Name: Uyku ve Meksika Cavefish Lokomotor aktivite otomatik ölçümleri (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-03-21T14:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 10 s
Description: Öğrenin Meksika mağara balığında lokomotor davranış ve uyku ölçüm yöntemlerini. Sosyal barınma koşullarında etkinlik analizi yaparak diğer balık türlerine uygulanabilir bir sistem geliştirir.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu eser NIGMS Ödülü GM127872 ACK, NINDS Ödülü 105072 ERD ve ACK ve bildirim için NSF Ödülü 1656574 tarafından desteklenmiştir

Not: sistemleri larva ve yetişkin davranış takibi için ayarlayın.
1. larvalar için bir uyku sistemi oluşturmak
Not: Birden çok kızılötesi (IR) aydınlatma, akrilik IR ışık Difüzörler, dahil olmak üzere ekipman parçaları ışık otomatik izleme çocuksu balık yaşlı 4 gün sonrası döllenme (dpf) aracılığıyla 30 dpf A. mexicanus ile larva için izleme sistemi gerektirir denetimleri (zamanlayıcılar), bilgisayar, kamera ve kablolama ve güç denetleyicileri (şekil 1A) gibi ikincil malzemeler. Aşağıdaki yönergeler nasıl doğru bir şekilde uyku ve sirkadiyen ritim larva olarak çalışmaya Lokomotor davranışını izlemek için bir sistem kurmak için size bilgi verecektir A. mexicanus.
<ol><li>IR ve beyaz ışık yayan diyot (LED) oluşan bir aydınlatma sistem inşa: 30,5 cm x 30,5 cm ince metal platformu soğutucu diğer her bir üçgen yaklaşık 7,62 cm üç IR ışık yerleştirin. Işıklar serisi ile elektrikli tel tel ve bir güç kaynağına bağlayın.</li>
	<li>Tek bir beyaz ışık LED üç IR ışık ortasına yerleştirin ve güç kaynağına ekleyebilirsiniz.</li>
	<li>Bir standart sirkadiyen ayarlanmış bir ışık çekim için LED için güç kaynağına bağlayın.</li>
	<li>Larva izleme sistemi için bir platform oluşturmak. 0,33 cm kalın beyaz işareti akrilik tüm platform bileşenleri için kullanın.</li>
	<li>Davranışsal izleme sırasında kayıt platformu üzerinde hangi alanlarda balık içeren ikamet edecek ışıklı kare soğutucu üzerine yerleştirin.</li>
	<li>
İkinci bir akrilik ışıklar ve IR optimum aydınlatma ve kontrast için diffüz hayvanlar arasında kutusu içine yerleştirin. Not: larva ışık kutusu için boyutları ise şöyle: iki 18 cm x 8,5 cm ve iki 17 cm x 8,5 cm kimyasal olarak birlikte forma bir 18 cm x 18 cm bağlı LED kare yani 8,5 cm boyunda. Ayrıca, akrilik kolayca kesme veya delinmiş uygun araçları için özelleştirilmiş boyutlandırma kullanarak olabilir.<ol>
<li>Bütün larva izleme sahne ve ışık Kurulum kapalı bir plastik tüp içinde yerleştirin ve sonra kameranın üst kısmında tüpü yerleştirin. Not: Bu izleme doğruluğu zarar gibi izleme video görünmesini ışık yansımaları tutmak önemlidir. Kameralar platformu çevreleyen bir tüp üzerine yerleşimini aydınlatma ve netlik bu deneyler için kullanılan kameralar için geliştirir.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Bir web kamerası işlemek ( Tablo malzemelerigörmek) IR tabanlı kayıt için. Döner bir aracı kullanarak üretici objektif kaldırmak ( Tablo malzemelerigörmek).</li>
	<li>İç konut kaldırmak için kameranın arka tarafta küçük gümüş vidayı çıkarın.</li>
	<li>Objektif geri kalanı gevşetmek için kamera gövdesi içinde küçük siyah vidayı çıkarın. Herhangi bir objektif kesim sonrası kalan lens konut bölümlerini kaldırmak için küçük bir tornavida kullanın.</li>
	<li>Şarj edilmiş üst kısmı üzerinde mavi LED kaldırma aygıt (CCD) Muhafazası birleştiğinde.</li>
	<li>Geri birlikte özgün yönünü geri iç konut yerleştirip özgün konumlarına geri iki gümüş vida vidalama kamerayı.</li>
	<li>Yuvarlak plastik yönlendirme ile biraz sığdırmak için rota küçük kullanarak kamera içini gördüm. Pürüzsüz bir lens adaptörü sığabilecek kadar ilave plastik aşağı.</li>
	<li>Fotoğraf makinesi ile doğrudan temas yapmadan CCD gibi mümkün olduğunca yakın kamera bünyesinde bir IR-pass filtre kurun. Not: Fotoğraf makinesinin gövdesi içinde CCD çipi zarar vermemesi için dikkat ediniz. Kesme mümkün olduğunca düzey tuttuğunuzdan emin olun. Filtre uygulanan CCD ulaşan ışık tutmak için kamera gövdesi ve IR filtre dışında arasında boş bir alanı kapatın.</li>
	<li>Kamera 35 mm sabit lens takmak ( Tablo malzemelerigörmek) adaptör kamera önünde lens arkasına vidalama tarafından.</li>
	<li>Kamera ve lens kapağı üstünde tepe-in belgili tanımlık sahne ve ışık evler tüp ayrıntılarına delik yerleştirin ve hayvanlar-ecek var olmak yazmak--dan bilgisayar USB ekleyin. Not: Balık stok balık nerede en az kesintileri davranış kayıtları sırasında sağlamak yerleştirilmiştir üzerinden ayrı bir davranış Oda yerleştirin. Sıcaklık ve havalandırma hangi davranışsal deney yıkmak dalgalanmalar en aza indirmek için dikkat ediniz.</li>
