Name: Ücret belirlenmesi- ve Polyfluorinated kimyasal türler ile kombine hedef ve hedef tarama olmayan yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi iş akışı (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-04-18T14:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 4 s
Description: Öğrenin, su örneklerinde PFAS bileşiklerinin hedefli ve hedefsiz yüksek çözünürlüklü kütle spektrometrisi ile kantitatif analizi ve yeni kirleticilerin keşfi için kapsamlı bir yöntem.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

ABD Çevre Koruma Ajansı kendi Office araştırma ve geliştirme, yoluyla finanse ve burada açıklanan araştırma yönetilir. Bu belge ABD Çevre Koruma Ajansı, Office araştırma ve geliştirme tarafından gözden geçirilmiş ve onaylanmış yayın için. Bu makalede görüşler yazarlar ve gösterim veya ABD Çevre Koruma Ajansı politikalarını temsil değil. Bu araştırma kısmen bir randevu için ulusal pozlama araştırma laboratuvarı için bilim ve eğitim yoluyla arasında kurumlararası anlaşma DW89992431601 Oak Ridge Enstitüsü tarafından yönetilen doktora sonrası araştırma programı tarafından desteklenen ABD Enerji Bakanlığı ve ABD Çevre Koruma Ajansı.

1. su örnekleri toplanması
<ol><li>PFAS standart hisse senetleri hazırlanması<ol>
<li>Faiz (PFOA, patlama, HFPO-DA) 1 ng/µL herhangi bir hedeflenen bileşikler içeren metanol bir PFAS standart karışımı hazırlayın. Yerli PFAS karışımı bu. Ticari olarak hazırlanan karışımlar are da elde edilebilir (yani, PFAC Mix A ve Mix B).</li>
		<li>(SIL) PFAS bileşikler (örn., 13C4- PFOA, 13C8- patlama, 13C3- HFPO-DA) etiketli eşleşen kararlı izotop içeren standart bir karışım 1 ng/µL hazırlayın. OLDUĞUNU PFAS karışımı bu. Ticari olarak hazırlanan karışımlar are da elde edilebilir (yani, MPAFC Mix A ve Mix B). Not: hedeflenen PFAS SIL sürümü yoksa, bir vekil benzer yapısı ve zincir uzunluğu ile kullanılabilir (örneğin, 13C2- PFHxA HFPO-DA için)</li>
	</ol>
</li>
	<li>Hazırlık, alanın boş (FB), Spike boş (SB) örnekleri<ol>
<li>İki doldurun, temiz yüksek yoğunluklu polipropilen (HDPE) veya 1000 mL ile polipropilen (PP) şişe laboratuvar (DI) su, PFAS ücretsiz olarak bilinen deiyonize. Dikkat: PFAS malzeme sık sık toksisite ve/veya carcinogenicity tanımlanmamış. Standartlar ya da hisse senedi çözümleri için sözlü veya dış görünüm maruz önlemek için özen gösterilmelidir.</li>
		<li>PFAS standart karışımı bir miktar son konsantrasyonu beklenen örnek konsantrasyonları (örneğin, 100 ng/L) eşdeğer, şişelerden birine ekleyin. Spike boş (SB) bu.</li>
		<li>5 mL % 35 nitrik asit koruyucu Spike boş olarak ekleyin.</li>
		<li>SB örnek ve unspiked alanı boş olarak denetimlerini örnekleme konuma taşır.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Alan örnekleme Not: Örnek toplayıcı nitril eldiven ve örnek akan sistemlerden mümkünse giymelisin. Musluk örnekleri akışı ve (2-3 dk) örnekleme önce equilibrate izin verilmemeli.<ol>
<li>500-1000 mL su temiz HDPE veya PP şişedeki alan konumdan toplamak.</li>
		<li>5 mL % 35 nitrik asit koruyucu örnek şişeleri ve alanı boş ekleyin. Dikkat: aşındırıcı ve güçlü bir oksitleyici nitrik asit olduğunu</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. örnek çıkarma
Not: Her yerde ve sürekli PFAS. Tüm çözücüler ve en yüksek notu ve düşük düzey PFAS kirlenme için analiz emin olun. Boşlukları ve örnekleri hazırlamadan önce standartları hazırlamak için kullanılan tüm labaratuar donanımları iyice durulayın.
<ol><li>Örnek Önarıtma<ol>
<li>Her örnek bir ayrı, önceden temizlenmiş 1 L HDPE mezun silindir ve kayıt tam birim dökün.</li>
		<li>10 mL metanol boşalttı örnek biberondan ekleyin, o kap ve adsorbe PFAS şişe iç iyi durulama için sallamak.</li>
		<li>Ölçülen su örneği methanolic durulama durulanır şişeyle geri dönün.</li>
	</ol></li>
	<li>Nefelometri için standart eğri<ol>
<li>Sekiz, doldurmak DI PFAS ücretsiz su ile 1 M HDPE/PP şişe.</li>
		<li>İstenen Nefelometri aralığı kapsayan sekiz eşit aralıklı konsantrasyonları seçin. Örneğin: 10, 25, 50, 100, 250, 500, 750 ve 1000 ng/L 10-1000 ng/l bir dizi için</li>
		<li>2.2.2 en son PFAS konsantrasyonlarda vermeye her şişe bir miktar yerli PFAS karışımı ekleyin (örneğin, 100 µL PFAS Mix A-DI su 1 litre = 100 ng/L).</li>
	</ol></li>
	<li>İç standart ek Not: Dahili standart (IS) etiketli kararlı izotop yalnızca nicel sonuçları analiz yanı sıra sigara hedefli istenirse gerekli eklenmesidir.<ol>
<li>Orta nokta kalibrasyon eğrisi yaklaşıldığıdır bir konsantrasyon, her örnek için olan PFAS karışımı ekleyin (örneğin, 250 µL olduğu PFAS Mix = 250 ng/L)</li>
	</ol></li>
	<li>Filtrasyon<ol>
<li>Örnekleri GF/A cam elyaf filtreler (47 mm, 1.6 µm gözenek boyutu) nazik vakum altında aracılığıyla önceden temizlenmiş bir 1 L HDPE vakum şişesi filtre.</li>
		<li>Partiküler madde şişede kalırsa, filtre içine ek deiyonize suyla durulayın. Filtrelenmiş su örnek şişe veya katı faz çıkarılması için yeni bir kapsayıcı geri dönmek.</li>
	</ol></li>
	<li>Katı faz ayıklama (SPE) Not: Kartuş toplama açıklanan burada sürekli akış pistonlu pompa kullanır. Mümkün ama değil çok tartışılan bir vakum manifold20 veya bir on-line SPE-LC-MS17 Kur kullanarak konsantrasyon alternatif yöntemlerdir.<ol>
<li>25 mL metanol zayıf anyon exchange (balmumu) kartuşla durumu.</li>
		<li>BALMUMU kartuş ek 25 mL deiyonize su ile durum.</li>
