-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

TR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

tr_TR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Environment
Colletotrichum fioriniae Su ve kloroform tabanlı yaban mersini ve kızılcık çiçek özleri ...
Colletotrichum fioriniae Su ve kloroform tabanlı yaban mersini ve kızılcık çiçek özleri ...
JoVE Journal
Environment
This content is Free Access.
JoVE Journal Environment
Colletotrichum fioriniae Development in Water and Chloroform-based Blueberry and Cranberry Floral Extracts

Colletotrichum fioriniae Su ve kloroform tabanlı yaban mersini ve kızılcık çiçek özleri kalkınma

Full Text
8,364 Views
12:32 min
April 12, 2019

DOI: 10.3791/58880-v

Timothy J. Waller1, Joshua D. Gager1, Peter V. Oudemans1

1Department of Plant Biology, P. E. Marucci Center for Blueberry and Cranberry Research and Extension,Rutgers University

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This protocol outlines bioassays to monitor the development of the fungal pathogen Colletotrichum fioriniae using floral extracts from blueberries and cranberries. It details extraction techniques and their application in studying pathogen dynamics.

Key Study Components

Area of Science

  • Plant Pathology
  • Microbiology
  • Ecology

Background

  • Colletotrichum fioriniae is a significant pathogen affecting plants.
  • Understanding its development can help in managing plant diseases.
  • Floral extracts may influence pathogen behavior.
  • Monitoring techniques are essential for real-time assessments.

Purpose of Study

  • To evaluate the effects of floral extracts on pathogen development.
  • To develop a cost-effective method for studying plant-pathogen interactions.
  • To enhance understanding of natural stimulants affecting fungal growth.

Methods Used

  • Preparation of spore suspensions from cultured C. fioriniae.
  • Extraction of floral compounds using chloroform and water.
  • Deployment of rainwater collection devices for natural sampling.
  • Microscopic examination of conidia and appressoria on glass coverslips.

Main Results

  • Successful extraction of floral compounds demonstrated.
  • Real-time monitoring of pathogen response to floral extracts achieved.
  • Variability in pathogen development based on extract type observed.
  • Methodology validated for future studies on plant pathogens.

Conclusions

  • The protocol provides a reliable framework for studying C. fioriniae.
  • Floral extracts can significantly impact pathogen dynamics.
  • Future research can build on these findings to explore other pathogens.

Frequently Asked Questions

What is Colletotrichum fioriniae?
Colletotrichum fioriniae is a fungal pathogen that affects various plants, particularly during their bloom phase.
How are floral extracts prepared?
Floral extracts are prepared using chloroform or water-based extraction techniques to isolate compounds from flowers.
What is the significance of monitoring pathogen development?
Monitoring pathogen development helps in understanding disease dynamics and can inform management strategies.
What equipment is needed for this protocol?
Essential equipment includes culture dishes, centrifuge tubes, and a microscope for examining samples.
Can this method be applied to other pathogens?
Yes, the methodology can be adapted to study other plant pathogens beyond Colletotrichum fioriniae.
What temperature is optimal for incubating samples?
Samples should be incubated at 25 degrees Celsius in the dark for optimal results.
How are results quantified in this study?
Results are quantified by counting conidia and appressoria under a microscope after treatment.

Burada, BİYOANALİZLER bir mantar patojen, Colletotrichum fioriniae, yaban mersini yoksa yabanmersini çiçek özleri cam coverslips Tarih huzurunda gelişimini izlemek için tasarlanmıştır açıklanmıştır. Su - kloroform-, dayanarak ve alan yağmur suyu - çiçek çıkarma teknikleri bu bilgileri uygulanabilir nasıl fikir yanı sıra ayrıntılı olarak açıklanmıştır.

Bu protokol, Colletotrichum fiorniae ve dönem çiçek enfekte diğer bitki patojenleri florokimyasal ipuçları zamansal dinamikleri değerlendirmek için ucuz ve uyarlanabilir bir sistem sağlar. Yeni zemin yağmur suyu toplama cihazları, kullanıcının doğal uyarıcıları ve patojen gelişimini etkileyen koşulları neredeyse gerçek zamanlı siteye özgü bir şekilde izlemesini sağlar. Bu yordamı, metin protokolünde açıklandığı gibi doğal olarak enfekte olmuş bir ana bilgisayardan Colletotrichum fiorniae kültürüyle başlatın.

Koloniler sporulate başladığında, başka bir V 8 Suyu agar üzerine bir yüksek yoğunluklu sporlama kültürü üretmek için hücre kültürü çanak içeren çizgi conidia. Büyüme yedi gün sonra, hafifçe conidial kitle döngü dokunarak yüksek yoğunluklu kültürden konidia küçük bir miktar toplamak için standart bir steril döngü kullanın. Steril deiyonize su 10 mililitre içeren 15 mililitrelik santrifüj tüp içine karıştırın.