</ol>2. uyku sistemi yetişkinler için
<ol><li>IR şeritler yaklaşık 46 cm aralıklarla keserek yetişkin balık izlemek için bir IR aydınlatma sistemi oluşturmak. Bir 46 cm şerit her 10 L davranış tank için yeterlidir.</li>
	<li>Her şerit birlikte bir dizi her şerit DC elektrik tel lehim, tel ve 9 V güç kaynağına takın.</li>
	<li>Her IR şerit soğutucu hareket edecek alüminyum 51 cm x 5,1 cm parçası takın.</li>
	<li>Bir 46 cm x 5 cm, 0,32 cm kalınlığında % 9 ışık taramalı beyaz işareti akrilik levha IR diffüz için doğrudan her IR ışık şerit önünde ışık yerleştirin.</li>
	<li>Tüm tankları arka monte IR aydınlatma destekleyen bir raf yerleştirin.</li>
	<li>Opak plastik bölücüler 10 L cam tanklarda bireysel alanlarda oluşturmak için kullanın. Not: Arena boyutu kullanılan bölücülerin sayısını ve tank boyutu bağlı olarak farklı olabilir. Arena boyutu Lokomotor aktivite ve mağara ve yüzey balık23uyku etkiler.</li>
	<li>Kameralar yaklaşık 4-6 m tankları uzak mount. Her kamera izleme için yeterli çözünürlük sağlamak için bir seferde 3 tank genellikle kaydedebilirsiniz. Not: Yetişkin davranış kayıtları genellikle gündüz-gece değişiklikleri denetlemek için bir ayrı beyaz aydınlatma sistemi gerek yoktur. Sadece kullanmak için bir zamanlayıcı bağlı bir davranış odada standart genel gider ışıklar yeterli olması muhtemeldir.</li>
</ol>3. kayıt Lokomotor aktivite
Not: Tüm davranış kayıtları bir standart dizüstü bilgisayar ya da okul sırası ile bir yedek pil kaynağı kullanılarak yapılır. 24 h (60-100 GB) kayıt büyük dosya büyüklüğü nedeniyle, dış sabit diskler üzerinde tüm kayıtları kaydedin.
<ol><li>Balık yaşları 4-30 dpf kayıtları başlatmadan önce 18-24 h için alışmana. Canlı tuzlu su ilk kayıt odasında ve kayıt başlamadan önce 1 h yerleştirildiğinde karides ile larva balık yemi. 4-5 gün önce kayıt davranış yetişkin balık alışmana ve pul gıda veya canlı blackworms ile günde bir kez yem. Not: Artık tuzlu karides daha sonra analiz sırasında izleme sorunları neden olur gibi tatlı su kayıt önce larva balık yerleştirdiğinizden emin olun. Onların küçük büyüklük izleme ile müdahale değil gibi Wrotek ile ortak kültür alternatif bir seçenek sağlar.</li>
	<li>Yer balık 4-6 dpf 24-iyi doku kültürü tabak içinde yaşlı. House balık 12-iyi doku kültürü levha kayıt için 20-30 dpf yaşlı.</li>
	<li>10 L tankları kayıt yetişkin beş ayrı ayrı ev Balık karşılamak için Bölücüler ile veya olmadan bölücüler kayıt uyku ve sosyal bir ortamda faaliyet için uygun. Not: İzleme doğruluğu en üst düzeye çıkarmak için kayıt başlatma önce kamera odaklama için dikkat ediniz. Kamera objektifi gözü aç değil çok uzakta, bu büyük ölçüde görüntü keskinliğini azaltır. Ancak bir denge olduğunu; Iris çok ileri kapalıysa, video kare hızı 15.00 fps düşer. Kare hızı bazı uyku özel olarak yazılmış komut dosyası23,24ile 15.00 kare / s kullanım için kalır daha sonraki analizler için esastır.</li>
	<li>Aydınlatma/parlaklık arka plan aydınlatma ayarlayın.</li>
	<li>Aydınlatma kayıt başlamadan önce en iyi duruma getirme. Her zaman kontrast olası en üst düzeyde tutmak ve en temiz hayvanlardır kadar parlaklığı ayarlamak için parlaklık ve Arka plan aydınlatma kullanın.</li>
	<li>Rekor balık için 24 veya 48 s. Not: Aydınlatma, bilgisayar ve kameralar güç Acil yedek batarya bohça elektrik kesintileri durumunda satın. Tüm bataryaları da acil güç çıkışı, mümkünse takılmalıdır. Bataryaları genellikle değil en az bir saat için bir kaç dakikadan Geçitin güç ve ana güç kaybediyor ve acil durum güç sistemine transfer arasında köprü için hizmet vermektedir.</li>
</ol>4. tek tek yer alan balık kullanarak izleme yazılımı otomatik Lokomotor aktivite analizi
<ol><li>Davranış Analiz başlamak için yazılım izleme açın, Şablondan yeni denemeseçin, ardından Pre-Defined Şablonu Uygulaseçeneğini belirleyin.</li>
	<li>Program şimdi izlemek için ne tür sorar gibi balıkseçin. Zebra balığı yetişkin deneysel paradigma bağlı olarak her iki Zebra balığı larva seçmek için açılan kutuyu kullanın.</li>
	<li>Her hayvan izlenir arenalarda kadar ayarla. Larvalar için de plaka, yuvarlak iyi ve Hayır bölgesi şablonuseçin. Yetişkinler için Açık alan, Meydanı No bölgesi şablonuile kullanın. O zaman arenas, bir video izlenen her hayvan için uygun sayısını belirleyin.</li>
