Name: Podosit Proteinleri Nephrin, Actin ve Podocinin Genleşme Mikroskopisi ile Görüntülenmesi (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-04-23T14:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 18 s
Description: Öğrenin, genleşme mikroskopisi ile glomerüler proteinleri nanometre çözünürlüğünde görüntülemeyi. Bu yöntem, standart mikroskoplarla 70 nm çözünürlük sağlayarak araştırmacılara erişilebilir bir protokol sunar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Yazarlar Blanka Duvnjak ve Nikola Kuhr'a mükemmel teknik yardımları için teşekkür etmek istiyor.

1. Hücrelerin bölünmesi ve tohumlama
<ol><li>%10 fetal baldır serumu (FCS), steril Fosfat tamponlu salin (PBS) ve steril tripsin dahil olmak üzere steril Dulbecco Modifiye Eagle's Medium 'u (DMEM) 37 °C'ye ısıtın. Temiz bankı aktif hale getir.</li>
	<li>Steril tokmaklar kullanarak her kuyuya bir steril cam kapak kayması (10 mm) ekleyerek 6 kuyulu bir plaka hazırlayın.</li>
	<li>Temiz tezgahın altına Cos7 hücreli 10 cm hücre kültürü yemeği koyun. Temiz tezgahın altında, bir vakum cihazı kullanarak hücrelerin ortamını aspire edin.</li>
	<li>Angüle edilmiş hücre kültürü çanasını bir elinizde tutun ve hücrelerin durulamasını önlemek için hücre kültürü çanağının yanına 10 mL steril PBS ekleyin. PBS'nin tüm hücre kültürü çanasını durulaması için hücre kültürü çanasını yere koyun.</li>
	<li>PBS'yi çıkarın ve hücre kültürü çanağının ortasına 1 mL tripsin ekleyin ve 37 °C'de 5 dakika kuluçkaya yatırın.</li>
	<li>%10 FCS dahil olmak üzere 10 mL DMEM ekleyerek ve hücreleri manuel olarak ayırmak için bir pipetle hücre çözeltisini yukarı ve aşağı pipetle kapatarak trypnizasyon reaksiyonunu durdurun.</li>
	<li>Sayım odası kullanarak mililitre başına hücre numarasını analiz edin.</li>
	<li>Cam kapağın üzerine kuyu başına 2 mL ortamda 68.000 hücre tohumu 6 kuyu plakasında kayar. Plakayı yatay ve dikey olarak dikkatlice sallayarak hücreleri 6 kuyu plakası içinde dağıtın. NOT: Hücreler dağınık olarak uzanmalıdır.</li>
	<li>%5 CO2ile 37 °C inkübatörde hücreleri bir gecede kuluçkaya yatırın.</li>
</ol>2. Hücrelerin transeksiyon
<ol><li>İki steril 1,5 mL tüp hazırlayın (biri seyreltilmiş DNA (A) için ve diğeri katyonik lipid transfeksiyon (B) için seyreltilmiş reaktif için). Pipet 0.75 μg nefrin ve 0.75 μg podocin cDNA ekspresyon plazmid kuyu başına bir 1.5 mL tüp içine ve kuyu başına 100 μL azaltılmış serum ortamına seyreltin. İkinci 1,5 mL tüpe kuyu başına 3 μL katyonik lipid transfeksiyon reaktifi ekleyin ve 100 μL azaltılmış serum ortamı ile seyreltin. Her iki reaksiyona da oda sıcaklığında 5 dakika kuluçkaya yatır.</li>
	<li>Her iki reaksiyoni (A ve B) bir DNA lipit kompleksinde birleştirin ve oda sıcaklığında 20 dakika kuluçkaya yatır. Her kuyuya 200 μL DNA-lipit kompleksi ekleyin.</li>
	<li>Transfected hücreleri 37 °C'de, ortamı değiştirmeden 48 saat boyunca% 5 CO2 ile kuluçkaya yatırın.</li>
</ol>3. Hücresel yapıların immünoblabeling
<ol><li>Bir sabitleme çözeltisi (PBS'de %4 (w/v) paraformaldehit, 1 mL/kuyu), permeabilizasyon çözeltisi (PBS'de %0,5 (w/v) Triton X-100, 1 mL/well) ve bir engelleme çözeltisi (PBS'de %5 (v/v) sığır serum albümini, 1 mL/kuyu) hazırlayın.</li>
	<li>Ortamı bir vakum cihazıyla çıkarın. Ekstra ortamı çıkarmak için her kuyuya 2 mL PBS ekleyin. PBS'i tamamen aspire edin. NOT: Hücrelerin PBS ile yıkanmasını önlemek için, PBS'yi doğrudan cam kapak kaymasına değil pipetle yıkadığından emin olun.</li>
	<li>PBS'de çözünmüş %4 (w/v) paraformaldehit (PFA) içeren hücreleri oda sıcaklığında 10 dakika boyunca sabitlayın. NOT: Alternatif olarak, hücreleri% 3 (v / v) glioksial-etanol18'desabitler.</li>
	<li>Cam kapak kaymalarına doğrudan pipetlemekten kaçınarak PFA'yı atın ve hücreleri PBS'de iki kez (her biri 2 mL) yıkayın. Sabit hücreleri ODA sıcaklığında 10 dakika boyunca PBS'de Triton X-100%0,5 (w/v) ile permeabilize edin.</li>
	<li>Permeabilizasyon çözeltisini çıkarın ve adım 3.2'de belirtildiği gibi PBS ile iki kez yıkayın.</li>
