Name: Metanol bağımsız ifade tarafından de-baskı teknolojilerinden yararlanan Pichia Pastoris (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-01-23T14:45:00.000+00:00
Duration: 5 min 30 s
Description: Öğrenin, Pichia pastoris kullanarak metanol bağımsız rekombinant protein üretimi için küçük ölçekli kültür koşullarını optimize etme yöntemini. Bu teknik, kromozom klonlarının ön seçimini kolaylaştırır ve yüksek verimli protein ifadesi sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

ROBOX Avrupa Birliği (AB) proje ROBOX (Hibe Sözleşmesi n ° 635734) Avrupa Birliği'nin ufuk 2020 programı araştırma ve yenilik altında eylemler H2020-LEIT biyo-2014-1 fon aldı. Görüş ve ifade burada fikir yalnızca o yazar(lar) ve mutlaka bu Avrupa Birliği Araştırma Ajansı yansıtmamaktadır. Avrupa Birliği'nin burada yer alan bilgiler yapılan herhangi bir kullanım için sorumlu değildir.
Doktora tezi ile J. Fischer bir grant tarafından Avusturya finansman Kurumu'nun işe FFG "tez için Industrienahe" ortak finanse edilmektedir.
Biz yararlı tartışmalar ve el yazması taslak için değerli giriş Gernot John (PreSens GmbH) teşekkür ederim.

1. medyası hazırlama
<ol><li>Arabelleğe alınan en az medya (BMG ile gliserol, dekstroz karbon kaynağı olarak ile BMD) hazırlık (1 L)<ol>
<li>Otoklav 650 mL distile su 1 L vidalı kapak cam şişede. Aşağı soğutma sonra orta autoclaved 10 x YNB (134 g/L Maya azot temel amino asitler w/o), potasyum fosfat tampon (1 M, pH 6) 200 mL, 30-100 mL % 10 w/v glikoz veya gliserol (bağlı olarak istenilen oluşturulan biyokütle 100 mL ekleyerek tamamlamak toplu işlem sırasında), 2 mL steril 500 x Biotin (10 mg/mL) çözüm ve dolgu 1 L ile steril distile su. Not: Tüm malzemeyi ayrı şişeler içinde autoclaved olmak zorunda. Biotin autoclaved zaman yok ve bu nedenle 0.2 µm membran filtreleri ile sterilize filtre olması gerekiyor.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Arabelleğe alınan zengin medya (BYPG) (1 L)<ol>
<li>Otoklav 700 mL distile su ile % 1 w/v maya özü ve % 2 w/v pepton 1 L vidalı kapak şişede. Aşağı soğutma sonra ayrı ayrı autoclaved % 10 w/v gliserol, potasyum fosfat tampon (1 M, pH 6) 200 mL 30-100 mL ekleyin ve 1 L steril distile su ile doldurun.</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. şişeler hazırlık çalkalanır.
<ol><li>5 mL distile su 250 mL şaşkın eklemek şişeler sallamak, pamuk bez iki kat ile kapak ve lastik bantlar ile yerde düzeltebilirim. Alüminyum folyo bir parça bezle kapak.</li>
	<li>Otoklav tam sterilizasyon için 20 dk için 121 ° C'de şişeler.</li>
	<li>Artık su şişesi ve önceden hazırlanmış medya aliquot 50 mL her şişeyi çıkarın.</li>
</ol>3. gecede kültür aşı
<ol><li>Bir gecede Kültür (Onkoloji) istenen ifade baskı YPD (% 1 w/v maya ekstresi, % 2 w/v pepton, % 2 w/v glikoz) 5 ml 50 mL santrifüj tüpü içinde taze bir koloni kapağı uygun havalandırma izin vermek için biraz açık bırakarak başlayın.</li>
	<li>Bu gece 28 ° c, % 80 nem, 100-130 rpm (2,5 cm sallayarak çapı) bir shaker büyümek?</li>
</ol>4. ölçüm kurulum ve ana kültür ekimi
<ol><li>Online izleme sistemi ayarlamak için uygun cihazları kalibrasyonu için üreticinin yönergelerini izleyin.</li>
	<li>Bir bilgisayarı izlemek için uygun yazılım aralığı ölçüm istasyonları Bluetooth bağlantısı için yüklendiği getirin. Bluetooth aygıtları bağlamak için yazılımını başlatın.<ol>
<li>Bluetooth bağlantısı biyokütle ölçüm cihazı üzerinde önünde gümüş düğmeye basarak açın.</li>
		<li>Yazılım, aygıtlar Aygıtları bultıklatın. Not: Cihazlar listesi penceresinde görev sınırının altında olarak görünmesi gerekir. Eğer onlar yapmak değil, bu pillerin dolu ve bilgisayar ulaşmak içinde bir Bluetooth bağlantı için kontrol etmek için tavsiye edilir.</li>
		<li>Sürükleyin ve Ölçüm tepsisiekranın sağ tarafında bulunan cihazlar kareler için bırakın.</li>
		<li>Bağlan' ı tıklatın. Not: ne zaman bağlantı başarılı oldu, kontrol ekranı görüntülenir.</li>
		<li>Bluetooth bağlantısı için bir deneme başlatmak için ölçümtıklatın.</li>
		<li>Deneme oluşturmak ayarla.<ol>
<li>Ölçüm başlatmak, adı deneme'i tıklatın ve izlemek için gereken tüm parametreleri etkinleştirin. Not: Lisans her olası ölçülen parametreler için ihtiyaç vardır.</li>
			<li>Küme aralığı için 3 dak. Not: Aralığı sıklığını belirler ölçüm noktaları alınır ve her ölçüm noktasında bir değer daha sonra olur. Her dakika ölçme çok doğru olduğunu, ancak büyük miktarda veri hangi geçici o daha zahmetli değerlendirmek oluşturulur.</li>
			<li>Ortalama ölçüm noktaları 11'e ayarlayın. Not: Bu ayarı kaç ölçüm zamanlarda aslında her 3 dakikada alınan belirler. Bu nedenle, 11 ölçüm puan üzerinde 11 ortalama değeri alınan çıktı s.</li>
			<li>Örnekleri için adlarını girin.</li>
			<li>Açı zaten (daha önce adım 4.1) kalibre olarak sonraki ekrana geçin. Not: Ana kültür aşı daha önce Bluetooth bağlantısı için bir deneme istikrarlı bağlantı ve bağlı bilgisayar uygun konumunu sağlamak için tavsiye edilir. Pilleri tahsil de.</li>
		</ol>
</li>
	</ol>
</li>
	<li>Yetiştirme ortamı (1:20) seyreltilmiş Onkoloji (adım 3.1) hücre yoğunluğu spektrofotometre 600 nm dalga boyu, ölçü birimi. Orta 50 mL aşılamak (önerilen karbon kaynağı konsantrasyon 0,3-%1, 1. adımda açıklandığı gibi farklı medya mümkün.) aşağıdaki hesaplamayı kullanarak 0,05 OD600 Onkoloji ile. <img alt="Equation 1" src="/files/ftp_upload/58589/58589eq1.jpg">
</li>
	<li>Şişeler dedektörleri yerleştirin ve 28 ° C, 130 rpm ve % 80 nem salla. Not: Ölçüm önlemek için başlangıç şişeye altına yapıştırma ve yanlış değerleri verimli hücrenin kültür sallayarak, 5 min vermek çok önemlidir.</li>
	<li>Ölçüm başlamak belgili tanımlık bilgisayar yazılımı içinde tıklatın.</li>
	<li>Hücre yoğunluğu ölçüm 4 h sonra aşılama ve karbon kaynağı alır (4.7 adımda açıklanan belirlenmesi) tükenmiş için 0.2 mL numune al triplicates içinde. Yetiştirme ortamı (ilk ölçüm 1:5, ikinci ölçüm 1:20) uygun şekilde örneklerinde sulandırmak ve 600 nm dalga boyu emme bir spektrofotometre de ölçün. Şişeler çıkarmadan önce ve shaker durdurmadan önce bile, her zaman belgili tanımlık bilgisayar yazılımı içinde ölçüm duraklatın. Not: Dedektörleri parametreler tanımlanmış sallayarak koşullar altında kaydetmek için kalibre edilmiş ve saçma ölçümleri için hala kültürler kaydederken verecektir. Ayrıca, her zaman tekrar ölçüm başlamadan önce sallayarak, 5 min beklemek emin olun. Dedektör biyokütle ve gerçek olmayan hücre yoğunluğu için sadece değerleri teslim çünkü hücre yoğunluk ölçümleri gereklidir. OD600 değerler arasında bir kalibrasyon fonksiyonu (x değeri) ve online ölçüm sistemi (y değerleri) tarafından elde edilen değerler birkaç timepoints spectrophotometrically ölçerek elde edilebilir. Bir doğrusal ancak de aşağıdaki kalibrasyon işlevine göre logaritmik bir ilişki değerlerdir: <img alt="Equation 2" src="/files/ftp_upload/58589/58589eq2.jpg"> y: OD600 değerleri spektrofotometre tarafından elde x: online ölçüm sistemi tarafından elde edilen değerler k: yamaç d: ekseni kesişim noktası Eğim ve eksen kesişim noktası daha sonra herhangi bir değeri karşılık gelen OD600 değeri dönüştürmek için kullanılabilir. Excel'de bir spectrophotometrically elde edilen OD600 değerler aynı timepoint online sistemden gelen değerler karşısında çizebilirsiniz. Logaritmik bir eğilim çizgisi ve karşılık gelen denklem eklenmesi yukarıda gösterilen kalibrasyon fonksiyonu verecektir.</li>
	<li>Karbon kaynağı neredeyse tükenmiş (app. 12-20 h) kadar yetiştirmek. Bu amaçla, oksijen konsantrasyonu sıfır yaklaşıyor ve hücreleri üstel büyüme aşamasındadır yazılım diyagramları görülebilir kadar büyümek kültürler izin. Not: Bu protokol için kullanılan karbon kaynağı konsantrasyonları için durum böyle. Bu exemplarily temsilcisi sonuçlar bölümünde, Şekil 1 ' deki oksijen seviyesini sıfır yaklaşımlar ve üstel büyüme hücrelerdir görüldüğü gibi karbon kaynak tükenmesi timepoint online izleme sistemi ile belirlenebilir aşama.</li>
</ol>5. protein ifade de-baskı tarafından
<ol><li>Adım 4,6 içinde açıklanan timepoint ulaşıldığında, steril koşullarda şişesi başına dört besleme diskler eklenmesiyle kültürler besleme başlatın. Not: açıklanan koşullar söz konusu olduğunda, dört gliserol besleme diskler sürüm 2 mg/h gliserol üreticiye göre.</li>
	<li>Seçim bir tahlil tarafından protein ifade izlemek için her 24 h örnekleri fotoğraf çekerken tarım 60-90 h için devam (e.g., Bradford tahlil15, SDS sayfa16 veya etkinlik deneyleri) ve hücre yoğunluk ölçümleri.</li>
</ol>6. kültür hasat
<ol><li>Yetiştirme 60-90 h sonra 4.000 x de g, 4 ° C'de 10 dakika aralıklarla tarafından ürün toplama 50 mL santrifüj tüpleri kültürlerde doldurun. Not: Süpernatant (için salgılanan proteinler) veya hücreleri (hücre içi protein ifade) tarafından 4.000 x de g, 4 ° C'de 10 dakika aralıklarla hasat edilebilir ve daha fazla analizler yapılabilir.</li>
	<li>Online ölçüm verileri yazılım daha ayrıntılı analiz için bir elektronik tablo dosyası olarak verin.</li>
	<li>5-10 mL distile su tüm şişeler ve otoklav kalan hücreleri devre dışı bırakabilirsiniz doldurun.</li>
</ol>

<ol><li>Bill, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Playing+catch-up+with+escherichia+coli%3A+Using+yeast+to+increase+success+rates+in+recombinant+protein+production+experiments%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Microbiology%22%5BJournal%5D)">Playing catch-up with escherichia coli: Using yeast to increase success rates in recombinant protein production experiments.</a> Frontiers in Microbiology. 5 (MAR), 1-5 (2005).</li>
<li>Cregg, J. M., Cereghino, J. L., Shi, J., Higgins, D. R. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/article/10.1385/MB:16:1:23">Recombinant Protein Expression in Pichia pastoris).</a> Molecular Biotechnology. 16, 23-52 (2000).</li>
<li>Weinhandl, K., Winkler, M., Glieder, A., Camattari, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Carbon+source+dependent+promoters+in+yeasts%5BTitle%5D)+AND+%22Microbial+Cell+Factories%22%5BJournal%5D)">Carbon source dependent promoters in yeasts.</a> Microbial Cell Factories. 13, 5(2014).</li>
<li>Vogl, T., Kickenweiz, T., Sturmberger, L., Glieder, A. Bidirectional Promoter. US patent. , 20150011407 (2005).</li>
<li>Vogl, T., Glieder, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+Pichia+pastoris+promoters+and+its+consequences+for+protein+production%5BTitle%5D)+AND+%22New+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Regulation of Pichia pastoris promoters and its consequences for protein production.</a> New Biotechnology. 30 (4), 385-404 (2013).</li>
<li>Rußmayer, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Systems-level+organization+of+yeast+methylotrophic+lifestyle%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biology%22%5BJournal%5D)">Systems-level organization of yeast methylotrophic lifestyle.</a> BMC Biology. 13 (1), 80(2015).</li>
<li>Sakai, Y., Yurimoto, H., Matsuo, H., Kato, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+peroxisomal+proteins+and+organelle+proliferation+by+multiple+carbon+sources+in+the+methylotrophic+yeast%2C+Candida+boidinii%5BTitle%5D)+AND+%22Yeast%22%5BJournal%5D)">Regulation of peroxisomal proteins and organelle proliferation by multiple carbon sources in the methylotrophic yeast, Candida boidinii.</a> Yeast. 14 (13), 1175-1187 (1998).</li>
<li>Hartner, F. S., Glieder, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+methanol+utilisation+pathway+genes+in+yeasts%5BTitle%5D)+AND+%22Microbial+Cell+Factories%22%5BJournal%5D)">Regulation of methanol utilisation pathway genes in yeasts.</a> Microbial Cell Factories. 5, 39(2006).</li>
<li>Vogl, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Toolbox+of+Diverse+Promoters+Related+to+Methanol+Utilization%3A+Functionally+Verified+Parts+for+Heterologous+Pathway+Expression+in+Pichia+pastoris%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Synthetic+Biology%22%5BJournal%5D)">A Toolbox of Diverse Promoters Related to Methanol Utilization: Functionally Verified Parts for Heterologous Pathway Expression in Pichia pastoris.</a> ACS Synthetic Biology. 5 (2), 172-186 (2016).</li>
<li>Mellitzer, A., Weis, R., Glieder, A., Flicker, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expression+of+lignocellulolytic+enzymes+in+Pichia+pastoris%5BTitle%5D)+AND+%22Microbial+Cell+Factories%22%5BJournal%5D)">Expression of lignocellulolytic enzymes in Pichia pastoris.</a> Microbial Cell Factories. 11 (1), 61(2012).</li>
<li>Macauley-Patrick, S., Fazenda, M. L., McNeil, B., Harvey, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Heterologous+protein+production+using+the+Pichia+pastoris+expression+system%5BTitle%5D)+AND+%22Yeast%22%5BJournal%5D)">Heterologous protein production using the Pichia pastoris expression system.</a> Yeast. 22 (4), 249-270 (2005).</li>
<li>Weis, R., Luiten, R., Skranc, W., Schwab, H., Wubbolts, M., Glieder, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reliable+high-throughput+screening+with+Pichia+pastoris+by+limiting+yeast+cell+death+phenomena%5BTitle%5D)+AND+%22FEMS+Yeast+Research%22%5BJournal%5D)">Reliable high-throughput screening with Pichia pastoris by limiting yeast cell death phenomena.</a> FEMS Yeast Research. 5 (2), 179-189 (2004).</li>
<li>Ukkonen, K. <a target="_blank" href="http://jultika.oulu.fi/files/isbn9789526203621.pdf">Improvement of Recombinant Protein Production in Shaken Cultures</a>. , Acta University Oulu C 480 (2014).</li>
<li>Jeude, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fed-batch+mode+in+shake+flasks+by+slow-release+technique%5BTitle%5D)+AND+%22Biotechnology+and+Bioengineering%22%5BJournal%5D)">Fed-batch mode in shake flasks by slow-release technique.</a> Biotechnology and Bioengineering. 95, 433-445 (2006).</li>
<li>Bradford, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+rapid+and+sensitive+method+for+the+quantitation+of+microgram+quantities+of+protein+utilizing+the+principle+of+protein-dye+binding%5BTitle%5D)+AND+%22Analytical+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding.</a> Analytical Biochemistry. 72, 248-254 (1976).</li>
<li>Smith, B. J. <a target="_blank" href="https://link.springer.com/protocol/10.1385/0-89603-062-8:41">SDS Polyacrylamide Gel Electrophoresis of Proteins.</a> Methods in molecular biology. 1, 41-55 (1984).</li>
<li>Hartner, F. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Promoter+Library+Designed+for+Fine-Tuned+Gene+Expression+in+Pichia+Pastoris%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Research%22%5BJournal%5D)">Promoter Library Designed for Fine-Tuned Gene Expression in Pichia Pastoris.</a> Nucleic Acids Research. 36 (12), e76(2008).</li>
<li>Panula-Perälä, J., Vasala, A., Karhunen, J., Ojamo, H., Neubauer, P., Mursula, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Small-scale+slow+glucose+feed+cultivation+of+Pichia+pastoris+without+repression+of+AOX1+promoter%3A+towards+high+throughput+cultivations%5BTitle%5D)+AND+%22Bioprocess+and+Biosystems+Engineering%22%5BJournal%5D)">Small-scale slow glucose feed cultivation of Pichia pastoris without repression of AOX1 promoter: towards high throughput cultivations.</a> Bioprocess and Biosystems Engineering. 37 (7), 1261-1269 (2014).</li>
</ol>

