-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

TR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

tr_TR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biochemistry
Çift DNA cetvelleri tek Nükledotid çözünürlüğe sahip Ribosome translocation mekanizmasını Incelem...
Çift DNA cetvelleri tek Nükledotid çözünürlüğe sahip Ribosome translocation mekanizmasını Incelem...
JoVE Journal
Biochemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biochemistry
Dual DNA Rulers to Study the Mechanism of Ribosome Translocation with Single-Nucleotide Resolution

Çift DNA cetvelleri tek Nükledotid çözünürlüğe sahip Ribosome translocation mekanizmasını Incelemek için

Full Text
6,660 Views
10:27 min
July 8, 2019

DOI: 10.3791/59918-v

Heng Yin1, Shoujun Xu1, Yuhong Wang2

1Department of Chemistry,University of Houston, 2Department of Biology and Biochemistry,University of Houston

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

The dual DNA ruler assay provides mechanistic insights into ribosome translocation and other nucleic acid displacements. This method uniquely allows probing both the entrance and exit sides of mRNA in ribosome complexes with single-nucleotide resolution.

Key Study Components

Area of Science

  • Neuroscience
  • Biochemistry
  • Molecular Biology

Background

  • The dual DNA ruler assay is a novel technique for studying mRNA dynamics.
  • It offers single-nucleotide resolution, enhancing the understanding of ribosome function.
  • This method can also measure DNA binding strength and selectivity of chemotherapeutical drugs.
  • Visual demonstrations of the method can aid in its broader application in research.

Purpose of Study

  • To develop a method for probing mRNA positioning during ribosome translocation.
  • To provide insights into nucleic acid displacements.
  • To demonstrate the advantages of the dual DNA ruler assay for future applications.

Methods Used

  • Construction of a plastic sample well using a styrene strip.
  • Drilling a cube in the center of the well.
  • Gluing a biotin-coated glass piece to the bottom surface with epoxy.
  • Visual demonstrations to showcase the method's advantages.

Main Results

  • The dual DNA ruler assay successfully probes both sides of mRNA.
  • It achieves single-nucleotide resolution in ribosome complexes.
  • Demonstrated potential for broader applications in nucleic acid research.
  • Visual methods enhance understanding and usability of the technique.

Conclusions

  • The dual DNA ruler assay is a significant advancement in studying ribosome translocation.
  • It provides valuable insights into mRNA dynamics and nucleic acid interactions.
  • This method has the potential for various applications in molecular biology research.

Frequently Asked Questions

What is the dual DNA ruler assay?
It is a method developed to probe mRNA positioning during ribosome translocation with single-nucleotide resolution.
How does the dual DNA ruler assay work?
It relies on the dissociation forces of formed DNA-mRNA duplexes to measure mRNA dynamics.
What are the applications of this assay?
It can be used to study ribosome translocation and other nucleic acid displacements, as well as DNA binding strength.
What are the advantages of this method?
It allows probing both the entrance and exit sides of mRNA in ribosome complexes.
Can this method be applied to other areas of research?
Yes, it has potential applications in various fields of molecular biology and biochemistry.

Çift DNA cetvel tahlil ribozom translocation sırasında mRNA konumunu belirlemek için geliştirilmiştir, hangi oluşmuş DNA-mRNA dubliklerin ayrışma güçleri dayanır. Tek nükle çözünürlüğü ve mRNA 'nın her iki ucunda ulaşmanın yeteneği ile, ribozom translokasyon ve prob diğer nüklik asit yerleşimleri için mekanik öngörüler sağlayabilir.

Çift DNA cetveli testi ribozom translokasyonu için mekanistik kavrayışlar sağlayabilir ve diğer nükleik asit yer değiştirmelerini inceleyebilir. Çift DNA cetveli testimiz şu anda ribozom komplekslerinde mRNA'nın giriş ve çıkış kenarlarını tek nükleotit çözünürlüğü ile objektif olarak inceleyebilen tek yöntemdir. Benzer yöntemler de DNA bağlama gücü ve keforik ilaçların seçiciliğini ölçmek için uygulanır.

