Name: Aneuploidi için Preimplantasyon Genetik Test için Yarı iletken Sıralama (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2019-08-25T13:00:00.000+00:00
Duration: 9 s
Description: Öğrenin, embriyolardaki anöploidi taraması için yarı iletken dizileme yöntemini. Bu hızlı ve düşük maliyetli teknik, PGT-A için güvenilir genom dizilemesi sağlar ve beş günlük sonuç süresiyle üreme sağlığında klinik uygulamalara katkıda bulunur.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma Hong Kong, Çin Ulusal Doğa Bilimleri Vakfı (Ref No. 81860272), Guangxi İl Bilim ve Teknoloji Vakfı (Ref No) Büyük Araştırma Planı Genel Araştırma Fonu (Ref No. 14162417) tarafından desteklenmiştir. AB16380219) ve Çin Doktora Sonrası Bilim Vakfı Hibe (Ref No. 2018M630993) Çin.

<ol><li>Balaban, B., Urman, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Effect+of+oocyte+morphology+on+embryo+development+and+implantation%5BTitle%5D)+AND+%22Reproductive+BioMedicine+Online%22%5BJournal%5D)">Effect of oocyte morphology on embryo development and implantation.</a> Reproductive BioMedicine Online. 12 (5), 608-615 (2006).</li>
<li>Capalbo, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Correlation+between+standard+blastocyst+morphology%2C+euploidy+and+implantation%3A+An+observational+study+in+two+centers+involving+956+screened+blastocysts%5BTitle%5D)+AND+%22Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">Correlation between standard blastocyst morphology, euploidy and implantation: An observational study in two centers involving 956 screened blastocysts.</a> Human Reproduction. 29 (6), 1173-1181 (2014).</li>
<li>Magli, M. C., Gianaroli, L., Ferraretti, A. P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosomal+abnormalities+in+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+and+Cellular+Endocrinology%22%5BJournal%5D)">Chromosomal abnormalities in embryos.</a> Molecular and Cellular Endocrinology. 183, 29-34 (2001).</li>
<li>Trussler, J. L., Pickering, S. J., Ogilvie, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Investigation+of+chromosomal+imbalance+in+human+embryos+using+comparative+genomic+hybridization%5BTitle%5D)+AND+%22Reproductive+BioMedicine+Online%22%5BJournal%5D)">Investigation of chromosomal imbalance in human embryos using comparative genomic hybridization.</a> Reproductive BioMedicine Online. 8 (6), 701-711 (2004).</li>
<li>Fragouli, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cytogenetic+analysis+of+human+blastocysts+with+the+use+of+FISH%2C+CGH+and+aCGH%3A+Scientific+data+and+technical+evaluation%5BTitle%5D)+AND+%22Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">Cytogenetic analysis of human blastocysts with the use of FISH, CGH and aCGH: Scientific data and technical evaluation.</a> Human Reproduction. 26 (2), 480-490 (2011).</li>
<li>Calhaz-Jorge, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Assisted+reproductive+technology+in+Europe%2C+2013%3A+Results+generated+from+European+registers+by+ESHRE%5BTitle%5D)+AND+%22Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">Assisted reproductive technology in Europe, 2013: Results generated from European registers by ESHRE.</a> Human Reproduction. 32 (10), 1957-1973 (2017).</li>
<li>Dyer, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((International+committee+for+monitoring+assisted+reproductive+technologies+world+report%3A+Assisted+reproductive+technology+2008%2C+2009+and+2010%5BTitle%5D)+AND+%22Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">International committee for monitoring assisted reproductive technologies world report: Assisted reproductive technology 2008, 2009 and 2010.</a> Human Reproduction. 31 (7), 1588-1609 (2008).</li>
<li>Dahdouh, E. M., Balayla, J., García-Velasco, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+chromosome+screening+improves+embryo+selection%3A+A+meta-analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Comprehensive chromosome screening improves embryo selection: A meta-analysis.</a> Fertility and Sterility. 104 (6), 1503-1512 (2015).</li>
<li>Chen, M., Wei, S., Hu, J., Quan, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Can+Comprehensive+Chromosome+Screening+Technology+Improve+IVF%2FICSI+Outcomes%3F+A+Meta-Analysis%5BTitle%5D)+AND+%22PloS+One%22%5BJournal%5D)">Can Comprehensive Chromosome Screening Technology Improve IVF/ICSI Outcomes? A Meta-Analysis.</a> PloS One. 10 (10), e0140779(2015).</li>
<li>Northrop, L. E., Treff, N. R., Levy, B., Scott, J. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((SNP+microarray-based+24+chromosome+aneuploidy+screening+demonstrates+that+cleavage-stage+FISH+poorly+predicts+aneuploidy+in+embryos+that+develop+to+morphologically+normal+blastocysts%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">SNP microarray-based 24 chromosome aneuploidy screening demonstrates that cleavage-stage FISH poorly predicts aneuploidy in embryos that develop to morphologically normal blastocysts.</a> Molecular Human Reproduction. 16 (8), 590-600 (2010).</li>
<li>Barbash-Hazan, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Preimplantation+aneuploid+embryos+undergo+self-correction+in+correlation+with+their+developmental+potential%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Preimplantation aneuploid embryos undergo self-correction in correlation with their developmental potential.</a> Fertility and Sterility. 92 (3), 890-896 (2009).</li>
<li>Fragouli, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comprehensive+cytogenetic+analysis+of+the+human+blastocyst+stage%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Comprehensive cytogenetic analysis of the human blastocyst stage.</a> Fertility and Sterility. 90 (11), S36(2008).</li>
<li>Fiorentino, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+and+validation+of+a+next-generation+sequencing-based+protocol+for+24-chromosome+aneuploidy+screening+of+embryos%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Development and validation of a next-generation sequencing-based protocol for 24-chromosome aneuploidy screening of embryos.</a> Fertility and Sterility. 101 (5), 1375-1382 (2014).</li>