Sunulan Protokolü genellikle yetiştirme ve indüksiyon derepressed koşullar altında için geçerli olsa da, bu çalışmada kullanılan yeni derepressed Rehberleri ticarileştirilmesi bir ilgi var bisy e.U. bildirir.

Bu yöntem güvenilir bir protokolü için verimli metanol bağımsız indüklenebilir ifade tarafından P. pastoris PAOX112tarafından tahrik klasik metanol indüklenen protein ifade bir alternatif olarak sunar. De-repressible rehberleri,DCP, PDF veya yukarıda açıklanan mutasyona uğramış PAOX1 türevleri17, gibi bu yeni protein üretim kavramı moleküler temeli oluşturmak. Gösterilen temsilcisi sonuçları kullanışlılığı ve P. pastoris Rekombinant protein ifadesinde de-bastırılmış rehberleri ve basit online izleme ile küçük ölçekli tarama tarafından pratiklik altını çizin. Bir yandan AOX1 organizatörü indüksiyon için genellikle kullanılan zararlı ve zehirli metanol ekimi ortadan kaldırılabilir. Öte yandan, bünye protein ifade, Örneğinaksine edilişi9 büyüme ve protein üretim aşaması vardır., yaygın olarak kullanılan PGAPile. Bu özellikle yararlı olduğunda hücreleri bir yük gosterir toksik veya zararlı proteinler hızlı.
Arazisi farklı karbon kaynağı konsantrasyonları ile başlatmak için olasılığı bir protein üretim aşamasında daha önce kazanmak istiyorum ne kadar biyokütle başlama kararı sağlar. Öte yandan yüksek hücre yoğunluğu da daha yüksek protein titreleri neden olabilir süre bir düşük karbon kaynağı yoğunluklu toplu iş iş işlemde seçerken, oksijen transfer sınırlamaları çok yüksek hücre yoğunluğu nedeniyle azaltılabilir. Şekil 1' de gösterildiği biyokütle üretimi ve oksijen konsantrasyonları açısından kültür geliştirme izleyerek, beslenen-toplu iş başlangıç için en uygun zaman noktası kolayca belirlenebilir.
Online bu işleme parametrelerini izlemek için bir uygun ölçüm sistemi uygulanması gerekir. Ölçüm cihazı (Örneğin, SFR Vario) biyokütle basit ve ekonomik online ölçüm sistemi kültür izleme için sallamak şişeler. Opto-elektronik okuyucu yolu ile dağınık ışık algılama şişeye hücre büyüme belirler ve şişeye entegre oksijen sensörü sinyal dışarı okur. Biyokütle ölçüm için optik parçacıklar kültür suyu (hücreler) tarafından dağınık ve bir fotodiyot ile tespit bir ışık sinyali yayan bir LED oluşur. Optik sensörleri belirli bir dalga boyu ışıkla heyecanlı zaman floresans yayarlar. Analit molekülleri mevcut miktarına bağlı olarak, bu floresan sinyal, hangi okuyucu optik tarafından algılanır ve konsantrasyon değerleri değiştirir. Ancak, bir hücre yoğunluğu ölçüm kalibrasyon ölçüm sistemi gerçek OD600 değerleri ölçme değil beri önceden, kurulacak vardır. Oksijen alımını oranı üzerinden reader yazılımı ile oksijen eğrisi eğimi hesaplanabilir ve sıcaklık gibi rpm sürekli diğer parametreler ile birlikte kaydedilir. Bu sistem ile izlemeyi etkinleştir için sallamak şişeler daha önce istenen parametreler için uygun sensörleri ile donatılmış olması gerekir.
Dört yavaş salımlı polimer eklenmesiyle diskler, gliserol kültür suyu için sabit bir miktarını sağlama biyokütle birikimi neredeyse durdu ve Rekombinant protein üretim devam etmektedir. Besleme disk ek zaman noktası belirlenmesi önemli bir adım bu deneyde değil, ama ifade üzerine başlar üstel büyüme aşamasında önce erken bir besleme başlangıç organizatörü aktivasyon inhibe düşünülmelidir karbon kaynak tükenmesi. Ayrıca, oysa sonra hücreleri durağan faz ulaştınız yem geciktirmek için açlıktan neden olabilir ve bozulma zaten protein üretilen yemek zamanı polimer kapasite sınırlamaları nedeniyle toplam azalabilir. Besleme diskler bu protokol için kullanılan miktarı deneysel organizatörü biyokütle üretimi düşük (veri gösterilmez) tutarken de-baskı altında tutmak en iyi karbon kaynağı sürülmesi tespit edilmiştir. Bu şekilde, arazisi olabilir 160-180 h herhangi bir müdahale olmadan kolayca üzerinden gerçekleştirilen.
Bu yeni protokol ana uygulamalar eleme ifade klon, enzim evrim ve keşif, karakterizasyonu ve mühendislik yeni Rehberleri metanol-Alerjik ekimi Protokolü iyi izlenen koşullarında istihdam olacaktır. Prensip olarak, aynı iletişim kuralını metanol ve sınırlı fermantatif karbon kaynağı beslemeleri gibi Panula-Perälä ve arktarafından açıklanan istihdam karışık-besleme stratejileri için uygulanabilir olmalıdır. 2014 yılında18.