Bu numuneyi 10 saniye boyunca girdaplayın. Standart bir pipet kullanarak, numuneyi daha fazla karıştırmak için defalarca yukarı ve aşağı daldırın. Daha sonra girdaplı numunenin bir damlasını hemositometrenin üzerine yerleştirin ve spor konsantrasyonlarını tahmin edin.

Beş mililitrelik son hacmi ile steril distile su mililitre başına 0,1 milyon conidia konsantrasyonu ayarlayın. Bu spor süspansiyon olarak adlandırılır ve sadece hemen önce her iki bioassay kullanmak için yapılır. Kloroform bazlı çiçek ekstraksiyonu gerçekleştirmek için tüm bileşenleri iki kez %95 etanol ile temizleyin.

Daha sonra her ekstraksiyon için kontaminasyonu önlemek için bileşenleri kloroform ile iki kez temizleyin. PTFE kaplı kapakları kloroform la temizlemeyin, çünkü bu kapaklar onlara zarar verir. Temizlendikten sonra, baş aşağı kuruması için bileşenleri bir kenara koyun.

Çiçek ve daha sonra kloroform ekleyerek bir beher dokuz parça kloroform bir parçası işlenmiş çiçekler birleştirin. Yavaşça 30 saniye boyunca girdap ve ikinci kabın içine paslanmaz çelik bir ekran ile süzün. İkinci kabın kloroform bazlı ekstresini cam kültür tüpüne dökün ve PTFE kapağını yapıştırın.

Buharlaşmayı önlemek için kapağı parafilmle sarın. Deneysel kullanıma kadar dört santigrat derecede ışık bozulmasını azaltmak için karanlıkta ortaya çıkan kloroform bazlı çiçek ekstresi saklayın. Çoğaltmasağlamak için çıkarmaları birden çok örnekle tekrarlayın.

Seçili her konum için bir toplama aygıtı oluşturmak için, bir püskürtme kabının altında delik açmak için matkap presine bağlı bir adım biti kullanın. Sonra sprey fincan ağzına deliğin üstünden düz bir çizgi kesti. Şimdi sprey kabın ağzında plastik kaplı tel iplik için yeterince büyük dört eşit uzaklıklı delik matkap.

Plastik kaplı tellerin bir ucunu serbest bırakarak takın. 50 mililitrelik bir santrifüj kapağı içine boya spreyveya fincan adaptörü iplik için yeterince büyük bir delik delin. Sızdırmayı önlemek için adaptör ipliklerini parafilm ile kapatın.

Bunu hem santrifüj kapağına hem de püskürtücü kabın dişli kısmına takın. Sonra çiftleştirilmiş 50 milimetrelik santimetrelik santimetrelik tüp ekleyin. Örnekleme konumu başına dört toplama aygıtı oluşturun.

Püskürtücü bardakları saplara sığacak şekilde esneterek cihazları seçili konumlara dağıtın. Püskürtücü kabının kesilmiş tarafını, diğer saplara bağlı plastik kaplamalı telleri kullanarak yukarı doğru yönlendirin. Bu çiçekler üzerinden geçen su yakalanır sağlar.

Kızılcık çiçeklerinden yağmur suyu toplamak için, ilk ısı bir metal sonda kullanarak hunin ağız etrafında sekiz eşit uzaklıkta delik delinme. Deliklerden dördüne büküm bağları yerleştirin. Diğer uçları o deliğin zıt konumuna takarak düzgün bir geçiş deseni oluştur.

Huniyi parafilm ile buhara sarın ve bir kenara koyun. Huniyi 50 mililitrelik bir santrifüj kapağına bir adım ucuyla sokacak kadar büyük bir delik aç. Hazırlanan huniyi santrifüj kapağına takın.

Yağış veya havai sulama sonra, kaldırmak ve santrifüj tüp alt tüp kısmı değiştirin. Yağmur suyu toplama tüpleri, bakteri ve diğer mantarlar gibi akıntıda harekete geçen doğal kirleticilerden bozulmaya yatkın oldukları için ıslatma olaylarından sonra hızlı bir şekilde değiştirilmelidir. Kültür yemekleri içinde kağıt diskler iki kat yerleştirin ve steril distile su iki mililitre ile ıslatın.

Daha sonra, iki mililitremikrosantrifüj tüpler steril distile su ve su bazlı çiçek ekstresi eşit hacimlerde karıştırın. Daha sonra hazırlanan iki mililitrelik mikrosantrifüj tüplere spor süspansiyonunun eşit hacimlisini ekleyin. Ortaya çıkan hazırlık sulu bir tedavi karışımı olarak adlandırılır.