	<li>PBS'de oda sıcaklığında 1 saat boyunca %5 (v/v) BSA'nın 1 mL'sini ekleyerek hücreleri engelleyin. Hücreleri 4 °C'de bir gecede birincil antikorun 200 μL'si (PBS'de % 1 (v/v) BSA'da 1:200 anti-podokin antikoru) ile kuluçkaya yatırın. NOT: Alternatif olarak, birincil antikoru oda sıcaklığında 1 saat kuluçkaya yatırın.</li>
	<li>Birincil antikoru çıkarın ve adım 3.2'de olduğu gibi PBS ile üç kez yıkayın. İkincil antikor (keçi anti-tavşan Alexa 488 1:1000 içinde 1% (v/v) BSA PBS) oda sıcaklığında 1 saat için ekleyin. Bir kutu kullanarak hücreleri karanlıkta tutun.</li>
	<li>İkincil antikorları atın ve PBS ile üç kez yıkayın.</li>
	<li>PBS'yi çıkarın ve hücreleri oda sıcaklığında 1 saat boyunca PBS'de% 1 (v/ v) BSA'da 1:100 μL anti-nefrin antikoru ile kuluçkaya yatırın. PBS ile üç kez yıkayın. Bir kutu kullanarak hücreleri karanlıkta tutun.</li>
	<li>PBS'yi çıkarın ve oda sıcaklığında 1 saat boyunca ikincil antikor eşek anti-gine domuzu 633, 1:200 ile kuluçkaya yatırın. PBS ile üç kez yıkayın. Bir kutu kullanarak hücreleri karanlıkta tutun.</li>
</ol>4. Genleşme mikroskopisi
<ol><li>Hazırlık
	<ol>
<li>Jelleşme odası için ara parçaları oluşturmak için, cam kapak kaymalarını #1.0 ve #1.5'i elmas bir bıçak kullanarak 5 mm çizgiler halinde (cam slayt başına dört) kesin. #1,5 mm kapak kayması şeritlerini cam bir kaydıraktan 2,5 cm uzunluğunda bir kare oluşturacak şekilde yerleştirin ve bir boyama odasınayerleştirin (Şekil 2A1-C1). Pipet bir damla ddH2O kare köşelerine cam kapak kayma şeritleri birbirine ve cam slayta yapışmak için (Şekil 2A2-C2). NOT: Yapışıklık kuvveti kaybolacağı için ddH2O'nun tamamen kurutılmasından kaçının. Gerekirse, daha fazla ddH2damlacık uygulayın #1.</li>
		<li>#1,5 mm kapak kaymalarına kapak kayması başına dört #1,0 cam kapak kayması şeridi yerleştirin. Her #1,5 mm kapak kayması şeridine bir damlacık pipet takarak şeritleri yapıştırın (Şekil 2A3-C3). NOT: Protokolün ilerlemesinde kullanımı kolaylaştırmak için jelin kalınlığı en az 0,15 mm olmalıdır. Bununla birlikte, hücrelerin üstünde aşırı jel olmasını önlemek için, aralayıcıların yüksekliğini hücre alt tabakasına yakın tutun. #1.5 ve #1.0 kapak kayması şeritlerini aralayıcı olarak kullanarak, ara uzayların yüksekliği yaklaşık 0,3 mm olacaktır. Hücreler kapak camına yapışır (yükseklik 0,12 mm). Bu nedenle, jel işlemek için yeterince kalın olacaktır, ancak #1.0 ve #1.5 kapak cam şeritleri aralayıcı olarak kullanılarak hücrelerin üstündeki aşırı jelden kaçınılır.</li>
		<li>Jelasyon odası kapağı için, bir kapak camını (#1,5) parafin filmi ile sarın. Parafin filmi üzerinde herhangi bir kıvrım veya kirden kaçının (Şekil 2A5-C5).</li>
	</ol></li>
	<li>Ankraj ve polimerizasyon (jelleşme)
	<ol>
<li>Bağlantı arabelleği hazırlayın (bkz. Tablo 1). Ankraj tedavisi için PBS'yi kuyu başına 250 μL ankraj tamponu ile doğrudan cam kapak kayması üzerine değiştirin ve oda sıcaklığında 3 saat kuluçkaya yatırın. Bir kutu kullanarak substratı karanlıkta tutun. NOT: Alternatif olarak, oda sıcaklığında gece boyunca kuluçkaya yatırın. Her deney için taze ankraj tamponu hazırlayın ve düzgün bir şekilde çözünene kadar 10-15 dakika bekleyin. 6-((Acryloyl)amino)heksanoik asit, süksinimimidyl ester (AcX) yeterli ankraj sağlamak için her 4-5 ayda bir değiştirilmelidir.</li>
		<li>Ankraj tamponu çıkarın ve kuyu başına 1,5 mL PBS ile bir kez yıkayın.</li>
		<li>Akrin liflerini lekelemek için ExM uyumlu bir phalloidin çözeltisini çözün ve phalloidini (PBS/kuyuda% 1 (v/v) BSA'nın 195 μL'sinde seyreltilmiş 5 μL phalloidin) oda sıcaklığında 45 dakika kuluçkaya yatırın. Bir kutu kullanarak örnekleri karanlıkta tutun.</li>
		<li>Bu arada, sodyum akrilatını karıştırma cihazı kullanarak ddH2O'da çözün. Buz üzerinde monomer çözeltisini hazırlayın (bkz. Tablo 1). NOT: Çözünmüş sodyum akrilat net ve renksiz bir çözelti olmalıdır. Çözelti sarı ise, yeni sodyum akrilit ile değiştirin.</li>
		<li>Jelleşme çözeltisini buz üzerinde hazırlayın (bkz. Tablo 1). Jelasyon çözeltisi jelleşme odasına uygulanmadan hemen önce jelleşme çözeltisine pipet amonyumperoksisidsülfat (APS).</li>