		<li>Pozisyon pompa boru süzülmüş örnek şişelerde çizmek ve SPE kartuşları karşılık gelen örnek adları ile etiket.</li>
		<li>500 akış yoluyla sıvı atık atarak mL kartuş 10 mL/dak (500 mL toplam), sürekli akış hızında aracılığıyla örnek su pompası. Not: Daha büyük veya daha küçük birimlere bağlı olarak beklenen örnek konsantrasyonu konsantre olabilir.</li>
		<li>Pistonlu pompa elüsyon için kartuşu çıkarın. Not: Eğer aynı pompa kullanarak ek örnekleri konsantre, pistonlu pompa 25 mL metanol ile sonraki kartuş denge için yüklemeden önce olarak kopyalanması.</li>
		<li>SPE kartuş için bir vakum manifold aktarmak ve dış cam rezervuar ile donatmak.</li>
		<li>SPE kartuşu ile 25 mM, pH 4.0 sodyum asetat arabellek nazik vakum altında 4 mL sifonu çek. İle akışı atmak. SPE yıkama kartuşu ile tarafsız metanol 4 mL. Not: Tarafsız yıkama kesir belirli Nonyonik kutup analitler bekleniyor Eğer toplanan. Aksi takdirde, atık atmak</li>
		<li>Eluent toplamak için her SPE Kartuş altında 15 mL polipropilen santrifüj tüpü yerleştirin. Örnek 4 mL metanol % 0,1 amonyum hidroksit ile elute.</li>
		<li>Elüsyon tüpü çıkarması ve eluate birim buharlaşma su banyosu biraz yüksek sıcaklıkta (40 ° C) akışında kuru azot altında 500-1000 µL için azaltın.</li>
		<li>Özler-ebilmek var olmak stok analiz oda sıcaklığında önce örnek yoğunlaşmıştır.</li>
	</ol></li>
	<li>Hedeflenen LC-MS/MS Nefelometri<ol>
<li>Örnek seyreltik 100 µL HPLC örnek şişe 2 mM amonyum asetat arabellek 300 µL ile ayıklayın.</li>
		<li>Kalibre ve HPLC ve MS sistemleri üretici yönergelerine göre equilibrate. Not: Arka plan PFAS yaygın olarak algılanır çoğu LC sistemi ve örnek şişe septa floropolimer bileşenlerinin kullanımı nedeniyle. Boşlukları tespit seviyelerinde kullanmadan önce ihmal edilebilir olduğunu doğrulayın. Mümkünse Teflon bileşenleri değiştirmek için LC sistemi modifikasyonu önerilmektedir. LC karıştırma Vana bitişik bir analitik "soygun" sütunu da önerilen29kullanımıdır.</li>
		<li>Standart eğri, örnekler ve enstrümantal drift çalışma değerlendirmek için standart eğri bir ek çoğaltma oluşan bir analitik worklist hazırlayın. Bir örnek worklist Tablo 1' de gösterilen.</li>
		<li>Faiz hedeflenen compound(s) için kurulan LC ve MS yöntemleri kullanarak örnekleri analiz. Örnek LC degrade Tablo 2 ' de gösterilen ve MS yöntem parametreleri Tablo 3 ve Tablo 4gösterilir. Daha ayrıntılı tartışma McCord vd.21' bulunabilir.</li>
		<li>Standart bir eğri analit için iç standart analit konsantrasyon ve pik alanı oranını kullanarak standart örnekleri oluşturmak. İkinci dereceden regresyon formül 1 / x konsantrasyon tahmin9için ağırlık oluşturmak.</li>
		<li>Hazırlanan standart eğrileri ve alan oranı kullanarak her örnek içinde hedeflenen analitler quantitate (standart alan / ALANDIR) her ölçüm için.</li>
		<li>Konsantrasyonu kalibrasyon aralığı aşarsa, orijinal örnek uygun IS konsantrasyon ve konsantrasyon uygun aralığı içine getirmek için yeniden özü ile çivili DI suyla seyreltik.</li>
	</ol></li>
	<li>Sigara hedefli LC-MS/MS veri toplama<ol>
<li>Örnek seyreltik 100 µL HPLC örnek şişe 2 mM amonyum asetat arabellek 300 µL ile ayıklayın.</li>
		<li>Kalibre ve HPLC ve üreticinin yönergelerine uygun yüksek çözünürlüklü MS equilibrate.</li>
		<li>2.6.2 olduğu gibi bir analitik worklist hazırlayın.</li>
		<li>Aracı yazılımını kullanarak, Tablo 5MS/MS. örnek LC degradede toplamak için veri bağımlı modunda geniş bir tarama MS1 yanına LC-MS veri toplamak. Enstrüman ayarlarını daha fazla tartışmak-ebilmek bulunmak Strynar ve ark.30 ve Newton vd.31. Not: Gelişmiş MS/MS için kaliteli veri bağımlı analiz veri işleme, 2.8.1-2.8.8 sonra kalan özelliklerin alt kümesini tercih edilen iyon listesi ile yürütülen olabilir.</li>
	</ol></li>
	<li>Sigara hedef veri işleme Not: Veri analizi ile a geniş sıra-in bilgisayar yazılımı gerçekleştirilebilir ve bu yöntemler rasgele veri kümesinin tek veya en iyi yöntem yansıtmamaktadır. Mümkünse, adımları diğer bilgisayar yazılımı içinde yürütülen olabilir genel bir açıklama sağlayın. Bu el yazması kullanılan örnek veri işleme, Newton ve ark detaylı olarak satıcı özel bir yazılım (yazılım 1 ve yazılım 2) kullanılarak yapılmıştır.31.<ol><li>Moleküler özellik çıkarma kimyasal özellikleri monoisotopic kitleler, saklama süreleri ve kimyasal entegre pik alanları tanımlamak için birkaç açık kaynak yazılım paketleri32,33 veya satıcı yazılım kullanarak gerçekleştirmek özellikleri.<ol>
<li>1. yazılım seçin Ekle/Kaldır örnek dosyaları > Dosyaları Ekle'yi ve ham veri hedef deneyden seçin, sonra Tamam'ıtıklatın.</li>
			<li>Yazılım 1 seçin toplu yinelenen özellik çıkarma > Open yöntemi..... preestablished bir yöntem veya el ile yazılım ayarları düzenlemek için. İlgili özellik çıkarma profinder ayarları Tablo 6' da bulunur.</li>
			<li>Yazılım 1özellik çıkarma sonra seçin Dosya > ihracat CSV dosyası olarak..., Dosya > Aktar CEF..., veya Dosya > Aktar PFA... için daha fazla alay. CEF dosyaları açıklama geri kalanı için kabul edilir.</li>
			<li>Yazılım 2 (MPP) türü tanımlanamayan ve iş akışı türü Veri Alma Sihirbazı ile yeni bir deneme oluşturun ve Tamam' ı tıklatın.</li>
			<li>MPP Veri dosyaları seçin ve dışa aktarılan yazılım 1 sonuçları (CEF veya PFA) almak için; Hizalama parametre seçenekleri görününceye kadar İleri ' yi tıklatın.</li>
			<li>MPP, bileşik hizalama değerleri 0.0 (hizalama zaten yazılım 1, adım 2.8.1.2 özellik çıkarma yapılır) için ayarlayın sonra bitirmek kullanılabilir duruma gelene kadar İleri adım adım'yi tıklatın.</li>
