2 Şubat 2018
Burada, bitki büyüme davranış ve özellikle fenotipleri tekrarlanabilir bir şekilde eğitim için bir iletişim kuralı mevcut. Değişken ve aynı zaman istikrarlı ışık koşulları sağlamak için nasıl gösterir. Uygun analizleri yeterli örnek numaraları ve geçerli istatistiksel değerlendirme bağlıdır.
Bu görsel ve moleküler fenotip analizinin genel amacı, farklı ışık koşulları altında ve çeşitli genotiplerde bitki büyümesini karşılaştırmaktır. Bu yöntem, bitki araştırma alanındaki farklı ışık koşullarına alışma gibi temel soruların yanıtlanmasına yardımcı olabilir. Bu tekniğin temel avantajı, tekrarlanabilir ve ölçülebilir sonuçlar vermesidir.
Prosedürü göstermek, laboratuvarımda bir teknisyen olan Franka Seiler olacak. Başlamak için, uygun bir numune büyüklüğü hesaplayın ve gerekli sayıda altı x yedi santimetre topraklı saksıları hazırlayın ve her birine tek bir tohum ekin. Ardından, tohumları iki gün boyunca dört santigrat derecede vernalize edin.
Bir iklim odasının bağıl hava nemini 65 saatlik gündüz, sekiz saatlik gece döngüsü için sıcaklığı 22 ve 16 santigrat dereceye ayarlayın. Ardından, tüm seviyelerdeki ışığı santimetre kare başına 200 mikromol yoğunluğa ve saniyeye ayarlayın. Spektral çıkışı sürekli olarak izlemek için dahili spektrometreyi kullanın.
Bitkileri iklim odasına yerleştirin ve iyi gelişmiş kotalininler ortaya çıkana kadar şeffaf bir üst kısımla örtün. Bitkileri görsel olarak inceleyin ve büyüme verilerini düzenli aralıklarla fotoğrafik olarak kaydedin. Tutarlı görüntüler elde etmek için her resim için bir kamera tripodu ve bir ölçek çubuğu kullanın.
İlk olarak, bir bitkiyi birkaç dakika karanlıkta bırakın. Ardından, tesisten uygun bir mesafede nabız modülasyonlu bir florometre ve bir kamera kurun. Rozetin tamamı canlı pencerede görünmelidir.
Yazılımı başlatın ve birim seç penceresinde görünen mini seçeneğini seçin. Ardından, Tamam'ı tıklayın. Ardından, açılır pencerede maviyi seçin ve Tamam'ı tıklayın.
Canlı video seçeneğini seçin ve görüntüyü odaklamak için objektif lensin ayar halkasını çevirin ve bitkinin belirli bir bölgesini seçin. Canlı pencereden çıkmak için sağ üst köşedeki çıkış kutusuna tıklayın. Varsayılan ayarlarla ilgilenilen bir alan veya AOI tanımlayın.
AOI'de bulunan piksellerin ortalama FT değerini içeren bir daire ve kırmızı bir kutu, ekranın ortasında otomatik olarak görünecektir. Kendi AOI'nizi tanımlamadan önce bu AOI'yi silmeniz gerekir. Ardından sağdaki sekmede varsayılan ayarları kabul edin.
Ardından, AOI sekmesinde ekle'ye tıklayın ve daireyi yaprak alanının içine yerleştirin. Bitki başına birkaç yaprak seçerek bu işlemi yaprak başına beş kez tekrarlayın. FV/FM görüntüsünü seçmek için maksimum PS 2 kuantum verimi ile ilgili kutuyu işaretleyin.
F0, FM düğmesine basarak floresan sıkma analizi yoluyla fotosentetik parametreleri ölçmek için doygun bir ışık flaşı uygulayın. Sonuçları rapor sekmesinde bulun. İlgili tüm kutuları işaretleyin ve bunları uygun analiz yazılımına aktarın.
Bu çalışmada, bitki büyümesi ve vena türlerinin gözlem ve analizinde stabil ışık miktarı ve kalitesinin sağlanmasını sağlamak için LED ışıklar kullanılmıştır. Bitkilerden elde edilen veriler dikişten 12, 21 ve 28 gün sonra toplandı. Bu şekilde 5 ve 5 bitkinin PS 2 kuantum verim değerlerini etkileyen ortalama değerler gösterilmiştir.
Simüle edilmiş güneş ışığı, zenginleştirilmiş mavi veya kırmızı ışık altında yetiştirilen bitkilerden elde edilen veriler istatistiksel olarak değerlendirildi. Bu şekil, 5 bitkinin ve günde 5 bitkinin ortalama PS 2 kuantum verim değerlerini göstermektedir. Mavi ve kırmızı ışık altında yetiştirilen bitkiler için ortalama değerler, simüle edilmiş güneş ışığı altında yetiştirilenlerden önemli ölçüde daha yüksekti.
Bir kez kurulduktan sonra, LED ışıklar, floresan lambalara kıyasla çok fazla enerji tasarrufu sağlayarak kararlı veya değişken ışık koşulları sağlayabilir. Deney sırasında bitkileri günlük olarak almak önemlidir. Geliştirildikten sonra, bu teknik, bitki araştırmaları alanındaki araştırmacıların, tanımlanmış dalga boyuna sahip farklı ışık koşulları altında büyüme davranışını keşfetmelerinin yolunu açar.
Bu videoyu izledikten sonra, bitkilerin nasıl yetiştirileceğini iyi anlamalı ve bitkileri görsel ve moleküler vena türlerine göre nicel bir şekilde analiz etmelisiniz.
Bu makale, farklı ışık koşulları altında bitki büyüme davranışlarını incelemek için bir protokol sunmaktadır. Fenotiplerin analizinde tekrarlanabilirliğin ve istatistiksel değerlendirmenin önemini vurgulamaktadır.
Kontrollü ışık koşulları altında Arabidopsis thaliana büyümesinin kantitatif analizi, bitki biyolojisi ve tarımsal biyoteknoloji süreçleri için güçlü hipotez testlerine olanak tanır. Stabil, programlanabilir LED ortamları ve standartlaştırılmış fenotipik ölçümler, erken keşif ve özellik doğrulamada öngörüsel güveni destekler. Bu yaklaşım, deneysel belirsizliği azaltır ve translasyonel araştırmalar ile platform geliştirme için tekrarlanabilirliği artırır.
Bu protokol; erken hipotez testlerini, assay geliştirmeyi ve translasyonel özellik değerlendirmesini destekleyerek keşiften doğrulamaya uzanan sürekliliğe entegre olur.