Name: Baculum diseksiyonu, mikroBT Tarama ve Morfometrik Analizleri (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-03-19T15:00:00.000+00:00
Duration: 4 min 32 s
Description: Öğrenin, fare baculumunun morfometrik analizi için diseksiyon ve mikroBT tarama tekniklerini kullanarak. Bu yöntem, belirgin referans noktaları olmayan karmaşık biyolojik yapıların üç boyutlu ölçümünü sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Tim Daley ve Andrew Smith ilk günlerinde birçok yararlı hesaplama tartışmalar sağlanan; Tim Daley Hesaplamalı kaynakları Güney Kaliforniya Üniversitesi&#39;nde Yüksek Başarımlı Hesaplama Cluster tarafından sağlanan Protokolün 5. için gerekli program rotate_translate_cylindrical yazdı. Bu çalışma NIH hibe # GM098536 (MDD) tarafından desteklenmiştir.

Tüm prosedürler ve personel Hayvan Bakımı ve Kullanımı Komitesi Güney Kaliforniya Enstitüsü Üniversitesi (IACUC), protokol # 11394 tarafından onaylanmıştır. 1. baculum Diseksiyon ve Hazırlık <ol><li> İlgili Kurumsal Hayvan Bakım ve Kullanım Komitesi (IACUC) tarafından belirlenen protokollere göre, aşırı maruz kalma karbondioksit yoluyla cinsel olgun erkek fare Euthanize. </li><li> yatar pozisyonda hayvan Lay ve başparmak prepusyal açılması yanal ile basınç uygulayarak penis uzatmak. </li><li> Penis uzamış sonra, mümkün olduğu kadar üstderi ile doku genişletmek. </li><li> makasla, baculum bulunduğu peniste penil vücut proksimal kesti. </li><li> 1.7 ml tüp disseke penis aktarın ve 200 ul musluk suyunu ekleyin. Penis tamamen sıvıya olduğundan emin olun. </li><li> 3-5 gün için 50 ° C sıcaklıkta su içinde doku inkübe edin. </li><li&gt; Uygun inkübasyondan sonra, bir diseksiyon mikroskobu altında forseps kullanarak, baculum çevreleyen doku kaldırmak. Yavaşça doku kalan defol ve kemik temizlemek için% 70 etanol fışkırtma. </li><li> Açık bir kap ile, yeni bir mikrosantrifüj tüpü içine parçalara baculum yerleştirin. Açık O kap bırakın / N kemik kurumaya. </li></ol> 2. mikroBT Tarama <ol><li> çiçekçi köpük bir silindir oluşturmak için çiçekçi köpük tuğla içine MikroBT&#39;lerin tarama silindirik tutucu basın. </li><li> çiçekçi köpük silindir Özü ve 2-5 cm kalınlığında ~ dilimleri kesti. </li><li> tarama sırasında girişimi en aza indirmek için tek bir dilimin çevresi etrafında, çiçekçi bir köpük halinde kurutuldu bacula itin. Kemiklerin kesin oryantasyon Protokolde 4 bireysel örneklerin uygun şekilde tanımlanması için izin söylediği edilmelidir. </li><li> Yavaşça MikroBT&#39;lerin tutucu içine gömülü kemikler dilimler yerleştirin. </li><li> MikroBT&#39;lerin taramaları kazanır. Fare Bacula 14 halinde </sup90 kVp, 155 uA, 0.5 mm Al filtre, 180 (360 kapsama) başına 750 projeksiyonları, maruz kalma süresi:&gt;, aşağıdaki ayarları altında USC Moleküler Görüntüleme Merkezi&#39;nde uCT50 tarayıcı (Scanco Medical AG, Bruttisellen, İsviçre) kullanıldı 500 ms ve 15.5 mm voksel boyutu. </li></ol> 3. mikroBT İşleme: Tek .xyz Dosyaya bir .DCM Stack dönüştürme NOT: Her MikroBT&#39;lerin taraması .DCM destesini, ya da &quot;DICOM&quot;, nesnesi üzerinden alınan görüntü dilimleri temsil eden dosyalar oluşturur. x, y, ve her bir pikselin z koordinatlarını ve -5.000 (siyah) dan +5,000 arasında değişen pikselin yoğunluğu, - tüm alt hesaplamalı geometri dört sütun içeren bir metin dosyası sadece olan düz .xyz dosyaları gerektirir (beyaz). 