		</ol></li>
		<li>Analitik tekrarlanabilirlik dayalı kimlikleri filtre. Birden fazla çoğaltma örnekleri mevcut olduğu, özellikleri mevcut olmalıdır > bireysel % 80'i çoğaltır ve analitik bir varyasyon (CV) < %30 katsayısı var<ol>
<li>MPP seçin deneysel Kur > deney gruplandırma ve onun kökenli örneğe karşılık gelen bir grup her raw dosyası atayın (örneğin, aynı kaynaktan çoğaltır aynı grupta olmalıdır). İç içe geçmiş değişkenlerini (örneğin, enstrümental teknik çoğaltır vs) karşılık gelen birden çok grubu oluşturulabilir.</li>
			<li>MPP seçin deneysel Kur > oluşturmak yorumu sonra deneme parametreyi işaretleyin (yani, grup) ve bitirmek kullanılabilir duruma gelene kadar İleri ' yi tıklatın. Bu-ecek yaratmak bir kategori bu gelecekteki filtreleme üzerinde çalışabilir.</li>
			<li>MPP seçin kalite kontrol > filtre Frekansa. Tüm varlıklar ve Group(non-averaged) 2.8.2.2 içinde oluşturulan sonra sonrakivurmak örnek yoruma için varlık liste oluşturma.</li>
			<li>Giriş parametreleri, varlık tutma %80 örneklenen içinde en az bir koşul olarak ayarla o zaman bitirmek kullanılabilir duruma gelene kadar İleri ' yi tıklatın. Frekans filtre özellikleri listesi adı</li>
			<li>MPP seçin kalite kontrol > örnek değişkenliği üzerinde filtre. Varlık listesi frekans filtre özellikleri için 2.8.2.4 ve Group(non-averaged) yoruma, daha sonra sonrakivurmak.</li>
			<li>Ham veriler ve % < 30 varyasyon katsayısı ilgisi aralığı için radyo düğmesini seçin. ' I tıklatın Sonraki > son ve kurtarmak belgili tanımlık liste olarak CV filtre özellikleri.</li>
		</ol></li>
		<li>Almıyoruz olduğu önemli ölçüde daha yüksek özellikleri kaldırmak (> 3 kat) alanı boş (FB) örnek daha bereket.<ol>
<li>MPP seçin Analiz > kat değişiklik. CV filtre özellikleri ve grup vurmak sonra en yakın örnek yoruma için varlık liste oluşturma. Tüm tek koşula göre ve koşul seç FB kat Değiştir seçeneğine veya boş işlenmiş örnek grubu adı her neyse seçin.</li>
			<li>Aşağıdaki ekranında, kat-değişiklik kesim 3.0 için ayarlama ve istemleri sonuna kadar tıklama. FC süzülmüş listeolarak kurtarmak belgili tanımlık liste.</li>
		</ol></li>
		<li>Uygun arka plan örneği karşı ilgi bireysel örneklerinin ikili karşılaştırmalar yapmak (örn, vs ters yönde bir nokta kaynak aşağı) kat-değişiklikler için tek tek kimyasal özellikleri belirlemek için.<ol>
<li>MPP seçin Analiz > yanardağ arsa üzerinde filtre. FC süzülmüş liste ve grup yoruma için varlık liste oluşturma.</li>
			<li>Kat-değişiklik koşulu için karşılaştırma (örneğin, bir ikili akış yukarı ve aşağı akım örnek) için iki örnek çifti seçmek ve seçme Mann-Whitney Unpairedsınayın.</li>
			<li>Ön analizler için değil aşağıdaki ekranda birden çok test düzeltme için bir değer seçin, sonuç arsa için tıklayın.</li>
			<li>Sonuçları ekranda bir kat-değişiklik kesim 3.0 ve p-değeri kesme 0,1 için seçin. O zaman bitirmek ve ihracat listesi olarak Ön sonuçları.</li>
		</ol></li>
		<li>Süzme sonra kalan her özellik için tahmin edilen kimyasal formula(s) tam kütle ve bileşik kitle spektrum oluşturmak.<ol>
<li>MPP, seçin sonuçları yorumlama > IDBrowser kimlik ve Ön sonuçları varlık listesi.</li>
			<li>IDBrowser moleküler formülü Jeneratör (MFG) tanımlama yöntemi olarak kullanılması tespit tüm maddeler ve birleşimler seçin.</li>
			<li>Formül oluşturmak seçenekleri F öğeleri sütun eklemek ve en fazla 50'ye ayarla, sonra bitirseçin. Formül üretimi kaydedip dönmek için MPP dönmek için seçin.</li>
			<li>MPP, filtre uygulanmış sağ tıklayın ve MFG varlık listesi eşleşen ve Liste Ver'iseçin. Sonuçları kaydedin.</li>
		</ol></li>
		<li>Monoisotopic kütle azaltılmış önemli kimyasal özellik listesinde türlerin kitle hataları fluorination gösterge içerenler için incelemek; Tür ve Fiehn34bakın.</li>
		<li>Not ortak polyfluorination motifleri (CF2 (m/z 49.9968), CF2O (m/z 65.9917), CH2CF2O (m/z 80.0074), vb) içeren kimyasal serisi kullanarak bir kitle kusur arsa veya yazılım algoritmasını; Tartışma bölümünde, Liu ve ark.17, Loos ve ark.35 ve Dimzon vd.36bakın.</li>
		<li>Tahmin edilen kimyasal formüller veya EPA kimya Pano veritabanı ve/veya olası kimyasal yapıları dönmek için diğer veritabanları karşı tarafsız kitleler arayın.<ol>
<li>EPA Comptox kimyasal madde Dashboard toplu arama aracını (https://comptox.epa.gov/dashboard/dsstoxdb/batch_search) açın ve tanımlayıcıları (formüller veya kitleler) listesi tanımlayıcısı türü (örneğin, MS hazır seçtikten sonra tanımlayıcı kutusuna yapıştırın Formül veya Monoisotopic kütle).</li>
			<li>İndir... kimyasal verileri seçin ve ayrıca açılan menü üzerinden olası eşleşmeleri için istenen herhangi bir fizik/kimya/toksikoloji verileri seçin.</li>
		</ol></li>
		<li>Kimyasal sezgi ve referans veri kullanarak, olası eşleşmeleri fizibilite kimyasal kararlılık, ionizability veya hydrophobicity, varlığı gibi fiziksel özellikleri nedeniyle temel her formül için potansiyel kimyasal yapısı listesinden kaldırmak kimyasallar yakın kaynaklardan gelen üretim vb. Ek veri yokluğunda, spektral fizibilite tamamen edebiyat yaygınlık temelinde sırada yer; McEachran ve ark.37bakın.</li>
		<li>Mevcut standartları ve/veya hedeflenen yüksek çözünürlüklü MS/MS kullanarak yapıları onaylamak spectra veritabanlarından, silico teorik spectra veya el ile küratörlüğü karşı parçalarının eşleştirme.</li>
	</ol></li>
</ol>

