Name: Elementel Görüntüleme için Sulak Alan Köklerini ve Rizosferleri Koruma Yöntemi (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-02-15T14:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 29 s
Description: Öğrenin sulak bitki kökleri ve rizosfer için slam-dondurma ve liyofilizasyon yöntemiyle elementel görüntüleme hazırlama tekniğini. Bu hızlı ve uygun maliyetli protokol, demir, manganez ve arsenik gibi elementlerin dağılımını ve spesiyasyonunu koruyarak bitki-toprak etkileşimlerinin detaylı incelenmesini sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Yazarlar, Delaware Üniversitesi ve Brookhaven Ulusal Laboratuvarı arasındaki işbirliğini desteklemek için Seyfferth ve Tappero'ya ortak tohum hibesi verildiğini kabul ediyorlar. Bu araştırmanın bazı bölümlerinde, Brookhaven Ulusal Laboratuvarı tarafından Brookhaven Ulusal Laboratuvarı tarafından DOE Bilim Ofisi için işletilen ABD Enerji Bakanlığı (DOE) Bilim Kullanıcı Tesisi Ofisi Olan Ulusal Senkrotron Işık Kaynağı II'nin XFM (4-BM) Beamline'ı kullanılmıştır. DE-SC0012704.

1. Çarpma donduran ekipmanın hazırlanması
<ol><li>Sıvı nitrojen tutabilen temiz bir soğutucunun içine yatay olarak iki bakır blok (~5 cm x 5 cm x 15 cm) yerleştirin ve blokları batıracak kadar sıvı azot dökün. Köpürtücülük azaldığında, her iki ucundaki bir bakır bloğun üzerine iki ara parçası yerleştirin. NOT: Aralayıcı yüksekliği, dondurulacak numunenin yüksekliğini belirler; Bu örnek, yaklaşık 3 cm x 3 cm x 2 cm küpler oluşturmak için 2 cm'lik bir aralayıcı kullanır. Sıvı nitrojenin hacmi daha soğuk boyuta bağlı olacaktır. Bu örnek, seri olarak yaklaşık 5 küp için yaklaşık 1 L kullanır. DİkKAT: Sıvı nitrojen bir kriyojen ve bir boğulma olduğu için uygun kişisel koruyucu ekipman ve havalandırma kullanın.</li>
	<li>Maşa ve kriyojenik eldivenler kullanarak, numune yerindeyken geri almayı kolaylaştırmak için ucundaki diğer bakır bloğu ayağa kaldırın.</li>
</ol>2. Örnek toplama ve çarpma dondurma
<ol><li>bir kürek kullanarak ıslak topraktan istenen bitkiyi ve rizosferi çıkarın ve kazılmış deliğin istenen kök hacminden çok daha büyük olduğundan emin olun. Toprağı ve bitkiyi bir kaba yerleştirin ve bir tezgah üzerine yerleştirin. NOT: Bir saksı çalışmasından elde edilen tüm saksı toprağı ve bitki de kullanılabilir.</li>
	<li>Köklerin alınacağı istenen toprak konumunu belirleyin (yani, sürgüne derinlik ve yakınlık). İstenilen alanda toprağı bozmamaya dikkat ederek çelik bir bıçak kullanarak fazla toprağı kesin. İstenilen alana ulaşıldığında, yaklaşık 3 cm x 3 cm x 2 cm kök "küp" kesin ve küpü hemen yatay bakır blok üzerindeki iki ara çubuğun arasına yerleştirin. Kriyojenik eldivenler kullanarak, dikey bakır bloğu alın ve rizosfer küpünü çarpmak için ara bileşenlerin üzerine yerleştirin.</li>
	<li>Köpürme azaldıktan sonra (~5 dk), bakır bloklardan donmuş rizosfer küpünü alın ve önceden etiketlenmiş bir alüminyum folyo karenin içine sarın. İsterseniz folyodaki bloğun yönünü işaretleyin. -80 °C'lik bir dondurucuda depolanınceye kadar ikinci bir sıvı azot kabına yerleştirin.</li>
	<li>Alan alanından veya denemeden istenen sayıda kök küp elde etmek için gerektiği gibi yineleyin. Her iki bakır bloğun da numuneler arasında soğuması için zaman verildiğine emin olun.</li>
