Name: 5-Etil-2-Deoksiroridin/Fosfo-Histon H3 Drosophila Nöral Kök Hücrelerde Hücre Döngüsü İlerleme Analizi için Çift Etiketleme Protokolü (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-05-04T15:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 34 s
Description: Öğrenin, Drosophila nöral kök hücrelerinde EdU ve pH3 çift etiketleme ile hücre döngüsü analizi yapmayı. Bu protokol G1, S ve M fazlarını ayırt ederek genetik mutasyonların etkilerini değerlendirmeye yardımcı olur.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma, İsviçre Ulusal Bilim Vakfı (proje hibe 31003A_173188; www.snf.ch) ve Bern Üniversitesi'nden (www.unibe.ch) BS'ye fon sağlanmasıyla desteklendi. Fon sağlayıcılar çalışma tasarımı, veri toplama ve analiz, yayınlama kararı veya makalenin hazırlanmasında hiçbir rol oynamamışlardır.

1. Click-it EdU tahlilleri için reaktiflerin ve stokların hazırlanması
NOT: Kit ve kit ile birlikte verilen reaktifler hakkında ayrıntılı bilgi için Malzeme Masası ve Tablo 1'e bakın.
<ol><li>Çözümleri hazırlamadan önce şişeleri oda sıcaklığına getirin.</li>
	<li>2 mL dimetilsüllfoksit (DMSO, bileşen C) ekleyerek 10 mM EdU (bileşen A) stok çözeltisi hazırlayın. İyice karıştırın ve -20 °C'de saklayın.</li>
	<li>70μL DMSO (bileşen C) ekleyerek Alexa Fluor 647-azide (bileşen B) çalışma çözeltisi hazırlayın. İyice karıştırın ve -20 °C'de saklayın.</li>
	<li>Bu çözeltinin 4 mL'lik kısmını 36 mL deiyonize su ile karıştırarak 1x Click-iT EdU reaksiyon tamponu (bileşen D) hazırlayın. Kalan çözeltiyi 2-6 °C'de saklayın.</li>
	<li>2 mL deiyonize su ekleyerek Click-iT EdU tampon katkı maddesinin (bileşen F) 10x stokunu (200 mg/mL) yapın. İyice karıştırın ve -20 °C'de saklayın.</li>
	<li>Hoechst 33342'i (G bileşeni) 2-6 °C'de saklayın. DMSO'yu (bileşen C) -20 °C'de bir kurutucuda saklayın. NOT: Eldivenler DMSO ve Hoechst'i idare etmek için kullanılmalıdır.</li>
</ol>2. Üçüncü instar larva beyinlerinin diseksiyonu ve EdU şirketleşmesi
NOT: Beyin diseksiyonları protokolü daha önce tanımlanmıştır12. Diseksiyonlara başlamadan önce, 2.6 ve 3.1'de açıklandığı gibi yeterli miktarda EdU ve PFA çözeltisinin hazırlandığından ve çözüldüğünden emin olun.
<ol><li>25,6 g Na 2 HPO 4,7H 2 0, 80 g NaCl,2g KCl ve2gKH2 PO4 ila 1 L deiyonize su ekleyerek 10x Fosfat tamponlu salin (PBS) hazırlayın. pH'ı 7.4'e ayarlayın ve daha sonra deiyonize suda 1x'lik bir çözelti hazırlayın.</li>
	<li>Schneiders diseksiyon ortamını (SM) bir camın ardışık iki çökemine (3 veya 9) çöken cam spot plaka ekleyin. Bir sonraki ardışık depresyona 1x PBS ekleyin.</li>
	<li>Bir çift toparlama kullanarak, dolaşan üçüncü instar larvalarını seçin ve sinek yiyecek kalıntılarını temizlemek için PBS ile ıslanmış bir dokuya yerleştirin. Larvaları PBS ile depresyona ve daha sonra SM ile ardışık depresyona yerleştirin.</li>
	<li>Bir çift ince kümes gücü kullanarak, larvaların alt gövdesinin3/4'lerini çıkarın.<ol>
<li>Larva ağız kancalarını bir çift ön uçla hafifçe tutun ve diğer ucundaki manikürleri diğer çift asalarla tutun.</li>
		<li>Ağız kancalarını içe doğru iterek ve aynı anda diğer ucundaki dokuyu soyarak larva başını ters çevirin.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Ekli hayal diskleri ile larva beynini gözlemleyin. Beyne bağlı diğer dokuları çıkarın ve beyni SM ile bir sonraki ardışık depresyona aktarın.</li>
	<li>10 mM EdU stok çözümünü çözün. Bu 10 mM stoğu SM'de seyrelterek 100 μM'lik bir çözelti hazırlayın.</li>
	<li>Pyrex plakasındaki başka bir çökemde bu 100 μM EdU+SM çözeltisinin 100 μL'sini ekleyin. 25 °C'de 2 saat boyunca 100 μL 100 μM EdU+SM çözeltisinde ~5-10 parçalanmış beyni kuluçkaya yatırın. NOT: NB'ler ~2 saat içinde bir kez bölündükçe, bu protokol bir tam hücre döngüsünü analiz etmeyi amaçlamaktadır. Sadece daha ileri adımlar için sağlam beyinler kullanın. Diseksiyon sırasında hasar gören beyinleri atın.</li>
</ol>3. Fiksasyon ve immünostaining
<ol><li>Duman kaputunda %4 paraformaldehit (PFA) çözeltisi hazırlayın.<ol>
<li>Manyetik bir karıştırıcıya yerleştirilen bir behere 80 mL 1x PBS'ye 4 g paraformaldehit tozu ekleyin ve 60 °C'ye ısıtın. PFA'yı çözmek için birkaç damla 1 N NaOH ekleyin. pH'ı kontrol edin ve gerekirse birkaç damla 1 M HCl ile 7.0'a ayarlayın.</li>
		<li>1x PBS ile ses seviyesini 100 mL'ye ayarlayın. PFA çözeltisini aliquot ve 2-6 ° C'de 1 aya kadar saklayın. Larva beyni gibi büyük dokuların verimli bir şekilde sabitlenmesi için PFA çözümüne% 0.3 iyonik olmayan deterjan ekleyin (Malzeme Tablosunabakın).</li>
	</ol>
</li>
	<li>EdU dahil edildikten sonra, beyinleri% 4 PFA içeren 0.6 mL mikrosantrifüj tüplerine aktarın. 15 dakika boyunca bir besleyici üzerinde oda sıcaklığında kuluçkaya yatırın. Laboratuvar tezgahındaki tüpe dokunun, böylece beyinler tüpün altına yerleşir.</li>
	<li>PFA'yı çıkarın ve oda sıcaklığında PBS + %0,3 iyonik olmayan deterjan (PBST) ile 3 kez yıkayın. Her yıkamanın bir besleyicide en az 10 dakika sürdüğüne emin olun. Son yıkamadan sonra PBST'yi çıkarın, blokaj çözeltisi ekleyin (PBST + % 5 sığır serum albümini) ve oda sıcaklığında 30 dakika kuluçkaya yatırın.</li>
	<li>PBST'de Anti-Miranda antikor (1:250) ve anti-pH3 antikorlarını (1:200) seyreltin (her ikisi de aynı tüpteki antikorlar). Engelleme tamponu çıkarın ve birincil antikor çözeltisini ekleyin. Bir besleyici üzerinde 2-6 ° C'de gece boyunca kuluçkaya yatırın. NOT: Miranda, CB NB'lerinde bulunan bir membran proteinidir. CB bölgesindeki bu büyük yuvarlak hücreleri tanımlamaya yarar13.</li>
	<li>Birincil antikor çözeltisini çıkarın ve PBST ile 3 kez yıkayın. Her yıkamanın oda sıcaklığında bir somun makinesinde 10 dakika sürdüğüne emin olun.</li>
