Name: Nematot Caenorhabditis Elegans - konak-mikrop etkileşimleri çalışmaya çok yönlü Vivo içinde manken (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-10-18T14:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 58 s
Description: Keşfedin Caenorhabditis elegans ile fungal enfeksiyon etkilerini in vivo araştırma yöntemini. Bu sistem patojen virülansı, konak bağışıklık yanıtları ve ilaç keşfi çalışmaları için hızlı ve uygun maliyetli bir model sunar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu eser gerçekleştirilen ve Worcester Polytechnic Enstitüsü tarafından desteklenen.

1. Yuvarlak solucanlar büyüme orta (NGM) hazırlık <ol><li>için 1 L medya, 20 g agar, 2.5 g organik azot kaynağı (örneğin, bacto-pepton) ve 3 g sodyum klorür bir 2 L şişesi içinde birleştirmek. 975 mL steril su ekle.
	<ol><li>Ekle bir steril heyecan barda. Bir otomatik medya dökücü, otoklav boru ve medya 15dk için kullanıyorsanız; medya-meli var olmak autoclaved için artık daha fazla yapılırsa.</li>
	</ol></li> <li>Ayarla medya heyecan plaka üzerinde ve soğumasını bekleyin.
	<ol><li>Medya (yaklaşık 60 ° C) aseptik dokunmak sıcak olduğunda 1 M MgSO 4 1 mL ekleyin &#9679; H 2 O, 1 mL 1 M CaCl 2, KPO 4 25 mL ve 1 mL etanol içinde % 0.5 kolesterol.</li>
		<li>Medya (el ile veya otomatik pompa) laminar akış altında 35 mm x 10 mm steril petri yemekler dökün. 1-2 gün kullanmadan önce başlık altında kurumasını izin. 
		Not: Tabak kontaminasyonu önlemek için 4 ° C saklanmalıdır.</li>
	</ol></li></ol> 2. Bir solucan almak yapım <ol><li>bir 1,5 cm parça Alüminyum tel kesme. Dikkatle bu uzunluğu yaklaşık 0.5 cm Pasteur pipet ucu takın.
	<ol><li>Bir Bunsen brülör veya alkol lamba, kullanarak Tel güvenli bir şekilde pipet pipet ucu orijinal şekli ödün vermeden yapıştırılır kadar yavaş yavaş alev içinde döndürerek cam pipet ucu eritebilir.</li>
	</ol></li></ol> 3. E. coli kültür hazırlanması <ol><li>bir kısır döngü kullanarak, koloni E. coli baskı OP50 Luria suyu 200 ml aşılamak. Gecede 37, sallayarak ile kuluçkaya ° C.</li>
	<li>Sıvı kültür ertesi gün kullanıma hazırdır ve kullanılmadığı zaman 4 ° C'de depolanmış olabilir. 
	Not: E. coli gerginliği, OP50, için bir besin kaynağı olarak kullanılan C. elegans. Bu kültür için kullanılabilir birkaç ay 4'te saklandığında kadar ° C.</li>
</ol> 4. Temel C. elegans bakım <ol><li>NGM Ağar kaplamalar E. coli ile yaklaşık 50-100 µL hazırlanan OP50 sıvı kültür plaka Merkezi lekelenme tarafından hazırlanan tohum.</li>
	<li>Kuruyucu ve onları, oda sıcaklığında 24 h için kurumasını bekleyin. Sonra kuru, hızlı büyüme için gecede 37 ° C'de tabak yerleştirin veya daha yavaş büyüme isterseniz oda sıcaklığında tutun.</li>
	<li>Ekleyin solucanlar plakasına tarafından &#34; parçalama, &#34; (bkz: protokol adım 5 &#34; Chunking ve malzeme çekme solucanlar &#34;), solucanlar tek tek seçmek veya solucan yumurta doğrudan plaka üzerine yerleştirerek (bkz: protokol adım 6 &#34; yumurta hazırlık &#34;).</li>
</ol> 5. Chunking ve solucanlar toplama Not: &#34; parçalama, &#34; C. elegans bakım ortak bir uygulama anlamına gelir. Bu bir bölüm solucan içeren NGM agar plaka kesme ve bu parça yeni bir tabak üzerine aktarılması, böylece aynı zamanda aktarılması sürecinde solucanlar, çok sayıda içerir. Kirlenme plaka bu şekilde dışarı kesebilir. Solucanlar seçilmesinde, solucanlar agar boşluklar kayıp olabilir çünkü agar bütünlüğünü korumak önemlidir. Buna ek olarak, agar erime veya solucanlar yanma önlemek için plaka dokunmadan önce soğuması çekme izin önemlidir.
<ol>Hızlı bir şekilde solucanlar yeni Kaplamalar, üzerine büyük miktarlarda aktarmak için <li>bir spatula kullanarak seçili solucan içeren NGM agar bir parça kesti. Kesilmiş parça çıkarın ve yüz aşağı OP50 çimenlerin üzerine yeni bir tabak kenarına yerleştirin.</li>
	<li>Transfer protokolü adım 8.2, aşağıda açıklandığı gibi ayrı ayrı solucanlar &#34; hayatta kalma yöntemi, &#34; bir solucan kullanarak seçin. Alev solucan Tel al kırmızı olana. Alev çıkarın ve birkaç saniye için soğumasını bekleyin.</li>
	<li>Tel çekme üzerinde kullanarak yavaşça tel çekme üzerinde kapsayan yeni plaka üzerinde yetiştirilen OP50 kültür çim kazımak.</li>
	<li>Tel ucu kapsayan viskoz kültür sopa çekmeyi ucuna, böylece nazikçe bir sürükleme hareketi kullanarak seçili solucanlar kadar aç kurt yapar.</li>
	Bir kez seçilen solucanlar toplandık, <li>koyun onları yeni bir tabağa nazikçe kültür agar swiping tarafından. Tel çekme üzerinde kalan kültür kaldırmak için alevin içine yerleştirin.</li>
</ol> 6. Yumurta hazırlık <ol><li>toplama ya da 5, protokolü adımda anlatıldığı gibi parçalama tarafından yaklaşık 20 Yetişkin Hayvanlar (yaklaşık 2-3 gün sonra 20 ° C'de yetiştirilen damızlık) yer &#34; Chunking ve solucanlar, malzeme çekme &#34; ile 50 numaralı seribaşı bir plaka üzerine E. coli baskı, OP50 µL.</li>
	<li>Yumurta toplamak için sel M9 arabellek 10 mL ile plaka 1-2 gün sonra. Bir cam serolojik pipet kullanarak, girdap ve yavaşça yumurta şaşırıp kalmış OP50 ya da Yetişkin Hayvanlar serbest bırakmak için agar plaka üzerinde içeriği tahrik. Yumurta ve yetişkin içeren sıvı toplamak.</li>
	<li>15 mL konik M9 transfer ve OP50 çözümde tüp. Santrifüj kapasitesi 2100 x g 2 dakika süreyle de 15 mL konik tüp</li>
	<li>Yaklaşık 9 mL süpernatant OP50 Pelet bozmadan Aspire edin.</li>
	<li>2 mL steril su, çamaşır suyu 1 mL ve 1 mL 0.25 M NaOH Pelet resuspend.</li>
	Yetişkin Hayvanlar (yaklaşık yüzde 70) çoğunluğu lysed görününceye kadar <li>karışımı yavaşça tarafından inversiyon; genellikle, yumurta bu kısa çamaşır suyu tedavi sırasında kendi kabuk nedeniyle korunacak. Konik tüp, 990 x g 2 dakika süreyle santrifüj kapasitesi</li>