Verim ve güvenilir yetiştirme koşulları bakteri ve Maya gibi mikroorganizmalar tarafından Rekombinant protein üretimi için büyük ölçekte iyileşme Binbaşı biridir bugünün biyoteknoloji1 ve Sanayi ticari başarısı ihtiyaçlarını uygulamaları. Karşılaşma basit yetiştirme yordamlar ve medya, yüksek verim ve de karakterize araçları2 Pichia pastoris (Komagataella phaffii) Rekombinant protein üretimi için yaygın olarak kullanılan bir sigara geleneksel Maya. Ek yenilikçi araçlar sürekli yaygın olarak kullanılan PAOX1, organizatörü bölge alkol oksidaz 1 gen3, alternatif olarak yeni rehberleri de dahil olmak üzere yeni ifade vektörel çizimler gibi bu tür için geliştirilen 4,5. 500 bp uzun DNA dizisi akıntıya karşı CAT1 (CTA1) gen P. pastorisyeni metanol-alerjik ve çok yönlü ifade stratejisinde sağlar organizatörü bölge olarak tespit edilmiştir. CAT1 gen P. pastoris tek katalaz gen ve protein peroksizomların içinde yer almaktadır. Katalaz, e.gkaynaklanan reaktif oksijen türleri, detoksifikasyon içinde önemli bir rol oynar., metanol oksidasyon peroksizomal MUT yolu veya yağ asitleri6,7' nin beta oksidasyon sırasında üzerinden. CAT1 Gen ifadesinin glikoz veya gliserol ekimi orta prescence bastırılmış ve bu karbon kaynakları8tükenmesi derepressed. Ayrıca, katalaz Gen ifadesinin metanol ve oleik asit, oleik asit bile olarak benzer ifade düzeyleriyle ulaşan ile indüklenen P. pastoris MUT yolun tek gen görünüşte olmak ile de remarkebly ile indüklenen Metanol indüksiyon9.
PDC (bazen de kısaltılmış PCAT1-500) denir, bu P. pastoris CAT1 organizatörü 500 bp parçası önce intracellularly ifade ve salgılanan proteinler üretimi için sınanmış ve olduğu ortaya çıktı bir iki klasik cazip alternatif P. pastoris Rehberleri-güçlü kurucu PGAP ve metanol daha 20 yıl önce geliştirilen indüklenebilir PAOX1,. PDC % 21 (CalB) ve şeker zengin Orta PGAP göre hacimsel faaliyetlerin (HRP) % 35 ulaşmayı başardı. Metanol indüksiyon, üzerine PDC sadece PAOX1daha hızlı yanıt vermedi, ama aynı zamanda açıkça bu bir 2,8 kat daha yüksek son titresi CalB9tarafından topundan daha iyi.
Yanı sıra PDC, bir orthologous organizatörü (PDF) benzer bir düzenleme profil sergileyen tespit edilmedi. Ancak, PDC küçük derepressed yanı sıra daha metanol kaynaklı altında (hazırlık el yazması)3koşullar önemli ölçüde güçlü.
Güçlü kurucu PGAP fizyolojik açıdan sorunlu ya da sitotoksik proteinler10,11nedeniyle başarısız olduğu durumlarda,DC P ve PDF ideal bir alternatif temsil eder. Mikro ölçekli deneyler, bu Organizatör tarafından tahrik ifade başlar ilk karbon kaynak tükenmesi sonra (Örn., glikoz veya gliserol), hangi kolaylaştırır biyokütle üretimi overexpression hücrelerle akneden olmadan Rekombinant protein en başından. Her ikisi de bu Organizatör tarafından metanol hala indüklenebilir olmakla birlikte, belgili tanımlık harekete geçirmek derepression tarafından ek P istihdam ifadeler karşılaştırıldığında preinduction faz kullanırAOX1. Ayrıca, PDC ve PDF büyük endüstriyel proseslerin12için arzu edilen bir hedeftir metanol-Alerjik protein üretimi için kullanılabilir.
Geçerli üretim suşları ve ifade yapıları gelişimi için ölçek-up için tercih edilen aday için transformants çok sayıda daraltmak için geçirilecek geliştirme birkaç adım var. Gösterimleri genellikle çok iyi tabak içinde yüksek işlem hacmi içinde gerçekleştirilir (mikro ölçekli: az 0.5 mL) klonlar mümkün olduğunca büyük bir dizi yakalamak için. Sonraki yeniden tarama ve re-re-screening olduğunu sallamak şişesi tarafından takip sonraki adım (küçük ölçekli: 50-250 mL) veya (mikro-) biyoreaktör gösterimleri12. Ancak, microlitres sallamak şişeler sonraki ölçek-up iyi kontrollü metanol-Alerjik üretim kadar birkaç mililitre kadar derin-şey tabak içinde yüzlerce farklı ölçekler arasında en benzer bir yöntem için katlanmak Biyoreaktörler. Shake şişeler zaten benzer birimler olarak küçük Biyoreaktörler sağlamasına karşın, sürekli besleme, havalandırma ve online izleme13 büyüme gibi büyük ölçekli protein üretim için son derece uygun birçok sınırlamalar vardır ve oksijen kaynağı. Optik izleme istihdam sallamak şişeler uyarlanmış ve sarsma cihazları gibi büyük kültür parametreleri hakkında sürekli online bilgi sağlamaya devam ederken paralel işleme için daha gelişmiş ekipman için düşük maliyetli bir alternatif sağlamak biyokütle ve çözünmüş oksijen konsantrasyonu. Karbon kaynağı yavaş salınımlı polimer gemisi karmaşık teknik çözümler ve cihazlar, Biyoreaktörler daha benzer koşullar daha önce uygulanan basit tam taklit dayanarak olmadan sürekli ve kontrollü besleme güvenliğini sağlamak için uygulanabilir karbon kaynağı9,10, tükenmesi burada devam eden protein ifade için enerji olur sınırlama.
Aşağıdaki yöntemi küçük açıklar orta ölçekli metanol ücretsiz kontrol edilebilir protein ifade için PDC ve PDF. P. pastoris sisteminde yeni Organizatör dayalı İndüksiyon derepression tarafından iki aşamadan oluşur. Protein üretimi olmadan biyokütle birikimi faiz, nerede bir karbon kaynağı küçük ama sabit konsantrasyonlarda sağlanan rehberleri ve hedef protein üretim, ikinci faz represses bir karbon kaynağı'nı ilk kısa aşaması derepressed organizatörü bakımı. Online en kritik ekimi parametreleri izleme tüm yetiştirme döneminde uygulanır. Metanol ücretsiz, güvenilir ve ölçeklenebilir yetiştirme sistemi P. pastorisiçin sağlamak için hedefi oldu.

