+with+Pseudomonas+strains%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Hazard.+Mater%22%5BJournal%5D)">Assessment of ethylene removal with Pseudomonas strains.</a> J. Hazard. Mater. 131 (3), 131-136 (2006).</li>
<li>Kim, H. E., Shitashiro, M., Kuroda, A., Takiguchi, N., Kato, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ethylene+chemotaxis+in+Pseudomonas+aeruginosa+and+other+Pseudomonas+species%5BTitle%5D)+AND+%22Microbes+Environ%22%5BJournal%5D)">Ethylene chemotaxis in Pseudomonas aeruginosa and other Pseudomonas species.</a> Microbes Environ. 22 (2), 186-189 (2007).</li>
<li>Augimeri, R. V., Strap, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+phytohormone+ethylene+enhances+bacterial+cellulose+production%2C+regulates+CRP%2FFNRKx+transcription+and+causes+differential+gene+expression+within+the+cellulose+synthesis+operon+of+Komagataeibacter+%28Gluconacetobacter%29+xylinus+ATCC+53582%5BTitle%5D)+AND+%22Front.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The phytohormone ethylene enhances bacterial cellulose production, regulates CRP/FNRKx transcription and causes differential gene expression within the cellulose synthesis operon of Komagataeibacter (Gluconacetobacter) xylinus ATCC 53582.</a> Front. Microbiol. 6, 1459(2015).</li>
<li>Zhang, W., Wen, C. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Preparation+of+ethylene+gas+and+comparison+of+ethylene+responses+induced+by+ethylene%2C+ACC%2C+and+ethephon%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol.+Biochem%22%5BJournal%5D)">Preparation of ethylene gas and comparison of ethylene responses induced by ethylene, ACC, and ethephon.</a> Plant Physiol. Biochem. 48 (1), 45-53 (2010).</li>
<li>Zhang, W., Hu, W., Wen, C. K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ethylene+preparation+and+its+application+to+physiological+experiments%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Signal.+Behav%22%5BJournal%5D)">Ethylene preparation and its application to physiological experiments.</a> Plant Signal. Behav. 5 (4), 453-457 (2010).</li>
<li>Warner, H. L., Leopold, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ethylene+evolution+from+2-chloroethylphosphonic+acid%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Ethylene evolution from 2-chloroethylphosphonic acid.</a> Plant Physiol. 44 (1), 156-158 (1969).</li>
<li>Biddle, E., Kerfoot, D. G. S., Kho, Y. H., Russell, K. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kinetic+studies+of+the+thermal+decomposition+of+2-chloroethylphosphonic+acid+in+aqueous+solution%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Kinetic studies of the thermal decomposition of 2-chloroethylphosphonic acid in aqueous solution.</a> Plant Physiol. 58 (5), 700-702 (1976).</li>
<li>Klein, I., Lavee, S., Ben-Tal, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+water+vapor+pressure+on+the+thermal+decomposition+of+2-chloroethylphosphonic+acid%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiol%22%5BJournal%5D)">Effect of water vapor pressure on the thermal decomposition of 2-chloroethylphosphonic acid.</a> Plant Physiol. 63 (3), 474-477 (1979).</li>
<li>Murashige, T., Skoog, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+revised+medium+for+rapid+growth+and+bio+assays+with+tobacco+tissue+cultures%5BTitle%5D)+AND+%22Physiol.+Plant%22%5BJournal%5D)">A revised medium for rapid growth and bio assays with tobacco tissue cultures.</a> Physiol. Plant. 15 (3), 473-497 (1962).</li>
<li>Schramm, M., Hestrin, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Factors+affecting+production+of+cellulose+at+the+air%2Fliquid+interface+of+a+culture+of+Acetobacter+xylinum%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Gen.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Factors affecting production of cellulose at the air/liquid interface of a culture of Acetobacter xylinum.</a> J. Gen. Microbiol. 11 (1), 123-129 (1954).</li>
<li>Schneider, C. A., Rasband, W. S., Eliceiri, K. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((NIH+Image+to+ImageJ%3A+25+years+of+image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Methods%22%5BJournal%5D)">NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis.</a> Nat. Methods. 9 (7), 671-675 (2012).</li>
<li>Ciolacu, D., Ciolacu, F., Popa, V. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Amorphous+cellulose-structure+and+characterization%5BTitle%5D)+AND+%22Cellul.+Chem.+Technol%22%5BJournal%5D)">Amorphous cellulose-structure and characterization.</a> Cellul. Chem. Technol. 45 (1), 13-21 (2011).</li>
</ol>

Yazarların açıklayacak hiçbir şeyi yoktur.