	<li>PBST'ye 1:500 seyreltilmiş Alexa Fluor 488 anti-Rabbit ve Alexa Fluor 568 anti-Rat ekleyerek ikincil antikor çözeltisi hazırlayın. PBST'yi çıkarın ve incelenmiş beyinlere ikincil antikor çözeltisini ekleyin. Karanlıkta 2-6 °C'de, bir besleyicide gece boyunca kuluçkaya yatırın ve PBST ile 3 kez yıkayın (adım 3.5).</li>
</ol>4. EdU tespiti, DNA boyama ve montaj
<ol><li>EdU algılama kokteylini hazırlamak için, bileşenleri 1,5 mL'lik bir tüpte karıştırın (bkz. Tablo 2).</li>
	<li>Son yıkamadan sonra (adım 3.6), PBST'yi çıkarın ve EdU algılama kokteylini parçalanmış beyinlere ekleyin. Bir fındık makinesinde 30 dakika karanlıkta oda sıcaklığında kuluçkaya yatırın. PBST ile her biri 10 dakika boyunca karanlıkta 2 kez yıkayın.</li>
	<li>DNA boyama için, 5 μg/mL çözeltisi hazırlamak için PBST'de Hoechst 33342 (G bileşeni) 1:2.000'i seyreltin.</li>
	<li>İkinci yıkamadan sonra PBST'yi çıkarın (adım 4.2) ve parçalanmış beyinlere 500 μL 5 μg/ mL Hoechst çözeltisi ekleyin. Karanlıkta 10 dakika kuluçkaya yaslanın. Hoechst'i çıkarın ve PBST ile bir kez 10 dakika yıkayın.</li>
	<li>Tüpü laboratuvar tezgahına dokunun ve beyinlerin sakinleşmesine izin verin. PBST'yi tüpten çıkarın, ancak geride sadece 50-100 μL bırakın.</li>
	<li>200 μL'lik bir mikropipette ucun ucunu kesin ve beyinleri dikkatlice temiz bir cam kaydırağa aktarın. Filtre kağıdı şeritleriyle şişirerek slayttan fazla PBST'yi çıkarın. Filtre kağıdının beyinlere dokunmasına izin vermemeye dikkat edin.</li>
	<li>Bir damla suda çözünür, floresan olmayan montaj ortamını beyinlere koyun ve beyinleri, ventral sinir kordonu kaydırağa, loblar yukarı bakacak şekilde yönlendirin. Beyinleri tek bir dosyada düzenleyin, böylece beyinleri seri olarak görüntüleyebilme daha kolaydır.</li>
	<li>Beyinlerin üzerine hafifçe bir kapak kılıfı yerleştirin. Slaydı gece boyunca 2-6 °C'ye yerleştirin. NOT: Montaj ortamı gece depolamada sertleşir, böylece kapak kapağını oje ile kapatmaya gerek yoktur.</li>
</ol>5. Görüntüleme
NOT: Bu protokolde kullanılan lazer tarama mikroskobu ve yağ daldırma hedefi hakkında ayrıntılı bilgi için Malzeme Tablosuna bakın.
<ol><li>Edinme yazılımından 63x hedefiniseçin.</li>
	<li>Dokuyu göz merceğinden bulmayı kolaylaştırmak için monte edilmiş beyinlerin hemen üstündeki kapak kapağına bir damla daldırma yağı koyun.</li>
	<li>DAPI/Hoechst 33342 kanalını kullanarak beyni göz merceğinden bulun ve ardından yazılımdaki alım moduna geçin.</li>
	<li>Hoechst 33342 (DNA), Alexa Fluor 488 (pH3), Alexa Fluor 568 (Miranda) ve Alexa Fluor 647 (EdU) görüntü için 4 kanal ayarlayın. Seçilen boyalar için heyecan lazerlerini ve emisyon filtrelerini otomatik olarak ayarlayan boya asistanı aracını kullanın.</li>
	<li>Görüş alanını tüm beyin lobını kapsayacak şekilde ayarlayın. 0,8 μm aralıklı z yığınları elde ederek beyin lobunun tüm hacmini görüntüleyin. Görüntüleme oturumundaki tüm görüntüleri *.lif kitaplığı biçiminde depolayın.</li>
</ol>6. Görüntü analizi
NOT: Aşağıdaki adımda, elde edilen görüntülerin analizi ve hücrelerin G0/G1 fazı, S fazı, S>G2/M (S'den G2/M'ye ilerleme) ve ImageJ yazılımını kullanarak M fazına nasıl sıralanılacağı açıklanmaktadır.
<ol><li>Fiji'yi (Fiji, ImageJ) aşağıdaki URL'den indirin: https://fiji.sc/. Fiji'yi açın, sonra .lif dosyalarını sürükleyip Fiji'ye bırakın. NOT: Fiji, imagej'ın önceden yüklenmiş olarak gelen bir sürümüdür14. .lif dosyalarını Fiji'ye aktarmak, .lif dosyalarını işlemek için gereken Bio-formatları eklentisini açacaktır. Nikon mikroskobundan oluşturulan nd2 dosyaları gibi diğer bazı mikroskop markalarından oluşturulan görüntü dosyalarını açmak için biyo-formatlar eklentisi de gereklidir. Bu eklenti Fiji ile önceden yüklenmiş olarak gelir.</li>
	<li>Yığın görüntüleme sekmesinden Veri tarayıcısı'nı seçin ve biyo-formatlar eklentislerindeki bellek yönetimi sekmesinden sanal yığını kullanın. NOT: 8-10 beyinden z-yığınları olan Lif dosyaları genellikle 300-400 megabayt boyutundadır. Düşük RAM'li bilgisayarlarda, bu tür birkaç dosyayı açmak ImageJ'deki mevcut RAM'i hızla düşürebilir ve daha fazla görüntü işlenmesini önleyebilir. Sanal yığın 'salt okunur', işleme için yüksek RAM'e ihtiyaç duymaz ve fiji'ye büyük veri kümeleri yüklemek için ideal bir seçenektir.</li>
	<li>ImageJ'de görüntülenen çok kanallı görüntüyü gözlemleyin. Görüntü | renk | kanalları aracını kullanarak menü çubuğundan kanalların renginideğiştirin. Miranda etiketli NB'leri CB bölgesindeki büyük yuvarlak hücreler olarak gözlemleyin.</li>
	<li>NB'yi iki kez saymaktan kaçınmak için her NB'nin üzerine elips aracını kullanarak bir ilgi alanı (ROI) çizin.<ol>
<li>ImageJ menü çubuğundan | araçları çözümle | Yatırım getirisi yöneticisi. Geçerli z bölümündeki tüm NB'leri işaretleyin ve her hücreyi işaretledikten sonra t tuşuna basın.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Geçerli z bölümündeki tüm NB'ler işaretlendikten sonra, kanalları pH3 ve EdU olarak değiştirin ve EdU pozitif NB'lerin, pH3 pozitif NB'lerin, hem EdU hem de pH3 için pozitif boyama NB'lerin sayısını ve her iki işaretleyici için de NB'lerin lekelenmediğini manuel olarak sayın.</li>
	<li>Sonraki z bölümlerinde NB'leri arayın, eski ROI'leri silin ve NB'leri farklı yığınlarda saymak için yeni ROI'ler ekleyin.</li>
	<li>Aşağıdaki sütunlarla bir elektronik tablo hazırlayın: 1. EdU- pH3-: Bu bölüm, hücre döngüsünün G0/G1 aşamasında bulunan çift negatif hücreleri temsil eder; 2. EdU+: bu kategorideki hücreler EdU'yu bünyesine katmıştır ve DNA replikasyonu (S fazı) geçirmektedir; 3. EdU+ pH3+: bu çift pozitif hücreler S fazını tamamlamış ve G2 veya M fazı aşamasına ilerlemiş; 4. pH3+: Bu NB'ler mitoz geçiriyor.</li>
	<li>Her lob için yukarıdaki 4 kategorinin tümlerinde bulunan NB'lerin yüzdelerini hesaplayın. Her kategorideki NB yüzdeleri için havuza alınan verileri gösteren elektronik tablo yazılımını kullanarak bir çubuk grafik hazırlayın.</li>
</ol>