	<li>Pelet bozmadan aspiratı süpernatant. Pelet 10 mL M9 arabellek yeniden askıya alma.</li>
	<li>990 x g 2 dk. aspiratı süpernatant olmadan rahatsız edici Pelet için konik tüp santrifüj kapasitesi. M9 arabelleği 200 µL ile yeniden askıya Pelet. 
	Not: Birden fazla denemeler yumurta hazırlık gerektirebilir. Onlar uzun süre bleach maruz kalır Eğer yumurta yok olabilir. Yumurtadan değil, çamaşır suyu çözüm konsantrasyonu azaltmak veya çamaşır suyu pozlama süresi azaltmak.</li>
</ol> 7. Enfeksiyon plaka koymak-yukarıya <ol><li>YPD 3-5 mL steril tüp içine dağıtmak ve bir kısır döngü kullanarak Candida albicans bir koloni ile aşılamak.
	<ol><li>Yaklaşık 16-18 h 30 için çevirme davul tüpü yerleştirin ° C.</li>
	</ol></li> <li>C. albicans ve başka OP50 içerecek şekilde içerecek şekilde etiket bir 1.5 mL microfuge tüp. Her boş tüpün ağırlığı kaydetmek.
	<ol><li>Yer 500 µL gecede C. albicans kültür tüp içine etiketli C. albicans ve gecede OP50 kültür (Kimden adım 3.1) 1.500 µL OP50 etiketli tüpüne.</li>
		<li>, 16,100 g. aspiratı süpernatant olmadan rahatsız edici Pelet x 10 dk santrifüj.</li>
		<li>Her Pelet 500 µL steril su ile yeniden askıya alma. Santrifüj 16,100 x g., 5 min için</li>
		<li>Pelet bozmadan aspiratı süpernatant. Microfuge tüpler son ağırlığı kaydetmek.</li>
		<li>Microfuge tüpler son ağırlık üzerinden ilk ağırlığını çıkararak her Pelet ağırlığını belirlemek.</li>
	</ol></li> <li>Steril su kullanarak yeniden askıya C. albicans Pelet 10 mg/ml ve 200 mg/ml OP50 Pelet. Streptomisin, 50 mg/mL solüsyon 10 µL, OP50 kültürünün 2.5 µL, 0.5 µL C. albicans kültür ve steril su 7 µL birleştirerek karışımı bir ana enfeksiyon olun.
	<ol><li>C. albicans kültür hacmi steril su ile değiştirerek kontrol levha için ana bir karışım oluşturmak. Enfeksiyon karışımı veya OP50 kontrol çözümü bir micropipette kullanarak Merkezi NGM plakalar üzerine 20 µL tohum. 
		Not: Yaklaşık 100 solucanlar istatistiksel anlamlılık Çözümleme sırasında belirlemek için gereklidir. Bu tahlil genellikle nüsha çalıştırılır. Böylece, 3.2 x enfeksiyon mix yanı sıra 3.2 x kontrol çözümü yapılır. Bu karışımları biraz üzerinde 3 x tam 20 µL üzerine hata izin her plaka numaralı seribaşı sağlamak için orijinal olmak için yapılır. Yutak solucanın ilk larva evrelerinde (L1-L3) C. albicans tüketmek için çok küçük olduğundan bu ana karışımı oluşturulur. Flukonazol kullanımı ( şekil 3B) gibi farmakolojik ajanlara maruz kalma için enfeksiyon karışıma aracı kullanılmaya başlandı. Aracı konsantrasyonu ampirik olarak belirlenir. Örneğin, içinde şekil 3B, 50 µM Flukonazol temsil edilmektedir, ancak 0, 12.5, 25, 50 ve 100 µM Flukonazol vardı da aynı iletişim kuralını kullanarak test.</li>
	</ol></li></ol> 8. Anal bölge (Dar) deforme fenotip ve hayatta kalma tahlil analiz <ol><li>Visualize Dar fenotip Not: Dar L3 aşamada ve ötesinde en iyi görüntülenir. Dar olan zaman içinde daha belirgin hale gelir solucanın ( şekil 2A), küçük bir çıkıntı sonrası anal bölgede olarak gözlenmektedir.
	<ol><li>Bir hayvan olup olmadığını hızlı bir şekilde plaka diseksiyon mikroskop sahneye dokunarak Dar; Dar hayvanlarla-ecek da lüzum hemen geriye doğru hareket hayvan Dar olmadan Onayla kendi yönünü ya da tersine çevirmek için dokunarak tur tekrarlanan Bunu hiç yapmak.</li>
	</ol></li> <li>Hayatta kalma tahlil <ol><li>daha önce protokol adım 6, açıklandığı gibi tam yumurta hazırlık &#34; yumurta hazırlık &#34;. Diseksiyon kapsamı altında yumurta sayısı ve yaklaşık 5-6 sağlıklı yumurta µL başına bir konsantrasyon elde kadar M9 yumurta Çözümle sulandırmak. Bir pipet kullanarak dağıtmak arasında yaşayan bakteri kültürü ve plaka tarafında hazırlanan NGM plaka üzerine yaklaşık 30 yumurta içeren 20 µL örnek (yumurta ve solucan yemek, OP50, iki farklı noktalar vardır).</li>
		<li>İçin 48 h 20 ° C'de Incubate tabaklar. Diseksiyon mikroskop altında canlı ve ölü yetişkin solucanlar her plaka üzerinde sayısı, hem de Dar Kurtlarla sayısını saymak. Dar ile yüzde rekor.</li>
		<li>Kafasına bir Alüminyum tel veya dokunarak plaka için dinleniyor vermezse bir hayvan ölü düşünün.</li>
		<li>Her gün, aktarım kalan yetişkin solucanlar tarafından malzeme çekme 5, protokolü adımda anlatıldığı gibi &#34; Chunking ve solucanlar, malzeme çekme &#34; yeni bir enfeksiyon veya kontrol levha üzerine. Bu noktada, canlı, ölü ve kayıp solucanlar sayısı her gün takip ederek bir hayatta kalma tahlil gerekirse, gerçekleştirmek. 
		Not: Bu tahlil yumurta hazırlık ile başlayan iki hafta boyunca çalıştırabilirsiniz. Çözüm OP50 öldürebilir çamaşır suyu izleri içerebilir gibi Ayrıca, yumurta çözüm bakteri kültürü reçete değil. Çözüm Ayrıca olmalıdır yumurta plaka ve agar kenarlarına arasında kalmış olur gibi yaklaşık 0.5 cm tabak kenarına uzakta reçete. Buna ek olarak, solucanlar hızlı yayılması nedeniyle, Yetişkin yeni plakalar üzerine aktarma onları--dan onların döl ayırmak için çok önemlidir.</li>
	</ol></li> <li>Analiz hayatta kalma <ol><li>sağkalım eğrisi analiz yazılımı kullanarak sonuçları analiz (malzeme listesi için bakınız).</li>
		Grehan-Breslow-Wilcoxon yöntemini kullanarak <li>Karşılaştır hayatta kalma eğrileri (veri buna göre erken hayatta kalma kez verilerden ilerleyen zamanlarda daha doğru olduğu varsayımıyla, ağırlığı) yanı sıra Logrank istatistiksel araçlar 45. 
		Not: Örneğin, içinde şekil 4B -C, mutant C. albicans ile tedavi solucanlar yaşama isogenic vahşi tipi denetimleri veya complementarystrains ile tedavi karşılaştırılır.</li>
	</ol>
	</li>
</ol>