</ol>3. Rizosfer küplerini dondurarak kurutma ve gömme
<ol><li>Dondurarak kurutucuyu üreticinin talimatlarına göre hazırlayın. -80 °C dondurucudan numuneleri çıkarmadan önce uygun vakum basıncını ve sıcaklığını elde ettiğine dikkat edin.</li>
	<li>Dondurarak kurutucu numune almaya hazır olduğunda, temiz ve asitle yıkanmış 50 mL tüpün içine bir donmuş rizosfer küpü yerleştirin ve temiz bir tek kullanımlık mendille gevşek bir şekilde örtün. Silme işlemini bir lastik bantla sabitleyin. Tüp başına bir küp sağlamak için gerektiği gibi tekrarlayın. NOT: Numune bir tüp için çok büyükse, numune tutucu olarak alüminyum folyo kullanılarak doğrudan dondurarak kurutucu kabına yerlenebilir.</li>
	<li>Numuneleri içeren tüpleri dondurarak kurutucu kaplara yerleştirin ve birkaç gün boyunca kurutun. Tam kuruma süresi toprak özelliklerine bağlı olacaktır. NOT: Kurutulmuş numuneleri yeniden sulanmasını önlemek için dondurucuda veya bir kurutucuda saklayın.</li>
	<li>Kurutulmuş toprak küplerini istenen forma sığacak şekilde kesmek için çelik bir bıçak kullanın (örneğin, 25 mm çapında form çoğu uygulama için idealdir). Her formu etiketleyin, toprak küplerini formlara yerleştirin ve formları bir vakum kurutucunun içine yerleştirin.</li>
	<li>Epoksiyi üreticinin talimatlarına göre hazırlayın. Seçilen epoksinin kontamine olmadığından ve istenen elemanların spesifikasyon değişikliklerine neden olmadığından emin olun 20,29,30.</li>
	<li>Numuneyi tamamen kaplayana kadar toprağın bir tarafındaki forma epoksi eklemek için bir damlalık kullanın. Epoksi toprağı ıslattıkça toprak renk olarak kararacak. NOT: Topraktaki havanın kaçmasını sağlamak için epoksiyi yavaşça ekleyin.</li>
	<li>Formlar epoksi ile doldurulduktan sonra vakum kurutucusunu kapatın ve vakumun açın. Toprağa sıkışan hava miktarına bağlı olarak, formlara periyodik olarak daha fazla epoksi eklenmesi gerekebilir. İlk 1-4 saat boyunca her 30-90 dakikada bir epoksi seviyesini kontrol edin ve gerektiğinde epoksi ekleyin.</li>
	<li>Epoksi sertleştikten sonra örneği formdan çıkarın (~5 gün).</li>
</ol>4. Rizosfer küplerinin kesilmesi ve bölümlere kesilmesi
<ol><li>Elmas bıçak hassasiyetinde ıslak testere kullanarak numuneyi kesin. Önceki kesimde kök elde edilirse numuneleri farklı yerlerde kesin.</li>
	<li>Kesilen numuneleri, kesim tarafında ~30 sn için kademeli olarak daha ince zımpara kağıdı (örneğin, 220, 500, 1000 ve 1500 kum) ile manuel olarak zımparalayın.</li>
	<li>LA-ICP-MS gibi teknikleri kullanarak örneklerin yüzey görüntülemesini gerçekleştirin. NOT: S-XRF için ince bölümler hazırlamak için, numuneleri ince bölümleri (tek veya çift yan parlatma) hazırlayabilecek bir şirkete gönderin veya aşağıda açıklandığı gibi 4.4 - 4.6 adımlarını izleyin.</li>
	<li>İstenilen numune tarafını süper tutkal kullanarak kuvars bir slayda yapıştırın ve bir gecede tedaviye izin verin.</li>
	<li>İnce bir kesit makinesi kullanarak, toprağı 2 mm kalınlıkta kaydıraklar üzerinde kesin ve ardından istediğiniz kalınlıkta (tipik olarak 30 μm) öğütün. İstenirse numune yüzeyi parlatılabilir.</li>
	<li>Bölümlerin S-XRF görüntülemesini gerçekleştirin. Görüntüleme süresine başvurmak ve kullanmak için istenen senkrotron tesisinde ve kiriş hattında uygun adımları izleyin.</li>
</ol>

Yazarların açıklayacak bir şeyi yok.