Burada tarif edilen yöntemler modeli organizma, K. kullanılarak bakteriyel etilen tepkisinin incelenmesi için CEPA etilenin in situ üretimini anahat xylinus. Etilen bir pH&#39;a CEPA saf etilen gazı veya özel laboratuar ekipmanı ihtiyacını ortadan sahip daha büyük 3.5 10,11 sahip herhangi bir sulu ortam ilave üretilebilir Bu yöntem çok yararlıdır. Bu yöntem, bakterilerin Cepa türetilmiş Etilenin etkilerini incelemek ile sınırlı değildir, aynı zamanda ökaryotik organizmalarda etilen ...

Olefin (C2 lH 4) havagazı lambaları kullanılan bir laboratuarda yetiştirilir bezelye fide, (hipokotiller) daha kısa olduğu gövde olan bir anormal morfoloji sergilemiş olduğu gözlemlenmiştir, birinci 1901, bir bitki hormonu olarak tespit edilmiştir, daha kalın ve normal bezelye fide ile karşılaştırıldığında yan bükülmüş; Bir fenotip sonra üçlü cevap 1,2 olarak nitelendirdi. Daha sonraki çalışmalar, etilen gibi büyüme, stres yanıtı, meyve olgunlaşma ve yaşlanma 3. Arabidopsis thaliana, bitki biyolojisi araştırma için bir model organizma olarak çok sayıda gelişimsel süreçleri düzenleyen önemli bir fitohormondur, iyi etilen verdiği yanıtta açısından incelenmiştir olduğunu göstermiştir. Çeşitli etilen tepki mutantlar koyu yetişkin A&#39;da görülen üçlü cevap fenotip istismar ederek izole edilmiştir etilen 1,4,5 mevcudiyetinde thaliana fideleri. bitkilerdeki etilen üretimi için biyosentetik ön-madde 1-a,minocyclopropane karboksilik asit (ACC) 6 ve yaygın olarak üç karşılık fenotipi 1,4,5 neden endojen, etilen üretimini geliştirmek için üçlü cevap deneyi sırasında kullanılır. Etilen yanıtı yaygın bitkilerde çalışılan olmasına rağmen, bakteriler üzerinde eksojen etilen etkisi büyük ölçüde bitkiler ile bakterilerin yakın ilişki rağmen understudied edilir. Bir çalışmada, belirli Pseudomonas suşları karbon ve enerji 7&#39;nin tek kaynağı olarak etilen kullanarak hayatta olduğunu bildirdi. Ancak, yalnızca iki çalışma bakteri etilen yanıt göstermiştir. İlk çalışma göstermiştir ki Pseudomonas aeruginosa, P. suşları fluorescens, P. putida ve P. syringae eriyik agaroz, saf etilen gazı 8 ile dengelenmiş bir kemotaksis tampon maddesi ile karıştırıldı olan bir agaroz tıkayıcı deneyi kullanılarak, etilen bakımından kemotaktik edildi. Ancak, bildiğimiz kadarıyla, hiçbir Furth olmuşturSaf etilen gazı kullanılarak er raporları nedeniyle özel ekipman olmadan laboratuvarda gazların sevkinde güçlüğüne muhtemel bakteriyel etilen tepkisini, karakterize etmek. Bakteriyel etilen tepkisinin ikinci rapor etilen 9 xylinus meyve ilişkili bakteri Komagataeibacter (eski Gluconacetobacter) bakteriyel selüloz üretimi ve etkisinde gen ifadesini arttığını gösterdi. Bu durumda, etilen-salan bileşik, 2-chloroethylphosphonic asit (İEKB) saf etilen gazı ve özel ekipman ihtiyaç kalmaz, bakteriyel büyüme ortamında in situ etilen meydana getirmek üzere kullanıldı. - 14, bir baz katalizörlü, birinci dereceden reaksiyon 12 boyunca pH 3.5 10,11 Yukarıdaki: 1 molar oranında İEHB 1 etilen üretir. CEPA bozunması pozitif Etil pH ve sıcaklık 13,14 ve sonuçlar ile ilişkilidiren, klorür ve fosfat. CEPA gaz etilen için uygun bir alternatif etilen bakteriyel yanıtları okuyan ilgilenen araştırmacılar sağlar. Aşağıdaki protokoller genel amacı bakteriyel etilen tepkisini incelemek için basit ve etkili bir yöntem sağlamaktır ve bakteriyel büyüme ortamında CEPA&#39;nın ayrışma etilen üretiminin fizyolojik olarak uygun seviyelerinin doğrulaması içerir, kültür pH analizi CEPA ayrışma sırasında zarar görmemesini sağlamak için bakteri üremesi ve bakteriyel morfoloji ve fenotip üzerindeki etilen etkisi değerlendirilmesi. Biz K. kullanarak bu protokolleri göstermek xylinus, bununla birlikte, bu protokoller uygun büyüme ortamı kullanılarak ve fenotip analizi diğer bakterilerde etilen tepkisini incelemek için adapte edilebilir.