	<li>En uygun izleme için modelini seçin, tıkırtı üstünde Merkezi maddelik, takip ve hayvan renk arka plan daha koyu için seçili olduğundan emin olun. Hangi video satın alınmıştır kare hızı uygulayın. İzleme yazılımı bu otomatik olarak tanımalıdır.</li>
	<li>Doğru Arena ayarlarıkullanarak balık Lokomotor davranışını belirlemek için bir nesnenin gerçek mesafe ayarlamak için bir ölçek çizmek.</li>
	<li>İçinde balıklar tüm alanı izlenecek emin olmak için arenalarda düzenlemek; Aksi takdirde örnekleri Alım sırasında kaybolacaktır. Not: Alanları ayarlarken dikkatli olun. Larva balık Eğer Arena ya çok büyük ya da küçük hataları izleme için özellikle duyarlıdır. Deneyinde kötü aydınlatma da program a yanlış mutlak oluşturma bir hayvandır düşünebilirsiniz iyi Kaplamalar, duvarlarda gölgeler oluşturabilirsiniz.</li>
	<li>Gelişmiş' i tıklatın. Yöntemi Algılama ayarıaltında Dinamik çıkarma, sonra arka plan üzerinde tıklatın seçip Başlatmak öğrenme. Karanlık kontrast sinyal/noise oranı kadar hayvanlar de izlenir ve arka plan atlamak izleme neden olmuyor ayarlayın. Not: Video kalitesi her farklı ayarlar, buna göre kullanmanız gerekebilir bu yüzden deneyler arasında değişebilir. Konu dağılımı ve Konu boyutu özelliklerini kullanarak izleme sonuçları önemli ölçüde artırabilir.</li>
	<li>Deneme listesi seçin ve uygun parametreleri programa veri kaydetmeye başlamadan önce yükleyin.</li>
	<li>Alma sekmesini tıklatın, Parça tüm planlanan denemeler seçin ve ekrandaki Kaydet düğmesini tıklatın.</li>
	<li>Analiz profilaltında mesafe ve zaman ve hareket seçilir emin olun. Not: Sırayla daha sonra uyku analiz, bu ayarlar doğru olduğu, .perl doğru sırada uyku hesaplamak için bu veri dosyasını okumak gerekir önemlidir.</li>
	<li>İhracat, Ham veriseçin altında veri Unicode metin olarak dışa aktarma.</li>
</ol>5. izleme sosyal balık muhafaza
<ol><li>4.1-4.4 izleme yazılımı deneyde kurmak için adımları izleyin.</li>
	<li>Kaç hayvan deneyi için takip için açılan menüden seçin.</li>
	<li>Arena ayarlarında, gerçek mesafe ayarlamak için doğru ölçek çizmek.</li>
	<li>Algılama ayarları, Dinamik çıkarmakullanın ve en iyi hayvan izlemek için karanlık karşıtlığı ayarlayın.</li>
	<li>Hayvan çok küçük bir bölümünü izlenir algılama ayarları altında konu boyutunu ayarlayın. Not: Hayvan sadece küçük bir bölümünü takip ederek, bu satın alma sırasında yolları geçerken hayvanlar arasında geçiş miktarını azaltır.</li>
	<li>Parça satın sonra Parça Editör nerede balık yolları çapraz kez el ile düzeltmek için kullanabilirsiniz.</li>
</ol>6. Lokomotor aktivite uyumak veri çıkarımı
Not: Davranışsal larva ve yetişkin A. mexicanus uykusunda 1 dak veya daha fazla sendika tanımıdır. Bu tanım uyarılma eşik deneyler, nerede büyük bir duyusal uyarıcı bir davranışsal yanıt uyuyan bir devlet olarak başlatmak için gereken kullanarak tespit edilmiştir (> 60 s)14,17uyanma için karşılaştırıldığında. Küçük hareketleri ve ortak sürüklenen türler, orada balık hesabına hız eşikleri gürültü ya da drift gerçek hareketinden ayırmak için uygulanır. Bu eşikleri mesafe ve en yüksek R-kare değerlerini bulmak için uyku süresi arasındaki bağıntıları karşılaştırarak hesaplama açısından elde edilen; böylece hareket ve uyku için en doğru hız belirleme. Larva balık, üst ve alt sınırları her iki 12 mm/s olarak orada hiçbir drift için küçük. Yetişkin için alt sınırı 2 cm/sn ile 4 cm/s drift için hesap için bir üst sınır balıktır.
<ol><li>Lokomotor ayıklamak ve davranış uyumak için özel olarak yazılmış komut dosyalarını yürütme taşımak için analiz bilgisayar için Cygwin yükleyin.</li>
	<li>Cygwin giriş dizini içinde yeni bir deneme klasör oluşturun.</li>
	<li>Yazılım izleme'den ham Unicode verileri alabilir ve UTF-16 UTF-8 kodlama dönüştürmek için Cygwin .sh dosya yürütmek.</li>
	<li>Uyumak veri ayıklamak için Cygwin içinde .perl dosyasını yürütün.</li>
	<li>Makro dosyasını açın ve istediğiniz gibi veri analizi tamamlamak üzere elektronik tablo içindeki yönergeleri izleyin. Not: Komut satırı kodlama bir temel düzeyde analiz bu kısmını dışında taşımak için gerekli olacaktır. Genel Linux komutları yeterli olacaktır. Düzgün veri okuma programları ile ilgili sorunlar varsa, kodlama veri--dan takip yazılımı herhangi bir serbestçe kullanılabilir metin düzenleyicisinde emin olmak için denetleyin ve düzgün yazmak için yürütülebilir dosyaları için doğru emirdir.</li>
</ol>