3000 üzerinde bir piksel eşik genellikle kemikleri tanımlamak için bir eşik olarak çalışır. <ol><li> Install Python (www.python.org) ve PYTHON modülleri KOMUTLARI, DICOM, PyLab, SYS ve numpy. </li><li> Aç &quot;01_process_dicom.py &quot;herhangi bir metin editörü ile {Figshare}. Gerekirse Değişkenler bölümünde, değişim yolunda, piksel eşikleri ve dizin adları altında. </li><li> &quot;Python 01_process_dicom.py&quot; çalıştırın. İlerleme ekrana basılacaktır. Adım 3.2 adlı her dizin içinde, yeni bir dosya adı imal edilmektedir; örneğin, PT3000 piksel eşiğini gösterir directory_name.PT3000.xyz aşama 3.2&#39;de gösterilen. </li></ol> 4. mikroBT işleme: segmentlere-out Bireysel Numune Files .xyz <ol><li> Kütüphane RGL&#39;nin ile Ar (https://www.r-project.org/) yükleyin. </li><li> herhangi bir metin editörü ile dosya &#39;02_segment_dicoms.r&#39; {Figshare} açın. Değişkenler bölümünde, yukarıda Protokolde 3 oluşturulan .xyz dosyaya işaret yolu adını değiştirin. </li><li> R içinden, (çift tırnak işaretleri olmadan) komutu &quot;kaynak ( &#39;02_segment_dicoms.r&#39;)&quot; çalıştırın. </li><li> Protokol 3&#39;te oluşturulan .xyz dosyasının üç boyutlu görüntü sonra görünür numbe giringenel .xyz dosyasında örneklerin R. Sonra etiket ve kaydırma ve yakınlaştırma işlevleri kullanarak her örnekten noktalarını seçin. NOT: Arka planda, ayrı .xyz dosyalar her numune için yapılacaktır. Bunlar PT3000 kullanılan piksel eşiğini gösterir, örneğin, XYZ_FILES_PT3000 için, adlı bir dizinde görünür. </li></ol> &quot;Hizalama&quot; 5. Numune Ortak Koordinatlar Dosyaları .xyz. <ol><li> ek modül mattdean_modules.py {Figshare} yanı sıra, iki kendi başına ayakta durabilen uygulama gerektirir Python komut &quot;03_transform.py&quot; {Figshare} açın &quot;rotate_translate_cylindrical&quot; (https://github.com/timydaley/dean_cylindrical_tranform) ve &quot;qconvex&quot; (www.qhull.org/html/qconvex.htm) Bu komut dosyası tarafından kullanılan. </li><li> Değişkenler bölümünün altında, rotate_path ve qconvex_dir mattdean_modules.py tam yol adları tespit. Buna ek olarak, bireysel .xy içeren dizinin tam yolunu belirlemek4. adımda oluşturduğunuz z dosyalar. </li><li> soneki .TRANSFORMED.xyz ile örnek başına yeni bir dosya oluşturur çalıştırın 03_transform.py. </li></ol> Dosyalar .xyz 6. &quot;Dilimleme&quot; Bağlantısızlar Numune Yarı işaretlerini tanımak. <ol><li> Açık ve Python komut &quot;04_identify_landmarks.py&quot; run {Figshare}. Değişkenler bölümünde, .TRANSFORMED.xyz dosyalarını içeren dizinin tam yol adlarını belirlemek. Bu komut yapısının boyutu ve şekli ölçmek için kullanılabilir 802 yarı işaretlerini tanımlar. </li></ol>