<ol><li>Harashima, H., Dissmeyer, N., Schnittger, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+cycle+control+across+the+eukaryotic+kingdom%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+in+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">Cell cycle control across the eukaryotic kingdom.</a> Trends in Cell Biology. 23 (7), 345-356 (2013).</li>
<li>Vermeulen, K., Van Bockstaele, D. R., Berneman, Z. N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+cell+cycle%3A+a+review+of+regulation%2C+deregulation+and+therapeutic+targets+in+cancer%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Proliferation%22%5BJournal%5D)">The cell cycle: a review of regulation, deregulation and therapeutic targets in cancer.</a> Cell Proliferation. 36 (3), 131-149 (2003).</li>
<li>Pardee, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+restriction+point+for+control+of+normal+animal+cell+proliferation%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+the+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">A restriction point for control of normal animal cell proliferation.</a> Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America. 71 (4), 1286-1290 (1974).</li>
<li>Gogendeau, D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Aneuploidy+causes+premature+differentiation+of+neural+and+intestinal+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Communications%22%5BJournal%5D)">Aneuploidy causes premature differentiation of neural and intestinal stem cells.</a> Nature Communications. 6, 8894(2015).</li>
<li>Barnum, K. J., O'Connell, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+cycle+regulation+by+checkpoints%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+in+Molecular+Biology%22%5BJournal%5D)">Cell cycle regulation by checkpoints.</a> Methods in Molecular Biology. 1170, 29-40 (2014).</li>
<li>Gratzner, H. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Monoclonal+antibody+to+5-bromo-+and+5-iododeoxyuridine%3A+A+new+reagent+for+detection+of+DNA+replication%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Monoclonal antibody to 5-bromo- and 5-iododeoxyuridine: A new reagent for detection of DNA replication.</a> Science. 218 (4571), 474-475 (1982).</li>
<li>Salic, A., Mitchison, T. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+chemical+method+for+fast+and+sensitive+detection+of+DNA+synthesis+in+vivo%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+National+Academy+of+the+Sciences+of+the+United+States+of+America%22%5BJournal%5D)">A chemical method for fast and sensitive detection of DNA synthesis in vivo.</a> Proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America. 105 (7), 2415-2420 (2008).</li>
<li>Kim, J. Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+value+of+phosphohistone+H3+as+a+proliferation+marker+for+evaluating+invasive+breast+cancers%3A+A+comparative+study+with+Ki67%5BTitle%5D)+AND+%22Oncotarget%22%5BJournal%5D)">The value of phosphohistone H3 as a proliferation marker for evaluating invasive breast cancers: A comparative study with Ki67.</a> Oncotarget. 8 (39), 65064-65076 (2017).</li>
<li>Homem, C. C., Knoblich, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Drosophila+neuroblasts%3A+a+model+for+stem+cell+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Drosophila neuroblasts: a model for stem cell biology.</a> Development. 139 (23), 4297-4310 (2012).</li>
<li>Daul, A. L., Komori, H., Lee, C. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((EdU+%285-ethynyl-2%27-deoxyuridine%29+labeling+of+Drosophila+mitotic+neuroblasts%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harbor+Protocols%22%5BJournal%5D)">EdU (5-ethynyl-2'-deoxyuridine) labeling of Drosophila mitotic neuroblasts.</a> Cold Spring Harbor Protocols. 2010 (7), 5461(2010).</li>
<li>Chippalkatti, R., Egger, B., Suter, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mms19+promotes+spindle+microtubule+assembly+in+Drosophila+neural+stem+cells%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Genetics%22%5BJournal%5D)">Mms19 promotes spindle microtubule assembly in Drosophila neural stem cells.</a> PLoS Genetics. 16, 1008913(2020).</li>
<li>Daul, A. L., Komori, H., Lee, C. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Immunofluorescent+staining+of+Drosophila+larval+brain+tissue%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harbor+Protocols%22%5BJournal%5D)">Immunofluorescent staining of Drosophila larval brain tissue.</a> Cold Spring Harbor Protocols. (7), (2010).</li>
<li>Mollinari, C., Lange, B., Gonzalez, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Miranda%2C+a+protein+involved+in+neuroblast+asymmetric+division%2C+is+associated+with+embryonic+centrosomes+of+Drosophila+melanogaster%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+of+the+Cell%22%5BJournal%5D)">Miranda, a protein involved in neuroblast asymmetric division, is associated with embryonic centrosomes of Drosophila melanogaster.</a> Biology of the Cell. 94 (1), 1-13 (2002).</li>
<li>Schindelin, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fiji%3A+an+open-source+platform+for+biological-image+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Methods%22%5BJournal%5D)">Fiji: an open-source platform for biological-image analysis.</a> Nature Methods. 9 (7), 676-682 (2012).</li>