<ol><li>Keene, A. C., Duboue, E. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+origins+and+evolution+of+sleep%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Experimental+Biology%22%5BJournal%5D)">The origins and evolution of sleep.</a> The Journal of Experimental Biology. , (2018).</li>
<li>Joiner, W. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unraveling+the+Evolutionary+Determinants+of+Sleep%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Unraveling the Evolutionary Determinants of Sleep.</a> Current Biology. 26 (20), R1073-R1087 (2016).</li>
<li>Allada, R., Siegel, J. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Unearthing+the+phylogenetic+roots+of+sleep%5BTitle%5D)+AND+%22Current+biology%22%5BJournal%5D)">Unearthing the phylogenetic roots of sleep.</a> Current biology. 18, R670-R679 (2008).</li>
<li>Sehgal, A., Mignot, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetics+of+sleep+and+sleep+disorders%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Genetics of sleep and sleep disorders.</a> Cell. 146, 194-207 (2011).</li>
<li>Campbell, S. S., Tobler, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Animal+sleep%3A+a+review+of+sleep+duration+across+phylogeny%5BTitle%5D)+AND+%22Neuroscience+and+Biobehavioral+Reviews%22%5BJournal%5D)">Animal sleep: a review of sleep duration across phylogeny.</a> Neuroscience and Biobehavioral Reviews. 8, 269-300 (1984).</li>
<li>Raizen, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lethargus+is+a+Caenorhabditis+elegans+sleep-like+state%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">Lethargus is a Caenorhabditis elegans sleep-like state.</a> Nature. 451, 569-572 (2008).</li>
<li>Geissmann, Q., Rodriguez, L. G., Beckwith, E. J., French, A. S., Jamasb, A. R., Gilestro, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ethoscopes%3A+An+Open+Platform+For+High-Throughput+Ethomics%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Ethoscopes: An Open Platform For High-Throughput Ethomics.</a> bioRxiv. , 113647(2017).</li>
<li>Garbe, D. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Context-specific+comparison+of+sleep+acquisition+systems+in+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+Open%22%5BJournal%5D)">Context-specific comparison of sleep acquisition systems in Drosophila.</a> Biology Open. 4 (11), (2015).</li>
<li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6 (6), 451-457 (2009).</li>
<li>Gilestro, G. F., Cirelli, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PySolo%3A+A+complete+suite+for+sleep+analysis+in+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Bioinformatics%22%5BJournal%5D)">PySolo: A complete suite for sleep analysis in Drosophila.</a> Bioinformatics. 25, 1466-1467 (2009).</li>
<li>Swierczek, N. A., Giles, A. C., Rankin, C. H., Kerr, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+behavioral+analysis+in+C.+elegans%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput behavioral analysis in C. elegans.</a> Nature Methods. 8 (7), 592-598 (2011).</li>
<li>Branson, K., Robie, A. A., Bender, J., Perona, P., Dickinson, M. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+ethomics+in+large+groups+of+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">High-throughput ethomics in large groups of Drosophila.</a> Nature Methods. 6, 451-457 (2009).</li>
<li>Rihel, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Zebrafish+behavioral+profiling+links+drugs+to+biological+targets+and+rest%2Fwake+regulation%5BTitle%5D)+AND+%22Science+%28New+York%2C+N.Y.%29%22%5BJournal%5D)">Zebrafish behavioral profiling links drugs to biological targets and rest/wake regulation.</a> Science (New York, N.Y.). 327, 348-351 (2010).</li>
<li>Yoshizawa, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distinct+genetic+architecture+underlies+the+emergence+of+sleep+loss+and+prey-seeking+behavior+in+the+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biology%22%5BJournal%5D)">Distinct genetic architecture underlies the emergence of sleep loss and prey-seeking behavior in the Mexican cavefish.</a> BMC Biology. 13, (2015).</li>
<li>Chiu, C. N., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+zebrafish+sleep+and+arousal+states%3A+current+and+prospective+approaches%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Neural+Circuits%22%5BJournal%5D)">Regulation of zebrafish sleep and arousal states: current and prospective approaches.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7 (April), 58(2013).</li>
<li>Elbaz, I., Foulkes, N. S., Gothilf, Y., Appelbaum, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Circadian+clocks%2C+rhythmic+synaptic+plasticity+and+the+sleep-wake+cycle+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Neural+Circuits%22%5BJournal%5D)">Circadian clocks, rhythmic synaptic plasticity and the sleep-wake cycle in zebrafish.</a> Frontiers in Neural Circuits. 7, (2013).</li>
<li>Duboué, E. R., Keene, A. C., Borowsky, R. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolutionary+convergence+on+sleep+loss+in+cavefish+populations%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolutionary convergence on sleep loss in cavefish populations.</a> Current Biology. 21, 671-676 (2011).</li>
<li>Beale, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Circadian+rhythms+in+Mexican+blind+cavefish+Astyanax+mexicanus+in+the+lab+and+in+the+field%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Circadian rhythms in Mexican blind cavefish Astyanax mexicanus in the lab and in the field.</a> Nature Communications. 4, 2769(2013).</li>
<li>Keene, A. C., Yoshizawa, M., McGaugh, S. E. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aKeene%2C+AC+%22Biology+and+Evolution+of+the+Mexican+Cavefish%22">Biology and Evolution of the Mexican Cavefish</a>. , (2015).</li>
<li>Jeffery, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regressive+evolution+in+Astyanax+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Annual+Review+of+Genetics%22%5BJournal%5D)">Regressive evolution in Astyanax cavefish.</a> Annual Review of Genetics. 43, 25-47 (2009).</li>
<li>Gross, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+complex+origin+of+Astyanax+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Evolutionary+Biology%22%5BJournal%5D)">The complex origin of Astyanax cavefish.</a> BMC Evolutionary Biology. 12, 105(2012).</li>
<li>Aspiras, A., Rohner, N., Marineau, B., Borowsky, R., Tabin, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Melanocortin+4+receptor+mutations+contribute+to+the+adaptation+of+cavefish+to+nutrient-poor+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences%22%5BJournal%5D)">Melanocortin 4 receptor mutations contribute to the adaptation of cavefish to nutrient-poor conditions.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences. 112 (31), 9688(2015).</li>
<li>Jaggard, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+lateral+line+confers+evolutionarily+derived+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Biology%22%5BJournal%5D)">The lateral line confers evolutionarily derived sleep loss in the Mexican cavefish.</a> Journal of Experimental Biology. 220 (2), (2017).</li>
<li>Jaggard, J. B., Stahl, B. A., Lloyd, E., Prober, D. A., Duboue, E. R., Keene, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hypocretin+underlies+the+evolution+of+sleep+loss+in+the+Mexican+cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">Hypocretin underlies the evolution of sleep loss in the Mexican cavefish.</a> eLife. , e32637(2018).</li>
<li>Hinaux, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Developmental+Staging+Table+for+Astyanax+mexicanus+Surface+Fish+and+Pacho+%C2%B4n+Cavefish%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">A Developmental Staging Table for Astyanax mexicanus Surface Fish and Pacho ´n Cavefish.</a> Zebrafish. 8 (4), 155-165 (2011).</li>
<li>Bill, B. R., Petzold, A. M., Clark, K. J., La Schimmenti,, Ekker, S. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+primer+for+morpholino+use+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Zebrafish%22%5BJournal%5D)">A primer for morpholino use in zebrafish.</a> Zebrafish. 6 (1), 69-77 (2009).</li>
<li>Bilandzija, H., Ma, L., Parkhurst, A., Jeffery, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+potential+benefit+of+albinism+in+Astyanax+cavefish%3A+downregulation+of+the+oca2+gene+increases+tyrosine+and+catecholamine+levels+as+an+alternative+to+melanin+synthesis%5BTitle%5D)+AND+%22Plos+One%22%5BJournal%5D)">A potential benefit of albinism in Astyanax cavefish: downregulation of the oca2 gene increases tyrosine and catecholamine levels as an alternative to melanin synthesis.</a> Plos One. 8 (11), e80823(2013).</li>
<li>Yokogawa, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+sleep+in+zebrafish+and+insomnia+in+hypocretin+receptor+mutants%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Biology%22%5BJournal%5D)">Characterization of sleep in zebrafish and insomnia in hypocretin receptor mutants.</a> PLoS Biology. 5, 2379-2397 (2007).</li>
<li>Appelbaum, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sleep-wake+regulation+and+hypocretin-melatonin+interaction+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">Sleep-wake regulation and hypocretin-melatonin interaction in zebrafish.</a> Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 106, 21942-21947 (2009).</li>
<li>Singh, C., Oikonomou, G., Prober, D. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Norepinephrine+is+required+to+promote+wakefulness+and+for+hypocretin-induced+arousal+in+zebrafish%5BTitle%5D)+AND+%22eLife%22%5BJournal%5D)">Norepinephrine is required to promote wakefulness and for hypocretin-induced arousal in zebrafish.</a> eLife. 4 (September), (2015).</li>
<li>Elipot, Y., Hinaux, H., Callebert, J., Rétaux, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evolutionary+shift+from+fighting+to+foraging+in+blind+cavefish+through+changes+in+the+serotonin+network%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Biology%22%5BJournal%5D)">Evolutionary shift from fighting to foraging in blind cavefish through changes in the serotonin network.</a> Current Biology. 23 (1), 1-10 (2013).</li>
<li>Bell, M. A., Foster, S. A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBell%2C+MA+%22The+evolutionary+biology+of+the+threespine+stickleback%22">The evolutionary biology of the threespine stickleback</a>. 584, Oxford University Press. Available from:
 <a target="_blank" href="http://books.google.com/books?hl=de&lr=&id=uxC0lN-Z3FIC&pgis=1">http://books.google.com/books?hl=de&lr=&id=uxC0lN-Z3FIC&pgis=1</a> (1994).</li>
<li>Seehausen, O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((African+cichlid+fish%3A+a+model+system+in+adaptive+radiation+research%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+Biological+Sciences%2FThe+Royal+Society%22%5BJournal%5D)">African cichlid fish: a model system in adaptive radiation research.</a> Proceedings of Biological Sciences/The Royal Society. 273 (1597), 1987-1998 (1597).</li>
<li>Basolo, A. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Female+preference+predates+the+evolution+of+the+sword+in+swordtail+fish%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Female preference predates the evolution of the sword in swordtail fish.</a> Science. 250, 808-810 (1990).</li>
</ol>