<table><tbody><tr><td>1-aminosiklopropan karboksilik asit (ACC)</td><td>Sigma</td><td>A3903</td><td>Bitkilerde etilenin biyosentetik öncüsü</td></tr><tr><td>4 sektörlü Petri kabı</td><td>Phoenix Biomedical</td><td>CA73370-022</td><td>Üçlü yanıtı test etmek için</td></tr><tr><td>Agar</td><td>BioShop</td><td>AGR001.1</td><td>Ortamı katılaştırmak için</td></tr><tr><td>Canon Rebel T1i DLSR fotoğraf makinesi</td><td>Canon</td><td>3818B004</td><td>Pelikül</td></tr> <tr><td>resimleri içinTrichoderma reesei ATCC 26921&nbsp'den selülaz;</td><td>Sigma</td><td>C2730</td><td>Sulu çözelti</td></tr><tr><td>Sitrik asit</td><td>BioShop</td><td>CIT002.500</td><td>SH ortamı için</td></tr><tr><td>Ticari çamaşır suyu</td><td>Life Marka</td><td>57800861874</td><td>Tohum sterilizasyonu için çamaşır suyu</td></tr><tr><td>Konsantre HCl</td><td>BioShop</td><td>HCL666.500</td><td>pH ayarı için hidroklorik asit</td></tr><tr><td>Dijital USB mikroskop</td><td>Takılabilir</td><td>N/A</td><td>Koloni resimleri için</td></tr><tr><td>Ethephon (> 96%; 2-kloroetilfosfonik asit)</td><td>Sigma</td><td>C0143</td><td>Etilen salgılayan bileşik</td></tr><tr><td>Glikoz</td><td>BioBasic</td><td>GB0219</td><td>SH ortamı için</td></tr><tr><td>Komagataeibacter xylinus ATCC 53582</td><td>ATCC</td><td>53582</td><td>Bakteriyel selüloz üreten alfaproteobakteri</td></tr><tr><td>Mikrosantrifüj tüpü</td><td>LifeGene</td><td>LMCT1.7B</td><td>1.7 ml mikrosantrifüj tüpü</td></tr><tr><td>Murashige ve Skoog (MS) bazal orta&nbsp;</td><td>Sigma</td><td>M5519</td><td>Arabidopsis thaliana büyüme ortamı</td></tr><tr><td>Na2HPO4&middot; 7H<alt>2</alt>O&nbsp;</td><td>BioShop</td><td>SPD579.500</td><td>Sodyum fosfat, SH ortamı NaCl için dibazik heptahidrat</td></tr><tr><td></td><td>BioBasic</td><td>SOD001.1</td><td>Tuzlu su ve kontrol çözeltisi için sodyum klorür</td></tr><tr><td>NaH2PO 4 ve orta nokta; H<alt>2</alt>O&nbsp;</td><td>BioShop</td><td>SPM306.500</td><td>Sodyum fosfat, kontrol çözeltisi NaOH için monobazik monohidrat</td></tr><tr><td></td><td>BioShop</td><td>SHY700.500</td><td>pH ayarı için sodyum hidroksit</td></tr><tr><td>Parafin filmi</td><td>Parafilm</td><td>PM996</td><td>Plakaları ve şişeleri sızdırmaz hale getirmek için</td></tr><tr><td>Pepton (bakteriyolojik)</td><td>BioShop</td><td>PEP403.1</td><td>SH ortamı</td></tr><tr><td>Petroff-Hausser sayma odası</td><td>Hausser için Bilimsel</td><td>3900</td><td>Bakteriyel hücre sayma odası</td></tr><tr><td>Polietersülfon sterilizasyon filtresi 0.2 ve mikro; m</td><td>VWR</td><td>28145-501</td><td>Selülazı sterilize etmek için</td></tr><tr><td>Sükroz</td><td>BioShop</td><td>SUC600.1</td><td>MS ortamı için</td></tr><tr><td>Maya özütü</td><td>BioBasic</td><td>G0961</td><td>SH ortamı için</td></tr></tbody></table>

