-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

TR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
<<<<<<< HEAD
K12 Schools
Biopharma
=======
K12 Schools
>>>>>>> dee1fd4 (fixed header link)

Language

tr_TR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Neuroscience
İnsan serebrospinal sıvı Endopeptidomic analiz için numune hazırlama
İnsan serebrospinal sıvı Endopeptidomic analiz için numune hazırlama
JoVE Journal
Neuroscience
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Neuroscience
Sample Preparation for Endopeptidomic Analysis in Human Cerebrospinal Fluid

İnsan serebrospinal sıvı Endopeptidomic analiz için numune hazırlama

Full Text
9,376 Views
10:23 min
December 4, 2017

DOI: 10.3791/56244-v

Karl T. Hansson1, Tobias Skillbäck1,2, Elin Pernevik1, Jessica Holmén-Larsson1, Gunnar Brinkmalm1, Kaj Blennow1,2, Henrik Zetterberg1,2,3, Johan Gobom1,2

1Inst. of Neuroscience and Physiology, Dept. of Psychiatry and Neurochemistry,Sahlgrenska Academy at University of Gothenburg, 2Clinical Neurochemistry Laboratory,Sahlgrenska University Hospital, 3Department of Molecular Neuroscience,UCL Institute of Neurology

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a method for mass spectrometric analysis of endogenous peptides in human cerebrospinal fluid (CSF). By utilizing molecular weight cut-off filtration, chromatographic pre-fractionation, and mass spectrometric analysis, the research significantly expands the known CSF peptidome, enhancing the identification of low abundance peptides that could serve as biomarkers for neurodegenerative disorders.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Mass Spectrometry
  • Biomarker Discovery

Background

  • Endogenous peptides in CSF are potentially significant in identifying neurodegenerative disorders.
  • Low abundance CSF peptides have not been extensively studied.
  • Existing methods have provided limited data on the CSF peptidome.

Purpose of Study

  • To enhance the identification and characterization of endogenous peptides in human CSF.
  • To provide a more comprehensive view of the CSF peptidome.
  • To explore the potential for new biomarkers in neurodegenerative conditions.

Methods Used

  • Mass spectrometry with pre-fractionation of CSF samples.
  • Involves thawing and processing 1.5 milliliter aliquots of CSF with specific reagents.
  • Compatible with multiplex isobaric labeling techniques.
  • Can be adapted for plasma and tissue sample analysis with minor modifications.

Main Results

  • The method allows for the detection of a significantly larger number of peptides compared to previous studies.
  • Key findings indicate the presence of previously unexplored low abundance peptides.
  • Provides insights that may lead to the discovery of new biomarkers.

Conclusions

  • This study demonstrates an efficient approach to characterizing the CSF peptidome.
  • The method's versatility opens avenues for clinical studies on neurodegenerative disorders.
  • Potential implications for understanding neuronal mechanisms and identifying disease markers.

Frequently Asked Questions

What are the key advantages of this method?
This method allows for the identification of low abundance peptides in human CSF, expanding the known peptidome significantly compared to previous techniques.
How is the biological model implemented?
The model involves human cerebrospinal fluid samples, which are processed and analyzed using mass spectrometry with an emphasis on peptide pre-fractionation.
What types of outcomes are obtained from this method?
The method yields extensive peptide profiles, potentially revealing biomarkers linked to neurodegenerative disorders.
How can this method be adapted for other biological samples?
With minor modifications, this protocol can also be applied to plasma and tissue samples to analyze endogenous peptides.
What are some key limitations to consider?
The initial method was primarily validated for CSF, thus further adaptation may be required for optimal performance with other sample types.

Endojen peptidler insan beyin-omurilik sıvısı (bos) kitle spektrometrik analizi için bir yöntem sunulur. Moleküler ağırlık kesme filtrasyon, Kromatografik ön ayırma, kitle spektrometrik analizi ve peptid kimlik stratejileri sonraki bir arada istihdam ederek, yaklaşık on göre bilinen CSF peptidome genişletmek olası Önceki çalışmalar için.

