Name: Regioselective O- glikozilasyon nükleozitler üzerinden geçici 2, 3-Diol koruması tarafından Boronic Ester Disaccharide nükleozitler sentezi için (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2018-07-26T13:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 46 s
Description: Keşfedin boronik ester geçici koruma yöntemiyle korunmamış nükleozitlerin regioselektif O-glikozilasyonunu. Bu kimyasal sentez tekniği, disakkarit nükleozit üretimini hızlandırarak ilaç keşfi araştırmalarına katkı sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu araştırma grants-in-aid Milli Eğitim Bakanlığı, kültür, spor, bilim ve teknoloji (MEXT) Japonya dan tarafından finanse edildi (NOS 15K 00408, 24659011, 24640156, 245900425 ve 22390005 Shin Aoki için), Tokyo biyokimyasal araştırma hibe tarafından Vakfı, Tokyo, Japonya ve Stratejik Araştırma alanları için TUS (Tokyo Üniversitesi bilim) Fonu tarafından. Noriko Sawabe (Eczacılık Bilimleri Fakültesi, Tokyo Üniversitesi bilim) NMR spectra, Fukiko Hasegawa (Eczacılık Bilimleri Fakültesi, Tokyo Üniversitesi bilim) ölçümleri için kütle ölçüleri için teşekkür etmek istiyorum Spectra ve elemental analizler ölçümleri için Tomoko Matsuo (Fen ve teknoloji, Tokyo Üniversitesi Bilim Araştırma Enstitüsü).