		<li>Phalloidin'i hücrelerden çıkarın ve oda sıcaklığında iki kez 1,5 mL PBS ile yıkayın. Numunenin cam kapak kayması üzerinde çıkarılmasını kolaylaştırmak için kuyunun içinde 1,5 mL PBS bırakın.</li>
		<li>Kapak camındaki hücreleri, kapak camı kaymasını 6 kuyulu plakadan kaldırmak için tokalar ve bir kanül kullanarak jelleşme odasına yerleştirin. NOT: Hücreler cam kapak kaymasının üstünde olmalıdır. Cam kapak kayması ara parçalarına dokunmamalıdır.</li>
		<li>Jelleşme çözeltisine aps ekleyin ve kısa süre içinde girdap. Pipet 200 μL jelleşme çözeltisi numune üzerinde (Şekil 2A4-C4). Jel içindeki hava kabarcıklarından kaçınarak jelleşme odasını dikkatlice kapatın (Şekil 2A5-C5).</li>
		<li>Jelleşme odasını ıslak boyama odasında polimerize etmek için 37 °C'de en az 1 saat kuluçkaya bırakın.</li>
	</ol></li>
	<li>Homojenizasyon (sindirim)
	<ol>
<li>Leke haznesini inkübatörden çıkar. Jelasyon odası kapağını açmak için, kapak ve aralayıcı arasına bir jilet takın. Kapağı dikkatlice çıkarın. Araları jiletle çıkarın ve jiletle keserek tüm ekstra jeli ortadan kaldırın.</li>
		<li>Jel ve kapak camı ile slaytı PBS ile dolu bir tabağa koyun. Hafifçe sallayarak, müstakil kapak camını jelden çıkarın. Jeli tabaktan kolayca çıkarmak için, jeli slayda tutturmak için jelin altına slaydı koyun.</li>
		<li>Jel slayttayken, jeli jilet kullanarak küçük parçalara bölün (jelin çeyreği iki ila üç parçaya ayrılır). Bir parça jeli cam tabanlı 6 kuyulu bir tabağa hafifçe itin ve bir boya fırçasıyla katlayın. Jelin susuz kalmasını önlemek için boya fırçasını kullanarak jeli biraz PBS ile nemlendirin. NOT: Hücreler aşağı doğru bakacaktır.</li>
		<li>Ters mikroskop kullanarak, genişletmeden sonra genişletme faktörünü belirlemek için düşük sayısal diyafram açıklığına sahip genel bakış görüntüleri alın.</li>
		<li>Sindirim arabelleği hazırlayın (bkz. Tablo 1). Sindirim çözeltisini almak için sindirim tamponunda Proteinaz K ila 4 U/mL seyreltin. NOT: Proteinaz K içermeyen sindirim tamponu 1-2 hafta boyunca 4 °C'de saklanabilir.</li>
		<li>Her kuyuya 500 μL sindirim çözeltisi ekleyin ve jeli çözeltinin içine daldırın. Oda sıcaklığında gece boyunca sindirin ve numuneleri karanlıkta tutarak kapağı kapatın. NOT: Alternatif olarak, 1 saat boyunca 37 °C'de sindirin.</li>
	</ol></li>
	<li>Genişleme
	<ol>
<li>Sindirim solüsyonunu bir pipetle çıkarın ve atın. 1 mL ddH2O ekleyin Daldırma jelini oda sıcaklığında 10 dakika kuluçkaya bırakın.</li>
		<li>Suyu çıkarın ve 1 mL taze ddH2O ekleyin. NOT: 4,5 kata kadar numune genişlemesi elde edilebilir. Jel optik olarak netleşir.</li>
	</ol></li>
	<li>Görüntüleme
	<ol>
<li>Suyu jelden çıkarın ve doğrudan mikroskopiye başlayın. Ters mikroskop kullanarak, öncelikle genişleme öncesi durumda görüntülenmiş hücreleri bulmak için bir hava hedefi (düşük büyütme) kullanın (adım 4.3.4).</li>
		<li>Daha iyi çözünürlük için 40x (yağ/su) ve 63x hedefe geçin. İlginin dalga boyu ile heyecanlandırın ve görüntüyü kamera üzerinden alın.</li>
	</ol></li>
	<li>Doğrulama
	<ol>
<li>Örneğin genel bir görüntüsünü alın. 4.3.4 adımında görüntülenmiş örnekteki yapıları bulun ve eşleştirin. Doğrulama için en iyi sinyal-gürültü oranına sahip kanalı kullanın (Şekil 3 A-B). NOT: Genişletilmemiş durumda elde edilen görüntüde olduğu gibi benzer parlaklık elde etmek için görüntüleme parametrelerini ayarlayın (adım 4.3.4).</li>
		<li>ImageJ ile döndürerek ve kaydırarak genişletme öncesi ve sonrası görüntüleri kaplayın. Açıkça tanımlanabilir yapılar arasındaki mesafeleri ölçmek için ImageJ'deki mesafe ölçüm aracını kullanın. En az 10 farklı yapıyı ölçün. NOT: Alternatif olarak,14'te açıklandığı gibi mesafeleri ölçmek için bir Python komut dosyası kullanın.</li>
		<li>Genişletme sonrası/öncesi ölçümleri bölerek genişleme faktörünü hesaplayın.</li>
		<li>Bozulmaları belirlemek için, daha yüksek sayısal diyafram açıklığına sahip görüntüler çekin (Şekil 4A-B). Bu görüntüleri kaplayın ve ImageJ ile veya15'te açıklandığı gibi analiz edin. NOT: Bozulmaların tespiti rutin olarak yapılmalıdır, ancak her numunede mutlaka yapılmamalıdır.</li>
	</ol></li>
</ol>