<table><tbody><tr><td>Bacto Maya Özü</td><td>BD Biosciences</td><td>212720</td><td></td></tr><tr><td>Şaşkın Şişe 250 mL</td><td>DWK Yaşam Bilimleri</td><td>212833655</td><td></td></tr><tr><td>BBL Phytone Peptone</td><td>BD Biosciences</td><td>298147</td><td></td></tr><tr><td>Biyofotometre</td><td>Eppendorf AG</td><td>5500-200-10</td><td></td></tr><tr><td>Certoclav-EL</td><td>CertoClav GmbH</td><td>9.842 014</td><td></td></tr><tr><td>Difco Maya nitrojen bazlı o amino asitler</td><td>BD Biosciences</td><td>291920</td><td></td></tr><tr><td>Besleme diskleri gliserol</td><td>Adolf Kuhner AG</td><td>315060</td><td></td></tr><tr><td>Glikoz-monohidrat</td><td>Carl Roth GmbH + Co. KG</td><td>6887</td><td></td></tr><tr><td>Gliserol & ge; %98 Carl</td> <td>Roth GmbH + Co. KG</td><td>3783</td><td></td></tr><tr><td>K2HPO<>sub4</td><td>Carl Roth GmbH + Co. KG</td><td>6875</td><td></td></tr><tr><td>KH2PO4</td><td>Carl Roth GmbH + Co. KG</td><td>3904</td><td></td></tr><tr><td>Multitron Standardı&nbsp;</td><td>Infors AG</td><td>444-4226</td><td></td></tr><tr><td>SFR Vario v2</td><td>PreSens GmbH</td><td>200001689</td><td></td></tr></tbody></table>

metanol bağımsız ifade tarafından de-baskı teknolojilerinden yararlanan pichia pastoris

Methanol Independent Expression by Pichia Pastoris Employing De-repression Technologies

Metanol bir iyi kurulmuş karbon kaynağı ve mikro-, laboratuvar ve endüstriyel ölçekte bir ev sahibi gibi Pichia pastoris (P. pastoris) istihdam verimli protein üretimi için uyarıcı olduğunu. Ancak, onun toksisite ve yanma nedeniyle, P. pastorisyüksek verimliliği korunarak metanol önlemek için bir arzusu yoktur. Küçük ölçekli biyoreaktör arazisi (0,5-5 M çalışma birimi) yaygın olarak derin kuyu plakaları microscale ekimi çok az kontrol edilebilir veya pahalı ekipman kullanır beri büyük bir yük ve protein üretim özellikleri değerlendirmek için kullanılır. Kurucu ifade veya metanol indüksiyon ve şimdiye kadar geleneksel iletişim kuralları yetiştirme ve P. pastoris indüksiyon için kurulmuştur Ayrıca, güvenilir iletişim kuralı yok ekran P. pastoris ifade için tarif edildi (kontrollü ve izlenen) paralel arazisi içinde derepressible rehberleri ile suşları. Yem sürekli yavaş gliserol de dahil olmak üzere biyoreaktör koşulları simüle metanol özgür ifade için bir basit sallamak şişesi yetiştirme sistemi kurduk karakterize ve yeni protein üretim suşları karşılaştırmak için ilk böyle arazisi basitleştirmek için ve böylece online izleme çoğunlukla uygulamalı küçük ölçekli toplu arazisi karşılaştırıldığında Biyoreaktörler gerçek koşullarda daha yakın geliyor. Karbon kaynağı P. pastoris, ifadesinde Rekombinant protein sürmeyi PDC ve PDF uygulanmış olan Organizatör bastırılmış. Katıştırılmış karbon kaynağı, gliserol bir ilerleme hızı biyokütle üretimi düşük tutarken Rehberleri etkin korumak için gerekli enerji teslim güvence verdi, sabit bir miktarda serbest ile polimer diskler.