<li>Fiorentino, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Application+of+next-generation+sequencing+technology+for+comprehensive+aneuploidy+screening+of+blastocysts+in+clinical+preimplantation+genetic+screening+cycles%5BTitle%5D)+AND+%22Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">Application of next-generation sequencing technology for comprehensive aneuploidy screening of blastocysts in clinical preimplantation genetic screening cycles.</a> Human Reproduction. 29 (12), 2802-2813 (2014).</li>
<li>Wells, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Clinical+utilisation+of+a+rapid+low-pass+whole+genome+sequencing+technique+for+the+diagnosis+of+aneuploidy+in+human+embryos+prior+to+implantation%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Medical+Genetics%22%5BJournal%5D)">Clinical utilisation of a rapid low-pass whole genome sequencing technique for the diagnosis of aneuploidy in human embryos prior to implantation.</a> Journal of Medical Genetics. 51 (8), 553-562 (2014).</li>
<li>Quail, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+tale+of+three+next+generation+sequencingplatforms%3A+comparison+of+Ion+Torrent%2C+PacificBiosciences+and+Illumina+MiSeq+sequencers%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">A tale of three next generation sequencingplatforms: comparison of Ion Torrent, PacificBiosciences and Illumina MiSeq sequencers.</a> BMC Genomics. 13 (1), 1-13 (2012).</li>
<li>Goodwin, S., McPherson, J. D., McCombie, W. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coming+of+age%3A+ten+years+of+next-generation+sequencing+technologies%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Reviews+Genetics%22%5BJournal%5D)">Coming of age: ten years of next-generation sequencing technologies.</a> Nature Reviews Genetics. 17 (6), 333-351 (2016).</li>
<li>Bono, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+of+a+semiconductor+next-generation+sequencing-based+protocol+for+preimplantation+genetic+diagnosis+of+reciprocal+translocations%5BTitle%5D)+AND+%22Prenatal+Diagnosis%22%5BJournal%5D)">Validation of a semiconductor next-generation sequencing-based protocol for preimplantation genetic diagnosis of reciprocal translocations.</a> Prenatal Diagnosis. 35 (10), 938-944 (2015).</li>
<li>Harton, G. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ESHRE+PGD+Consortium%2FEmbryology+Special+Interest+Groupbest+practice+guidelines+for+polar+body+and+embryo+biopsy+for+preimplantation+genetic+diagnosis%2Fscreening+%28PGD%2FPGS%29%5BTitle%5D)+AND+%22Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">ESHRE PGD Consortium/Embryology Special Interest Groupbest practice guidelines for polar body and embryo biopsy for preimplantation genetic diagnosis/screening (PGD/PGS).</a> Human Reproduction. 26 (1), 41-46 (2011).</li>
<li>Liu, W. Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+performance+of+MALBAC+and+MDA+methods+in+the+identification+of+concurrent+mutations+and+aneuploidy+screening+to+diagnose+beta-thalassaemia+disorders+at+the+single-+and+multiple-cell+levels%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Clinical+Laboratory+Analysis%22%5BJournal%5D)">The performance of MALBAC and MDA methods in the identification of concurrent mutations and aneuploidy screening to diagnose beta-thalassaemia disorders at the single- and multiple-cell levels.</a> Journal of Clinical Laboratory Analysis. 32 (2), 1-8 (2018).</li>
<li>Zhang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+comparison+of+the+performance+of+four+whole+genome+amplification+kits+on+ion+proton+platform+in+copy+number+variation+detection%5BTitle%5D)+AND+%22Bioscience+Reports%22%5BJournal%5D)">The comparison of the performance of four whole genome amplification kits on ion proton platform in copy number variation detection.</a> Bioscience Reports. 37 (4), BSR20170252(2017).</li>
<li>Munné, S., Grifo, J., Wells, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mosaicism%3A+%E2%80%9Csurvival+of+the+fittest%E2%80%9D+versus+%E2%80%9Cno+embryo+left+behind%E2%80%9D%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Mosaicism: “survival of the fittest” versus “no embryo left behind”.</a> Fertility and Sterility. 105 (5), 1146-1149 (2016).</li>
<li>Del Carmen Nogales, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Type+of+chromosome+abnormality+affects+embryo+morphology+dynamics%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Type of chromosome abnormality affects embryo morphology dynamics.</a> Fertility and Sterility. 107 (1), 229-235 (2017).</li>
<li>Harton, G. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ESHRE+PGD+consortium+best+practice+guidelines+for+amplification-based+PGD%5BTitle%5D)+AND+%22Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">ESHRE PGD consortium best practice guidelines for amplification-based PGD.</a> Human Reproduction. 26 (1), 33-40 (2011).</li>
<li>Deleye, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Shallow+whole+genome+sequencing+is+well+suited+for+the+detection+of+chromosomal+aberrations+in+human+blastocysts%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Shallow whole genome sequencing is well suited for the detection of chromosomal aberrations in human blastocysts.</a> Fertility and Sterility. 104 (5), 1276-1285 (2015).</li>
<li>Bielanska, M., Tan, S. L., Ao, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chromosomal+mosaicism+throughout+human+preimplantation+development+in+vitro%3A+incidence%2C+type%2C+and+relevance+to+embryo+outcome%5BTitle%5D)+AND+%22Human+Reproduction%22%5BJournal%5D)">Chromosomal mosaicism throughout human preimplantation development in vitro: incidence, type, and relevance to embryo outcome.</a> Human Reproduction. 17 (2), Oxford, England. 413-419 (2002).</li>
<li>Treff, N. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+targeted+next-generation+sequencing-based+preimplantation+genetic+diagnosis+of+monogenic+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Fertility+and+Sterility%22%5BJournal%5D)">Evaluation of targeted next-generation sequencing-based preimplantation genetic diagnosis of monogenic disease.</a> Fertility and Sterility. 99 (5), 1377-1384 (2013).</li>
</ol>

Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.