<ol><li>Fire, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Potent+and+specific+genetic+interference+by+double-stranded+RNA+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans.</a> Nature. 391 (6669), 806-811 (1998).</li>
<li>Ellis, H. M., Horvitz, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetic+control+of+programmed+cell+death+in+the+nematode+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Genetic control of programmed cell death in the nematode C. elegans.</a> Cell. 44 (6), 817-829 (1986).</li>
<li>Hengartner, M. O., Ellis, R. E., Horvitz, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Caenorhabditis+elegans+gene+ced-9+protects+cells+from+programmed+cell+death%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Caenorhabditis elegans gene ced-9 protects cells from programmed cell death.</a> Nature. 356 (6369), 494-499 (1992).</li>
<li>Sulston, J. E., Horvitz, H. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Post-embryonic+cell+lineages+of+the+nematode%2C+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Dev+Biol%22%5BJournal%5D)">Post-embryonic cell lineages of the nematode, Caenorhabditis elegans.</a> Dev Biol. 56 (1), 110-156 (1977).</li>
<li>Chalfie, M., Tu, Y., Euskirchen, G., Ward, W. W., Prasher, D. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Green+fluorescent+protein+as+a+marker+for+gene+expression%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Green fluorescent protein as a marker for gene expression.</a> Science. 263 (5148), 802-805 (1994).</li>
<li>Kong, C., Yehye, W. A., Abd Rahman, N., Tan, M. W., Nathan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Discovery+of+potential+anti-infectives+against+Staphylococcus+aureus+using+a+Caenorhabditis+elegans+infection+model%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Complement+Altern+Med%22%5BJournal%5D)">Discovery of potential anti-infectives against Staphylococcus aureus using a Caenorhabditis elegans infection model.</a> BMC Complement Altern Med. 14, 4(2014).</li>
<li>Marsh, E. K., May, R. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Caenorhabditis+elegans%2C+a+model+organism+for+investigating+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Caenorhabditis elegans, a model organism for investigating immunity.</a> Appl Environ Microbiol. 78 (7), 2075-2081 (2012).</li>
<li>Kaletta, T., Hengartner, M. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Finding+function+in+novel+targets%3A+C.+elegans+as+a+model+organism%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Drug+Discov%22%5BJournal%5D)">Finding function in novel targets: C. elegans as a model organism.</a> Nat Rev Drug Discov. 5 (5), 387-398 (2006).</li>
<li>Sem, X., Rhen, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pathogenicity+of+Salmonella+enterica+in+Caenorhabditis+elegans+relies+on+disseminated+oxidative+stress+in+the+infected+host%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Pathogenicity of Salmonella enterica in Caenorhabditis elegans relies on disseminated oxidative stress in the infected host.</a> PLoS One. 7 (9), e45417(2012).</li>
<li>Irazoqui, J. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distinct+pathogenesis+and+host+responses+during+infection+of+C.+elegans+by+P.+aeruginosa+and+S.+aureus%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Pathog%22%5BJournal%5D)">Distinct pathogenesis and host responses during infection of C. elegans by P. aeruginosa and S. aureus.</a> PLoS Pathog. 6, e1000982(2010).</li>
<li>Kim, D. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+conserved+p38+MAP+kinase+pathway+in+Caenorhabditis+elegans+innate+immunity%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">A conserved p38 MAP kinase pathway in Caenorhabditis elegans innate immunity.</a> Science. 297 (5581), 623-626 (2002).</li>
<li>Bae, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Staphylococcus+aureus+virulence+genes+identified+by+bursa+aurealis+mutagenesis+and+nematode+killing%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Staphylococcus aureus virulence genes identified by bursa aurealis mutagenesis and nematode killing.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (33), 12312-12317 (2004).</li>
<li>Couillault, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((TLR-independent+control+of+innate+immunity+in+Caenorhabditis+elegans+by+the+TIR+domain+adaptor+protein+TIR-1%2C+an+ortholog+of+human+SARM%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Immunol%22%5BJournal%5D)">TLR-independent control of innate immunity in Caenorhabditis elegans by the TIR domain adaptor protein TIR-1, an ortholog of human SARM.</a> Nat Immunol. 5 (5), 488-494 (2004).</li>
<li>Aballay, A., Drenkard, E., Hilbun, L. R., Ausubel, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Caenorhabditis+elegans+innate+immune+response+triggered+by+Salmonella+enterica+requires+intact+LPS+and+is+mediated+by+a+MAPK+signaling+pathway%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Caenorhabditis elegans innate immune response triggered by Salmonella enterica requires intact LPS and is mediated by a MAPK signaling pathway.</a> Curr Biol. 13 (1), 47-52 (2003).</li>
<li>Kesika, P., Balamurugan, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Studies+on+Shigella+boydii+infection+in+Caenorhabditis+elegans+and+bioinformatics+analysis+of+immune+regulatory+protein+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Biochem+Biophys+Acta%22%5BJournal%5D)">Studies on Shigella boydii infection in Caenorhabditis elegans and bioinformatics analysis of immune regulatory protein interactions.</a> Biochem Biophys Acta. 1824 (12), 1449-1456 (2012).</li>
<li>Cinar, H. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Vibrio+cholerae+hemolysin+is+required+for+lethality%2C+developmental+delay%2C+and+intestinal+vacuolation+in+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Vibrio cholerae hemolysin is required for lethality, developmental delay, and intestinal vacuolation in Caenorhabditis elegans.</a> PLoS One. 5 (7), e11558(2010).</li>
<li>Jain, C., Pastor, K., Gonzalez, A. Y., Lorenz, M. C., Rao, R. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+role+of+Candida+albicans+AP-1+protein+against+host+derived+ROS+in+in+vivo+models+of+infection%5BTitle%5D)+AND+%22Virulence%22%5BJournal%5D)">The role of Candida albicans AP-1 protein against host derived ROS in in vivo models of infection.</a> Virulence. 4 (1), 67-76 (2013).</li>
<li>Jain, C., Yun, M., Politz, S. M., Rao, R. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+pathogenesis+assay+using+Saccharomyces+cerevisiae+and+Caenorhabditis+elegans+reveals+novel+roles+for+yeast+AP-1%2C+Yap1%2C+and+host+dual+oxidase+BLI-3+in+fungal+pathogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Eukaryot+Cell%22%5BJournal%5D)">A pathogenesis assay using Saccharomyces cerevisiae and Caenorhabditis elegans reveals novel roles for yeast AP-1, Yap1, and host dual oxidase BLI-3 in fungal pathogenesis.</a> Eukaryot Cell. 8 (8), 1218-1227 (2009).</li>
<li>Tampakakis, E., Okoli, I., Mylonakis, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+C.+elegans-based%2C+whole+animal%2C+in+vivo+screen+for+the+identification+of+antifungal+compounds%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Protoc%22%5BJournal%5D)">A C. elegans-based, whole animal, in vivo screen for the identification of antifungal compounds.</a> Nat. Protoc. 3 (12), 1925-1931 (2008).</li>
<li>Pukkila-Worley, R., Ausubel, F. M., Mylonakis, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Candida+albicans+infection+of+Caenorhabditis+elegans+induces+antifungal+immune+defenses%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Pathog%22%5BJournal%5D)">Candida albicans infection of Caenorhabditis elegans induces antifungal immune defenses.</a> PLoS Pathog. 7 (6), e1002074(2011).</li>
<li>Dieterich, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+reconstructed+human+epithelia+reveal+contributions+of+Candida+albicans+EFG1+and+CPH1+to+adhesion+and+invasion%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">In vitro reconstructed human epithelia reveal contributions of Candida albicans EFG1 and CPH1 to adhesion and invasion.</a> Microbiology. 148 (Pt 2), 497-506 (2002).</li>
<li>Chen, C. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Non-lethal+Candida+albicans+cph1%2Fcph1+efg1%2Fefg1+transcription+factor+mutant+establishing+restricted+zone+of+infection+in+a+mouse+model+of+systemic+infection%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Immunopathol+Pharmacol%22%5BJournal%5D)">Non-lethal Candida albicans cph1/cph1 efg1/efg1 transcription factor mutant establishing restricted zone of infection in a mouse model of systemic infection.</a> Int J Immunopathol Pharmacol. 19 (3), 561-565 (2006).</li>
<li>Ricicova, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Candida+albicans+biofilm+formation+in+a+new+in+vivo+rat+model%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">Candida albicans biofilm formation in a new in vivo rat model.</a> Microbiology. 156 (Pt 3), 909-919 (2010).</li>