<ol><li>Slice, D. E. <a target="_blank" href="http://www.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev.anthro.34.081804.120613">Geometrics morphometrics.</a> Annu. Rev. Anthropol. 36, 261-281 (2007).</li>
<li>Slice, D. E. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSlice%2C+DE+%22Modern+morphometrics+in+physical+anthropology%22">Modern morphometrics in physical anthropology</a>. 6, Springer. (2005).</li>
<li>Zelditch, M. L., Swiderski, D. L., Sheets, H. D. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aZelditch%2C+ML+%22Geometric+morphometrics+for+biologists%3A+a+primer%22">Geometric morphometrics for biologists: a primer</a>. , 2nd, Elsevier. (2012).</li>
<li>Bookstein, F. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBookstein%2C+F+%22Morphometric+tools+for+landmark+data%3A+geometry+and+biology%22">Morphometric tools for landmark data: geometry and biology</a>. , Cambridge University Press. (1991).</li>
<li>Rohlf, F. J., Marcus, L. F. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21236128">A Revolution in Morphometrics.</a> Trends. Ecol. Evol. 8 (4), 129-132 (1993).</li>
<li>Zelditch, M. L., Swiderski, D. L., Sheets, H. D., Fink, W. L. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aZelditch%2C+ML+%22Geometric+morphometrics+for+biologists%3A+a+primer%22">Geometric morphometrics for biologists: a primer</a>. , Elsevier. (2004).</li>
<li>Rohlf, F. J., Slice, D. E. <a target="_blank" href="https://www.jstor.org/stable/2992207">Extensions of the Procrustes method for the optimal superimposition of landmarks.</a> Syst. Zool. 39 (1), 40-59 (1990).</li>
<li>Gunz, P., Mitteroecker, P. <a target="_blank" href="http://www.italian-journal-of-mammalogy.it/article/view/6292">Semilandmarks: a method for quantifying curves and surfaces.</a> Hystrix. 24 (1), 103-109 (2013).</li>
<li>Gunz, P., Ramsier, M., Kuhrig, M., Hublin, J. J., Spoor, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+mammalian+bony+labyrinth+reconsidered%2C+introducing+a+comprehensive+geometric+morphometric+approach%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Anat%22%5BJournal%5D)">The mammalian bony labyrinth reconsidered, introducing a comprehensive geometric morphometric approach.</a> J. Anat. 220 (6), 529-543 (2012).</li>
<li>Mitteroecker, P., Gunz, P. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1007/s11692-009-9055-x">Advances in geometric morphometrics.</a> Evol. Biol. 36 (2), 235-247 (2009).</li>
<li>Bookstein, F. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Landmark+methods+for+forms+without+landmarks%3A+morphometrics+of+group+differences+in+outline+shape%5BTitle%5D)+AND+%22Med.+Im.+Anal%22%5BJournal%5D)">Landmark methods for forms without landmarks: morphometrics of group differences in outline shape.</a> Med. Im. Anal. 1 (3), 225-243 (1997).</li>
<li>Gunz, P., Mitteroecker, P., Bookstein, F. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aGunz%2C+P+%22Modern+morphometrics+in+physical+anthropology%22">Modern morphometrics in physical anthropology</a>. Slice, D. E. , Kluwer Press. 73-98 (2005).</li>
<li>Oxnard, C., O'Higgins, P. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1162/biot.2009.4.1.84">Biology Clearly Needs Morphometrics. Does Morphometrics Need Biology?</a> Biological Theory. 4 (1), 84-97 (2009).</li>
<li>Schultz, N. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+genetic+basis+of+baculum+size+and+shape+variation+in+mice%5BTitle%5D)+AND+%22G3%22%5BJournal%5D)">The genetic basis of baculum size and shape variation in mice.</a> G3. 6 (5), 1141-1151 (2016).</li>
<li>Schultz, N. G., Lough-Stevens, M., Abreu, E., Orr, T. J., Dean, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+baculum+was+gained+and+lost+multiple+times+during+mammalian+evolution%5BTitle%5D)+AND+%22Integr+Comp+Biol%22%5BJournal%5D)">The baculum was gained and lost multiple times during mammalian evolution.</a> Integr Comp Biol. 56 (4), 644-656 (2016).</li>
<li>Dines, J. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sexual+selection+targets+cetacean+pelvic+bones%5BTitle%5D)+AND+%22Evolution%22%5BJournal%5D)">Sexual selection targets cetacean pelvic bones.</a> Evolution. 68 (11), 3296-3306 (2014).</li>
<li>Adams, D. C., Otárola-Castillo, E. <a target="_blank" href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/2041-210X.12035/abstract">geomorph: an R package for the collection and analysis of geometric morphometric shape data.</a> Methods Ecol. Evol. 4 (4), 393-399 (2013).</li>
</ol>