Diğer sıralama kimyalarından farklı olarak, burada açıklanan sıralayıcı nükleotitlerin tespiti için yarı iletken kullanır. Çipin kendisi polimeraz tahrikli baz birleşme17ile hidrojen iyonlarını algılayan elektronik bir cihazdır, bu da Proton programının 2−4 saat sıralama süresini sağlar. Ayrıca, çip diğer sıralayıcı sağlayıcıları tarafından akış hücresi sıralama kimyası farklı bir hedef molekül, lokalizasyonu sağlayan bir microwell çip. Bu protokol, PGT-A uygulaması için optimize edilmiş değiştiri...

Yardımlı üreme transferi için normal kromozom kopya numaraları (euploid) ile kaliteli canlı embriyoların seçilmesi gebelik sonuçlarını iyileştirmeye yardımcı olur. Geleneksel olarak, köklü morfolojik derecelendirme sistemi yaygın kolay kullanılabilirliği ve non-invaziv doğası nedeniyle embriyo değerlendirme için kullanılır. Ancak, morfolojik değerlendirmenin sadece embriyo kalitesi1 ve implantasyon potansiyeli2hakkında sınırlı bilgi sağlayabileceği gösterilmiştir. Bir temel nedeni embriyoların kromozom bileşimi değerlendirilmesinde yetersizlik olduğunu.
Kromozom alofoidi (kromozomların anormal kopya sayısı) embriyonik gelişim durmasına, implantasyon yetmezliğine veya gebelik kaybına yol açan başlıca nedenlerden biridir. Aneuploidin in oluşumu insan embriyolarında iyi belgelenmiştir, dekolte evresi embriyolarda %60−%70,blastosistlerde %3,4 ve %50−%60'ı blastosistlerde%50-60'dır. Bu, bir dereceye kadar, yaklaşık% 35−40%6,7korumuştur in-vitro fertilizasyon (IVF) tedavisi, gebelik oranının iyileştirilmesinde darboğaz katkıda bulunmuştur. Bu nedenle, transfer için euploid embriyoların seçilmesi gebelik sonuçlarını iyileştirmek için yararlı olduğuna inanılmaktadır. Bu amaçla, aneuploidi için preimplantasyon genetik test (PGT-A) daha genetik yaklaşımlar kullanılarak embriyo canlılığı araştırmak için geliştirilmiştir. PGT-A'nın önemli rolünü destekleyen randomize kontrollü çalışmalar ve kohort çalışmaları giderek artmaktadır. PGT-A uygulamasının düşük oranını azalttığı ve klinik gebelik oranını ve implantasyon oranını artırdığı kanıtlanmıştır8, devam eden gebelik oranı ve canlı doğum oranı9.
Tarihsel olarak PGT-A'da floresan in situ hibridizasyon (FISH), karşılaştırmalı genomik hibridizasyon (CGH), dizi-CGH ve tek nükleotid polimorfizm (SNP)-mikrodizi gibi farklı yöntemler uygulanmıştır. Daha önceki çalışmalar, FISH tarafından dekolte evresi embriyoları için PGT-A'nın 59273array-CGH veya SNP-microarray5927310. Bu tutarsızlıklar kromozom mozaisiliğine, FISH teknik eserlerine veya gelişim sırasında kromozom elayrımı hatalarının embriyonik kendini düzeltmesine bağlanabilir11. Bu yaygın olarak dizi tabanlı PGT-A dizi-CGH veya SNP-mikrodizi için blastosist trophectoderm (TE) biyopsikullanarak embriyolarda kromozom dengesizliği tanımlamak için etkili olduğu kabul edilmiştir10,12. Son zamanlarda, tek hücreli yeni nesil sıralama (NGS) genetik analiz için yüksek iş ve maliyet-etkin bir yaklaşım sağlar ve PGT-A klinik uygulanabilirlik göstermiştir13,14,15, hangi bir yapmak şu anda mevcut yöntemlere umut verici bir alternatif.
Burada, insan embriyolarında aneuploidi taraması için hızlı, sağlam ve düşük maliyetli yarı iletken dizilime tabanlı NGS yöntemisi saiyoruz. İş akışının ilk adımı, biyopsi yapılan embriyo örneğinin tüm genom amplifikasyonu (WGA) olup, tek hücreli WGA kiti kullanılarak, ardından sıralama kütüphanesinin inşası ve ardından yarı iletken sıralama sistemi üzerinde sıralama dır.
DNA iplikçik sentezi sırasında her deoksiribonükleoside trifosfatdan salınan H+ iyonlarının tespit edilmesi yle sistem, yarı iletken elementler tarafından yakalanan kimyasal sinyalleri (pH değişimi) doğrudan dijital verilere aktarır. , daha fazla DNA dizisi bilgi olarak yorumlanır. Pahalı optik algılama ve karmaşık sıralama reaksiyonları gereksinimini ortadan kaldıran bu basit sıralama kimyası toplam reaktif maliyetini azaltır vesıralama çalışma süresini 2−4 saat 16'ya kadar kısaltır. Daha da önemlisi, üreticinin performans özelliklerine göre, yarı iletken sıralama platformu çalıştıran başına 15 GB'a kadar sıralama verisi (kitaplığın kalitesine bağlıdır) üretebilir ve bu da diğer sıralayıcılardan önemli ölçüde daha yüksektir. sadece yaklaşık 3−4 GB veri üreten (2 x 75 bp okuma uzunluğu ile)17. PGT-A'nın klinik uygulamalarında, bu platform 80 milyon adede kadar okuma17 ve her numunenin en az bir milyon benzersiz okuması üreten çip başına 24 örnek elde edebilir. Okuma derinliği, her numunenin en az 0,05x tüm genom kapsama alanına sahip olmasını sağlayabilir. Bu platformun yukarıdaki avantajları ideal bir tarama yöntemi yapmak ve böylece, PGT-A18geniş uygulamaları kolaylaştırmak.