aracı olarak etilen serbest bileşik, 2-chloroethylphosphonic acid, kullanan bakterilerin etilen yanıtı eğitim için

Utilizing the Ethylene-releasing Compound, 2-Chloroethylphosphonic Acid, as a Tool to Study Ethylene Response in Bacteria

Etilen (C2H4), bitki gelişiminin çeşitli yönlerinde yer alan, yaşlanma ve meyve olgunlaşmasında baskın rol oynayan gaz halinde bir fitohormondur. Erken bitki gelişimi sırasında uygulanan eksojen etilen, üçlü tepki fenotipini tetikler; abartılı bir apikal kancaya sahip daha kısa ve daha kalın bir hipokotil. Bitkiler ve bakteriler arasındaki yakın ilişkiye rağmen, eksojen etilenin bakteriler üzerindeki etkisi büyük ölçüde göz ardı edilmiştir. Bu kısmen, özel ekipman olmadan laboratuvarda gaz halindeki etilenin kontrol edilmesinin zorluğundan kaynaklanmaktadır. 2-Kloroetilfosfonik asit (CEPA), pH 3.5 veya daha yüksek sulu bir ortamda çözündüğünde 1:1:1:1 molar oranda etilen, klor ve fosfata ayrışan bir bileşiktir. Burada, meyve ile ilişkili, selüloz üreten bakteri Komagataeibacter xylinus'u model organizma olarak kullanarak bakterilerde etilen tepkisinin araştırılması için yerinde etilen üretmek için CEPA'nın kullanımını açıklıyoruz. Burada açıklanan protokoller, hem Arabidopsis thaliana üçlü yanıt testi yoluyla CEPA'dan etilen üretiminin doğrulanmasını hem de eksojen etilenin K. xylinus selüloz üretimi, pelikül özellikleri ve kolonyal morfoloji üzerindeki etkilerini içerir. Bu protokoller, uygun büyüme ortamı ve fenotip analizleri kullanılarak etilenin diğer mikroplar üzerindeki etkisini incelemek için uyarlanabilir. CEPA'nın kullanımı, araştırmacılara bakteriyel etilen tepkisinin rutin olarak belirlenmesi için saf etilen gazına basit ve verimli bir alternatif sunar.

Üçlü cevap testi ile SH ortamında CEPA etilen kurtuluş (pH 7) doğrulanması için bir şematik plaka kurulum Şekil 1A gösterilmiştir - C. Zar protokolünü gösteren bir akış şeması Şekil 2&#39;de Koyu-yetişkin A. gösterilir thaliana fideler ACC mevcudiyetinde ve SH ortamı Cepa ayrışma yoluyla üretilen etilen (pH 7) varlığında üçlü cevap fenotipi (abartılı apikal kancalı daha kısa ve daha kalın hipokotil) sergiler, fakat teda...