Bu protokolün amacı, endojen peptitlerin LC-MS analizi için insan beyin omurilik sıvısı örneklerini hazırlamak ve analiz etmektir. LC-MS'den önce bir peptit ön fraksiyonlama adımı, tanımlanan peptitlerin sayısını arttırır ve nispeten düşük bolluktaki BOS peptitlerinin tespit edilmesini sağlar. BOS'taki endojen peptitler, kapsamlı bir şekilde araştırılmamış kalsiyum molekülleridir ve potansiyel olarak nörodejeneratif bozuklukların önemli yeni biyobelirteçlerini içerebilir. Bu yöntem, BOS peptidomunun kütle spektrometresi ile kapsamlı bir şekilde karakterize edilmesini sağlar. Bu yöntemin başlıca avantajları, düşük bolluktaki BOS peptitlerinin enjeksiyonunu mümkün kılması ve multipleks izobarik etiketleme teknikleriyle uyumlu olması ve klinik çalışmalar için uygulanabilir olmasıdır. Şimdiye kadar bu yöntemi esas olarak beyin omurilik sıvısının analizine uyguladık. Ancak, küçük değişikliklerle plazma ve doku örneklerinin analizi için de kullanılabileceğini gösteren ön verilerimiz var. 1.5 mililitre BOS alikotunu silindir karıştırıcı üzerinde oda sıcaklığında çözdürerek başlayın. Çözüldükten sonra, içeriği 10 mililitrelik polipropilen tüplere aktarın. Ve tamponlama maddesi olarak 80 mikrolitre bir molar TAB ekleyin. Daha sonra protein agregatlarını çözmek için 0.65 mililitre sekiz molar guanidinyum hidroklorür ekleyin ve oda sıcaklığında 10 dakika boyunca hafifçe girdap yapın. Daha sonra, 60 mikrolitre 200 milimolar sulu TCEP'de ve 55 ° C'de inkübe edin

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Neuroscience sayı: 130 beyin omurilik sıvısı peptidomics endojen peptidler biyolojik ateş Alzheimer hastalığı LC-MS/MS ön ayırma izobarik etiketleme multiplexed

Related Videos

Formalin gelen Proteomic Numune Hazırlama parafin blok doku Sabit ve

09:20

Formalin gelen Proteomic Numune Hazırlama parafin blok doku Sabit ve

Related Videos

28.3K Views

Kantitatif Real Time PCR kullanarak Beyin Omurilik Sıvısı MicroRNA Profil

09:26

Kantitatif Real Time PCR kullanarak Beyin Omurilik Sıvısı MicroRNA Profil

Related Videos

15.9K Views

Konsensus Beyin kaynaklı protein, 2D-DIGE ve Mini 2DE İmmünoblotting Hem kullanma İnsan ve Kemirgen Beyin proteomun Çalışmaları Ekstraksiyon Protokolü

10:51

Konsensus Beyin kaynaklı protein, 2D-DIGE ve Mini 2DE İmmünoblotting Hem kullanma İnsan ve Kemirgen Beyin proteomun Çalışmaları Ekstraksiyon Protokolü

Related Videos

16.7K Views

Bir Yüksek Verimli, Çoklanmış ve Hedefli Proteomik BOS Deneyi nörodejeneratif Biyomarkerleri ve Apolipoprotein E İzoformları Durum belirlememize

07:08

Bir Yüksek Verimli, Çoklanmış ve Hedefli Proteomik BOS Deneyi nörodejeneratif Biyomarkerleri ve Apolipoprotein E İzoformları Durum belirlememize

Related Videos

8.2K Views

Oküler yüzdeki kütle spektrometresi esaslı proteomik analiz için numune hazırlama

11:32

Oküler yüzdeki kütle spektrometresi esaslı proteomik analiz için numune hazırlama

Related Videos

11.9K Views

FASP Sindirimi ve Veriden Bağımsız Analiz yoluyla EPS-İdrarın Proteomik Profili

14:48

FASP Sindirimi ve Veriden Bağımsız Analiz yoluyla EPS-İdrarın Proteomik Profili

Related Videos

7.6K Views

Callinectes sapidus'ta Nöropeptitlerin Çok Yönlü Kütle Spektrometrik Araştırması

09:22

Callinectes sapidus'ta Nöropeptitlerin Çok Yönlü Kütle Spektrometrik Araştırması

Related Videos

2.8K Views

Beyinden Amiloid Fibril Çekirdeklerinin Biyokimyasal Saflaştırılması ve Proteomik Karakterizasyonu

09:00

Beyinden Amiloid Fibril Çekirdeklerinin Biyokimyasal Saflaştırılması ve Proteomik Karakterizasyonu

Related Videos

3.7K Views

Taze Dondurulmuş İnsan Beyninin Bölümlerinden Salınan Küçük Hücre Dışı Veziküllerde MikroRNA Yüklerinin Gücünden Yararlanma

07:55

Taze Dondurulmuş İnsan Beyninin Bölümlerinden Salınan Küçük Hücre Dışı Veziküllerde MikroRNA Yüklerinin Gücünden Yararlanma

Related Videos

821 Views

Dissected Serebral Kortikal Eksplantlarından ile kullanım için Kemirgen Embriyolar arasından Beyin Omurilik Sıvısı İzolasyonu

09:47

Dissected Serebral Kortikal Eksplantlarından ile kullanım için Kemirgen Embriyolar arasından Beyin Omurilik Sıvısı İzolasyonu

Related Videos

23.8K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code