Yöntemin görsel gösterimi, tekniğimizin avantajlarını sezgisel olarak göstermemiz ve diğer araştırmacıların daha fazla uygulamaya dönüştürmelerine yardımcı olmak için iyi bir şanstır. Başlamak için, iki milimetre üç milimetre üç milimetre boyutları ile merkezinde bir küp sondaj tarafından bir stiren şerit ile iyi bir plastik örnek olun. Daha sonra, epoksi kullanarak, alt yüzeye yaklaşık beş milimetre uzunluğunda biyotin kaplı cam bir parça tutkal.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Biyokimya sayı 149 DNA cetvelleri ribozom translocation frameshifting Force spektroskopisi manyetik etiketleme kuvvet kaynaklı kalıntı magnetizasyon spektroskopisi mRNA looping antibiyotikler atomik Magnetometri

Related Videos

Protein-DNA Etkileşiminin Çalışmaları Tek molekül Manipülasyon ve Görüntüleme birleştiren

14:43

Protein-DNA Etkileşiminin Çalışmaları Tek molekül Manipülasyon ve Görüntüleme birleştiren

Related Videos

12.1K Views

Optik cımbız ile Tek RNA Moleküllerin Nanomanipulation

06:59

Optik cımbız ile Tek RNA Moleküllerin Nanomanipulation

Related Videos

15.5K Views

En iyi kromozom Location(s) belirlenmesi için yeni bir Transposon-aracılı yaklaşımın kullanarak Escherichia coli DNA öğesinde

11:12

En iyi kromozom Location(s) belirlenmesi için yeni bir Transposon-aracılı yaklaşımın kullanarak Escherichia coli DNA öğesinde

Related Videos

8K Views

Tek Moleküllü İzleme Mikroskobu - Sitosolik Moleküllerin Diffüz Durumlarını Belirlemede Bir Araç

10:20

Tek Moleküllü İzleme Mikroskobu - Sitosolik Moleküllerin Diffüz Durumlarını Belirlemede Bir Araç

Related Videos

8.9K Views

Yüksek Konsantrasyonlı Tek Moleküllü Mikroskopi için Sıfır Mod Dalga Kılavuzlarının İmalatı

08:01

Yüksek Konsantrasyonlı Tek Moleküllü Mikroskopi için Sıfır Mod Dalga Kılavuzlarının İmalatı

Related Videos

8.8K Views

Bakterilerde RIBO-seq: NGS Dizilimi için Örnek Toplama ve Kütüphane Hazırlama Protokolü

12:05

Bakterilerde RIBO-seq: NGS Dizilimi için Örnek Toplama ve Kütüphane Hazırlama Protokolü

Related Videos

9.4K Views

Çeviri Yönetmeliğinde RNA-Protein Etkileşimlerini İncelemek için Optik Cımbız

12:26

Çeviri Yönetmeliğinde RNA-Protein Etkileşimlerini İncelemek için Optik Cımbız

Related Videos

6K Views

Ribozom Protein Sentezinin Tek Molekül floresan Enerji Transferi Çalışması

08:07

Ribozom Protein Sentezinin Tek Molekül floresan Enerji Transferi Çalışması

Related Videos

3.2K Views

Ko-Translasyonel Etkileşim Ağlarının Seçici Ribozom Profilleme ile Küresel Tanımlanması

06:58

Ko-Translasyonel Etkileşim Ağlarının Seçici Ribozom Profilleme ile Küresel Tanımlanması

Related Videos

3K Views

De novo Aktif Olarak Çevrilmiş Açık Okuma Çerçevelerinin Ribozom Profil Oluşturma Verileri ile Tanımlanması

08:23

De novo Aktif Olarak Çevrilmiş Açık Okuma Çerçevelerinin Ribozom Profil Oluşturma Verileri ile Tanımlanması

Related Videos

4.2K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code