Not: Bir önceki kağıt51de tüm deneysel veriler [NMR, kızılötesi spectroscopies (IR), kitle spectroscopies (MS), optik rotasyonlar ve elemental analizler veri] sentezlenen bileşiklerin bildirildi.
1. O- glikozilasyon reaksiyonlar için yordamı
<ol><li>Bileşik α/β-12 (Tablo 1'deki giriş 12) sentezi Not: Tablo 1 1-13 girişlerinde benzer bir yordam kullanılarak yapılmıştır.<ol>
<li>
2', 3'-diol ribonucleoside40 geçici koruma
		<ol>
<li>Bir 10 mL armut biçimli şişesi (1 cep şişesi) dağıtılması mannosyl donör α -9 (28,4 mg, 0.0486 mmol)52, uridine 10 (7,9 mg, 0.0324 mmol) ve 4-(trifluoromethyl) phenylboronic asit 11 c (9,3 mg, 0.0490 mmol) içinde susuz pyridine (0,40 mL). Not: 1.1.3.1 adımda tepki karışım kabı 2 (bir 10 mL iki boyunlu yuvarlak alt şişe ile ona bağlı bir septum) transfer edileceği, armut biçimli bir 10 mL şişe kullanımı önerilir moleküler içeren toz Sita.</li>
			<li>(1.1.1.1. adımda elde.) tepki karışımı susuz pyridine (0.40 mL, 3 x) ve susuz 1,4-dioxane (0.40 mL, 3 x), oda sıcaklığında yaklaşık 40 ° C ile birlikte herhangi bir su kaldırmak için buharlaşır.</li>
			<li>(1.1.1.2. adımda elde.) Kalıntı susuz 1,4-dioxane (0,32 mL) içinde dağıtılması ve boronic ester (geçici koruma) oluşturmak 1 h için onun reflü sıcaklığında tepki karışımı ilave edin.</li>
			<li>Bir vakum pompası tarafından takip bir rotary evaporatör kullanarak solvent kaldırın.</li>
		</ol>
</li>
		<li>
Moleküler elekler aktivasyonu
		<ol>
<li>Bir 10 mL iki boyunlu yuvarlak alt şişeye (şişeye 2) bağlı bir septum ile 4 ekleyin Å moleküler elekler toz (64 mg). Not: Uygun moleküler elekler (Å Asetonitril için) için 3 ve 4 Å 1,4-dioxane, diklorometan ve propionitrile Glikozilasyon için kullanılan çözücü göre seçilmelidir.</li>
			<li>Moleküler elekler atmosferik basınç altında bir mikrodalga ısı ve onları bir vakum pompası (3 x) tarafından tahliye düşük basınç altında serin ve daha sonra düşük basınç altında ısı silahla hava argon gazı ile birkaç kez değiştirirken kuru onları.</li>
		</ol>
</li>
		<li>
Glikozilasyon
		<ol>
<li>Adım 1.1.1.4 kalıntısı geçiyoruz. şişeye propionitrile (0,64 mL) 1 veya diğer maddeleri ve bu çözüm şişeye 2 transfer. Not: Asetonitril, 1,4-dioxane, diklorometan ve propionitrile kullanılan yazılar 1-7 ve 9, giriş 10, giriş 11 ve girişleri 8, 12 ve 13, anılan sıraya göre.</li>
			<li>Şişeye 2 0,5 h-40 ° C'ye soğutma tarafından takip için oda sıcaklığında tepki karışımı ilave edin Not: Sıcaklık (diklorometan ve propionitrile için-40 ° C), oda sıcaklığında için 1,4-dioxane ve -20 ° C için Asetonitril Glikozilasyon için kullanılan çözücü göre değiştirildi.</li>
			<li>Gümüş triflate (49,9 mg, 0.194 mmol) ve p -toluenesulfenyl klorür (12,8 µL, 0.0968 mmol) 1.1.3.2. adımda kullanılan aynı sıcaklıkta tepki karışıma ekleyin.</li>
			<li>1,5 saat için aynı sıcaklıkta tepki karışımı ilave edin.</li>
			<li>Reaksiyon hekzan/etil asetat ile ince katmanlı Kromatografi (TLC) tarafından kontrol [3/glikosil bağış kontrol etmek için 1 (v/v)] [saklama faktörü (Rf) (donör α -9) 0.63 =] ve kloroform/metanol ile [10/1 (v/v))] glikosil kontrol etmek alıcısı ve ürünleri [Rf (alıcısı 10) 0.03, Rf (istenen ürün) = 0,50 =].</li>
			<li>Reaksiyon karışımı ile doymuş sulu sodyum bikarbonat (1.0 mL) gidermek, kloroform (2.0 mL) ile sulandırmak, CELITEile çözünmez malzemeyi kaldır ve dikkatle CELITE kloroform (20 mL) ile yıkayın.</li>
			<li>Filtrate (organik katman) doymuş sulu sodyum bikarbonat (20 mL, 3 x) ve 100 mL HCI'yi huni kullanarak tuzlu su (20 mL) ile yıkayın.</li>
			<li>Sodyum sülfat ile elde edilen organik katman kuru, çözünmez malzemeleri filtre ve rotary evaporatör kullanarak filtrate konsantre ol.</li>
			<li>Kabaca sütun Kromatografi tarafından kalan kalıntıları arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 50/1 (v/v)] ham 5' göze-O-(6"-O- asetil-2", 3", 4"- tri-Ey- Benzil-α/β-ᴅ-mannopyranosyl) Üridin içeren bir yan (15,2 mg, renksiz şurubu) küçük miktarı.</li>
		</ol>
</li>
		<li>
Asetilasyon
		<ol>
<li>5 mL şişede susuz pyridine (0.20 mL) 1.1.3.9 adımda hazırlanan elde edilen ham bileşik geçiyoruz.</li>
			<li>N,NEkle-dimetil-4-aminopyridine (katalitik tutar) ve asetik anhidrit (20.4 µL, 0.0216 mmol: 10 eşdeğerleri üzerinde ham bileşik dayalı) 0 ° C'de çözüm için</li>
			<li>0,5 h bir oda sıcaklığına ısınmaya tarafından takip için aynı sıcaklıkta tepki karışımı ilave edin.</li>
			<li>Gecede karıştırma sonra TLC ile tepki kloroform/metanol ile kontrol [30/1 (v/v)] [Rf (α/β-12) 0.45 =].</li>
			<li>Kloroform (20 mL) ile reaksiyon karışımı sulandırmak.</li>
			<li>Organik katman 1 M hidroklorik asit (20 mL, 3 x), doymuş sulu sodyum bikarbonat (20 mL, 3 x) ve 100 mL HCI'yi huni kullanarak tuzlu su (20 mL) ile yıkayın.</li>
			<li>Sodyum sülfat ile elde edilen organik katman kuru, çözünmez malzemeleri filtre ve rotary evaporatör kullanarak filtrate konsantre ol.</li>
			<li>Sütun Kromatografi tarafından kalan kalıntıları arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 90/1 (v/v)] α/β vermek-12 (15,8 mg, %61, α/β = 1.6/1, renksiz amorf katı).</li>
		</ol>
</li>
	</ol></li>
	<li>Bileşikler β-22 β-30 (Tablo 2) ve β-33 (Tablo 3) sentezi Not: Bir sentez β-22-β-30ve β-33benzer bir yordam kullanılarak gerçekleştirilmiştir.<ol><li>Bileşik β-22 (Tablo 2'deki giriş 1) sentezi
