-1::1
Simple Hit Counter
Skip to content

Products

Solutions

×
×
Sign In

TR

EN - EnglishCN - 简体中文DE - DeutschES - EspañolKR - 한국어IT - ItalianoFR - FrançaisPT - Português do BrasilPL - PolskiHE - עִבְרִיתRU - РусскийJA - 日本語TR - TürkçeAR - العربية
Sign In Start Free Trial

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
View All
JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

Biological Techniques
Biology
Cancer Research
Immunology
Neuroscience
Microbiology
JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduate courses

Analytical Chemistry
Anatomy and Physiology
Biology
Calculus
Cell Biology
Chemistry
Civil Engineering
Electrical Engineering
View All
JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

Advanced Biology
Basic Biology
Chemistry
View All
JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

Biology
Chemistry

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

Accounting
Finance
Macroeconomics
Marketing
Microeconomics

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Authors

Teaching Faculty

Librarians

K12 Schools

Biopharma

Products

RESEARCH

JoVE Journal

Peer reviewed scientific video journal

JoVE Encyclopedia of Experiments

Video encyclopedia of advanced research methods

JoVE Visualize

Visualizing science through experiment videos

EDUCATION

JoVE Core

Video textbooks for undergraduates

JoVE Science Education

Visual demonstrations of key scientific experiments

JoVE Lab Manual

Videos of experiments for undergraduate lab courses

BUSINESS

JoVE Business

Video textbooks for business education

OTHERS

JoVE Quiz

Interactive video based quizzes for formative assessments

Solutions

Authors
Teaching Faculty
Librarians
K12 Schools
Biopharma

Language

tr_TR

EN

English

CN

简体中文

DE

Deutsch

ES

Español

KR

한국어

IT

Italiano

FR

Français

PT

Português do Brasil

PL

Polski

HE

עִבְרִית

RU

Русский

JA

日本語

TR

Türkçe

AR

العربية

    Menu

    JoVE Journal

    Behavior

    Biochemistry

    Bioengineering

    Biology

    Cancer Research

    Chemistry

    Developmental Biology

    Engineering

    Environment

    Genetics

    Immunology and Infection

    Medicine

    Neuroscience

    Menu

    JoVE Encyclopedia of Experiments

    Biological Techniques

    Biology

    Cancer Research

    Immunology

    Neuroscience

    Microbiology

    Menu

    JoVE Core

    Analytical Chemistry

    Anatomy and Physiology

    Biology

    Calculus

    Cell Biology

    Chemistry

    Civil Engineering

    Electrical Engineering

    Introduction to Psychology

    Mechanical Engineering

    Medical-Surgical Nursing

    View All

    Menu

    JoVE Science Education

    Advanced Biology

    Basic Biology

    Chemistry

    Clinical Skills

    Engineering

    Environmental Sciences

    Physics

    Psychology

    View All

    Menu

    JoVE Lab Manual

    Biology

    Chemistry

    Menu

    JoVE Business

    Accounting

    Finance

    Macroeconomics

    Marketing

    Microeconomics

Start Free Trial
Loading...
Home
JoVE Journal
Biology
Büyüme ve Gen İfadesinde Heterojenliği Ölçmek için Mikrokolonların Yüksek Verimli Canlı Görüntüle...
Büyüme ve Gen İfadesinde Heterojenliği Ölçmek için Mikrokolonların Yüksek Verimli Canlı Görüntüle...
JoVE Journal
Biology
Author Produced
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
High-Throughput Live Imaging of Microcolonies to Measure Heterogeneity in Growth and Gene Expression

Büyüme ve Gen İfadesinde Heterojenliği Ölçmek için Mikrokolonların Yüksek Verimli Canlı Görüntülemesi

Full Text
5,507 Views
12:52 min
April 18, 2021

DOI: 10.3791/62038-v

Federica M. O. Sartori1, Cassandra Buzby1, Yevgeniy Plavskin1, Mark L. Siegal1

1Center for Genomics and Systems Biology, Department of Biology,New York University

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This study presents a protocol for high-throughput imaging of yeast growth phenotypes through tracking thousands of microcolonies. The research focuses on understanding how genetic and environmental factors influence stress tolerance and gene expression in isogenic cells.

Key Study Components

Research Area

  • Cell biology
  • Genetics
  • Microscopy

Background

  • Yeast is used as a model organism to study cell growth and behavior.
  • The approach allows for quantification of differences across strains and environments.
  • The integration of growth and expression data offers insights into gene expression heterogeneity.

Methods Used

  • High-throughput imaging and time-lapse analysis
  • Yeast cells as the biological system
  • Fluorescence intensity measurement and precise dilution techniques

Main Results

  • Effective tracking of yeast growth rates and protein expression.
  • Detection of variations in growth and expression across genetically identical cells.
  • Validated estimates of growth distributions and gene expression values.

Conclusions

  • This study demonstrates a reliable method for assessing yeast cell growth under various conditions.
  • The findings have significant implications for research in cell biology and genetics.

Frequently Asked Questions

What are the main advantages of this high-throughput protocol?
The protocol allows for simultaneous analysis of thousands of microcolonies, providing detailed insights into growth dynamics and gene expression variability.
How does this method impact future research in yeast biology?
By enabling precise quantification of growth and protein localization, this method can inform genetic studies and environmental response assessments in yeast.
Are there specific strains of yeast used in this study?
Yes, the protocol is adaptable for different yeast strains depending on the experimental requirements.
What role does Concanavalin A play in the experimental setup?
Concanavalin A is used to facilitate proper adhesion of yeast cells to the microwell plate for effective imaging.
Can this method be applied to other organisms?
While optimized for yeast, the imaging and analysis techniques may be adapted for other cell types with modifications.
What precautions should be taken during the experimental procedure?
It is essential to maintain sterile conditions and ensure thorough mixing to prevent contamination and ensure accurate results.
How is the data from this study useful in a broader context?
The integrated datasets can help elucidate fundamental principles of growth regulation and gene expression, benefiting multiple areas of biological research.

Maya büyüme fenotipleri, mikrokolonlara dönüşen hareketsiz hücrelerin son derece paralel zaman atlamalı görüntülemesi ile tam olarak ölçülür. Aynı zamanda, stres toleransı, protein ekspresyasyonu ve protein lokalizasyonu izlenebilir, çevresel ve genetik farklılıkların yanı sıra izojenik hücreler arasındaki gen ekspresyon heterojenliğinin büyümeyi nasıl modüle ettiğini incelemek için entegre veri kümeleri üretilebilir.

Yüksek verim, maya hücreleri için protokolümüz, aynı anda binlerce mikrokolon için büyüme ve gen ekspresyonunun izlenmesini sağlar. Suşlar arasındaki, ortamlar arasındaki ve hatta paylaşılan bir ortamda yetişen genetik olarak özdeş hücreler arasındaki fark ölçülebilir. Protokol, gen ekspresyon muhabirlerinin ortalama büyüme hızı ve ortalama floresan yoğunluğu hakkında kesin tahminler sürmektedir.

Ek olarak, birçok bireysel mikrokolonya test edildiği için, büyüme ve ifade değerlerinin tüm dağılımlarının kesin tahminleri elde edilir. Bu protokol, deneysel plakanın hazırlanması ve hücrelerin görüntüleme için hazırlanması olmak üzere iki ana adımı izler. Hücreler seyreltme ve karıştırmadan hemen sonra kaplanmalıdır.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Sign In Start Free Trial

Explore More Videos

Biyoloji Sayı 170 büyüme hızı Saccharomyces cerevisiae nongenetik heterojenlik yüksek verimli mikroskopi doğal varyasyon

Related Videos

Canlı Hücre Görüntüleme Bacillus subtilis Ve Streptococcus pneumoniae Otomatik Zaman atlamalı Mikroskopi

07:31

Canlı Hücre Görüntüleme Bacillus subtilis Ve Streptococcus pneumoniae Otomatik Zaman atlamalı Mikroskopi

Related Videos

43.5K Views

Gen Yönetmelik Tek molekül Görüntüleme In vivo Dilinim tarafından Cotranslational Aktivasyon (CoTrAC) kullanma

11:31

Gen Yönetmelik Tek molekül Görüntüleme In vivo Dilinim tarafından Cotranslational Aktivasyon (CoTrAC) kullanma

Related Videos

10.3K Views

ScanLag: Yüksek verim Colony Büyüme niceliksel ve Zaman Lag

07:47

ScanLag: Yüksek verim Colony Büyüme niceliksel ve Zaman Lag

Related Videos

16.9K Views

Yüzey koloniler Mikrobiyal Populasyonlarında Mekansal Ayrışma İzleme

07:40

Yüzey koloniler Mikrobiyal Populasyonlarında Mekansal Ayrışma İzleme

Related Videos

11.7K Views

Bakteriyel büyüme kesin, yüksek üretilen iş analizi

09:00

Bakteriyel büyüme kesin, yüksek üretilen iş analizi

Related Videos

25.1K Views

Ince katman Kromatografi takip Escherichia coli (p) ppGpp çoklu In vivo ölçümleri Için mikrotiter bulaşık Radiolabeling kullanma

06:30

Ince katman Kromatografi takip Escherichia coli (p) ppGpp çoklu In vivo ölçümleri Için mikrotiter bulaşık Radiolabeling kullanma

Related Videos

6.5K Views

Bakterilerde Hücre Altı Protein Lokalizasyonu ve Hücre Morfolojisi Değişikliklerini Araştırmak Için Canlı Hücre Floresan Mikroskobu

05:57

Bakterilerde Hücre Altı Protein Lokalizasyonu ve Hücre Morfolojisi Değişikliklerini Araştırmak Için Canlı Hücre Floresan Mikroskobu

Related Videos

7.9K Views

Tek Hücreli Türler Arası Bakteri Etkileşimlerinin Kinetik Görselleştirilmesi

08:33

Tek Hücreli Türler Arası Bakteri Etkileşimlerinin Kinetik Görselleştirilmesi

Related Videos

7.6K Views

Hızlı ve Nicel Intravital Chick Chorioallantoic Membran Modeli Kullanılarak Metastatik Regülatörlerin Keşfi

07:03

Hızlı ve Nicel Intravital Chick Chorioallantoic Membran Modeli Kullanılarak Metastatik Regülatörlerin Keşfi

Related Videos

3.1K Views

Drosophila Mikrobiyomuna Uygulanan 96 Delikli Plaka Formatında Hızlı Koloni Oluşturma Birimi Sayımı

12:55

Drosophila Mikrobiyomuna Uygulanan 96 Delikli Plaka Formatında Hızlı Koloni Oluşturma Birimi Sayımı

Related Videos

8.6K Views

JoVE logo
Contact Us Recommend to Library
Research
  • JoVE Journal
  • JoVE Encyclopedia of Experiments
  • JoVE Visualize
Business
  • JoVE Business
Education
  • JoVE Core
  • JoVE Science Education
  • JoVE Lab Manual
  • JoVE Quizzes
Solutions
  • Authors
  • Teaching Faculty
  • Librarians
  • K12 Schools
  • Biopharma
About JoVE
  • Overview
  • Leadership
Others
  • JoVE Newsletters
  • JoVE Help Center
  • Blogs
  • JoVE Newsroom
  • Site Maps
Contact Us Recommend to Library
JoVE logo

Copyright © 2026 MyJoVE Corporation. All rights reserved

Privacy Terms of Use Policies
WeChat QR code