Burada özetlenen protokoller, 2-kloroetilfosfonik asit (CEPA) kullanarak bakteriyel etilen yanıtlarının uygun şekilde araştırılmasını kolaylaştırır. Etilen, CEPA'nın sulu bir bakteri üreme ortamında ayrışması yoluyla yerinde üretilir ve saf etilen gazı gereksinimini ortadan kaldırır.

Aracı Olarak Etilen serbest Bileşik, 2-chloroethylphosphonic acid, kullanan Bakterilerin Etilen Yanıtı Eğitim için

Ethylene (C2H4) is a gaseous phytohormone that is involved in numerous aspects of plant development, playing a dominant role in senescence and fruit ...

Bu prosedürün genel amacı, bakterilerin etilene verdiği yanıtın incelenmesi için basit ve güvenli bir yöntem sunmaktır. Bu yöntem, etilenin bitkilerde bakteriyel yapışma ve kolonizasyondaki rolü gibi bitki-mikrop etkileşimlerine dair temel soruları yanıtlayacaktır. Bu tekniğin temel avantajı, herhangi bir özel ekipman gerektirmemesi ve laboratuvarda gaz halindeki etilenle çalışmaktan çok daha güvenli olmasıdır.Bu yöntem, bakteriyel selüloz üretiminin etilenden nasıl etkilendiğine dair bilgi sağlayabilmesinin yanı sıra, etilen aracılı süreçlerin bitki kolonizasyonuna nasıl dahil olduğunu in vitro olarak incelemek amacıyla bitki ilişkili diğer mikroorganizmalar için de uygulanabilir. Hazırlık aşamasında, Arabidopsis fideleri için 100 mililitre büyüme ortamı ve CEPA ayrışması için 100 mililitre bakteriyel büyüme ortamı hazırlayın. Arabidopsis ortamı oda sıcaklığına geldiğinde, 40 mililitreyi steril bir flaska ayırın ve bu alikotu 40 µL 10 mM ACC ile destekleyin.Şimdi, plaka kadranlarına beş mililitre besiyeri ekleyin ve agarın katılaşmasını bekleyin. Tüm plakaların karşıt kadranlarında bakteri büyüme besiyeri ve arabidopsis besiyeri bulunur. Üç farklı besiyeri konfigürasyonu kullanın.CEPA işlemi protokolün ilerleyen aşamalarında gerçekleştirilecektir. Her plaka konfigürasyonunu üç tekerrürlü olarak hazırlayın. Agar soğuduktan sonra, arabidopsis ortamının her kadranına yaklaşık 50 tohumu eşit şekilde dağıtın.Ardından, plakları dört derece santigrat sıcaklıkta, karanlıkta üç ila dört gün boyunca inkübe edin. Daha sonra, tohumları inkübe ettikten sonra iki saat boyunca floresan ışığa maruz bırakın. Ardından, bir plak konfigürasyonunun bakteriyel agarı üzerine 10 µL 500 mM CEPA stok çözeltisi yayın.Agar içerisindeki nihai CEPA konsantrasyonu 1 mM olacaktır. Şimdi, tüm plakaları laboratuvar filmi ile kapatın ve folyoya sarın. Ardından, plakaları agar tarafı aşağı gelecek şekilde 23 °C sıcaklıkta karanlık bir ortama yerleştirin ve tohumların çimlenmesi için üç gün boyunca inkübe edin.Tohumlar çimlendikten sonra, her bir işleme karşılık gelen fideleri çıkarmak için alevle sterilize edilmiş pensler kullanın. Toplamda işlem başına 180 adet olacak şekilde, her kuadrandan 30 fide seçin. Fideleri, ölçekleme için yanına bir cetvel koyarak siyah bir arka plan önünde, bir diseksiyon mikroskobu altında veya yüksek çözünürlüklü bir dijital kamera ile görüntüleyin.Ardından, hipokotil uzunluklarını ImageJ yazılımını kullanarak ölçün. "Straight" aracını kullanarak 10 milimetreyi ölçün ve ölçeği ayarlamak için "Analyze" sekmesi altındaki "Set Scale" seçeneğini belirleyin. Daha sonra, her bir hipokotili ölçmek için "Straight Line" aracı altındaki "Segmented" aracını kullanın ve uzunlukları hesaplamak için M tuşuna basın.Pelikül analizi, bakteriyel selüloz üretimi için standart bir analiz aracıdır. pH ve morfolojik analizler ilgili protokolde detaylandırılmıştır. Hazırlık aşamasında, hücreleri başlangıç kültürlerinden üç tekrarlı olarak toplayın ve hücreleri bir Petroff-Hauser Sayım Odası kullanarak nicelleştirin.Ardından, farklı CEPA konsantrasyonlarına sahip dört adet ortam ana karışımı hazırlayın. Her bir ana karışım için, 60 mililitre pH 7 SH ortamı alikote edin ve sıfır, 0,1, 0,1 veya 1,0 milimolar nihai CEPA konsantrasyonları elde etmek için sıfır, beş, 50 veya 500 milimolar CEPA stok çözeltisinden 120 mikrolitre ekleyin. Bu ortamları flaskları çalkalayarak karıştırın.Her