<li>Nag, R. N., Niggli, S., Sousa-Guimaraes, S., Vazquez-Pianzola, P., Suter, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mms19+is+a+mitotic+gene+that+permits+Cdk7+to+be+fully+active+as+a+Cdk-activating+kinase%5BTitle%5D)+AND+%22Development%22%5BJournal%5D)">Mms19 is a mitotic gene that permits Cdk7 to be fully active as a Cdk-activating kinase.</a> Development. 145 (2), (2018).</li>
<li>Cabernard, C., Doe, C. Q. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live+imaging+of+neuroblast+lineages+within+intact+larval+brains+in+Drosophila%5BTitle%5D)+AND+%22Cold+Spring+Harbor+Protocols%22%5BJournal%5D)">Live imaging of neuroblast lineages within intact larval brains in Drosophila.</a> Cold Spring Harbor Protocols. 2013 (10), (2013).</li>
<li>Hartenstein, V., Spindler, S., Pereanu, W., Fung, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+development+of+the+Drosophila+larval+brain%5BTitle%5D)+AND+%22Advances+in+Experimental+Medicine+and+Biology%22%5BJournal%5D)">The development of the Drosophila larval brain.</a> Advances in Experimental Medicine and Biology. 628, 1-31 (2008).</li>
<li>Hebar, A., Rutgen, B. C., Selzer, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((NVX-412%2C+a+new+oncology+drug+candidate%2C+induces+S-phase+arrest+and+DNA+damage+in+cancer+cells+in+a+p53-independent+manner%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">NVX-412, a new oncology drug candidate, induces S-phase arrest and DNA damage in cancer cells in a p53-independent manner.</a> PLoS One. 7, 45015(2012).</li>
<li>Wyllie, F. S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((S+phase+cell-cycle+arrest+following+DNA+damage+is+independent+of+the+p53%2Fp21%28WAF1%29+signalling+pathway%5BTitle%5D)+AND+%22Oncogene%22%5BJournal%5D)">S phase cell-cycle arrest following DNA damage is independent of the p53/p21(WAF1) signalling pathway.</a> Oncogene. 12 (5), 1077-1082 (1996).</li>
<li>Xu, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Inhibition+of+DNA+replication+and+induction+of+S+phase+cell+cycle+arrest+by+G-rich+oligonucleotides%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Biological+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Inhibition of DNA replication and induction of S phase cell cycle arrest by G-rich oligonucleotides.</a> Journal of Biological Chemistry. 276 (46), 43221-43230 (2001).</li>
<li>Duronio, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Developing+S-phase+control%5BTitle%5D)+AND+%22Genes+%26+Development%22%5BJournal%5D)">Developing S-phase control.</a> Genes & Development. 26 (8), 746-750 (2012).</li>
<li>Turrero Garcia, M., Chang, Y., Arai, Y., Huttner, W. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((S-phase+duration+is+the+main+target+of+cell+cycle+regulation+in+neural+progenitors+of+developing+ferret+neocortex%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Comparative+Neurology%22%5BJournal%5D)">S-phase duration is the main target of cell cycle regulation in neural progenitors of developing ferret neocortex.</a> Journal of Comparative Neurology. 524 (3), 456-470 (2016).</li>
<li>Pereira, P. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantification+of+cell+cycle+kinetics+by+EdU+%285-ethynyl-2%27-deoxyuridine%29-coupled-fluorescence-intensity+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Oncotarget%22%5BJournal%5D)">Quantification of cell cycle kinetics by EdU (5-ethynyl-2'-deoxyuridine)-coupled-fluorescence-intensity analysis.</a> Oncotarget. 8 (25), 40514-40532 (2017).</li>
<li>Sakaue-Sawano, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualizing+spatiotemporal+dynamics+of+multicellular+cell-cycle+progression%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">Visualizing spatiotemporal dynamics of multicellular cell-cycle progression.</a> Cell. 132 (3), 487-498 (2008).</li>
<li>Zielke, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fly-FUCCI%3A+A+versatile+tool+for+studying+cell+proliferation+in+complex+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Reports%22%5BJournal%5D)">Fly-FUCCI: A versatile tool for studying cell proliferation in complex tissues.</a> Cell Reports. 7 (2), 588-598 (2014).</li>
<li>Shen, Y., Vignali, P., Wang, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+profiling+cell+cycle+by+flow+cytometry+using+concurrent+staining+of+DNA+and+mitotic+markers%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protocol%22%5BJournal%5D)">Rapid profiling cell cycle by flow cytometry using concurrent staining of DNA and mitotic markers.</a> Bio-protocol. 7 (16), 2517(2017).</li>
<li>Berger, C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((FACS+purification+and+transcriptome+analysis+of+drosophila+neural+stem+cells+reveals+a+role+for+Klumpfuss+in+self-renewal%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Reports%22%5BJournal%5D)">FACS purification and transcriptome analysis of drosophila neural stem cells reveals a role for Klumpfuss in self-renewal.</a> Cell Reports. 2 (2), 407-418 (2012).</li>
<li>Harzer, H., Berger, C., Conder, R., Schmauss, G., Knoblich, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((FACS+purification+of+Drosophila+larval+neuroblasts+for+next-generation+sequencing%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Protocols%22%5BJournal%5D)">FACS purification of Drosophila larval neuroblasts for next-generation sequencing.</a> Nature Protocols. 8 (6), 1088-1099 (2013).</li>
</ol>

