Name: 2D-HELS MS Seq: Farklı Nükleotid Modifikasyonlarına Sahip RNA Karışımlarının Doğrudan ve de novo Dizilimi için Genel LC-MS Tabanlı Bir Yöntem (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2020-07-10T13:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 41 s
Description: Keşfedin: LC-MS tabanlı bu yeni yöntemle cDNA aracısız RNA dizileme yapın. Tek iplikçikli, karışık ve modifiye RNA örneklerini aynı anda yüksek hassasiyetle analiz edin. Epitranskriptomik araştırmalar için güvenilir bir araç sunar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Addepalli, B., Venus, S., Thakur, P., Limbach, P. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Novel+ribonuclease+activity+of+cusativin+from+Cucumis+sativus+for+mapping+nucleoside+modifications+in+RNA%5BTitle%5D)+AND+%22Analytical+and+Bioanalytical+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Novel ribonuclease activity of cusativin from Cucumis sativus for mapping nucleoside modifications in RNA.</a> Analytical and Bioanalytical Chemistry. 409 (24), 5645-5654 (2017).</li>
<li>Gao, H., Liu, Y., Rumley, M., Yuan, H., Mao, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sequence+confirmation+of+chemically+modified+RNAs+using+exonuclease+digestion+and+matrix-assisted+laser+desorption%2Fionization+time-of-flight+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Communications+in+Mass+Spectrometry%22%5BJournal%5D)">Sequence confirmation of chemically modified RNAs using exonuclease digestion and matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry.</a> Rapid Communications in Mass Spectrometry. 23 (21), 3423-3430 (2009).</li>
<li>McLuckey, S. A., Van Berkel, G. J., Glish, G. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tandem+mass+spectrometry+of+small%2C+multiply+charged+oligonucleotides%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+The+American+Society+for+Mass+Spectrometry%22%5BJournal%5D)">Tandem mass spectrometry of small, multiply charged oligonucleotides.</a> Journal of The American Society for Mass Spectrometry. 3 (1), 60-70 (1992).</li>
<li>Fountain, K. J., Gilar, M., Gebler, J. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+native+and+chemically+modified+oligonucleotides+by+tandem+ion-pair+reversed-phase+high-performance+liquid+chromatography%2Felectrospray+ionization+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Rapid+Communications+in+Mass+Spectrometry%22%5BJournal%5D)">Analysis of native and chemically modified oligonucleotides by tandem ion-pair reversed-phase high-performance liquid chromatography/electrospray ionization mass spectrometry.</a> Rapid Communications in Mass Spectrometry. 17 (7), 646-653 (2003).</li>
<li>Taucher, M., Breuker, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Characterization+of+modified+RNA+by+top-down+mass+spectrometry%5BTitle%5D)+AND+%22Angewandte+Chemie+International+Edition+in+English%22%5BJournal%5D)">Characterization of modified RNA by top-down mass spectrometry.</a> Angewandte Chemie International Edition in English. 51 (45), 11289-11292 (2012).</li>
<li>Kellner, S., Burhenne, J., Helm, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+RNA+modifications%5BTitle%5D)+AND+%22RNA+Biology%22%5BJournal%5D)">Detection of RNA modifications.</a> RNA Biology. 7 (2), 237-247 (2010).</li>
<li>Thomas, B., Akoulitchev, A. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mass+spectrometry+of+RNA%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+in+Biochemical+Sciences%22%5BJournal%5D)">Mass spectrometry of RNA.</a> Trends in Biochemical Sciences. 31 (3), 173-181 (2006).</li>
<li>Bjorkbom, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bidirectional+direct+sequencing+of+noncanonical+RNA+by+two-dimensional+analysis+of+mass+chromatograms%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+the+American+Chemical+Society%22%5BJournal%5D)">Bidirectional direct sequencing of noncanonical RNA by two-dimensional analysis of mass chromatograms.</a> Journal of the American Chemical Society. 137 (45), 14430-14438 (2015).</li>
<li>Zhang, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+general+LC-MS-based+RNA+sequencing+method+for+direct+analysis+of+multiple-base+modifications+in+RNA+mixtures%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Research%22%5BJournal%5D)">A general LC-MS-based RNA sequencing method for direct analysis of multiple-base modifications in RNA mixtures.</a> Nucleic Acids Research. 47 (20), 125(2019).</li>
<li>Zhang, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+sequencing+of+tRNA+by+2D-HELS-AA+MS+Seq+reveals+its+different+isoforms+and+dynamic+base+modifications%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Chemical+Biology%22%5BJournal%5D)">Direct sequencing of tRNA by 2D-HELS-AA MS Seq reveals its different isoforms and dynamic base modifications.</a> ACS Chemical Biology. 15 (6), 1464-1472 (2020).</li>