Bu makalede, elementel görüntüleme ve/veya kimyasal spektasyon haritalaması için kullanılabilecek bir çarpma dondurma tekniği kullanarak sulak alan bitki köklerinin korunmuş dökme toprağı + rizosferlerini elde etmek için bir protokol açıklanmaktadır.
Bu yöntemin mevcut yöntemlere göre çeşitli yararları vardır. İlk olarak, bu yöntem köklerin ve çevresindeki rizosferlerin eşzamanlı olarak araştırılmasına izin verir. Şu anda, toprağı yıkayarak ve kökleri 31,32ve...

Kökler ve rizosferleri dinamik, heterojen ve bitkilerin mineral besin maddelerini ve kirleticileri nasıl elde ettiğini anlamak için kritik öneme sahiptir1,2,3. Kökler, besin maddelerinin (örneğin fosfor) ve kirleticilerin (örneğin arsenik) topraktan bitkilere taşındığı ve böylece bu sürecin anlaşılmasının gıda miktarı ve kalitesi, ekosistemin işleyişi ve fitoremediasyon üzerinde etkileri olduğu birincil yoldur. Bununla birlikte, kökler besin edinme ihtiyaçlarına yanıt olarak büyüyen uzay ve zamanda dinamiktir ve genellikle işlev, çap ve yapı bakımından değişirler (örneğin, yanal kökler, maceracı kökler, kök kılları)2. Kök sistemlerinin heterojenliği hücreselden ekosistem seviyesine kadar mekansal ölçeklerde ve saatlikten dekadale kadar zamansal ölçeklerde incelenebilir. Bu nedenle, köklerin ve çevresindeki toprakların dinamik ve heterojen doğası veya rizosfer, zaman içinde rizosfer kimyasını yakalamak için zorluklar oluşturur. Bu zorluğa rağmen, bu kritik bitki-toprak ilişkisini karakterize etmek için toprak ortamlarındaki kökleri incelemek zorunludur.
Sulak alan bitkilerinin rizosfer kimyası, kütle toprağından köklere kadar uzay ve zamanda değişen dik oksijen gradyanları nedeniyle araştırılması özellikle zordur. Köklerin solunum için oksijene ihtiyacı olduğundan, sulak alan bitkileri aerenchyma4,5oluşturarak sulak alan topraklarının düşük oksijen koşullarınaadapteolmuşlardır. Aerenchyma, sürgünlerden köklere uzanan, bitkiden köklere havanın yayılmasına izin veren içi boş kortikal dokulardır. Bununla birlikte, bu havanın bir kısmı, köklerin daha az bastırılmış kısımlarında, özellikle yanal kök kavşaklarının yakınında, daha az olgun kök uçlarında ve uzama bölgelerinde rizosfere sızar6,7,8,9. Bu radyal oksijen kaybı, sulak alan bitkilerinin rizosferinde rizosfer (biyo-jeo)kimyasını etkileyen ve azaltılmış dökme toprak10 , 11,12'denfarklı bir oksitlenmiş bölge oluşturur. Sulak alan rizosferleri ve köklerindeki besin maddelerinin ve kirleticilerin kaderini ve taşınmasını anlamak için, kimyasal olarak azaltılmış dökme toprağın, oksitlenmiş rizosferin ve sulak alan bitkilerinin köklerinin analiz için korunması önemlidir. Bununla birlikte, dökme toprak oksijene duyarlı azaltılmış toprak bileşenleri içerdiğinden, kök ve toprak koruma yöntemleri kök yapılarını korumalı ve oksijene duyarlı reaksiyonları en aza indirmelidir.