Yazarlar rakip çıkarların olmadığını açıkladılar.

EdU şirketleşme ve hücre geçirgen azide ile sonraki 'tıklama' reaksiyonu, bu tekniğin daha önce kullanılan BrdU yöntemine göre pratik avantajlarını sunar7. Bununla birlikte, bu reaksiyon Cu(I) iyonları tarafından katalizöre edilir ve Click-it EdU kit üreticisi tarafından açıkça tavsiye edildiği gibi, bu bakır katalizörün varlığında birkaç boya kararsız olabilir. EdU algılama adımının gerçekleştirilmesinden sonra immünostaining deneyleri yapıldığı zaman, kırmızı kanal boyaları, Alexa Fluor 568 ve C...

Hücre bölünme döngüsü bir G1 fazı (ilk boşluk fazı), bir çoğaltıcı/S fazı, bir G2 (ikinci boşluk aşaması) ve bir M (mitotik) fazını içerir. Bu aşamalardan geçen hücre, sitoskeletal makinelerin hücresel transkripsiyonunda, çevirisinde ve yeniden düzenlenmesinde dramatik değişikliklere uğrar1,2. Gelişimsel ve çevresel ipuçlarına yanıt olarak, hücreler geçici olarak bölünmeyi ve sessiz hale gelebilir (G0) veya farklılaşabilir ve kalıcı olarak3bölmeyi durdurabilir. DNA hasarı gibi diğer senaryolar erken farklılaşmaya veya apoptoz3,4'eneden olabilir. Bu tür ipuçlarına yanıt, hücre bölünme döngüsünün bir sonraki aşamasına geçmeden önce temel hücresel süreçlerin bütünlüğünü sağlamak için bir gözetim sistemi görevi gören hücre döngüsü kontrol noktaları tarafından aracılık edilir5. Bu nedenle, DNA replikasyonunu düzenleyen genler, kontrol noktaları ve mitotik makineler üzerinde yapılan çalışmaların, mutant hücrelerde veya bu genlerin siRNA nakavtında oluşabilecek olası hücre döngüsü ilerleme kusurlarını analiz etmesi gerekir. Ayrıca, bu tür analizler genel hücre sağlığını ve ilaç tedavisine verilen hücresel yanıtları test etmek için kullanılabilir.
5-bromo-2'-deoksiyridin (BrdU), replikasyon sırasında DNA'ya dahil edilen bir timidin analogudur6. Bu yöntem, S fazındaki hücreleri tanımlamak için yoğun olarak kullanılmıştır. Bununla birlikte, hücreler daha sonra anti-BrdU antikorları kullanılarak BrdU'nun tespit edilmesine izin vermek için sert DNA denatürasyon prosedürlerine tabi tutulur6. Bu sert tedavi hücresel epitoplara zarar verebilir ve immünostainleme yoluyla numunenin daha fazla karakterizesini önleyebilir. EdU dahil ve daha sonra bakır katalize, 'tıklama reaksiyonu' ile küçük, hücre geçirgen, floresan etiketli azide boyaları ile tespit sert denatürasyon prosedürleri ihtiyacını ortadan kaldırır7. Bu nedenle, bu yöntem BrdU şirketleşme için daha pratik bir alternatif olarak ortaya çıkmıştır.
Ayrıca, pH3 mitotik / M faz hücreleri8için güvenilir bir işaretleyici olarak tanımlanmıştır. Histone H3, geç G2 fazında erken M fazına kadar fosforilize olan ve anafaz8'insonuna doğru fosforilasyondan arındırılan DNA ilişkili bir çekirdek histone proteinidir. Standart immünostaining protokolleri kullanılarak pH3'ün tespit edilmesi için çeşitli ticari antikorlar kullanılabilir. Bu nedenle EdU ve pH3'ün çift boyanması, S fazındaki ve M fazlı hücrelerin tespitini sağlayacaktır. Ek olarak, G1 ve erken G2 fazındaki hücreler her iki belirteç için de olumlu leke olmaz.
Drosophila nural kök hücreler veya nöroblastlar (NB'ler), hücrelerin asimetrik olarak bölünerek aynı kendini yenileyen NB ve farklılaşma için yazılmış bir ganglion ana hücre (GMC) ürettiği iyi karakterize bir kök hücre modeli sunar9. Ek olarak, çeşitli genetik araçlar ve NB'ye özgü antikorlar bu sistemi genetik manipülasyon ve canlı hücre görüntüleme için uygun hale getirir. Sonuç olarak, çeşitli çalışmalar asimetrik bölünmeleri ve hücre kaderini belirlemeyi düzenleyen genleri incelemek içinNB'lerdenyararlanmıştır 9 . Larva beyninin merkezi beyninde (CB) ve optik lobunda (OL) farklı NB popülasyonlarıvardır 9; Mevcut çalışmada CB NB'ler kullanılmıştır. Bu üçüncü instar larva CB NB'ler, mitotik mil montajlarını düzenleyen faktörleri incelemek için de uygun olan büyük hücrelerdir. Hücre döngüsü ilerleme kusurlarını analiz etmek için bir protokol bu tür çalışmalarda hayati bir araç olacaktır.
Daha önce yayınlanan protokoller, EdU dahil ve algılama10için çeşitli Alexa Fluor boyaları ile etiketlenmiş çeşitli reaksiyon bileşenleri ve azide boyaları sağlayan Click-iT EdU Alexa Fluor Hücre Çoğalma Kiti gibi ticari kitler kullandı. Bununla birlikte, bu tür kitlerle birlikte verilen reaktifler, genellikle ikincil antikorlarla kullanılan bazı floresan etiketlerle uyumlu değildir. Bu EdU tespit kiti (Alexa Fluor 647-konjuge azide boyası ile birlikte verilen Click-iT EdU Alexa Fluor Hücre Çoğalma Kiti) Drosophila üçüncü instar larva NB'lerinde test edildi ve NB'ler için bir belirteç olan pH3 ve Miranda'ya karşı antikorlarla birlikte boyama denendi. Ayrıca, NBs11'inplazma zarında Miranda etiketlemesinin tespiti için Alexa Fluor 568 veya Cy3 etiketli ikincil antikorlar kullanılmıştır. Ancak EdU saptanması sonrasında immün yetinme yapılırken bu sekonder antikorlarla beklenen sinyal yoğunluğu ve lekelenme paterni (yayınlanmamış sonuçlar) gözlenmedi.
EdU kuruluşu için, Daul ve meslektaşları tarafından açıklanan protokol, larvaların EdU ve bromofenol mavisi (BPB)10ile karıştırılmış Kankel-Beyaz ortamı ile beslenmesini gerektiriyor. Larvalar, larva bağırsağı yutulması üzerine mavi rengiyle görülebilen EdU ve BPB çivili yiyeceklerle beslenir. Bu yöntem Mms19 fonksiyon kaybı (Mms19 P)üçüncü instar larvalarında EdU dahil için kullanılmış olsa da, Mms19P larvaları görünüşe göre larva bağırsağinde neredeyse hiç mavi renk tespit edildiği için beslenmedi (yayınlanmamış sonuçlar). Mms19P larvaları sert gelişimsel deformiteler gösterir ve sonunda üçüncü başlangıç aşamasında tutuklanır. Bu bir şekilde üçüncü instar larvaların beslenme davranışını etkileyebilir ve EdU besleme protokolünü bu gibi durumlar için uygun hale getirebilir.
Mevcut literatürü inceledikten ve temel adımların standartlaştırılması üzerinde kapsamlı bir şekilde çalıştıktan sonra, Drosophila NBs'de EdU/ pH3 çift etiketleme için alternatif bir yaklaşım önerildi, bu da EdU'yu larvalara beslemeyi gerektirmez. Önceki bir çalışmada, NB'lerdeki hücre döngüsünü analiz etmek için çift EdU / pH3 boyama kullanıldı, ancak ayrıntılı bir protokol sunmadı4. Bu, bu yöntemi uygulamaya çalışan laboratuvarlar için gereksiz bir engel sunar. Ayrıca, çeşitli reaktiflerin EdU kiti ile uyumluluğunu değerlendirmek ve daha fazla optimizasyon yapmak zaman alıcı bir süreç olabilir. Bu makale, parçalanmış larva beyinlerinde EdU birleşmesini ve anti-pH3 antikorları ile immünostainingi kapsayan adım adım bir protokol sunar, ardından NB'leri dört ayrı kategoriye ayırmak için konfokal mikroskopi ve görüntü analizi: G0/G1 fazı, S fazı, S>G2/M (S'den G2/M'ye ilerleme) ve M fazı. En iyi duruma getirilmesi gereken adımlar özetlenir ve büyük veri kümelerinin görüntü analizi için ipuçları sağlanır. Ek olarak, vahşi tip NB'lerdeki EdU/pH3 okuması analiz edilir ve yakın zamanda hücre döngüsü gecikmesi gösterdiği bildirilen Mms19P NB'lerle karşılaştırılır11.