		<ol>
<li>
2', 3'-diol ribonucleoside, geçici koruma
			<ol>
<li>Bir 10 mL armut biçimli şişesi (3 cep şişesi) dağıtılması adenozin 13 (20.4 mg, 0.0763 mmol), galactosyl donör β -21 (80,4 mg, 0,114 mmol)53ve 4-(trifluoromethyl) phenylboronic asit 11 c (21,7 mg, 0,114 mmol) içinde susuz pyridine (0,76 mL). Not: tepki karışımı şişesi 4 (bir 10 mL iki boyunlu yuvarlak alt şişe ile ona bağlı bir septum) transfer edileceği Çünkü armut biçimli bir 10 mL şişe kullanılması tavsiye edilir moleküler içeren Sita toz adımda 1.2.1.3.1.</li>
				<li>(1.2.1.1.1 adımda elde.) tepki karışımı susuz pyridine (0,76 mL, 3 x) ve susuz 1,4-dioxane (0,76 mL, 3 x), oda sıcaklığında yaklaşık 40 ° C ile birlikte herhangi bir su kaldırmak için buharlaşır.</li>
				<li>(1.2.1.1.2 adımda elde.) Kalıntı susuz 1,4-dioxane (0,76 mL) içinde dağıtılması ve boronic ester (geçici koruma) oluşturmak 1 h için onun reflü sıcaklığında tepki karışımı ilave edin.</li>
				<li>Bir vakum pompası tarafından takip bir rotary evaporatör kullanarak solvent kaldırın.</li>
			</ol>
</li>
			<li>
Moleküler elekler aktivasyonu
			<ol>
<li>Bir 10 mL iki boyunlu yuvarlak alt şişeye (şişesi 4) bağlı bir septum ile 4 ekleyin Å moleküler elekler toz (150 mg).</li>
				<li>Moleküler elekler atmosferik basınç altında bir mikrodalga ısı ve onları bir vakum pompası (3 x) tarafından tahliye düşük basınç altında serin ve daha sonra düşük basınç altında ısı silahla hava argon gazı ile birkaç kez değiştirirken kuru onları.</li>
			</ol>
</li>
			<li>
Glikozilasyon
			<ol>
<li>Adım 1.2.1.1.4 kalıntısı geçiyoruz. şişeye propionitrile (1,50 mL) 3 içinde ve bu çözüm şişesi 4 transfer.</li>
				<li>0,5 h,-40 ° C'ye soğutma tarafından takip için oda sıcaklığında tepki karışımı ilave edin</li>
				<li>Aynı sıcaklıkta tepki karışıma gümüş triflate (117,6 mg, 0,458 mmol) ve p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol) 1.2.1.3.2 adımda belirtildiği gibi ekleyin.</li>
				<li>1,5 saat için aynı sıcaklıkta tepki karışımı heyecan.</li>
				<li>TLC ile tepki hekzan/etil asetat ile kontrol [2/glikosil bağış kontrol etmek için 1 (v/v)] [Rf (donör β -21) 0.62 =] ve kloroform/metanol ile [10/kontrol glikosil alıcısı ve ürün [Rf (alıcısı 13-1 (v/v)] ) 0,05, Rf (istenen ürün) = 0,30 =].</li>
				<li>Reaksiyon karışımı ile doymuş sulu sodyum bikarbonat (2.0 mL) gidermek, kloroform (3,0 mL) ile sulandırmak, CELITEaracılığıyla çözünmez malzemeyi kaldır ve dikkatle kloroform (30 mL) ile CELITE yıkayın.</li>
				<li>Filtrate (organik katman) doymuş sulu sodyum bikarbonat (30 mL, 3 x) ve 100 mL HCI'yi huni kullanarak tuzlu su (30 mL) ile yıkayın.</li>
				<li>Sodyum sülfat ile elde edilen organik katman kuru, çözünmez malzemeleri filtre ve rotary evaporatör kullanarak filtrate konsantre ol.</li>
				<li>Sütun Kromatografi tarafından kalan kalıntıları arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 30/1 (v/v)] β -22 (27,4 mg, %42, renksiz katı) göze.</li>
			</ol>
</li>
		</ol></li>
		<li>Bileşik β-23 (Tablo 2'deki giriş 2) sentezi
		<ol>
<li>Kuralları kullanarak 14 (28,4 mg, 0.0765 mmol)54, β -21 (80,5 mg, 0.115 mmol), 11 c (21,8 mg, 0.115 mmol) tepki, p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol), gümüş triflate (117.8 mg, 0,458 mmol), susuz 1,4-dioxane (0,76 mL), susuz propionitrile (1,50 mL) ve 4 Å moleküler elekler (150 mg). Sütun Kromatografi tarafından elde edilen kalıntı arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 50/1 (v/v)] β-23 (21,9 mg, %30, renksiz katı) vermek. TLC: Rf (β -23) 0,37 = [kloroform/metanol 10/1 (v/v) =].</li>
		</ol></li>
		<li>Bileşik β-24 (Tablo 2'deki giriş 3) sentezi
		<ol>
<li>Kuralları kullanarak 15 (21.6 mg, 0.0763 mmol), β -21 (80,5 mg, 0.115 mmol), 11 c (21,8 mg, 0.115 mmol), p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol), gümüş triflate (117,6 mg, 0,458 mmol), susuz 1,4-dioxane () tepki 0,76 mL), susuz propionitrile (1,50 mL) ve 4 Å moleküler elekler (150 mg). Sütun Kromatografi tarafından elde edilen kalıntı arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 8/1 (v/v)] β -24 (8.1 mg, %12, renksiz katı) vermek. TLC: Rf (β -24) 0,20 = [kloroform/metanol 10/1 (v/v) =].</li>
		</ol></li>
		<li>Bileşik β-25 (Tablo 2 giriş 4) sentezi
		<ol>
<li>Kuralları kullanarak 16 (27.0 mg, 0.0764 mmol)55, β -21 (80,5 mg, 0.115 mmol), 11 c (21,8 mg, 0.115 mmol) tepki, p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol), gümüş triflate (117.8 mg, 0,458 mmol), susuz 1,4-dioxane (0,76 mL), susuz propionitrile (1,50 mL) ve 4 Å moleküler elekler (150 mg). Sütun Kromatografi tarafından elde edilen kalıntı arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 20/1 (v/v)] β -25 (31,4 mg, %44, renksiz katı) vermek. TLC: Rf (β -25) 0,27 = [kloroform/metanol 10/1 (v/v) =].</li>
		</ol></li>
		<li>Bileşik β-26 (Tablo 2'deki giriş 5) sentezi
		<ol>
<li>Kuralları kullanarak 10 (18,6 mg, 0.0762 mmol), β -21 (80,4 mg, 0,114 mmol), 11 c (21,7 mg, 0,114 mmol), p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol), gümüş triflate (117,6 mg, 0,458 mmol), susuz 1,4-dioxane () tepki 0,76 mL), susuz propionitrile (1,50 mL) ve 4 Å moleküler elekler (150 mg). Sütun Kromatografi tarafından elde edilen kalıntı arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 40/1 (v/v)] β -26 (26,1 mg, %42, renksiz katı) vermek. TLC: Rf (β -26) 0.45 = [kloroform/metanol 10/1 (v/v) =].</li>
