Hibridizasyon uyarlaması yakalama kromatin ilişkili proteinlerin proteomik memeli hücreleri için

Bu yöntem, kodlamayan bölgelerdeki hastalıkla ilişkili dizi varyantlarının, protein bağlanmasını değiştirerek gen ekspresyonunu ve düzenlemeyi nasıl etkilediği gibi, genom düzenlemesi anlayışımızdaki temel soruları yanıtlamaya yardımcı olabilir ve bu proteinlerin tanımlanmasına yardımcı olabilir. Bu tekniğin temel avantajı, hücrelerin veya dokuların veya antikorların herhangi bir genetik manipülasyonunu gerektirmemesi ve o lokusta DNA ile etkileşime girebilecek DNA bağlayıcı proteinler hakkında önceden bilgi sahibi olmamasıdır. Bu prosedürü göstermek, laboratuvarımdan bir teknisyen olan Danu Perumalla olacak.

Metin protokolüne göre oligonükleotidler tasarlandıktan sonra, 6 mililitre RPMI 1640 ortamındaki bir T25 şişesinde 2 ila 5 kez 5. lenfoblastoid hücrelere veya diğer hücre hatlarına 2 ila 5 kez plaka koyun, %1 Pen Strep, 2 mil veya daha fazla L-glutamin ve %5 FBS ile desteklenmiştir. Hücreleri 37 santigrat derecede ve% 5 karbondioksitte inkübe edin. Hücre yoğunluğunu ölçmek için bir hemositometre veya otomatik bir hücre sayacı kullanın.