<table><tbody><tr><td>fly hisse senetleri</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>P{EPgy2}Mms19EY00797/TM3, Sb1 Ser1 (Mms19p)</td><td>Bloomington stok merkezi</td><td>#15477</td> Mms19&nbsp;+'<td>nın üçüncü ekzonuna P-elemanı ekleme</td></tr><tr><td>; Mms19::eGFP, Mms19p</td><td>Evde üretilen</td><td></td><td>eGFP etiketli Mms19 proteini, Mms19p arka planında ifade edilir</td></tr><tr><td>w1118</td><td>Bloomington stok merkezi</td><td>#3605</td><td>vahşi tip stok (w;+;+)</td></tr><tr><td>Birincil antikorlar</td><td></td><td></td><td>Seyreltme</td></tr><tr><td>Sıçan anti-Miranda</td><td>Abcam</td><td>Ab197788</td><td>1/250</td></tr><tr><td>Tavşan anti-pH3</td><td>Hücre Sinyali</td><td>9701</td><td>1/200</td></tr> <tr><td>< güçlü > İkincil antikorlar< / güçlü ></td><td></td><td></td><td></td></tr> <tr><td>Keçi anti-Sıçan Cy3</td><td>Jackson Immuno</td><td>112-165-167</td><td>1/150</td></tr><tr><td>Keçi anti-Sıçan Alexa Fluor 568</td><td>Invitrogen</td><td>A11077</td><td>1/500</td></tr><tr><td>Keçi anti-Tavşan Alexa Fluor 488</td><td>Invitrogen</td><td>A27034</td><td>1/500</td></tr> <tr><td>< güçlü > Reaktif / Kit< / güçlü></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Aqua Poly/Mount montaj ortamı</td><td>Polysciences Inc</td><td>18606-20</td><td></td></tr><tr><td>Click-it EdU birleştirme kiti, Alexa Flour 647</td><td>Thermo Fischer Scientific</td><td>C10340</td><td></td></tr><tr><td>Schneider' s Drosophila medium</td><td>Thermo Fischer Scientific</td><td>21720-024</td><td></td></tr><tr><td>Sığır serum albümini (BSA) fraksiyonu V</td><td>Merck</td><td>10735078001</td><td></td></tr><tr><td>Triton X-100</td><td>Fischer Scientific</td><td>9002-93-1</td><td>iyonik olmayan deterjan</td></tr><tr><td>Software</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Fiji (Imagej)</td><td>https://imagej.net/Fiji</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Leica Uygulama Paketi (LAS X)</td><td>Leica microsystems</td><td></td><td></td></tr><tr><td>PRISM</td><td>Graph pad yazılımı</td><td>Sürüm 5</td><td></td></tr><tr><td>Microsoft</td><td>Excel Microsoft office</td><td>2016</td><td></td></tr><tr><td>Equipment</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Leica TCS SP8 lazer taramalı konfokal mikroskop, 63x yağa daldırma, 1.4 NA Plan-apokromat objektif</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>< güçlü > Malzemeler< / güçlü ></td><td></td><td></td><td></td></tr> <tr><td>Aqua Poly / Montaj ortamı</td><td></td><td></td><td>suda çözünür, floresan olmayan montaj ortamı</td></tr><tr><td>Pyrex 3 veya 9 çöküntü cam spot plakası</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Whatman filtre kağıdı</td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

5-etil-2'-deoksiroridin/fosfo-histon h3 drosophila nöral kök hücrelerde hücre döngüsü İlerleme analizi için Çift etiketleme protokolü

5-Ethynyl-2'-Deoxyuridine/Phospho-Histone H3 Dual-Labeling Protocol for Cell Cycle Progression Analysis in Drosophila Neural Stem Cells

In vivo hücre döngüsü ilerleme analizi, mitoz ve DNA replikasyonunu düzenleyen genler üzerinde yapılan çalışmalarda rutin olarak yapılmaktadır. 5-Etil-2'-deoksiyridin (EdU) replikatif/S faz ilerlemesini araştırmak için kullanılırken, fosfo-histon H3'e karşı antikorlar mitotik çekirdekleri ve hücreleri işaretlemek için kullanılmıştır. Her iki etiketin birleşimi, G0/G1 (Boşluk fazı), S (çoğaltıcı) ve M (mitotik) fazlarının sınıflandırılmasını sağlar ve mitotik gen devirmelerinin veya boş mutantların hücre döngüsü ilerlemesi üzerindeki etkilerini değerlendirmek için önemli bir araç olarak hizmet eder. Bununla birlikte, EdU etiketli hücreleri işaretlemek için kullanılan reaktifler birkaç ikincil antikor floresan etiketiyle uyumsuzdur. Bu, birincil ve etiketli ikincil antikorların pH3-pozitif mitotik hücreleri işaretlemek için kullanıldığı immünostainingi zorlaştırır. Bu makalede, mitotik faktörleri incelemek için yoğun olarak kullanılan bir sistem olan Drosophila larva nöral kök hücrelerinde EdU ve pH3'ün çift etiketli olarak etiketlenerek kullanılması için adım adım bir protokol açıklanmaktadır. Ayrıca, etiketli hücreleri G0/G1, S, S>G2/M (S'den G2/M'ye ilerleme) ve M aşamaları olmak üzere 3 ayrı kategoride ayırmak için görüntü analizi ve niceleme için bir protokol sağlanır.

İki loblu Drosophila üçüncü instar larva beyni, temel hücresel ve gelişimsel süreçleri incelemek için bir model sistemi olarak kullanılmıştır9. Mevcut çalışmanın odak noktası, CB bölgesinin EdU ve pH3 etiketli NB'lerinde hücre döngüsü ilerlemesinin analizi için bir protokol sunmaktı (Şekil 1). CB NB'leri tip I ve tip II'ye alt olarak ayrılmıştır ve karakteristik asimetrik bölme deseni9'u görüntülerler. Her tip I NB bölümü, kendini yeni...

5-etil-2'-deoksiyridin (EdU) ve fosfo-histon H3 (pH3) etiketlemeli hücre döngüsü analizi, kapsamlı optimizasyon gerektirebilecek çok adımlı bir prosedürdür. Burada, farklı hücre döngüsü aşamalarındaki hücreleri ayırt etmek için görüntü analizi ve niceleme dahil olmak üzere bu prosedür için tüm adımları açıklayan ayrıntılı bir protokol sunuyoruz.

5-Etil-2'-Deoksiroridin/Fosfo-Histon H3 Drosophila Nöral Kök Hücrelerde Hücre Döngüsü İlerleme Analizi için Çift Etiketleme Protokolü

In vivo cell cycle progression analysis is routinely performed in studies on genes regulating mitosis and DNA replication. 5-Ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) ...