Kontrol için, çiçek özü kısmını atlayın ve conidial konsantrasyonları tutarlı tutmak için steril distile su ile değiştirin. Şimdi hücre kültürü çanak içinde ıslatılmış kağıt havlu üstüne önceden temizlenmiş cam kapakları yerleştirin. Bir coverslip merkezine sulu tedavi karışımı bir 40 mikrolitre damlacık yerleştirin.

Kontrol de dahil olmak üzere istenilen tedaviler için bunu tekrarlayın. Sonra hücre kültürü çanak kapatın. Tüm tedaviler ve çoğaltmalar dağıtıldıktan sonra, tüm çoğaltılmış hücre kültürü yemeklerini kapalı plastik bir kap içine yerleştirin ve karanlıkta 25 santigrat derecede kuluçkaya yatırın.

Önceden belirlenmiş zaman noktalarında, büyümeyi durduran ve dağı yarı koruyan damlacıklara 10 mikrolitre fiksatif ekleyin. Bir fiksatif eklendikten sonra, mikroskobik incelemeyi kolaylaştırmak için kapakların her birini cam mikroskop kaydırağı üzerine yerleştirerek dikkatlice ters çevirin. Tüm kapaklar cam mikroskop slaytlar üzerinde olduğunda, yerleşmek ve kısmen 20 dakika boyunca akış kaputunda kuru maya bırakın.

Primer konidia, çimlenmiş konidia ve yeni oluşan ikincil konidia ve appressoria dahil olmak üzere kapak ta mevcut tüm conidia mevcut saymak. 3.808 milimetrelik bir alanı 400 kez büyütme veya 200 kez toplam çalışma. Bir laminar akış kaputunda, iki mililitrelik mikrosantrifüj tüpüne iki eşit hacimli steril distile su ve bir hacim spor süspansiyon ekleyin.

Kloroform bazlı çiçek özü bioassays için kenara bu sulu tedavi karışımı ayarlayın. Bir duman başlık içinde, hazırlanan plastik hücre kültür çanak içinde bir cam coverslip üzerine bir Van T Cell yerleştirin. Hücrenin ortasına istenilen kloroform bazlı çiçek ekstresinin 33 mikrolitresini dağıtın ve kurumasını bekleyin.

Hücrenin duvarlarına dokunmayın. Kontrol tedavisi için, bakire kloroform ekleyin. Kloroform bazlı çiçek özü kuruduktan sonra, van T Hücresi'nin merkezine standart bir pipet ile hazırlanan sulu arıtma karışımının 99 mikrolitresini dağıtın.

Sonra tüm hücre kültürü yemekleri kapatın ve kuluçka. Önceden belirlenmiş zaman noktalarında, Van T Hücresine 15 mikrolitre fiksatif ekleyin ve yeterli mantar lekesi sağlamak için en az beş dakika bekleyin. Bu süre sonunda Van T Hücresini dikkatlice çıkarın.

Coverslip ters çevirme ve veri toplama adımlarını eskisi gibi gerçekleştirin. 24 saat sonra aşılama da C.fiornia mikroskobik değerlendirilmesi üzerine, steril distile su varlığında konidia karşılaştırma su bazlı çiçek ekstresi ikincil konidiyasyon ve appressoryum oluşumunda dramatik bir artış ortaya koymaktadır. Ancak, kloroform biyoassay steril distile su kontrolü kloroform bazlı özler karşılaştırırken ikincil konidiasyon olarak belirgin değildi.

Bunun yerine, C.fiorniae büyüme appressorial oluşumudoğru kaymıştır. Bu testte, steril distile su kontrolü ve kızılcık kloroform bazlı çiçek ekstraksiyonları görsel olarak sıfır, altı, 12 ve 24 saat sonra aşılama denetlenmiştir. Appressoryum oluşumu kloroform bazlı çiçek ekstresi altı saat başladı ve sürekli sonraki zaman noktaları boyunca arttı.

Bu sonuç, çiçeklerenfeksiyon yapıları oluşturmak için gerekli süreyi azaltmak bulgu destekler. Meyve çürüyen mantarlar için hastalık yönetimi genellikle çiçek zaman fungisit uygulamaları içerir. Burada, kızılcık birden fazla büyüme aşamalarında kızılcık kloroform bazlı özler görsel c.fiorniae üzerinde etkili yüzey mumlar için değerlendirildi 24 saat sonrası aşılama.

Haziran ayında toplanan yumurtalıklar, Temmuz ayında toplanan olgunlaşmamış meyveler ve Ağustos ayında ekim ayında toplanan meyveler ve steril distile su kontrolü appressorial oluşumu için denetlendi. Yumurtalık kloroform bazlı ekstreler, C.fiorniae yaşam döngüsünde çiçeklenmenin önemini gösteren appressorial formasyonun en büyük büyüklüğüne sahipti. Patojen bu protokolün en önemli bileşenidir.