bir triplikat için bir set besiyeri gereklidir ve steril kontrol olarak görev yapması için dördüncü bir set gereklidir. Bu nedenle, hazırlanan her 60 milliliter besiyerini dört adet 14 milliliter alikota bölün. Ardından, mililitre başına 100,000 hücre nihai konsantrasyonunda ilgili başlangıç kültürleri ile inoküle etmeden önce 14 milliliter alikotları ön soğutma işlemine tabi tutun.Selüloz üretimini önlemek için inoküle edilen tüm tüpleri buz üzerinde tutun. Kalan 14 mikrolitrelik alikotları steril kontrol kuyucukları için kullanın. Şimdi, her 14 mikrolitrelik ana karışımdan, analiz edilen başlangıç kültürü başına toplam dört yüklü plaka olacak şekilde, steril bir 24 kuyucuklu plakanın altı kuyucuğuna ikişer mikrolitrelik alikotlar yükleyin.Plakaları parafin film ile dikkatlice mühürleyin ve 30 °C'de yedi gün boyunca statik olarak inkübe edin. İnkübasyon sırasında, ortamın asitliğini periyodik olarak ölçmek için paralel olarak 25 mL'lik bir sıvı kültürü inkübe edin. Asitlik pH 5'in altına düşerse, organizmanın büyümesi CEPA'nın etilene dönüşümünü engelleyecektir ve bu durum söz konusu analizle uyumsuzdur.Bir hafta sonra, pelikül ıslak ağırlığını, kalınlığını, kuru ağırlığını ve kristalliğini hasat edin ve ölçün. Plakadan pelikül toplamak için, karşı kenarı yükseltmek amacıyla pelikülün bir tarafına bastırın ve pensle alın. Tutuşu korurken, fazla medyumu temizlemek için pelikülleri üç saniye boyunca temiz bir kağıt havlu üzerine yerleştirin.Ardından, her bir pelikliği tartın ve bunu ıslak ağırlık olarak kaydedin. Daha sonra, peliklikleri bir cetara hizalayın ve yüksek çözünürlüklü bir dijital kamera kullanarak yan taraftan fotoğraflarını çekin. Pelikliklerin kalınlıklarını belirlemek için bu fotoğrafları analiz edin.Ardından, pelikülleri tek tek altı kuyucuklu bir plakanın kuyucuklarına aktarın. Hücreleri parçalamak için 80 °C'de 20 dakika boyunca 12 mL 0,1 normal sodyum hidroksit ile muamele edin. Daha sonra sodyum hidroksiti uzaklaştırın ve işlem görmüş pelikülleri, altı kuyucuklu bir plakada 24 saat boyunca ajitasyonla 12 mL ultra saf su ile iyice yıkayarak nötralize edin.Bu inkübasyon sırasında suyu her altı saatte bir değiştirin. İnkübasyon sona erdiğinde, peliküller beyaz renkte olmalıdır. Ardından, kuru ağırlık ölçümüne hazırlamak için pelikülleri silikon matlara yerleştirin ve 50 °C'de 48 saat boyunca kurutun.Peliküllerin kristalliği, Fourier dönüşümlü kızılötesi spektroskopisi kullanılarak analiz edilebilir. Karanlıkta büyütülen arabidopsis thaliana fideleri; ACC varlığında ve SH ortamında CEPA bozunması yoluyla üretilen etilen varlığında, kısa ve kalın hipokotil ile belirgin bir apikal kanca ile karakterize edilen üçlü yanıt fenotipini sergilemiş, ancak işlem görmemiş koşullar altında bu durumu sergilememiştir. Açıkça görülmektedir ki, işlem görmüş tohumların hipokotil uzunluğu, işlem görmemiş kontrollere göre anlamlı derecede daha kısadır.Böylece, SH ortamındaki CEPA'dan fizyolojik olarak ilgili bir konsantrasyonda etilen salınımı gerçekleşmiştir. CEPA kaynaklı etilenin tüm konsantrasyonları pelikül yaş ağırlığını önemli ölçüde azaltmış ancak pelikül kalınlığını etkilememiş; CEPA kaynaklı etilenin tüm konsantrasyonları ise pelikül kuru ağırlığını önemli ölçüde artırmıştır. Ayrıca, CEPA kaynaklı etilenin tüm konsantrasyonları pelikül hidratasyonunu azaltmıştır.Bu prosedürü uygularken, CEPA'nın etilene yıkımının engellenmemesi için pH değerinin beşin altına düşmediğinden emin olmak amacıyla büyüme ortamının pH'ını ölçmek önemlidir. Toz halindeki CEPA'nın mukoza zarları için son derece tehlikeli olduğunu unutmayın. Bu protokol uygulanırken her zaman gerekli önlemler alınmalıdır.Bu teknik, bitki-bakteri etkileşimleriyle ilgilenen araştırmacıların, etilen aracılı yanıtları in vitro ortamda güvenle incelemelerine olanak sağlayacaktır. Bu, bitki sinyallerinin bakteriyel kolonizasyon ve adezyonu nasıl yönettiğine ışık tutmaya yardımcı olacaktır. Mevcut durumda, bu alan yeterince çalışılmamıştır.