<li>Fazly, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chemical+screening+identifies+filastatin%2C+a+small+molecule+inhibitor+of+Candida+albicans+adhesion%2C+morphogenesis%2C+and+pathogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Chemical screening identifies filastatin, a small molecule inhibitor of Candida albicans adhesion, morphogenesis, and pathogenesis.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (33), 13594-13599 (2013).</li>
<li>Lo, H. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nonfilamentous+C.+albicans+mutants+are+avirulent%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Nonfilamentous C. albicans mutants are avirulent.</a> Cell. 90 (5), 939-949 (1997).</li>
<li>Koh, A. Y., Kohler, J. R., Coggshall, K. T., Van Rooijen, N., Pier, G. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mucosal+damage+and+neutropenia+are+required+for+Candida+albicans+dissemination%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Pathog%22%5BJournal%5D)">Mucosal damage and neutropenia are required for Candida albicans dissemination.</a> PLoS Pathog. 4 (2), e35(2008).</li>
<li>McDonough, K. A., Rodriguez, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+myriad+roles+of+cyclic+AMP+in+microbial+pathogens%3A+from+signal+to+sword%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The myriad roles of cyclic AMP in microbial pathogens: from signal to sword.</a> Nat Rev Microbiol. 10 (1), 27-38 (2011).</li>
<li>Sonneborn, A., Tebarth, B., Ernst, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Control+of+white-opaque+phenotypic+switching+in+Candida+albicans+by+the+Efg1p+morphogenetic+regulator%5BTitle%5D)+AND+%22Infect+Immun%22%5BJournal%5D)">Control of white-opaque phenotypic switching in Candida albicans by the Efg1p morphogenetic regulator.</a> Infect Immun. 67 (9), 4655-4660 (1999).</li>
<li>Li, F., Palecek, S. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((EAP1%2C+a+Candida+albicans+gene+involved+in+binding+human+epithelial+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Eukaryot+Cell%22%5BJournal%5D)">EAP1, a Candida albicans gene involved in binding human epithelial cells.</a> Eukaryot Cell. 2 (6), 1266-1273 (2003).</li>
<li>Staib, P., Kretschmar, M., Nichterlein, T., Hof, H., Morschhauser, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transcriptional+regulators+Cph1p+and+Efg1p+mediate+activation+of+the+Candida+albicans+virulence+gene+SAP5+during+infection%5BTitle%5D)+AND+%22Infect+Immun%22%5BJournal%5D)">Transcriptional regulators Cph1p and Efg1p mediate activation of the Candida albicans virulence gene SAP5 during infection.</a> Infect Immun. 70 (2), 921-927 (2002).</li>
<li>Korting, H. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reduced+expression+of+the+hyphal-independent+Candida+albicans+proteinase+genes+SAP1+and+SAP3+in+the+efg1+mutant+is+associated+with+attenuated+virulence+during+infection+of+oral+epithelium%5BTitle%5D)+AND+%22J+.Med+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Reduced expression of the hyphal-independent Candida albicans proteinase genes SAP1 and SAP3 in the efg1 mutant is associated with attenuated virulence during infection of oral epithelium.</a> J .Med Microbiol. 52 (Pt 8), 623-632 (2003).</li>
<li>Chamilos, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Drosophila+melanogaster+as+a+facile+model+for+large-scale+studies+of+virulence+mechanisms+and+antifungal+drug+efficacy+in+Candida+species%5BTitle%5D)+AND+%22J+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Drosophila melanogaster as a facile model for large-scale studies of virulence mechanisms and antifungal drug efficacy in Candida species.</a> J Infect Dis. 193 (7), 1014-1022 (2006).</li>
<li>Brothers, K. M., Newman, Z. R., Wheeler, R. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live+imaging+of+disseminated+candidiasis+in+zebrafish+reveals+role+of+phagocyte+oxidase+in+limiting+filamentous+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Eukaryot+Cell%22%5BJournal%5D)">Live imaging of disseminated candidiasis in zebrafish reveals role of phagocyte oxidase in limiting filamentous growth.</a> Eukaryot Cell. 10 (7), 932-944 (2011).</li>
<li>Brennan, M., Thomas, D. Y., Whiteway, M., Kavanagh, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Correlation+between+virulence+of+Candida+albicans+mutants+in+mice+and+Galleria+mellonella+larvae%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Immunol+Med+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Correlation between virulence of Candida albicans mutants in mice and Galleria mellonella larvae.</a> FEMS Immunol Med Microbiol. 34 (2), 153-157 (2002).</li>
<li>Mallo, G. V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Inducible+antibacterial+defense+system+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Biol%22%5BJournal%5D)">Inducible antibacterial defense system in C. elegans.</a> Curr Biol. 12 (14), 1209-1214 (2002).</li>
<li>Chavez, V., Mohri-Shiomi, A., Maadani, A., Vega, L. A., Garsin, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oxidative+stress+enzymes+are+required+for+DAF-16-mediated+immunity+due+to+generation+of+reactive+oxygen+species+by+Caenorhabditis+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Oxidative stress enzymes are required for DAF-16-mediated immunity due to generation of reactive oxygen species by Caenorhabditis elegans.</a> Genetics. 176 (3), 1567-1577 (2007).</li>
<li>Moy, T. I., Mylonakis, E., Calderwood, S. B., Ausubel, F. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cytotoxicity+of+hydrogen+peroxide+produced+by+Enterococcus+faecium%5BTitle%5D)+AND+%22Infect+Immun%22%5BJournal%5D)">Cytotoxicity of hydrogen peroxide produced by Enterococcus faecium.</a> Infect Immun. 72 (8), 4512-4520 (2004).</li>
<li>Hoeven, R., McCallum, K. C., Cruz, M. R., Garsin, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ce-Duox1%2FBLI-3+generated+reactive+oxygen+species+trigger+protective+SKN-1+activity+via+p38+MAPK+signaling+during+infection+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Pathog%22%5BJournal%5D)">Ce-Duox1/BLI-3 generated reactive oxygen species trigger protective SKN-1 activity via p38 MAPK signaling during infection in C. elegans.</a> PLoS Pathog. 7 (12), e1002453(2011).</li>
<li>Meitzler, J. L., Ortiz de Montellano, P. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Caenorhabditis+elegans+and+human+dual+oxidase+1+%28DUOX1%29+%26%2334%3Bperoxidase%26%2334%3B+domains%3A+insights+into+heme+binding+and+catalytic+activity%5BTitle%5D)+AND+%22J+Biol+Chem%22%5BJournal%5D)">Caenorhabditis elegans and human dual oxidase 1 (DUOX1) &#34;peroxidase&#34; domains: insights into heme binding and catalytic activity.</a> J Biol Chem. 284 (28), 18634-18643 (2009).</li>
<li>Issi, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zinc+Cluster+Transcription+Factors+Alter+Virulence+in+Candida+albicans%5BTitle%5D)+AND+%22Genetics%22%5BJournal%5D)">Zinc Cluster Transcription Factors Alter Virulence in Candida albicans.</a> Genetics. 205 (2), 559-576 (2017).</li>
<li>Ford, C. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+evolution+of+drug+resistance+in+clinical+isolates+of+Candida+albicans%5BTitle%5D)+AND+%22Elife%22%5BJournal%5D)">The evolution of drug resistance in clinical isolates of Candida albicans.</a> Elife. 4, e00662(2015).</li>
<li>Naglik, J. R., Fidel, P. L., Odds, F. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Animal+models+of+mucosal+Candida+infection%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+microbiology+letters%22%5BJournal%5D)">Animal models of mucosal Candida infection.</a> FEMS microbiology letters. 283 (2), 129-139 (2008).</li>
<li>Garsin, D. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+simple+model+host+for+identifying+Gram-positive+virulence+factors%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences%22%5BJournal%5D)">A simple model host for identifying Gram-positive virulence factors.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 98 (19), 10892-10897 (2001).</li>
<li>Sifri, C. D., Begun, J., Ausubel, F. M., Calderwood, S. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Caenorhabditis+elegans+as+a+Model+Host+for+Staphylococcus+aureus+Pathogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Infection+and+immunity%22%5BJournal%5D)">Caenorhabditis elegans as a Model Host for Staphylococcus aureus Pathogenesis.</a> Infection and immunity. 71 (4), 2208-2217 (2003).</li>
<li>Jain, C., Yun, M., Politz, S. M., Rao, R. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+pathogenesis+assay+using+Saccharomyces+cerevisiae+and+Caenorhabditis+elegans+reveals+novel+roles+for+yeast+AP-1%2C+Yap1%2C+and+host+dual+oxidase+BLI-3+in+fungal+pathogenesis%5BTitle%5D)+AND+%22Eukaryotic+cell%22%5BJournal%5D)">A pathogenesis assay using Saccharomyces cerevisiae and Caenorhabditis elegans reveals novel roles for yeast AP-1, Yap1, and host dual oxidase BLI-3 in fungal pathogenesis.</a> Eukaryotic cell. 8 (8), 1218-1227 (2009).</li>
</ol>

