Name: Vitro Sirkadiyen ritim meme epitel hücreleri ayırdetmek için bioluminescence tahlil (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-09-28T12:30:00.000+00:00
Duration: 11 min 56 s
Description: Öğrenin meme epitel hücrelerinde sirkadiyen ritmi değerlendirmek için biyolüminesans analiz yöntemini. Bu teknik çevresel faktörlerin hücresel ritim üzerindeki etkilerini incelemek için uyarlanabilir.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu eser 2012 toplum, toksikoloji (SOT tarafından) desteklenen-Colgate Palmolive Grant değiştirici araştırma (M. Fang) ve uluslararası işbirliği araştırma fonu hayvan ve bitki karantina ajansı, Kore (M. Fang), ve NIEHS vermek P30ES005022 (H. Zarbl). Biz Dr Zheng Chen (McGovern Tıp Fakültesi Üniversitesi'nde Teksas Sağlık Bilimleri Merkezi Houston) teşekkür etmek için Bay Shao-An Juan yaptığı deneysel yardım için ve Bayan Kimi Nakata onun kanıt okumak için yararlı onun tartışma istiyorum.

1. PER2 organizatörü tahrik dengeleri bozdu Luciferase muhabir vektör inşaatı <ol><li>satın almak bir özelleştirilmiş pLS [hPER2P / rLuc / Puro] cDNA rLuc ve insan kodlaması içeren vektör PER2 organizatörü parçası (hPER2P, 941 bp) sitesinde Sac arasında ben ve Hind III birden çok klonlama bölge 17.</li>
	<li>İnsan PER2 organizatörü parçası kesme (hPER2P, 941 bp) out vektöründen.
	<ol><li>Ekleyin 2.5 µL restriksiyon enzimi tampon, 10 µL (180 ng) pLS [hPER2P / rLuc / Puro] vektör ve 1 µL her enzimleri, Sac ben (10 birim/µL) ve Hind III (10 birim/µL), bir DNA/RNA/nükleotit-Alerjik içine microcentrifuge tüp. Ultrasaf su (10.5 µL) en çok 25 µL ve karışımı yavaşça pipetting tarafından ekleyin.</li>
		<li>Isıtma blok içinde 90 dk 37 ° C'de Incubate.</li>
		<li>Çalıştıracağınız tüm birim (25 µL) restriksiyon enzimi tepkisi %0,0001 etidyum bromür (EtBr) hPER2P öğesinden ayırmak için içeren % 0.7 özel jel. 
		Not: EtBr, 3,8-diamino-1-ethyl-6-phenylphenantridinium bromür (CAS kayıt numarası: 1239-45-8), kokusuz bir kırmızı sıvıdır. Yaygın olarak kullanılan özel Jel Elektroforez (nükleik asit leke) bir floresan etiketi gibi ve UV ışığı altında turuncu renk olarak görünür intercalating bir ajandır. Düzenleyici kurumlar hiçbiri kanserojen 18 kategorize rağmen olası riskleri geri dönüşü olmayan mutajenik etkileri deneysel hayvanlarda meydana gelmiştir. Bu nedenle, biz kullanılan özel arabellek EtBr kimyasal tehlike atık olarak içeren jel ve Elektroforez toplanan ve Rutgers çevre sağlığı istenen &#38; almak ve güvenli bir şekilde imha Emanet (REHS).</li>
		<li>Bir EtBr floresan band 941 içeren özel jel bir parça kesip kan basıncı ve emme yoğunluğu (OD) ölçülerek bir Spektrofotometre miktar tarafından takip bir DNA jel ekstraksiyon kiti ile jel hPER2P parçalardan 260 nm dalga boyu arındırmak.</li>
	</ol></li> <li>Linearize 1.0 µL (1 µg) istikrarsızlığın ateş böceği luciferase ifade vektör, pGL [Luc2P / Neo] adımları 1.2.1-1.2.2 açıklandığı gibi aynı yöntemi ile. Bir Spektrofotometre kullanarak yukarıda açıklandığı gibi miktar tarafından takip bir DNA temizlik kiti ile vektör ayıklamak.</li>
	<li>HPER2P doğrusallaştırılmış vektör pGL ligate [Luc2P / Neo]. 
	Not: Üretici başına &#39; s talimat, Ekle ve vektör ideal molar oranı 2: 1'dir. 50 ng vektör için INSERT ideal miktarı 23,6 hesaplanır bir formül, [(50 ng vector x 1.0 kb insert)/4.242 kb vektör ile ng] x (2/1) 23,6 ng Ekle =]. HPER2P konsantrasyonları dayalı (7,26 ng/µL) ve pGL [Luc2P / Neo] (50 ng/µL), 50 ng pGL hacimleri [Luc2P / Neo] ve 23,6 ng hPER2P hesaplanırken 1 µL ve 3.26 µL anılan sıraya göre.
	<ol><li>Ekleyin 2 µL T4 DNA ligaz tepki tampon (10 X) (50 mM Tris-HCl, 10 mM MgCl 2, 1 mM ATP ve 10 mM DTT) 3.26 µL (23,6 ng) hPER2P, 1 µL (50 ng) pGL [Luc2P / Neo], ve 13.74 µL su 20 µL , karışımı yavaşça.</li>
		<li>1 µL T4 DNA ligaz (400 Ünite/µL) eklemek, karışımı yavaşça ve geceleme bir thermocycler 16 ° C'de kuluçkaya ve sonra üreticinin başına buz üzerinde ve birleştirilmiş vektör chill &#39; s eğitimi.</li>
	</ol></li> <li>Ve birleştirilmiş vektör pGL dönüştürmek [hPer2P / Luc2P / Neo] kimyasal olarak yetkili E. coli için 19.
	<ol><li>42 ° c, catabolite baskı (S.O.C.) orta ile süper en iyi suyu kadar sıcak su banyosu ayarla (%2 Tryptone, %0,5 Maya ekstresi, 10 mM NaCl, 2.5 mM KCl, 10 mM MgCl 2, 10 mM MgSO 4 ve 20 mM glikoz) oda sıcaklığında , Luria-Bertani (LB) agar plaka 37 ° C kuluçka (100 µg/mL Ampisilin, 80 µg/mL X-gal ve 0.5 µM IPTG içeren) ısınmak ve çözülme buz bir şişe yetkili E. coli hücreleri her dönüşüm için.</li>
		<li>Ekleyin 6 µL (21 ng) tane vektör veya 1 µL (30 ng) boş bir tüp kimyasal olarak yetkili E. coli (50 µL) için vektör (negatif kontrol) ve sonra yavaşça karıştırın tüpünü çevir. 30 dakika süreyle buz üzerinde kuluçkaya</li>
		<li>Isı 30 42 ° C su banyosu şokta s sallayarak olmadan ve sonra buz dönmek</li>
	</ol></li> <li>Mavi/beyaz tarama kullanarak ve birleştirilmiş bir vektör ile dönüştürülmüş bir E. coli kolonisi seçin.
	<ol><li>Ekleyin 250 µL S.O.C. ortamda dönüştürülmüş E. coli tüp ve 1 h 37 ° c ile 200 devir / dakikada sallayarak için kuluçkaya.</li>
		<li>10-50 µL dönüştürülmüş E. coli LB agar plaka yüzeyine eşit olarak yayılmış. Plaka baş aşağı gecede 37 ° C kuluçka makinesine koy. 
		Not: Yüz sömürgeler verimli bir klonlama reaksiyon üretmek gerekir. İki farklı birimi kaplama en az bir tabak büyük, açık beyaz veya mavi renk ve iyi aralıklı kolonileri sahip olmasını sağlamak için önerilir. Kolonilere çok küçük ve renk ayırt değil, bir mikroskop (10 X veya 50 X) kullanarak yararlıdır.</li>