Protokol bölümünde açıklandığı gibi yazılım önemli ekimi parametreleri üzerinde tüm yetiştirme kaydeder. Şekil 1 görselleştirme biyokütle gelişme ve oksijen konsantrasyonu % 0,5 (Şekil 1A) ya da % 0,3 (Şekil 1B) karbon kaynağı diskler yem gliserol eklenmesi tarafından takip toplu iş ile başladı bir ekimi sırasında gösterir. Toplu işlem tam olarak belirlenebilir sonra online izleme sistemi karbon kaynak tükenmesi timepoint de-bastırılmış arazisi için özellikle yararlıdır. Şekil 1' de görüldüğü gibi orta oksijen konsantrasyonu hızla düşüyor ve sıfıra, özellikle için % 0,5 gliserol toplu iş (iken biyokütle bu noktada katlanarak artmaktadırŞekil 1A). Burada, üstel büyüme aşamasında hücrelerdir ve iletişim kuralında açıklandığı kısa bir süre kültür durağan faz ulaşmadan karbon kaynağı serbest bırakmak en iyi yararlanmak için besleme diskler eklenmelidir. Oksijen konsantrasyonu sıfır ulaşmadan önce besleme diskler eklenmesi de-bastırılmış protein ifade hücreleri oksijen sınırlama gelen önlemek için önemlidir. O Şekil 1B adımında görülebilir ve bu nedenle de-bastırılmış protein ifade için tavsiye edilir düşük gliserol konsantrasyonlarda kısa süreli oksijen sınırlamalar etkisini azaltmak.
Aşağıda, iki farklı yetiştirme-istihdam açıklanan protokol ve izleme sistemi 1 rakam gösterilir-deneyler açıklanan sonuçlar. İlk denemede, glikoz oksidaz Aspergillus niger (A. niger) üzerinden PDC ve ikinci kontrol altında insan büyüme hormonu üreten P. pastoris zor üreten bir P. pastoris yük PDF kontrolü altında gösterilir.
Bu deneyde, glikoz oksidaz üretim PDC kontrol altında araştırılmıştır. Bu nedenle, farklı yetiştirme stratejileri karşılaştırıldı: gliserol darbe, sürekli gliserol besleme diskler ve yetiştirme olmadan herhangi bir besleme veya nabız gibi atan eklenmesi tarafından besleme. Ekimi tek karbon kaynağı olarak 250 mL sallamak şişeler (Tablo 1) 50 mL arabelleğe alınan en az medya % 0.5 glukoz ile yapıldı.
160 h ekimi, üzerine yüksek biyokütle konsantrasyonu elde edilmiştir, biyokütle üretimi (38 h) ve (% 0,25 w/v gliserol 38 h, 61 h ve 86 h ekimi sonra) gliserol darbe için bir glikoz toplu iş kullanarak bir beslenme stratejisi ne zamandı (0,21 g/M salgı toplam istihdam protein, 8.4 U/mL). Logosuna 2 kat azalma biyokütle konsantrasyonu ve salgılanan protein toplam miktarı elde rağmen besleme diskleri 38 h glikoz toplu iş iş sonra eklendiğinde, hatta 1 U/gliserol darbe kullanarak ekimi için karşılaştırıldığında mL daha yüksek hacimsel etkinliği oldu . Bu salgılanan protein önemli bir miktar hacimsel etkinliğinde süpernatant için katkı sağlamamaktadır ve etkin bir biçimde salgılanan gösterir. Bu nedenle, daha yüksek gliserol konsantrasyonları düşük gliserol bakliyat görünüşte biyokütle yerine hedef protein üretim ve sürekli düşük gliserol yayın daha fazla iki kat daha yüksek özel verimlilik için liderliğindeki oluşumu lehine.
Başka bir deneme de-bastırılmış ifade yöntemle contalı profillerde PDFkontrol altında insan büyüme hormonu (hGH) ifade ederek yapıldı. Yapı stabil P. pastoris zorlanma BSYBG11 genom entegre edildi. Burada, BYPG, 50 mL arabelleğe alınmış zengin Orta, 250 mL şaşkın sallamak şişeler kullanıldı % 0,3 (w/v) gliserol ile karbon kaynağı bir toplu iş olarak. Gliserol tükenmesi sürekli gliserol yem protein ifadesiyle 4 şişe diskler yem ve yem (Şekil 2) hiçbir gliserol karşılaştırıldığında eklenmesiyle sağlanmış.
Şekil 2 hGH ifade ve ekili ve sürekli gliserol yem olmadan aynı soy biyokütle gelişimi arasında karşılaştırma gösterir. Tahlil sandviç ELISA HRP için erimiş ikincil antikor ile kullanılan ve algılama gerçekleştirildiği 3,3′, 5, 5 '-tetramethylbenzidine (TMB) substrat olarak ile. Özellikle bu protein, kasanın yanında besleme, bu bozulma olabilir, ancak herhangi bir besleme olmadan hücreleri üretilen protein yaklaşık 30 h (ışık mavi kareler), sonra aşağılamak başlar engelledi (koyu mavi üçgen) gibi görünüyordu ve hatta protein konsantrasyonu biyokütle başına hala ekimi 150 h sonra arttı. Hansenula polymorpha14olarak pek gözlenen zaten, bu sonucu nasıl P. pastoris arazisi optimize edebilirsiniz genellikle sallamak şişesi ölçekte, beslenen-toplu modu için kullanılır gibi toplu iş, geçiş gösterir.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/58589/58589fig1.jpg"> Şekil 1: görselleştirme Online sırasında iki arazisi ile farklı gliserol konsantrasyonları toplu iş parametreleri kaydedildi. Arazisi % 0,5 w/v(a)ve % 0,3 w/v (B) gliserol toplu iş başına şişesi 4 besleme diskler uygulayarak beslenen nerede hücreleri de-baskı aşaması gelir ile başlanmıştır (Yayın oranı 0.5 mg/h/disk üreticiye göre). Sürekli satırlar hücre yoğunluğu (OD600) gösterir, ancak kesik çizgiler ortamda oksijen konsantrasyonu göster. Hata çubukları altı standart sapması çoğaltır (2 biyolojik, üç teknik her) gösterir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/58589/58589fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/58589/58589fig2.jpg"> Şekil 2: toplu iş ve beslenen-toplu iş modunda insan büyüme hormonu (hGH) ifade karşılaştırılması. hGH içerik 405 emme değerlerinde belirttiği nm nerede bir HRP fusion 2nd antikor olduğunu ve TMB algılaması için bir substrat kullanılan bir ELISA tarafından. İki farklı kültür için sonuçları gösterilmiştir: ışık mavi çizgi ve kareler görüntü hücre yoğunluğu ve nerede gliserol yem diskler bir kültüre göre toplu sonra herhangi bir yayın olmadan bir kültürün hücre yoğunluğu tarafından normalleştirilmiş hGH konsantrasyonu (koyu mavi çizgiler ve üçgenler) uygulanır. Hata çubukları altı standart sapması çoğaltır (2 biyolojik, üç teknik her) gösterir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/58589/58589fig2large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td rowspan="2">PDC- GOX 160 h ekimi saat</td>
			<td colspan="2">OD600</td>
			<td colspan="2">Vol. etkinlik [U/mL]</td>
			<td colspan="2">salgılanan protein [mg/mL] toplam tutar</td>
			<td>hücre yoğunluğu hacimsel yansıtılmasında</td>
		</tr>
<tr>
<td>Demek</td>
			<td>SD</td>
			<td>Demek</td>
			<td>SD</td>
			<td>Demek</td>
			<td>SD</td>
			<td>Demek</td>
		</tr>
<tr>
<td>BMD1% toplu + gliserol darbe</td>
			<td>74,6</td>
			<td>2</td>
			<td>8.4</td>
			<td>2.4</td>
			<td>0.21</td>
			<td>0,01</td>
			<td>0,11</td>
		</tr>
<tr>
<td>BMD1% toplu + sabit gliserol besleme</td>
			<td>32.5</td>
			<td>0,3</td>
			<td>9,4</td>
			<td>0,7</td>
			<td>0,09</td>
			<td>0,01</td>
			<td>0,29</td>
		</tr>
<tr>
<td>BMD1% toplu</td>
			<td>18,8</td>
			<td>0,6</td>
			<td>3.7</td>
			<td>0,7</td>
			<td>0,01</td>
			<td>0</td>
			<td>0,2</td>
		</tr>
</tbody></table>Tablo 1: de-bastırılmış Düzenleyicinin kontrolü altında metanol bağımsız GOX ifadenin sonuçlarını PDC .