Yazarlar ifşa gerek yok.

Örnek kullanım ve hazırlık Başvuru/spike standartlar dahil büyük önem hedeflenen herhangi bir analizi için analitik geçerliliğini kontrol etmek için bir atış siperi sağladıkları gibi vardır. QC örnekleri eksikliği herhangi bir değerlendirme sonuçlarının doğruluğunu engeller; her yerde yapısı fluorochemicals ve şans bulaşma alanı örnekleri, malzeme veya LC-MS sistem işleme nadir değildir ve sorumluydu gerekir anlamına gelir. Ayrıca, protokole bakılmaksızın işleme, adımlardan son derece değişken olabilir gibi özellikle SPE günlük örnek olarak doğrulanmasını sağlar ve örnek toplama adımlar. Her iki eski ve yeni perfluorinated kimyasallar çıkarma ağır durağan faz yoğunlaşması seçimi ve kaynak örnekleri, pH ve tuzluluk46gibi bileşenleri tarafından etkilenebilir. Pefluorinated kimyasal maddelerin belirli sınıfları ilgi varsa örnek koşullar etkisi dikkate alınmalıdır. Laboratuvar kurulumu mevcuttur ve aşağı akım veri analizi benzer kalır su özleri için alternatif örnek hazırlama düzenleri kullanılabilir.
Hedeflenen veri analizi Mevcut standartlara ve kendi standartlarına etiketli eşleşen, kararlı izotop bileşikler için Veri çözümlemeleri için birincil endişeleri enstrümantal ve yöntemi algılama sınırlarının belirlenmesi ve uygun raporlama aralıkları üzerinde belirlenen bir Sinyal-gürültü oranı düşük seviyeli standardı gibi standart yaklaşımları kullanarak Laboratuvar Laboratuvar olarak47gönderiyor. Eşleşen kendi standartlarına yokluğunda eşleşmeyen matris etkileri hataların ortaya çıkabileceğini ve çivili örneklerin doğru olarak geri tahmin ölçümleri doğruluğunu tahmin etmek için kullanılabilir. Bir eğri hazırlamak için standartlar eksik zaman bilinmeyen bir nicel bir tahmini yakından eşleşen bir standart olarak aynı şekilde davranarak bileşik yapılabilir, ancak 10 + kat belirsizlik ölçmek, görmek için sınırlı yeteneği ile sırasına tahmin hataları olan McCord, Newton ve Strynar21. Bu gibi durumlarda, eğilim verisi hala toplanabilir ama konsantrasyon tahminler doğal olarak güvenilir değildir.
Sigara hedef veri analizi En yüksek malzeme çekme ayarları oldukça etkili kimyasal özellikleri tespit sayısına, ancak özellik seçimi kalitesini de ağır etkilenir. 1) spectra içinde özellikler, özellik bereket eşik 3) özelliği algılama dikkate alınması gereken 2) ayıklanan Kromatografik yoğunluğunu doruklarına iyon bereket eşik dahil edilecek bireysel kitleler yoğunluğu en yüksek malzeme çekme ilgi kararlardır frekans, çoğaltma eşik ve 4) analitik varyasyon, CV eşik (şekil 10).
Ek özellikler giderek daha düşük bereket (Tablo 7) gidermek için örnek zaman bir üstel artış en yüksek malzeme çekme sonuçlar için gerçek olamayacak kadar düşük eşikler ayarlama. İyon-bereket eşik filtreleri nerede yeterince bireysel izotop zenginliği eşiği geçemiyor spektral özellikleri kitle. İdeal olarak yalnızca kalite MS spectra, onlar enstrümantal gürültü yerine gerçek kimyasal özellikleri sağlayarak ve bırakmak için formül tahmin aşağı akım işleme özellikleri için seçer. Uygun bir eşik değeri üzerinde enstrümantal gürültü dayanır, ideal olarak en az 3 MS1 için gürültü eşik x tarar. Özelliği bereket eşik kimyasal özellikleri yoğunluk veya çıkarılan Kromatografik özellik alanı temel alan filtre uygular. Bu adım genellikle Kromatografik kalitesiz, yüksek farklarını veya veya diğer zavallı yazılım ekstraksiyon sonucu düşük bereket doruklarına reddi etkinleştirir. Uygun bir eşik deney ve matris zavallı özellik üretimi (örneğin, eşik sergi kabul edilemeyecek zavallı Kromatografi aşağıda özellikleri) kabul edilebilir bir seviyeye göre belirlenmelidir. Daha fazla analitik QC analitik ve/veya hazırlık çoğaltır (çoğaltma eşik) içinde tutarsız kimliğine göre Kromatografik düzeyinde özellikleri reddetmek için kullanılan veya çoğaltır (CV eşik) zavallı tekrarlanabilirlik dayalı. Kullanılan en yüksek entegrasyon yazılım kalitesini ve kimyasal varlıklar soruşturma altında uygun düzeyleri bağlıdır. Suda çözünür perfluorinated bileşikler ve hafifçe en iyi duruma getirilmiş Tümleştirme protokoller için özellikleri içinde tanımlanması gereken 80 + % analitik çoğaltır ve CVs yöntemleri bölümünde ayrıntılı olarak % 30 altında düşüş bekleniyor.
Sigara hedefli analizinden tespit doruklarına tespit malzemeleri konsantrasyonları kantitatif tahminler pes ediyor musun. Ayrıca, doğru bilinmeyenler kimliği roman bileşikler eksik olduğundan onaylamak zor olabilir kamuya veritabanlarından. Roman yapısal kararlılık geniş analizi ile birden çok yöntemi gerektirir ve kütle spektrometresi ve kimya uzmanlık gerektirir. Ancak, en yüksek alanlarda kimyasal özellikleri normalize bilinmeyenli bilinen türler21konsantrasyonları yarı kantitatif tahminler sağlar. Eğer tutarlı örnekleme ve hazırlık adımları istihdam, zaman eğilim bilgileri bireysel türler için yanıt için bireysel bir tür kısıtlama büyük tutarlı olması gerektiği gibi bir kimyasal sebat geleceğe izlemek için oluşturulabilir matris21değişimler.
Bu yöntemin hedeflenen ve nontargeted analiz izin vermek için örnek tedavi genişletilebilirlik kullanılabilmesidir. Hedeflenen analiz eşdeğer veya üstün niceliksel bilgileri sağlamasına karşın, bu büyük ölçüde matris malzeme ile ilişkilerini yanı sıra yeni ve ortaya çıkmakta olan malzemeleri ile ilgili istenilen analiz genişliğini yoksun. Hedeflenen bir metodoloji veya yöntem eleme bile şüpheli uygulama sadece bilinen malzemeler üzerinde tabanlı ve sınırlı veritabanları önceden denetlenmediğini türler için tamamen kör bile olsa da önemli sağlık etkileri olabilir. Yazılım geliştiren ve veritabanları daha sağlam hale gibi bilinmeyen kimlik doğruluğunu zaman yatırım ve bu tarafından oluşturulan çok boyutlu verileri çözümlemek gerekli uzmanlık düzeyi eşlik eden bir azalma ile artmaya devam edecek yaklaşım. Bankacılık verileri yeni geliştirilen yazılım ile post-hoc analizi için izin verir ve algılanan bir bileşik kimliğini şu anda bilinmeyen karşılaştırma zamana olanak tanır çünkü yine de, şu anda oluşturulan veri önemli gelecekteki değeridir.