<li>Bakin, A., Ofengand, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Four+newly+located+pseudouridylate+residues+in+Escherichia+coli+23S+ribosomal+RNA+are+all+at+the+peptidyltransferase+center%3A+analysis+by+the+application+of+a+new+sequencing+technique%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Four newly located pseudouridylate residues in Escherichia coli 23S ribosomal RNA are all at the peptidyltransferase center: analysis by the application of a new sequencing technique.</a> Biochemistry. 32 (37), 9754-9762 (1993).</li>
<li>Cantara, W. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+RNA+Modification+Database%2C+RNAMDB%3A+2011+update%5BTitle%5D)+AND+%22Nucleic+Acids+Research%22%5BJournal%5D)">The RNA Modification Database, RNAMDB: 2011 update.</a> Nucleic Acids Research. 39 (Database issue), D195-D201 (2011).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>5 'DNA Adenilasyon kiti</td><td>New England Biolabs</td><td>E2610S</td><td>50uM konsantrasyon</td></tr><tr><td>6550 Q-TOF kütle spektrometresi</td><td>Agilent Technologies</td><td>5991-2116EN</td><td>1290 Infinity LC sistemine bağlı</td></tr><tr><td>A (5 akut;)pp(5&akut;)Cp-TEG-biotin-3 ve akut;</td><td>ChemGenes</td><td>91718</td><td>HPLC saflaştırılmış</td></tr><tr><td>ATP ve gama; S</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>11162306001</td><td>Lityum tuzu</td></tr><tr><td>Bicine</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>B8660</td><td>BioXtra, & ge; %99 (titrasyon)</td></tr><tr><td>Biotin maleimid</td><td>Vektör Laboratuvarları</td><td>SP-1501</td><td>Uzun kol</td></tr><tr><td>C18 sütunu</td><td>Sular</td><td>186003532</td><td>50 mm ve kez; 2,1 mm Xbridge C18 sütunu, partikül boyutu 1,7 & mu; m</td></tr><tr><td>Santrifüj Vakum Konsantratörü</td><td>Labconco</td><td>Soğutma 115v/60hz 7310022</td><td>Labconco CentriVap</td></tr><tr><td>ChemBioDraw</td><td>PerkinElmer</td><td>ChemDraw Prime</td><td>Yapıların ve parçaların kimyasal yapı ve özellik verilerini oluşturun</td></tr><tr><td>CMC (N-sikloheksil-N?-(2-morfolinoetil)-karbodiimid meto-p-toluensülfonat)</td> <td>Sigma-Aldrich</td><td>2491-17-0</td><td>%95 Saflık</td></tr><tr><td>Siyanin3 maleimid (Cy3)</td><td>Lumiprobe</td><td>11080</td><td>Suda çözünmeyen</td></tr><tr><td>DEPC ile arıtılmış su</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>AM9906</td><td>Otoklavlanmış, sertifikalı nükleaz içermeyen</td></tr><tr><td>Diizopropilamin (DIPA)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>108-18-9</td><td>%99 Alfa Aesar</td></tr><tr><td>DMSO</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>276855</td><td>Susuz dimetil sülfoksit, %99,9</td></tr> <tr><td>EDTA</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>E6758</td><td>Susuz, kristalimsi, BioReagent, hücre kültürü için uygun</td></tr><tr><td>Formik asit</td><td>Merck</td><td>64-18-6</td><td>%98-100, ACS reag, Ph Eur</td></tr><tr><td>Heksafloro-2-propanol (HFIP)</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>920-66-1</td><td>%99 Acros Organics</td></tr><tr><td>LC-MS numune şişeleri</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>C4000-11</td><td>Plastik vidalı vidalı şişeler</td></tr><tr><td>LC-MS flakon kapakları</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>C5000-54A</td><td>Otomatik Numune Alma Cihazı flakon vida dişi kapakları</td></tr><tr><td>Na2CO3 tamponu</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>88975</td><td>BioUltra, >0,1 M Na2CO3, >0,2 M NaHCO3</td></tr><tr><td>Oligo Temiz & Yoğunlaştırıcı</td><td>Zymo Research</td><td>D4060</td><td>Spin sütunu</td></tr><tr><td></td><td>OriginLab OriginLab</td><td>OriginPro</td><td>Veri analizi ve grafik yazılımı</td></tr><tr><td>pCp-biotin</td><td>TriLink BioTechnologies</td><td>NU-1706-BIO</td><td>20 ul (1 mM)</td></tr><tr><td>RNA #1--#6</td><td>Entegre DNA Teknolojileri</td><td>Özel RNA oligoları</td><td>19nt-21nt tek sarmallı RNA'lar, daha fazla saflaştırma olmadan kullanılır</td></tr><tr><td>Sallanma platform çalkalayıcı</td><td>VWR</td><td>Orbital Çalkalayıcı Standart 1000</td><td>Hız Aralığı 40 ila 300 rpm</td></tr><tr><td>Streptavidin manyetik boncuklar</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>88816</td><td>Bağlama yaklaşık 55ug biyotinile tavşan lgG mg boncuk başına</td></tr><tr><td>Sülfonatlı Siyanin3 maleimid</td><td>Lumiprobe</td><td>11380</td><td>Suda çözünür</td></tr><tr><td>T4 DNA ligaz 1</td><td>New England Biolabs</td><td>M0202S</td><td>400 birim/uL</td></tr><tr><td>T4 polinükleotid kinaz</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T4PNK-RO</td><td>Fajdan T4 N81 pse T1 enfekte Escherichia coli BB</td></tr><tr><td>Tris-HCl tamponu</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T6455</td><td>Tris-HCl Tamponu, pH 10, 10 kez;, Antijen Retriever</td></tr><tr><td>Üre</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>81871</td><td>Sentez için üre. CAS No. 57-13-6, EC numarası 200-315-5.</td></tr></tbody></table>