Bu yöntem ilk kez karbon düzenlenir Kaynak Rehberleri P istihdam Pichia pastoris (Komagataella phaffii), verimli indüklenebilir metanol-Alerjik Rekombinant protein üretimi için güvenilir deneysel yordamlar açıklanır DCve PDF küçük ölçekli deneylerde ekimi sırasında parametreleri online izlenebilir ve sürekli gliserol besleme uygulanır.

Metanol bağımsız ifade tarafından de-baskı teknolojilerinden yararlanan Pichia Pastoris

Methanol is a well-established carbon source and inducer for efficient protein production employing Pichia pastoris (P. pastoris) as a host on micro-, lab ...

Bu yöntem, pichia pastoris suşları tarafından kromozomklonlarının ön seçiminde basit bir sallama şişesi ekimi ile bastırılmış koşullar altında rekombinant proteinleri ifade yardımcı olabilir ölçekleme önce. Bu tekniğin en büyük avantajı, önemli yetiştirme parametrelerinin tam online izlenmesi ile desteklenen Pichia pastoris kullanılarak yüksek düzeyde metanolsüz protein ekspresyonuna ulaşılabiliyor olmasıdır. Genel olarak, bu yönteme yeni başlayan bireyler, cam yetiştirme yemi başlatma nın zaman noktasının belirli üretim geriliminin büyüme özelliklerine uyarlanması gerektiği için mücadele edebilirler.Ana kültürü kurmadan önce, 50 ml konik bir tüp te maya pepto ve dekstroz suyu 5 ml içine ilgi ifade gerginlik tek bir taze koloni tohum. Uygun havalandırma sağlamak için kapağı biraz açık bırakın. Than, 28 santigrat derece, % 80 nem ve 100-130 RPM gecede bir shaker kültür yerleştirin.Ertesi sabah Bluetooth üzerinden cihazları bağlamak için yazılım başlatın. Ardından, cihaza bluetooth bağlantısını açmak için biyokütle ölçüm cihazının önündeki gümüş düğmeye basın ve bilgisayar izleme yazılımındaki cihazları bul'a tıklayın. Bulunan aygıtları ölçü tepsisindeki karelere sürükleyin ve bırakın ve bağlan'ı tıklatın.Başarılı bir bağlantı yapıldığında, bir denetim ekranı görüntülenir. Deneme ayarlamak için, başlangıç ölçümü'nü tıklatın. Denemeyi adlandırın ve izleme için gereken tüm parametrelerin etkin olup olmadığını kontrol edin.Aralığı üç dakikaya, ortalama ölçüm puanını 11'e ayarlayın. Örneklerin adlarını girin ve açı kalibrasyonundan atlayın. 600 nanometre dalga boyunda bir spektrofotometrede bir ila yirmi oranında seyreltilmiş gece kültürünün hücre yoğunluğunu ölçün.05 bir OD 600 gece kültürü ile orta 50 ml aşılamak. Daha, beş dakika boyunca 28 santigrat derece, 130 RPM ve% 80 nem de dedektörleri şişeleri yerleştirin. Yazılımda başlangıç ölçümü'nü tıklatın.Aşılamadan dört saat sonra, hücre yoğunluğu ölçümü için sadece gösterildiği gibi 2 ml'lik bir numune kullanın. Oksijen konsantrasyonu sıfıra yaklaşırken ve hücreler üstel büyüme aşamasında steril koşullar altında her şişe için dört gliserol besleme diskleri ekleyin. Daha fazla, ek bir 60 ila 90 saat için sallayarak kuluçka için şişeleri geri dönün.Hücre yoğunluğunu ve protein ekspresyonunu seçerek izlemek için her 24 saatte bir numune alın. Ekimin sonunda, santrifüj için 50 ml konik tüpler içine kültürleri aktarın. Daha fazla analiz için çevrimiçi ölçüm verilerini yazılımdan elektronik tablo dosyası olarak dışa aktarın.Bu temsili ekimde, başlangıç gliserol konsantrasyonu oldu 5%Biyokütle katlanarak artarken yem diskleri eklendi rağmen, oksijen neredeyse sıfıra düştü. Düşük gliserol konsantrasyonları kısa süreli oksijen sınırlamaları etkisini azalttı ve bu nedenle de-bastırılmış protein ekspresyonu için tavsiye edilir. Gliserol tükenmesi üzerine bastırılmış bir karbon kaynağının kontrolü altında insan büyüme hormonunun ifade edildiği bu temsili deneyde, şişe başına dört yem diski eklenmesiyle protein ekspresyonu sağlanmıştır.Beklendiği gibi insan büyüme hormonu ekspresyonu ve biyokütle gelişimi gliserol yem disklerinin varlığında zaman içinde arttı, protein ekspresyonu zamanla azaldı ve biyokütle gliserol takviyesi yokluğunda sabit kaldı. Bu yordamı çalışırken, en iyi ifade başlangıç saatini belirlemek için yetiştirme parametrelerini dikkatle gözlemleyip hatırlamayı unutmayın. Bu prosedürütaki protein konsantrasyonu tayini batı leke analizi veya aktivite tahlilleri gibi diğer yöntemler protein verimi değerlendirmesi için yanı sıra küçük ölçekli biyoreaktör deneyleri daha büyük bir ölçekte bireysel zorlanma performansı hakkında ek sorulara cevap için yapılabilir.Geliştirilmesinden sonra, bu teknik pichia pastoris yaygın olarak kullanılan metanol bağımlı AOX1 organizatörü için umut verici bir alternatif keşfetmek için metanol serbest rekombinant protein ekspresyonu alanında araştırmacılar için yol açtı.