Sınıf başına- ve polyfluoroalkyl maddeler (PFASs) önemli halk sağlığı endişe ile kalıcı organik kirleticiler vardır. Belirli bileşikler perfluorooctanoic asit (PFOA) ve perfluorooctanesulfonate (patlama) içme suyu sağlık Danışma seviyeleri tarafından EPA1,2 dizi ve onların büyük ABD üretim 2000'lerde3' te,4 kesildiği tarih var . PFAS özelliklerinin önemli bir anlayış kazanmak için küreler, yüzlerce, binlerce değilse, alternatif PFAS kimyaları imalat Tekstil ve tüketici ürün malzemeler yerine de dahil olmak üzere ürün niş doldurmak için geliştirilmiştir Kaldırılan bileşikleri5,6,7,8. Bir devam eden düz Zincirli perfluorinated karboksilik asitler çevresel düzeyde izlemeleri gerekir ve bu tür patlama, PFOA ve onların ilgili homolog serisi sulfonates ama ortaya çıkan kimyasal bileşikler EPA gibi kurulmuş yöntemler tarafından kapsanmayan Yöntemi 5379 ve sık sık eksikliği analitik standartları geleneksel hedeflenen analiz için. Bu iletişim kuralının amacı böylece iki yönlüdür. Fluorochemical türler analitik standartları elde edilebilir nerede su hedeflenen LC-MS/MS analizi için bir yol sağlar ve sigara hedefli, yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi temelli bir yaklaşım veri analizi için sorunsuz entegrasyon detayları Bilinmeyen veya beklenmeyen bileşikleri aynı örnekte tespiti sağlar.
Katı faz ayıklama (SPE) örnek Temizleme ve konsantrasyon ile uygulamalar birçok analitler ve örnek matrisler10,11için kurulan bir tekniktir. PFAS analiz, polar olmayan-dahil olmak üzere birden çok katı kuvvetli aşamaları functionalized kutup ve iyon değiştirme sütun matrisler9,12geniş çeşitli flüorlu türlerin alt sınıflarının değişen kapsamlarını için kullanılmış olan, 13,14,15,16. SPE örnek analiz kullanarak on-line kurulumları büyük ölçüde gelişmeler yaklaşımının iş çıkarma yeteneğini artırmak ve tekrarlanabilirlik örnek işleme geliştirmek, ancak temel işlem tutarlı17kalır. SPE büyük hacimli enjeksiyonlar kullanarak çevrimdışı konsantrasyonu kaldırmak için bazı çabalar da üstlenmiş oldu, ama bunlar onları rahat analiz18,19 bölge dışında yer değişiklikleri Kromatografi için yapılması . Bizim örnek analiz bir polimer zayıf anyon exchange (balmumu) kuvvetli faz iyice asidik PFAS malzemeleri önemli örnek toplama faktörler elde ederken geleneksel organik kirletici maddeler ayırmak için kullanır. Bu balmumu faz kısa zincir perfluorinated asit perfluorobutane Sülfonat (KUMAŞI) gibi veya daha uzun zincir eski perfluorinated kutup hexafluoropropylene oksit dimer asit (HFPO-DA) gibi perfluorinated eterler yakalamak önemlidir türler20,21. Son PFAS kimya5' te daha kısa flüorlu zincirleri ve eter eklenmesi doğru önemli bir değişim oldu gibi bu faz seçimi MS analizi için roman bileşiklerin daha kapsamlı kurtarma sağlar.
Hedeflenen LC-MS/MS Nefelometri kullanılarak kimlik doğrulaması standartları ve kararlı izotop kendi standartlarına etiketli kantitatif analiz için duyarlılık ve özgüllük benzersiz bir düzeyde sağlar. Bu yaklaşım birçok durumda arzu edilir iken, all-çok-ortak durumlar analizi için zordur. Hedeflenen yaklaşımlar örnek beklenen türler için ve hangi yöntemleri daha önce kurulmuş olan çalışma. Yeni ve ortaya çıkmakta olan bileşikler için bile onların Kimya veya konsantrasyon, ne olursa olsun ilgi olabilir tür tespit aciz bir yaklaşımdır ve düşük çözünürlüklü Kütle Spektrometreleri neredeyse yapmak için yeterli bilgi sağlama aciz Bilinmeyen bileşiklerin kesin kimyasal atamaları. Sonuç olarak, analiz olmayan hedef alan, yüksek çözünürlüklü modern Kütle Spektrometreleri örnekleri bir presupposed hipotez olmadan analiz ve geriye dönük olarak algılanabilir özelliklerine örnek kimyasallar atamak için güç yararlanarak ortaya çıkmıştır. Bu yaklaşım Biyoloji22,23,24 ve Çevre Bilimleri25,26,27 çok sayıda sınıflar kimyasalların, alanlarında yaygın olarak kullanılmış. Perfluorinated kimyasal maddeler nedeniyle kendi benzersiz kitle spektral desen Bu yöntemde tanımlamak özellikle basit ve bileşikleri yüzlerce sadece son birkaç yıl5,28tarif edilmiştir.
Burada tartışılan Protokolü tanımlamak ve yarı kantitatif ilgi gelişmekte olan bileşikler izlemek için ihtiyaç ile hedeflenen LC-MS/MS PFAS Nefelometri hizalamak için tasarlanmıştır. SPE faz yakalama daha hidrofilik gelişmekte olan PFAS asit su sağlamak için tasarlanmıştır seçimi ve örnek hazırlama teknikleri ve daha az daha uzun zincir polimer türler ve non-iyonik türler için uygun olmayabilir. Ayrıca, Sigara hedefli çözümleme tarafından oluşturulan veri yoğun ve yüksek dimensionality hangi veri analiz yazılımı kullanımını gerektirir. Bu yazılım paketleri sık satıcıya özel ve enstrüman platformlar arasında faaliyet için değişiklik gerektirir. Mümkün olan yerlerde, analiz süreci genel bir moda tarif ve açık kaynak/freeware alternatifler başvurulan ama verimlilik ve doğruluğu konusunda herhangi bir yazılım yaklaşım bireysel olarak değerlendirilmesi gerekir.