Yazarlar onlar rakip hiçbir ilgi alanlarına sahip bildirin.

Bu iletişim kuralı uyku ve larva ve yetişkin cavefish Lokomotor aktivite miktarının için özel bir sistem açıklar. Cavefish uyku yönetmelik1genetik ve nöral temeli araştırmak için kullanılan uyku evrimi çalışmak için önde gelen bir model olarak ortaya çıkmıştır. Bu iletişim kuralı kritik adımlarda aydınlatma duruma getirilmesi ve video kalitesi doğru izleme sağlamak için uyku ölçmek için gerekli. Toplama ve burada açıklanan analiz sistemi tamamen işlevsel, birçok diğer sistemleri, ticari ve özel ol...

Uyku hayvanlar alemi, fonksiyonel, fizyolojik ve davranışsal düzeyleri1,2,3boyunca son derece korunmuş. Uyku memeli laboratuvar hayvanlarda genellikle electroencephalograms kullanarak değerlendirilir, Elektrofizyolojik kayıtlar küçük genetik olarak mükellef modeli sistemlerinde daha az pratik ve böylece uyku tipik olarak davranış3 üzerinde karşılaştırılmasıyla ölçülmüştür , 4. davranışsal özellikleri uyku ile ilişkili hayvanlar alemi son derece korunmuş ve artmış uyarılma eşik, uyarılma ve uzun süreli davranış sendika5ile reversibility dahil. Bu önlemlerin uyku sıra--dan belgili tanımlık yuvarlak kurt, C. elegans, ile insanlar6hayvanlarda karakterize etmek için kullanılabilir.
Uyku karakterize etmek için davranışsal sendika kullanımı otomatik izleme yazılımı gerektirir. Yazılım izleme, etkinlik ve hareketsizlik dönemleri birkaç gün üzerinden belirlenir ve uzun süre kullanılmadığında uyku7,8gibi sınıflandırılır. Son yıllarda, birden fazla izleme sistemi küçük genetik olarak mükellef model sistemleri bir çeşitlilik arasında etkinlik veri edinme için geliştirilmiştir; solucanlar, meyve sinekleri ve balık9,10,11de dahil olmak üzere. Bu programlar hayvan davranışları, açık kaynak ücretsiz ve ticari olarak mevcut yazılım7,12,13,14 dahil olmak üzere otomatik izleme için sağlayan yazılım eşlik eder . Bu sistemler ve onların esneklik farklı verimli tarama ve uyku fenotipleri çok sayıda genetik olarak iyileştirilebilir modellerinde karakterizasyonu için izin.
Zebra balığı, Danio rerio, uykusunda genetik incelenmesi çok sayıda gen ve uyku15,16düzenleyen sinir devreleri tanımlaması için açmıştır. Bu ise daha az omurgalı laboratuvar hayvanı uykusunda nöral temeli soruşturma için güçlü bir sistem olması koşuluyla nasıl uyku geliştikçe hakkında bilinen ve ne kadar doğal varyasyon yönetmelik uyku katkıda bulunmaktadır. Meksika cavefish, Astyanax mexicanus (a. mexicanus), uyku, Lokomotor aktivite ve sirkadiyen ritim17,18dramatik farklılıklar gelişmiştir. Sierra Del Abra bölgenin etrafında nüfus kuzeydoğu Meksika19,20,21gözlü yüzey balık Meksika ve Güney Teksas ve en az 29 nehirler yaşamaktadır mağara gibi balıkların adlı biri yok. Dikkat çekici, uyku kaybı, dahil olmak üzere birçok davranış farklılıkları bağımsız olarak birden çok cavefish nüfus14,22yılında çıkmıştır görünmektedir. Bu nedenle, cavefish, uyku, sirkadiyen ve sosyal davranışlar yakınsak evrim soruşturma için bir model sağlar.
Bu iletişim kuralı uyku ve aLokomotor davranış ölçmek için bir sistem açıklar. mexicanus larva ve yetişkinler. Aydınlık ve karanlık koşullarda hayvanların video kaydı için özel olarak oluşturulmuş kızılötesi tabanlı kayıt sistemi sağlar. Piyasada bulunan yazılım etkinliğini ölçmek için kullanılabilir ve özel makrolar hareketsizlik çeşitli yönlerini ölçmek ve uyku dönemleri belirlemek için kullanılır. Bu iletişim kuralı da uyku ve sosyal davranışlar arasındaki etkileşimler incelemek olanağı sağlayan bir tank içinde birden fazla hayvan etkinliğini izlemek için deneysel değişiklikleri açıklar. Bu sistemler ölçü uyku, sirkadiyen davranış ve Zebra balığı ve takımıdır dahil olmak üzere ek balık türlerinin Lokomotor aktivite için uygulanabilir.

