Fare açık erişim NASA GeneLab platformu kullanarak fizyolojisi üzerinde uzay uçuşu etkileri keşfetmek

Bu yöntem, uzay biyolojisi alanındaki hipotezlerin üretimi yle ilgili anahtar soruların yanıtlatArak, kamuya açık tüm karışım verilerini kullanarak gelecekteki araştırmalara yardımcı olabilir. Bu tekniğin en büyük avantajı, uzay biyolojisi verileri üretmek için bir araç olarak kullanılabilir olmasıdır. GeneLab'da kamuya açık veriler, araştırmaların hastalık tedavileri veya uzay uçuşuyla ilişkili sağlık hizmetlerine karşı önlemler hakkında klinik teoriler geliştirmesine olanak sağlamaktadır.

Kemirgen yaşam alanlarını gösteren Yasaman Shirazi-Fard, Kemirgen araştırmaları için ISS misyon bilim adamı olacak. Teslimatı takiben, kemirgenleri standart vivarium kafesleri içinde gruplandırma. Ve hayvanlar NASA besin yükseltilmiş kemirgen gıda çubukları, lixits ve yükseltilmiş tel zeminler için hayvanlar taşıyıcı içine yüklenir kadar uyum var.

Dünya ve Uluslararası Uzay İstasyonu arasında seyahat için, taşıyıcı başına toplam 20 fare için her ışınlayıcı içine yan başına on fare yerleştirin. Bir kez Uluslararası Uzay İstasyonu'nda, taşıyıcı hayvan erişim ünitesi eklemek ve habitatlara bir seferde beş fareler aktarmak için fare transfer kutuları kullanın. Fareleri habitata yüklemek için, hayvan erişim ünitesini ışınlayıcıdan ayırın ve üniteyi kemirgen yaşam alanına takın.

Daha sonra, fare transfer kutuları gelen onlar görev süresince ikamet edecek kemirgen habitatları için hayvanları aktarın. Her gün, habitatlar içinde hayvanların video kemirgenlerin sağlık ve refahını izlemek için eğitimli personel tarafından incelenir. Hayvanlarla ilgili tüm çalışmalar için rehberlik ve gözetim, katılan bir veteriner tarafından sağlanmaktadır.

Kızılötesi görüntüleme, farelerin genellikle en aktif olduğu açık-koyu döngünün karanlık evresinde yaşam alanlarının içindeki hayvanları görmek için kullanılır. Bu kamera görünümü, çerçevenin üst kısmındaki gıda çubuklarını, solda bir erişim kapısı ve pencereyi ve sağda kızılötesi ışıklandırmayı gösterir. Su kaynağı kamera görüntüsünün dışında, bu görünümdeki yemek demirleri arkasında.

Bu, çalışmanın ikinci gününde, açık-koyu döngünün karanlık evresinde yer kontrol yaşam alanıdır. Bu habitat kafesin altındaki atık tepsisi ile yeryüzünde odaklı, kamera görünümü yerçekimi vektörü boyunca aşağıya bakıyor. Kameraya en yakın hayvan yemek barlarının üstünde oturuyor, yiyor.

Bu habitatta beş fare olmasına rağmen genellikle aynı anda sadece birkaç fare görülür. Fareler, yemek çubukları ile kafes duvarı arasındaki gömme boşluk gibi kapalı yuva benzeri yerleri tercih etme eğilimindedirler. Burası aynı zamanda su kaynağının yeridir.

Fareler, bakım ve yeryüzünde fareler için tipik davranışları olan sosyal etkileşimleri gösteren ambulating vardır. Fareler serbestçe hareket etmek için habitat altı duvarları kullanmak ve sık sık yukarı ve aşağı duvarlar tırmanma gözlenir. Bu, çalışmanın ikinci gününde, farelerin tipik olarak en aktif olduğu açık-koyu döngünün karanlık evresinde uçuş yaşam alanıdır.

Uzay uçuşu sırasında, yeryüzünde olduğu gibi, fareler kafesin altı tarafını kullanarak habitat etrafında hareket. Fareler aktif olarak yaşam alanı boyunca keşfetmek ve ambulate ve yeme, içme, tımar ve sosyal etkileşimler de dahil olmak üzere yeryüzünde fareler gibi aynı davranışları sergiler. Fareler kendilerini bölmeye itmek için farklı yöntemler kullanırlar.

Uçuş sırasında fareler genellikle tel örgü boyunca kendilerini çekmek için ön ayaklarını kullanarak görüldü, daha sonra uçuş sırasında, fareler habitat astar tel ızgara üzerinde çalıştırmak için dört uzuvları kullanmak eğilimindedir. Fareler de bir yerden diğerine yüzerek hareket etti. Fareler Kemirgen Araştırma One Çalışması sırasında yaşam alanına alıştıkça, sadece bölmede hareket etmede usta olmakla kalmadılar, aynı zamanda kuyruklarını ve/veya patilerini kullanarak kendilerini duvarlara demirlemeyi de öğrendiler.

Veri analizini, meta veri eksenini ve çalışma açıklamasını gösteren şey GeneLab ekibinde veri koordinatörü olan Sam Gebre olacaktır. GeneLab'da analiz için veri kümelerini bulmak için GeneLab web sayfasını açın ve veri deposuna tıklayın. Belirli ilgi alanlarını aramak ve istediğiniz gibi diğer ilgi alanlarını seçmek için anahtar kelimeleri arama veri kutusuna girin.