Yazarlar, rekabet eden hiçbir finansal çıkarları olmadığını beyan ederler.

Yukarıdaki protokol kritik adımlar 1) Bacula diseksiyon vardır, 2) MikroBT&#39;lerin görüntüleri toplama, 3) xyz düz bir dosyaya MikroBT&#39;lerin çıktı dönüştürme, 4) Her numune en nokta bulutu dışarı segmentlere koordinatları, 5) Her numune dönüştürülmesi standart koordinat sistemi, ve 6) yarı yerler tanımlayan. Bu adımlar kolayca farklı nesneleri yerleştirmek için modifiye edilmiştir. Bu yöntemler, olasılıkla çok kavisli en azından esas olarak &quot;çubuk biçimli&quot; ya da herhangi bir ...

Morfometrik alan boyutu ve biyolojik formunun biçimine, bilimsel araştırma, 1, 2, 3, 4, 5, 6 temel bir adım ölçmek için yöntemler çeşitlilik bulunmaktadır. Geleneksel olarak, boyut ve şekil istatistiksel analizi, bir biyolojik yapısına işaretlerini belirlenmesi ve daha sonra, bir çok değişkenli çerçevesinde analiz edilebilir, doğrusal uzaklık, açı ve oranları ölçülerek başlar. Landmark tabanlı Geometrik Morfometri analizi ve görselleştirme 5 üzerinden veri toplama geometrik bilgiler koruyarak yerlerinden uzaysal konumunu koruyan bir yaklaşımdır. Genelleştirilmiş Procrust Analizi (GPA) m numuneler arasında bir uyum üretmek için konum, ölçek ve yerlerinden rotasyon farklılıkları ortadan kaldırmak için uygulanabilironların kare farklılıkları inimizes - ne kalır şekil farklılık 7&#39;dir. Herhangi bir morfometrik analizi önemli bir kavram benzerliği veya bir güvenilir örneklerin ya da yapılar arasında uygun biyolojik olarak anlamlı ve ayrık özellikler gösteren yerler belirleyebilir fikirdir. Örneğin, insan kafatasları morfometrik analizleri etkinleştirebilirsiniz homolog süreçleri, foraminanın, sütürler ve kanalları var. Ne yazık ki, karşılık gelen noktalara tanımlanması düz yüzeyler veya eğri 8, 9, 10, özellikle de, bir çok biyolojik yapılar arasında zordur. Biz hesaplamalı geometri kullanarak aşağıda bu sorunu yaklaşım. genel iş akışı hepsi bu böylece nokta bulutu noktaları bir bulut olarak temsil edilebilir nesnenin üç boyutlu tarama oluşturmak ve sonra döndürmek ve dönüştürmektirpecimens ortak bir koordinat sistemi üzerinde odaklı. Sonra matematiksel nesnenin belirli bölgelerde yarı-işaretlerini tanımlar. Bu tür bölgelere yerleştirilen ayrık yarı görülecek 11 biyolojik keyfi vardır. Keyfi yerleştirilen görülecek biyolojik homolog olmayabilir çünkü not ortalamasına ve sonraki istatistiksel analizler yürütülmesi istenmeyen eserler 8, 12 üretebilir. Bu nedenle, biz bu yarı-görülecek matematiksel &quot;slayt&quot; için izin verir. Bu prosedür, yapılar arasında potansiyel farkı en aza indirir. Başka bir yerde açıklandığı gibi burada kullanılan kayar algoritması yoksun içindeki anatomik bölge ölçmek için uygun olan, kolayca görülecek 3, 6, 8, 10, 11, 12 karşılık gelen tespit edilmiştir. Bu yöntemler kendi li varmitations 13 fakat farklı bir boyut ve şekle sahip nesnelere uyarlanabilir olmalıdır. Burada, bu yöntemin fare baculum 14 son çalışmada uygulanan nasıl göstermek, kazanmış ve memeli evrimi 15 sırasında birden çok bağımsız kez kesildi penis bir kemik. Diseksiyon ve belirli bir kemik hazırlanmasını baculum (Protokol 1), MikroBT&#39;lerin görüntülerin üretimi (Protokol 2) ve tüm alt hesaplama geometri sağlayan bir biçime, bu görüntülerin dönüşüm ele (Protokoller 3 ve 4). ~ 100K xyz koordinatları bu adımlardan sonra, her numune temsil edilir. Biz o zaman etkili bir şekilde ortak yönelim içine tüm örnekler (Protokol 5) hizalamak dönüşümün bir dizi yürümek, sonra hizalanmış numunelerden yarı işaretlerini (Protokol 6) tanımlar. Protokoller 1-4 bakılmaksızın nesne analiz edilen benzer olmalıdır. Protokol 5 ve Protokol 6 SPE vardırkabinini bir baculum için tasarlanmış, ancak bu adımları ayrıntılı tarafından, araştırmacılar kendi ilgi nesnesi için uygun olacağını değişiklikler hayal edebiliyorum bizim umudumuz. Örneğin, bu yöntemlerin değişiklikler balina pelvik kemikleri ve kaburga kemikleri 16 çalışma uygulandı.