<table><tbody><tr><td>PCR tüpleri, 0.2 mL</td><td>Axygen</td><td>PCR-02D-C</td><td></td></tr><tr><td>UltraPure 0.5M EDTA, pH 8.0</td><td>ThermoFisher</td><td>15575020</td><td></td></tr><tr><td>PBS, pH 7.4, Ca2+ ve Mg2+ içermeyen</td><td>ThermoFisher</td><td>10010023</td><td></td></tr><tr><td>1.0 M NaOH (1.0N) solüsyonu</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>S2567</td><td>Melt-off solüsyonu için. Moleküler dereceli</td></tr><tr><td>Eppendorf LoBind Tüpleri, 1,5 mL</td><td>Fisher Scientific</td><td>13-698-791</td><td></td></tr><tr><td>İyon Artı Parça Kitaplığı Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td></td></tr><tr><td>ELGA PURELAB Flex 3 Su Arıtma Sistemi veya Eşdeğeri 18 M&Omega; su sistemi</td><td>ThermoFisher</td><td>4474524</td><td></td></tr><tr><td>İyon Plus Parça Kitaplığı Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td></td></tr><tr><td>PicoPLEX WGA Amplifikasyon tamponu</td><td>Rubicon Genomics</td><td>R30050</td><td>Bu, SurePlex DNA Amplifikasyon Sistemi ile değiştirilebilir, katalog numarası: PR-40-415101-03.</td></tr><tr><td>PicoPLEX WGA Amplifikasyon enzimi</td><td>Rubicon Genomics</td><td>R30050</td><td>Bu, SurePlex DNA Amplifikasyon Sistemi ile değiştirilebilir, katalog numarası: PR-40-415101-03.</td></tr><tr><td>İyon OneTouch Amplifikasyon Plakası</td><td></td><td></td><td>Kit içinde: İyon OneTouch 2 Sarf Malzemeleri (Parça No. A26367). Sayfa 5'te genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>İyon PI Tavlama Tamponu</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>MyOne Boncuk Yakalama Çözeltisi</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Agilent 2100 Biyoanalizör cihazı</td><td>Agilent</td><td>G2939AA</td><td></td></tr><tr><td>İyon OneTouch Kırma Çözeltisi (siyah kapak)</td><td></td><td></td><td>Kit içinde: İyon PI Merhaba? Q OT2 Solutions 200 (Parça No. A26429). Sayfa 5'teki genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>Dynabeads MyOne Streptavidin C1</td><td>ThermoFisher</td><td>65001</td><td></td></tr><tr><td>PicoPLEX WGA Hücre ekstraksiyon tamponu</td><td>Rubicon Genomics</td><td>R30050</td><td>Bu, SurePlex DNA Amplifikasyon Sistemi ile değiştirilebilir, katalog numarası: PR-40-415101-00.</td></tr><tr><td>PicoPLEX WGA Hücre ekstraksiyon enzimi</td><td>Rubicon Genomics</td><td>R30050</td><td>Bu, SurePlex DNA Amplifikasyon Sistemi ile değiştirilebilir, katalog numarası: PR-40-415101-03.</td></tr><tr><td>İyon PI Çip Kiti v3</td><td>ThermoFisher</td><td>A26771</td><td></td></tr><tr><td>İyon Çip Minifuge, 230 V</td><td>ThermoFisher</td><td>4479673</td><td></td></tr><tr><td>İyon PI dATP</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td></td></tr><tr><td>İyon PI dCTP</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td></td></tr><tr><td>İyon PI dGTP</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td></td></tr><tr><td>İyon Plus Parça Kitaplığı Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td></td></tr><tr><td>Ion Plus Parça Kitaplığı Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td></td></tr><tr><td>ThermoQ&ndash; Sıcaklık Kuru Banyo</td><td>TAMAR</td><td>HB-T2-A</td><td></td></tr><tr><td>NEBNext dsDNA Fragmentaz</td><td>New England Biolabs</td><td>M0348L</td><td></td></tr><tr><td>NEBNext dsDNA Fragmentaz</td><td>New England Biolabs</td><td>M0348L</td><td></td></tr><tr><td>İyon PI dTTP</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td></td></tr><tr><td>İyon OneTouch 2 Cihaz</td><td>ThermoFisher</td><td>INS1005527</td><td>ThermoFisher Katalog numarası: 4474778.</td></tr><tr><td>Ion Plus Parça Kitaplığı Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td></td></tr><tr><td>Ion One Touch ES</td><td>ThermoFisher</td><td>8441-22</td><td>ThermoFisher Katalog numarası: 4469495. Sayfa 5'teki genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>Etanol</td><td>SIGMA-ALDRICH</td><td>51976</td><td>Bu, herhangi bir markanın moleküler dereceli mutlak etanolü ile değiştirilebilir.</td></tr><tr><td>PicoPLEX WGA Ekstraksiyon enzimi seyreltme tamponu</td><td>Rubicon Genomics</td><td>R30050</td><td>Bu, SurePlex DNA Amplifikasyon Sistemi ile değiştirilebilir, katalog numarası: PR-40-415101-01.</td></tr><tr><td>PicoPLEX WGA Ekstraksiyon enzimi seyreltme tamponu</td><td>Rubicon Genomics</td><td>R30050</td><td>Bu, SurePlex DNA Amplifikasyon Sistemi ile değiştirilebilir, katalog numarası: PR-40-415101-02.</td></tr><tr><td>Qubit 3.0 Florometre</td><td>ThermoFisher</td><td>Q33216</td><td>Bu model Qubit 4 Florometre ile değiştirilmiştir, Katalog numarası: Q33226.