methanol-independent-expression-pichia-pastoris-employing-de

Research

JoVE Journal

Bioengineering

Biyomühendislik

Protokol Metilotropik maya kullanarak protein ekspresyonu açıklar.

Rekombinant Proteinlerin Metilotropik maya İfade Pichia pastoris</em

Petrol kirliliğinin iyileştirilmesi için bakteriyel sistemini düzenleyen sürdürülebilir bir otomatik standart değiştirilebilir DNA parçalarının (BioBricks) kullanılarak tasarlanmıştır. Bir...

Sulu Ortamlarda Hidrokarbon Dönüşüm Enable A Toolkit

Bu beş günlük protokolü bütün adımlar, ekipman, ve esaslı etkili endojen Escherichia coli sıfırdan TX-TL hücre serbest ifade sistemi oluşturmak ve çalıştırmak için gerekli ek yazılım özetliyor. Reaktif ile protokol 8 kurulumu için saat veya daha az bir tepki toplamak ve işlem verileri alır.

Bir uygulama için Protokoller Escherichia coli Tabanlı TX-TL Hücre-Özgür İfade Sistemi

Burada, gelişmiş gen delesyon verimliliği için Yarrowia lipolytica Po1g suşunun moleküler genetik manipülasyonuna ilişkin yöntemleri rapor ediyoruz. Elde edilen mühendislik ürünü Y. lipolitica suşları, biyoyakıt ve biyokimyasal üretimde potansiyel uygulamalara sahiptir.

Yenilenebilir Biyoyakıt ve Biyokimyasal Üretim için bir Sıradışı Maya Genetik Mühendisliği

Bu çalışma, pMGX plazmid sistemini kullanarak Escherichia coli'de tek bir plasmidden çoklu genlerin T7 aracılı co-ekspresyonu için yöntemleri açıklamaktadır.

İndüklenebilir T7 RNA Polimeraz aracılı Çok Boylu İfade Sistemi, pMGX

Mutagenesis site yönettiği belirli mutasyonların Deoksiribonükleik asit (DNA) tanıtmak için kullanılan bir tekniktir. Bu iletişim kuralı site yönettiği mutagenesis ile 2 adım nasıl açıklar ve ilgi herhangi bir DNA parçası geçerlidir yaklaşım 3 adımlı polimeraz zincir tepkimesi (PCR) dayalı.

Site yönettiği Mutagenesis in Vitro ve Escherichia Coli etkileşimlerde RNA ile örneği Vivo deneyler için

Bu iletişim kuralı canlı hayvan veya gelişmiş lac önleyici ve/veya tet harekete geçirmek sistemleri kullanarak hücreleri içinde ilgi endojen bir gen transkripsiyonu koşullu olarak kontrol edilebilir bir modeli sistemi oluşturmak için gereken adımları açıklar.

Uzaktan kumandalı sistem in vivo uygulama için işleme endojen gen ekspresyonu

Baculovirüs ekspresyon vektör sistemi (BEVS), biyokimyasal, biyofiziksel ve yapısal çalışmalarda kullanılacak protein arginin metiltransfenazlarının (PRMT) ekspresyon taraması ve üretimi için sağlam bir platformdur. Milligram miktarda malzeme, ökaryotik bir ifade platformu gerektiren PRMT'lerin ve diğer ilgi proteinlerinin çoğunluğu için üretilebilir.

Baculovirüs Ekspresyon Vektör Sistemi Kullanılarak Rekombinant PRMT Proteinlerinin Üretimi

Mikrobiyal metabolizmanın optogenetik kontrolü, fermantasyon süreçleri üzerinde esnek dinamik kontrol sağlar. Buradaki protokol, farklı hacimsel ölçeklerde kimyasal ve protein üretimi için mavi ışık ayarlı fermantasyonların nasıl kurulacağını göstermektedir.

Mikrobiyal Kimyasal ve Protein Üretimi için Işık Kontrollü Fermantasyonlar

Bu çalışma, Schizosaccharomyces pombe'de çok kopyalı baskılayıcı genetik ekran için bir protokolü açıklamaktadır. Bu ekran, bir sorgu mutant suşu ile ilişkili bir fonksiyon kaybı fenotipinin baskılayıcı klonlarını tanımlamak için genom çapında bir plazmid kütüphanesi kullanır. Bu ekran kullanılarak ell1 null mutantının yeni genetik baskılayıcıları tanımlandı.

Şizosakkaromices pombe'de Multicopy Suppressorların Tanımlanması için Genetik Ekran

Burada, yüksek, uzun vadeli, kararlı, hedefe yönelik susturma verimliliğine ve düşük genom çapında, hedef dışı aktiviteye sahip tasarlanmış transkripsiyonel baskılayıcıların (ETR'ler) in vitro seçimi için bir protokol sunuyoruz. Bu iş akışı, aday ETR'lerin başlangıçtaki karmaşık repertuarını, terapötik olarak ilgili ortamlarda daha fazla değerlendirme için uygun olan kısa bir listeye indirgemeye olanak tanır.

In Vitro Hedeflenen Epigenetik Susturma için Tasarlanmış Transkripsiyonel Baskılayıcıların Seçimi

Öğrenin, Pichia pastoris kullanarak metanol bağımsız rekombinant protein üretimi için küçük ölçekli kültür koşullarını optimize etme yöntemini. Bu teknik, kromozom klonlarının ön seçimini kolaylaştırır ve yüksek verimli protein ifadesi sağlar.

Metanol bağımsız ifade tarafından de-baskı teknolojilerinden yararlanan Pichia Pastoris

Daha fazla video keşfet