utilizing-ethylene-releasing-compound-2-chloroethylphosphonic-acid-as

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biyokimya

Biz canlı bakteri stoma yanıt erişmek için basit ve tekrarlanabilir bir protokol geliştirmiştir. Bu yöntem daha önce bildirdiği epidermal peeling kullanımı ile karşılaştırıldığında yaprak yaralama ve manipülasyona en aza indirir.

Tüm Yaprak Görüntüleme kullanarak Bakteriyel Hücreler Live Stoma Tepki Değerlendirilmesi

Kaynak: Nathoo, N., ve diğerleri. Bitki/Mikrop Moleküler Etkileşimlerinin ve Sinyallemenin Eşzamanlı ve Sistematik Analizi için Hidroponik Birlikte Yetiştirme Sistemi. J. Vis. Uzm. (2017).Bu video, steril koşullar altında bitki-bakteri etkileşimlerini incelemek için hidroponik bir birlikte yetiştirme sistemini göstermektedir. Bitki fideleri steril, asidik bir büyüme ortamına aktarılır, inkübe edilir ve Agrobacterium ile aşılamadan önce kontaminasyon açısından incelenir. Aktive edilmiş...

Bitki konakçılarının ve etkileşen bakterilerin moleküler tepkilerini incelemek için bir birlikte yetiştirme sistemi

Kaynak: Augimeri, R. V. ve diğerleri, Bakterilerde Etilen Tepkisini İncelemek İçin Bir Araç Olarak Etilen Salan Bileşik 2-Kloroetilfosfonik Asitin Kullanılması. J. Vis. Uzm. (2016)Bu video, 2-kloroetilfosfonik asit (CEPA) tarafından üretilen etilenin bakteri üremesi ve selüloz üretimi üzerindeki etkisini göstermektedir. Etilen, selüloz sentezini uyaran sinyal yollarını aktive ederek pelikül oluşumunun artmasına neden olur. Bu sonuçlar, etilene bakteriyel tepkiyi vurgulamaktadır.