2d-hels ms seq: farklı nükleotid modifikasyonlarına sahip rna karışımlarının doğrudan ve de novo dizilimi için genel lc-ms tabanlı bir yöntem

2D-HELS MS Seq: A General LC-MS-Based Method for Direct and de novo Sequencing of RNA Mixtures with Different Nucleotide Modifications

Kolayca tanımlanabilen kütle-tR merdivenleri üretmek için RNA'nın 3' ucuna bir biyotin etiketi eklemek. 2D-HELS MS Seq yaklaşımının iş akışı Şekil 1a'da gösterilmiştir. RNA'nın 3' ucuna eklenen hidrofobik biyotin etiketi (bakınız Bölüm 2), 3' etiketli merdiven bileşenlerinin kütlelerini ve tR'lerini, etiketlenmemiş muadillerine kıyasla arttırır. Böylece, 3' merdiven eğrisi, 2B kütle-tR grafiğinde daha büyük y ekseni değerlerine (tR...

2D-HELS MS Seq: Farklı Nükleotid Modifikasyonlarına Sahip RNA Karışımlarının Doğrudan ve de novo Dizilimi için Genel LC-MS Tabanlı Bir Yöntem

Mass spectrometry (MS)-based sequencing approaches have been shown to be useful in&#160;direct&#160;sequencing&#160;RNA without the need for a ...

Bu protokol, RNA örneğinin tek sarmallı, karışık veya modifiye edilmiş olmasına bakılmaksızın, RNA'yı doğrudan dizilemek için geliştirilen yeni yöntemi kullanırken gereken tüm temel adımları kapsar. Yöntem, enzimatik hatadan veya baz tamamlayıcılığından etkilenmez. Bir seferde belirli bir modifikasyon yerine farklı RNA modifikasyonlarını aynı anda sıralamayı mümkün kılan doğrudan bir iş akışı ve genel bir çözüm sağlar.Bu teknoloji, insan hastalığıyla ilişkilendirmek için imza RNA segmentlerini belirlemek için bir tanı aracı ve epitranskriptomik düzeyde RNA modifikasyonlarını incelemek için doğru bir araç olarak geliştirilebilir. Yöntem, önceki herhangi bir sıralama yöntemine dayanmaz. Bunun yerine, bu tamamen yeni bir yaklaşımdır ve herhangi bir modifiye edilmiş RNA'yı dizilemek için başvurulacak yönteme geçmeyi amaçlıyoruz.Bu protokolün bazı bölümleri, RNA LC-MS veri toplamanın 3'ünün etiketlenmesi ve MassHunter yazılımı tarafından veri analizi gibi görsel gösterimle daha doğru bir şekilde aktarılabilecek kritik yönleri içerir. Bu prosedürü göstereceğim ve LC-MS'yi kuracağım ve RNA örneklerimizi ölçeceğim. Tek adımlı bir etiketleme reaksiyonu gerçekleştirmek için, 2 mikrolitre 150 mikromolar AppCp-biotin, 3 mikrolitre 10x ligaz reaksiyon tamponu, 1.5 mikrolitre 100 mikromolar RNA örneği, 3 mikrolitre susuz DMSO, 10 ünite T4 RNA ligaz ve toplam 30 mikrolitre hacim için 19.5 mikrolitre DEPC ile muamele edilmiş su.Reaksiyonu gece boyunca 16 santigrat derecede inkübe edin, ardından el yazması talimatlarına göre sütun saflaştırması gerçekleştirin. RNA'yı üç alikota böldükten ve eşit hacimde