<table><tbody><tr><td>Acqity ultra yüksek performanslı sıvı kromatografi sistemi&nbsp;</td><td>Waters Corporation</td><td></td><td>PFC analiz kiti (176001744) ile modifiye edilmiştir; PFAS arka planı kontrol edilir ve düşük olduğu onaylanırsa eşdeğer UPLC sistemi kabul edilebilir</td></tr><tr><td>Amonyum asetat</td><td>Fluka</td><td>17836</td><td>Kütle spektrometresi derecesi% >99 saf</td></tr><tr><td>Amonyum Hidroksit</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>338818</td><td></td></tr><tr><td>Dengesi</td><td>Mettler</td><td>AB204S</td><td></td></tr><tr><td>BEH C18 ters faz UPLC sütunu, 2.1&kat; 50&nbk; mm, 1.7&nbsp; &mu; m&nbsp;</td><td>Waters Corporation</td><td>186002350</td><td></td></tr><tr><td>Çift pistonlu şırınga pompası&nbsp;</td><td>Waters Corporation</td><td>SPC10-C</td><td></td></tr><tr><td>Buzul Asetik Asit</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>ARK2183&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>Cam Mikrofiber Filtreler</td><td>Whatman</td><td>1820-070</td><td></td></tr><tr><td>Yüksek yoğunluklu polietilen numune şişesi&nbsp;</td><td>Nalgene</td><td>2189-0032&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>Yüksek Çözünürlüklü Kütle Spektrometresi</td><td>Çeşitli</td><td></td><td>Kütle Spektrometresi, < 10 ppm ve MS/MS verilerinin toplanması. Bu çalışmada Agilent 6530 qTOF ve Thermo Fisher Orbitrap Fusion kullanılmıştır</td></tr><tr><td>Metanol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Nitrik Asit (%35 a/a)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>SVCN-5-1</td><td>Konsantre nitrik asit ve reaktif suyu kullanılarak evde hazırlanabilir</td></tr><tr><td>Polipropilen Buchner hunisi</td><td>ACE Glass</td><td>12557-09&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>Polipropilen senitrfüj tüpü ve kapağı</td><td>BD Falcon</td><td>352096</td><td></td></tr><tr><td>Polipropilen Vakum Şişesi (1 L)</td><td>Nalgene</td><td>DS4101-1000</td><td></td></tr><tr><td>Quattro Premier XE üçlü dört kutuplu kütle spektrometresi&nbsp;</td><td>Waters Corporation</td><td></td><td>Bunun yerine eşdeğer üçlü dört kutuplu veya daha iyi bir sistem kullanılabilir, hedeflenen analiz için yüksek hassasiyet ve stabilite sağlamalıdır</td></tr><tr><td>Reaktif Su</td><td></td><td></td><td>PFAS içermediği belirlenen herhangi bir kaynak</td></tr><tr><td>Sodyum Asetat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>W302406</td><td></td></tr><tr><td>TurboVap nitrojen buharlaştırıcısı&nbsp;</td><td>Kaliper Yaşam Bilimleri</td><td>103198</td><td>Bunun yerine eşdeğer sistemler veya döner vakumlu evaporatör kullanılabilir</td></tr><tr><td>Zayıf anyon değişimi SPE kartuşu (Oasis WAX Plus)</td><td>Waters Corporation</td><td>186003519</td><td></td></tr><tr><td><güçlü>Standart Çözümler</güçlü></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>2,3,3,3-Tetrafloro-2- (1,1,2,2,3,3,3,3-heptafloropropoksi)propanoik asit (HFPO-DA)</td><td>Wellington</td><td>HFPO-DA</td><td></td></tr><tr><td>Ön analiz ve standart kullanılabilirliğe dayalı olarak belirlenecek</td> <td>ek hedeflenen bileşik standartları</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Kütle etiketli HFPO-DA</td><td>Wellington</td><td>M2HFPO-DA</td><td></td></tr><tr><td>Doğal PFCA/PFAS Karışımı (2 ug/mL)</td><td>Wellington</td><td>PFAC-MXA</td><td>veya PFAC-MXB; veya ilgilenilen bileşikleri içeren ayrı ayrı hazırlanmış karışım</td></tr><tr><td>Kararlı izotop etiketli PFCA/PFAS Karışım (2 ug / mL)</td> <td>Wellington</td><td>MPFAC-MXA</td><td>veya MPFAC-MXB; veya Yerel PFAS'lar için uygun şekilde ilgilenilen bileşikleri içeren ayrı ayrı hazırlanmış karışım</td></tr><tr><td>Software</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Mass Profiler Professional</td><td>Agilent</td><td></td><td>Veya açık kaynaklı yazılım paketleri</td></tr><tr><td>Profinder</td><td>Agilent</td><td></td><td>Veya açık kaynaklı yazılım paketleri</td></tr></tbody></table>

Ücret belirlenmesi- ve polyfluorinated kimyasal türler ile kombine hedef ve hedef tarama olmayan yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi iş akışı

Identifying Per- and Polyfluorinated Chemical Species with a Combined Targeted and Non-Targeted-Screening High-Resolution Mass Spectrometry Workflow

Tarihi ve başına ortaya çıkan- ve polyfluoroalkyl maddeler (PFASs)--dan yerel kamu ve hükümet kuruluşları federal düzeyde önemli ilgi topladı. PFAS kimyaları devam eden evrimi nerede hedefli yöntemleri sürekli bir gelişim gecikme mutlaka yeni kimyasal bileşikler keşfi çevresel izleme için bir meydan okuma sunuyor. Bir gerek yoktur, bu nedenle, gelişmekte olan ve beklenmedik bileşikleri algılayan, zamanla bu türlerin izlemek ve gelecekteki etkinleştirmek için kimyasal yapılarını ayrıntılarını çözümlemek ileriye dönük metodolojileri insan sağlığı çalışması için. Bu amaçla, Sigara hedefli analizi yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi ile hemen hemen her örnek hazırlama düzeni ile kombine edilebilir bir geniş taban algılama yaklaşım ve bileşik kimlik tespiti sonra için önemli yetenekleri sunmaktadır. Burada, biz daha kısa zincir ve daha fazla hidrofilik PFAS kimyaları, için gibi flüorlu eter asitler ve sulfonates, ayarlı bir katı fazlı ayıklama (SPE) dayalı örnek toplama yöntemi açıklamak ve analiz örnekleri bu şekilde hazırlanan tarif hem hedef hem de sigara hedefli modları. Kullanılan standartlar mevcuttur ancak çözümleme işlemi sırasında özünde için beklenen bileşikler sınırlıdır hedefli yöntemleri üstün miktar sağlar. Buna ek olarak, bir sigara hedefli yaklaşım beklenmeyen bileşikler varlığı belirlemek ve onların kimyasal yapısı hakkında bilgi verebilir. Kimyasal özellikleri hakkında bilgi bileşikleri örnek yerlerdeki ilişkilendirmek ve bereket ve zaman içinde oluşumu izlemek için kullanılabilir.

Burada, kütle spektrometresi tarafından bir protokol sıralı hedeflenen miktar ve sigara hedefli çözümleme fluor bileşikleri su mevcut. Bu metodoloji bilinen fluorochemical bileşikler nicel düzeyleri sağlar ve onların bereket yarı kantitatif tahminler ile ilgili örnekleri bilinmeyen kimyasallar tanımlar.

Ücret belirlenmesi- ve Polyfluorinated kimyasal türler ile kombine hedef ve hedef tarama olmayan yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi iş akışı

Historical and emerging per- and polyfluoroalkyl substances (PFASs) have garnered significant interest from the public and government agencies from the ...