<ol><li>Matsushita, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Association+of+estimated+glomerular+filtration+rate+and+albuminuria+with+all-cause+and+cardiovascular+mortality+in+general+population+cohorts%3A+a+collaborative+meta-analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Lancet%22%5BJournal%5D)">Association of estimated glomerular filtration rate and albuminuria with all-cause and cardiovascular mortality in general population cohorts: a collaborative meta-analysis.</a> Lancet. 375 (9731), 2073-2081 (2010).</li>
<li>Faul, C., Asanuma, K., Yanagida-Asanuma, E., Kim, K., Mundel, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Actin+up%3A+regulation+of+podocyte+structure+and+function+by+components+of+the+actin+cytoskeleton%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+in+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Actin up: regulation of podocyte structure and function by components of the actin cytoskeleton.</a> Trends in Cell Biology. 17 (9), 428-437 (2007).</li>
<li>Saleem, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Co-localization+of+nephrin%2C+podocin%2C+and+the+actin+cytoskeleton+-+Evidence+for+a+role+in+podocyte+foot+process+formation%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Pathology%22%5BJournal%5D)">Co-localization of nephrin, podocin, and the actin cytoskeleton - Evidence for a role in podocyte foot process formation.</a> American Journal of Pathology. 161 (4), 1459-1466 (2002).</li>
<li>Kestila, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Positionally+cloned+gene+for+a+novel+glomerular+protein+-+nephrin+-+is+mutated+in+congenital+nephrotic+syndrome%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Cell%22%5BJournal%5D)">Positionally cloned gene for a novel glomerular protein - nephrin - is mutated in congenital nephrotic syndrome.</a> Molecular Cell. 1 (4), 575-582 (1998).</li>
<li>Huber, T. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Podocin-mediated+recruitment+of+nephrin+into+lipid+rafts+is+required+for+efficient+nephrin+signaling%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+the+American+Society+of+Nephrology%22%5BJournal%5D)">Podocin-mediated recruitment of nephrin into lipid rafts is required for efficient nephrin signaling.</a> Journal of the American Society of Nephrology. 14, 8(2003).</li>
<li>Boute, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((NPHS2%2C+encoding+the+glomerular+protein+podocin%2C+is+mutated+in+autosomal+recessive+steroid-resistant+nephrotic+syndrome%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Genetics%22%5BJournal%5D)">NPHS2, encoding the glomerular protein podocin, is mutated in autosomal recessive steroid-resistant nephrotic syndrome.</a> Nature Genetics. 24 (4), 349-354 (2000).</li>
<li>Galbraith, C. G., Galbraith, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Super-resolution+microscopy+at+a+glance%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Cell+Science%22%5BJournal%5D)">Super-resolution microscopy at a glance.</a> Journal of Cell Science. 124 (10), 1607-1611 (2011).</li>
<li>Willig, K. I., Rizzoli, S. O., Westphal, V., Jahn, R., Hell, S. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((STED+microscopy+reveals+that+synaptotagmin+remains+clustered+after+synaptic+vesicle+exocytosis%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">STED microscopy reveals that synaptotagmin remains clustered after synaptic vesicle exocytosis.</a> Nature. 440 (7086), 935-939 (2006).</li>
<li>van de Linde, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+stochastic+optical+reconstruction+microscopy+with+standard+fluorescent+probes%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Protocols%22%5BJournal%5D)">Direct stochastic optical reconstruction microscopy with standard fluorescent probes.</a> Nature Protocols. 6 (7), 991-1009 (2011).</li>
<li>Rust, M. J., Bates, M., Zhuang, X. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sub-diffraction-limit+imaging+by+stochastic+optical+reconstruction+microscopy+%28STORM%29%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Sub-diffraction-limit imaging by stochastic optical reconstruction microscopy (STORM).</a> Nature Methods. 3 (10), 793-795 (2006).</li>
<li>Testa, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multicolor+fluorescence+nanoscopy+in+fixed+and+living+cells+by+exciting+conventional+fluorophores+with+a+single+wavelength%5BTitle%5D)+AND+%22Biophysical+Journal%22%5BJournal%5D)">Multicolor fluorescence nanoscopy in fixed and living cells by exciting conventional fluorophores with a single wavelength.</a> Biophysical Journal. 99 (8), 2686-2694 (2010).</li>
<li>Wassie, A. T., Zhao, Y., Boyden, E. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expansion+microscopy%3A+principles+and+uses+in+biological+research%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Expansion microscopy: principles and uses in biological research.</a> Nature Methods. 16 (1), 33-41 (2019).</li>
<li>Tillberg, P. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein-retention+expansion+microscopy+of+cells+and+tissues+labeled+using+standard+fluorescent+proteins+and+antibodies%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Protein-retention expansion microscopy of cells and tissues labeled using standard fluorescent proteins and antibodies.</a> Nature Biotechnology. 34 (9), 987-992 (2016).</li>
<li>Truckenbrodt, S., Sommer, C., Rizzoli, S. O., Danzl, J. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+practical+guide+to+optimization+in+X10+expansion+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Protocols%22%5BJournal%5D)">A practical guide to optimization in X10 expansion microscopy.</a> Nature Protocols. 14 (3), 832-863 (2019).</li>
<li>Truckenbrodt, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((X10+expansion+microscopy+enables+25-nm+resolution+on+conventional+microscopes%5BTitle%5D)+AND+%22Embo+Reports%22%5BJournal%5D)">X10 expansion microscopy enables 25-nm resolution on conventional microscopes.</a> Embo Reports. 19 (9), (2018).</li>
<li>Chang, J. B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Iterative+expansion+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Iterative expansion microscopy.</a> Nature Methods. 14 (6), 593-599 (2017).</li>
<li>Chozinski, T. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((nanoscale+optical+imaging+of+mouse+and+human+kidney+via+expansion+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+Reports%22%5BJournal%5D)">nanoscale optical imaging of mouse and human kidney via expansion microscopy.</a> Scientific Reports. 8 (1), 10396(2018).</li>
<li>Richter, K. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glyoxal+as+an+alternative+fixative+to+formaldehyde+in+immunostaining+and+super-resolution+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22The+EMBO+Journal%22%5BJournal%5D)">Glyoxal as an alternative fixative to formaldehyde in immunostaining and super-resolution microscopy.</a> The EMBO Journal. 37 (1), 139-159 (2018).</li>
<li>Rinschen, M. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+deep+mapping+of+the+cultured+podocyte+proteome+uncovers+shifts+in+proteostatic+mechanisms+during+differentiation%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Physiology-Cell+Physiology%22%5BJournal%5D)">Quantitative deep mapping of the cultured podocyte proteome uncovers shifts in proteostatic mechanisms during differentiation.</a> American Journal of Physiology-Cell Physiology. 311 (3), 404-417 (2016).</li>
<li>Asano, S. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Expansion+microscopy%3A+protocols+for+imaging+proteins+and+RNA+in+cells+and+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Protocols+in+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Expansion microscopy: protocols for imaging proteins and RNA in cells and tissues.</a> Current Protocols in Cell Biology. 80 (1), 56(2018).</li>
<li>Wen, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+direct+grafting+strategies+via+trivalent+anchoring+for+enabling+lipid+membrane+and+cytoskeleton+staining+in+expansion+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Nano%22%5BJournal%5D)">Evaluation of direct grafting strategies via trivalent anchoring for enabling lipid membrane and cytoskeleton staining in expansion microscopy.</a> ACS Nano. 14 (7), 7860-7867 (2020).</li>
<li>Chen, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoscale+imaging+of+RNA+with+expansion+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Nanoscale imaging of RNA with expansion microscopy.</a> Nature Methods. 13 (8), 679-684 (2016).</li>
<li>Gambarotto, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Imaging+cellular+ultrastructures+using+expansion+microscopy+%28U-ExM%29%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Imaging cellular ultrastructures using expansion microscopy (U-ExM).</a> Nature Methods. 16 (1), 71-74 (2019).</li>
<li>Zhao, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Nanoscale+imaging+of+clinical+specimens+using+pathology-optimized+expansion+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Biotechnology%22%5BJournal%5D)">Nanoscale imaging of clinical specimens using pathology-optimized expansion microscopy.</a> Nature Biotechnology. 35 (8), 757-764 (2017).</li>
</ol>

Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.

Sunulan yöntem, araştırmacının hücresel proteinleri, örneğin podocin, nephrin ve sitoskeletal bileşenleri, örneğin F-actin'i görselleştirmesini sağlar. Bu protokolde, transfected cos7 hücreleri, yarık diyafram proteinlerinin F-actin ile etkileşimini incelemek için bir model olarak kullanılır. Ne yazık ki, ölümsüzleştirilmiş podosit hücre hatları yeterli miktarda yarık diyafram proteinini ifade etmez19.
Bu yöntemle hücresel proteinler geleneksel floresan mikroskop kullan...

Albüminüri kardiyovasküler riskin taşıyıcı bir parametresidir ve glomerüler filtrenin bozulmasından kaynaklanır1. Glomerüler filtre fenestratlı endotel, glomerüler bodrum zarı ve podositlerin oluşturduğu yarık diyaframdan oluşur. Podositlerin birincil ve ikincil ayak süreçleri glomerulum2'ninkılcal duvarının etrafına sarılır. Ayak proseslerinin hassas yapısı, birden fazla yarık diyafram proteini ve diğer adaptör proteinleri için çapa görevi gören kortikal akrin demetleri tarafından korunur2. Yarık diyaframın omurga proteinine nephrin denir ve karşıt podositlerin nefrin molekülleriyle homofilik bir şekilde etkileşime girer. Çeşitli adaptör proteinleri aracılığıyla, nephrin aktin sitoskeleton2,3ile bağlantılıdır. Nefrin kodlayıcı gen NPHS1'deki mutasyonlar Finlandiya tip4'ünnefrotik sendromuna yol açar.
Nephrin'in etkileşime giren proteinlerinden biri, stomatin ailesinin saç tokası benzeri bir proteini olan podocin3. Podocin lipid salları için nephrin işe ve actin sitoskeleton5bağlar . Podocin NPHS2 geni tarafından kodlanmıştır. NPHS2'deki mutasyonlar steroid dirençli nefrotik sendroma yol açar6.
Akin adaptör proteinlerini görselleştirmek ve birlikte lokalize etmek için immünofluoresans teknikleri kullanılabilir. Ne yazık ki, ışığın kırınım bariyeri geleneksel floresan mikroskopların çözünürlüğünü 200-350 nm7ile sınırlar. Yeni mikroskopi teknikleri, örneğin uyarılmış emisyon tükenmesi (STED)8, foto-aktif lokalizasyon mikroskopisi (PALM)9, stokastik optik rekonstrüksiyon mikroskopisi (STORM veya dSTORM) veya zemin durumu silme mikroskopisi ve ardından bireysel molekül dönüşü (GSDIM) 9,10,11, yaklaşık 10 nm'ye kadar bir çözünürlük sağlar. Bununla birlikte, bu süper çözünürlük teknikleri çok pahalı mikroskoplar, iyi eğitimli personel gerektirir ve bu nedenle birçok laboratuvarda mevcut değildir.
Genleşme mikroskopisi (ExM), geleneksel mikroskoplarla süper çözünürlüklü görüntüleme sağlayan ve büyük bir araştırma topluluğu için potansiyel olarak kullanılabilen yeni ve basit bir tekniktir12. Protein tutma genleşme mikroskopisinde (proExM), ilgi örneği (hücreler veya doku) sabitlenir ve floroforlarla lekelenir13. Numune içindeki proteinler daha sonra küçük bir molekül (6-(((Acryloyl)amino)heksanoik asit, süksinimsal ester, AcX) tarafından koordine bir şekilde şişme bir hidrojel13'etutturulr. Proteinaz K (ProK) ile enzimmatik sindirim yoluyla, proteinler ve floroforlar genişlemeden sonra jel içindeki göreceli konumlarınıkorurlar 13. Jelin şişmesi sonrasında, numune 4,5 kata (90 kat hacimsel genleşme) kadar genişleyerek yaklaşık 60-70 nm (300 nm/4,5) etkili bir yanal çözünürlüğe sahiptir. Bu tekniğin modifikasyonları, geleneksel mikroskoplarda14,15,16'da20-30 nm çözünürlük oluşturarak 10 kat genişlemeye(1.000kat hacimsel genişleme) bile izin verebilir.
Fare ve insan böbreklerinin glomerüler yapıları ExM17ile görselleştirilmiştir. Bu yazıda, geleneksel bir floresan mikroskobu kullanarak F-actin ve aksin adaptörü protein podocin'in süper çözünürlüklü görüntülerini görselleştirmek için ayrıntılı bir proExM protokolü sunuyoruz.