		</ol></li>
		<li>Bileşik β-27 (Tablo 2'deki giriş 6) sentezi
		<ol>
<li>Kuralları kullanarak 17 (19,7 mg, 0.0763 mmol), β -21 (80,5 mg, 0.115 mmol), 11 c (21,8 mg, 0.115 mmol), p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol), gümüş triflate (117,6 mg, 0,458 mmol), susuz 1,4-dioxane () tepki 0,76 mL), susuz propionitrile (1,50 mL) ve 4 Å moleküler elekler (150 mg). Sütun Kromatografi tarafından elde edilen kalıntı arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 40/1 (v/v)] β -27 (33,8 mg, %53, renksiz katı) vermek. TLC: Rf (β -27) 0,50 = [kloroform/metanol 10/1 (v/v) =].</li>
		</ol></li>
		<li>Bileşik β-28 (Tablo 2'deki giriş 7) sentezi
		<ol>
<li>Kuralları kullanarak 18 (20,0 mg, 0.0763 mmol), β -21 (80,4 mg, 0,114 mmol), 11 c (21,7 mg, 0,114 mmol), p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol), gümüş triflate (117,6 mg, 0,458 mmol), susuz 1,4-dioxane () tepki 0,76 mL), susuz propionitrile (1,50 mL) ve 4 Å moleküler elekler (150 mg). Sütun Kromatografi tarafından elde edilen kalıntı arındırmak [silika jel, kloroform sonra etil asetat/kloroform 1/1 (v/v) =] β-28 (38.8 mg, %61, renksiz katı) vermek. TLC: Rf (β -28) 0,33 = [kloroform/metanol 10/1 (v/v) =].</li>
		</ol></li>
		<li>Bileşik β-29 (Tablo 2'deki giriş 8) sentezi
		<ol>
<li>Kuralları kullanarak 19 (18,5 mg, 0.0761 mmol), β -21 (80,4 mg, 0,114 mmol), 11 c (21,7 mg, 0,114 mmol), p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol), gümüş triflate (117,6 mg, 0,458 mmol), susuz 1,4-dioxane () tepki 0,76 mL), susuz propionitrile (1,50 mL) ve 4 Å moleküler elekler (150 mg). Sütun Kromatografi tarafından elde edilen kalıntı arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 10/1 (v/v)] β -29 (34.1 mg, %55, renksiz katı) vermek. TLC: Rf (β -29) 0.25 = [kloroform/metanol 10/1 (v/v) =].</li>
		</ol></li>
		<li>Bileşik β-30 (Tablo 2 giriş 9) sentezi
		<ol>
<li>Kuralları kullanarak 20 (26,6 mg, 0.0766 mmol)56, β -21 (80.6 mg, 0.115 mmol), 11 c (21,8 mg, 0.115 mmol) tepki, p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol), gümüş triflate (117.8 mg, 0,458 mmol), susuz 1,4-dioxane (0,76 mL), susuz propionitrile (1,50 mL) ve 4 Å moleküler elekler (150 mg). Sütun Kromatografi tarafından elde edilen kalıntı arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 50/1 (v/v)] β -30 (28.0 mg, %40, renksiz katı) vermek. TLC: Rf (β -30) 0.48 = [kloroform/metanol 10/1 (v/v) =].</li>
		</ol></li>
		<li>Bileşik β-33 (giriş 1 Tablo 3'de) sentezi
		<ol>
<li>Kuralları kullanarak 18 (20,0 mg, 0.0762 mmol), β -31 (80,4 mg, 0,114 mmol)57, 11 c (21,7 mg, 0,114 mmol) tepki, p- toluenesulfenyl klorür (30.3 µL, 0,229 mmol), gümüş triflate (117,6 mg, 0,458 mmol), susuz 1,4-dioxane (0,76 mL), susuz propionitrile (1,50 mL) ve 4 Å moleküler elekler (150 mg). Sütun Kromatografi tarafından elde edilen kalıntı arındırmak [silika jel, kloroform/metanol = 1/0 - 30/1 (v/v)] β -33 (34,5 mg, %54, renksiz katı) vermek. TLC: Rf (β -33) 0,33 = [kloroform/metanol 10/1 (v/v) =].</li>
		</ol></li>
	</ol></li>
</ol>2. deprotection β-28 (Şekil 2)
<ol><li>5 mL şişede β -28 (25,2 mg, 0.0300 mmol) ve metanol (2.0 mL)5810 M methylamine ekleyin.</li>
	<li>0 ° c 2 h oda sıcaklığına ısınmaya tarafından takip için tepki karışımı ilave edin.</li>
	<li>13 h için karışımı karıştırma sonra TLC ile tepki kloroform/metanol ile kontrol [10/1 (v/v)] [Rf (β -35) 0,20 =].</li>
	<li>Rotary evaporatör kullanarak tepki karışımı konsantre.</li>
	<li>Su (15 mL) elde edilen kalıntı dağıtılması ve diklorometan (15 mL, 3 x) katmanı sulu yıkama 50 mL HCI'yi huni kullanarak.</li>
	<li>Rotary evaporatör kullanarak sulu katman konsantre.</li>
	<li>Partiye Hazırlık yüksek performanslı sıvı kromatografi tarafından (HPLC) kalan kalıntıları arındırmak [sütun: (octadecylsilane) sütun ODS (20Φ x 250 mm), eluent: su (%0,1 [v/v] trifluoroacetic asit içerir), akış hızı: 8.0 mL/dk, algılama: 266 nm, Sıcaklık: 25 ° C, saklama süresi: 20 dk] β -35 (7,9 mg, %62, renksiz amorf katı)59vermek.</li>
</ol>3. NMR çalışmaları çevrimsel Boronic Ester (Şekil 3 ve 4)
<ol><li>
Hazırlık ve 36 ölçümü
	<ol>
<li>10 mL şişeye, armut biçimli Üridin 10 (34,3 mg, 0,140 mmol) ve 4-(trifluoromethyl) çözmek phenylboronic asit 11 c (40.0 mg, 0.211 mmol) içinde susuz pyridine (1.00 mL).</li>
		<li>Reaksiyon karışımı susuz pyridine (1.00 mL, 3 x) ve susuz 1,4-dioxane (1.00 mL, 3 x), oda sıcaklığında yaklaşık 40 ° C ile birlikte herhangi bir su kaldırmak için buharlaşır.</li>
		<li>Kalıntı susuz 1,4-dioxane (1,40 mL) içinde dağıtılması ve boronic ester (geçici koruma) oluşturmak 1 h için onun reflü sıcaklığında tepki karışımı ilave edin.</li>
		<li>5 mL flakon tepki karışıma (0,14 mL) dağıtmak.</li>
		<li>Çözücü bir vakum pompası tarafından takip bir rotary evaporatör kullanarak 5 mL flakon kaldırın.</li>
		<li>Asetonitril -d3 (0,64 mL) elde edilen kalıntı 36 geçiyoruz.</li>
		<li>1H, 11B ve 19F NMR spectroscopies bir kuvars NMR tüp 25 ° C'de kullanarak ölçmek</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Hazırlık ve 38 ölçümü
	<ol>
<li>11 c (40.0 mg, 0.211 mmol) tepki karışımı 38 hazırlamak adım 3.1 benzer işlem kullanmakta.</li>
	</ol>
</li>
</ol>