formik asit ekledikten sonra, reaksiyonları 40 santigrat derecede inkübe edin. Her reaksiyon bittiğinde, asit bozunmasını söndürmek için numuneyi hemen kuru buz üzerinde dondurun.Numuneyi yaklaşık 30 dakika kurutmak için bir santrifüj vakum yoğunlaştırıcı kullanın. Kurutulmuş numuneleri 20 mikrolitre DEPC ile arıtılmış suda tekrar süspanse edin ve birleştirin. Numuneleri LC-MS ölçümüne kadar 20 santigrat derecede saklayın.Mobil fazları hazırladıktan sonra RNA örneğini LC-MS örnek şişesine aktarın. Her enjeksiyon 100 ila 400 pikomol RNA ve 20 mikrolitre içermelidir. Verileri aldıktan sonra, kütle, bekletme süresi, hacim ve kalite puanı dahil olmak üzere bileşik bilgileri ayıklamak için moleküler özellik ayıklama iş akışını kullanın.Küçük molekül ayarlarında centroid veri formatını kullanın. Tepe yüksekliğini en az 100, ancak 1.000'den az ve kalite puanını en az 50 olarak ayarlayın. Son olarak, verileri bir Excel dosyası olarak dışa aktarın.3' merdivenin 5' merdivenden ayrılması ve diğer istenmeyen parçalar burada bir 2B kütle tutma süresi grafiğinde gösterilmiştir. Her RNA'da 5'biotin etiketi ile farklı uzunluklarda iki RNA ipliği içeren karışık numuneleri dizilemek de mümkündür. Üridini bir psödouridin'den ayırt etmek için, RNA, bir psödouridini bir CMC-psödouridin eklentisine dönüştüren CMC ile muamele edildi.Adduktun, bir üridinde farklı bir kütleye sahiptir ve 2D-HELS MS Seq'de ayırt edilebilir. Reaksiyonu dönüştüren psödouridini CMC eklentisine dönüştüren ham ürünün HPLC profili, %42 olan dönüşüm yüzdesini hesaplamak için kullanıldı,% 42 olan beş farklı RNA zincirinin bir karışımı, 3'uç etiketleme ile 2D-HELS MS Seq yaklaşımı ile dizilendi ve çoklu RNA dizilerinin daha iyi görselleştirilmesi için normalleştirildi. Normalizasyon olmasaydı, beş RNA'nın dizileri için harf kodları bir araya toplanmış olurdu.Bu prosedürü denerken, etiketli RNA örneklerinden yüksek verim elde etmek için etiketleme reaksiyonunu dikkatli bir şekilde ayarlayın. Ayrıca, güvenilir kütle merdivenleri oluşturmak için bozunma süresini dikkatlice izleyin ve 20 mikrolitre su ile maksimum miktarda kurutulmuş numune toplayın. Bu protokolü gerçekleştirdikten sonra sorulabilecek bir soru, sıralama yönteminin genişliğinin, uzunluğunun ve veriminin nasıl artırılacağıdır.Daha iyi bir algoritma ve daha yüksek çözünürlük ve hassasiyete sahip daha gelişmiş bir cihaz yardımcı olabilir. Bu protokolün geliştirilmesinden sonra, CDA tabanlı RNA dizilimi ile ilgili herhangi bir hata olmaksızın hem kanonik hem de modifiye nükleotidleri içeren daha geniş bir RNA örneği yelpazesini doğrudan dizilemek mümkün hale geldi.