<table><tbody><tr><td>12 V güç adaptörü</td><td>Çevre Işıkları</td><td>24 Watt 12 VDC Güç Kaynağı</td><td></td></tr><tr><td>Akrilik bölücüler (yetişkinler)</td><td>TAP Plastik</td><td></td><td>İhtiyaca göre boyutlarda sipariş levhaları</td></tr><tr><td>Yetişkin kızılötesi ışık güç kaynağı</td><td>Çevre Işıkları 24 Watt 12 VDC Güç Kaynağı</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Pil takımı</td><td>CyberPower</td><td>CP850PFCLCD</td><td></td></tr><tr><td>Kamera lensi (yetişkin)</td><td>Navitar Zoom 7000</td><td>Zoom 7000</td><td></td></tr><tr><td>Kamera lensi (larva)</td><td>Fujian 35mm f/1.7</td><td>B01CHX7668</td><td>Amazon'dan satın alın</td></tr><tr><td>Kamera lens adaptörü</td><td>d</td><td>1524219</td><td></td></tr><tr><td>Kamera montajı</td><td>CowboyStudio Super Clamp</td><td>B002LV7X1K</td><td>Amazon'da Satın Alın</td></tr><tr><td>Akvaryum</td><td>Deep Blue Professional</td><td>ADB11006</td><td></td></tr><tr><td>Isı emici (yetişkin)</td><td>MD Yapı ürünleri</td><td>SKU: 61085</td><td>Sığacak şekilde kesilmiş</td></tr><tr><td>Isı emici (larva)</td><td>M-D Yapı ürünleri</td><td>SKU: 57000</td><td>Sığacak şekilde kesin</td></tr><tr><td>Kızılötesi ışıklar (yetişkinler)</td><td>Çevresel Işıklar Kızılötesi 850 nm 5050 LED şerit</td><td>irrf850-5050-60-makara</td><td>Sığdırmak için kesilmiş</td></tr><tr><td>Kızılötesi ışıklar (larva)</td><td>LED World</td><td>B00MO9H7H4</td><td>Amazon'dan satın alın</td></tr><tr><td>IR yayan akrilik</td><td>TAP Plastik</td><td></td><td>Sayfaları gerektiği gibi boyutlarda sipariş</td></tr> edin <tr><td>Dizüstü bilgisayar/bilgisayar</td><td>N/A</td><td>N/A</td><td>Herhangi bir dizüstü bilgisayar çalışacaktır.</td></tr><tr><td>LED ışık</td><td>Chanzon 10 Yüksek Güçlü Led Çip 3W Beyaz (6000K-6500K / 600mA-700mA / DC 3V-3.4V / 3 Watt)</td><td>B06XKTRSP7</td><td>Chanzon ile kullanın 25 adet 1 W, 3 W, 5 W LED Isı Emici (2 pin Siyah) Alüminyum Taban Plakası Panel</td></tr><tr><td>ışık zamanlayıcı</td><td>Yüzyıl 24 Saat Plug-in Mekanik Zamanlayıcı</td> IR Everbilt için topraklı <td></td><td></td></tr><tr><td>plastik duvara montaj</td> Plastik <td>pegboard</td><td>Model # 17961</td><td></td></tr><tr><td>Güç kablosu</td><td>BNTECHGO 22 Ölçer Silikon Tel</td><td>B01K4RPE0Y</td><td></td></tr><tr><td>Güç kaynağı</td><td>Hızlı LED</td><td>MOONLIGHT DRIVER (350MA)</td><td></td></tr><tr><td>Doku kültürü plakaları</td><td>Fisherbrand</td><td>12 kuyulu (FB012928) 24 kuyulu (FB012929)</td><td></td></tr><tr><td>Tripod Top kafa</td><td>Demon DB-44</td><td>B00TQ54CZO</td><td>Amazon USB'den Satın Alın</td></tr><tr><td>Hardrive Seagate</td><td>3 TB yedekleme</td><td>STDT3000100</td><td></td></tr><tr><td>USB Web kamerası</td><td>Microsoft LifeCam</td><td>Q2F-00014</td><td>Amazon'dan satın alın</td></tr><tr><td>Kamera LDR Endüstrileri için duvara montaj</td><td>1/2" Çelik boru</td><td>307 12X36</td><td>Flanş ve 90 derece boru dirseği ile duvara monte edilir. Kamerayı tutmak için bir tripod da kullanabilir.</td></tr></tbody></table>

uyku ve meksika cavefish lokomotor aktivite otomatik ölçümleri

Automated Measurements of Sleep and Locomotor Activity in Mexican Cavefish

Kültürlenebilen uyku yükseltilmiş uyarılma eşik dahil, Uyku yoksunluğu takip rebound ve davranışsal hareketsizlik dönemlerinde konsolide son derece korunmuş davranış özellikleri ile karakterizedir. Meksika cavefish Astyanax mexicanus (A. mexicanus), özelliği evrim çevre pertürbasyon karşılık olarak çalışmak için bir model var. A. mexicanus gözlü yüzey-konut formları ve sağlam morfolojik ve davranışsal farklılıklar içeren birden çok kör mağaralarda yaşayan nüfus olduğu gibi adlı biri yok. Uyku kaybı birden çok, cavefish bağımsız olarak gelişti nüfus oluştu. Bu iletişim kuralı için uyku ve yüzey balık ve A. mexicanus mağara Lokomotor aktivite miktarının bir metodoloji açıklar. Bir hafta veya daha uzun bir süre için ayrı ayrı muhafaza larva veya yetişkin balık davranış görüntüleme için uygun maliyetli bir video izleme sistemi sağlar. Sistem yaşında 4 gün sonrası döllenme yoluyla yetişkinliğe balık için uygulanabilir. Yaklaşım aynı zamanda tek bir alanda birden çok balık kaydederek sosyal etkileşimler uyku üzerinde etkileri ölçmek için adapte edilebilir. Davranış kayıtları, veri kullanarak izleme yazılımı otomatik analiz ve uyku analiz süresi, dersin uzunluğu ve dersin numarası da dahil olmak üzere birden çok uyku değişken ölçmek özel komut dosyaları kullanılarak işlenir. Bu sistem ölçü uyku, sirkadiyen davranış ve neredeyse herhangi bir balık türleri Zebra balığı ve takımıdır gibi Lokomotor aktivite için uygulanabilir.