		<li>3-6 beyaz kolonileri sterilize diş sopa ile plakalar üzerinden almak ve her koloni LB kültür orta 50 µg/mL Ampisilin ile 4 mL içeren bir kültür tüp içine bırakın.</li>
		<li>Gecede 200 devir / dakikada sallayarak ile tüpler 37 ° C'de kuluçkaya. 4 mL 2 mL kullanarak DNA ayıklamak bir plazmid DNA ekstraksiyon mini hazırlık kiti ile üretici başına E. coli kültürlü &#39; s eğitimi.</li>
	</ol></li> <li>Doğrula ve INSERT analiz (hPER2P, 941 bp) <ol><li>enzimleri ile plazmid DNA sindirmek ve Elektroforez bir ekleme olup olmadığını doğrulamak için adımları 1.2.1-1.2.3 içinde açıklandığı gibi çalıştırmanız. 
		Not: Pozitif kontrol (hPER2P vasıl adım 1.2.4 saf) ve negatif kontrol (E. coli ile boş bir vektör dönüşüm) dahil edildi.</li>
		<li>Sıra Yönlendirme ve INSERT plazmid 19 sırasını onaylamanız M13 ileriye ve geriye doğru M13 astar kullanarak seçili plazmid DNA. 
		Not: vardı bir ekleme hPER2P Elektroforez ve doğru Yönlendirme ve sıralama sonucu sırayla doğru boyutu ile tek bir koloni seçildi.</li>
		<li>İnsan PER2 organizatörü parçası analiz (hPER2P, 941 bp) sıra sirkadiyen öğeleri için yasal E-box motifi (Bmal1 binding site, kedi/CGTG) dahil olmak üzere, CCAATC, GC kutusu ve site (CAGCGG) 20 başlatmak transkripsiyon.</li>
	</ol></li> <li>Ekleyerek seçilen E. coli artık 2 mL 200 mL LB kültür 50 µg/mL Ampisilin içeren ve daha sonra bu gecede 37 ° C'de 200 devir / dakikada sallayarak ile kuluçka orta içine E. coli kültürlü genişletme.</li>
	<li>DNA ayıklamak bir plazmid endotoksin-Alerjik maxi ile kit başına hazırlayın Üretici &#39; s öğretim ve sonra OD 260 nm dalga boyu ile Spektrofotometre ölçerek ölçmek. Aliquot ve mağaza pGL [hPer2P/Luc2P/Neo],-80 ° C dondurucu ileride kullanmak üzere, plazmid DNA.</li>
</ol> 2. Geçici Transfection <ol><li>satın alma ve MCF10A hücre kültür <ol><li>satın alma bir ölümsüzleştirdi, Sigara dönüşüm normal insan meme epitel hücre satırından (MCF10A) ticari bir hücre Bankası, hücreleri nerede cytogenetically test edilmiş ve kimliği doğrulanmış ile kısa tandem tekrar donma önce analiz. Çözülme ve en fazla 8 hafta kültür donmuş hücrelerde her şişe korumak. 
		Not: ~ %70 izdiham için geldiklerinde temas inhibisyonu bu hücreler diğer hücrelere farklı olarak, sahip. Bu alt kültür ~ %70 yürütülen gerektirir.</li>
		<li>Meme epitelyal Bazal orta (MEBM), büyüme takviyeleri ve 37 ° C, % 95 nem oranı ve % 5 CO 2 hücre kültür kuluçka kolera toksin içeren hücreleri ile meme epitel hücre büyüme orta (MEGM), kültür. 
		Not: kullanıma hazır büyüme faktörleri SingleQuot (SQ) sağlanan satın alma ve kolera toksin ayrı olarak elde edilir. Son büyüme takviyeleri konsantrasyonları vardır % 0,4 sığır hipofiz özü, % 0,1 insülin, % 0,1 hidrokortizon, % 0,1 insan epidermal büyüme faktörü, 100 ng/mL kolera toksini ve % 0.05 viomisin sülfat ve % 0.05 Amfoterisin B.</li>
		<li>10 mL tripsin/EDTA ile kuluçka tarafından 10 cm kültür çanak hücrelerde ayırmak ~ 20 dk ve tripsin çözüm nötralize 10 mL tripsin ekleyerek etkisiz hale getirin. Toplamak HEPES içeren tüm hücreleri tuzlu çözüm (HBSS) arabelleğe.</li>
		<li>Ters bir mikroskop altında hemasitometre içeren hücreleri saymak ve tek hücre süspansiyon konsantrasyon hesaplamak ve hücreleri belirli sayıda sonra gerektiği gibi temel olarak belirler. İyice her plaka hücrelerde eşit dağılımı elde plakalara girdap. Hücreleri hücre kültür kuluçka 37 ° C, % 95 nem oranı ve % 5 CO 2 kuluçkaya. 
		Not: tripsin/EDTA, tripsin nötralize çözüm ve kullanmak için HBSS içeren bir alt kültür reaktif paketi satın.</li>
	</ol></li> <li>Hücre inşa sirkadiyen vektör ile geçici transfection.
	<ol><li>Tohum 2 x 10 5 MCF10A hücrelerde eşit 35 mm kültür çanağı ile MEGM ve % 20-30 izdiham (ertesi gün) büyümek.</li>
		<li>Sıcak azalır kadar serum medyada (örneğin, Opti-MEM) 37 ° C su banyosu ve transfection reaktif, oda sıcaklığında 30 dakika süreyle seyreltik plazmid DNA inşa (pGL [hPer2P / Luc2P / Neo]) 30 ng/µL endo-toksin ücretsiz için Tris-EDTA (TE) arabellek ve oda sıcaklığında tutmak.</li>
		<li>1.5 mL microcentrifuge tüp plazmid transfection karışımı 63.6 µL sıcak düşük serum medya eklemek, sonra 33.4 µL (0.1 µg) plazmid DNA ekleme hazırlamak ve karışımı yavaşça pipetting ve son olarak transfection 3 µL ekleme Reaktif doğrudan duvara dokunmadan tüp Merkezi. Pipetting tarafından hafifçe karıştırdıktan sonra oda sıcaklığında 30 dakika süreyle devam</li>
		<li>Plaka ortamda Merkezi yüzeyine doğrudan tüm plazmid karışımı (100 µL) bırakın ve sonra karışımı yavaşça çanak sallayarak. CO 2 kuluçka için ek 48-72 h. hücreler kültür 
		Not: Bu en yüksek transfection verimliliği % 40-70 izdiham nedeniyle onların temas inhibisyonu bu hücrelerin adlı olacağını tahmin edilmektedir ~ % 70. Bu nedenle, en iyi başlayan transfection çalışır ~ % 20 ve durağında ~ % 70 izdiham.</li>
	</ol></li></ol> 3. Kurulması In Vitro Bioluminescence tahlil hücrelerdeki geçici Transfected MCF10A <ol><li>MEBM olmadan büyüme faktörleri için 24 h ~ %70 izdiham (sonra transfection 48-72 saat), kültürlü hücreleri açlıktan</li>
	<li>Eşitleme Aracısı (örneğin, % 50 at serum (HS)) MEBM içinde CO 2 kuluçka 1,5 saat için hücrelerle tedavi. 
	Not: bir ideal eşitleme Aracısı, 10 µM forskolin, 1 nM melatonin, 0,1 µM deksametazon, %50 HS ve % 100 seçim için SQ karşılaştırıldığında sirkadiyen genlik ve süre açısından sirkadiyen vektör transfected hücrelerde. Boş vektör transfected hücreleri ile % 100 kabul edilir bir negatif kontrol olarak SQ.</li>