<table><tbody><tr><td>Akrilamid >%99</td> <td>Sigma-Aldrich</td><td>A3553-100G</td><td></td></tr><tr><td>6- ((Akriloyl) amino) heksanoik asit, süksinimidil ester, Akriloyl-X, SE</td><td>invitrojen</td><td>A-20770</td><td>4 aya kadar saklar</td></tr><tr><td>APS</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>A3678-25G</td><td></td></tr><tr><td>Deckgl & auml; ser (kapak camları)</td><td>Engelbrecht</td><td>K12432</td><td>24x32mm #1.0</td></tr><tr><td>Diamont kesici</td><td>VWR</td><td>201-0392</td><td>kapak fişlerini kesmek için</td></tr><tr><td>Guanidin HCl</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G3272-100G</td><td>8M Stok RT</td></tr><tr><td>Marten saç boya fırçası</td><td>Leon Hardy</td><td>3 (770)</td><td></td></tr> <tr><td>"Menzel" Deckgl&auml'de tutulabilir; ser (kapak camları)</td> <td>Thermo Fischer&nbsp;</td><td>15654786</td><td>24x24mm # 1.5</td></tr><tr><td>N, N'-Metilenbisakrilamid</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M7256-25G</td><td></td></tr><tr><td>Objekttr&auml; ger UniMark</td><td>Marienfeld</td><td>703010</td><td></td></tr><tr><td>Proteinaz K</td><td>New England Biolabs</td><td>P8107S</td><td></td></tr><tr><td>Sodyum Akrilat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>408220</td><td>saflığı kontrol edin&nbsp;</td></tr><tr><td>Sodyum Bikarbonat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S5761</td><td></td></tr><tr><td>Üniversitenin atölyesinde üretilen</td><td>boyama odası</td><td></td><td></td></tr><tr><td>TEMED</td><td>ROTH</td><td>2367.1</td><td></td></tr><tr><td>6 Kuyulu cam alt plakalar</td><td>Cellvis</td><td>P06-1.5H-N</td><td></td></tr><tr><td><güçlü>Antikorlar</güçlü></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Aktin-ExM 546&nbsp;</td><td>chrometra</td><td>mevcut değil</td><td>1:40</td></tr><tr><td>Tavşan Sigma'da üretilen Anti Podocin</td><td></td><td>P-0372-200UL</td><td>1:200</td></tr><tr><td>Eşek anti kobay CF633</td><td>Sigma</td><td>SAB4600129-50UL</td><td>1:200</td></tr><tr><td>Keçi anti tavşan 488</td><td>Yaşam Teknolojileri</td><td>A11034</td><td>1:1000</td></tr><tr><td>Gine domuzu anti nefrin</td><td>Origene</td><td>BP5030</td><td>1:100</td></tr><tr><td>Software</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>FIJI</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Visiview</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>microscope</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>AXIO Observer Z1</td><td>Zeiss</td><td>kullanılamaz</td><td></td></tr></tbody></table>

podosit proteinleri nephrin, actin ve podocin'in genleşme mikroskopisi ile görüntülenmesi

Imaging of Podocytic Proteins Nephrin, Actin, and Podocin with Expansion Microscopy

Glomerüler endotel, glomerüler bodrum membranı ve podositlerden oluşan glomerüler filtrenin bozulması albüminüri ile sonuçlanır. Podosit ayak prosesleri, podocin gibi sitoskeletal adaptör proteinlerine bağlanan aktin demetleri içerir. Podocin gibi adaptör proteinleri, nefrin gibi glomerüler yarık diyaframın omurgasını aktin sitoskeleton'a bağlar. Bu ve diğer podositik proteinlerin lokalizasyonunu ve işlevini incelemek, glomerüler filtrenin sağlık ve hastalıktaki rolünün anlaşılması için gereklidir. Sunulan protokol, kullanıcının geleneksel bir mikroskopta süper çözünürlüklü görüntüleme ile hücrelerde akrin, podokin ve nefrin görselleştirmesini sağlar. İlk olarak, hücreler geleneksel bir immünoresans tekniği ile lekelenir. Numunedeki tüm proteinler daha sonra kovalently şişme bir hidrojel'e tutturulır. Proteinaz K ile sindirim yoluyla, yapısal proteinler son adımda jelin izotropik şişmesine izin vererek bölünür. Numunenin suda diyaliz edilmesi, numunenin 4-4,5 kat genişlemesine neden olur ve numune geleneksel bir floresan mikroskobu ile görüntülenebilir ve 70 nm'lik potansiyel bir çözünürlük sağlar.

Bu proExM protokolünün kavramı ve zamanlaması Şekil 1'de tasvir edilmiştir. 5. günde, transfected hücreler ilgi proteinini hedefleyen floresan antikorlarla sabitlenir ve lekelenir (Şekil 1A,B). 6. günde, AcX ile tedavi tüm proteinler üzerinde amin gruplarının oluşumuna yol açar (floroforlar dahil) (Şekil 1A,B)12. Hidrojel polimerizasyonu üzeri...

Sunulan yöntem, floresan etiketli hücresel proteinlerin, geleneksel bir mikroskopta 70 nm çözünürlüğe yol açan genleşme mikroskopisi ile görselleştirilmesini sağlar.

Podosit Proteinleri Nephrin, Actin ve Podocin'in Genleşme Mikroskopisi ile Görüntülenmesi

Disruption of the glomerular filter composed of the glomerular endothelium, glomerular basement membrane and podocytes, results in albuminuria. Podocyte ...