Etilen Salan Bir Bileşik Kullanarak Etilene Bakteriyel Tepkinin Araştırılması

Patojen büyümesinin niceliksel olarak belirlenmesi, çeşitli Arabidopsis thaliana (bundan böyle Arabidopsis olarak anılacaktır) bağışıklık tepkilerini karakterize etmek için güçlü bir araçtır. Burada açıklanan yöntem, Pseudomonas syringae pv'yi ölçmek için optimize edilmiş bir şırınga infiltrasyon testi sunar. maculicola ES4326 yetişkin Arabidopsis yapraklarında büyüme.

Kullanarak Bitki Savunma Yanıtları ince Karakterizasyonu için Bakteriyel Yaprak Sızma Deneyi<em&gt; Arabidopsis thaliana-Pseudomonas syringae</em&gt; Pathosystem

Diğer bakterilere karşı inhibe edici bileşiklerin üretimi için bakteri kültürlerini taramak için basit bir yöntem açıklıyoruz.

Yumuşak agar üst tabaka tekniği kullanımı bakteriyel olarak üretilmiş önleyici bileşiklerin taranması için

Floresan protein temelli yaklaşımlar konak hücrelere bakteriler tarafından salgılanan effectors izlemek için zor olan. Bu tip III salgı sistemi ve floresan proteinler arasındaki uyumsuzluk kaynaklanmaktadır. Burada, bir en iyi duruma getirilmiş split superfolder GFP sistemi ana bitki hücre bakteriler tarafından salgılanan effectors görselleştirme için kullanılır.

Split yeşil flüoresan Protein sistemi effectors görselleştirmek için bakteri enfeksiyonu sırasında teslim.

Bu makalenin amacı, RING tipi E3 ubikitin ligaseskapsamlı biyokimyasal ve fonksiyonel çalışmalar için bir anahat sunmaktır. Ayrıntılı protokollere sahip bu çok aşamalı boru hattı, test edilen proteinin enzimatik aktivitesini doğrular ve aktivitenin işlevine nasıl bağdaştırılabildiğini gösterir.

Ring Tipi E3 Ubiquitin Ligases In Vitro ve Planta Fonksiyonel Karakterizasyonu

Burada, model olarak AT4G18020 (APRR2)-AirID proteini kullanarak salatalıkta (Cucumis sativus L.) yakınlık etiketleme (PL) deneyini gerçekleştirmek için adım adım bir protokol sunuyoruz. Yöntem, bir vektörün inşasını, agroinfiltrasyon yoluyla bir yapının dönüşümünü, biyotin infiltrasyonunu, protein ekstraksiyonunu ve afinite saflaştırma tekniği ile biyotin etiketli proteinlerin saflaştırılmasını açıklar.

Bitkilerde protein-protein etkileşimi için AirID tabanlı yakınlık etiketlemesi

Bu protokol, bitki apoplastı içinde yetiştirilen Pseudomonas şırıngası popülasyonları üzerinde tek hücreli gen ekspresyon analizine izin veren bir yöntemi açıklamaktadır.

Bitki Dokusu İçindeki Pseudomonas syringae Genlerinin Ekspresyonunun Tek Hücreli Analizi

Bu protokol, aynı örnekte bitki iyon sızıntısı, peroksidaz aktivitesi ve kallos üretimini değerlendirmek için yüksek verimli bir yaklaşımı tanımlar.

Mikrobiyal İkincil Metabolitlere Yaprak Yanıtlarının Yüksek Verimlilikli Bir Formatla Değerlendirilmesi

Öğrenin, bakterilerin etilen yanıtını 2-chloroethylphosphonic acid kullanarak güvenli şekilde nasıl inceleyeceğinizi. Bu yöntem, bitki-mikrop etkileşimlerinde etilenin rolünü araştırmak için özel ekipman gerektirmeden laboratuvar ortamında uygulanabilir.

Aracı Olarak Etilen serbest Bileşik, 2-chloroethylphosphonic acid, kullanan Bakterilerin Etilen Yanıtı Eğitim için

Daha fazla video keşfet