<table><tbody><tr><td>Diseksiyon makası</td><td>VWR</td><td>470106-338</td><td>Çoğu boyut çalışmalıdır</td></tr><tr><td>Diseksiyon Forseps, İnce Uç, Kavisli</td><td>VWR</td><td>82027-406</td><td></td></tr><tr><td>1.7 mL mikrosantrifüj tüpü</td><td>VWR</td><td>87003-294</td><td></td></tr><tr><td>Mutlak Etanol</td><td>Fisher Scientific</td><td>CAS 64-17-5</td><td>Diseksiyonlar için% 70'e seyreltilmelidir</td></tr><tr><td>Çiçek Köpüğü</td><td>Toptan Çiçek</td><td>6002-48-07</td><td></td></tr><tr><td>uCT50 tarayıcı&nbsp;</td><td>Scanco Medical AG, Bruttisellen, İsviçre</td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

baculum diseksiyonu, mikrobt tarama ve morfometrik analizleri

Dissection, MicroCT Scanning and Morphometric Analyses of the Baculum

Modern Morfometri boyutu ve şekli varyasyonu ölçmek için güçlü bir yöntem sağlar. Bir temel gereksinimi yerlerinden tanımlayan koordinatların bir listesi; ancak bu tür koordinatlar örneklerin arasında homolog yapılar temsil etmelidir. Birçok biyolojik nesneler homoloji varsayımı karşılamak için kolayca tespit yerlerinden oluşan ederken, birçok tür yapıları yoksundur. Bir potansiyel çözüm örneklerinin arasında aynı morfolojik bölgeyi temsil bir nesne üzerinde yer yarı işaretlerini matematiksel olarak etmektir. Burada, matematiksel fare baculum (penis kemiği) yarı-işaretlerini tanımlamak için yeni geliştirilmiş bir boru hattı göstermektedir. Bizim yöntemler nesnelerin geniş bir geçerli olmalıdır.