	<li>5 mL MEGM de, MEBM, 150 µL sodyum bikarbonat, 200 µL HEPES ve 40 µL biyoluminesans 15 mL ekleyerek pre-prepare 20 mL kayıt orta (10, 30 mm kültür yemeklerin için) stok 50 mL steril santrifüj tüpü (50 mM) çözümde. 
	Not: Her bileşenleri son konsantrasyonları: %20 SQ ve 20 ng/mL kolera toksini, % 0,06 sodyum bikarbonat, % 1 penisilin/streptomisin ve 10 mM HEPES. Orta kayıt ve 1 x PBS için 30 dk 37 ° C su banyosu içinde sterilize önceden hazırlanmış ısınmak. 100 µM biyoluminesans kullanımdan hemen önce ekle.</li>
	<li>Sıcak 1 hücrelerle yıkama Dulbecco x &#39; s Phosphate-Buffered serum fizyolojik (D-PBS) için 3 kez eşitleme Aracısı ile kuluçka sonra ve 2 mL orta kayıt ekleyin.</li>
	<li>Silikon gres buharlaşma önlemek ve o zaman üstünde belgili tanımlık yan etiket kullanarak bir steril kapak sınıfı ile çanak mühür.</li>
	<li>Luminometer içinde koltukta mühürlü çanak yerleştirin ve klasörde dosya konumunu kaydetmek için seçeneğini etkinleştirin (ayrıntı için bkz: Bölüm 6).</li>
</ol> 4. Stabil Transfected hücre seçimini <ol><li>üreticiye göre öldürmek eğrisi tahlil ile ideal bir G418 konsantrasyonu (800 µg/mL) en iyi duruma &#39; stabil transfected hücrelerin seçimini s talimatı.</li>
	<li>48 h veya 72 h için geçici transfection sonra alt kültür ve tohum MEGM 5.000 adlı daha büyük yemekler hücrelerle hücreler/yemek (100-mm). 24 saat sonra kültür hücre kültür kuluçka (37 ° C, % 95 nem ve % 5 CO 2) tedavi 800 µg/mL G418 hücrelerle yeni orta 2 hafta boyunca her 3-4 günde 800 µg/mL G418 içeren eski orta değiştirerek.</li>
	<li>Stabil kalan alt kültür 500µg/mL G418 hPer2P/Luc2P istikrarlı ifade elde etmek ve ileride kullanmak için sıvı azot dondurmak için içeren MEGM ile 1-3 pasajlar için koloniler transfected.</li>
	<li>Tedavisinde 500µg/mL G418 hücreleri, stabil transfected nüfusu yeniden seçmek için genel alt kültür sonra birçok pasajlar kullanımdan sonra vitro bioluminescence tahlil sonucu bioluminescence şiddeti giderek daha düşük hale gelirse.</li>
</ol> 5. Kimyasallar ile tedavi <ol><li>48 s, ya da 72 h sonrası transfection, büyüme faktörleri MEBM için 24 h içinde hücrelerden açlıktan</li>
	<li>% 50 ile eşitlemeden sonra HS için 2 h, 0,25 mM veya 0,5 mM nitrosomethylurea (NMU), 20 nM EX527 veya 1 µM cambinol MEBM %20 içeren 1 h için hücrelerle tedavi SQ.</li>
	<li>1 ile yıkama sonra x D-PBS, tek başına veya birlikte 20 nM EX527 veya hücrelere 1 µM cambinol ile orta içeren 12.5 µM MSC kayıt ekleyin. Luminometer ile bioluminescence izleme.</li>
	<li>Tedavi stabil transfected MCF10A / PER2-NMU dLuc hücrelerle 0.5, 1 veya 2 mM, 40 nM, EX527 veya Cambinol için 1 h % 50 ile eşitleme sonra 2.0 µM, HS ve MSC orta içeren 12.5 µM kayıt hücreler kuluçkaya ya da farklı doz (5, 10 veya 20 µM) n-acetylcysteine (NAC). Tabakları luminometer, kayıt yerleştirmek ve 3.6 bölümünde anlatıldığı gibi luminometer tarafından bioluminescence 4-8 gün boyunca kaydedin. 
	Not: NMU metillenmiş nitrosourea mutajenik, kanserojen ve teratojenik özellikleri ile bileşik olduğunu. NMU doğrudan etkili bölücü ve kısa bir yarı ömrü vardır (T 1/2 = ~ 30 dk). Asidik koşulu (pH 4-5), ama kararsız alkalin koşulu (pH 9-10) ve sıcaklık 20 ° c ötesinde, stabil Bu nedenle, çamaşır suyu %10 verimli bir deactivating ajan olarak temizlik tezgah yüzeyler ve potansiyel olarak NMU Solutia tarafından kontamine laboratuar gereçleri için kullanılabilirüzerinde. Artık hisse senedi çözüm aldı-up ve güvenli bir şekilde bertaraf tarafından REHS. Kimyasal maddelerin eylem modu dayanarak, eşitlenmiş hücreleri daha önce kayıt ortamda kültür kısa süreleri için tedavi edilebilir. Hücreleri de tedavi edilebilir kayıt orta uzun bir süre (birkaç gün).</li>
</ol> 6. Veri toplama, analiz ve sunum Not: hücre canlılığı ihtiyacı standart yöntemleri (Örneğin, ÇMT tahlil) kullanarak belirlenecek hücre Aynı konsantrasyonlarda tedavisinde belirtilen aynı kez sonra. Vitro bioluminescence assay olarak kullanılan tüm tedavi konsantrasyonu % 30 öldürücü konsantrasyon (LC30) düşük bulunmuştur. Tüm deneyler nüsha yapılmıştır ve temsilcisi sonuçları sunuldu.
<ol><li>Çanak (Adım 3.5) mühürledikten sonra bulaşıkları ayarla H 2 O ve CO 2 olmadan 37 ° C'de ve bir bilgisayara bağlı bir kuluçka içinde tutulur luminometer koltuklarda üzerine yük.</li>
	<li>Tıklama &#34; kurtarmak &#34; ve nerede karşılık gelen çanak kaydedilen ışıldama sinyalini kaydedilecek dosya ve klasör adlarını girin. 
	Not: Sistem ışıldama sinyali algılar bireysel pozisyonlarda tabak hücrelerden gerçek zamanlı. Sinyalleri üzerinden photomultiplier tüp 4 foton sayma, bilgisayara transfer ve kaydedilir ve bilgisayar veri toplama yazılımı tarafından görüntülenen.</li>
	<li>Kayıt için orta değiştirmek ve sürekli bir ikinci hafta için gerekirse kayıt tarafından takip edilebilir 4-7 gün sonra sinyalleri analiz. 
	Not: dahil olmak üzere faz, dönem uzunluğu, ritim genlik ve oranı, sönümleme sirkadiyen parametreleri elde etmek için biz luminometer analiz yazılımı bioluminescence verileri çözümlemek için kullanılan.</li>
	<li>Çalışan bir ortalama ile ham veri detrend ve en uygun dönem, evre, genlik ve oranı 21 , 22 damping almak için bir sinüs dalga için analiz.</li>
	<li>Tedavi ve orta değiştirmek üzerine yüksek geçici bioluminescence nedeniyle, ilk döngüsü veri çözümleme dışı bırakmak.</li>
	<li>Zaman (saat veya gün) karşı ham verileri (bioluminescence, sayısı/s) veri sunumu için çizmek. Gerekli olduğunda, veri temel düşülen genlik ve faz karşılaştırmak için çizilebilir.</li>
</ol>

