Studying RNA Interactors of Protein Kinase RNA-Activated during the Mammalian Cell Cycle

Sujin Kim; Minjeong Kang; Yoosik Kim

doi:10.3791/59215

RNA Interactors Protein kinaz memeli hücre döngüsü sırasında RNA-harekete geçirmek, eğitim

JoVE Journal
Biochemistry

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biochemistry

Studying RNA Interactors of Protein Kinase RNA-Activated during the Mammalian Cell Cycle

RNA Interactors Protein kinaz memeli hücre döngüsü sırasında RNA-harekete geçirmek, eğitim

Full Text

6,907 Views

10:05 min

March 5, 2019

DOI: 10.3791/59215-v

Sujin Kim¹, Minjeong Kang¹, Yoosik Kim¹

¹Department of Chemical and Biomolecular Engineering and KI for Health Science and Technology (KIHST),Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Memeli hücre HeLa hücreleri kullanarak döngüsü sırasında eğitim RNA-interactors için çift iplikçikli RNA bağlayıcı protein kinaz (PKR) RNA-harekete geçirmek ve deneysel yaklaşımlar mevcut. Formaldehit crosslink RNA-PKR kompleksleri ve immunoprecipitation PKR bağımlı RNA'ların zenginleştirmek için bu yöntemi kullanır. Bu RNA'ların daha da yüksek üretilen iş sıralama veya qRT-PCR ile çözümlenebilir.

Bu protokol, rna bağlayıcı protein PKR'nin RNA interaktörlerini genom çapında bir şekilde tanımlamak için bir yöntem sağlar. RNA bağlayıcı protein tarafından gen ekspresyonunun transkripsiyon sonrası düzenlenmesini daha iyi anlamamıza yardımcı olur. Bu tekniğin en büyük avantajı, RNA bağlayıcı proteinlere bağlı RNase'yi onarmak ve immünopresipitasyon yoluyla zenginleştirmek için formaldehitin verimli çapraz bağlanmasını kullanmastır.

Parkinson ve Alzheimer hastalığı gibi nörodejeneratif hastalığı olan hastalarda aktive PKR gözlenir. PKR-etkileşen çift iplikçikli RNase'nin tanımlanması bu dejeneratif hastalıkların patogenezini daha iyi anlamamıza yardımcı olacaktır. Bu yöntem, herhangi bir RNA bağlayıcı proteinlerin RNA interactors çalışma için kullanılabilir.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos