Name: Sitosolion Glutatyon S-Transferazlarının Potansiyel Inhibitörleri için Spektrofotometrik Tarama (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2020-10-10T14:30:00.000+00:00
Duration: 14 min 57 s
Description: Öğrenin, sitozolik GST inhibitörlerini spektrofotometrik yöntemle taramayı. Bu protokol, kanser kemoterapi direncini tersine çevirmek için IC50 ve Ki değerlerinin belirlenmesini sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu araştırma CANSEARCH Vakfı tarafından desteklenmiştir. Yazarlar, bayan Laurence Lesne ve Bay Yoann Sarmiento'yu teknik yardım için kabul etmek isterler, özellikle de tahlilleri inhibitörlerle standartlaştırırken çoğaltma deneylerini yaparken. Sayın Denis Marino, Dr Simona Mlakar ve Dr Vid Mlakar tarafından verimli tartışmalar ve girdileri büyük ölçüde kabul edilmektedir. Dr.Patricia Huezo-Diaz Curtis'e videonun anlatımındaki yardımları için teşekkür ederiz. Biz silico tahminler onun girişleri için Dr Muthukumar teşekkür ederiz. Ayrıca Bay Darren Hart'a bu el yazmasının İngilizce dil kanıtı okumasındaki yardımları için teşekkür ederiz.

1. GST enzim çözeltisinin hazırlanması
NOT: Enzim çözeltisinin hazırlanması prosedürü enzimaktivitesi birimlerinin tsay'dan önce bilinip bilinmediğine bağlıdır. Enzimlerden biri, dakikada 1 μmol ürün sentezlemek için gereken enzim miktarıdır. Enzimatik aktivite birim/mL veya μmol/min/mL olarak temsil edilir ve enzimatik çözeltinin seyreltilmesine bağlıdır. Spesifik enzimatik aktivite ünite/mg veya μmol/min/mg'da temsil edilir ve sadece çözeltinin saflığına bağlıdır. Her ikisi de bu özellikleri aşağıda belirlenir. İzole edilmiş bir GST izoformunun enzimatik birimi bilinmiyorsa, her reaksiyon için enzimatik konsantrasyonları ayarlamak ve tekrarlanabilir sonuçlar sağlamak için tahmin edilmelidir.
<ol><li>Eğer, tsömedinde kullanılan GST enzimatik birimi biliniyorsa:<ol>
<li>GST enziminin taze stok çözeltisini suda 0,1 U/mL'de hazırlayın ve ardından adım 2 ile devam edin. NOT: Bu çözelti -20 °C'de birkaç ay veya -80 °C'de daha uzun süre saklanabilir, ancak donma/çözülme döngüsünden kaçınılmalıdır.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Tsömdede kullanılan GST enzimatik birimi bilinmiyorsa:<ol>
<li>Bir bicinchoninic asit kullanarak enzim çözeltisinin protein konsantrasyonu ölçmek (BCA) protein testi, ya da başka bir kit.</li>
		<li>Protein çözeltisini 0.02 mg/mL nihai protein konsantrasyonuna seyreltin.</li>
		<li>96 kuyulu bir plakaya enzim çözeltisinin 20 μL'sini, 20 μL'ini GSH 25 mM (molekül ağırlığı: 307,32 g/mol) ve 150 μL Dulbecco'nun fosfat tamponlu salinini (DPBS) ekleyin. Boş için, enzim çözeltisi yerine 20°L su ekleyin.</li>
		<li>Her kuyuya 10 μL CDNB 50 mM (molekül ağırlığı: 202,55 g/mol) substrat ekleyin.</li>
		<li>Spektrofotometrik mikroplaka okuyucuda, kuyuları 340 nm olarak okumak için parametreleri ayarlayın. Emiciliği her dakika 10 dakika ölçmeli olarak ölçülmesi tavsiye edilir.</li>
		<li>Plakayı mikroplaka okuyucuya takın ve 1.2.5 adımın ayarlarına göre okumaya başlayın.</li>
		<li>Enzimatik numuneler ve boş için dakika başına absorbance değişikliğini hesaplayın. NOT: X ekseninde y ekseni ve dakika lar üzerinde emicilik çizerek reaksiyonun doğrusal olduğunu doğrulayın. Reaksiyon doğrusal değilse ve bir platoya ulaşırsa, tüm substrat kullanılır ve reaksiyon çok hızlı dır. Böylece, stok çözeltisini iki oranında seyrelterek kuyuya eklenen enzim miktarını azaltın.</li>
		<li>Test örneklerinin emicilik okumalarını boş düzeltin.</li>
		<li>Bira-Lambert yasasını temsil eden denklem 1 ile, her dakika oluşan GS-DNB konsantrasyonu (μM) hesaplayın. Denklem 1: <img alt="Equation 1" src="/files/ftp_upload/61347/61347equ01v2.jpg"> C'nin μM'deki substrat konsantrasyonu olduğu yerde, A340/dk dakikada absorbans değişimidir, 1.2.7'de ölçüldüğü gibi, ε CDNB eşlenik için 340 nm (0,0096 μM-1*cm-1) ve l kuyudaki ışık yolunun uzunluğudur (cm cinsinden). 200 μL enzimatik çözelti ile doldurulmuş 96 kuyuluk bir plaka için yol uzunluğu 0,55 cm civarındadır. Bu değer plaka modeline göre değişebilir ve üretici ile doğrulanmalıdır.</li>
		<li>Μmol/dk içinde bir kuyuda bulunan ürün miktarını belirlemek için, 1.-4</li>
		<li>Adım 1.2.9'un sonuçlarını 4 x 10-4 mg'a bölerek kullanılan protein başına aktiviteyi normalleştirin. Sonuç birim/mg veya μmol/min/mg'daki spesifik enzimatik aktivitedir. NOT: Seyreltme adım 1.2.6'da değiştirildiyse, doğrusal olmayan bir reaksiyon nedeniyle protein miktarını buna göre ayarlayın.</li>
		<li>Enzimatik aktiviteyi bulmak için, 1.2.10 adımda bulunan spesifik enzimatik aktiviteyi 0.002 mg/mL ile çarparak sonuçları mg/mL'deki protein konsantrasyonuna ayarlayın. Bu birim/mL veya μmol/min/mL enzimatik aktivite verecektir. NOT: Enzimatik aktivitenin aksine, bu ölçü protein çözeltisinin seyreltilmesine bağlı olarak değişmez. Adım 1.2.10 ile aynı not ama protein konsantrasyonu için.</li>
		<li>GST enziminin suda 0,1 birim/mL'de stok çözeltisini hazırlayın ve ardından adım 2 ile devam edin. NOT: Bu çözelti -20 °C'de birkaç ay veya -80 °C'de daha uzun süre saklanabilir, ancak donma/çözülme döngüsünden kaçınılmalıdır. Enzimatik aktivitenin kontrolü, protein çözeltisinin bozulması olabileceğinden deneylerin uzun bir süre boyunca yapılması önerilir.</li>
	</ol>
</li>
</ol>2. CDNB için GST isoformun Michaelis-Menten sabitinin ölçümü
NOT: Yordam bir CDNB alt katmanı için açıklanmıştır, ancak GSH gibi diğer alt tabakalara uygulanabilir. CDNB'nin her konsantrasyonunun kendi boş ihtiyacı vardır, çünkü 340 nm'deki absorbans CDNB konsantrasyonuna göre artacaktır.
<ol><li><li><li><li><li> <img alt="Equation 2" src="/files/ftp_upload/61347/61347equ02v2.jpg"> </li><li><li> </li><li></li></ol><ol><li> </li><li><li> </li><li></li><li><li><li><li><ol><li> </li><li></ol></li></ol><ol><li> </li><li><li><ol><li><li><li> </li></ol></li><li></li><li><li><li><li><li> </li></ol><ol><li></li><li><li><li></li><li></li><li> </li><li> </li></ol>

<ol><li>Mannervik, B., Danielson, U. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione+transferases--structure+and+catalytic+activity%5BTitle%5D)+AND+%22CRC+Critical+Reviews+in+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Glutathione transferases--structure and catalytic activity.</a> CRC Critical Reviews in Biochemistry. 23 (3), 283-337 (1988).</li>
<li>Awasthi, Y. C., Sharma, R., Singhal, S. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Human+glutathione+S-transferases%5BTitle%5D)+AND+%22The+International+Journal+of+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Human glutathione S-transferases.</a> The International Journal of Biochemistry. 26 (3), 295-308 (1994).</li>
<li>Rowe, J. D., Nieves, E., Listowsky, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Subunit+diversity+and+tissue+distribution+of+human+glutathione+S-transferases%3A+interpretations+based+on+electrospray+ionization-MS+and+peptide+sequence-specific+antisera%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemical+Journal%22%5BJournal%5D)">Subunit diversity and tissue distribution of human glutathione S-transferases: interpretations based on electrospray ionization-MS and peptide sequence-specific antisera.</a> Biochemical Journal. 325, Pt 2 481-486 (1997).</li>
<li>Beckett, G. J., Hayes, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione+S-transferases%3A+biomedical+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Advances+in+Clinical+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Glutathione S-transferases: biomedical applications.</a> Advances in Clinical Chemistry. 30, 281-380 (1993).</li>
<li>Oakley, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione+transferases%3A+a+structural+perspective%5BTitle%5D)+AND+%22Drug+Metabolism+Reviews%22%5BJournal%5D)">Glutathione transferases: a structural perspective.</a> Drug Metabolism Reviews. 43 (2), 138-151 (2011).</li>
<li>Townsend, D. M., Tew, K. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+role+of+glutathione-S-transferase+in+anti-cancer+drug+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">The role of glutathione-S-transferase in anti-cancer drug resistance.</a> Oncogene. 22 (47), 7369-7375 (2003).</li>
<li>Tew, K. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione-associated+Enzymes+in+Anticancer+Drug+Resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Cancer+Research%22%5BJournal%5D)">Glutathione-associated Enzymes in Anticancer Drug Resistance.</a> Cancer Research. 54 (16), 4313-4320 (1994).</li>
<li>Laborde, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione+transferases+as+mediators+of+signaling+pathways+involved+in+cell+proliferation+and+cell+death%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Death+and+Differentiation%22%5BJournal%5D)">Glutathione transferases as mediators of signaling pathways involved in cell proliferation and cell death.</a> Cell Death and Differentiation. 17 (9), 1373-1380 (2010).</li>
<li>Adler, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Regulation+of+JNK+signaling+by+GSTp%5BTitle%5D)+AND+%22The+EMBO+Journal%22%5BJournal%5D)">Regulation of JNK signaling by GSTp.</a> The EMBO Journal. 18 (5), 1321-1334 (1999).</li>
<li>Cho, S. G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione+S-Transferase+Mu+Modulates+the+Stress-activated+Signals+by+Suppressing+Apoptosis+Signal-regulating+Kinase+1%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biological+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Glutathione S-Transferase Mu Modulates the Stress-activated Signals by Suppressing Apoptosis Signal-regulating Kinase 1.</a> Journal of Biological Chemistry. 276 (16), 12749-12755 (2001).</li>
<li>Hayes, J. D., Flanagan, J. U., Jowsey, I. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione+Transferases%5BTitle%5D)+AND+%22Annual+Review+of+Pharmacology+and+Toxicology%22%5BJournal%5D)">Glutathione Transferases.</a> Annual Review of Pharmacology and Toxicology. 45 (1), 51-88 (2005).</li>
<li>Lo, H. W., Ali-Osman, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genetic+polymorphism+and+function+of+glutathione+S-transferases+in+tumor+drug+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Opinion+in+Pharmacology%22%5BJournal%5D)">Genetic polymorphism and function of glutathione S-transferases in tumor drug resistance.</a> Current Opinion in Pharmacology. 7 (4), 367-374 (2007).</li>
<li>Ansari, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione+S-transferase+gene+variations+influence+BU+pharmacokinetics+and+outcome+of+hematopoietic+SCT+in+pediatric+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Bone+Marrow+Transplantation%22%5BJournal%5D)">Glutathione S-transferase gene variations influence BU pharmacokinetics and outcome of hematopoietic SCT in pediatric patients.</a> Bone Marrow Transplantation. 48 (7), 939-946 (2013).</li>
<li>Mahajan, S., Atkins, W. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+chemistry+and+biology+of+inhibitors+and+pro-drugs+targeted+to+glutathione+S-transferases%5BTitle%5D)+AND+%22Cellular+and+molecular+life+sciences%3A+CMLS%22%5BJournal%5D)">The chemistry and biology of inhibitors and pro-drugs targeted to glutathione S-transferases.</a> Cellular and molecular life sciences: CMLS. 62 (11), 1221-1233 (2005).</li>
<li>Allocati, N., Masulli, M., Ilio, C. D., Federici, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione+transferases%3A+substrates%2C+inihibitors+and+pro-drugs+in+cancer+and+neurodegenerative+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogenesis%22%5BJournal%5D)">Glutathione transferases: substrates, inihibitors and pro-drugs in cancer and neurodegenerative diseases.</a> Oncogenesis. 7 (1), 8(2018).</li>
<li>Aggarwal, B. B., Kumar, A., Bharti, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Anticancer+potential+of+curcumin%3A+preclinical+and+clinical+studies%5BTitle%5D)+AND+%22Anticancer+Research%22%5BJournal%5D)">Anticancer potential of curcumin: preclinical and clinical studies.</a> Anticancer Research. 23 (1), 363-398 (2003).</li>
<li>Han, S. S., Chung, S. T., Robertson, D. A., Ranjan, D., Bondada, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Curcumin+causes+the+growth+arrest+and+apoptosis+of+B+cell+lymphoma+by+downregulation+of+egr-1%2C+c-myc%2C+bcl-XL%2C+NF-kappa+B%2C+and+p53%5BTitle%5D)+AND+%22Clinical+Immunology%22%5BJournal%5D)">Curcumin causes the growth arrest and apoptosis of B cell lymphoma by downregulation of egr-1, c-myc, bcl-XL, NF-kappa B, and p53.</a> Clinical Immunology. 93 (2), Orlando, Fla. 152-161 (1999).</li>
<li>Golonko, A., Lewandowska, H., Świsłocka, R., Jasińska, U. T., Priebe, W., Lewandowski, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Curcumin+as+tyrosine+kinase+inhibitor+in+cancer+treatment%5BTitle%5D)+AND+%22European+Journal+of+Medicinal+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Curcumin as tyrosine kinase inhibitor in cancer treatment.</a> European Journal of Medicinal Chemistry. 181, 111512(2019).</li>
<li>Awasthi, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Curcumin-glutathione+interactions+and+the+role+of+human+glutathione+S-transferase+P1-1%5BTitle%5D)+AND+%22Chemico-Biological+Interactions%22%5BJournal%5D)">Curcumin-glutathione interactions and the role of human glutathione S-transferase P1-1.</a> Chemico-Biological Interactions. 128 (1), 19-38 (2000).</li>
<li>Appiah-Opong, R., Commandeur, J. N. M., Istyastono, E., Bogaards, J. J., Vermeulen, N. P. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Inhibition+of+human+glutathione+S-transferases+by+curcumin+and+analogues%5BTitle%5D)+AND+%22Xenobiotica%3B+the+Fate+of+Foreign+Compounds+in+Biological+Systems%22%5BJournal%5D)">Inhibition of human glutathione S-transferases by curcumin and analogues.</a> Xenobiotica; the Fate of Foreign Compounds in Biological Systems. 39 (4), 302-311 (2009).</li>
<li>Dubey, V., Owusu-Apenten, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Curcumin+Restores+Glutathione-S-Transferase+Activity+for+LNCaP+Prostate+Cancer+Cells%5BTitle%5D)+AND+%22Pure+and+Applied+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Curcumin Restores Glutathione-S-Transferase Activity for LNCaP Prostate Cancer Cells.</a> Pure and Applied Chemistry. 2, 61-72 (2014).</li>
<li>Habig, W. H., Pabst, M. J., Jakoby, W. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glutathione+S-transferases.+The+first+enzymatic+step+in+mercapturic+acid+formation%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Biological+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Glutathione S-transferases. The first enzymatic step in mercapturic acid formation.</a> The Journal of Biological Chemistry. 249 (22), 7130-7139 (1974).</li>
<li>Johnson, K. A., Goody, R. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Original+Michaelis+Constant%3A+Translation+of+the+1913+Michaelis-Menten+Paper%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemistry%22%5BJournal%5D)">The Original Michaelis Constant: Translation of the 1913 Michaelis-Menten Paper.</a> Biochemistry. 50 (39), 8264-8269 (2011).</li>
<li>Ochs, R. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Understanding+Enzyme+Inhibition%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Chemical+Education%22%5BJournal%5D)">Understanding Enzyme Inhibition.</a> Journal of Chemical Education. 77 (11), 1453(2000).</li>
<li>Bisswanger, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Enzyme+assays%5BTitle%5D)+AND+%22Perspectives+in+Science%22%5BJournal%5D)">Enzyme assays.</a> Perspectives in Science. 1 (1), 41-55 (2014).</li>
<li>Acker, M. G., Auld, D. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Considerations+for+the+design+and+reporting+of+enzyme+assays+in+high-throughput+screening+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Perspectives+in+Science%22%5BJournal%5D)">Considerations for the design and reporting of enzyme assays in high-throughput screening applications.</a> Perspectives in Science. 1 (1), 56-73 (2014).</li>
<li>Cheng, A. L., et al. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aCheng%2C+AL+%22Anticancer+Research%22">Anticancer Research</a>. 21, 2895-2900 (2001).</li>
<li>Yang, J., Copeland, R. A., Lai, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Defining+Balanced+Conditions+for+Inhibitor+Screening+Assays+That+Target+Bisubstrate+Enzymes%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biomolecular+Screening%22%5BJournal%5D)">Defining Balanced Conditions for Inhibitor Screening Assays That Target Bisubstrate Enzymes.</a> Journal of Biomolecular Screening. 14 (2), 111-120 (2009).</li>
<li>Uppugunduri, C. R. S., Muthukumaran, J., Santos-Silva, T., Ansari, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+putative+substrates+and+inhibitors+for+Glutathione+S-transferases+using+computational+methods%5BTitle%5D)+AND+%22Zenodo%22%5BJournal%5D)">Identification of putative substrates and inhibitors for Glutathione S-transferases using computational methods.</a> Zenodo. , (2017).</li>
<li>Burlingham, B. T., Widlanski, T. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+Intuitive+Look+at+the+Relationship+of+Ki+and+IC50%3A+A+More+General+Use+for+the+Dixon+Plot%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Chemical+Education%22%5BJournal%5D)">An Intuitive Look at the Relationship of Ki and IC50: A More General Use for the Dixon Plot.</a> Journal of Chemical Education. 80 (2), 214(2003).</li>
<li>Wang, Y. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stability+of+curcumin+in+buffer+solutions+and+characterization+of+its+degradation+products%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Pharmaceutical+and+Biomedical+Analysis%22%5BJournal%5D)">Stability of curcumin in buffer solutions and characterization of its degradation products.</a> Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis. 15 (12), 1867-1876 (1997).</li>
<li>Copeland, R. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+enzyme+inhibitors+in+drug+discovery.+A+guide+for+medicinal+chemists+and+pharmacologists%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+of+Biochemical+Analysis%22%5BJournal%5D)">Evaluation of enzyme inhibitors in drug discovery. A guide for medicinal chemists and pharmacologists.</a> Methods of Biochemical Analysis. 46, 1(2005).</li>
<li>Kalliokoski, T., Kramer, C., Vulpetti, A., Gedeck, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparability+of+Mixed+IC50+Data+-+A+Statistical+Analysis%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+ONE%22%5BJournal%5D)">Comparability of Mixed IC50 Data - A Statistical Analysis.</a> PLoS ONE. 8 (4), (2013).</li>
<li>Brandt, R. B., Laux, J. E., Yates, S. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Calculation+of+inhibitor+Ki+and+inhibitor+type+from+the+concentration+of+inhibitor+for+50%25+inhibition+for+Michaelis-Menten+enzymes%5BTitle%5D)+AND+%22Biochemical+Medicine+and+Metabolic+Biology%22%5BJournal%5D)">Calculation of inhibitor Ki and inhibitor type from the concentration of inhibitor for 50% inhibition for Michaelis-Menten enzymes.</a> Biochemical Medicine and Metabolic Biology. 37 (3), 344-349 (1987).</li>
<li>Brooks, H. B., et al. Basics of Enzymatic Assays for HTS. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBrooks%2C+HB+%22Eli+Lilly+%26+Company+and+the+National+Center+for+Advancing+Translational+Sciences%22">Eli Lilly & Company and the National Center for Advancing Translational Sciences</a>. , (2012).</li>
<li>Arakawa, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+hepatic+glutathione+transferase+Mu+1+and+Theta+1+activities+in+humans+and+mice+using+genotype+information%5BTitle%5D)+AND+%22Drug+Metabolism+and+Disposition%3A+The+Biological+Fate+of+Chemicals%22%5BJournal%5D)">Evaluation of hepatic glutathione transferase Mu 1 and Theta 1 activities in humans and mice using genotype information.</a> Drug Metabolism and Disposition: The Biological Fate of Chemicals. 40 (3), 497-503 (2012).</li>
<li>Sherratt, P. J., Pulford, D. J., Harrison, D. J., Green, T., Hayes, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+that+human+class+Theta+glutathione+S-transferase+T1-1+can+catalyse+the+activation+of+dichloromethane%2C+a+liver+and+lung+carcinogen+in+the+mouse.+Comparison+of+the+tissue+distribution+of+GST+T1-1+with+that+of+classes+Alpha%2C+Mu+and+Pi+GST+in+human%5BTitle%5D)+AND+%22The+Biochemical+Journal%22%5BJournal%5D)">Evidence that human class Theta glutathione S-transferase T1-1 can catalyse the activation of dichloromethane, a liver and lung carcinogen in the mouse. Comparison of the tissue distribution of GST T1-1 with that of classes Alpha, Mu and Pi GST in human.</a> The Biochemical Journal. 326 (3), 837-846 (1997).</li>
</ol>

Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.

Spektrofotometrik GST enzim testinin her adımını açıklayan bir protokol salıyoruz, putatif inhibitörleri(Şekil 1, Tablo 1)taramak ve inhibitör gücünü ölçmek için. Ayrıca, tekrarlanabilir sonuçlar sağlayan doğru enzim tahlilleri için göz önünde bulundurulması gereken en önemli kriterleri de vurguladık. Açıklanan protokolün diğer kolorimetrik yöntemler veya kütle spektrometresi üzerinde en büyük avantajları, bu protokolün hızlı ve kolay gerçekleştirilebilir ve GST aktivitesinin kantitatif ölçümlerinin yanı sıra taranmış moleküllerin inhibisyonu cocitensi sa¤lanmasının sa¤lanmışolduğudur.
Bir enzim inhibitörünün en önemli iki Michaelis-Menten parametresini hesaplamanın yolunu sıyoruz: IC50 ve Ki. Güçlü bir inhibitör mümkün olan en düşük Ki ve IC50 uygulayacak, inhibitör ve enzim arasındaki yakınlık yüksek olduğunu belirten30. IC50 enzim konsantrasyonu ve deneme koşulları33bağlı olduğundan, farklı deneyler veya diğer deneme koşulları34kullanılarak elde inhibitörleri karşılaştırmak için bu değeri kullanmak zor olabilir. İnhibisyon sabiti Ki kullanarak potansiyel bileşiklerin inhibitör potens daha iyi bir göstergesidir. Ki, iki inhibitörü farklı inhibisyon modlarıyla karşılaştırmak için kullanılabilir, çünkü bu inhibitör ve enzim arasındaki yakınlığa bağlıdır. Ancak, inhibisyonun doğası hakkında net bir fikre sahip olmak için inhibitörün parametrelerinin her ikisini de belirlemeli30. Kurkuminlerin IC50 ve Ki'yi sırasıyla 3,6 μM ± ve 23,2 ± 3,2 μM olarak ölçtük ve bu bileşiğin güçlü bir GST inhibitörü olduğunu belirttik. Bu sonuçlar, farklı insan GST izoformları ve curcumin için 27,4 ila 78,1 μM arasında Ki değerleri tahmin silico tahminleri doğruladı.
Enzimaktivitesi veya reaksiyon oranı ve enzim miktarı Yukarıda belirtildiği gibi, IC50 enzim konsantrasyonuna bağlıdır ve enzimaktivitesi bilinmeyen bir düzeyde bir deney yapmak yanlış sonuçlara yol açabilir33. Inhibitör aktiviteyi azaltabilecek diğer faktörleri kontrol etmek için, her yeni GST grubu için enzimatik aktiviteyi göz önünde bulundurmalı ve ölçmelisiniz. Örneğin, çok fazla donma/çözülme döngüsünden kaynaklanan enzimatik bir toplu iş parçasının bozulması etkinliği azaltabilir ve böylece deneme aynı koşullar altında çalıştırılsa bile daha düşük bir IC50'ye yol açabilir. Başka bir deyişle, 0.01 birim enzim kullanarak 1 birim kullanarak aynı sonuçları vermeyecektir. Çok fazla enzim kullanmak substratın hızlı tükenmesine yol açabilir ve reaksiyon doğrusal bir şekle sahip olmayacaktır. Bu parametre böylece kesin olmayan bir sonuca yol açabilir, çünkü uzun bir kuluçka süresinden sonra emicilikte herhangi bir değişiklik görülemez.
Km Değeri Bir inhibitör tarafından sergilenen inhibisyon türünü değerlendirmek için en iyi koşulları sağlamak için, substrat konsantrasyonu Michaelis-Menten sabitine (Km)eşit veya altında olmalıdır. Km enzim28aktif sitelerin yarısını işgal etmek için gerekli substrat konsantrasyonu ile temsil edilir. Örneğin, daha yüksek substrat konsantrasyonu rekabetçi bir inhibitöre karşı koyabilirsiniz ve bu tür inhibisyon değerlendirmek bu tür bir ortamda zor olacaktır. Bu nedenle, bu metodolojideki en önemli adımlardan biri enzimin Km'sinin seçilen substrat için belirlenmesidir (burada CDNB). Bazı çalışmalarda, bu değer belirlenmemiştir ve bu inhibitör neden olduğu inhibisyon paterni hakkında yanlış sonuçlara yol açabilir, ve inhibisyon modu yanlış ise, Denklem inhibisyon desen dayanır gibi Ki yanlış hesaplanacaktır26,28. Farklı bir GST isoform test edilirse, bu değer bir çift enzim ve ligand için benzersiz olduğundan, Km değerinin yeni bir değerlendirmesi zorunludur. 0,26 ± 0,08 mM olarak tanımladığımız Km (0,2 mM) daha düşük CDNB konsantrasyonu kullanıldığından, GST'de curcumin inhibisyonunun öngörülen rekabet modu doğru olarak belirlenmiştir.
IC50 IC50'yi tahmin etmek için iyi bir sigmoidal eğri elde etmek hem alt hem de üst platoları bulmayı gerektirir. Alt plato maksimum inhibitör aktivitesi sağlayan bir inhibitör konsantrasyonları temsil eder. Bazı durumlarda, bir bileşik tam enzim inhibe olmayabilir, yüksek konsantrasyonlarda bile, çözünürlüğü gibi teknik sorunlar nedeniyle. Ancak, GraphPad Prism gibi araçlar oldukça doğru alt plato sığabilir. Üst plato enzimi inhibe etmek için yetersiz olan inhibitör konsantrasyonlarından oluşur ve bu nedenle aktivite maksimaldır. Her iki plato da IC50'nin yanı sıra aradaki konsantrasyonları belirlemek için çok önemlidir, eğrinin eğimini bulmak için-daha sonra IC50 sigmoideğri35şeklinden türetilebilir. Curcumin suda kötü çözünür, bu nedenle bu istiyatuar kullanılan maksimum konsantrasyon sınırlıdır, istiyatuar çözeltisinde yağış önlemek için. Böylece GST aktivitesini tam olarak engellemeyen daha az konsantre çözeltiler kullanılmıştır. Bu durum, alt platonun belirlenmesinde sorunlara yol açtı. Bu sorunu çözmek için, kurkumin için 31,6 ± 3,6 μM'lik ic50 sağlayan doğrusal olmayan regresyon grafiğine dayalı alt değerleri tahmin ettik(Şekil 3A). Etakrinik asit için, bu bileşik istihsal çözeltisinde çözünür ve IC50 6.6 ± 1.1 μM olarak ölçüldü olarak alt plato için değerleri tahmin etmek gerek yoktu.
Bu yöntem insanda en çok ifade edilen GST izoformlarına, yani GSTA1, GSTM1 veya GSTP1'e uygulanabilir. Ancak, CDNB bu alt tip için bir alt tabaka olmadığı için, bu protokol GSTT1 izoformaktivitesini ölçmek için uygun değildir. 36, 37 Bu arada, protokol bu sorunu karşı lamak için biraz değiştirilebilir. Örneğin, 1,2-epoksi-3-(4'-nitrophenoxy)propan (ENPP) GSTT1 için bir substrat olarak kullanarak ve 340nm yerine 360nm konjuge miktarını ölçmek. 37.000
Protokolün adımları, hücre kültürü deneylerinde GST aktivitesini ve inhibitör testini test etmek için uyarlanmış ve uygulanabilir. GST inhibitörü ile ve GST inhibitörü olmayan hücrelerde GST aktivitesinin ölçülmesi, bu bileşiğin bu tür deneysel ortamda kullanIlip kullanılamayacağı na işaret eder. Inhibitör lipophilic olduğunda özellikle ilginçtir. Örneğin, biz curcumin güçlü bir GST inhibitörü bu protokolü kullanarak olduğunu sundu. Yine de, hücresel çalışmalara uygulanması sınırlı olabilir, molekül suda kötü çözünür ve orta hızla bozulur gibi. 31 Bu protokolün bir başka iyileştirilmesi substrat CDNB non-isoform özgüllük ile ilgili mümkündür. Hücre çalışmalarında bu protokolü kullanarak sadece genel GST etkinliği hakkında bilgi verecektir, ancak kesin GST alt tipi etkinliği hakkında değil. İzoforma özgü substrat ve/veya spesifik rekombinant GST izoform kullanılarak izoform spesifik GST inhibitörlerinin test inoform olarak kullanılmasına izin verecektir.
Sonuç olarak, elektrofilik kemoterapi ile birlikte kullanılma potansiyeline sahip GST inhibitörlerini test etmek için tam bir prosedür uyguluyoruz. Biz potansiyel ilginç molekül test etmek ve kantitatif değerler, IC50 ve Kiile inhibitör olarak verimliliğini belirlemek için, bir GST enzim ve inhibisyon testi önemli adımları vurguladı . Bu yöntem herhangi bir putatif bileşik uygulanabilir ve en ifade edilen insan GST izoformları (GSTA1, GSTM1 ve GSTP1) üzerinde gerçekleştirilen veya biraz GST inhibitörleri ile hücre kültürü çalışmaları gerçekleştirmek veya seçim diğer ilginç GST izoform aktivitesini ölçmek için uyarlanmış.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always" fo:text-align="center"><tbody>
<tr>
<td>Reaktif</td>
			<td>Adı</td>
			<td>Asa çözeltisinde konsantrasyon</td>
			<td>Diğer</td>
		</tr>
<tr>
<td>Substrat</td>
			<td>CDNB</td>
			<td>Ölçülen Km (mM)</td>
			<td>%95 etanolle seyreltilmiş. Son etanol konsantrasyonu %5 ≤ olmalıdır (v/v)</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">Çekim substrat</td>
			<td rowspan="2">Gsh</td>
			<td rowspan="2">2,5 mM</td>
			<td>Suda seyreltilmiş.</td>
		</tr>
<tr>
<td>Konsantrasyon çözeltiyi doygunlaştırmalıdır.</td>
		</tr>
<tr>
<td>Arabellek</td>
			<td>Pbs</td>
			<td>-</td>
			<td>pH = 7.1</td>
		</tr>
<tr>
<td>Enzim</td>
			<td>GST isoformhavuzu veya saf isoform</td>
			<td>0.01 birim/mL, deneysel olarak belirlenir.</td>
			<td>Suda seyreltilmiş.</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">GST inhibitörü</td>
			<td rowspan="2">Potansiyel tercih bileşiği</td>
			<td>IC50: En üst düzeyde inhibe 3 konsantrasyonu, en az inhibe 3, ve 3 arasında.</td>
			<td rowspan="2">DMSO'da ve daha sonra suda seyreltilmiş, dmso ≤% 1 (v/v) son konsantrasyonu için</td>
		</tr>
<tr>
<td>Ki: IC50 çevresinde 3 konsantrasyon.</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4" style="text-align:center;">Parametre</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4" style="text-align:center;">Oda sıcaklığı (25°C)</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4" style="text-align:center;">pH = 7.1</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4" style="text-align:center;">DMSO ≤ %1 (v/v)</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="4" style="text-align:center;">Etanol ≤ %5 (v/v)</td>
		</tr>
</tbody></table>Tablo 1: GST inhibisyonu sırasında göz önünde bulundurulması gereken reaktiflerin ve parametrelerin özeti.

Sitosolik glutatyon S-transferaz enzimleri (GSTs, EC 2.5.1.18) kemoterapötik ajanlar gibi çeşitli elektrofilik bileşikler içine glutatyon (GSH) konjugasyon katalize, detoks ve vücuttan kolayca ortadan kaldırmakiçin 1. Sitosolik GST'nin yedi isoformu alfa, mu, pi, sigma, omega, teta ve zeta olarak tanımlanmıştır. GST'ler esas olarak karaciğer, testisler, akciğerler ve gastrointestinal sistemde ifade edilir2. GST alfa 1 (GSTA1) isoform yüksek hepatositler ifade edilir. Vücut heterojen diğer alt tipleri ifade eder, GST pi dahil 1 (GSTP1) ağırlıklı olarak beyin, kalp, ve akciğerler, ve GST mu 1 (GSTM1) karaciğer vetestisler 3. GST isoforms arasında yüksek sekans homoloji olmasına rağmen, her sergiler substrat özgüllük ve farklı şekillerde ilaç metabolizması ve kanser karıştığı, diferansiyel ifadeye göre4,5.
Elektrofilik bileşikler ya vücuda dışa dönük olarak girer ya da endojen olarak üretilir. Pestisitler, prostaglandinler, kanserojenler ve kemoterapötik ilaçlar glutatyon konjugasyon reaksiyonları için potansiyel substratlar bazılarıdır6. Örneğin, bir hücre içinde oluşan herhangi bir elektron eksikliği reaktif bileşik elektrofilik substrat olma olasılığı yüksektir. Klorambucil veya melfalan gibi alkilleyici ajanlar GST'ler tarafından katalize GSH konjugatları olarak ortadan kaldırılır ve bu enzimlerin artan düzeyleri bu bileşiklere direnç ile korelasyon olmuştur6,7.
Sitosolik GST'lerin bir diğer önemli rolü de MAPK8 (c-Jun N-terminal kinaz veya JNK1 olarak da bilinir) ve MAP3K5 (apoptoz sinyal düzenleyici kinaz 1 veya ASK1olarakda bilinir) 8 gibi mitojen aktive protein kinazlarının (MAPK) aktivitesini düzenlemektir. Monomerik konformasyonlarındaki bazı izoformlar bu proteinlere bağlanır ve böylece fosforiyasyon basamaklarını bloke ederler. Normal şartlar altında, GSTP1 izoform MAPK8 (c-Jun proteinaktivatörü) tecrit edecek. C-Fos proteini ile c-Jun birleştirerek aktivatör protein 1 oluşturur (AP-1) transkripsiyon faktörü, pro-apoptotik genlerin transkripsiyonu sorumludur. Stresli hücrelerde, GSTP1 ve MAPK8 dissociates tarafından oluşturulan kompleks, c-Jun aktive edilir, ve apoptosis giden genler ifade etmeye başlar9. Bu GST isoform daha fazla ifade bu nedenle yolu bloke edebilir, artan hücre canlılığı yol, daha fazla hücresel prolifelife, ve kemoterapi için daha düşük hücresel duyarlılık. Benzer senaryolar GSTP1 paralogları ile oluşabilir, örneğin, GSTM1, MAP3K510ile etkileşim .
İlaç metabolizmasında ve MAPKs'nin sekestrasyonunda GST'lerin oynadığıroller,GST'lerin daha büyük bir ekspresyonunun kemoterapötik tedaviye karşı tümöral direnç mekanizmasının bir işareti olabileceği hipotezine yol açtı6,11. Örneğin, GSTP1 çok sayıda kanserde aşırı ifade edilir ve varlığı kötü bir prognoz ve nüks artan insidansı ile ilişkili olmuştur8. Bu genlerdeki polimorfizm, çeşitli hastalıklar sunan hastalarda diferansiyel ilaç maruziyeti ve sağkalım oranları göstererek, bu enzimlerin ilaç direnci mekanizmaları için çok önemli olduğu fikrini güçlendirmiştir. Örneğin, GSTM1 null genotip olan bireyler daha düşük ilaç temizleme ve daha iyi sağkalım ile ilişkilidir12,13. GSH analoglarının kullanımı, GST'lerle çekim le aktive edilen proilaçlar veya doğrudan GST inhibitörleri14,15gibi bu aşırı ifadeye karşı koymanın çeşitli potansiyel araçları vardır.
Tüm bu yöntemler şu anda araştırılmaktadır ve birkaç bileşikler hastalar arasında potansiyel kullanım ları için klinik çalışmalara başlamıştır. Ancak, bilgimizin en iyi, klinik ortamlarda GST inhibitörleri olarak kullanılan hiçbir bileşikler vardır15. Gerçekten de, bazı izoformlar veya normal hücrelerde GSH tükenmesi için özgüllük eksikliği, hangi organ sistemlerinde reaktif oksijen türlerinin birikimine neden toksisite yol açabilir (ROS), gst inhibitörleri potansiyelini azaltmak dezavantajları sadece bazılarıdır14,15. Bu bileşiklerin vücut üzerinde diğer farmakodinamik etkileri uygulamak olabilir riski de onların kullanımını sınırlandırıyor. Etakinik asit, örneğin, laboratuvar ortamlarında en çok çalışılan GST inhibitörü, ancak öncelikle güçlü bir idrar söktürücü olarak kullanıldığından, bu özellik klinik ortamlarda diğer ilaçlarile birlikte kullanımını sınırlar. Curcumin başarıyla bir GST inhibitörü olarak taranır başka bir doğal bileşiktir. Bu molekül zerdeçal Curcuma longa türlerinden elde edilen bir polifenol eterdir. Bu tümör hücre hatları çeşitli tür apoptosis indükleyerek kansere karşı olası bir tedavi seçeneği olarak umut verici sonuçlar göstermiştir16,17. Bileşik tirozin kinaz18 veya GST yolu gibi çeşitli hücresel yolları düzenleyebilir. Saf proteinler ile yapılan çalışmalar GSTA1, GSTM1 ve GSTP119,,20üzerindeki inhibisyon gücünü göstermiştir. Ancak, çelişkili sonuçlar kanser hücrelerinde gözlendi, hücreler curcumin ile tedavi edildiğinde daha fazla hücre içi GST aktivitesi ölçüldü21. Bu nedenle, daha fazla hücresel deney planlamadan önce, herhangi bir putatif GST inhibitörü nün yarı maksimal inhibitör konsantrasyonu (IC50) ve inhibisyon sabitini (Ki)araştırmak önemlidir.
Tarama ve potansiyel yeni GST inhibitörleri test bu nedenle önemli klinik ilgi, ve bulunan herhangi bir yeni bileşik elektrofilik ilaçlar ile birlikte kullanım için güvenli ve verimli olmalıdır. İzoforma özgü inhibitörler üzerinde durulan araştırmalar, spesifik GST ekspresyonu örüntülerini sergileyen tümör dokularında GST inhibisyonunu sağlayarak etkili bir kombinasyon tedavisinin geliştirilmesine olanak sağlayabilir. Diferansiyel inhibisyon modları ile inhibitörleri bulma da ilgi olabilir. Örneğin, bir substrat olarak GSH kullanan rekabetçi bir inhibitör onun tükenmesine neden olabilir. Hücrelerde GSH konsantrasyonunun bu azalma nöronlarda oksidatif stres indüklemek için gösterilmiştir, apoptosis yol. Başka bir yaygın inhibisyon modu-rekabet dışı inhibisyon-substrat yüksek konsantrasyonlarda mevcut olsa bile geri alınamaz.
Enzimatik aktivite oranı Michaelis-Menten sabiti (Km)ve maksimum hız (Vmax)ile temsil edilir, bu da michaelis-Menten grafiği çizilerek belirlenebilir, reaksiyonun hızına karşı substrat konsantrasyonu23. Km, enzimatik aktif alanların yarısını işgal etmek için gereken substrat konsantrasyonudur, yani yüksek Bir Km daha az yakınlık temsil ederler. Vmax, tüm aktif alanlar substrat tarafından işgal edildiğinde ulaşılan reaksiyonun maksimum hızını temsil eder. Km yarım Vmaxeşittir. En yaygın üç engelleme modu vardır: rekabetçi, rekabetçi olmayan ve rekabet edemeyen. Rekabetçi inhibisyon durumunda, inhibitör enzimin aktif bölgesine bağlanır ve substrat ile rekabet eder. Bu nedenle, Vmax inhibitörü eklenmesinden sonra değişmez, ancak Km artar, daha fazla substrat inhibisyon karşı gerekli olduğu gibi. Rekabet ematür, ancak substrat enzimle kompleks oluşturduğunda ortaya çıkar. Bu durumda, inhibisyon düzeyi substrat ve enzim konsantrasyonuna bağlı olduğundan, inhibitör reaksiyona eklendiğinde Vmax ve Km azalır. İnhibisyonun son modu rekabetçi değildir ve diğer iki inhibisyon modelinin bir karışımıdır. Inhibitör enzimin substratBağlı olup olmadığını enzimin aktif bölgeye bağlanabilir. Burada Vmax inhibitörü ilavesi sonra azalır, ancak Km 24değişmez.
GST aktivitesini ölçen bir spektrofotometrik tspeca ilk olarak Habig ve ark. tarafından 1974 yılında 1-kloro-2,4-dinitrobenzen (CDNB) kullanılarak reaksiyon22'ninsubstratı olarak geliştirilmiştir. GSH ve CDNB arasındaki çekim, 340 nm dalga boyunda maksimum ışık emiciliği sergileyen GS-DNB formunu oluşturur ve spektrofotometre ile kaydedilebilir. Aşağıda açıklanan tekniğin çoğu Habig ve ark., en iyi ayarlar ve inhibitör bir tahkikat için önemli optimizasyon noktaları hakkında bilgi de dahil olmak üzere türetilmiştir. Bu teknik, ister hesaplamalı tahminler kullanılarak ister literatür taraması ile rasyonel ilaç seçimi tarafından seçilsin, potansiyel GST inhibitörlerinin taranmasıiçin uygulanabilir. Protokolün yeni sentezlenen GST proteinlerine veya spesifik isoformlara nasıl uyarlanış edilebilenler de tartışılmıştır. Örneğin, klinik olarak ilgili polimorfizm veya tek nükleotid polimorfizm (SNP) sergileyen GST izoformlarının inhibitör gücünü test etmek, hastaya özel GST'leri hedefleyen bu protokol için potansiyel kullanım alanları olabilir.
Bu protokol, diğer fonksiyonel çalışmalardan önce potansiyel GST inhibitörlerinin in vitro olarak taranması için hızlı, uygulanabilir ve etkili bir yöntem sağlar. Enzimatik inhibitörün en sık ölçülen özelliklerini değerlendirmek için gereken adımlar tanımlanmıştır: enzimatik aktiviteyi yarı yarıya azaltmak için gerekli inhibitör konsantrasyonu olan inhibitör konsantrasyonu 50 (IC50); ve inhibitör ve enzim arasındaki dissosiyatasyonun denge sabitini temsil eden inhibisyon sabiti (Ki)bu iki molekül arasındaki yakınlığın karakteristik özelliğidir. Bu iki değer doğrusal olmayan regresyon ile ölçülür ve her inhibisyon moduna özgü denklemler kullanılarak, sırasıyla. Ayrıca,inhibitör23,25,26eklenmesinden sonra Vmax ve Km değişimini belirlemek için Michaelis-Menten çizimleri kullanarak, inhibisyon bu modelin değerlendirilmesi göstermek.

<table><tbody><tr><td>1-Kloro-2,4-dinitrobenzen (CDNB)</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>237329</td><td>GST enzimatik tahlili için kullanılan substrat</td></tr><tr><td>Corning UV-Şeffaf Mikroplakalar</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>CLS3635</td><td>Enzimatik tahlili gerçekleştirmek için şeffaf plaka. 200 ul kullanıldığında, bu plaka için yol uzunluğu 0,552 cm'dir.</td></tr><tr><td>Curcumin</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>8511</td><td>Sonuçlar bölümünde, curcumin</td></tr><tr><td>Dimetil sülfoksit (DMSO)</td> <td>Sigma-Aldrich</td><td>D2650'nin</td> inhibisyon gücünü test etmek için kullanılır Varsayılan <td>inhibitörün stoğunu hazırlamak için</td></tr><tr><td>DPBS</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>D8537</td><td>Enzimatik reaksiyon için tampon</td></tr><tr><td>Etanol %95</td> <td>Fisher bilimsel</td><td>10542382</td><td>CDNB'yi</td></tr> <tr><td>seyreltmek içinAt karaciğerinden elde edilen glutatyon S-Transferaz</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G6511</td> Sonuçlar bölümünde, kurkumin L-glutatyonu azaltılmış (GSH) in <td>inhibisyon gücünü test etmek için</td></tr> <tr><td></td><td>kullanılırSigma-Aldrich</td><td>G4251</td><td>GST enzimatik tahlili için ko-substrat</td></tr><tr><td>Pierce BCA Protein Test Kiti</td><td>ThermoFisher</td><td>23225</td><td>Enzimatik çözelti Spectramax</td>iD3'te</tr> <tr><td></td><td>bulunan protein miktarını ölçmek içinMoleküler cihazlar</td><td></td><td>Spektrofotometrik ölçümler yapmak</td></tr></tbody></table>

sitosolion glutatyon s-transferazlarının potansiyel inhibitörleri için spektrofotometrik tarama

Spectrophotometric Screening for Potential Inhibitors of Cytosolic Glutathione S-Transferases

Glutatyon S-transferazlar (GSTs) glutatyon (GSH) konjugasyonu ile endojen veya eksojen elektrofilik bileşiklerin ortadan kaldırılmasından sorumlu metabolik enzimlerdir. Buna ek olarak, GST'ler apoptotik yollarda yer alan mitojen aktive protein kinazlarının (MAPKs) düzenleyicileridir. GST'lerin aşırı ekspresyonu, elektrofilik alkilleyici ajanlarla kemoterapi gören hastalarda azalmış terapötik etkinlik ile ilişkilidir. GST inhibitörleri kullanarak bu eğilimi tersine çevirmek ve tedavi gücünü artırmak için potansiyel bir çözüm olabilir. Bu hedefe ulaşmak, doğru, hızlı ve kolay bir enzim tsay ile, bu tür bileşiklerin keşfi gerektirir. 1-kloro-2,4-dinitrobenzen (CDNB) substrat olarak kullanılan bir spektrofotometrik protokol literatürde en çok kullanılan yöntemdir. Ancak, zaten açıklanan GST inhibisyonu deneyleri, CDNB için Michaelis-Menten sabitinin (Km)ölçümü veya kullanılan enzim konsantrasyonunun göstergesi, test edilmiş bir bileşiğin inhibisyon gücünü değerlendirmek için önemli parametreler gibi optimal inhibisyon testinin her aşamasını ayrıntılı olarak açıklayan bir protokol sağlamaz. Bu nedenle, bu protokol ile, potansiyel inhibitörlerin kitaplıklarını taramak için optimize edilmiş spektrofotometrik GST enzim testinin her adımını tanımlıyoruz. Hem yarı maksimal inhibitör konsantrasyonunun (IC50) hem de inhibisyon sabitinin (Ki)—bir enzim inhibitörünün gücünü ölçmek için kullanılan iki özelliğin hesaplanmasını açıklarız. Açıklanan yöntem, hücrelerden veya saf rekombinant insan GST'lerinden, yani GST alfa 1 (GSTA1), GST mu 1 (GSTM1) veya GST pi 1 'den (GSTP1) çıkarılan GST'ler havuzu kullanılarak uygulanabilir. Ancak, CDNB bu izoform için bir substrat olmadığı için bu protokol GST teta 1 (GSTT1) uygulanamaz. Bu yöntem, at karaciğerinden GST kullanarak curcumin inhibisyonu potens test etmek için kullanılmıştır. Curcumin anti-kanser özellikleri sergileyen bir moleküldür ve silico yerleştirme tahminleri sonra GST izoformlar doğru yakınlık gösterdi. Biz curcumin güçlü bir rekabetçi GST inhibitörü olduğunu gösterdi, 31.6 ± 3.6 μM bir IC50 ve Ki 23.2 ± 3.2 μM. Curcumin etkinliğini artırmak için elektrofilik kemoterapi ilaç ile kombine edilme potansiyeline sahiptir.

Michaelis-Menten sabiti (Km)CDNB ile AT karaciğerinden GST Curcumin yüksek dozlarda yenilmesinden sonra bile güvenli bir doğal bileşiktir27 antikanser özellikleri gösterdi16. Bu molekülün inhibitör potens insan rekombinant GSTs19,,20gösterilmiştir. Açıklanan protokolü kullanarak, kurkuminin GST aktivitesi üzerindeki etkisini at karaciğerinden gelen GST izoformları havuzunu kullanarak değerlendirdik. Tedarikçiye göre, bu protein karışımının özgül aktivitesi 25 U/mg'dır. 0.1 U/mL'lik bir stok çözeltisi, liyofilize toz un uygun miktarda su ile eritilerek hazırlanmıştır. Etakinik asit bu bileşik çalışmalarda en yaygın olarak kullanılan GST inhibitörü olduğu gibi pozitif kontrol olarak paralel olarak kullanılmıştır. GST aktivitesi testi nin ayarlanması ve inhibitörlerin test edilmesindeki adımlar Şekil 1'deözetlenmiştir.
Km her enzim substrat reaksiyonu için tanımlanmalıdır, çünkü Km'ye eşdeğer substrat konsantrasyonu kullanılması inhibisyon modunun belirlenmesikonusunda önyargı sağlamaz28. Bu parametreyi ölçmek için 2,5 mM GSH sabit konsantrasyonu kullanılarak, 0,5 mM ile 5 mM arasında değişen altı farklı CDNB konsantrasyonu test edildi.
Reaksiyonun son hacmi 96 kuyulu bir plakada 200 μL idi. CdNB ve GSH'nin spontan çekimi oluşabilir ve absorbasyonu artırabilir, çünkü test iyi olarak CDNB aynı konsantrasyonu kullanarak, her deney için belirli bir boşluk kullanılmıştır. Tahlil karışımına stok çözeltisinin 20 μL'lik kısmı eklenerek tüm reaksiyonlar için 0.01 birim/mL'lik son bir enzim konsantrasyonu kullanıldı. 340 nm'de emicilik 10 dakika boyunca her dakika kaydedildi. Reaksiyonun hızı (mM/dk cinsinden) Denklem 2kullanılarak hesaplanmıştır. Michaelis-Menten grafiği substrat konsantrasyonu (mM) hızına (μM/dk) karşıFigure 2çizildi ve reaksiyonun Km değeri hesaplandı. Deney, en az üç veri kümesi benzer sonuçlar gösterene kadar tekrarlandı. Atm karaciğerinden GST ile CDNB'nin K m'si 0.26 ± 0.08 mM olarak ölçüldü. Bu gstt grubu kullanılarak her inhibitör titret için 0,2 mM CDNB konsantrasyonu kullanıldı.
340 nm'de emilen bir metabolitin spontan oluşumu GSH ve CDNB ile tek başına inkübe edilmiş curcumin kullanılarak ölçüldü. Aynı boşluk her deneydeki her inhibitör konsantrasyonu için kullanıldı.
GST'lerde Curcumin'in inhibitör gücü Curcumin's inhibitör gücü yazılım (örneğin, AutoDock Vina sürüm 1.1.2) ile silico yerleştirme simülasyonu kullanılarak tahmin edildi. 29 Farklı GST isoformları (yani GSTA1, GSTM1 ve GSTP1) ve curcumin arasındaki serbest bağlama enerjisi tahmin edildi (veriler gösterilmedi). Daha sonra, inhibisyon sabiti Ki Denklemi 3kullanılarak hesaplandı .
Denklem 3: <img alt="Equation 3" src="/files/ftp_upload/61347/61347equ03v2.jpg"> ∆G silico analizi kullanılarak bulunan serbest bağlayıcı enerji, R gaz sabiti 1.987 cal*K-1*mol-1, ve T deney sırasında sıcaklık, Kelvin bu durumda (298 K).
AutoDock Vina tarafından döndürülen serbest bağlayıcı enerji sonuçlarına dayanarak, curcumin sırasıyla 78.1 μM, 78.1 μM ve 27.4 μMK değerleri ile insan GSTA1, GSTM1 ve GSTP1 güçlü bir GST inhibitörüdür. İlk inhibitör tahliller bu hesaplamalı Ki tahminleri kullanılarak yapıldı ve konsantrasyonlar gerekirse sonuçlara göre ayarlandı.
İlk olarak, IC50 tahmin edildi. Bu özellik, bir enzimin reaksiyon oranını P azaltan inhibitörükonsantrasyonudur. Bu nedenle enzim konsantrasyonu bağlıdır30. Inhibitörün dokuz son konsantrasyonu hazırlandı, 0.39 μM ile 100 μM arasında değişen ve her konsantrasyon bir öncekinin iki katıydı. Tahlil çözeltisi 20 μL GSH 2.5 mM, at karaciğerinden 0.01 U/mL finalinde 2 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 000 g/L ve 148 μL PBS'den oluşuyordu. Kontrol curcumin için kullanılan dilüent ile aynı çözeltiden oluşuyordu. Bu karışım enzim tsay başlatmak ve bu bileşik tampon çözeltileri kararsız olduğu gibi, gut çözeltisi kurkumin bozulmasını önlemek için 15 dakika kuluçka oldu31. Daha sonra, 0,2 mM CDNB'lik son konsantrasyon için her kuyuya 4 mM'lik 10 μL CDNB çözeltisi eklendi. 340 nm'deki absorbans, dakika başına absorbance'daki değişiklikleri hesaplamak için her dakika 10 dakika boyunca kaydedildi. IC50'yi hesaplamak için, kurkumin ile kuluçkaya yatan her örnek, aktivite yüzdesini vermek için kontrole normalleştirildi. Bu sonuçlar, inhibitörün logaritmik konsantrasyonunun inhibisyona karşı doğrusal olmayan regresyonu hesaplanarak çizim yazılımı kullanılarak analiz edilmiştir. At karaciğerinden GST'de kurkumin için bulunan IC50 31,6 ± 3,6 μM(Şekil 3A)idi.
Aynı deney pozitif kontrol olarak etakrinik asit kullanılarak paralel olarak, 0.39 ile 100 μM arasında değişen konsantrasyonlar ile, kurkumin ile birlikte yapılmıştır. IC50'nin 6.6 ± 1.1 μM(Şekil 3B)olduğu bulunmuştur.
Bir sonraki adım, curcumin'in bu transferler üzerindeki inhibisyon modunu değerlendirmekti. Dört farklı curcumin konsantrasyonu test edildi: 0, 7.5, 15 ve 30 μM, cdnb dört farklı konsantrasyonları ile birlikte: 0.2, 0.4, 1, ve 1.5 mM. Protokol önceki denemeyle aynıydı. Her koşulun hızı Denklem 2kullanılarak hesaplanmıştır. Her inhibitör konsantrasyonu için, substrat konsantrasyonuna (mM) karşı hız (μM/dk) ile bir eğri çizildi (Şekil 3C). Vmax ve Km GraphPad Prizma ile her arsa dayalı olarak belirlenmiştir. Potansiyel inhibitörün inhibisyon şekli bu iki parametredeki değişikliklere ve tahlillerin farklı durumuna göre değerlendirildi. 24 Vmax koşullar arasında önemli ölçüde değişmedi ama Km farklı inhibitör konsantrasyonları ile arttı, GSTs curcumin inhibisyonu rekabetçi. İnhibisyon Bu desen inhibitör enzimin aktif site için substrat ile rekabet oluşur. Rekabetçi bir inhibitörün Ki ölçmek için, GraphPad Copeland ve ark.32tarafından açıklandığı gibi Denklem 4 ve Denklem 5 kullanır. Denklem 4: <img alt="Equation 4" src="/files/ftp_upload/61347/61347equ04v2.jpg"> Denklem 5: <img alt="Equation 5" src="/files/ftp_upload/61347/61347equ05v2.jpg"> Km obs gözlenen Michaelis-Menten sabit, Km michaelis-Menten kontrolün sabiti, [I] inhibitör konsantrasyonu, Ki inhibisyon sabiti, Y hız ve X substrat konsantrasyonudur.
Hesaplamalar, inhibisyon modunun değerlendirilmesi ile aynı deneylere dayanmaktadır. Ki at karaciğerinden GST curcumin inhibisyonu için tahmin 23.2 ± 3.2 μM oldu.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61347/61347fig01.jpg"> Şekil 1: GST enzimatiği ve inhibisyonu tahlillerinin adımlarını açıklayan akış şeması. Yordam la ilgili ayrıntılar protokol bölümünde sunulur. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61347/61347fig01large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61347/61347fig02.jpg"> Şekil 2: GST enzim aktivitesinin Michaelis-Menten çizimi. Substrat CDNB artan konsantrasyonu at karaciğergst bir havuzdan GST aktivitesini belirlemek için GSH sabit konsantrasyonu (2.5 mM) ile kullanılmıştır. CDNB için Km değeri grafiğin eğrisine göre 0,08 mM ± 0,08 mM olarak belirlenmiştir. Çizimdeki her veri noktası, SD ile dört farklı deneysel çalıştırmanın ortalamasını temsil <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61347/61347fig02large.jpg" target="_blank">eder.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/61347/61347fig03.jpg"> Şekil 3: Kurkumin ve etakriyonik asitin GST enzim aktivitesi üzerine etkisi. (A-B) Aynı GST (0,01 U/mL), GSH (2,5 mM) ve CDNB (0,2 mM) son konsantrasyonları doğrusal olmayan bir regresyon ile at karaciğerinden GST için her iki bileşiğin IC50'sini hesaplamak için kurkumin(A)veya pozitif kontrol etakriyonik asit(B)konsantrasyonlarının artması kullanıldı. IC50, kurkumin için 31,6 ± 3,6 μM, etakrinik asit için 6,6 ± 1,1 μM olarak belirlendi. (C) Michaelis-Menten farklı konsantrasyonlarda curcumin, CDNB substrat değişen konsantrasyonlarda inhibisyon rekabetçi bir modu gösteren karşı test. İnhibitör süzgeci olmadan Vmax ve Km sırasıyla 132,7 ± 4,6 μM ve 0,5 ± 0,08 μM olarak ölçüldü. 30 μM curcumin ile, Vmax ve Km 130.4 ± 13.1 μM ve 1.08 ± 0.39 μM. Tüm grafiklerdeki veri noktaları(A-C)SD ile üç farklı deneysel çalıştırmanın aracını temsil <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/61347/61347fig03large.jpg" target="_blank">eder.</a>

Glutatyon S-transferazlar (GSTs) çok sayıda kemoterapötik ilaçların metabolizmasında rol oynayan detoksifikasyon enzimleridir. GST'lerin aşırı ekspresyonu kanser kemoterapi direnci ile ilişkilidir. Bu fenotip karşı bir yolu inhibitörleri kullanmaktır. Bu protokol, potansiyel GST inhibitörlerini taramak için spektrofotometrik bir test kullanarak bir yöntem tanımlar.

Sitosolion Glutatyon S-Transferazlarının Potansiyel Inhibitörleri için Spektrofotometrik Tarama

Glutathione S-transferases (GSTs) are metabolic enzymes responsible for the elimination of endogenous or exogenous electrophilic compounds by glutathione ...

Glutatyon S-transferazları, GST'ler, hücre içi elektrofilik bileşikleri bozan ve apoptoz iskende yer alan MAP kinazlarla etkileşime giren metabolik enzimlerdir. GST ifade bu iki rol ilaç direnci ile ilişkili olduğu için, bu sorunu karşı koymak için bir çözüm enzimatik inhibitörleri kullanmaktır. Bu protokolle, bu tür molekülleri test etmenin bir yolunu sağlıyoruz.Bu yöntem, enzim-bileşiğin etkileşimini incelemek için hızlı ve kolay bir yöntem kullanmak isteyen GST inhibitörleri alanında yeni olan herkese yöneliktir. Ayrıca bir inhibitörün iki özelliğini, inhibitör konsantrasyonu 50, IC50'yi ve inhibisyon sabitini belirlemek için gerekli adımları Ki.As, farklı biyolojik sonuçları olan önemli bir özellik olan inhibisyon modunu tanımlama tekniğini iyi tanımladık. İlk adım birim başına çözüm GST enzimatik aktivitesini belirlemektir.Mil başına bir birim dakikada bir mikromolar ürün sentezlemek için gerekli enzim hacmidir. Enzim çözeltisinin protein konsantrasyonuna göre ölçün. Kolaylığınıza göre tekniği seçin.Protein çözeltisini, sudaki mil başına 0,02 miligramlık son konsantrasyona seyreltin. Enzimatik çözeltiyi buzda tutun. Reaksiyonu 96 kuyulu bir plakayla hazırlayın.Boş kuyular için 20 mikrolitre su ekleyin. Test kuyuları için enzimatik çözeltinin 20 mikrolitresini ekleyin. 20 mikrolitre GSH ekleyin.PBS 150 mikrolitre ekleyin. Her kuyuya 50 milimolar cdnb 10 mikrolitre ekleyin. Plakayı bir çalkalayıcının üzerine birkaç saniye karıştırın.Spektrofotometrik plaka okuyucu ile emiciliği dakikada 340 nanometre ile 10 dakika boyunca kaydedin. Sonuçları elektronik tabloda ve özel bir yazılımla analiz edin. Elde edilen sonuçlara göre, su mil başına 0,1 birim bir GST stok çözeltisi hazırlayın.200 mikrolitrelik son hacimde %95 etanolde 20 kez altı farklı CDNB konsantrasyonu hazırlayın. Her kuyuya 25 milimolar'da 20 mikrolitre GSH ekleyin. Test kuyularına, mil başına 0,1 birim gst 20 mikrolitre ekleyin.Boş kuyulara 20 mikrolitre su ekleyin. Her kuyuya 150 mikrolitre PBS ekleyin. Test kuyuları ve boş kuyular için, ilgili CDNB çözeltisinin 10 mikrolitreekleyin.CDNB'nin her konsantrasyonunun belirli bir boşa ihtiyacı vardır. Birkaç saniye için bir shaker üzerinde içerik karıştırın, 10 dakika boyunca her dakika 340 nanometre de emici kayıt. Sonuçları özel bir yazılımla analiz edin.Bir Michaelis-Menten arsa çizerek Km belirleyin. Sonuçlara göre, %95 etanolde elde edilen Km'nin 20 katı cdnb çözeltisi hazırlayın. Inhibitör çözeltiyi gerekli konsantrasyona seyreltin.96-iyi plaka, potansiyel GST inhibitörü iki mikrolitre ekleyin. Boş kuyulara iki mikrolitre dilüent ekleyin. Her kuyuya 25 milimolar'da 20 mikrolitre GSH ve 168 mikrolitre PBS ekleyin.CdNB 10 mikrolitre ekleyin 20 kez Km önceki adımda bulundu. Plakayı bir çalkalayıcının üzerine birkaç saniye karıştırın. Emiciliği dakikada 340 nanometre de 10 dakika boyunca kaydedin.Sonuçları özel bir yazılımla analiz edin. Sonuçlara göre, aynı boş her GST inhibitörü için kullanılabilir veya ayarlanmalıdır. Test edilmiş GST inhibitörüdokuz konsantrasyonları hazırlayın.148 mikrolitre PBS ve 20 mikrolitre GSH'den oluşan deneme çözümünün 25 nanomolar'da tek bir reaksiyon için hazırlanın. Çözeltiyi iyice karıştırın. Test kuyuları için iki mikrolitre GST inhibitörü, 20 mikrolitre GST, mil başına 0,1 birim ve 168 mikrolitre test çözeltisi ekleyin.Kontrol kuyuları için, GST inhibitörü için kullanılan iki mikrolitre, mil başına 0,1 birim GST 20 mikrolitre ve 168 mikrolitre istiğar çözeltisi ekleyin. Boş kuyular için, GST inhibitörü için kullanılan iki mikrolitre dilüent, 20 mikrolitre su ve 168 mikrolitre istiğar çözeltisi ekleyin. Boş da dahil olmak üzere her kuyu için 10 mikrolitre CDNB çözeltisi ekleyin.Birkaç saniye çalkalayıcı üzerinde karıştırın. Emiciliği dakikada 340 nanometre de 10 dakika boyunca kaydedin. IC50'yi özel bir yazılımla hesaplayın.Protokolde açıklandığı gibi farklı konsantrasyonlarda dört CDNB çözeltisi hazırlayın. Protokolde açıklandığı gibi farklı konsantrasyonlarda üç GST inhibitörü çözeltisi hazırlayın. 148 mikrolitre PBS ve 20 mikrolitre GSH içeren enzimatik solüsyonları 25 milimolar'da tek bir reaksiyon için hazırlayın.Kontrol kuyuları için, GST inhibitörü için kullanılan dilüent iki mikrolitre ekleyin. Ve test ve boş kuyular için, doğru GST inhibitörü çözeltisinin iki mikrolitresi. Birkaç saniye karıştırın.Her kuyuya enzimatik çözeltinin 168 mikrolitresini ekleyin. Her bir kuyuya ilgili CDNB konsantrasyonlarından 10 mikrolitre ekleyin. Birkaç saniye karıştırın, sonra 10 dakika boyunca her dakika 340 nanometre de emici kaydedin.GST inhibitörü üç farklı konsantrasyonları boyunca CDNB dört farklı konsantrasyonları kullanmak için aynı kaplama deseni kullanarak deneyi tekrarlayın. İnhibisyon modunu belirlemek için özel bir yazılım ile sonuçları analiz, yanı sıra Ki.This protokolü curcumin, antikanser özellikleri olan bir molekül uygulandı. Bu bileşik, birkaç GST isoforms için bağlayıcı yakınlık hesaplamalı tahminler tarafından seçildi.Buna paralel olarak, aynı deneyler etakiyonik asit üzerinde yapılmıştır, pozitif kontrol olarak laboratuvar ortamında en yaygın olarak kullanılan GST inhibitörü. Inhibitör potens at karaciğerGTs bir havuz üzerinde test edildi ve seçim herhangi bir GST izoforms uygulanabilir. IC 50 yanı sıra inhibisyon türü ve Ki belirlendi.En iyi titre koşullarını sağlamak için, ilk olarak Michaelis-Menten sabiti, Km substrat CDNB ile gst havuzu belirlendi. Km substrat ve enzim arasındaki yakınlığı temsil eder. Bu değerin belirlenmesi kompozisyon için doymak bilmeyen bir konsantrasyon kullanmak için çok önemlidir.Aslında, iki yüksek konsantrasyonları rekabetçi inhibitörleri dezavantaj olabilir, çok az miktarda tespit edilemez ise. Bu konuda daha fazla bilgi için lütfen metinlere bakın. Bu deney için, gsh ve GST enzimlerinin sabit konsantrasyonu ile altı farklı CDNB konsantrasyonu kullanıldı.Michaelis-Menten grafiği, X ekseninde milimolar içindeki substrat konsantrasyonları ve Y ekseninde dakikada milimolar içindeki hızın çizilmesiyle elde edilmiştir. Reaksiyonun hızı birinci denklemle hesaplandı. Km yarım Vmax olarak belirlenir, eşledik oluşumu bir plato elde etmek için substrat ile çözelti doygunluğu sonra elde edilen bir değer.Test edilen GST enzimatik çözeltisi için CDNB km özel bir yazılım ile hesaplamalar dayalı 0,26 milimolar olarak belirlenmiştir. IC50, enzim aktivitesini yarı yarıya inhibe etmek için gereken maddenin konsantrasyonu olarak tanımlanır. IC50, GST inhibitörülogunun logaritmik konsantrasyonunun X ekseninde çizildiği ve Y eksenindeki GST aktivitesinin yüzdesi ile doğrusal olmayan bir regresyon grafiği kullanılarak tahmin edilmiştir.Dokuz farklı inhibitör konsantrasyonu kullanıldı. GST etkinliği birinci denklemin uygulanması ile belirlenmiştir. Sonuçlar hiçbir inhibitör ile kontrol kullanılarak normale döndü.Curcumin suda kötü çözünür. Böylece daha yüksek konsantrasyonlarda kullanımı mümkün değildi, bu da maksimum inhibisyon elde etmeyi zorlaştırdı. Yine de, özel bir yazılım 31,4 mikromolar değerinde GST bu havuz için müfredat IC50 tahmin başardı.Buna paralel olarak, aynı deney pozitif kontrol olarak etakronik asit ile yapılmıştır. Beklendiği gibi, bu molekül 6.7 mikromolar bir IC50 ile bir GST inhibitörü olarak doğrulandı. Bu sonuçlar kurkumin inyanıküzere mikromolar aralığında bir IC50 ile bir GST inhibitörü olduğunu doğruladı, etacrynic asit benzer.Bir GST inhibitörü olarak ayrıntılı curcumin çalışmak için, inhibisyon türü, hem de inhibisyon sabiti, Ki, belirlendi. İlk olarak, inhibisyon türü Michaelis-Menten grafikleri ile değerlendirildi. GST inhibitörü konsantrasyonları artarken substrat CDNB farklı konsantrasyonlarda kullanarak, Kms önemli ölçüde curcumin konsantrasyonları ile korelasyon arttı Vmax değişen koşullara rağmen değişmeden kaldı.Bu inhibisyon modu, rekabetçi bir inhibisyon modunun tipik bir nedenidir. Diğer engelleme türleri hakkında daha fazla bilgi için lütfen metne bakın. Ki buna göre curcumin 23.3 mikromolar değeri sağlayan, aynı veri seti kullanılarak inhibisyon türüne göre hesaplanmıştır.Açıklanan yöntemler, doğru ve tekrarlanabilir sonuçlar sağlamak için belirli adımlarla dikkatlilik gerektiren temel enzimatik denemelerdir. Michaelis-Menten sabit km belirlenmesi, enzim için substrat yakınlık gösteren önemli adımlardan biridir. Aslında, substrat konsantrasyonu çok yüksek veya çok düşük olduğunda, inhibisyon doğru modu belirlemek zor hale getirir ve Ki doğru hesaplanmaz.Bu prosedür insan rekombinant GST'ler uygulanabilir, örnek OLARAK GSTA1 ve P1 biri, ilaç direncini azaltmak için elektrofilik ajanlar ile birlikte kullanılacak potansiyeli değerlendirmek için hücre kültürü çalışmalarında kullanılır.

spectrophotometric-screening-for-potential-inhibitors-cytosolic

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biyokimya

Bu videoda, boncuk tabanlı bir yakınlık testi olan güçlendirilmiş ışıldayan yakınlık homojen testini gösteriyoruz. Protein etkileşimlerini inhibe eden potansiyel küçük molekülleri taramak için etkileşime girme eğiliminde olan iki protein ile hareketsiz hale getirilmiş, homojen boyutta alıcı ve verici boncuklar kullanır.

Amplifiye Lüminesan Yakınlık Homojen Deneyi: Protein-Protein Etkileşimlerini İnhibe Eden Küçük Molekülleri Taramak için Boncuk Tabanlı Bir Yakınlık Testi

Membran kaçakçılığı, proteinlerin plazma zarından hücre içine taşınmasını (yani endositoz) ve ardından bozunma için lizozomlara veya geri dönüşüm için plazma zarına kaçakçılığı içerir. Bu makalede açıklanan yöntemler, endositoz ve plazma zarı proteinlerinin geri dönüşümünü incelemek için tasarlanmıştır.

Plazma Zarı Proteinlerinin Endositozu ve Geri Dönüşümünü İncelemek için Hücre Bazlı L-Glutatyon Koruma Testleri

In vitro sistemlerin Metabolik yetkinlik ilaç ve toksik maddelerin biyotransformasyonu ve dışa atılması için önemli bir gereksinimdir. Bu protokol, biz Hücre kültürlerinde metabolizma faz değerlendirmek için referans metabolik sondaları uygulanmasını açıklar.

Kütle Spektrometre ve lüminojenik tabanlı Yaklaşımlar Faz I Metabolik Yetkinlik ait Characterize<em&gt; İn Vitro</em&gt; Hücre Kültürleri

Bu el yazması oksidatif stres xenobiotic kaynaklı incelenmesi için genetik olarak kodlanmış fluorogenic gazetecilere canlı hücre görüntüleme bir uygulamada kullanımını açıklar. Bu deneysel yaklaşım eşsiz kronolojik zamanmekansal çözünürlük, duyarlılık ve özgüllük eksiklikleri toksikolojik oksidatif stres tespiti için kullanılan geleneksel yöntemlerden birçoğu kaçınırken sunmaktadır.

Genetik olarak kodlanmış Fluorogenic sensörleri kullanarak toksikolojik oksidatif stres ilişkin Değerlendirmeler yaklaşımlar görüntüleme

DNA metiltransferazlar potansiyel kanser ilaç hedefleridir. Burada, DNA metiltransferaz inhibisyonu için küçük molekülleri değerlendirmek için bir protokol sunulmaktadır. Bu tahlil, DNA metilasyonunu floresan üretimine bağlamak için bir endonükleaz kullanır ve enzim aktivitesinin gerçek zamanlı olarak izlenmesini sağlar.

DNA Metiltransferaz İnhibitörlerini Taramak için Sürekli Floresan Bazlı Endonükleaz Bağlantılı DNA Metilasyon Testi

Bu yazıda, neotropikal anuran türlerinde biyobelirteçlerin değerlendirilmesi için standartlaştırılmış ekotoksikolojik yöntemler sunulmuştur. Spesifik olarak, bu makale genetik, hücresel-histolojik, biyokimyasal, morfolojik ve bireysel seviyeler gibi farklı ekotoksikolojik değerlendirme ölçeklerinde çeşitli metodolojileri detaylandırmaktadır.

Neotropik Anuranlarda Biyobelirteçleri Farklı Ölçeklerde Değerlendirmek için Ekotoksikolojik Metodolojiler

Burada, yarı otomatik, yüksek verimli bir tarama formatında lusiferaz bazlı bir raportör testinin kullanımı için ayrıntılı bir protokol açıklıyoruz.

Otofaji ile İlişkili 4B Sistein Peptidaz İnhibitörleri için Hücre Bazlı İlaç Taraması

Hem oksitlenmiş hem de indirgenmiş glutatyon formlarının (sırasıyla GSSG ve GSH) miktar tayini, Orto-ftalaldehit (OPA) kullanılarak elde edilmiştir. OPA, GSH'ye konjuge edildiğinde yüksek oranda floresan hale gelir, ancak indirgenene kadar GSSG'yi konjuge edemez. Burada, normalizasyon için protein miktar tayini kullanarak her ikisini de ölçmek için multiparametrik bir tahlili açıklıyoruz.

İn Vitro Kültürlenmiş Memeli Hücrelerinde Orto-ftalaldehit Kullanılarak Oksitlenmiş ve İndirgenmiş Glutatyon Formlarının Hızlı Miktar Tayini

Kantitatif geri dönüşümsüz bağlama (qIT) testi, bir hedef proteinle seçici olarak etkileşime giren kovalent fragmanları tanımlamak için floresan tabanlı bir yöntemdir. Burada, qIT testini tanımlamak için örnek sonuçlar dahil olmak üzere ayrıntılı bir protokol özetlenmiştir.

Kantitatif Tersinmez Tethering Testi Kullanılarak Kovalent Fragman Taraması

Bu protokol, protein sentezinin doğal ürün/küçük molekül inhibitörlerini belirlemek için optimize edilmiş bir florometrik tarama metodolojisi tanıtmaktadır. Pratikliği, hem ilaç keşif teknikleri lisans eğitimi için hem de tıbbi kimya kampanyalarında uygulanması için uygun hale getirir.

Doğal Kaynaklardan Protein Sentezi İnhibitörlerinin Ön Taraması için Flüoresans Tabanlı Protokol

Öğrenin, sitozolik GST inhibitörlerini spektrofotometrik yöntemle taramayı. Bu protokol, kanser kemoterapi direncini tersine çevirmek için IC50 ve Ki değerlerinin belirlenmesini sağlar.

Sitosolion Glutatyon S-Transferazlarının Potansiyel Inhibitörleri için Spektrofotometrik Tarama

Daha fazla video keşfet