2d-hels-ms-seq-general-lc-ms-based-method-for-direct-de-novo

Research

JoVE Journal

Genetics

Genetik

MicroRNA'lar (miRNA'lar), yaygın olarak korunan bir düzenleyici molekül sınıfıdır. Burada, iki güçlü ligasyon adımına ve ardından yüksek verimli dizilemeye dayanan bir miRNA klonlama yöntemini açıklıyoruz. Yöntemimiz, miRNA'ların genom çapında doğru bir şekilde kantitasyonuna izin verir.

Yüksek Verim Dizilimine tarafından MicroRNA ölçümü için Küçük RNA molekülleri, yüksek Verimli ligasyonu

Gen ekspresyonu, mutasyonlar ve gen füzyonları için seçilen transkriptleri sorgulamak için indekslenmiş cDNA kütüphanelerinin hazırlanmasını, özel problarla hibridizasyon ve yakalama ve veri analizini içeren hedefli RNA dizileme tabanlı bir yöntemi tanımlıyoruz. Hedeflenen RNAseq, seçilen transkriptlerin bir masaüstü sıralayıcıda uygun maliyetli, hızlı bir şekilde değerlendirilmesine izin verir.

RNA Sıralama Deneyi Gen İfade ve Genomik değişiklikleri tanımlamak için hedeflenen

Biz RNA bağlanıcı proteinler tanımlamak ve kendi RNA bağlayıcı bölgeleri UV-aracılı photocrosslinking ve kütle spektrometresi kullanılarak canlı hücrelerdeki eşlemek için bir protokol tanımlamak.

Kütle spektrometresi tabanlı kimlik RNA-bağlama bölgelerinin için numune hazırlama

Bu iletişim kuralı için siteleri işleme eşleme pre-mRNA 3' ucu bir yöntemi açıklar.

A-seq2 ile kütüphane hazırlık sıralama 3' ucu

Standart yöntemlere göre daha az önyargılı ve 2'-O-metil RNA'lar için artan hassasiyetiçeren ayrıntılı bir küçük RNA kütüphane telafi protokolü saiyoruz. Bu protokol maliyet tasarrufu veya kolaylık sağlamak için kitleri kullanarak ev yapımı reaktifler kullanılarak izlenebilir.