Bitki dokularını düzeltmek ve görüntüleme için ultrayapıyı korumak için yöntemler vardır, ancak bu yöntemler sulak alanda yetişen kökleri kimyasal olarak korumak için uygulanamaz. Sadece bitki hücreleri içindeki element dağılımının istendiği incelemeler için, bitkiler tipik olarak hidroponik olarak yetiştirilir ve kökler çözeltiden kolayca çıkarılabilir, yüksek basınçlı dondurma ve donma ikamesi altında sabitlenebilir ve yüksek çözünürlüklü ikincil iyon kütle spektrometresi (nanoSIMS), elektron mikroskopisi ve senkrotron X-ışını floresan (S-XRF) analizi13dahil olmak üzere çeşitli görüntüleme uygulamaları içinbölümlenebilir. 14,15. Sulak alan köklerinin dışındaki Fe plaklarını araştırmak için, bu topraksız çalışmalar yapay olarak Fe plak oluşumunu teşvik etmelidir Çözelti16Fe plak oluşumunun dağılımının ve mineral bileşiminin heterojenliğini doğru bir şekilde temsil etmeyen17 , 18,19,20. Sulak alan toprağını ve buna bağlı mikroorganizmaları dondurarak korumak için yöntemler vardır21, ancak bu teknikle kök elde etmek zordur. Toprakta yetişen kökleri ve rizosferik kimyalarını görselleştirmek için mevcut yöntemler iki birincil ölçüm türünden oluşur: elemental akılar ve toplam element konsantrasyonu (ve speciation). Birincisi tipik olarak ince filmlerdeki (DGT)22 , 23,24'tekidifüzif gradyanlar kullanılarak ölçülür, burada toprak bir laboratuvar ortamında bitki büyümesini desteklemek için rhizobox'lara yerleştirilir ve topraktaki labile elemanları bir jel yoluyla bağlayıcı bir katmana yayılır. Bu bağlama katmanı daha sonra ilgi çekici labile öğelerini ölçmek için görüntülenebilir. Bu teknik, kökler ve rizosfer24 , 25,26,27arasındaki ilişkileri başarıyla gösterebilir, ancak kök sınırlayıcı eserler rhizobox'larda bitki yetiştirerek bulunabilir ve kök iç kısmı hakkındaki bilgiler DGT ile yakalanmaz. İkincisi, köklerin ve rizosferin örneklemini, numunenin korunmasını ve örnek bir bölümdeki elementel dağılımın doğrudan analizini içerir. Sulak alan bitki köklerinin ve çevresindeki rizosferin bu çevresel örneklemesi için, numune hazırlamadan elde edilen eserleri önlemek için dikkatli numune işleme gereklidir.
Burada, sulak alan bitkilerinin kök yapılarını ve rizosfer kimyasını çarpma ve dondurarak kurutma yoluyla etkili bir şekilde koruyan bir protokol açıklanmaktadır. Flaş dondurma, oksijene duyarlı solutların dönüşümlerini büyük ölçüde yavaşlatabilir, ancak köklere zarar verebilir ve numuneler kurudığında harekete geçirilmesine neden olabilir. Bununla birlikte, numunenin sıvı nitrojen ile önceden soğutulan bakır bloklar arasında dondurulduğu slam dondurma, kök hasarını ve numune bozulmasını en aza indirir28. Korunmuş numuneler daha sonra speciation20 , 29olarak koruyan verizosfer topraklarındaki köklerin görüntülenmesi için kesilip parlatılabilen bir epoksi reçineye gömülür. Bu rapordaki örnekler ince kesitleme sonrası S-XRF kimyasal spektrasyon görüntülemesi ile analiz edilmiştir. Bununla birlikte, lazer ablasyon-endüktif olarak birbirine bağlı plazma kütle spektrometresi (LA-ICP-MS), parçacık kaynaklı x-ışını emisyonu (PIXE), ikincil iyon kütle spektrometresi (SIMS) ve lazer kaynaklı çöküntü spektroskopisi (LIBS) görüntüleme dahil olmak üzere diğer görüntüleme teknikleri de kullanılabilir.