Bu yaklaşım, bilinen PFAS'ın sayısallaştırılmasına ve aynı numunelerde yeni maddelerin keşfine olanak sağlar, sadece hedeflenen yaklaşımlarla karşılaştırıldığında, ortaya çıkan bileşikleri özler. Bu protokol, ortaya çıkan en yeni kimyasalları temsil eden daha geniş bir PFAS bileşimi yelpazesini hedeflemektedir. Konsantrasyon adımı bileşikler için uyarlanırsa, burada kullanılan ölçüm yöntemleri herhangi bir kimyasal sınıfa uygulanabilir.Alanından bir örnek toplamak için, nitril eldiven giymek ve temiz, yüksek yoğunluklu polietilen, HDPE veya polipropilen şişe de alan konumundan su 500 ila 1.000 mililitre toplamak. Numune şişesine ve boş bir alana beş mililitre nitrik asit koruyucu ekleyin ve numuneleri laboratuvara geri götürün. Her numuneyi ayrı ayrı, önceden temizlenmiş, bir litrelik, yüksek yoğunluklu polipropilen silindirlerine dökün ve numunelerin tam hacmini kaydedin.Şişe iç lerinden emilen per-ve polifloroalkil maddeleri veya PFAS'ı durulamak için kapamadan ve şiddetle sallayarak önce her boşalan numune şişesine 10 mililitre metanol ekleyin. Daha sonra, ölçülen su örneğini metanolik durulama ile durulanmış şişeye geri verin. Sayısallaştırma için standart bir eğri elde etmek için sekiz boş, tek litrelik numune şişelerini PFAS içermeyen deiyonize suyla doldurun ve şişeleri istenilen nicelik aralığını kapsayan sekiz eşit aralıklı konsantrasyonla etiketleyin.Ardından, uygun PFAS konsantrasyonlarını sağlamak için her şişeye bir miktar yerli PFAS karışımı ekleyin ve kalibrasyon eğrisinin orta noktasına yaklaşan bir konsantrasyonla her numuneye dahili standart PFAS karışımını ekleyin. Daha sonra örnekleri cam elyafı ile filtreleyin Hafif vakum altındaki filtreleri tek tek, önceden temizlenmiş, bir litrelik yüksek yoğunluklu polipropilen vakum şişelerine dönüştürün. Partikül madde şişenin içinde kalırsa, ek deiyonize suyu durulayın ve yıkamayı şişeye süzün.Katı faz lı ekstraksiyon için filtrelenmiş suyu numune şişesine iade edin ve zayıf bir aniyon değişimi veya WAX, 25 mililitre metanol ve 25 mililitre deiyonize su ile kartuş durumuna getirin. Pompa çekme borusunu filtrelenmiş numune şişelerinin içine yerleştirin ve uygun numune adlarına sahip kartuşları katı faz çıkarma veya SPE olarak etiketleyin. Her bir numuneden 500 mililitre, her kartuştan dakikada 10 mililitre sabit bir akış hızıyla pompalayarak akışı atın.Piston pompalarından WAX SPE kartuşlarını çıkarın ve SPE kartuşunu harici cam rezervuarlarla donatılmış bir vakum manifolduna aktarın. Her SPE kartuşunu dört mililitre 25 milimolar, pH dört sodyum asetat tamponu ile hafif vakum altında temizler ve ardından dört mililitrelik nötr metanol yıkama. Yıkama sonunda, elüent toplamak için her SPE kartuş altında 15 mililitrelik polipropilen santrifüj tüp yerleştirin ve metanol% 0.1 amonyum hidroksit dört mililitre ile örnekleri elute.Daha sonra, elüsyon tüpleri çıkarın ve 40 santigrat derece bir su banyosunda kuru azot deresi altında buharlaşma tarafından 500 ila 1.000 mikrolitre eluat hacmini azaltmak. Tandem kütle spektrometresi ile hedeflenen sıvı kromatografiiçin, yüksek basınçlı sıvı kromatografi numuneşişesinde 300 mikrolitre iki milimonisamamyum asetat tamponu ile 100 mikrolitre numune ekstresini seyreltin ve standart eğriden, numunelerden ve koşu boyunca enstrümantal sürüklenmeyi değerlendirmek için standart eğrinin ek bir kopyasını içeren bir analitik çalışma listesi hazırlayın. Numuneleri, hedeflenen ilgi bileşikleri için oluşturulan standart sıvı kromatografisi ve kütle spektrometresi yöntemlerini kullanarak analiz edin.Analizin sonunda, analitin en yüksek alan oranını iç standarda ve analit konsantrasyonuna göre kullanan standart numunelerden standart bir eğri oluşturun ve konsantrasyon tahmini için x'in üzerinde ağırlık içeren bir kuadratik regresyon formülü oluşturun. Her numunedeki hedeflenen analitleri, her ölçüm için hazırlanan standart eğrileri ve alan oranını kullanarak ölçün. Konsantrasyon kalibrasyon aralığını aşarsa, orijinal numuneyi uygun iç standart konsantrasyonu ile çivili deiyonize su ile seyreltin ve konsantrasyonu uygun aralıkta getirmek için yeniden ayıklayın.Tandem kütle spektrometresi ile hedeflenmemiş sıvı kromatografisi için, 100 mikrolitre numune ekstresini 300 mikrolitre iki milimolar amonyum asetat tamponu ile yüksek basınçlı sıvı kromatografi örnek şişesine seyreltin. Gösterildiği gibi bir iş listesi ayarladıktan sonra, veriye bağımlı modda geniş bir tetkik ile sıvı kromatografi-kütle spektrometresi verileri toplamak için cihaz yazılımını kullanın. Hedeflenmemiş veri işleme için, uygun moleküler özellik çıkarma yazılımı paketini açın ve Örnek Dosyalar Ekle ve Dosya Ekle'yi seçin ve hedeflenmemiş denemedeki ham verileri seçin.Önceden oluşturulmuş bir yöntemi yüklemek veya yazılım ayarlarını el ile yeniden yüklemek için Tamam'ı tıklatın ve Toplu Yinelemeli Özellik Çıkarma ve Açık Yöntemi'ni seçin. Filtrelemeden sonra kalan her özellik için, tam kütle ve kompozit kütle spektrumundan tahmin edilen kimyasal formüller oluşturun ve Çevre Koruma Ajansı CompTox Chemicals Dashboard Batch Search aracını açın. Tahmin edilen kimyasal formülleri veya nötr kütleleri aramak, olası kimyasal yapıları döndürmek için tanımlayıcı türünü seçin ve tanımlayıcı listesini tanımlayıcı kutusuna yapıştırın.Açılan menüden Kimyasal Verileri ve olası eşleşmeler için istenen fiziksel, kimyasal veya toksikoloji verilerini karşıdan yükleyin'i seçin. Daha sonra, mevcut standartları ve/veya hedeflenen yüksek çözünürlüklü tandem kütle spektrometresi ile eşleşen yapıları veritabanlarından silico teorik spektrumveya manuel kürleme ile onaylayın. Tandem kütle spektrometresi sonuçları ile kantitatif sıvı kromatografi, toplam iyon kromatogramı ve ölçülen kimyasallar için belirli kimyasal geçişlerin çıkarılan iyon kromatogramları için iyon kromatogramları şeklinde sunulmaktadır.Kimyasal geçişin entegre tepe alanı bileşik bolluğu ile ilgilidir ve bir iç standarda normalleştirilmiş bir kalibrasyon eğrisi kullanarak tam konsantrasyonu hesaplamak için kullanılabilir. Tam MS tarar kullanılarak hedeflenmemiş analiz, numuneler için toplam iyon kromatogramı verir ve bu da tek tek iyonlar için özel olarak çıkarılan iyon kromatogramlarının üretilemesine olanak tanır. PFAS bileşikleri flor atomlarının üstünlüğü nedeniyle negatif kütle kusurlarına sahiptir ve poliflorlu bileşikler homolog organik maddelere göre pozitif ama önemli ölçüde daha küçük kütle kusurlarına sahiptir.İkinci bir yöntem filtreleme adımı, uygun bir yazılım paketi kullanarak PFAS türlerine ortak olan yinelenen birimleri içeren homolog serileri tanımlamaktır. Yüksek çözünürlüklü MS verilerinden, bir veya daha fazla putatif kimyasal formülkütle spektrumunun izotopik parmak izi ile eşleşebilir ve puanlanabilir. Kimyasal formüller daha da doğrulanabilir ve bazı yapısal bilgiler tandem kütle spektrometresi verilerinden elde edilebilir.Yeni bileşiklerin kimliğini doğrulamak için daha fazla kütle spektrometresi deneyi kullanılabilir ve örnek karşılaştırmaları kimyasalların yaygınlığı ve göreceli miktarı hakkında bilgi verebilir. Nicel ve hedefsiz ölçümleri doğrulamak için matris için uygun boşluklara ve kalite kontrol örneklerine sahip olmak çok önemlidir. Gösterilen stratejiler, bilinmeyenlerin keşfine ve kimliklerinin tahmin edilmesine izin vererek PFAS için çevresel taramada yeni bir yaklaşım haline gelmiştir.

identifying-per-polyfluorinated-chemical-species-with-combined

Research

JoVE Journal

Environment

Çevre

Yakalama Bileşikler fotoğraf crosslinking ve saflaştırma takip fonksiyonel geri dönüşümlü küçük molekül-protein etkileşim proteom karmaşıklığını azaltmak için trifunctional küçük moleküllerdir. Burada Yakalama...