Yazarlar ifşa gerek yok.

Bu yazının amacı sıkıcı koruma grubunun manipülasyon olmadan korunmasız ribonucleosides kullanarak disaccharide nükleozitler hazırlamak için uygun bir sentetik Yöntem göstermektir. Biz burada regioselective O- glycosylations, nükleozit ile geçici 2', 3'-diol koruma çevrimsel boronic ester (Şekil 1B)51tarafından rapor.
Çevrimsel boronic ester ara hazırlanması önemli adımlardan biridir. Nükleozit ve boronic ...

Conjugates bir nükleozit ve karbonhidrat yan vardır disaccharide nükleozitler bağlı yolu ile bir O-glycosidic bağ, doğal olarak meydana gelen karbonhidrat türevleri1,2 değerli bir sınıf teşkil ,3,4,5,6,7. Örneğin, tRNA (transfer ribonükleik asit) ve poly(ADP-ribose) biyolojik oluştururlar içinde dahil edilmiştir (ADP adenozin nükleotittir =), yanı sıra bazı antibakteriyel ajanları ve diğer biyolojik olarak aktif maddeler (Örneğin, adenophostins, amicetins, ezomycin)5,6,8,9,10,11,12,13, 14,15,16,17,18,19. Bu nedenle, disaccharide nükleozitler ve onların türevleri ilaç bulma araştırma için kurşun bileşikleri olması bekleniyor. Metodolojisi disaccharide nükleozitler sentezi için üç kategoride sınıflandırılır; enzimatik O- glikozilasyon20,21, kimyasal N- glikozilasyon5,9,16,22,23, 24ve kimyasal O- glikozilasyon7,9,14,16,18,19,24, 25,26,27,28,29,30,31,32,33, 34,35,36,37. Özellikle, kimyasal O- glikozilasyon stereoselective sentezi ve disaccharide nükleozitler büyük ölçekli sentezi için verimli bir yöntem olacaktır. Önceki araştırma O- glikozilasyon 2'-deoxyribonucleoside 2 thioglycosyl donör 1 p- toluenesulfenyl klorür ve gümüş triflate, bileşimini kullanarak, affords göstermiştir istenen disaccharide nükleozit 3 (resim 1A; AR aril ve PG = koruma grubu =)38.
Bu sonuçlar O- glikozilasyon ribonucleosides p- toluenesulfenyl klorür/gümüş triflate organizatörü sistemi uygulayarak, geliştirmeye karar verdi. Ise O- glikozilasyon kısmen korunmuş ribonucleosides, çeşitli örnekler gösterdi7,9,14,16,18,olabilirdi19 ,24,32,33,34,35,36,37, korumasız veya geçici olarak korunan kullanımı ribonucleosides O- Glikozilasyon için glikosil alıcısı olarak negligibly bildirilmiştir. Bu nedenle, regioselective O- glikozilasyon, korumasız veya geçici olarak korunan ribonucleosides gelişimi ribonucleosides grubu işlemler koruma olmadan daha faydalı bir sentetik yöntemi sağlar. Regioselective O- glikozilasyon ribonucleosides, elde etmek için biz üzerinde bor bileşikleri, çünkü odaklı regio - ve/veya stereoselective asilasyonu, alkillenme, silylation ve karbonhidrat glikozilasyon çeşitli örnekler türevleri destekli tarafından boronic veya borinic asit-si olmak be39,40,41,42,43,44,45 bildirdi ,46,47,48,49,50. Bu makalede, biz regioselective O- glikozilasyon ribonucleosides yolu ile boronic ester ara 5'-hidroksil grubu, kullanan disaccharide nükleozitler sentezi için yordamı göstermek. Burada sunulan stratejisinde boronic ester ara 6 ribonucleoside 4 , regioselective O- glikozilasyon sağlayan boronic asit ile 5, esterleşme tarafından tanınan disaccharide nükleozit 8 (Şekil 1B)51vermek 5'-hidroksil grubuyla thioglycosyl donör 7 . Ayrıca boronic ester oluşumu gözlemlemek için nükleer manyetik rezonans (NMR) spektroskopisi tarafından ribonucleoside ve boronic asit etkileşimi okudu. Boronic ester ve glikozilasyon tepki yapmak esterleşme boronic ester ve glikosil donör hidroliz önlemek için susuz koşulları gerektirir. Bu makalede, araştırmacılar ve öğrenciler Kimya hem de diğer araştırma alanlarında başarılı glikozilasyon reaksiyonlar için susuz koşulları elde etmek için tipik yordamlar gösterir.