<table><tbody><tr><td>Bakır bloklar</td><td>McMaster Carr</td><td>89275K42</td><td></td></tr><tr><td>Elmas bıçak</td><td>Buehler</td><td>15 LC, 102 mm x 0,3 mm</td><td>çalışma hızı: 225 rpm</td></tr><tr><td>Epoksi formları</td><td>Struers</td><td>40300085</td><td>FixiForm</td></tr><tr><td>Epoksi</td><td>Epotek</td><td>301-2FL</td><td></td></tr><tr><td>Süper Yapıştırıcı</td><td>Loctite</td><td>404</td><td></td></tr><tr><td>İnce kesit alma makinesi</td><td>Buehler</td><td>PetroThin</td><td></td></tr><tr><td>Islak testere</td><td>Buehler</td><td>IsoMet 1000</td><td></td></tr></tbody></table>

elementel görüntüleme için sulak alan köklerini ve rizosferleri koruma yöntemi

A Method to Preserve Wetland Roots and Rhizospheres for Elemental Imaging

Kökler toprak ortamlarıyla yoğun bir şekilde etkileşime girer, ancak kökler ve çevresindeki rizosfer arasındaki bu tür etkileşimleri görselleştirmek zordur. Sulak alan bitkilerinin rizosfer kimyasının, köklerden dökme toprağa dik oksijen gradyanları nedeniyle yakalanması özellikle zordur. Burada, sulak alan bitkilerinin kök yapısını ve rizosfer kimyasını çarpma ve dondurarak kurutma yoluyla etkili bir şekilde koruyan bir protokol açıklanmaktadır. Numunenin sıvı azotla önceden soğutulan bakır bloklar arasında dondurulduğu slam-freeze, kimyasal belirtim değişikliklerini en aza indirirken flaş dondurma ile oluşabilecek kök hasarını ve numune bozulmasını en aza indirir. Numune bozulması hala mümkün olsa da, birden fazla numuneyi hızlı ve minimum maliyetle elde etme yeteneği, tatmin edici örnekler elde etme potansiyelini artırır ve görüntüleme süresini optimize eder. Veriler, bu yöntemin pirinç köklerinde ve demir plaklarla ilişkili rizosferlerde azaltılmış arsenik türlerini korumada başarılı olduğunu göstermektedir. Bu yöntem, iz elementli bisiklet sürmeden fitokilatasyon uygulamalarına kadar konsantrasyon aralıklarını kapsayan çok çeşitli sulak alan ortamlarında bitki-toprak ilişkilerinin çalışmaları için benimsenebilir.

Bu yöntem, sulak alan bitkilerinin köklerinde ve rizosferinde ve dökme toprağa köklerin ve kimyasal türlerin korunmasına izin verir. Bu çalışmada yöntem, pirincin rizosferinde(Oryza sativa L.) Fe ve Mn oksitler ve bitki besin maddeleri ile spesifikasyon ve birlikte lokalizasyon olarak değerlendirilmek için kullanılmıştır. Pirinç, Delaware Üniversitesi'ndeki RICE Tesisinde, As ve Cd alımını pirinç tanesine düşürmek amacıyla çeşitli toprak ve su yönetimi koşullarında pirinç yetiştirmek için 30 pirinç çeltik mezoko...

Örnek bir tür olarak pirinç(Oryza sativa L.) kullanarak sulak alanlardan bozulmamış kökleri ve çevresindeki rizosfer toprağını örnekleme, koruma ve bölümleme protokolünü açıklıyoruz. Numune korunduktan sonra senkrotron X-ışını floresan (XRF) kimyasal spektrasyon görüntüleme gibi elementel görüntüleme teknikleri kullanılarak analiz edilebilir.

Elementel Görüntüleme için Sulak Alan Köklerini ve Rizosferleri Koruma Yöntemi

Roots extensively interact with their soil environment but visualizing such interactions between roots and the surrounding rhizosphere is challenging. The ...