Mantarlar denemeler arasında tutarlılık korumak için rutin taze medya taşınmalıdır. Kloroform ile herhangi bir çalışma güvenlik nedenleriyle bir duman başlık içinde yapılmalıdır. Bu malzeme ve cam hazırlanması, ekstraksiyon prosedürleri ve kloroform bazlı biyoassay iletkeniçerir.

Zaman noktaları, patojenler, çiçek yağmur suyu koleksiyonları veya konak ekstraksiyon kombinasyonları çeşitli konak-patojen etkileşimleri değerlendirmek için kullanılabilir. Yağmur suyu toplama cihazları ve ilgili bioassays başkalarının çok sayıda yol sistemlerinde yağmur olayları sırasında seferber ev sahibi uyarıcılar ile çalışmak sağlayacaktır.

Explore More Videos

Çevre Bilimleri sayı: 146 Colletotrichum patojen biyoloji çiçek stimülasyon çiçek özleri bloom kloroform ayıklama coverslip bioassay yağmur suyu izleme yüzey Vakslar ikincil conidiation appressoria karar verme araçları

Related Videos

Otobur bağlı Blueberry uçucu ve Intra-bitki Sinyalleşme

10:28

Otobur bağlı Blueberry uçucu ve Intra-bitki Sinyalleşme

Related Videos

16.9K Views

İnce tabaka kromatografi (TLC) Ayırımı ve bitki özleri Biyodenemeler Antimikrobiyal Bileşikler tanımak

12:04

İnce tabaka kromatografi (TLC) Ayırımı ve bitki özleri Biyodenemeler Antimikrobiyal Bileşikler tanımak

Related Videos

69.7K Views

HPLC Ölçümleri dayanarak Yakın kızılötesi Spektroskopisi Yaban mersini içinde Hammadde İçeriği tahribatsız Tahmininde Modellerinin İnşaatı

10:25

HPLC Ölçümleri dayanarak Yakın kızılötesi Spektroskopisi Yaban mersini içinde Hammadde İçeriği tahribatsız Tahmininde Modellerinin İnşaatı

Related Videos

11.3K Views

Dondurularak Kurutulmuş Berry Tozundan Polifenollerin Vasküler Düz Kas Hücrelerinin Tedavisinde Ekstraksiyonu ve Saflaştırılması In vitro

12:00

Dondurularak Kurutulmuş Berry Tozundan Polifenollerin Vasküler Düz Kas Hücrelerinin Tedavisinde Ekstraksiyonu ve Saflaştırılması In vitro

Related Videos

20.1K Views

Metaorganizma Araştırma ve Koruma için Biyoremediasyon ve Probiyotikler Gelişimi için Mikrobiyal Suşların Prospektileri

09:49

Metaorganizma Araştırma ve Koruma için Biyoremediasyon ve Probiyotikler Gelişimi için Mikrobiyal Suşların Prospektileri

Related Videos

23.3K Views

Diş Çürüklerini Önlemek İçin Bitkilerin Özlerinden ve Fraksiyonlarından Yeni Antimikrobiyal ve Antibiyofilm Moleküllerini Tanımlamak için Sistematik Yaklaşım

08:20

Diş Çürüklerini Önlemek İçin Bitkilerin Özlerinden ve Fraksiyonlarından Yeni Antimikrobiyal ve Antibiyofilm Moleküllerini Tanımlamak için Sistematik Yaklaşım

Related Videos

7K Views

Hücresel Düzeyde Mantar-Mikrobiyal Etkileşimleri Probalamak için Mikroakışkan Araçlar

08:19

Hücresel Düzeyde Mantar-Mikrobiyal Etkileşimleri Probalamak için Mikroakışkan Araçlar

Related Videos

4.4K Views

Mikoheterotrofik Bitkilerde Endofitik Mantarları Tanımlamak için İzolasyon, Karakterizasyon ve Toplam DNA Ekstraksiyonu

06:53

Mikoheterotrofik Bitkilerde Endofitik Mantarları Tanımlamak için İzolasyon, Karakterizasyon ve Toplam DNA Ekstraksiyonu

Related Videos

4.4K Views

Tarladaki olgunlaşmamış tefritid meyve sineklerini tespit etmek için meyve özü elemek

04:21

Tarladaki olgunlaşmamış tefritid meyve sineklerini tespit etmek için meyve özü elemek

Related Videos

2.6K Views

Chromobacterium violaceum'da violacein miktarının belirlenmesi ve biyoaktif bileşikler tarafından inhibisyonu

07:13

Chromobacterium violaceum'da violacein miktarının belirlenmesi ve biyoaktif bileşikler tarafından inhibisyonu

Related Videos

1.9K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code