Methyltransferases, profilleme ve Diğer S Adenosil- L</subYakalama Bileşik Kütle Spektrometresi (CCMS)> homosistein bağlayıcı Proteinler

Kütle spektrometresi (UPLC-MS) ile birleştirilmiş ultra performanslı sıvı kromatografisi ile hedeflenmemiş metabolit profili, metabolizmayı araştırmak için güçlü bir tekniktir.  Bu makale, numune organizasyonu ve hazırlama, veri toplama, veri analizi, kalite kontrol ve metabolit tanımlaması dahil olmak üzere serumun hedeflenmemiş metabolit profili için kullanılan tipik bir iş akışını özetlemektedir.

Ultra Performans Sıvı Kromatografisi-Kütle Spektrometresi (UPLC-MS) ile Serum Büyük Ölçekli Sigara hedefli metabolomik Profilleme

Hedefsiz metabolomik bir metabolik profili anlık üreten bir hipotez sağlar. Bu protokol, serum hücreler veya doku metabolitlerinin çıkarma ve analiz gösterecektir. Metabolitleri bir dizi sıvı-sıvı faz ekstraksiyon kullanılarak anket vardır, Mikrosirkülasyon Ultra Performanslı sıvı kromatografisi / diferansiyel analiz yazılımı için birleştiğinde yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi (UPLC-HRMS).

Ultra Performanslı Sıvı Kromatografi-Yüksek Çözünürlüklü Kütle Spektrometre (UPLC-HRMS) kullanarak Biyolojik Kaynaklar gelen hedefsiz Metabolomik

Proton Transfer Reaksiyon Süresi Uçuş Kütle Spektrometresi, uçucu organik bileşiklerin yüksek hassasiyetli, hızlı ve invaziv olmayan analizine izin verir. Potansiyelini göstermek için üç örnek veriyoruz: yoğurdun laktik asit fermantasyonu (on-line biyoproses izleme), farklı elma genotipleri (büyük ölçekli tarama) ve kahve içtikten sonra retronazal boşluk (burun boşluğu analizi).

Gıda Örneklerinde Otomatik Örnekleme Sistemi ve Özelleştirilmiş Veri Analizi ile Birleştirilen PTR-ToF-MS: Biyolojik İşlem İzleme, Tarama ve Burun Uzayı Analizi

Biz bir protokol zaman uçuş kütle spektrometresi, eczacılık sularda tanımlamak için mükemmel bir araç olarak kullanarak olmayan hedef analizi için mevcut. Biz onların ortadan kaldırılması için UV radyoterapi uygulama göstermek. Işınlama, bileşik yalıtım, kimlik ve kinetik bozulması profilleri modelleme analiz gösterilmektedir.

Eczacılık HPLC-ESI-Q-TOF-MS ve eritromisin fotoğraf kaynaklı bozulması ile ortadan kaldırılması kullanılarak Su ortamındaki tanımlaması

Bu iletişim kuralı tek bir üretim için doğal organik madde ve mikrobiyal proteomik farklı ekosistemleri içinde tam olarak eşleştirilmiş karakterizasyonu sonuçlanan tamamlayıcı analitik ve omics teknikleri açıklar. Bu yaklaşım sağlam karşılaştırmalar metabolik yollar ve sera gazı üretim tanımlamak ve çevresel değişimin yanıt tahmin için önemli dönüşümleri tanımlamak için izin verir.

Karmaşık doğal organik madde karışımları karakterize için tek işlem hacmi tamamlayıcı yüksek çözünürlüklü analitik teknikler

Açıklanan ilgi ve etiket-free kütle spektrometresi belirli bir protein in immünafinite zenginleştirme kullanarak bir nükleer hücre altı fraksiyonu protein etkileşim ortakları tanımlamak için bir proteomik iş akışıdır. İş akışı hücre altı fraksiyonu, immünoprepitasyon, filtre destekli numune hazırlama, çevrimdışı temizleme, kütle spektrometresi ve aşağı akım biyoinformatik boru hattını içerir.

Büyük Ölçekli Nükleer Etkileşimom Profilleme için Etiketsiz İmmünoprekütle Spektrometresi İş Akışı

Bu protokol, gelişmiş özellik ekstraksiyonu ve biyoinformatik analiz yazılımı ile birlikte sıvı kromatografi kütle spektrometresi kullanılarak peptidoglikan bileşiminin ayrıntılı bir analizini kapsar.

Peptidoglikanın Sıvı Kromatografisi, Kütle Spektrometrisi ve Biyoinformatik ile Yarı Kantitatif Analizi

Bu protokolün amacı, yarı hedefli kromatografi-kütle spektrometrisi yöntemi kullanarak plazmadaki fenolik metabolitleri tespit etmektir.

Yaşlı Yetişkinlerin Plazmasındaki Fenolik Metabolitlerin Kütle Spektrometri Analizine Bağlanan Yarı Hedefli Ultra Yüksek Performanslı Kromatografi

XY-Meta ve metaX'i birbirine entegre eden hedefsiz bir metabolomik iş akışı oluşturduk. Bu protokolde, açık erişim spektrumu referansından bir aldatmaca spektral kütüphanesi oluşturmak için XY-Meta'nın nasıl kullanılacağını gösterdik ve daha sonra FDR kontrolünü gerçekleştirdik ve metabolomik spektrumları tanımladıktan sonra metabolitleri ölçmek için metaX'i kullandık.

FDR Kontrol Tabanlı Hedefsiz Metabolom Üzerinde Entegre Bir Tanımlama ve Niceleme İş Akışı

Mevcut protokol, buğdayda perfloroalkil asitlerin uzun mesafeli taşınması için basit ve etkili bir yöntem tanımlamaktadır.

Buğdaydaki Perfloroalkil Asitlerin Bölünmüş Kök Maruziyet Tekniği ile Uzun Mesafeli Taşınmasının İncelenmesi

Öğrenin, su örneklerinde PFAS bileşiklerinin hedefli ve hedefsiz yüksek çözünürlüklü kütle spektrometrisi ile kantitatif analizi ve yeni kirleticilerin keşfi için kapsamlı bir yöntem.

Ücret belirlenmesi- ve Polyfluorinated kimyasal türler ile kombine hedef ve hedef tarama olmayan yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi iş akışı (Video) | JoVE Journal

Ücret belirlenmesi- ve Polyfluorinated kimyasal türler ile kombine hedef ve hedef tarama olmayan yüksek çözünürlüklü kütle spektrometresi iş akışı

Daha fazla video keşfet