Bu yöntem, araştırmacılara elementel görüntüleme teknikleri için sucul bitki köklerini, çevredeki rizosferi ve dökme toprağı hazırlamak için yeni bir yol sağlar. Bu yöntemin ana avantajı, nispeten hızlı ve uygun fiyatlı olması ve aynı zamanda ilgi çekici unsurların dağılımını ve spekülasyonunu doğru bir şekilde korumasıdır. Bu teknik, tarım sistemlerindeki besin maddelerinden fettermiasyon sistemlerindeki kirleticilerin kaderine ve taşınmasına kadar birçok element ve bitki sistemi ile ilgili soruları yanıtlamak için kullanılabilir.Örnekleme için kök sisteminin istenen alanına veya alanlarına dikkat ederken hızlı bir şekilde çalıştığınızdan emin olun. Ve kök sistemi başına birden fazla örnek alın. Çarpma dondurma ekipmanını bir deneye hazırlamak için, sıvı nitrojen tutabilen temiz bir soğutucuya yatay olarak iki, beşe beşe beş bakır blok yerleştirin.Ve uygun KKD'yi giyerek, blokları batırmak için soğutucuya yeterli sıvı nitrojen dökün. Köpürtücülük azaldığında, bir bakır bloğun her ucuna bir ara yerleştirin. Daha sonra, maşa ve kriyojenik eldivenler kullanarak, numune yerindeyken geri almayı kolaylaştırmak için diğer bakır blogunu ucunda bekletin.Örneği toplamak için, bir saksı bitkisi kullanın veya ıslak topraktan istenen bitkiyi ve rizosferi çıkarmaya başlamak için bir kürek kullanın, kazılmış deliğin istenen kök hacminden çok daha büyük olmasına dikkat edin. İstenilen alan içindeki toprağı rahatsız etmemeye dikkat ederek fazla toprağı kesmek için çelik bir bıçak kullanın. İstenilen alanlar ulaştığında, yaklaşık üçe üçe üç iki santimetre kök küpü kesin ve küpü hemen yatay bakır blok üzerindeki iki ara çubuğun arasına yerleştirin.Numunenin bir slam donması için, dikey bakır bloğu yaklaşık beş dakika boyunca ara öğelere yerleştirmek için kriyojenik eldivenleri kullandı. Köpürme azaldığında, slam donmuş rizosfer küpü örneğini önceden etiketlenmiş bir alüminyum folyo kare parçasına aktarın. Toprak küplerini dondurmak için, donduran kurutucu uygun vakum basıncına ve sıcaklığına ulaştığında, temiz ve asitle yıkanmış 50 mililitrelik tüp için bir donmuş rizosfer küpü örneği yerleştirin veya doğrudan dondurucu kurutucuya yerleştirin ve tozun vakum pompasına girmesini önlemek için temiz bir tek kullanımlık mendil kullanın.Numuneleri kuruyana kadar en az birkaç gün dondurularak kurutucu kabına yerleştirin. Dokular dondurularak kurutulduğunda, küpleri bir vakum kurutucunun içindeki etiketli formlara yerleştirmeden önce toprak küplerini analiz için uygun bir boyuta kurutulmuş bir çelik bıçak kullanın. Üreticinin talimatlarına göre epoksiyi hazırladıktan sonra, epoksi numuneyi tamamen kaplayana kadar toprağın bir tarafındaki forma yavaşça epoksi eklemek için bir damlalık kullanın.Epoksi toprağı ıslattıkça toprak renk olarak kararacak. Formlar epoksi ile doldurulduktan sonra, kurutucuyu kapatın ve vakumun açın. İlk bir ila dört saat boyunca her 30 ila 90 dakikada bir epoksi seviyesini kontrol edin ve gerekirse ek epoksi ekleyin.Epoksi sertleştikten sonra numuneyi çıkarın. Gömmeden sonra, numuneyi kesmek için elmas bıçak duyarlı ıslak testere kullanın. Önceki kesimde kök elde edilirse numuneyi farklı bir yönde kesin.Kırpmadan sonra, her numunenin kesilmiş tarafını kum boyutu başına 30 saniye boyunca kademeli olarak daha ince zımpara kağıdı ile manuel olarak zımparalayın. Bu şekilde, toprak matrisi içinde enine kesitler olarak birkaç kök çapı gözlenebilir. Kökler farklı kalite seviyeleri gösterebilir.Örneğin, bu görüntüde, iyi korunmuş bir kök, dondurarak kurutma işlemi tarafından bozulmuş bir kök ve ince kesit işlemi sırasında çekilen bir kök gözlemlenebilir. Bu kök enine kesitinin uzunlamasına bölümde lateral kök ile senkrotron x-ışını floresan görüntüleme ile analiz edilmesi demir, manganez ve arsenik tespitine izin verir. Toprak içindeki demirin varlığı ve demir plaktaki kökün çevresi de ışık mikrografi görüntülerinde görülebilir.Manganez, yanal kökün korteksinde benzersiz bir şekilde bulunur, aynı zamanda demir plak içindeki bazı alanlarda yeşil-mavi bir ton olarak demir ile birlikte lokalize eder. Arsenik çoğunlukla primer kökün vaskülatında birleşen lateral kökün vaskülatında bulunur. Kimyasal spektasyon görüntüleme, arsenik türlerinin lokalizasyonunda değişkenlik olduğunu ortaya koymaktadır.Bu üç renkli arsada gözlemlendiği gibi, arsenit ve arsenit glutatyon vaskülasyonda yakından ilişkilidir, arsenat ise öncelikle demir plakla ilişkili olarak kökün dış kısmı içinde lokalize olur. Örnek toplamadan önce, elementel görüntüleme için kök sisteminin istenen kısmını belirleyin. Bu, kaldırılan kök anahtarın konum yönünü belirler.Bu protokolü takiben, örnekler, belirli araştırma sorularına, ilgi çekici unsurlara veya mevcut enstrümantasyona bağlı olarak çeşitli teknikler kullanılarak mikron ölçeğinde veya kaba olarak görüntülenebilir.