</td></tr><tr><td>Qubit ds DNA HS Test kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>M2002-02</td><td></td></tr><tr><td>Qubit Test Tüpleri</td><td>ThermoFisher</td><td>Q32856</td><td></td></tr><tr><td>İyon PI Köpürtme Çözeltisi</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td></td></tr><tr><td>Kütüphanelerin barkodlaması için indeks</td><td>BaseCare</td><td></td><td>bu kurum içi hazırlanmış bir indekstir. Kullanıcılar, ThermoFisher Ion Xpress Barkod Adaptör Kitlerinden (Cat. 4474517)</td></tr> <tr><td>İyon PI Yükleme Tamponu</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td></td></tr><tr><td>Katı(TM) Tampon Kiti-1X Düşük TE Tampon</td><td>ThermoFisher</td><td>4389764</td><td></td></tr><tr><td>Agencour AMPure XP Kiti</td><td>Beckman Coulter</td><td>A63880</td><td></td></tr><tr><td>DynaMag-2 mıknatıs (manyetik raf)</td><td>ThermoFisher</td><td>12321D</td><td></td></tr><tr><td>İyon PI Master Mix PCR tamponu</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Sorvall Legend Micro 17 Microcentrifuge</td><td>Micro 17</td><td>75002430</td><td></td></tr><tr><td>Ion Plus Fragment Library Kit</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td></td></tr><tr><td>Nükleaz içermeyen su</td><td>ThermoFisher</td><td>AM9922</td><td>Bu, başka bir marka ile değiştirilebilir.</td></tr><tr><td>PicoPLEX WGA Nükleaz içermeyen su</td><td>Rubicon Genomics</td><td>R30050</td><td>Bu, SurePlex DNA Amplifikasyon Sistemi ile değiştirilebilir, katalog numarası: PR-40-415101-03.</td></tr><tr><td>İyon OneTouch Yağ şişesi</td><td></td><td></td><td>Ion PI Merhaba? Q OT2 Solutions 200 (Parça No. A26429). Sayfa 5'te genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>İyon Artı Parça Kitaplığı Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td>Sayfa 3'te genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>çift sarmallı DNA standardı</td><td></td><td></td><td>Bu, kitaplığın nicelleştirilmesinden önce Qubit'in kalibrasyonu için kurum içi hazırlanmış bir DNA standardıdır.</td></tr><tr><td>PicoPLEX WGA Preamplifikasyon tamponu</td><td>Rubicon Genomics</td><td>R30050</td><td>Bu, SurePlex DNA Amplifikasyon Sistemi ile değiştirilebilir, katalog numarası: PR-40-415101-03.</td></tr><tr><td>PicoPLEX WGA Preamplifikasyon enzimi</td><td>Rubicon Genomics</td><td>R30050</td><td>Bu, SurePlex DNA Amplifikasyon Sistemi ile değiştirilebilir, katalog numarası: PR-40-415101-03.</td></tr><tr><td>Kütüphane Amplifikasyon Astar Karışımı</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td>Sayfa 3'te Genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>İyon OneTouch Reaksiyon Filtresi</td><td></td><td></td><td>Sayfa 5'te genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>Kurtarma Yönlendiricisi</td><td></td><td></td> Sayfa <td>5'te genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>Geri Kazanım Tüpleri</td><td></td><td></td> Sayfa <td>5'te genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>ISP Yeniden Süspansiyon Çözümü</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>İyon Proton</td><td>ThermoFisher</td><td>DA8600</td><td>Bu model, Sun Yat-Sen Üniversitesi'nden Da An Gene Co., LTD. tarafından ThermoFisher'dan ithal edilmiştir ve klinik uygulama için Çin Gıda ve İlaç Dairesi tarafından onaylanmıştır. ThermoFisher'daki katalog numarası 4476610'dir.</td></tr><tr><td>İyon PI Merhaba? Q Sıralama Polimeraz</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td></td></tr><tr><td>İyon PI Sıralama Sıralayıcı için astar</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>sunucusu</td><td>Lenovo</td><td>T260</td><td></td></tr><tr><td>İyon PI Küre Parçacıkları Platin</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>PCR SuperMix Yüksek Sadakatli</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td></td></tr><tr><td>Nalgene 25mm Şırınga Filtreleri</td><td>ThermoFisher</td><td>724-2045</td><td>Gözenek boyutu: 0.45&mu;m. Özellikle sulu sıvılar için.</td></tr><tr><td>İyon PI Merhaba? Q W2 Çözeltisi</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td></td></tr><tr><td>İyon PI 1X W3 Çözeltisi</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td></td></tr><tr><td>İyon OneTouch Yıkama Çözeltisi C1</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>İyon PGM Merhaba? Q View Sıralama Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>A30044</td><td>Sayfa 2'deki Genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>Ion Plus Parça Kitaplık Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>4471252</td><td>Sayfa 3'teki Genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>Ion PI Hi-Q Sıralama 200 Kiti (başlatma başına 1 sıralama çalışması)</td><td>ThermoFisher</td><td>A26772</td><td>Sayfa 4'teki genişletilmiş kit bileşeni</td></tr><tr><td>İyon PI Merhaba? Q OT2 200 Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>A26434</td><td>Sayfa 5'teki genişletilmiş kit bileşeni</td></tr></tbody></table>