Küçük RNA-seq iyileştirilmesi: Daha Az Önyargı ve 2'-O-Metil RNA'ların Daha İyi Tespiti

13 C/ 15 Netiketli ve etiketsiz RNA'da mikro-milisaniye dinamikleri1H R1φ  gevşeme dağılımı nükleer manyetik rezonans (NMR) spektroskopisi ile ölçmek için bir protokol sunuyoruz.  Bu protokolün odak noktası, NMR deneylerinin yüksek saflıkta numune hazırlanması ve kurulumunda yatmaktadır.

RNA'nın 1 H R1φ Gevşeme Dispersiyon Deneylerinin Numune Hazırlama ve Kurulumunun Pratik Yönleri

RNA'nın transkripsiyon sonrası modifikasyonları, son zamanlarda merkezi sinir sistemi plastisitesi ile bağlantılı olan az çalışılmış bir translasyon düzenleme katmanını temsil eder. Burada, tek nöronlarda çok sayıda RNA modifikasyonunun eşzamanlı karakterizasyonu için numune hazırlama ve sıvı kromatografisi-tandem kütle spektrometrisi yaklaşımı tanımlanmıştır.

Kütle Spektrometrisi Kullanarak Tek Nöronlardaki RNA Modifikasyonlarını Karakterize Etme

Protokol, mutasyonel profilleme deneyleri için RNA'nın dimetil sülfat ile modifiye edilmesi için talimat sağlar. İki alternatif kütüphane hazırlama yöntemi ile in vitro ve in vivo problama içerir.

RNA Yapısının Dimetil Sülfat Mutasyonel Profillemesi ile İn Vitro ve İn Hücre Dizilimi ile İncelenmesi

Mutlak miktar tayini RNA dizilimi (AQRNA-seq), biyolojik karışımlardaki tüm küçük RNA'ların manzarasını ölçmek için geliştirilmiş bir teknolojidir. Burada, açlığın neden olduğu uyku hali sırasında Mycobacterium bovis BCG'deki transfer RNA (tRNA) havuzundaki değişiklikleri ölçen AQRNA-seq'nin hem kütüphane hazırlama hem de veri işleme adımları gösterilmektedir.

Küçük RNA'ları Ölçmek için AQRNA-seq

Bu protokol, acemi biyoinformatikçiler için karşılaştırmalı bir de novo transkriptom derlemesi ve açıklama iş akışını ana hatlarıyla belirtir. İş akışı tamamen CyVerse aracılığıyla ücretsiz olarak kullanılabilir ve Veri Deposu ile bağlanır. Komut satırı ve grafik kullanıcı arayüzleri kullanılır, ancak gereken tüm kodlar kopyalanıp yapıştırılabilir.

CyVerse Kaynaklarını Kaldıracak<emDe Novo</em&gt; Yetersiz Üretilmiş (Model Olmayan) Organizmaların Karşılaştırmalı Transkriptomikleri

Keşfedin: LC-MS tabanlı bu yeni yöntemle cDNA aracısız RNA dizileme yapın. Tek iplikçikli, karışık ve modifiye RNA örneklerini aynı anda yüksek hassasiyetle analiz edin. Epitranskriptomik araştırmalar için güvenilir bir araç sunar.

2D-HELS MS Seq: Farklı Nükleotid Modifikasyonlarına Sahip RNA Karışımlarının Doğrudan ve de novo Dizilimi için Genel LC-MS Tabanlı Bir Yöntem (Video) | JoVE Journal

2D-HELS MS Seq: Farklı Nükleotid Modifikasyonlarına Sahip RNA Karışımlarının Doğrudan ve de novo Dizilimi için Genel LC-MS Tabanlı Bir Yöntem

Daha fazla video keşfet