Bu genleşme mikroskobik protokolü, araştırmacının glomerüler proteinleri geleneksel bir mikroskopta nano ölçekli çözünürlükle görselleştirmesini sağlar. Genişleme mikroskopisinin temel avantajı, büyük bir araştırma topluluğunun erişebileceği olmasıdır. Jelasyon odası için aralayıcılar yaparak başlayın.Bir numaralı ve 1,5 numaralı cam kapağı elmas bir bıçak kullanarak beş milimetrelik çizgilere bölün. Bir cam kaydırağı bir boyama odasına yerleştirin ve 1,5 numaralı kapak kayma çizgilerini cam kaydırağın üzerine yerleştirin, böylece 2,5 santimetre kare oluştururlar. Pipet, cam kapak kayma çizgilerini birbirine ve cam kaydırağa yapışmak için meydanın köşelerine çift damıtılmış su damlası.1,5 numaralı kapak fişlerinin dikkatlice tutturulması için yaklaşık 20 dakika bekleyin. Pipet her sayı 1.5 kapak kayma şeridinde bir damla su. 1,5 numaralı kapak fişlerinin üzerine dört adet bir numaralı cam kapak kayması şeridi yerleştirin.Jelleşme odası kapağı için, filmdeki herhangi bir kıvrım veya kirden kaçınarak parafin filmi ile bir kapak camı sarın. Ankraj tedavisi için PBS'yi bağışıklık lekeli hücrelerden çıkarın ve kuyu başına 250 mikrolitre ankraj tamponu doğrudan cam kapak kaymasına ekleyin. Plakayı oda sıcaklığında üç saat kuluçkaya yatırın.Bir kutu kullanarak substratı karanlıkta tutun. İnkübasyondan sonra, ankraj tamponunu çıkarın ve kapak fişini kuyu başına 1,5 mililitre PBS ile bir kez yıkayın. Akrin liflerini lekelemek için EXM uyumlu bir phalloidin çözeltisini çözün ve oda sıcaklığında 45 dakika kuluçkaya bırakın.Bu arada, sodyum akrilatları karıştırma cihazı kullanarak çift damıtılmış suda çözün ve monomer çözeltisini buz üzerinde hazırlayın. Phalloidin'i hücrelerden çıkarın ve oda sıcaklığında iki kez 1,5 mililitre PBS ile yıkayın. Son yıkamadan sonra kuyuda 1,5 mililitre PBS bırakın.Kapak camı kaymasını altı kuyu plakasından kaldırmak ve jelasyon odasına yerleştirmek için kümesler ve bir canül kullanın. Jelleşme çözeltisine ve girdabına kısaca APS ekleyin. Pipet Numune üzerinde 200 mikrolitre jelleşme çözeltisi ve jel içindeki hava kabarcıklarını önleyerek odayı dikkatlice kapatın.Boyama odasına su ekleyin ve jeli polimerize etmek için leke odasını 37 santigrat derecede en az bir saat kuluçkaya bırakın. Leke haznesini inkübatörden çıkar. Jelasyon odası kapağını açmak için, kapak ve aralayıcı arasına bir jilet takın ve kapağı dikkatlice çıkarın.Aralayıcıları jiletle çıkarın ve tüm ekstra jeli kesin. Jelin kenarlarını ayırmak için bir boya fırçası kullanın. Jel ve kapak camı ile slaytı PBS ile dolu bir tabağa koyun.Daha sonra kopan kapak camını hafifçe sallayarak jelden çıkarın. Jeli slayda takmak için slaydı jelin altına koyun. Jel slayttayken, jilet kullanarak jeli küçük parçalara bölün.Bir parça jeli cam tabanlı altı kuyu plakasının kuyusuna hafifçe itin ve bir boya fırçasıyla açın. Jeli az miktarda PBS ile nemlendirmek için boya fırçasını kullanın. Ters mikroskop kullanarak, genişletme öncesi görüntüler için düşük sayısal diyafram açıklığına sahip genel bakış görüntüleri alın.Sindirim çözeltisini yapmak için proteinaz K'yi sindirim tamponunda mililitre başına dört üniteye seyreltin. Her kuyuya 500 mikrolitre sindirim çözeltisi ekleyin ve jeli çözeltinin içine daldırın. Numuneleri karanlıkta tutmak için kapak kapalıyken oda sıcaklığında gece boyunca sindirin.Sindirim solüsyonunu bir pipetle çıkarın ve atın. Bir mililitre çift damıtılmış su ekleyin ve daldırılmış jeli oda sıcaklığında 10 dakika kuluçkaya bırakın. Suyu çıkarın ve bir mililitre taze, çift damıtılmış su ekleyin.Bir genişleme platosununa ulaşılana kadar her 10 dakikada bir su alışverişine devam edin ve jelin optik olarak netleşmesine neden olun. Suyu jelden çıkarın ve hemen mikroskopiye başlayın. Ters mikroskop kullanarak, genişleme öncesi durumdaki hücreleri bulmak için düşük büyütmede bir hava hedefi kullanın.Daha iyi çözünürlük için 40 X ve 63 X hedefine geçin. İlginin dalga boyu ile heyecanlandırın ve görüntüyü kamera üzerinden alın. Bu EXM protokolü dört kata kadar genişleme sağlar.Genişletme faktörünü belirlemek için genişlemeden önce ve sonra hücreleri görüntüleyesiniz. Yetersiz ankraj ve homojenizasyon hücrelerin bozulmasına ve yırtılmasına yol açabilir. Yırtılmış hücrelerin temsili örnekleri burada gösterilmiştir.Bu yöntem, podokin ve nefrin gibi F-actin ve akrin adaptör proteinlerinin kolokalizasyonunu araştırmak için kullanılabilir. Podocin yeşil, actin mavi ve nephrin kırmızı ile tasvir edilir. Beyaz alanlar kolokalizasyonu gösterir.Floresan sinyal yoğunluğu ve bolluğu başarılı EXM için anahtardır. Floresan boyaların ACX üzerinden verimli bir şekilde tutturulduğu bu protokol için kritik öneme sahiptir. Elimizde çözünür ACX üç ila dört aya kadar iyidir.

imaging-podocytic-proteins-nephrin-actin-podocin-with-expansion

Research

JoVE Journal

Biochemistry

Biyokimya

Bu videoda, klinik doku örneklerinin nano ölçekli yapıların mikroskobik incelemesi için bir polimer ağı kullanılarak kimyasal olarak genişletildiği, genişleme mikroskobunun bir çeşidi olan genişleme patolojisi adı verilen bir yöntemi açıklıyoruz.