aneuploidi için preimplantasyon genetik test için yarı iletken sıralama

Semiconductor Sequencing for Preimplantation Genetic Testing for Aneuploidy

Kromozomal aneuploi, embriyonik gelişim durmasına yol açan ana nedenlerinden biri, implantasyon yetmezliği, veya gebelik kaybı, iyi insan embriyolarında belgelenmiştir. Aneuploidi için preimplantasyon genetik test (PGT-A) önemli ölçüde embriyoların kromozomanomalileri tespit ederek üreme sonuçlarını iyileştirir genetik bir testtir. Yeni nesil sıralama (NGS) genetik analiz için yüksek iş artışı ve maliyet-etkin bir yaklaşım sağlar ve PGT-A klinik uygulanabilirlik göstermiştir. Burada embriyolarda aneuploidi taraması için hızlı ve düşük maliyetli yarı iletken dizilime tabanlı NGS yöntemini salıyoruz. İş akışının ilk adımı biyopsi yapılan embriyo örneğinin tüm genom amplifikasyonu (WGA) ve ardından sıralama kütüphanesinin inşası ve ardından yarı iletken sıralama sistemi üzerinde sıralamadır. Genellikle, bir PGT-A uygulaması için, ortalama okuma uzunluğu 150 baz çifti olan 60−80 milyon okuma üreten her yongaya 24 örnek yüklenebilir ve sıralanabilir. Yöntem, PGT-A algılamasını tekrarlanabilir, yüksek verimli, maliyet açısından verimli ve zaman tasarrufu sağlayan şablon amplifikasyonu ve sıralama kitaplığını zenginleştirme işlemi için zarif bir protokol sağlar. Bu yarı iletken sıralayıcının çalışma süresi sadece 2−4 saattir ve numune almaktan rapor verme süresini 5 güne kısaltır. Tüm bu avantajlar bu töşeyi, embriyolardan kromozomal aneuploidies tespit etmek ve böylece PGT-A geniş uygulama kolaylaştırmak için ideal bir yöntem yapmak.

Bu modifiye protokole dayanarak, yarı iletken sıralama platformu ilk kez PGT-A için uygulandı. Hem de dekolte-evre blastomerlerden biyopsiler ve blastosist evresi embriyoları üzerinde test ettik. Biyopsi yapılan hücrelerin DNA'nın bozulmasını önlemek için mümkün olan en kısa sürede WGA'ya tabi tutulması önerilmektedir. Bir önceki çalışmada farklı WGA yöntemlerinin performansı karşılaştırıldığında ve burada açıklanan yöntem 100 KB20bin boyutunda en iyi tekdüzelik ol...

Burada, kısa dönüş süresi, düşük maliyet ve yüksek iş elde etme avantajları ile aneuploidy (PGT-A) için preimplantasyon genetik test için bir yarı iletken sıralama yöntemi sokulmaktadır.

Aneuploidi için Preimplantasyon Genetik Test için Yarı iletken Sıralama

Chromosomal aneuploidy, one of the main causes leading to embryonic development arrest, implantation failure, or pregnancy loss, has been well documented ...