<ol><li>Akerstedt, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Night+work+and+breast+cancer+in+women%3A+a+Swedish+cohort+study%5BTitle%5D)+AND+%22BMJ+Open%22%5BJournal%5D)">Night work and breast cancer in women: a Swedish cohort study.</a> BMJ Open. 5 (4), e008127(2015).</li>
<li>Parent, M. E., El-Zein, M., Rousseau, M. C., Pintos, J., Siemiatycki, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Night+work+and+the+risk+of+cancer+among+men%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Epidemiol%22%5BJournal%5D)">Night work and the risk of cancer among men.</a> Am J Epidemiol. 176 (9), 751-759 (2012).</li>
<li>Knutsson, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Breast+cancer+among+shift+workers%3A+results+of+the+WOLF+longitudinal+cohort+study%5BTitle%5D)+AND+%22Scand+J+Work+Environ+Health%22%5BJournal%5D)">Breast cancer among shift workers: results of the WOLF longitudinal cohort study.</a> Scand J Work Environ Health. 39 (2), 170-177 (2013).</li>
<li>Fu, L., Lee, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+circadian+clock%3A+pacemaker+and+tumour+suppressor%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Cancer%22%5BJournal%5D)">The circadian clock: pacemaker and tumour suppressor.</a> Nat Rev Cancer. 3 (5), 350-361 (2003).</li>
<li>Fu, L., Kettner, N. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+circadian+clock+in+cancer+development+and+therapy%5BTitle%5D)+AND+%22Prog+Mol+Biol+Transl+Sci%22%5BJournal%5D)">The circadian clock in cancer development and therapy.</a> Prog Mol Biol Transl Sci. 119, 221-282 (2013).</li>
<li>IARC. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Painting%2C+Firefighting%2C+and+Shiftwork%5BTitle%5D)+AND+%22IARC+Monographs+on+the+Evaluation+of+Carcinogenic+Risks+to+Humans%22%5BJournal%5D)">Painting, Firefighting, and Shiftwork.</a> IARC Monographs on the Evaluation of Carcinogenic Risks to Humans. 98, 563-764 (2010).</li>
<li>Zhang, X., Zarbl, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemopreventive+doses+of+methylselenocysteine+alter+circadian+rhythm+in+rat+mammary+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Prev+Res+%28Phila+Pa%29%22%5BJournal%5D)">Chemopreventive doses of methylselenocysteine alter circadian rhythm in rat mammary tissue.</a> Cancer Prev Res (Phila Pa). 1 (2), 119-127 (2008).</li>
<li>Fang, M. Z., Zhang, X., Zarbl, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Methylselenocysteine+resets+the+rhythmic+expression+of+circadian+and+growth-regulatory+genes+disrupted+by+nitrosomethylurea+in+vivo%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Prev+Res+%28Phila%29%22%5BJournal%5D)">Methylselenocysteine resets the rhythmic expression of circadian and growth-regulatory genes disrupted by nitrosomethylurea in vivo.</a> Cancer Prev Res (Phila). 3 (5), 640-652 (2010).</li>
<li>Burbulla, L. F., Kruger, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Converging+environmental+and+genetic+pathways+in+the+pathogenesis+of+Parkinson%27s+disease%5BTitle%5D)+AND+%22J+Neurol+Sci%22%5BJournal%5D)">Converging environmental and genetic pathways in the pathogenesis of Parkinson's disease.</a> J Neurol Sci. 306 (1-2), 1-8 (2011).</li>
<li>Aitlhadj, L., Avila, D. S., Benedetto, A., Aschner, M., Sturzenbaum, S. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Environmental+exposure%2C+obesity%2C+and+Parkinson%27s+disease%3A+lessons+from+fat+and+old+worms%5BTitle%5D)+AND+%22Environ+Health+Perspect%22%5BJournal%5D)">Environmental exposure, obesity, and Parkinson's disease: lessons from fat and old worms.</a> Environ Health Perspect. 119 (1), 20-28 (2011).</li>
<li>Nagoshi, E., Brown, S. A., Dibner, C., Kornmann, B., Schibler, U. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Circadian+gene+expression+in+cultured+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Enzymol%22%5BJournal%5D)">Circadian gene expression in cultured cells.</a> Methods Enzymol. 393, 543-557 (2005).</li>
<li>Ramanathan, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+type-specific+functions+of+period+genes+revealed+by+novel+adipocyte+and+hepatocyte+circadian+clock+models%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genet%22%5BJournal%5D)">Cell type-specific functions of period genes revealed by novel adipocyte and hepatocyte circadian clock models.</a> PLoS Genet. 10 (4), e1004244(2014).</li>
<li>Sporl, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+circadian+clock+in+HaCaT+keratinocytes%5BTitle%5D)+AND+%22J+Invest+Dermatol%22%5BJournal%5D)">A circadian clock in HaCaT keratinocytes.</a> J Invest Dermatol. 131 (2), 338-348 (2011).</li>
<li>Zhang, E. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+genome-wide+RNAi+screen+for+modifiers+of+the+circadian+clock+in+human+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">A genome-wide RNAi screen for modifiers of the circadian clock in human cells.</a> Cell. 139 (1), 199-210 (2009).</li>
<li>Yoo, S. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PERIOD2%3A%3ALUCIFERASE+real-time+reporting+of+circadian+dynamics+reveals+persistent+circadian+oscillations+in+mouse+peripheral+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">PERIOD2::LUCIFERASE real-time reporting of circadian dynamics reveals persistent circadian oscillations in mouse peripheral tissues.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (15), 5339-5346 (2004).</li>
<li>Leclerc, G. M., Boockfor, F. R., Faught, W. J., Frawley, L. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+a+destabilized+firefly+luciferase+enzyme+for+measurement+of+gene+expression%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechniques%22%5BJournal%5D)">Development of a destabilized firefly luciferase enzyme for measurement of gene expression.</a> Biotechniques. 29 (3), (2000).</li>
<li>Genomics, S. <a target="_blank" href="http://switchgeargenomics.com/wp-content/uploads/2009/02/switchdb_technote1.pdf">Technical Note: SwitchGear methods for gene model construction and transcription start site prediction</a>. , (2009).</li>
<li>Scientific, F. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aScientific%2C+F+%22Safety+Data+Sheet%3A+Ethidium+bromide%2C+1%25+Solution%2FMolecular+Biology%22">Safety Data Sheet: Ethidium bromide, 1% Solution/Molecular Biology</a>. , (2010).</li>
<li>Ausubel, F. M., Brent, R., Kingston, R. E., Moore, D. D., Seidman, J. G., Smith, J. A., Struhl, K. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aAusubel%2C+FM+%22Current+Protocols+in+Molecular+Biology%22">Current Protocols in Molecular Biology</a>. , Greene Publishing Associates and Wiley-Interscience. New York. (1994).</li>
<li>Yoo, S. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+noncanonical+E-box+enhancer+drives+mouse+Period2+circadian+oscillations+in+vivo%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">A noncanonical E-box enhancer drives mouse Period2 circadian oscillations in vivo.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 102 (7), 2608-2613 (2005).</li>
<li>Chen, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+diverse+modulators+of+central+and+peripheral+circadian+clocks+by+high-throughput+chemical+screening%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Identification of diverse modulators of central and peripheral circadian clocks by high-throughput chemical screening.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 109 (1), 101-106 (2012).</li>
<li>Fang, M., Guo, W. R., Park, Y., Kang, H. G., Zarbl, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Enhancement+of+NAD%2B-dependent+SIRT1+deacetylase+activity+by+methylselenocysteine+resets+the+circadian+clock+in+carcinogen-treated+mammary+epithelial+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Oncotarget%22%5BJournal%5D)">Enhancement of NAD+-dependent SIRT1 deacetylase activity by methylselenocysteine resets the circadian clock in carcinogen-treated mammary epithelial cells.</a> Oncotarget. , (2015).</li>
<li>Chen-Goodspeed, M., Lee, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tumor+suppression+and+circadian+function%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Rhythms%22%5BJournal%5D)">Tumor suppression and circadian function.</a> J Biol Rhythms. 22 (4), 291-298 (2007).</li>
<li>Balsalobre, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clock+genes+in+mammalian+peripheral+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Tissue+Res%22%5BJournal%5D)">Clock genes in mammalian peripheral tissues.</a> Cell Tissue Res. 309 (1), 193-199 (2002).</li>
<li>Jung-Hynes, B., Huang, W., Reiter, R. J., Ahmad, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Melatonin+resynchronizes+dysregulated+circadian+rhythm+circuitry+in+human+prostate+cancer+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J+Pineal+Res%22%5BJournal%5D)">Melatonin resynchronizes dysregulated circadian rhythm circuitry in human prostate cancer cells.</a> J Pineal Res. 49 (1), 60-68 (2010).</li>
<li>von Gall, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Melatonin+plays+a+crucial+role+in+the+regulation+of+rhythmic+clock+gene+expression+in+the+mouse+pars+tuberalis%5BTitle%5D)+AND+%22Ann+N+Y+Acad+Sci%22%5BJournal%5D)">Melatonin plays a crucial role in the regulation of rhythmic clock gene expression in the mouse pars tuberalis.</a> Ann N Y Acad Sci. 1040, 508-511 (2005).</li>
<li>Vujovic, N., Davidson, A. J., Menaker, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sympathetic+input+modulates%2C+but+does+not+determine%2C+phase+of+peripheral+circadian+oscillators%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Physiol+Regul+Integr+Comp+Physiol%22%5BJournal%5D)">Sympathetic input modulates, but does not determine, phase of peripheral circadian oscillators.</a> Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol. 295 (1), R355-R360 (2008).</li>
<li>Schofl, C., Becker, C., Prank, K., von zur Muhlen, A., Brabant, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Twenty-four-hour+rhythms+of+plasma+catecholamines+and+their+relation+to+cardiovascular+parameters+in+healthy+young+men%5BTitle%5D)+AND+%22Eur+J+Endocrinol%22%5BJournal%5D)">Twenty-four-hour rhythms of plasma catecholamines and their relation to cardiovascular parameters in healthy young men.</a> Eur J Endocrinol. 137 (6), 675-683 (1997).</li>
<li>Yu, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Circadian+rhythm+of+circulating+fibroblast+growth+factor+21+is+related+to+diurnal+changes+in+fatty+acids+in+humans%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Chem%22%5BJournal%5D)">Circadian rhythm of circulating fibroblast growth factor 21 is related to diurnal changes in fatty acids in humans.</a> Clin Chem. 57 (5), 691-700 (2011).</li>
<li>Nakagawa, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modulation+of+circadian+rhythm+of+DNA+synthesis+in+tumor+cells+by+inhibiting+platelet-derived+growth+factor+signaling%5BTitle%5D)+AND+%22J+Pharmacol+Sci%22%5BJournal%5D)">Modulation of circadian rhythm of DNA synthesis in tumor cells by inhibiting platelet-derived growth factor signaling.</a> J Pharmacol Sci. 107 (4), 401-407 (2008).</li>
<li>Yang, X., Guo, M., Wan, Y. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Deregulation+of+growth+factor%2C+circadian+clock%2C+and+cell+cycle+signaling+in+regenerating+hepatocyte+RXRalpha-deficient+mouse+livers%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Pathol%22%5BJournal%5D)">Deregulation of growth factor, circadian clock, and cell cycle signaling in regenerating hepatocyte RXRalpha-deficient mouse livers.</a> Am J Pathol. 176 (2), 733-743 (2010).</li>
<li>Virag, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Structure+and+function+of+poly%28ADP-ribose%29+polymerase-1%3A+role+in+oxidative+stress-related+pathologies%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Vasc+Pharmacol%22%5BJournal%5D)">Structure and function of poly(ADP-ribose) polymerase-1: role in oxidative stress-related pathologies.</a> Curr Vasc Pharmacol. 3 (3), 209-214 (2005).</li>
<li>Kon, N., Sugiyama, Y., Yoshitane, H., Kameshita, I., Fukada, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell-based+inhibitor+screening+identifies+multiple+protein+kinases+important+for+circadian+clock+oscillations%5BTitle%5D)+AND+%22Commun+Integr+Biol%22%5BJournal%5D)">Cell-based inhibitor screening identifies multiple protein kinases important for circadian clock oscillations.</a> Commun Integr Biol. 8 (4), e982405(2015).</li>
<li>Ramanathan, C., Khan, S. K., Kathale, N. D., Xu, H., Liu, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Monitoring+Cell-autonomous+Circadian+Clock+Rhythms+of+Gene+Expression+Using+Luciferase+Bioluminescence+Reporters%5BTitle%5D)+AND+%22J+Vis+Exp%22%5BJournal%5D)">Monitoring Cell-autonomous Circadian Clock Rhythms of Gene Expression Using Luciferase Bioluminescence Reporters.</a> J Vis Exp. (67), e4234(2012).</li>
<li>Welsh, D. K., Yoo, S. H., Liu, A. C., Takahashi, J. S., Kay, S. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bioluminescence+imaging+of+individual+fibroblasts+reveals+persistent%2C+independently+phased+circadian+rhythms+of+clock+gene+expression%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Bioluminescence imaging of individual fibroblasts reveals persistent, independently phased circadian rhythms of clock gene expression.</a> Curr Biol. 14 (24), 2289-2295 (2004).</li>
</ol>