Yazarlar ifşa gerek yok.

Biz anlatmıştık C. albicans maruz ömür boyu üzerinde C. elegans enfeksiyon ve hayatta kalma raporlaması için yöntemler başka bir patojen sınamak için değiştirilebilir. Başka bir bakteri veya mantar sıvı kültürleri yapılmış ve C. elegans için benzer bir şekilde beslenir. Ayrıca, seri enfeksiyonlar denetlesinler ilk larva bir patojen için açıklandığı gibi göstererek ve sonra hayvanlar yetişkinlik ulaştıktan sonra ayrı bir patojen içeren yeni bir plaka üzerine transfer tarafından.
<p class="jo...

C. elegans 50 yıldan fazla bir güçlü model organizma kullanılmıştır. 1960'larda, Güney Afrikalı biyolog Sydney Brenner hücre ve hayvan biyolojisi nematodlar içinde çeşitli yönlerini incelemek için uzun bir soy bilim adamlarının önünü nöronal gelişim, eğitim için C. elegans kullanılmasına öncülük etmiştir. Bu soy Nobel Ödülü sahipleri Craig Mello ve Andrew Fire onların RNAi iş1için Robert Horvitz ve John Sulston organ gelişimi ve Apoptozis2,3,4onların çalışmaları için ve Martin Chalfie içerir Yeşil flüoresan protein5üzerine çalışmaları için. Bu model organizma geleneksel olarak son 15 yılda biyoloji, moleküler ve gelişimsel çalışmaya yolculuklarında uygulanmış olsa, araştırmacılar Biyoloji Pseudomonas dahil olmak üzere çeşitli insan patojenlerin araştırmak için C. elegans kullanmaya başladı aeruginosa, Staphylococcus aureus, Salmonella entericave Serratia marcescens6,7,8,9,10. Bu çalışmalar birçok insan-patojen etkileşimde yer alan ilgili mekanizmaların korunmuş ortaya nematodlar de, ama bu bu model organizma11,12' ye özgü bazı bağışıklık mekanizmaları vardır. Doğada, C. elegans tehditlerine karşı alınan patojenler toprakta mevcut çeşitli karşılaşır ve bu gelişmeye ve onun intestinal Lümen sofistike bir doğuştan gelen bağışıklık sistemi korumak için güçlü bir seçici basınç sağlamıştır. Genler ve mekanizmaları intestinal Lümen korunması dahil çoğu aynı zamanda daha yüksek memeliler11,13' te var son derece korunmuş öğeler tarafından düzenledi. C. elegans bu nedenle Salmonella enterica14, Shigella boydii15veya kolera16gibi gastrointestinal patojenler çalışmaya büyük bir model temsil eder.
Burada biz C. elegans olağanüstü çok yönlü C. albicansgibi enfeksiyöz ajanlar çalışmaya modeli ana bilgisayar olarak vurgulayın. C. elegans modeli ana bilgisayar olarak daha az pahalı ve zaman alıcı kandidiyazis42eğitim için yaygın olarak kullanılan bir fare modeli daha virülans için yüksek aktarım tarama sağlar.
Bu çalışmada, biz bu modeli ve assosiated hayatta kalma tahlil güvenilir ana bilgisayar doğuştan gelen bağışıklık effectors enfeksiyonlar, virülans, sürücü patojen belirleyicileri karşı koymak önemli eğitim için kullanılabileceğini gösterir ve farmakolojik olabilir maddeler ve birleşimler patogenezinde müdahale. Yukarıda açıklanan deneyleri için birbirine benzemeyen, bu yöntem maruz kalma bir patojen hayvan sadece yetişkinlik yerine, yetişkinlik larva Sahne Alanı'ndan ölüm43,44ömrünü üzerinden eğitim için bir yol sağlar. Özet olarak, bizim C. elegans - sadece sürücü enfeksiyon ve bağışıklık genetik üsleri eğitim için aynı zamanda yeni bileşenleri, terapötik müdahale için tanımlamak için kullanılan çok yönlü ve güçlü bir araç C. albicans modelidir.