<table><tbody><tr><td>Gümüş triflorometansülfonat</td><td>Nacalai Tesque</td><td>34945-61</td><td></td></tr><tr><td>Fenilboronik asit (değişen miktarlarda anhidrit içerir)</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>B0857</td><td></td></tr><tr><td>p-Metoksifenilboronik asit</td><td>Wako Saf Kimya Endüstrileri</td><td>321-69201</td><td></td></tr><tr><td>4- (Triflorometil) fenilboronik asit (değişen miktarlarda anhidrit içerir)</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>T1788</td><td></td></tr><tr><td>2,4-Diflorofenilboronik asit (değişen miktarlarda anhidrit içerir)</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>D3391</td><td></td></tr><tr><td>Siklopentaylboronik asit (değişen miktarlarda Anhidrit içerir)</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>C2442</td><td></td></tr><tr><td>4-Nitrofenilboronik asit (değişen miktarlarda anhidrit içerir)</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>N0812</td><td></td></tr><tr><td>4-Heksilfenilboronik asit (değişen miktarlarda anhidrit içerir)</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>H1489</td><td></td></tr><tr><td>Adenozin</td><td>Merck KGaA</td><td>862.</td><td></td></tr><tr><td>Guanosine</td><td>Acros Organics</td><td>411130050</td><td></td></tr><tr><td>Cytidine</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>C0522</td><td></td></tr><tr><td>Uridine</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>U0020</td><td></td></tr><tr><td>5-Florouridin</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>F0636</td><td></td></tr><tr><td>5-Metilüridin</td><td>Sigma</td><td>M-9885</td><td></td></tr><tr><td>Metilamin (Metanol içinde% 40, &nbsp; 9.8mol/L)</td><td>Tokyo Kimya Endüstrisi</td><td>M1016</td><td></td></tr><tr><td>N, N-dimetil-4-aminopiridin</td><td>Wako Saf Kimya Endüstrileri</td><td>044-19211</td><td></td></tr><tr><td>Asetik anhidrit</td><td>Nacalai Tesque</td><td>00226-15</td><td></td></tr><tr><td>Piridin, Susuz</td><td>Wako Saf Kimya Endüstrileri</td><td>161-18453</td><td></td></tr><tr><td>Asetonitril</td><td>Kanto Kimyasal</td><td>01031-96</td><td></td></tr><tr><td>1,4-Dioksan</td><td>Nacalai Tesque</td><td>13622-73</td><td></td></tr><tr><td>Diklorometan</td><td>Wako Saf Kimya Endüstrileri</td><td>130-02457</td><td></td></tr><tr><td>Propionitril</td><td>Wako Saf Kimya Endüstrileri</td><td>164-04756</td><td></td></tr><tr><td>Moleküler elekler 4A toz</td><td>Nacalai Tesque</td><td>04168-65</td><td></td></tr><tr><td>Moleküler elekler 3A toz</td><td>Nacalai Tesque</td><td>04176-55</td><td></td></tr><tr><td>Celite 545RVS</td><td>Nacalai Tesque</td><td>08034-85</td><td></td></tr><tr><td>Asetonitril-D3 (D,%99.8)</td><td>Cambridge İzotop Laboratuvarları</td><td>DLM-21-10</td><td></td></tr><tr><td>Trifloroasetik asit</td><td>Nacalai Tesque</td><td>34831-25</td><td></td></tr><tr><td>TLC Silika jel 60 F254</td><td>Merck KGaA</td><td>1.05715.0001</td><td></td></tr><tr><td>Chromatorex</td><td>Fuji Silysia Kimyasal</td><td>FL100D</td><td></td></tr><tr><td>Sodyum hidrojen karbonat</td><td>Wako Saf Kimya Endüstrileri</td><td>191-01305</td><td></td></tr><tr><td>Hidroklorik asit</td><td>Wako Saf Kimya Endüstrileri</td><td>080-01061</td><td></td></tr><tr><td>Sodyum sülfat</td><td>Nacalai Tesque</td><td>31915-96</td><td></td></tr><tr><td>Kloroform</td><td>Kanto Kimyasal</td><td>07278-81</td><td></td></tr><tr><td>Sodyum klorür</td><td>Wako Saf Kimya Endüstrileri</td><td>194-01677</td><td></td></tr><tr><td>Metanol</td><td>Nacalai Tesque</td><td>21914-74</td><td></td></tr><tr><td>JEOL Always 300</td> JEOL <td>NMR Lamda</td>400 <td>JEOL</td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td>Ölçümü NMR</td></tr><tr><td>PerkinElmer Spektrumu 100 FT-IR Spektrometresi</td><td>Perkin Elmer</td><td></td><td>IR Ölçümü</td></tr><tr><td>JEOL JMS-700</td><td>JEOL</td><td></td><td></td></tr> MS <tr><td>PerkinElmer Ölçümü CHN 2400 analizörü</td><td>Perkin Elmer</td><td></td><td>Element analizinin ölçülmesi</td></tr><tr><td>JASCO P-1030 dijital polarimetre</td><td>JASCO</td><td></td><td>Optik rotasyon ölçümü</td></tr><tr><td>JASCO PU-2089 Plus akıllı HPLC pompası</td><td>HPLC için</td><td>JASCO</td><td></td></tr><tr><td>Jasco UV-2075 Plus Akıllı UV/Vis Dedektörü</td><td>HPLC</td><td></td>Rheodyne Model 7125 Enjektör Sigma-Aldrich için JASCO <td></td></tr><tr><td></td><td></td><td>58826</td><td>HPLC</td></tr><tr><td>Kromatopak için C-R8A</td><td>Shimadzu</td><td></td><td>HPLC</td></tr><tr><td>Senshu Pak Pegasil ODS</td><td>Senshu Scientific</td><td></td><td>için HPLC</td></tr><tr><td>p-Toluensülfenil&nbsp; </td><td></td><td></td> klorür <td>Hazırlanmış&nbsp; Ref. 38</td></tr><tr><td>Fenil 6-O-asetil-2,3,4-tri-O-benzil-1-tiyo-a-D-mannopiranosid (a-<güçlü>9</güçlü>)</td><td></td><td></td><td>Hazırlanmış&nbsp; Ref. 52</td></tr><tr><td>4-Metilfenil 2,3,4,6-tetra-O-benzoil-1-tiyo-b-D-galaktopiranosid (b-<güçlü>21</güçlü>)</td><td></td><td></td><td>Hazırlanmış&nbsp; Ref. 53</td></tr><tr><td>4-Metilfenil 2,3,4,6-tetra-O-benzoil-1-tiyo-b-D-glukopiranosid (b-<güçlü>31</güçlü>)</td><td></td><td></td><td>Hazırlanmış&nbsp; Ref. 57</td></tr><tr><td>4-Metilfenil 2,3,4,6-tetra-O-benzoil-1-tiyo-a-D-Mannopyranoside (a-<güçlü>32</güçlü>)</td><td></td><td></td><td>Hazırlanmış&nbsp; Ref. 67</td></tr><tr><td>6-N-Benzoyladenozin (<güçlü>14</güçlü>)</td><td></td><td></td><td>Hazırlanmış&nbsp; Ref. 54</td></tr><tr><td>2-N-İzobütirilguanozin (<güçlü>16</güçlü>)</td><td></td><td></td><td>Hazırlanmış&nbsp; Ref. 55</td></tr><tr><td>4-N-Benzoilsitidin (<güçlü>20</güçlü>)</td><td></td><td></td><td>Hazırlanmış&nbsp; Ref. 56</td></tr></tbody></table>