Genişleme Patolojisi: Klinik Doku Örneklerinin Yüksek Çözünürlüklü Optik Görüntülenmesi İçin Bir Yöntem

Podositlerdeki hücre içi kalsiyum seviyelerindeki değişiklikler, glomerüllerin filtrasyon fonksiyonunu kontrol etmenin en önemli yollarından biridir. Burada, yeni izole edilmiş glomerüllerin podositlerinde gerçek zamanlı kalsiyum işlemenin ve tek iyon kanalları aktivitesinin tespit edilmesini sağlayan yüksek verimli bir yaklaşımı açıklıyoruz.

Taze İzole glomerulusların Podositler Tek kanallı Analizi ve Kalsiyum Görüntüleme

Bu protokol ana odak verimli bir şekilde uygun birincil glomeruli kültürlerin çeşitli aşağı akım uygulamaları kullanmak için en az kirletici maddeleri ile izole etmektir. İzole glomeruli bileşeni hücre tipleri arasındaki yapısal ilişkileri korumak ve kültürlü ex vivo kısa bir süre için olabilir.

Yetişkin sıçan böbrek üzerinden olduğu gibi Glomeruli yalıtmak için verimli bir eleme yöntemi

Antikor etiketleme, optik temizleme ve gelişmiş ışık mikroskobu kombinasyonu, tam yapıların veya organların üç boyutlu analizini sağlar. Burada açıklanan, kalın böbrek dilimleri immünolabeling birleştirmek için basit bir yöntemdir, etil cinnamate ile optik Temizleme, ve üç boyutlu böbrek yapıların görselleştirme ve kantifikasyon sağlayan konfoköz görüntüleme.

Optik temizleme ve Immünolabeled böbrek dokusu görüntüleme

Klinik doku örneklerinin nanoölçekli görüntülemesi hastalık patogenezinin anlaşılmasını iyileştirebilir. Genleşme patolojisi (ExPath), geleneksel kırınım sınırlı mikroskoplar kullanarak biyomoleküllerin nano ölçekli konfigürasyonunun araştırılması için standart klinik doku örnekleriile uyumluluk için modifiye edilen genleşme mikroskobunun (ExM) bir versiyonudur.

Fiziksel ve İzotropik Genişleme Yoluyla İnsan Doku Bölümlerinin Nanoskobik Görüntülemesi

Burada sunulan, insan böbrek podositlerinin yüksek verimli (%&gt;90) ve genetik manipülasyonlardan veya alt popülasyon seçiminden bağımsız olarak indüklenmiş pluripotent kök hücrelerden türetülmesi için kimyasal olarak tanımlanmış bir protokoldür. Bu protokol 26 gün içinde istenen hücre tipini üretir ve nefrotoksisite testi ve hastalık modellemesi için yararlı olabilir.

Olgun Böbrek Podositlerinin Kimyasal Olarak Tanımlanmış Koşullar Altında İnsan kaynaklı Pluripotent Kök Hücrelerden Rehberli Farklılaşması

Burada, konvansiyonel lazer taramalı konfokal mikroskop kullanılarak süper çözünürlüklü görüntüleme elde etmek için erken Drosophila embriyolarında genişleme mikroskobunun uygulanması için bir protokol sunulmaktadır.

Süper Çözünürlüklü Görüntüleme için Tam Montajlı Drosophila Embriyolarını Fiziksel Olarak Büyütmek için Genişleme Mikroskobunun Kullanılması

Burada, 11 kata kadar genişleme için modifiye edilmiş, kapsamlı bir biyomolekül sınıfı dizisini koruyan ve çok çeşitli doku tipleriyle uyumlu olan genişleme mikroskobunun (ExM) yeni bir versiyonu olan Magnify sunulmaktadır. Konvansiyonel kırınım sınırlı mikroskoplar kullanılarak biyomoleküllerin nano ölçekli konfigürasyonunun sorgulanmasını sağlar.

11 Katlı Genişleme Mikroskobu ile Üniversal Moleküler Retansiyon

Bu makalede, dermal fibroblastlardan hastaya özgü podositlerin epizomal yeniden programlanması yoluyla insan kaynaklı pluripotent kök hücrelere (hiPSC'ler) ve ardından podositlere farklılaşması için iki aşamalı bir protokol açıklanmaktadır.

Cilt Biyopsilerinden Hasta Kaynaklı Podositlerin Üretimi

Bu çalışma, Chagas hastalığından sorumlu patojen olan Trypanosoma cruzi'nin üç in vitro yaşam döngüsü aşamasında ultrayapı genişletme mikroskobunu gerçekleştirmek için ayrıntılı bir protokol göstermektedir. Hücre iskeleti proteinleri ve pan-proteom etiketleme için optimize edilmiş tekniği dahil ediyoruz.

Ultrastrüktürel Genleşme Mikroskobu in Üç İn Vitro Yaşam Döngüsü Aşamaları Trypanosoma cruzi

Mevcut protokoller, oküler lensteki periferik yapıların görüntü niceleme yöntemleriyle görselleştirilmesi için yeni tam montajlı görüntülemeyi tanımlamaktadır. Bu protokoller, lens mikro ölçekli yapıları ile lens gelişimi/işlevi arasındaki ilişkiyi daha iyi anlamak için yapılan çalışmalarda kullanılabilir.

Periferik lens yapısını, hücre morfolojisini ve organizasyonunu görselleştirmek ve ölçmek için tam montajlı görüntüleme

Öğrenin, genleşme mikroskopisi ile glomerüler proteinleri nanometre çözünürlüğünde görüntülemeyi. Bu yöntem, standart mikroskoplarla 70 nm çözünürlük sağlayarak araştırmacılara erişilebilir bir protokol sunar.

Podosit Proteinleri Nephrin, Actin ve Podocin'in Genleşme Mikroskopisi ile Görüntülenmesi

Daha fazla video keşfet