Yazarlar ifşa gerek yok.

Memeli hücrelerinde sirkadiyen saat periyodik olarak birbirine bağlı transkripsiyon/translasyonel geribesleme döngüsü tarafından düzenlenir. Bmal1 heterodimers ve saat veya Npas2 düzenleyen ve çekirdek CGs, Per2 ve Cryve çok sayıda CCGs4de dahil olmak üzere E-box öğelerine bağlama tarafından sirkadiyen transkripsiyon. Onlar heterodimers, hücrede biriktikçe başına: Cry post-translationally değiştirilme tarihi ve saati: Bmal1 transkripsiyon faaliyet bastırmak için çekirdeği nakli. ...

Sirkadiyen saat geniş bir düzenleyen davranış tahmin edilebilir bir ritim içinde yaklaşık 24 h Epidemiological bir periodicity ile uyku genlerin diurnal ifadeden biyolojik süreçlerin çalışmalar güçlü sirkadiyen kronik bu bozulma önermek ritim meme ve shift işçiler, hemşireler ve uçuş ekipleri1,2,3gibi prostat kanseri riskini artırır. Bu bulgular kemirgen çalışmaları, jet-lag artış tümörü insidansı taklit ve tümör büyüme4,5hızlandırır sabit ışık, ışık gece veya hafif döngüleri için bu maruz kalma gösteren tarafından doğrulanmıştır. İnsan ve kemirgen çalışmaları gelen verileri esas, Uluslararası Ajansı kanser araştırma için vardiyalı çalışma muhtemel insan kanseri (tip 2A) 20106olarak sınıflandırılmış.
Daha önce biz bu gösterdi meme tümör belirli kanserojen, N- nitrozo kanserojen bir tek doz-N- methylurea (NMU), bozulmuş sirkadiyen ifade büyük sirkadiyen genlerin (CGs) (örneğin, dönem 2 , Per2) ve dahil olmak üzere birkaç sirkadiyen kontrollü genler (CCGs), anahtar DNA hasarı duyarlı ve onarım (DDRR) genleri hedef meme bezi (Ama karaciğer içinde). Ayrıca, diyet Lchemopreventive bir rejimi tarafından normal doğru Per2 ve DDRR genlerin sirkadiyen ifade sıfırlama-metil-selenocysteine (MSC) %63 tümörü insidansı azaldı. Bu bulgular sirkadiyen ritim, kimyasal karsinojenezis ve chemoprevention7,8arasında mekanik bir bağlantı göstermek için ilk idi. Etkilenmeler sirkadiyen gen ifade içinde vivo bozmaya gösterilen diğer çevresel toxicants için Ayrıca çevresel hastalıklar9,10riski ile ilişkilidir. Çevre toxicants ve Patogenez sirkadiyen bozulma bağlantı mekanizmaları anlama mechanistically tabanlı yaklaşımlar hastalık önleme neden olabilir. Ancak, çalışmalar yönelik pozlama arasındaki etkileşimler tanımlama ve sirkadiyen ritim genellikle yapılan içinde vivo. Sirkadiyen ritim etkisi en az üç dokulardan kontrol ve üç maruz kalan hayvan olması gerekir gibi hayvanlar, çok sayıda gerektirir araştıran bir tipik vivo içinde deneme her 3-4 h 24 veya 48 s süre içinde toplanır. Vivo gözlemler ve mekanizmaları beyannamedir doğrulanmış vitro sisteminin geliştirilmesi bu nedenle sadece hayvanların gerekli sayıda azaltmak ama aynı zamanda önemli ölçüde deneysel maliyeti ve gereksinimi azaltmak bu araştırmacılar sürekli olarak 24-48 h bir süre içinde iş. Ayrıca, bir doğrulanmış vitro sistem yüksek üretilen iş bileşikler ve/veya sirkadiyen ritim veya çevresel stres veya toxicants onun yanıtı etkileyen genetik değişiklik ile taranması için kullanılabilir. Bu nedenle, vitro ve in vivo modeller ve deneyler stratejik kombinasyonu ile farklı odak farklı anlayışlar elde etmek için gereklidir.
Memelilerde, sirkadiyen osilatörler SCN özel nöronlar sadece, aynı zamanda en periferik hücre tipleri içinde mevcut. Bu moleküler saatleri embriyo veya yetişkin hayvanlar kurulan fibroblast hücre satırları ve birincil fibroblastlar benzer; Ancak, doku türüne özgü hücresel modelleri11için bir ihtiyaç vardır. Sonuç olarak, geleneksel Lokomotor aktivite içinde vivo, SCN (sahne) çalışmaların ex vivoexplants ve hücre tabanlı vitro deneyleri ölümsüzleştirdi fibroblast hücrelerinde yaygın olarak hücre özerk sirkadiyen hataları incelemek için kullanılır. Ancak, bir vitro fibroblast hücre tabanlı tahlil sirkadiyen mekanizmaları özetlemek gösteren hiçbir kanıt yoktur ve yanıt-e doğru diğer çevre organlara vivo içindehücrelerinde mevcut. Farklı hücre tipleri farklı desenler gen ekspresyonu, xenobiotic metabolizma ve DDRR sahip olabilir ve toksisite ve sirkadiyen gen ekspresyonu arasında bağlantılar hücre tipi olabilir belirli ve/veya farklı fizyolojik parametreler tarafından modüle edilmiş. Buna ek olarak, fibroblast tabanlı sistemlerde sirkadiyen osilatörler tam yanıt çevre toxicants, stres ve Etkilenmeler hastalığı geliştirme ve Önleme mekanizmaları için bağlantı koruyucu ajanlar için değerlendirdikten değil. Böylece, facile, doğrulanmış hücre türü özel, vitro bioluminescence deneyleri organ belirli çevre sirkadiyen bozucular çalışmaya ihtiyaç vardır. Hücresel saat modelleri (örneğin, karaciğer, keratinositler ve yağ hücrelerinin yanı sıra bir osteosarkom hücre kültürünü) çeşitli olmasına rağmen son yıllarda12,13,14' te, geliştirilmiştir 15, burada açıklanan tahlil ilk hücresel saat meme epitel hücreleri ve in vivo yanıt çevresel stres, toxicants, uyuşturucu ve chemopreventive ajanlar için özetlemek için ilk gösteri modelidir.
Renilla luciferase (rLuc) ve ateş böceği luciferase enzimatik aktivite için işleme ardından gerektirmeyen ve hemen sonra çeviri genetik bir muhabir olarak işlev görebilir 30-61 kDa monomeric proteinlerdir. Bir kez belgili tanımlık substrate luciferase enzim ile ilişkilendirir, katalize biyokimyasal reaksiyon bir ışık üretir. Böylece, luciferase yapıları bir gen ifade muhabir sistem vitro ve içinde vivoolarak yaygın olarak kullanılmaktadır. Ancak, sirkadiyen ritim çalışmaları, luciferase muhabir yarar luciferase protein nispeten uzun yarı ömrü tarafından sınırlı (T1/2 = 3.68 h) (özellikle için kısa süre) dönem sirkadiyen gen değişiklikleri için göreli ifade; Ancak, yıl içinde çok sayıda çalışmalar başarıyla luciferase gen hızla parçalanabilir luciferase ritimleri ile daha uzun bir süre için özellikle sirkadiyen ritim gibi raporlama için gerekli olmayabilir gösteren pGL3 vektör kullanmışlardır 24 saat. Bu nedenle, bozulma luciferase vektör kullanarak bir muhabir plazmid pGL [Luc2P/Neo], hPEST (protein istikrarsızlık dizisi) içeren, mevcut için tüp bebek sirkadiyen muhabir vektör olarak kullanmak bize izin verdiği için geliştirilmiştir bioluminescence tahlil. Luc2P tarafından kodlanmış protein bir çok daha kısa yarı ömrü vardır (T1/2 = 0,84 h) ve bu nedenle, daha hızlı ve daha büyük bir büyüklük değişikliklere daha vahşi-türü, transkripsiyon faaliyette yanıt verdiği beno-ebilmek var olmak göstergeli doğru bir şekilde gerçek zamanlı16içinde PER2 düzenleyici tarafından düzenlenen luciferase ritmik ifade izlemek için kullanılır.