Burada sunduğumuz protokol, embriyolarda aneuploidin taranması için hızlı ve düşük maliyetli yarı iletken, sıralama tabanlı yöntemlerdir. Şablon amplifikasyonu gerçekleştirmek için geliştirilmiş protokol ve sıralama kitaplığı düzenlemeleri PGTA algılamayı yeniden dönüştürülebilir, yüksek iş elde etme, maliyet etkin ve zaman tasarrufu sağlar. Bu yarı iletken sıralayıcının çalışma süresi sadece 2-4 saattir.Örneklerin alınmasından rapor verme süresinin beş güne çıkarılması. Bu yöntem aneuploigrafi taraması, kopya numarası değişimi ve tek nükleotit polimorfizm aramaları için genom dizilimi sağlar. Farklı sıralama kimyası nedeniyle, bu protokol tarafından hazırlanan kütüphane doğrudan diğer sıralama sistemlerinde sıralanamaz.Ama aynı sıralayıcı, ama farklı kütüphane hazırlık, non invaziv prenatal tarama yapmak için yeteneğine sahiptir. Prosedürü gösteren Xiangchun Guo, laboratuarımızdan bir teknisyen olacak. Sıralamaya başlamak için, girdap her seyreltilmiş kütüphane ve kısaca üç saniye her zaman için mini santrifüj üzerinde dört kez spin.Sonra, her kütüphanenin beş mikrolitre almak, çekirdeksiz içine havuz, bir nokta beş mililitre tüp. Girdap karışık kütüphane ve kısaca üç saniye için bir mini santrifüj üzerinde spin. İki yeni kurtarma tüpüne 150 mikrolitre kırma çözeltisi ekleyin.Yeni kurtarma tüplerini, kurtarma yönlendiricisini ve amplifikasyon plakasını töyikurun. Yağ şişesini üç kez ters çevirerek karıştırın. Hem yağ hem de geri kazanım çözeltisinin en az üçte ikisinin dolu olduğundan emin olun.Vortex ana karışımı PCR tampon 30 saniye ve kısaca üç saniye için bir mini santrifüj üzerinde spin. Girdap küre parçacıkları ve bir dakika için karışık kütüphane ve kısaca üç saniye için bir mini santrifüj üzerinde spin. Daha sonra, 172 mikrolitre nükleaz içermeyen su, karışık kütüphanenin sekiz mikrolitresi, enzim karışımının 120 mikrolitresi ve küre parçacıklarının 100 mikrolitresini ana karışım PCR tamponunun 2000 mikrolitresini içeren tüpe ekleyerek 2400 mikrolitrelik bir ligasyon karışımı hazırlayın.Bir pipeti 800 mikrolitreye ayarlayın ve ligasyon karışımını numune portundan reaksiyon filtresine yükleyin. Yağ şişesini üç kez ters çevirin ve reaksiyon filtresine 200 mikrolitre reaksiyon yağı eklemek için P1000 pipeti kullanın. Program Proton'u seçin ve monitördeki talimatları izleyerek aygıtın doğru şekilde ayarlandığından emin olmak için destekli düğmeyi seçin.Ardından programı başlatmak için İleri'yi tıklatın. Emülsiyon PCR ürün numunesinin 100 mikrolitresini, yıkanmış boncukların 130 mikrolitresini, ES yıkama çözeltisinin 300 mikrolitresini ve erime çözeltisinin 300 mikrolitresini sekiz tüp şeridine yükleyin. Zenginleştirme sistemi üzerine sekiz tüp şerit yerleştirin.Bir pipet ucu ve yeni bir sıfır noktası iki mililitretüp yükleyin ve programı başlatın. Sıfır noktası iki mililitrelik tüpü 15, 500 kez G'yi beş dakika lığına santrifüj edin. Supernatant atın ve zenginleştirme ürünü on mikrolitre tutun.Tüpe 200 mikrolitre nükleaz içermeyen su ekleyin ve girdap ile karıştırın. Sıfır noktası iki mililitrelik tüpü tekrar santrifüj edin. Supernatant atın ve zenginleştirme ürünü 10 mikrolitre tutun.Tüpe 90 mikrolitre nükleaz içermeyen su ekleyin ve girdap ile karıştırın. Şablonu hazırlamak için, pozitif kontrolü girdap ve kısa bir süre spin. Zenginleştirme ürününün 100 mikrolitresine beş mikrolitre pozitif kontrol ekleyin.Girdap ve santrifüj 15, 500 kez G beş dakika. Supernatant atın ve şablonun 10 mikrolitre tutun. Ardından, şablon tüpüne sıralama astarının 20 mikrolitresini ve 15 mikrolitre annealing arabelleği ekleyin.Tüp girdap ve kısa bir süre üç saniye için bir mini santrifüj üzerinde spin. Tüpü ısıtılmış kapaklı bir termal döngüiçinde kuluçkaya yatırın. Daha sonra tüpyükleme tampon 10 mikrolitre ekleyin.Yukarı ve aşağı boru lar karıştırarak karıştırın. 55 mikrolitre numuneyi yukarı ve aşağı borularla karıştırın ve numuneyi çipin yükleme kuyusuna yükleyin. Kullanılan pipet ucunu ve sıfır noktası iki mililitre PCR tüp tutun.Bazı numune çipe girdiğinde çipi mini santrifüjün üzerine yerleştirin. Pozisyonunu kontrol edin ve çipi 10 dakika santrifüj edin. Bir nokta beş mililitrelik tüp içine 500 mikrolitre tavustampon ve 500 mikrolitre nükleaz içermeyen su ekleyerek %50 annealing tamponu hazırlayın.Bir nokta beş mililitrelik tüp içine 500 mikrolitre annealing tampon ve % 100 2-propanol 500 mikrolitre ekleyerek, yıkama çözeltisi hazırlayın. Daha sonra, iki yeni bir nokta beş mililitre tüpler için% 50 annealing tampon ve köpük çözeltisi bir mikrolitre 49 mikrolitre ekleyerek, köpük karışımı hazırlayın. Pipet havaköpük karışımlarından birine, ve yükleme kuyusu içine kabarcıklar 120 mikrolitre yükleyin.Aşırı çıkarılan sıvıyı çıkış kuyusu yükleme kuyuya aktarın ve çipi mini santrifüjüzerinde 30 saniye santrifüj edin. İkinci köpük karışımı için işlemi tekrarlayın. Sıfır noktasında tutulan iki mililitrelik tüp e%50'lik tamponun 55 mikrolitresini ekleyin.Pipet yukarı ve aşağı için tutulan pipet ucunu kullanın. Ekleyici tamponun 55 mikrolitresinin tümlerini yükleme kuyuya yükleyin. Belirlenen çip mini santrifüj üzerinde 30 saniye boyunca çip santrifüj.Yıkama çözeltisinin 100 mikrolitresini iyi yüklenen yongaya yükleyin ve çıkarılan sıvıyı çıkış kuyunundan atın. Bu yükleme adımLarını bir kez tekrarlayın. %50'lik tamponun 100 mikrolitresini talaş yükleme kuyuya yükleyin.Bu yükleme adımını toplam üç kez tekrarlayın. Yeni bir nokta beş mililitre tüp içine% 50 annealing tampon ve sıralama enzimaltı mikrolitre 60 mikrolitre ekleyin. Yukarı ve aşağı boru lar karıştırarak karıştırın.Yavaş yavaş pipet 65 mikrolitre bu karışık çözeltiyi yongaya iyi yükleyerek kabarcıklardan kaçınArak. Çipi ışıktan uzak tutun ve oda sıcaklığında beş dakika kuluçkaya yatırın. Son olarak, kuluçkadan sonra, fişi hemen sıralayıcıya yükleyin ve sıralamaya başlamak için ekranda Sıralama Çalıştır'ı başlat'ı tıklatın.186 dekolte evresi ve 1135 blastosist evre embriyoları üzerinde retrospektif istatistiksel analiz her iki tip örnekte de %95'in üzerinde WGA başarı oranı ile sonuçlandı. Sıralama kalite kontrol başarısızlık oranları dekolte evre grubunda %3.4, blastosist evre grubunda ise sadece %1.9 idi. Aneuploidi yanında, sıralama verileri diğer analizler için kullanılabilir.Örneğin, sıralama derinliğine ve kalitesine bağlı olarak, beş megabazdan daha küçük bir boyuta veya mycondrial DNA analizine sahip kopya numarası varyasyonları. Kopya numarası aramasındaki iyileşme ile araştırmacılar, insan erken evre embriyolarında kromozommozizmin geleceğini daha da araştırabilirler.