Larva yaşları 4-30 dpf güvenilir bir şekilde kapalı şekil 1' de açıklanan özel yapı sistemindeki kaydedilebilir. Sistem IR ve görünür aydınlatma çeşitli koşullarda görünür ışık (şekil 1A), aydınlık ve karanlık koşullarda kayıtları için izin vermek için içerir. Videolar sonra izleme yazılımı (şekil 1BC) kullanılarak analiz ve özel uyku makro (bkz: Tamamlayıcı Download...

Bu iletişim kuralı Lokomotor davranış ve Meksika cavefish uykusunda miktarının için metodoloji ayrıntıları. Önceki analizlere bu davranışları sosyal yer alan balık ölçmek için genişletilir. Bu sistem uyku ve aktivite diğer balık türleri çalışmak için yaygın olarak uygulanabilir.

Uyku ve Meksika Cavefish Lokomotor aktivite otomatik ölçümleri

Across phyla, sleep is characterized by highly conserved behavioral characteristics that include elevated arousal threshold, rebound following sleep ...

Bu protokol herhangi bir balık popülasyonundaki uyku ve aktiviteyi ölçmek için kullanılabilir ve uyku regülasyonlarını incelemek için kullanılan model sistemlerin sayısını genişletme potansiyeline sahiptir. Bu tekniğin avantajı esnekliğidir. Örneğin, balıklar çeşitli arena boyutlarında veya tek ildeki veya grup lu deneylerde izlenebilir.Bu sistemde uyku ölçme gücü yüksek iş gücü ilaç veya genetik tarama için yöntemin amenability olduğunu. Bu yöntemi, önemli ölçüde farklı uyku fenotiplerini gösteren iki farklı mağara balığı popülasyonunda uykuevriminin incelenmesine uyguladık. Davranışsal görüntüleme için bir sistem kurmak zor olsa da, sistemimiz larva ve erişkin balıkları incelemek için uygun maliyetli bir yöntem sunmaktadır.Larva A.mexicanus'ta uyku ve sirkadiyen ritimleri incelemek için lokomotor davranışı doğru bir şekilde izlemek için sistemi oluşturmak için, larva takip sistemi için bir platform oluşturmak için 0.33 santimetre kalınlığında beyaz işaret akrilik kullanın. Kayıt platformlarını, balık içeren arenaların davranışsal izleme deneyleri sırasında yer alacağı ışıklı kare ısı lavabonun üzerine yerleştirin ve optimum aydınlatma ve kontrast için kızılötesi ni yaymak için hayvan gövdesindeki ışıklar arasında kutunun içine ikinci bir akrilik yerleştirin. Tüm larva izleme aşamasını ve aydınlatmayı kapalı bir plastik tüpün içine yerleştirin.Lensi deneysel olarak uygun bir web kamerasından çıkarmak için döner bir alet kullanın. İç gövdeyi çıkarmak için kameranın arka daki küçük vidaları çıkarın ve lensin geri kalanını gevşetmek için kameranın gövdesindeki küçük vidaları çıkarın. Lensi kestikten sonra kalan lens gövdesinin herhangi bir kısmını çıkarmak için küçük bir tornavida kullanın.Ve şarj-coupled cihazın veya CCD muhafaza üst kısmında mavi ışık yayan diyot kaldırın. Daha sonra, iki dış vidayı orijinal konumlarına geri vidalamadan önce iç gövdeyi orijinal yönüyle döndürün. Kameranın bir lens adaptörüeşlik edene kadar ekstra plastik yumuşatma yuvarlak bir plastik yönlendirme bit imal etmek için kameranın içini yönlendirmek için küçük bir testere kullanın.Kamerayla doğrudan temas etmeden kameranın içine mümkün olduğunca yakın bir kızılötesi geçiş filtresi tonu tonuyla kameranın arkasına doğru 35 milimetrelik sabit lensin adaptörünün vidasını verin. Daha sonra kamera yı ve lensi, sahne ve ışıkları barındıran tüpün üst kısmındaki kapağın içine delinmiş deliğe yerleştirin ve USB'yi hayvanların kaydedeceği bilgisayara takın. Yetişkin balıklar için bir uyku sistemi oluşturmak için, ilk yaklaşık 46 santimetre aralıklarla kızılötesi şeritler kesti.Ve kızılötesi ışığı yaymak için 46'ya 5'lik 0,32 santimetre lik ışık geçişi beyaz işaret akrilik levhayı her kızılötesi ışık şeridinin tam önüne yerleştirin. Daha sonra tüm tankları arkaya monte edilmiş kızılötesi aydınlatmayı destekleyen bir rafa yerleştirin ve tek tek arenalar oluşturmak için opak plastik bölücüler ve 10 litrelik cam tanklar kullanın. Meksika tetra balığının lokomotor aktivitesini kaydetmek için 4-6 post-fertilizasyon balığı 24 kuyulu doku plakasının bireysel kuyularına, ve altı kuyulu doku plakasının bireysel kuyularında 20-30 post-fertilizasyon ait.Bölücüler olsun veya olmasın, 10 litrelik tank başına beş yetişkine kadar sosyal bir ortamda yetişkin tetra uyku su ve aktivite kaydetmek için. Bu temsili deneyde, üç bağımsız mağara balığı popülasyonundan larva balıkları yüzey balıklarına göre uykuda önemli bir azalma göstermiştir. Uyku da önemli ölçüde yetişkin Pachon, Molino ve Tinaja mağara balık yüzey balık göre azaltılmış olarak test edilen tüm çağlar boyunca bu uyku üretimi tutarlıdır.Özellikle, sosyal konut sağlam mağara balık popülasyonları bir bodrum etkisi nedeniyle Pacho mağara balık uyku etkilemeden yüzey balık uyku azalttı. Balık kayıt yaparken kamera aydınlatmaarka göre balık sinyalini geliştirmek için en uygun olduğundan emin olmak için alınmalıdır. Metinde tam olarak açıklanan ve herhangi bir laboratuar ayarı için uygun olması gereken bu protokol için bazı temel komut satırı kodlaması gereklidir.Bu protokol uyku evrimi hakkında çok sayıda soruya yol açmıştır ve şu anda uyuşturucu ekranları için kullanılmakta olan, uyku davranışı izlemek, ve sosyal davranış uyku nasıl etkilediğini anlamak.