Protokolde 6 üretilen yarı yerlerinden xyz koordinatlar doğrudan herhangi bir dönüm noktası tabanlı geometrik morfometrik analizi 17 içine alınabilir. Hesaplamalı boru hattı üzerinde fare Bacula 14, yanı sıra balina pelvik ve kaburga kemikleri 16 incelemek için uygulanmıştır. Yarı yerlerinden hesaplama tanımı ile ilgili daha fazla detay araştırmacıların ilgi kendi özel nesne karşılamak için modifiye edilebilir adımla...

Birçok biyolojik yapılar zor, modern morfometrik yöntemleri uygulamak için yapım, kolayca tanımlanabilir yerlerinden yoksundur. İşte biz boyutunu ölçmek ve varyasyonu şekillendirmek için kullanılan yarı işaretlerini belirlemek için hesaplama yöntemleri takip diseksiyon ve MikroBT&#39;lerin tarama dahil fare baculum (penis bir kemik), çalışma yöntemleri göstermektedir.

Baculum diseksiyonu, mikroBT Tarama ve Morfometrik Analizleri

Modern morphometrics provides powerful methods to quantify size and shape variation. A basic requirement is a list of coordinates that define landmarks; ...

Bu diseksiyon ve morfometrik analizinin genel amacı, fare penis kemiği gibi karmaşık şekillere sahip yapıların incelenmesinde morfometrik metodolojimizin dayanıklılığını göstermektir. Uzunluk ve genişlik boyutlarının alınması gibi mevcut bakulum varyasyon ölçüm yöntemlerinin, eğrilik ve şekil karmaşıklığına dair tüm bilgileri kaybettiğini fark ettiğimizde bu çalışma fikri ilk kez ortaya çıktı; bu nedenle, ilgilenilen herhangi bir kemiğin veya yapının boyut ve şekil varyasyonunu üç boyutta nicelleştirmek için bu yöntemi geliştirdik. Bu tekniğin temel avantajı, modern morfometriyi belirgin işaret noktaları (landmark) bulunmayan yapılara uygulamasıdır.Bu çalışma, karmaşık yapıların tekrarlanabilirliğinin artırılmış ölçümlerini sağlayarak alanı geliştirmelidir. Ötanazi uygulanmış, cinsel olarak olgun bir erkek fareyi sırtüstü konumlandırın ve prepusyal açıklığın yan tarafına başparmakla baskı uygulayarak penisi dışarı çıkarın. Penis ortaya çıktıktan sonra, dokuyu prepusun içinden mümkün olduğunca ileriye doğru uzatın.Ardından, makas kullanarak, baculumun bulunduğu bölgeden gland penis'in proksimalinden penis gövdesini kesin ve penisi ayırın. Daha sonra penisi, bir mikrosantrifüj tüpü i

dissection-microct-scanning-and-morphometric-analyses-of-the-baculum

Research

JoVE Journal

Bioengineering

Biyomühendislik

Diseksiyon yaygın doku içindeki DNA, RNA ve protein incelenmesi için kullanılmıştır. Lazer yakalama mikroskobu (LCM) en sık kullanılan yöntem, ancak, yeni bir freze tekniği, mesodissection, son zamanlarda kullanılabilir. Biz mesodissected formalin sabit parafin Mycobacterium tuberculosis granülomlarının gömülü doku slaytlar RNA çıkarma göstermektedir.

Kurtarma Bir Roman Mikrodiseksiyon Yaklaşımı<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</emAkciğer granülomlara Gömülü Formalinle Sabit Parafin dan&gt; Özel Transkript

Boyuna değerlendirilmiş vivo içinde bir semiautomated microcomputed tomografi tabanlı nicel yapısal analizi kullanarak olabilir bir çıplak sıçan vertebral kompresyon Osteoporoz ile ilgili kırık modeli oluşturmak için bu iletişim kuralını hedefidir.

Semiautomated boyuna Microcomputed tomografi tabanlı nicel yapısal analizi bir çıplak sıçan vertebra kırığı Osteoporoz ile ilgili Model

Bu el yazması xarakteristikaları ve kemirgenler çene kemiğinde düzgün içinde hücresel değişikliklerin analizi için yöntemler sunar.