a-method-to-preserve-wetland-roots-rhizospheres-for-elemental

Research

JoVE Journal

Environment

Çevre

Burada, yüksek numerik diyafram açıklığı hedefleri ve daldırma ortamı olarak perflorodekalin kullanılarak 3 güne kadar kök ve hipokotil gelişiminin yüksek çözünürlüklü konfokal zaman atlamalı görüntülemesi için basit bir teknik sunulmuştur.

Kök ve Hipokotil Gelişimin Uzun Süreli Konfokal Görüntülemesi için Basit Bir Oda

Bir deneysel protokol toprak bitki kök sistemleri RGB ve hyperspectral görüntüleme ile yetiştirilen değerlendirilmesi için sunulmaktadır. RGB görüntü zaman serisi hyperspectral chemometric bilgilerle tarar kombinasyonu bitki kök dynamics anlayışlar en iyi duruma getirir.

RGB ve bitki fenotipleme ve fizyolojik araştırma için spektral kök görüntüleme: deneysel kurulum ve iletişim kuralları görüntüleme

Bu makalede ekosistem bitkiler ve son derece kontrollü laboratuvar koşullarında bitki-mikrop etkileşimleri sağlayan aygıtlar (EcoFABs) imalatı için detaylı iletişim kurallarını açıklar.

Ekosistem imalat (EcoFAB) protokolleri laboratuvar ekosistemlerinin bitki-mikrop etkileşimleri çalışma için tasarlanmış inşası için

Burada, toprak, rizosferde ve kök endosphere microbiomes amplicon sıra verileri elde etmek için bir protokol açıklayın. Bu bilgiler kompozisyon ve çeşitlilik bitki ilişkili mikrobiyal toplulukların araştırmak için kullanılan ve bitki türlerinin geniş bir kullanım için uygundur.