Bu protokolde, sadece EDU şirketleşme ve immünostaining'in her adımının ayrıntılı bir açıklamasını sağlamakla kalmıyor, aynı zamanda görüntü alımını, görüntü işlemeyi açıklıyor ve büyük veri kümelerini analiz etmek için bazı ipuçları sağlıyoruz. Bu teknik, G1, S ve M fazlarındaki hücrelerin tahsisine izin verir. Bu özellikle mitotik genleri etkileyen mutasyon olmayan çalışmalar üzerinde hücre döngüsü analizi için yararlı olacaktır.İnsanların bu teknikle ilgili önceden bilgi veya deneyime sahip olmadıkları takdirde iki ila üç ay boyunca mücadele etmesini bekleriz. Başlamak için, Schneider'ın diseksiyon ortamını veya SM'yi parlak bir nokta plakasının ardışık iki çökemine ekleyin ve sonraki depresyona PBS ekleyin. Bir çift toparlama kullanarak, dolaşan üçüncü instar larvalarını seçin ve sinek yiyecek kalıntılarını temizlemek için PBS ile sıçan bir dokuya yerleştirin.Larvaları PBS ile depresyona yerleştirin ve ardından SM içeren ardışık depresyonu takip edin. Daha sonra bir diseksiyon mikroskobu altında, larvaların alt gövdesinin dörtte üçünü çıkarmak için ince tokmaklar kullanın. Daha sonra larva ağız kancalarını bir çift önsezi ile hafifçe tutun ve diğer ucun manikürini diğer çift asa ile tutun. Ağız kancalarını içe doğru iterek ve aynı anda diğer uçtaki dokuyu soyarak larva başını ters çevirin.Ekli hayal diskleri ile larva beynini gözlemleyin. Beyne bağlı diğer dokuları çıkarın ve beyni SM ile sonraki ardışık depresyona aktarın. Pyrex plakasındaki başka bir depresyona 100 mikromoler EDU SM çözeltisi ekleyin ve bu çözeltide yaklaşık 5 ila 10 parçalanmış beyni 25 santigrat derecede 2 saat kuluçkaya yatırın. Fiksasyon ve immün yetmezlik sonrası PBST'yi çıkarın ve parçalanmış beyinlere EDU algılama kokteylini ekleyin.Sonra onları bir nötroter üzerinde karanlıkta oda sıcaklığında kuluçkaya yatırın. 30 dakika sonra, numuneleri PBST ile iki kez karanlıkta yıkama başına 10 dakika yıkayın. DNA boyama için mililitre Hoechst 33342 çözeltisi başına 5 mikrogram hazırlayın.İkinci yıkamadan sonra PBST'yi çıkarın ve parçalanmış beyinlere 500 mikrolitre Hoechst çözeltisi ekleyin, ardından karanlıkta kuluçkaya yatırın. 10 dakika sonra Hoechst'i çıkarın ve örnekleri PBST ile 10 dakika yıkayın. Tüpü laboratuvar tezgahına dokunun ve beyinlerin yerleşmesine izin verin.PBST'yi tüpten çıkarın ve arkasında 50 ila 100 mikrolitre bırakın. 200 mikroliter mikropipet ucunun ucunu kesin ve beyinleri temiz bir cam kaydırağa aktarmak için kullanın. Erişim PBST'yi filtre kağıdı şeritleriyle şişirerek slayttan kaldırın.Filtre kağıdının beyinlere dokunmasına izin vermeyin. Bir damla suda çözünür, floresan olmayan montaj ortamını beyinlere koyun ve beyinleri, ventral sinir kordonu kaydırağa ve loblar yukarı bakacak şekilde yönlendirin. Beyinleri tek bir dosyada düzenleyin, böylece beyinleri seri olarak görüntüleyebilme daha kolaydır.Beynin üzerine hafifçe bir kapak kayması yerleştirin ve slaytı gece boyunca 2 ila 6 santigrat derecede kuluçkaya bırakın. Satın alma yazılımından 63 kez hedefini seçin. Dokuyu göz merceğinden bulmayı kolaylaştırmak için monte edilmiş beyinlerin hemen üstündeki kapak kaymasına bir damla daldırma yağı koyun.Dappy Hoechst 33342 kanalını kullanarak beyni göz merceğinden bulun ve ardından yazılımdaki alım moduna geçin. Hoechst 33342, Alexa kat 4 8 8, Alexa kat 5 6, 8 ve Alexa kat 6 4 7'yi görüntülemek için 4 kanal ayarlayın. Seçilen boyaları heyecanlandırma lazerlerini ve emisyon filtrelerini otomatik olarak ayarlamak için boya asistanı aracını kullanın.Görüş alanını, tüm beyin lobını kapsayacak şekilde ayarlayın. 0,8 mikron aralıklı bu vergiyi alarak beyin lobunun tüm hacmini görüntüleyin. Görüntüleme oturumundaki tüm görüntüleri nokta L I F kitaplık biçiminde depolayın.Görüntü analizi için Fiji'yi açın, ardından LIF dosyalarını sürükleyip Fiji'ye bırakın. Yığın görüntüleme sekmesinden veri tarayıcısını seçin ve biyo formatlar eklentisinde bellek yönetimi sekmesinden sanal yığın kullanın. Görüntüde görüntülenen çok kanallı görüntüyü gözlemleyin J.Görüntü, renk ve kanallar aracını kullanarak menü çubuğundan kanalların rengini değiştirin.Miranda etiketli nöroblastları izleyin, orta beyin bölgesinde büyük yuvarlak hücreler olarak görünür. Nöroblast'ı iki kez saymamak için her nöroblast üzerine elips aracını kullanarak ilgi çekici bir bölge çizin. Görüntü J menü çubuğundan analiz, araçlar ve yatırım getirisi yöneticisi'ni seçin.Mevcut Z bölümündeki tüm nöroblastları işaretleyin ve her hücreyi işaretledikten sonra T tuşuna basın. Mevcut Z bölümündeki tüm nöroblastlar işaretlendikten sonra, kanalları pH3 ve EDU olarak değiştirin ve EDU pozitif nöroblastların, pH3 pozitif nöroblastların, EDU ve pH3 pozitif nöroblastların ve nöroblastların sayısını manuel olarak sayın. Nöroblastları ve sonraki Z bölümlerini arayın, eski ROI'leri silin ve farklı yığınlardaki nöroblastları saymak için yeni ROI'ler ekleyin.Bir elektronik tablo hazırlayın ve her lob için dört kategoride de bulunan nöroblastların yüzdelerini hesaplayın. Her kategorideki nöroblastların yüzdeleri için havuz verilerini gösteren elektronik tablo yazılımını kullanarak bir çubuk grafik hazırlayın. Miranda, EDU ve pH3 ile işaretlenmiş üçüncü instar larva beyinlerinden merkezi beyin nöroblastları burada gösterilmiştir.Hücreler G1/G0, S, SG2/M ve M evrelerine ayrıldı. MMS19'un anlamlı derecede daha yüksek bir oranı olan EDU pH3 analizinde, M fazında vahşi tip nöroblastlara kıyasla fonksiyon nöroblast kaybı bulunmuştur. MMS19:EGFP ifadesi MMS19 fonksiyon arka plan kaybı, M fazındaki hücrelerin vahşi tip düzeylerine oranını kurtardı.Sonraki adımlar için hasarlı beyinleri kullanmamak önemlidir. Ve ED çözeltisi diseksiyonlara başlamadan önce taze olarak hazırlanmalıdır. Bu varlık, belirli hücre döngüsü aşamalarındaki kusurları tanımlamak için hızlı bir ilk tarama olarak kullanılabilir.Bu daha sonra belirli bir aşamanın daha ayrıntılı bir analizi ile takip edilebilir.