Bir xarakteristikaları ve fare çene kemiğinde düzgün için hücresel analiz yöntemi

Microglia anket ve değişmiş beyin fizyolojisi kantitatif değerlendirilecek morfolojik değişiklikleri ile tepki beyin bağışıklık hücreleri vardır. Bu iletişim kuralı özetliyor bir ImageJ microglia morfoloji hücre yaklaşım, karmaşıklık ve şekli gibi ölçümleri göre sürekli veri olarak temsil etmek için analiz protokolüne dayalı.

ImageJ kullanarak doku hazırlanan immünhistokimya Photomicrographs üzerinden Microglia morfoloji miktarının

Kemik eksektijinin ex vivo kültürü kemik fizyolojisi ve kemik remodeling ve kemik hastalıklarında ilaçların potansiyel değerlendirilmesi çalışmaları için değerli bir araç olabilir. Sunulan protokol, yeni doğan fare kafataslarından izole edilen calvariaların hazırlanmasını ve kültürünün yanı sıra uygulamalarını da açıklamaktadır.

Calvaria Co-culture ve Histomorfometri Kullanarak Kemik Remodeling ve Tümör-Kemik Mikroortamı yeniden oluşturma

Bu protokol, in vivo osteoklast aktivitesini kontrol eden kritik genleri anlamak için kurallı bir yöntemi açıklar. Bu yöntem, iskelet fenotipini analiz etmek için transgenik bir fare modeli ve bazı kurallı teknikler kullanır.

Koşullu Stat3 Silme Fare Modelinin İskelet Fenotip Analizi

Murine hipokampustaki dendritik dikenleri görüntülemek ve analiz etmek için Seri Blok-Yüz Tarama Elektron Mikroskopisi (SBEM) uygulanır.

Dendritik Dikenlerin Çalışması için Seri Blok-Yüz Tarama Elektron Mikroskopisi (SBEM)

Bu protokol, Hematoksilen-Eozin (HE) boyama ve mikro-bilgisayarlı tomografi (Mikro-BT) tekniklerini birleştirerek osteoporozun fare modelinde kemik mikromimarisinin kantitatif değerlendirilmesi için ekonomik ve etkili bir yöntem sunar.

Osteoporoz Fare Modelinde Trabeküler Kemik Mikromimarisinin Değerlendirilmesi

Burada, farelerde kraniyomaksillofasiyal kemik gelişiminin mevcut yöntemlerle mümkün olandan daha iyi değerlendirilmesi için farelerde kraniyomaksillofasiyal kemiklerin 3D modellerini segmentlere ayırmak ve ölçmek için mikrobilgisayarlı tomografiye dayanan bir yöntemi derinlemesine açıklıyoruz.

Üç Boyutlu Mikrobilgisayarlı Tomografi Kullanılarak Farelerde Kraniyomaksillofasiyal Malformasyonların Analizi

Kemik yenilenmesini çeşitli hiyerarşik seviyelerde değerlendirmek için bir protokol öneriyoruz. Bu çok modlu yaklaşım, farklı uzunluk ölçeklerinde yapısal analizlere olanak tanır ve örnek hazırlığındaki zorlukları etkili bir şekilde ele alır. Ayrıca, biyomalzemelerin kemik yenilenmesini teşvik etmedeki etkinliğini değerlendirmek için güvenilir bir iş akışı sağlar.

Kemik Yenilenmesi ve İskelet Performansını Değerlendirmek İçin Multimodal Yaklaşım

Öğrenin, fare baculumunun morfometrik analizi için diseksiyon ve mikroBT tarama tekniklerini kullanarak. Bu yöntem, belirgin referans noktaları olmayan karmaşık biyolojik yapıların üç boyutlu ölçümünü sağlar.

Baculum diseksiyonu, mikroBT Tarama ve Morfometrik Analizleri

Daha fazla video keşfet