automated-measurements-sleep-locomotor-activity-mexican

Research

JoVE Journal

Behavior

Davranış

Biz günlük lokomotor aktivite ritimleri kayıt için prosedürler...

Sirkadiyen Rhythms Eğitim ve Parametreler Uyku Lokomotor Aktivitesi Assaying Drosophila</em

Bir prosedür elektroansefalogram, elektromiyogram ve serebral laktat konsantrasyon takip edilir iken optogenetically kortikal piramidal nöronların etkinlik işlenmesi için tarif edilmektedir. Onlar kendiliğinden uyku / uyanıklık döngüsü geçmesi ise Deneysel kayıtları kablo-tethered fareler üzerinde gerçekleştirilmiştir. Optogenetic cihaz laboratuar monte edilmiştir; kayıt ekipman ticari olarak temin edilebilmektedir.

Eşzamanlı Elektroensefalografi, Kemirgen Serebral Korteks Laktat Konsantrasyonu ve Nöronal Faaliyet Optogenetic Manipülasyon Gerçek zamanlı ölçüm

Bu videoda, anestezi uygulanmış bir fareye elektroensefalogram (EEG) ve elektromiyogram (EMG) elektrot düzeneğinin implante edilmesi için bir protokol gösterilmektedir. İşlem, fareyi stereotaksik bir çerçeve üzerine sabitlemeyi, kafatasında orta hat kesisi yapmayı, elektrotlar için delikler açmayı ve sinyal kaydı için elektrot ünitesini sabitlemeyi içerir. Kurtarma işleminden sonra, farenin uyku-uyanıklık davranışı kaydedilen sinyaller kullanılarak analiz edilir.

Elektroensefalogram ve Elektromiyogram Kayıtları ile Farelerde Uyku Davranışının Analiz Edilmesi

Burada, akustik uyarılara karşı uyku tepkisini modüle eden, farelerde non-REM uykusunda sinirsel ve kardiyak değişkenlerin zamansal dinamiklerini tanımlamak için deneysel ve analitik prosedürleri sunuyoruz.

Uyku Faresinde Spektral Gücün ve İnsanın Yavaş yavaş Dinamiklerinin Nicelleştirilmesi

Etkinlik tabanlı ev-kafes izleme aracılığıyla uyku ölçme bir yüksek-den geçerek yöntemi açıklamak. Bu yöntem geleneksel EEG tabanlı yöntemleri avantaj sunar. Toplam uyku süresi belirlenmesi için de doğrulanır ve uyku insan hastalık kemirgen modellerinde izlemek için güçlü bir araç olabilir.

Uyku süresi Rodents noninvaziv, yüksek üretilen iş belirlenmesi

Bu makale sürekli kayıt ve kerevit kardiyak ve Lokomotor faaliyetlerin analizleri için bir noninvaziv biomonitoring sistemi sunar. Bu sistem yakın kızılötesi optik sensör, video izleme modülü ve fizyolojik durumuna yansıtır ve kerevit davranış sırasında kalp atışı dalgalanmaları karakterize kerevit sinyal değerlendirmek için yazılım oluşur.

Kerevit kardiyak ve davranışsal faaliyetlerinin sürekli noninvaziv ölçme

Bu iletişim kuralı, biz Astyanax mexicanus yetişkin doğurmak, larvalar yükseltmek nasıl gösterir ve bütün Dağı immünhistokimya yüzey fenotipleri karşılaştırmak ve morphotypes mağara sonrası larva balık gerçekleştirin.

Meksika Tetra Astyanax mexicanus analiz Post-larval fenotipleri ve bütün Dağı immünhistokimya için yetiştirme

Evrimsel modeli sistem Astyanax mexicanusgenler manipülasyon yaklaşımları açıklar. Üç farklı teknikler açıklanmıştır: Tol2-aracılı transgenesis, CRISPR/Cas9 ve nakavt morpholinos kullanarak ifade kullanarak genom hedeflenen manipülasyon. Bu araçları doğrudan soruşturma yüzey ve mağaralarda yaşayan biçimler arasında varyasyon yatan genlerin kolaylaştıracaktır.

Meksika Cavefish işlevinde Gene manipülasyon

Burada, davranışları ve hayati bir mechanosensory sistem boyama yöntemleri için yüksek üretilen iş çalışma Meksika cavefish bir dizi mevcut. Bu yöntemler davranışları çalışmaları için pratik ve düşük maliyetli bir yöntem sağlayan ücretsiz yazılım ve özel komut dosyalarını kullanın.

Davranışsal izleme ve Meksika Cavefish Neuromast görüntüleme

Lokomotor aktivite (LMA) farelerde davranış basit ve kolay uygulanabilir bir ölçüsüdür. Video izleme yazılımı (VTS) ve LMA Kaplin LMA analizi manuel, çizgi geçiş yöntemi ile karşılaştırıldığında, özellikle, özgüllük ve duyarlılık geliştirilmesi için izin verir. Ayrıca VTS fare LMA uzun vadeli izleme sağlar.

Fare Kısa ve Uzun Vadeli Lokomotor Aktivite video Takip Yazılımı ile Analiz

Öğrenin Meksika mağara balığında lokomotor davranış ve uyku ölçüm yöntemlerini. Sosyal barınma koşullarında etkinlik analizi yaparak diğer balık türlerine uygulanabilir bir sistem geliştirir.

Uyku ve Meksika Cavefish Lokomotor aktivite otomatik ölçümleri

Daha fazla video keşfet