<table><tbody><tr><td>pLS[hPER2P/rLuc/Puro] vektör</td><td>SwitchGear Genomics</td><td>S700000</td><td>özelleştirilmiş vektör</td></tr><tr><td>pGL4.18[Luc2P/Neo] vektör</td><td>Promega</td><td>9PIE673</td><td>kararsız lusiferaz ekspresyon vektörü</td></tr><tr><td>T4 DNA ligaz</td><td>Invitrogen</td><td>15224041</td><td>Alt klonlama için</td></tr><tr><td>TOPO TA klonlama kiti</td><td>Invitrogen</td><td>K4500-02</td>, <td>One Shot TOP10 Kimyasal Olarak Yetkin E. coli</td></tr><tr><td>Sac I</td><td>New England BioLabs</td><td>R0156S</td><td>Kısıtlama enzimi</td></tr><tr><td>Hind III-HF</td><td>New England BioLabs</td><td>R3104S</td><td>Kısıtlama enzimi</td></tr><tr><td>CutSmart tamponu</td><td>New England BioLabs</td><td>B7204S</td><td>Kısıtlama enzimi tamponu</td></tr><tr><td>DNA jel ekstraksiyon kiti</td><td>Qiagen</td><td>28704</td><td>DNA parçalarını agaroz jel</td></tr><tr><td>PCR Saflaştırma Kiti</td><td>Qiagen'den</td> saflaştırın<td>28104</td><td>DNA temizleme</td></tr><tr><td>LB Miller'ın modifikasyonu</td><td>TEKNOVA</td><td>L8600</td><td>Dönüştürülmüş E. Coli kültürü için</td></tr><tr><td>LB Agar Plakası</td><td>TEKNOVA</td><td>L1902</td><td>Beyaz/mavi seçimi için</td></tr><tr><td>QIAprep spin miniprep Kiti</td><td>Qiagen</td><td>27104</td><td>Plazmid DNA ekstraksiyonu için</td></tr><tr><td>EndoFree plazmid maksi hazırlama Kiti</td><td>Qiagen</td><td>12362</td><td>Plazmid DNA ekstraksiyonu için</td></tr><tr><td>FuGene HD</td><td>Promega</td><td>E2311</td><td>Transfeksiyon reaktifi</td></tr><tr><td>Opti-MEM azaltılmış serum ortamı</td><td>Invitrogen</td><td>31985-062</td><td>Transfeksiyon için</td></tr><tr><td>MCF10A hücre hattı</td><td>Amerikan Tipi Kültür Koleksiyonu</td><td>CRL-10317</td><td>Meme Epitel Hücreleri</td></tr><tr><td>MEGM BulletKit</td><td>Lonza</td><td>CC-3150</td><td>Meme Epitel Büyüme Ortamı</td></tr><tr><td>MEBM</td><td>Lonza</td><td>CC-3151</td><td>Meme Epitelyal Bazal Orta</td></tr><tr><td>MEGM SingleQuot Kiti</td><td>Lonza</td><td>CC-4136</td><td>Takviyeler ve Büyüme Faktörleri</td></tr><tr><td>ReagentPack</td><td>Lonza</td><td>CC-5034</td><td>Alt kültür için reaktif</td></tr><tr><td>D-PBS (10X)</td><td>Sigma</td><td>D1408</td><td>Kültür kaplarında hücreleri yıkayın</td></tr><tr><td>UltraSaf Damıtılmış Su</td><td>Invitrogen</td><td>10977</td><td>Seyreltik 10X D-PBS</td></tr><tr><td>Doku kültürü kabı (35 mm)</td><td>BD/Falcon</td><td>353001</td><td>LumiCycle Silikon grese uygun hücre kültürü kabı</td></tr><tr><td></td><td>Fisher</td><td>NC9044707</td><td>Kayıt ortamı ile çanağı kapatmak için</td></tr><tr><td>Yuvarlak kapaklı cam</td><td>Harvard Bioscience</td><td>64-1500 (CS-40R)</td><td>Kayıt ortamı ile çanağı kapatmak için</td></tr><tr><td>Kolera toksini</td><td>Sigma</td><td>C8052</td><td>Büyüme ortamı için takviye</td></tr><tr><td>G418 sülfat (Geniticin)</td><td>Invitrojen</td><td></td><td>10131035 Stabliy transfekte edilmiş hücrelerin seçimi için antibiyotik</td></tr><tr><td>Ampisilin</td><td>Sigma</td><td>A9393</td><td>Koloni seçimi için</td></tr><tr><td>Forskolin</td><td>Sigma</td><td>F6886</td><td>Senkronizasyon ajanı</td></tr><tr><td>Melatonin</td><td>Sigma</td><td>M5250</td><td>Senkronizasyon ajanı</td></tr><tr><td>Deksametazon</td><td>Sigma</td><td>D4902</td><td>Senkronizasyon ajanı</td></tr><tr><td>At serumu</td><td>Sigma</td><td>H1138</td><td>Senkronizasyon ajanı</td></tr><tr><td>d-Luciferin, sodyum tuzu</td><td>Invitrogen</td><td>L2912</td><td>Luciferaz substratı</td></tr><tr><td>IC261</td><td>Sigma</td><td>10658</td><td>Sirkadiyen bozucu</td></tr><tr><td>Metilnitrosourea (NMU)</td> <td>Sigma</td> için pozitif kontrol <td>N1517</td><td>Memeye özgü kanserojen</td></tr><tr><td>Metilselenosistein (MSC)</td> <td>Sigma</td><td>M6680</td><td>Organik selenyum (kemopreventif ajan)</td></tr> <tr><td>EX527</td><td>Sigma</td><td>E7034</td><td>SIRT1 spesifik inhibitör</td></tr><tr><td>Cambinol</td><td>Sigma</td><td>C0494</td><td>SIRT1 & SIRT2 inhibitörü</td></tr><tr><td>NanoDrop Spektrofotometre</td><td>Thermo Scientific</td><td>NanoDrop 8000</td><td>Nükleotidi Ölçer</td></tr><tr><td>GeneAmp PCR Sistemi 9700</td><td>Uygulamalı Biyosistemler</td><td>N805-0200</td><td>Moleküler biyoloji deneyi için</td></tr><tr><td>CO2 İnkübatörü</td><td>NAPCO</td><td>Serisi 8000 DH</td> %<td>5'te hücre kültürü için CO2 37 ° C'de; C</td></tr><tr><td>Refrezeratörlü masaüstü santrifüj</td><td>Eppendorf</td><td>5430R</td><td>Moleküler biyoloji deneyi için</td></tr><tr><td>Döner kovalı santrifüj</td><td>Eppendorf</td><td>5810 R</td><td>Hücre kültürü için</td></tr><tr><td>Ters mikroskop</td><td>Nikon</td><td>80124</td><td>Faz kontrastı isteğe bağlı</td></tr><tr><td>Doku kültürü başlığı</td><td>Labconco</td><td>Sınıf II A2</td><td>BSL-2 sertifikalı</td></tr><tr><td>LumiCycle 32</td><td>Actimetrics</td><td>Mevcut Değil</td><td>Parlaklık dedektörü</td></tr></tbody></table>

vitro sirkadiyen ritim meme epitel hücreleri ayırdetmek için bioluminescence tahlil

In Vitro Bioluminescence Assay to Characterize Circadian Rhythm in Mammary Epithelial Cells

Sirkadiyen ritim biyolojik süreçlerin davranış uyumaya gen ifadeden değişen düzenleyen bir temel fizyolojik tüm canlılar arasında mevcut bir süreçtir. Omurgalılar, sirkadiyen ritim fonksiyonları hem suprachiasmatic çekirdeği (SCN; Merkezi kalp pili) ve tek tek hücreler en periferik dokularda oluşan bir moleküler osilatör tarafından kontrol edilir. Daha da önemlisi, sirkadiyen ritim ışık gece, çevresel stres ve/veya toxicants maruz bozulma yaşlanma ve kronik hastalıkların riski ile ilişkilidir. Merkezi ve/veya periferik biyolojik saatler bozabilir ajanlar ve önlemek veya sirkadiyen bozulma, etkilerini azaltmak aracıları tanımlama yeteneği kronik hastalıkların önlenmesi için önemli sonuçları vardır. Kemirgen modelleri Etkilenmeler ve teşvik veya sirkadiyen kesintileri önlemek/azaltmak aracıları tanımlamak için kullanılan rağmen bu deneylerin hayvanlar çok sayıda gerekir. İn vivo çalışmalar da önemli miktarda kaynak ve altyapı çalıştırmaları ve araştırmacılar bütün gece çalışmak gerekir. Böylece, işte bir hücre tipi uygun vitro sistemi için acil bir ihtiyaç için çevre sirkadiyen olduk ve hücre tipleri arttırıcılar ekran farklı organ ve hastalık durumlarında. Biz insan dönemi 2 gen düzenleyici denetimi altında ökaryotik hücrelerde bozulma luciferase, transkripsiyon sürücüler bir vektör inşa. Bu sirkadiyen muhabir yapıyı stabil insan meme epitel hücreleri transfected ve sirkadiyen duyarlı muhabiri hücre vitro bioluminescence testi geliştirmek üzere seçildi. Burada, kurmak ve tahlil doğrulamak için detaylı bir iletişim kuralı mevcut. Daha fazla kanıt-in vivo etkileri çeşitli kimyasallar hücresel biyolojik saat özetlemek için bizim vitro tahlil yeteneği gösteren kavram deneyler için ayrıntıları sağlar. Sonuçlar tahlil çeşitli hücre tiplerinin çevresel olduk ve chemopreventive arttırıcılar sirkadiyen saatler için ekran için adapte edilebilir gösterir.

Sirkadiyen bioluminescence muhabir vektör: insan PER2 organizatörü tahrik ifade istikrarsızlığın luciferase varyant
941 bp parçası oluşan DNA dizisi sirkadiyen muhabir vektör, pGL oluşturmak için kullanılan insan PER2 organizatörü türetilmiş [hPer2P/Luc2P/Neo, ilk düzenleyici elemanlarının düzenleyen bilinen varlığı için analiz sirkadiyen gen ekspresyonu. Biyoinformatik analizi bu organizatörü pa...

