Protein kompleksleri milisaniyelik zaman ölçekte dinamikleri çalışmaya vitro Floresans rezonans enerji transferi içinde kullanma

Yöntemimiz bir protein kompleksi oluşumunun kinetik çalışmasına yardımcı olur. Bir protein kompleksinin ne kadar sıkı olduğunu ve protein kompleksinin diğer proteinler tarafından müdahale edilip edilebiş olmadığını açıklar. Bu teknik, bir muhabir olarak floresan kullanarak nicel bir şekilde protein-protein etkileşimi incelenmesini sağlar, bizim tsözde gerçek zamanlı olarak bir protein kompleksinin ilişki ve ayrışma izleyebilirsiniz.

Başlamak için, protein veritabanından COL1 CAND1 kompleksi için veri ile başlayan FRET titresini tasarlayın. PyMOL'daki yapıyı yükleyin ve ardından sihirbaz menüsüne gidin ve CAND1'in ilk amino asidi ile COL1'in son amino asidi arasındaki mesafeyi tahmin etmek için ölçüm işlevini kullanın. Daha sonra, online spektrum görüntüleyici yükleyin ve aynı anda 7-amino-4-methylcoumarin ve FlASH uyarma ve emisyon spektrumları görüntülemek.