<table><tbody><tr><td>Agar (granül, bakteriyolojik sınıf)</td><td>Apex BioResearch Products</td><td>20-248</td><td></td></tr><tr><td>Alüminyum Tel (%95 Pt, 32 Gauge)</td><td>Genesee Scientific</td><td>59-1M32P</td><td></td></tr><tr><td>Axiovision Zeiss Ters Mikroskop</td><td>Axiovision Zeiss</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Bacto-Peptone</td><td>Fisher BioReagants</td><td>BP1420-500</td><td></td></tr><tr><td>C. elegans suşu Bli-3</td><td>Caenorhabditis Genetik Merkezi</td><td>Bli-3 (e767) CB767</td><td></td></tr><tr><td>Kalsiyum Klorür</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP51-250</td><td></td></tr><tr><td>Kolesterol, Sigma Sınıfı, minimum% 99</td> <td>Sigma</td><td>C8667-25G</td><td></td></tr><tr><td>Tek Kullanımlık Kültür Tüpleri (20 x 150 mm)</td> <td>FIsherBrand</td><td>14-961-33</td><td></td></tr><tr><td>Diseksiyon Mikroskobu (NI-150 Yüksek Yoğunluklu Aydınlatıcı)</td><td>Nikon Instrument Inc.</td><td></td><td></td></tr><tr><td>E. coli</td><td>Caenorhabditis Genetik Merkezi</td><td>OP50</td><td></td></tr><tr><td>GraphPad Prism (Hayatta Kalma Eğrisi Analiz Yazılımı)</td><td>GraphPad Yazılımı</td><td></td><td></td></tr><tr><td>LB Et Suyu (Miller's)</td><td>Apex BioResearch Products</td><td>11-120</td><td></td></tr><tr><td>Magnezyum Sülfat</td><td>Fisher Scientific</td><td>10034-99-8</td><td></td></tr><tr><td>Orta Boy Petri Kapları (35 X 10 mm)</td><td>Falcon</td><td></td><td></td>353001</tr><tr><td>Potasyum Fosfat monobazik</td><td>Sigma</td><td>P0662-500G</td><td></td></tr><tr><td>Sodyum Klorür</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP358-1</td><td></td></tr><tr><td>Sodyum Fosfat</td><td>Fisher Scientific</td><td>BP332-500</td><td></td></tr><tr><td>Wildtype C. albicans SC5314</td><td>ATCC</td><td>SC5314</td><td></td></tr><tr><td>Wildtype C. elegans</td><td>Caenorhabditis Genetik Merkezi</td><td>N2</td><td></td></tr></tbody></table>

nematot caenorhabditis elegans - konak-mikrop etkileşimleri çalışmaya çok yönlü vivo içinde manken

The Nematode Caenorhabditis Elegans - A Versatile In Vivo Model to Study Host-microbe Interactions

Biz Caenorhabditis elegans mikrobiyal etkileşim çalışmaya modeli ana bilgisayar olarak kullanarak bir yöntem göstermek. Mikroplar bağırsak hastalığı için birincil konumunu yaparak diyet ile tanıtılmaktadır. Nematot bağırsak yapısal ve işlevsel olarak memeli bağırsak taklit ve yapım o mükellef kolonizasyon mikroskobik incelenmesi için saydamdır. İşte patojenler hastalık ve ölüm neden olabilir göstermektedir. Değiştirilmiş virülans göstermek mikrobiyal mutantlar tespit edebiliyoruz. Biyotik streslere korunmuş onun doğuştan gelen yanıt C. elegans ana bilgisayar doğuştan gelen bağışıklık etkileşimleri yönleriyle araştırmak için mükemmel bir sistem yapar. Gösterdiğimiz ev sahipliği yapan çift oksidaz gen mutasyonları ile Reaktif oksijen türleri üretemez ve mikrobiyal hakaret direnmek mümkün değildir. Daha fazla çok yönlülük sunulan hayatta kalma testin inhibitörlerinin mikrobiyal büyüme etkileri çalışma için kullanılabilir göstererek göstermektedir. Bu tahlil yanı sıra roman antifungal ajanların gelişim için hedefler olarak mantar virülans faktörleri keşfetmek daha fazla ana bilgisayar-mikrop etkileşimleri ortaya çıkarmak için bir fırsat sağlamak için de kullanılabilir. Cryo-koru solucanlar ileride kullanmak için yetenek çalışmak için bir maliyet-etkin ve çekici bütün hayvan modeli yapar iken bu tahlil tasarımını de yüksek üretilen iş için bütün-genom ekranlar, ödünç vermek kendisi.

C. albicans ve C. elegans kullanarak bir Patogenez tahlil (şekil 1) daha önce bizim laboratuvar17,18 ve diğer labs19,20tarafından tarif edilmiştir. C. albicans hücreleri hızlı bir şekilde solucanlar tarafından yutulur ve yavaş hareket, neden intestinal Lümen içinde birikir gösterilen C. albicans virülans çal...

Burada, mikrobiyal etkileşim çalışmaya çok yönlü ana model olarak Caenorhabditis elegans Yuvarlak solucanlar mevcut.

Nematot Caenorhabditis Elegans - konak-mikrop etkileşimleri çalışmaya çok yönlü Vivo içinde manken

We demonstrate a method using Caenorhabditis elegans as a model host to study microbial interaction. Microbes are introduced via the diet making the ...