semiconductor-sequencing-for-preimplantation-genetic-testing-for

Research

JoVE Journal

Genetics

Genetik

Bu makale, tek hücreli FISH, blastomer çekirdeklerinin yayılmasını teknikleri, in situ hibridizasyon ve klinik bir ortamda pre-implantasyon genetik tanı (PGD) uygulanan sinyal puanlama için uygun probların seçim açıklamaktadır.

Pre-implantasyon Genetik Tanı için FISH

Bisülfit mutagenez DNA metilasyon analizi için altın standarttır. Bizim modifiye protokolü tek hücre düzeyinde DNA metilasyon analizini sağlar ve özellikle bireysel oositler için tasarlanmıştır. Ayrıca, bölünme aşamalı embriyo için de kullanılabilir.

Tek Oosit Bisülfit Mutagenez

Periventriküler Nodüler Heterotopya (PNH) malformasyonu kortikal gelişim (MCD) en sık görülen yetişkinlikte ama genetik temeli en dağınık durumda bilinmeyen kalır. Biz son zamanlarda roman aday genler MCD'ler için tanımlamak için ve doğrudan kendi etken rol içinde vivoonaylamak için bir strateji geliştirdik.

Dizi-CGH, Bütün exome sıralama ve rahim içinde elektroporasyon Rodents beyin malformasyonlar için sorumlu genlerin tanımlamak için birleştirerek yeni bir strateji

Yeni nesil sıralama (NGS) platformu (~0.5–2.0%) yüksek hata oranı tarafından sınırlı genomik karakterizasyonu için güçlü bir araçtır. NGS hata oranı önlemek ve mutasyonlar varyant alleli kesirler 0,0001 nadir, tespit etmemize izin bizim hata düzeltilmiş sıralama yöntemleri açıklanmaktadır.

Nadiren de olsa algılama hatası düzeltildi DNA ve RNA sıralama

Bu protokolün amacı, embriyo ödün vermeden gastrasyon sırasında deniz anemone nematostella vectensis genotip etmektir.

Erken gelişim sırasında deniz anemon Genotipleme

Bu çalışma, embriyo biyopsisini önleyen ve NGS kullanılarak kromozom ploidi tanımlamasını sağlayan, harcanan kültür ortamını kullanan insan embriyolarının kromozom taraması için bir protokol bildirmektedir. Bu makale, kültür ortamının hazırlanması, tüm genom amplifikasyonu (WGA), yeni nesil dizileme (NGS) kütüphanesinin hazırlanması ve veri analizi dahil olmak üzere ayrıntılı prosedürü sunmaktadır.

İnsan Preimplantasyon Embriyolarının Harcanan Kültür Ortamı Kullanılarak Kromozom Taraması: Örnek Toplama ve Kromozomal Ploidi Analizi

Protokol, yarı iletken tabanlı yeni nesil dizileme platformunda anöploidi için implantasyon öncesi genetik testlerde gerekli olan genel laboratuvar içi prosedürleri sunar. Burada tüm genom amplifikasyonunun, DNA fragmanı seçiminin, kütüphane yapımının, şablon hazırlamanın ve dizileme çalışma akışının ayrıntılı adımlarını temsili sonuçlarla sunuyoruz.

Yarı İletken Tabanlı Yeni Nesil Dizileme Platformunda Anöploidi için İmplantasyon Öncesi Genetik Test

Bu protokol, bir iyon yarı iletken dizileme platformuna dayalı olarak mide kanseri örneklerinde tek nükleotid polimorfizmlerini tespit etmek için gerekli bütünsel laboratuvar prosedürlerini önermektedir. Hedef diziler, bağlama adaptörleri, kütüphane amplifikasyonu ve saflaştırması ve kalite kontrol kriterleri de ayrıntılı olarak açıklanmaktadır.

Mide Kanserinde İyon Yarı İletken Dizileme Platformuna Dayalı Çok Genli Tek Nükleotid Polimorfizmi Tespiti

Burada bir protokol Metil-Bağlama DNA Yakalama sıralama (MBDCap seq veya MBD-seq) teknolojisi ve sonraki biyoinformatik analiz boru hattı kullanılarak büyük ölçekli klinik hasta tarama çalışmalarında genom DNA metilasyonu araştırmak için sunuyoruz.

Hasta Dokularda metil-bağlayıcı DNA yakalama Dizi

Burada, gelişmiş gen delesyon verimliliği için Yarrowia lipolytica Po1g suşunun moleküler genetik manipülasyonuna ilişkin yöntemleri rapor ediyoruz. Elde edilen mühendislik ürünü Y. lipolitica suşları, biyoyakıt ve biyokimyasal üretimde potansiyel uygulamalara sahiptir.

Yenilenebilir Biyoyakıt ve Biyokimyasal Üretim için bir Sıradışı Maya Genetik Mühendisliği

Öğrenin, embriyolardaki anöploidi taraması için yarı iletken dizileme yöntemini. Bu hızlı ve düşük maliyetli teknik, PGT-A için güvenilir genom dizilemesi sağlar ve beş günlük sonuç süresiyle üreme sağlığında klinik uygulamalara katkıda bulunur.

Aneuploidi için Preimplantasyon Genetik Test için Yarı iletken Sıralama

Daha fazla video keşfet