regioselective o- glikozilasyon nükleozitler üzerinden geçici 2', 3'-diol koruması tarafından boronic ester disaccharide nükleozitler sentezi için

Regioselective O-Glycosylation of Nucleosides via the Temporary 2',3'-Diol Protection by a Boronic Ester for the Synthesis of Disaccharide Nucleosides

Moieties disaccharide ve nükleobazından oluşur, disaccharide nükleozitler doğal ürünler çok yönlü bioactivities sahip değerli bir grup olarak bilinmektedir. Kimyasal O- glikozilasyon disaccharide nükleozitler sentezlemek için yaygın olarak yararlı bir strateji olsa da, glikosil bağış ve alıcısı gibi yüzeylerde hazırlanması sıkıcı koruma grubu manipülasyonlar ve bir saflaştırma gerektirir Sentetik her adım. Bu arada, birkaç araştırma grubu bu boronic bildirdin ve borinic esterleri bir koruma veya aktive regio - ve/veya stereoselective asilasyonu, alkillenme, silylation ve glikozilasyon ulaşmak için karbonhidrat türevleri grup olarak hizmet vermektedir. Bu makalede, biz regioselective O- glikozilasyon, korumasız ribonucleosides boronic asit kullanan yordamı göstermek. Esterleşme, 2' 3'-diol ribonucleosides boronic asit ile geçici koruma diol ve aşağıdaki O- glikozilasyon glikosil donör huzurunda p- toluenesulfenyl klorür ve gümüş triflate, izni yapar regioselective tepki disaccharide nükleozitler göze 5'-hidroksil grubunun. Bu yöntem guanozin, adenozin sitidin Üridin 5-metyluridine ve 5-fluorouridine gibi çeşitli nükleozitler için uygulanabilir. Bu makale ve beraberindeki video korumasız nükleozit, O- Glikozilasyon için yararlı (görsel) bilgi ve kendi analogları disaccharide nükleozitler, hem de biyolojik olarak ilgili çeşitli sentezi için temsil eder türevleri.

O- glikozilasyon Üridin 10 thiomannoside α -9 ile sonuçları Tablo 160,61' özetlenir. 1. giriş, O- glikozilasyon 10 α -9 yokluğunda boronic asit türevleri, karmaşık bir karışımı oluşumunda sonuçlandı. Giriş 2'de, 10 phenylboronic asit 11a karışık ve pyridine ve 1,4-dioxane ile birlikte buharlaşmış...

Burada, bir geçici koruma ribonucleosides ile regioselective O- glikozilasyon tarafından iletişim kuralları disaccharide nükleozitler sentezi için mevcut onların 2', döngüsel bir boronic ester kullanan 3'-diol moieties. Bu yöntem Adenozin, guanozin sitidin Üridin 5-methyluridine ve ilgili disaccharide nükleozitler vermek 5-fluorouridine gibi birkaç korumasız nükleozitler uygulanır.

Regioselective O- glikozilasyon nükleozitler üzerinden geçici 2', 3'-Diol koruması tarafından Boronic Ester Disaccharide nükleozitler sentezi için

Disaccharide nucleosides, which consist of disaccharide and nucleobase moieties, have been known as a valuable group of natural products having ...

Bu yöntemin, geleneksel mevcut yöntemlerle karşılaştırıldığında, biyolojik olarak aktif disakkarit nükleozitlerin hazırlanması için gereken sürecin kısa olması nedeniyle ilaç keşif araştırmalarına yardımcı olması beklenebilir. Bu tekniğin ana avantajı, korunmasız nükleositlerin, disakkarit nükleozitlerini sentezlemek için sıkıcı bir koruyucu grup manipülasyonu olmadan glikozilasyon için uygulanabilmesidir. Bu yöntemin görsel gösterimi, sadece kimyada değil, diğer araştırma alanlarında da araştırmacılar ve öğrenciler için korunmasız nükleozitlerin başarılı bir şekilde glikozilasyonu için yararlı bilgiler sunacaktır.Başlamak için, metin protokolünde açıklandığı gibi bileşik Alfa ve Beta-12'nin sentezi için reaksiyon koşullarını optimize edin. Daha sonra, benzer bir prosedür kullanarak optimize edilmiş reaksiyon koşullarını Beta-22'nin Beta-30'a ve ayrıca Beta-33'e sentezine uygulayın. Bu videoda, Beta-22 bileşiğinin sentezi gösterilmiştir.10 mililitrelik armut biçimli bir şişede 0.76 mililitre susuz piridin içinde 20.4 miligram Adenozin-13'ü çözerek iki asal, üç asal-Diol ribonükleozitin geçici olarak korunmasıyla başlayın. Ardından, 80.4 miligram galaktozil donörü Beta-21 ekleyin. Ş

regioselective-o-glycosylation-nucleosides-via-temporary-2-3-diol

Research

JoVE Journal

Chemistry

Kimya

Bu makale, yüksek bir verim yöntemi antijen sunan hücreler üzerinde belirli reseptörlerine yönelik olarak kullanım için polianhidrid Nanopartiküllerin yüzeyine oligosaccharidler ve ekin sentezi için sunulmuştur.