Bu testin genel amacı, model organizma C. Elegans'ta mantar enfeksiyonunun etkisini gözlemlemektir. Bu yöntem, patojen virülans faktörleri, konakçı bağışıklık efektörleri ve ilaç keşfi gibi bulaşıcı hastalık alanındaki temel mekanik soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Bu tekniğin temel avantajı, konak-patojen etkileşimlerini her iki açıdan da incelemek için deneysel olarak izlenebilir bir sistem olmasıdır.Hızlı, kolay ve uygun maliyetli bir sistemdir. Bu özel yöntem, mantar patojenleri hakkında bilgi sağlayabilse de, canlı bir konakçıdaki mikrobiyal etkileşimleri incelemek için bakteriler ve hatta çoklu organizmalar gibi diğer bulaşıcı ajanlara da uygulanabilir. Solucan penası yapmak için, 1,5 santimetrelik bir alüminyum tel parçası kesin ve ardından telin yaklaşık 0,5 santimetresini bir pastör pipetinin ucuna dikkatlice yerleştirin.Bir Bunsen brülörü veya alkol lambası kullanarak, pipet ucunun orijinal şeklinden ödün vermeden tel pipete güvenli bir şekilde yapışana kadar cam pipet ucunu alevin içinde yavaşça döndürerek eritin. Son olarak, forseps kullanarak, küçük bir halka oluşturmak için telin ucunu dikkatlice bükün. Büyük miktarlarda solucanları yeni plakalara hızlı bir şekilde aktarmak için, seçilen solucanları içeren bir NGM agar parçasını kesmek için bir spatula kullanın.Ardından kesilen parçayı çıkarın ve yüzü aşağı bakacak şekilde OP50 yamasının kenarına yeni bir plaka üzerine yerleştirin. Solucanları tek tek aktarmak için, solucan penasındaki teli kırmızı olana kadar alevlendirin, ardından alevden çıkarın ve birkaç saniye soğumaya bırakın. Kazma üzerindeki teli kullanarak, yeni plaka üzerinde büyütülen OP50 kültürünün yamasını kazma üzerindeki teli kaplayacak şekilde nazikçe kazıyın.Telin ucunu kaplayan viskoz kültür, solucanların çukurun ucuna yapışmasını sağlar. Bu nedenle, seçilen solucanları nazikçe almak için bir kaydırma hareketi kullanın. Seçilen solucanlar toplandıktan sonra, kültürü agar boyunca nazikçe kaydırarak onları yeni bir tabağa yerleştirin.Ardından, kazma üzerinde kalan kültürü çıkarmak için teli aleve yerleştirin. Yaklaşık 20 yetişkin hayvanı, 50 mikrolitre E.coli suşu OP50 ile oturtulmuş bir tabağa toplayarak veya parçalayarak yerleştirin. Yumurtaları toplamak için, bir ila iki gün sonra, plakayı 10 mililitre M9 tamponu ile doldurun.Daha sonra bir cam serolojik pipet kullanarak, OP50'ye yapışmış yetişkin hayvanları veya yumurtaları serbest bırakmak için agar plakasındaki içeriği döndürün ve hafifçe çalkalayın. Yumurtaları ve yetişkinleri içeren tüm sıvıyı toplayın. M9 ve OP50 çözeltisini 15 mililitrelik konik bir tüpe aktarın.Tüpü iki dakika boyunca 2.100 x g'da santrifüjleyin. Ardından, peleti rahatsız etmeden yaklaşık dokuz mililitre süpernatan aspire edin. Ardından, peleti yeniden süspanse etmek için iki mililitre steril su, bir mililitre çamaşır suyu ve bir mililitre 0.25 molar sodyum hidroksit kullanın.Yetişkin hayvanların yaklaşık% 70'i parçalanmış görünene kadar ters çevirerek nazikçe karıştırın. Tipik olarak yumurtalar, kabukları nedeniyle bu kısa ağartma işlemi sırasında bozulmadan kalır. Bu adımda çamaşır suyuna maruz kalma miktarının sınırlı olması çok önemlidir.Çamaşır suyuna uzun süre maruz kalmak yumurtaları tahrip eder. Yumurta hazırlığı başarısız olursa, ağartıcıya maruz kalma süresini sınırlayın veya çözeltiyi seyreltin. Konik tüpü 990 x g'da iki dakika santrifüjleyin.Peleti rahatsız etmeden süpernatanı aspire edin. Ardından peleti 10 mililitre M9 tamponunda yeniden süspanse edin. Tekrar döndürdükten ve peleti bozmadan süpernatanı çıkardıktan sonra, peleti yeniden süspanse etmek için 200 mikrolitre M9 tamponu kullanın.Üç ila beş mililitre YPD'yi steril bir test tüpüne dağıtın ve tek bir Candida albicans kolonisi ile aşılamak için steril bir halka kullanın. Tüpü yaklaşık 16 ila 18 saat boyunca 30 santigrat derecede döner bir tambur üzerine yerleştirin. Bir 1.5 mililitrelik mikrofüj tüpünü C.albicans içerecek şekilde ve diğerini OP50 içerecek şekilde etiketleyin, ardından her boş tüpün ağırlığını kaydedin.Gece boyunca C.albicans kültürünün 500 mikrolitresini C.Albicans etiketli tüpe aktarın. Ve gece boyunca OP50 kültüründen 1500 mikrolitre OP50 etiketli tüpe. Tüpleri 16, 100 x g'da 10 dakika santrifüjleyin, ardından peletleri rahatsız etmeden süpernatanı aspire edin.Her peleti yeniden süspanse etmek için 500 mikrolitre steril su kullanın. Daha sonra tüpleri beş dakika boyunca 16, 100 x g'de santrifüjleyin. Peletleri rahatsız etmeden süpernatanı aspire edin.Ardından mikrofüj tüplerinin son ağırlığını kaydedin. Mikrofüj tüplerinin başlangıç ağırlığını son ağırlıktan çıkararak her bir peletin ağırlığını belirleyin. Steril su kullanarak, C.albicans peletini mililitre başına 10 miligrama ve OP50 peletini mililitre başına 20 miligrama kadar yeniden süspanse edin.Daha sonra, mililitre Streptomisin çözeltisi başına 50 miligramlık 10 mikrolitreyi birleştirerek bir ana enfeksiyon karışımı yapın. 2.5 mikrolitre OP50 kültürü. 0.5 mikrolitre C.Albicans kültürü ve 7 mikrolitre steril su.Kontrol plakaları için, C.albicans kültürünün hacmini steril su ile değiştirerek bir ana karışım oluşturun. Daha sonra 20 mikrolitre enfeksiyon karışımını veya OP50 kontrol solüsyonunu NGM plakalarının ortasına tohumlamak için bir mikropipet kullanın. Bu videoda daha önce gösterildiği gibi yumurtaları hazırladıktan sonra, diseksiyon kapsamı altındaki yumurtaları sayın.Ve mikrolitre başına yaklaşık beş ila altı sağlıklı yumurta konsantrasyonu elde edilene kadar yumurta çözeltisini seyreltmek için M9'u kullanın. Bir pipet kullanarak, yaklaşık 30 yumurta içeren 20 mikrolitrelik bir numuneyi, bakteri kültürü ile plakanın kenarı arasındaki alanda hazırlanmış bir NGM plakasına dağıtın. Plakaları 48 saat boyunca 20 santigrat derecede inkübe edin.Daha sonra, bir diseksiyon mikroskobu altında, her plakadaki canlı ve ölü yetişkin solucanların sayısını sayın. Kafasına alüminyum bir tel ile vurulmasına veya plakaya vurulmasına yanıt vermiyorsa, hayvanın öldüğünü düşünmek. Ayrıca Dar ile solucan sayısını sayın ve diseksiyon mikroskobu sahnesinde plakaya hızlıca dokunarak bir hayvanın Dar'a sahip olup olmadığını onaylayın.Dar'ı olmayan hayvanlar hemen geriye doğru hareket ederken, Dar'lı hayvanlar yönlerini tersine çevirmek için ya tekrar tekrar dokunma turlarına ihtiyaç duyacak ya da bunu hiç yapmayacaklar. Her iki günde bir, solucanları toplayarak kalan yetişkin solucanları yeni bir enfeksiyon veya kontrol plakasına aktarın. Bu noktada, gerekirse, her gün canlı, ölü ve eksik solucanların sayısını izleyerek bir hayatta kalma testi yapın.Solucanları en az iki günde bir transfer etmek önemlidir. Bu, bu tahlilde puanlanan yetişkin solucanların döllerinde karıştırılmamasını sağlar. C. elegans, altı günlük bir süre boyunca C. albicans'a maruz bırakıldı ve enfeksiyon belirtileri, hastalığın ilerlemesi ve ölüm açısından gözlendi.Dar fenotipi, enfekte olmamış hayvanda görünmeyen çıkıntılı bir anal bölge tarafından belirtildiği gibi, hayatta kalma testinin dördüncü gününde en çok görülür. C.albicans tarafından enfekte olan solucanların vulva bölgesinde şişlik sergilediği de bilinmektedir. Her iki durumda da solucan bu aşamaya ulaştıktan sonra enfeksiyonu temizleyemez.Bağırsak lümeninde C. Albicans'ın kolonizasyonunu görselleştirmek için, solucanlar, kolonizasyon alanlarının kırmızı floresan olmasına neden olan RFP ile etiketlenmiş vahşi tip C.albicans ile beslendi. C.albicans, testin üçüncü gününde bağırsak lümenini kolonize eder. Burada gösterildiği gibi, enfekte solucanlar, enfekte olmamış kontrolde gözlenenden daha şiddetli bağırsak şişliği gösterdi.Bu deneyde, solucanların öldürücü bir C.Albicans efg1/efg1 cph1/cph1 çift mutantının neden olduğu enfeksiyondan kurtulma yetenekleri test edildi. Çift mutant ile enfekte olmuş solucanlar, kontrollerden istatistiksel olarak anlamlı derecede daha uzun yaşarlar. Bu iki genin C. albicans'ın C. Elegans'a karşı virülansı için gerekli olduğunu düşündürmektedir.Bir kez ustalaştıktan sonra, bu tekniğin her bir parçası, solucanın ömrünün her günü bir ila iki saat içinde yapılabilir. Bu prosedürü denerken, kişinin bulaşıcı ajanlar kullanıyor olabileceğini hatırlamak önemlidir. Bu nedenle uygun biyogüvenlik önlemleri uygulanmalıdır.Bu temel prosedürde, canlı bir konakçı bağlamında mikrobiyal etkileşimleri incelemek için ek mikrobiyal ajanların tanıtılması gibi küçük değişiklikler yapılabilir. Geliştirilmesinden sonra, bu teknik, bulaşıcı hastalıklar alanındaki araştırmacıların mikrobiyal virülansı, konakçı doğuştan gelen bağışıklık tepkilerinin mekanizmalarını ve yeni antimikrobiyal ajanların keşfini keşfetmelerinin yolunu açtı. Bu videoyu izledikten sonra, C.Elegans'ı nasıl koruyacağınızı ve manipüle edeceğinizi iyi anlamalı ve organizmayı moleküler düzeyde konakçı mikrop etkileşimlerini incelemek için kullanmalısınız.Mikrobiyal patojenler ve sodyum azid gibi kimyasal reaktiflerle çalışmanın tehlikeli olabileceğini ve KKD ve atık bertaraf yöntemleri gibi uygun güvenlik önlemlerinin alınması gerektiğini unutmayın.