Kök Microbiome keşfetmek: toprak, rizosferde ve kök Endosphere bakteriyel topluluk verileri ayıklama

Kazı alanından bitki köklerinin yanı sıra endosphere, rizosferde ve toprak içine örnekleri işleme DNA ekstraksiyon ve veri analiz yöntemleri de dahil olmak üzere ayrıntılı olarak açıklanmıştır. Bu kağıt bu teknikleri toprak, endosphere ve rizosferde microbiomes çalışma için kullanmak diğer laboratuvarlar sağlamak için tasarlanmıştır.

Yalıtım ve mikrobiyal topluluklarda toprak, rizosferde ve kökleri çok yıllık çim deneylerde Analizi

Görselleştirme ve kök büyüme in situ ölçme son derece zordur. Biz kök gelişimi ve nükleer silahların yayılmasına karşı zaman içinde yanıt-e doğru besin zenginleştirme izlemek için özelleştirilebilir rhizobox Yöntem mevcut. Bu yöntem kök plastisite yanıt bir organik azot kaynağı olarak Mısır genotypic farklılıklar analiz etmek için kullanılır.

Kök büyüme ve yerelleştirilmiş besin kavramaları görselleştirmek için en iyi duruma getirilmiş bir Rhizobox Protokolü

Bu protokol, kütle spektrometresi görüntüleme ile birlikte ince filmlerdeki (DGT) difüzif gradyanlar kullanılarak birden fazla labile inorganik besin ve kirletici çözünür türünün mm altı 2D görselleştirilmesi için bir iş akışı sunar. Karasal bitkilerin rizosferinde solutların nicel haritalandırılması için çözünür örnekleme ve yüksek çözünürlüklü kimyasal analiz ayrıntılı olarak açıklanmıştır.

Topraktaki Labile, Inorganik Bitki Besinleri ve Kirleticilerin İki Boyutlu Görselleştirilmesi ve Nicelleştirilmesi

Buradaki protokol, arbusküler mikorizal kolonizasyon paternlerinin değerlendirilmesi için yöntemleri ve iki türün köklerindeki stratejiyi açıklamaktadır: Zea mays ve Festuca rubra. MycoPatt yönteminin kullanılması, parametrelerin hesaplanmasına, mikorizal yapıların dijital verilere dönüştürülmesine ve köklerdeki gerçek konumlarının haritalandırılmasına izin verir.

Festuca rubra ve Zea mays'ın Köklerinde Kolonizasyon Kalıplarını ve Mantar Stratejilerini Keşfetmek İçin Bir Araç Olarak Mikorizal Haritalar

Arabidopsis ve Medicago'nun kök sistem mimarisini (RSA) incelemek için basit laboratuvar araçları kullanıyoruz. Fideler ağ üzerinde hidroponik olarak yetiştirilir ve RSA'yı ortaya çıkarmak için bir sanat fırçası kullanılarak yayılır. Görüntüler tarama veya yüksek çözünürlüklü bir kamera kullanılarak alınır, daha sonra özellikleri haritalamak için ImageJ ile analiz edilir.

Bitki kök sistemi mimari özelliklerini haritalamak için basit bir protokol

Mikrobiyota ve biyofilm ile birlikte bitki ve mantar biyokütlesi içeren oldukça heterojen ve hassas numuneleri görselleştirmek için optimize edilmiş bir Taramalı Elektron Mikroskobu protokolü öneriyoruz. Bu protokol, mikrobiyota organizasyonunun mekansal boyutlarının tanımlanmasına izin verir.

Attine Karıncalarının Bahçelerinin Mikrobiyotası: Elektron Mikroskobunu Tarayarak Mikrobiyal Bir Manzarayı Görselleştirmek

Öğrenin sulak bitki kökleri ve rizosfer için slam-dondurma ve liyofilizasyon yöntemiyle elementel görüntüleme hazırlama tekniğini. Bu hızlı ve uygun maliyetli protokol, demir, manganez ve arsenik gibi elementlerin dağılımını ve spesiyasyonunu koruyarak bitki-toprak etkileşimlerinin detaylı incelenmesini sağlar.

Elementel Görüntüleme için Sulak Alan Köklerini ve Rizosferleri Koruma Yöntemi

Daha fazla video keşfet