5-ethynyl-2-deoxyuridinephospho-histone-h3-dual-labeling-protocol-for

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

SAC kardeş kromatidler arasında mitotik segregasyon izlenmesi, sinyali başlatır nerede kinetochore olduğunu. A metodunda kromozom hareketi ile kinetochore proteinler ve koordinasyon birinin seçilmesi ve devir görselleştirme tarif...

Living Görselleştirilmesi Dinamik Kinetochore Protein Davranış ve Kromozom Hareket tarafından Mitotik Checkpoint incelenmesi<em&gt; Drosophila</em&gt; Sinsityal Embriyolar

Canlı hücre döngüsü analizi için bir...

Canlı Hücre Döngüsü Analizi<em&gt; Drosophila</emAkort Akustik Odaklama Sitometreyi ve Vybrant DyeCycle Violet DNA Leke kullanarak&gt; Dokular

Timidin iki analoglarının Yönetimi, edu ve BrdU, hamile farelerde embriyonik fare beyninde sinir ve progenitör hücrelerde hücre döngüsü ilerlemesinin analizine izin verir. Bu yöntem, beyin gelişimi sırasında iyonizan radyasyon içeren genotoksik stres, etkilerini belirlemek için yararlıdır.

Genotoksik Stres sonrası nöral kök ve Fare Gelişmekte Beyin Progenitör Hücrelerinin Değerlendirilmesi Hücre Döngüsü İlerlemesi

İmmün boyama, dokulardaki belirli hücre tiplerini ve proteinleri görselleştirmek için etkili bir tekniktir. Sonikasyonu kullanarak, burada açıklanan protokol, immünostainingden önce Drosophila melanogaster dokularını geç evre embriyolardan ve larvalardan ayırma ihtiyacını hafifletir. Formaldehitle sabitlenmiş bütün mount larvalarının immün boyaması için etkili bir metodoloji sunuyoruz.

Geç evre embriyonik ve larva soniklenmesi-kolaylaştırdı Immunoflorasan Boyama<em&gt; Drosophila</em&gt; Dokular<em&gt; Yerinde</em

Bu protokol, kinesin-5'in küçük moleküllü inhibitörlerine duyarlı bir Drosophila S2 hücre hattının nasıl oluşturulacağını açıklar. Bu hücrelerin hücre tabanlı bir hata düzeltme testinde kullanımı da ana hatlarıyla belirtilmiştir.

Bir &quot;humanize&quot; oluşturuluyor<em&gt; Drosophila</emKinesin-5 Farmakolojik inhibisyonu için&gt; S2 Hücre Hattı Duyarlı

Hücre türleri farklı morfoloji görüntülemek ve a değişiklik-in onların komşuları ile etkileşim kurmak. Bu iletişim kuralı tek hücre morfolojisi açıklamaya ve hücre-hücre etkileşim köklü Gal4/UAS ifade sistemi kullanılarak incelemek için açıklar.

Yüksek çözünürlüklü tek hücre türleri morfoloji ve Glia Drosophila içinde etkileşimlerin hücre çalışmaya uygulama çok renkli FlpOut tekniği

Bu protokol, Drosophila politen hücrelerindeki heterokromatin agregalarını görselleştirmeyi amaçlamaktadır.

Drosophila Tükürük Bezlerinde Heterokromatin İlişkili Proteinlerin Görselleştirilmesi için İmmünofluoresan Boyama

İn vivo olarak dahil edilen ve mikroskopi ve akış sitometrisi ile Click kimyası kullanılarak tespit edilen bir timidin analoğu olan EdU'yu kullanarak S. cerevisiae'deki S-faz süresini doğru bir şekilde belirlemek için iki tamamlayıcı protokol tanımladık. DNA replikasyon süresinin ve mutantlarda gözden kaçan replikasyon kusurlarının kolay karakterizasyonuna izin verir.

Saccharomyces cerevisiae'de 5-Etinil-2'-deoksiüridin Kullanımı Kullanılarak S-Faz Süresinin Belirlenmesi

Aşağıdaki protokol, hücre döngüsü senkronizasyonu ve ardından RPA2 immünofloresan boyama kullanılarak hücre döngüsünün G1 fazında tek sarmallı DNA odaklarının saptanmasını sunar.

Hücre Döngüsünün G1 Fazında Tek Sarmallı DNA Odaklarının Görselleştirilmesi

Burada, Drosophila yumurtalık nişindeki germ hattı kök hücrelerinin (GSC'ler) asimetrik bölünmesinin canlı görüntülemesini gerçekleştirmek için ayrıntılı bir protokol sunuyoruz. Spektrozom proteini Par-1'in yeşil floresan proteini (GFP) füzyonunu her yerde ifade eden bir transgenik çizgi kullanıyoruz.

Kadın Drosophila melanogaster Germline Kök Hücre Nişlerinin Genişletilmiş Canlı Görüntülenmesi

Genişleme Destekli Yinelemeli Floresan In Situ Hibridizasyon (EASI-FISH), kalın dokuda birden fazla genin ekspresyonunu tespit etmek için genleşme mikroskobunu floresan in situ hibridizasyon (FISH) ile birleştiren sağlam bir tekniktir. Bu protokol, yöntemdeki son gelişmeleri ve bozulmamış Drosophila merkezi sinir sistemini etiketlemek için adaptasyonunu özetlemektedir.

Genişleme Destekli Yinelemeli Floresan In Situ Hibridizasyon Kullanılarak Sağlam Drosophila Beyindeki Gen Ekspresyonunun Multipleks Tespiti

Öğrenin, Drosophila nöral kök hücrelerinde EdU ve pH3 çift etiketleme ile hücre döngüsü analizi yapmayı. Bu protokol G1, S ve M fazlarını ayırt ederek genetik mutasyonların etkilerini değerlendirmeye yardımcı olur.

5-Etil-2-Deoksiroridin/Fosfo-Histon H3 Drosophila Nöral Kök Hücrelerde Hücre Döngüsü İlerleme Analizi için Çift Etiketleme Protokolü (Video) | JoVE Journal

5-Etil-2'-Deoksiroridin/Fosfo-Histon H3 Drosophila Nöral Kök Hücrelerde Hücre Döngüsü İlerleme Analizi için Çift Etiketleme Protokolü

Daha fazla video keşfet