Polianhidrid Nanopartiküller Yüksek throughput Karbonhidrat sentezi ve işlevsel

Burada tarif edilen protokol modifiye nükleosit trifosfat yol açan karmaşık güzergah yolunda çok sayıda engeller açıklamak ve kesintiye uğratmak için amaçlamaktadır. Dolayısıyla, bu protokol bu aktive bina bloklarının sentezini ve pratik uygulamalar için onların durumu hem de kolaylaştırır.

Nükleosid trifosfatlar - sentezinden Biyokimyasal Karakterizasyonu için

Indoxyl glikozitler, enzim taraması ve enzim aktivitesinin izlenmesi için iyi bilinen ve yaygın olarak kullanılan araçlardır. Özellikle glikoz tipi yapılar için, önceki sentezlerin zorlu ve düşük verimli olduğu kanıtlanmıştır. Yeni yaklaşımımız, iyi verimlerde önemli sayıda indooksil glikozit elde etmek için değerli ara ürünler olarak indooksilik asit esterlerini kullanır.

Glikosidaz Faaliyetlerinin Belirlenmesi için indoksil-glikozitler sentezi

N- glukanlardir bağlantı için bir alüminyum oksit kaplı cam sentezi için modüler bir yaklaşım olarak geliştirilen glycan Mikroarray ve geniş antikor nötralize bir HIV profil oluşturma için kullanımı gösterilmiştir (ACG slayt) kaydırın.

N- glukanlardir dizi geliştirme ve HIV antikor için kemoterapi enzimatik sentezi profil oluşturma

Bu makale, C2'- O -konumunda modifiye edilmiş RNA dodekamerlerinin katı faz sentezi, saflaştırılması ve karakterizasyonu hakkında ayrıntılı bir prosedür sunmaktadır. UV-vis ve dairesiz dikroizyum fotometrik analizleri yapısal yönleri, yani tek telli veya çift telli elektronları ölçmek ve karakterize etmek için kullanılır.

Bir 2&#39;-amino asit içeren RNA Oligomerlerinin Katı Faz Sentezi Protokolü<em&gt; Ç</em&gt; Tiyofenilmetil Değiştirme ve Sirküler Dikroizm ile Karakterizasyonlar

Biyokimyasal ve yapısal analizleri glikozile proteinlerin homojen örnekleri nispeten büyük miktarda gerektirir. Burada, reaktif Cys thiols hedefleyerek bakterilerden saflaştırılmış rekombinant proteinlerin siteye özgü Glikozilasyon için verimli bir kimyasal yöntem mevcut.

Sistein Thiols rekombinant proteinler Vitro siteye özgü Glikozilasyon için hedefleme

Bir 2-azido-1-nitrat-ester karşılık gelen 2-azido-1-trichloroacetimidate bir pot yordamdaki dönüştürülebilir. El yazması karbonhidrat sentezi mikrodalga reaktörde yarar göstermek için hedeftir.

One-pot mikrodalga destekli dönüşüm anomerik nitrat-esterleri Trichloroacetimidates

Bu protokol, oligosakkaritlerin hiyerarşik ve programlanabilir tek pot sentezi için Auto-CHO yazılımının nasıl kullanılacağını göstermektedir. Ayrıca RRV tayini deneyleri ve SSEA-4'ün tek potlu glikozilasyonunun genel prosedürünü açıklar.

Hiyerarşik ve Programlanabilir Tek Pot Oligosakkarit Sentezi

Burada, rutin mikroskopi ekipmanı kullanarak hücre içi sialillenmiş N-glikoproteinlerin biyogörüntülemesine izin veren metabolik oligosakkarit mühendisliği, tıklama kimyası ve genleşme mikroskobunu birleştiren basit bir protokol öneriyoruz.

Click Kimyası ve Genleşme Mikroskobu ile Hücre İçi Sialilasyonun Görselleştirilmesi

Havaya duyarlı bir titanyum ve vanadyum anti-kanser ajanlarının sentezi için bir yöntem olup, MTT testi ile insan kanser hücre çizgisi karşı sitotoksik aktivitenin değerlendirilmesi ile birlikte tarif edilmiştir.

MTT deneyi ile sentez ve Sitotoksisite Değerlendirilmesi: Anticancer Metal Kompleksleri

Keşfedin boronik ester geçici koruma yöntemiyle korunmamış nükleozitlerin regioselektif O-glikozilasyonunu. Bu kimyasal sentez tekniği, disakkarit nükleozit üretimini hızlandırarak ilaç keşfi araştırmalarına katkı sağlar.

Regioselective O- glikozilasyon nükleozitler üzerinden geçici 2, 3-Diol koruması tarafından Boronic Ester Disaccharide nükleozitler sentezi için (Video) | JoVE Journal

Regioselective O- glikozilasyon nükleozitler üzerinden geçici 2', 3'-Diol koruması tarafından Boronic Ester Disaccharide nükleozitler sentezi için

Daha fazla video keşfet