Hücresel sirkadiyen ritim meme epitel hücreleri belirlemek için bir vitro bioluminescence tahlil sunulur. Bu yöntem memeli hücre muhabir plazmid istikrarsızlığın luciferase dönem 2 gen düzenleyici denetimi altında ifade kullanır. Sirkadiyen ritim organ özgü etkileri değerlendirmek için diğer hücre tipleri için uyarlanabilir.

Vitro Sirkadiyen ritim meme epitel hücreleri ayırdetmek için bioluminescence tahlil

The circadian rhythm is a fundamental physiological process present in all organisms that regulates biological processes ranging from gene expression to ...

Bu in vitro biyolüminesans analizinin genel amacı, farklı çevresel sirkadiyen bozucuların ve artırıcıların, normal veya hastalıklı durumdaki meme bezlerinden alınan meme epitel hücrelerinin hücresel sirkadiyen ritmi üzerindeki etkilerini belirlemektir. Bu yöntem, kimyasal bileşikler dahil olmak üzere çevresel faktörlerin hücresel sirkadiyen ritmi etkileyip etkilemediği gibi çevresel sağlık alanındaki temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Dolayısıyla, bu analizin temel avantajı, farklı organlardaki sirkadiyen saatlerin çevresel modülatörlerini tarayabilmemiz için çeşitli hücre tiplerine kolayca uyarlanabilmesidir.Prosedürü benimle birlikte uygulayan kişi, laboratuvarımızdaki lisansüstü öğrencisi Brian Estrella'dır. İnsan PER2 promotör fragmanı, çoklu klonlama bölgesindeki SecI ve HindIII arasındaki bölgede insan PER2P içeren özelleştirilmiş bir vektörden elde edilir. İnsan PER2P fragmanını vektörden kesmek için bir DNA/RNA ve nükleotid içermeyen mikro santrifüj tüpünde şunları karıştırın: 2.5 microliters restriksiyon enzimi tamponu, 10 microliters vektör, one microliter SacI restriksiyon enzimi, one microliter HindIII restriksiyon enzimi ve 25 microliters'e tamamlayacak

in-vitro-bioluminescence-assay-to-characterize-circadian-rhythm

Research

JoVE Journal

Genetics

Genetik

Lusiferaz ifade Meme tümör hücrelerini farelerde subkütan implant ve uzunlamasına bir çalışmada non-invaziv tümör büyümesini ve gelişimini izlemek için optik görüntüleme ile görüntülendi.

Meme Tümörleri IVIS Spektrum kullanarak in vivo Bioluminescent Görüntüleme

Sirkadiyen saatler tek tek hücrelerin içinde fonksiyon, yani, bu hücre-özerktir. Burada, non-invaziv, lusiferaz tabanlı gerçek zamanlı biyolüminesans teknolojisini kullanarak cep özerk saat modelleri üretme yöntemleri açıklanmaktadır. Muhabir hücreleri sirkadiyen biyoloji eğitimi için uysal, fonksiyonel model sistemleri sağlıyoruz.

Lusiferaz Biyoparlaklık Gazeteciler kullanma Gen Ekspresyonunun Hücre-özerk Sirkadiyen Saat Ritimleri İzlenmesi

Time-lapse görüntüleme özgü davranışsal parametreler ve farklı genetik lezyonlar arasında bir korelasyon olup olmadığını belirlemek için meme kanseri riskinin genetik fare modelleri türetilmiştir birincil preneoplastic meme epitel hücrelerinin davranışlarını değerlendirmek için kullanılır.

Birincil Preneoplastic Meme Epitel Hücrelerinin Time-lapse görüntüleme Meme Kanseri Genetik Fare Modelleri türetilen

Bakteriyel biyolüminesans gen kasetinin ifade eden memeli hücreleri...

Sitotoksisite Sürekli ve gerçek zamanlı izlenmesi için özerk Bioluminescent Memeli Hücre

Burada, paralel sirkadiyen biyolüminesansı ve insan adacık hücrelerinin ve birincil miyotüplerin salgı aktivitesini izlemek için ayarları açıklıyoruz. Bunun için, bir lusiferaz çekirdek saat raportörünün lentiviral gen iletimini, ardından in vitro senkronizasyonu ve sürekli hücre perifüzyonu ile çıkış ortamının toplanmasını kullandık.

İnsan Primer Hücre Kültürleri içinde Sirkadyen Saat Gen İfade ve Hormon salgısını Paralel Ölçümü

Genetik olarak kodlanmış luciferase gen ekspresyonu popüler bir non-invaziv muhabir var. Gaz ve sıcaklık optimize Kaydedici (timsah) Imaging otomatik bir boyuna luciferase çok çeşitli koşullar altında kollarındaki hücrelerden Boylamsal kayıt sağlar. İşte nasıl timsah sirkadiyen ritim araştırma bağlamında kullanılabilir göstermektedir.

Kollarındaki gazetecilere bir otomatik boyuna Luciferase gaz ve sıcaklık optimize Kaydedici (timsah) Imaging kullanarak esnek ölçüm

Bu yeni geliştirilmiş floresans tabanlı teknoloji uzun vadeli, suprachiasmatic çekirdeği (SCN) sirkadiyen saat genlerde transkripsiyonu gerçek zamanlı olarak ve yüksek zamansal çözünürlükte fareler serbestçe hareket izleme sağlar.

Vivo Sirkadiyen saat gen ekspresyonu floresans gazetecilere kullanarak fare Suprachiasmatic çekirdeği olarak izlenmesi

Bu protokol, insan meme hücrelerinin dönüşümünü değerlendirmek için deneysel in vitro araçlar sağlar. Hücre çoğalma hızının takibi, ankraj-bağımsız büyüme kapasitesi ve hücre soylarının 3Boyutlu kültürlerde bazal membran matrisi ile dağılımı nın detaylı adımları tanımlanmıştır.

İnsan Meme Epitel Hücrelerinde Onkojenik Dönüşümün İn Vitro Değerlendirilmesi

Burada, çeşitli meme kanseri hücre hatlarında lusiferaz ve yeşil floresan protein ekspresyonunu içeren noninvaziv bir izleme yöntemini tanımladık. Bu protokol, farelerde tümör oluşumunu ve metastatik kolonizasyonu gerçek zamanlı olarak izlemek için bir teknik sağlar.

Biyolüminesans Kullanarak Farelerde Meme Kanseri Büyümesi ve Metastatik Koloni Oluşumunun İzlenmesi

Mevcut protokol, lazer taramalı konfokal ve multifoton mikroskobu ile emziren fare meme bezinin intravital görüntülenmesi için kolay bir tekniği tanımlamaktadır.

Meme bezinin intravital hücre altı mikroskobu

Çoğu organizmada bulunan sirkadiyen ritimler, biyolojik süreçlerin zamansal organizasyonunu düzenler. 3D organoidler son zamanlarda fizyolojik olarak ilgili bir in vitro model olarak ortaya çıkmıştır. Bu protokol, organoidlerde sirkadiyen ritimleri gözlemlemek için biyolüminesan raportörlerin kullanımını açıklar ve çok hücreli sistemlerde sirkadiyen ritimlerin in vitro olarak araştırılmasını sağlar.

Organoidlerde Biyolüminesans Raportörü ile Sirkadiyen Salınımların İzlenmesi

Öğrenin meme epitel hücrelerinde sirkadiyen ritmi değerlendirmek için biyolüminesans analiz yöntemini. Bu teknik çevresel faktörlerin hücresel ritim üzerindeki etkilerini incelemek için uyarlanabilir.

Vitro Sirkadiyen ritim meme epitel hücreleri ayırdetmek için bioluminescence tahlil

Daha fazla video keşfet