the-nematode-caenorhabditis-elegans-versatile-vivo-model-to-study

Research

JoVE Journal

Genetics

Genetik

Temel<em&gt; Caenorhabditis elegans</em&gt; Yöntem: Senkronizasyon ve Gözlem

Yabani Caenorhabditis nematodları, genellikle bağırsak lümeninde veya bağırsağı enfekte eden birçok mikropla ilişkilidir. Bu protokol, dauer lütikülün direncinden yararlanarak bağırsağı kolonlaştıran kültürsüz mikropları zenginleştirmek için bir yöntemi detaylandırıyor.

Bağırsak Mikrobiyom Bakterileri İçin Zenginleştirmek için Yabani Caenorhabditis Nematodlarının Seçici Temizliği

Caenorhabditis elegans'ın mikrosporidian parazit Nematocida parisii tarafından enfeksiyonu, solucanların aynı patojene karşı oldukça dirençli yavrular üretmesini sağlar. Bu, kötü anlaşılmış bir epigenetik fenomen olan kalıtsal bağışıklığın bir örneğidir. Mevcut protokol, genetik olarak izlenebilir bir solucan modelinde kalıtsal bağışıklığın incelenmesini açıklamaktadır.

Caenorhabditis elegans Mikrosporidia Enfeksiyonu Modelinde Kalıtsal Bağışıklığın İncelenmesi

Hücre dışı bakteriler ve Orsay virüsü ve mikrosporidia (mantarlar) gibi hücre içi patojenler de dahil olmak üzere bağırsak mikropları genellikle vahşi Caenorhabditis nematodları ile ilişkilidir. Bu makalede, C. elegans nematodlarını kolonize eden ve/veya enfekte eden mikropların tespiti ve nicelleştirilmesi ve laboratuvarda kontrollü enfeksiyonlardan sonra patojen yükünün ölçülmesi için bir protokol sunulmaktadır.

Caenorhabditis elegans Bağırsaklarında Mikrobiyal Kolonizasyon ve Enfeksiyonu Görselleştirmek için RNA Floresan in situ Hibridizasyon (FISH)

Bu protokol, dış bakterileri uzaklaştırmak için soğuk felç ve yüzey ağartmayı takiben bireysel bakteriyel olarak kolonize Caenorhabditis elegans'ın 96 kuyucuklu bir bozulmasını tanımlar. Elde edilen süspansiyon, çok sayıda bireysel solucanda bakteri yükünün doğru, orta verimli bir şekilde ölçülmesini sağlamak için agar plakaları üzerine kaplanmıştır.

Caenorhabditis elegans-Bakteriyel Etkileşimlerde Heterojenliği Ölçmek için Tek Solucanlı Verileri Kullanma

Caenorhabditis elegans , biyolojideki ana model türlerden biridir, ancak neredeyse tüm araştırmalar doğal olarak ilişkili mikroplarının yokluğunda gerçekleştirilir. Burada açıklanan yöntemler, gelecekteki fonksiyonel C. elegans araştırmalarının temeli olarak ilişkili mikropların çeşitliliği hakkındaki anlayışımızı geliştirmeye yardımcı olacaktır.

Model Nematod Caenorhabditis elegans'ın Doğal Mikrobiyotasının İzolasyonu ve Karakterizasyonu

Kompost mikrokozmosları, Caenorhabditis elegans'ta mikrobiyom araştırmalarını kolaylaştırmak için doğada bulunan mikrobiyal çeşitliliği laboratuvara getirir. Burada, çevresel mikrobiyal çeşitlilik ile solucan bağırsak mikrobiyom bileşimi arasındaki ilişkileri keşfetmek için çevresel mikrobiyal çeşitliliği modüle etme yeteneğini gösteren deneylerle mikrokozmos deneyleri kurmak için protokoller verilmiştir.

Caenorhabditis elegans'ta Mikrobiyom Araştırmaları için Mikrobiyal Çeşitliliğe Sahip, Doğal Benzeri Ortamlar Olarak Kompost Mikrokozmoslar

Caenorhabditis elegans , konakçı-mikrobiyom etkileşimlerini yönlendiren moleküler belirleyicileri incelemek için güçlü bir modeldir. C. elegans fizyolojisinin temel yönleriyle birlikte bağırsak mikrobiyom kolonizasyonunun tek hayvan seviyelerinin profilini çıkaran yüksek verimli bir boru hattı sunuyoruz.

Caenorhabditis elegans Bağırsak Mikrobiyomunun Miktar Tayini ve Analizi için Akış Vermimetrisinin Uygulanması

Burada, geniş alan mikroskobu görüntülerinde tek tek solucanların otomatik segmentasyonu için geliştirdiğimiz bir derin öğrenme sistemi olan SegElegans'ın daha sonra ImageJ gibi görüntü analiz yazılımlarında kullanılmak üzere etkin bir şekilde kullanılmasına ilişkin talimatlar sunuyoruz. Sistemi hem çevrimiçi hem de çevrimdışı kullanmanın yollarını sunuyoruz.

SegElegans Kullanarak C. elegans Floresan Görüntülerinin Otomatik Analizi

Genetik Ustilago Maydis'in karalamak mantar işlemek için Biz sağlam bir gen değiştirme stratejisini açıklar. Bu protokol enfeksiyon fenotipleri araştırmak için silme mutantlarını üretmek açıklar. Bir floresan protein etiketi kodlayan bir sekansı ilave olarak, örneğin, arzu edilen herhangi bir şekilde, genleri değiştirme uzatılabilir.

Bitki patojeni olarak genetik manipülasyonu<em&gt; Ustilago maydis</em&gt; Mantar Biyoloji ve Bitki Mikrop Etkileşimleri Eğitim için

Keşfedin Caenorhabditis elegans ile fungal enfeksiyon etkilerini in vivo araştırma yöntemini. Bu sistem patojen virülansı, konak bağışıklık yanıtları ve ilaç keşfi çalışmaları için hızlı ve uygun maliyetli bir model sunar.

Nematot Caenorhabditis Elegans - konak-mikrop etkileşimleri çalışmaya çok yönlü Vivo içinde manken

Daha fazla video keşfet