-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

TR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

tr_TR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biochemistry
NEMO'nun IKK bağlayıcı alanının üretimi, kristalizasyonu ve Yapı Tayini
NEMO'nun IKK bağlayıcı alanının üretimi, kristalizasyonu ve Yapı Tayini
JoVE Journal
Biochemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biochemistry
Production, Crystallization, and Structure Determination of the IKK-binding Domain of NEMO

NEMO'nun IKK bağlayıcı alanının üretimi, kristalizasyonu ve Yapı Tayini

Full Text
7,964 Views
13:02 min
December 28, 2019

DOI: 10.3791/60339-v

Adam H. Barczewski1, Michael J. Ragusa1, Dale F. Mierke1, Maria Pellegrini1

1Department of Chemistry,Dartmouth College

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This protocol facilitates the structure determination of the IKK-binding domain of NEMO in its unbound form. It details the production and crystallization methods, emphasizing the use of coiled-coil adapters to stabilize the native conformation of the protein.

Key Study Components

Area of Science

  • Structural Biology
  • Protein Crystallization
  • Drug Discovery

Background

  • NEMO is a crucial target for developing inhibitors against inflammatory and autoimmune diseases.
  • Understanding its structure aids in the design of therapeutic agents.
  • The IKK-binding domain plays a significant role in NEMO's function.
  • Crystallization techniques are essential for structure determination.

Purpose of Study

  • To determine the structure of the IKK-binding domain of NEMO.
  • To optimize crystallization methods for better results.
  • To provide a foundation for future studies on NEMO complexes with inhibitors.

Methods Used

  • Protein expression and purification techniques.
  • Characterization of the protein to ensure purity.
  • Strategies for crystal optimization.
  • X-ray crystallography for structure determination.

Main Results

  • Successful determination of the IKK-binding domain structure.
  • Insights into the stabilization of the protein during crystallization.
  • Potential applications in drug discovery highlighted.
  • Foundation laid for studying NEMO complexes with inhibitors.

Conclusions

  • The protocol provides a reliable method for studying NEMO.
  • Crystallization techniques can be adapted for other protein complexes.
  • Understanding NEMO's structure is crucial for therapeutic development.

Frequently Asked Questions

What is NEMO?
NEMO is a protein involved in the NF-kB signaling pathway, playing a key role in immune responses.
Why is the IKK-binding domain important?
It is crucial for NEMO's function and is a target for developing inhibitors for various diseases.
What methods are used for protein purification?
Techniques such as affinity chromatography and size-exclusion chromatography are commonly used.
How does crystallization aid in structure determination?
Crystallization allows for the formation of ordered structures that can be analyzed using X-ray crystallography.
Can this protocol be applied to other proteins?
Yes, the methods can be adapted for other proteins and their complexes.

NEMO'nun IKK-bağlayıcı alanının x-ışını kristalografisi ile yapı tayinine ilişkin protokolleri açıklıyoruz. Bu yöntemler arasında protein ekspresyonu, saflaştırma ve karakterizasyonunun yanı sıra başarılı kristal optimizasyonu ve proteinin sınırsız formunda yapı tespiti stratejileri yer almaktadır.

Bu protokol, NEMO'nun IKK bağlayıcı alanının sınırsız biçimde başarılı bir yapı belirlemesini kolaylaştırmaktadır. Ve üretim ve kristalizasyon detayları. Protokol, kristalizasyon ve yapı tayinini kolaylaştıran bobin bağlatan adaptörler aracılığıyla NEMO'nun IKK bağlayıcı etki alanı parçasının yerli teyidinin bu stabilizasyonundan yararlanır.

Nemo yapısal biyoloji, bir hedef olarak, inflamatuar ve otoimmün hastalıklar ve kanser tedavisinde NEMO inhibitörleri gelişiminde önemli bir avantaj sağlar. Bu protokol, ilaç keşfi veya optimizasyonu için peptit veya küçük molekül inhibitörleri ile NEMO komplekslerinin yapı tayini için uzatılabilir. Protein refolding ve konsantrasyon, protein üretim aşamasında, saf bir NEMO dimer elde etmek için temel vardır.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Biyokimya Sayı 154 NF-κB NEMO IκB kigazı (IKK) NEMO bağlayıcı etki alanı (NBD) sarmal bobin X-ışını kristalografisi protein mühendisliği yapı tayini yapı bazlı ilaç tasarımı

Related Videos

Dayanıksız Multi-protein Kompleksleri izolasyonu In vivo Kontrollü Hücresel Çapraz Bağlama ve immuno-manyetik Afinite Kromatografisi

10:50

Dayanıksız Multi-protein Kompleksleri izolasyonu In vivo Kontrollü Hücresel Çapraz Bağlama ve immuno-manyetik Afinite Kromatografisi

Related Videos

18K Views

Aracılığıyla DEĞİŞTİR Protein-protein etkileşimleri İnhibitörlerinin Geliştirilmesi: Tasarım ve Geliştirme Olmayan ATP Rekabetçi CDK inhibitörleri Uygulama

10:33

Aracılığıyla DEĞİŞTİR Protein-protein etkileşimleri İnhibitörlerinin Geliştirilmesi: Tasarım ve Geliştirme Olmayan ATP Rekabetçi CDK inhibitörleri Uygulama

Related Videos

11.9K Views

β-varil Dış Membran Proteinleri Yapı Tayini Doğru - Yapıların itibaren Crystals

09:55

β-varil Dış Membran Proteinleri Yapı Tayini Doğru - Yapıların itibaren Crystals

Related Videos

14.2K Views

İnsan Norovirüs çıkıntılı Domains üretimi içinde E. E. coli, X ışını Kristallografi için

10:46

İnsan Norovirüs çıkıntılı Domains üretimi içinde E. E. coli, X ışını Kristallografi için

Related Videos

9.1K Views

Islak ve kuru Lab Teknikleri birleştiren Büyük Spiral-coil İçeren Proteinler kristalleşmesini Kılavuzu

11:14

Islak ve kuru Lab Teknikleri birleştiren Büyük Spiral-coil İçeren Proteinler kristalleşmesini Kılavuzu

Related Videos

8.5K Views

Üretim, Kristalleşme ve Yapı Tayini ve C. difficile PPEP-1 mikro-tohumlama ve Çinko-SAD aracılığıyla

13:34

Üretim, Kristalleşme ve Yapı Tayini ve C. difficile PPEP-1 mikro-tohumlama ve Çinko-SAD aracılığıyla

Related Videos

12K Views

Üretim, kristalizasyon ve insan IKK1/α yapı belirlenmesi için bir rehber

11:27

Üretim, kristalizasyon ve insan IKK1/α yapı belirlenmesi için bir rehber

Related Videos

9.6K Views

Necroptosis MLKL-aracılı plazma zarı kopma karakterizasyonu

08:55

Necroptosis MLKL-aracılı plazma zarı kopma karakterizasyonu

Related Videos

11.4K Views

N-terminal etki alanı Ryanodine reseptör Plutella xylostella gelen kristal yapısı

11:31

N-terminal etki alanı Ryanodine reseptör Plutella xylostella gelen kristal yapısı

Related Videos

8K Views

Fonksiyonel Protein bölgeleri Chimeric Protein inşaat aracılığıyla tanımlaması

11:39

Fonksiyonel Protein bölgeleri Chimeric Protein inşaat aracılığıyla tanımlaması

Related Videos

11K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code