Ardından, aramaya başlamak için büyüteç simgesini tıklatın. Tüm anahtar sözcükler arandığında ve veri kümelerini gözden geçirdiyseniz, araçları tıklatın, ardından ortak çalışma alanı ve uygun şekilde yeni bir hesap için oturum açın veya kaydolun. Oturum açtıktan sonra, çalışma alanının nasıl kullanılacağına ilişkin ayrıntılı talimatlara erişmek için yardım ve kullanım kılavuzunu tıklatın.

Her kullanıcı için, gen laboratuarı deposundaki tüm veri kümelerine erişmek için ortak gen laboratuarını seçin ve klasörü ilgi çekici verilerle açın. İlgi alan verilerini yerel bir dizin çalışma alanına kopyalamak için, tek bir dosyaya sağ tıklayın, görünen menüde kopyala/taşı'nı seçin, dosyayı kopyalamak için klasörü seçin ve kopyala'yı tıklatın. Ardından, yalnızca veri kümeleri aramasında bulunan önceki yayınlarla ilgili veri kümelerini bulun ve meta veri dosyalarını yerel çalışma alanına kopyalayın.

Her ilgi alanı için meta veri dosyalarına erişmek için, ortak gen laboratuvarı veri kümesi alt klasörünü açın ve ilgi alanı nın meta veri verilerini bulmak için her veri kümesinin meta veri alt klasöründe bulunan bir veya daha fazla meta veri dosyasına erişin. Her veri kümesinin, araştırma, çalışma, araştırma sekmesi belirtimine göre meta veri sağlayan tek bir sıkıştırılmış dosyaolduğundan emin olun. Araştırmayı, çalışmayı, çalışma hesabını meta verilerini ve her veri kümesi için tetkik meta verilerini görselleştirmek ve erişmek için uygun bir metin düzenleyicisi açın.

Ardından, her veri kümesi alt klasöründe bulunan çıktı tofaş veri dosyalarının varlığını, tsay türüne göre denetleyin. Transkriptomik verileri analiz etmek için menüdeki araçları tıklatın ve galaxy'yi tıklatın. Gen laboratuarından, genom uzayından veri almak için genom uzayı ithalatçısı aracını kullanın.

Veriler, çözümleme bölümünün geçmişinde görünür. Görünümü ve alınan veri kümelerini ve geçerli geçmişi doğruladıktan sonra, analiz seçenekleri ve veri girişlerinin belirtimi ile orta panelde bir form doldurmak için bir GeneLab gökada aracı kullanın. İşlemi yürütmek için iş oluşturmak için formu doldurun ve yürütmenin durumunu belirtmek için geçmiş ve renk kodlu gönderilen işleri denetlemek, ardından araçları karmaşık iş akışına bağlamak, iş akışlarını iş akışları aracıyla yönetmek ve veri kümelerini iş akışlarını ve geçmişlerini diğer araştırmacılarla paylaşmak için paylaşılan veri menüsünü kullanın.

Bu temsili grafikte gösterildiği gibi, biyolojik kopyaları gruplandırmak için ilke bileşen analizi çizimleri kullanılarak, gen kümesi zenginleştirme analizi gen kümelerinden önde gelen kenar genleri belirlenebilir. 1.2 kat değişim ile genler kullanarak, upstream düzenleyiciler, kanonik yollar ve biyo fonksiyonlar için tahminler ile ilgili genler tahmin edilebilir, tüm genler için ilgili ortak örtüşen genler gruplandırılabilir. Daha sonra bu anahtar genlerin kemirgenler ve kemirgenler habitatları ve vivarium kontrolleri arasındaki yanıtı nasıl yönlendiren ağ gösterimi analiz edilen her veri kümesi için merkezi hub'ları görüntüler.

Örneğin, harita kiazaz bir farelerden uzay mekiği misyonu STS108 iskelet kas dokuları için merkezi merkezi ve anahtar genleri sürüş gen ve büyük olasılıkla kemirgen habitatları karşı vivarium kafesleri barındırılan fareler için biyolojik farklılıklara neden için merkezi oyuncu olarak yorumlanabilir. Bir sistem biyolojisi yaklaşımı yla, tüm anahtar genlerden bir ağ oluştururken en çok bağlanan tüm veri kümelerinden gelen gen belirlendi ve harita kiazaz Bir'in tüm anahtar genlerden en çok bağlı gen ve merkezi merkez olduğunu ortaya çıkardı. Prosedürü denerken, uzay biyolojisi kemirgen araştırma deneyleri yürüten araştırmacıların NASA'nın kemirgen araştırma misyonu bilim adamları ile yakın bir şekilde çalışacağını hatırlamak önemlidir, kurmak ve deneyler icra.

Buna ek olarak, tüm uzay biyolojisi ile ilgili tüm karışım verileri NASA GenesLab platformunda mevcuttur ve bu prosedürü kullanarak uzay biyolojisi ile ilgili yeni hipotezler geliştirmek için en etkili yöntemdir. Bu teknik aynı zamanda kanser biyolojisi, Alzheimer ve kardiyovasküler hastalık gibi biyolojik sistemlerle ilgili diğer tüm karışım veri kümelerine de uygulanabilir. Bu teknik, geliştirildikten sonra uzay biyolojisi alanında araştırmacıların Uluslararası Uzay İstasyonu'ndaki astronotlar için karbondioksitin etkileri üzerine araştırmalar alabına başlamalarının önünü açtı.