Name: MRGde Optik Sinir Kesit Alanının Nicelemesi: Fiji Yazılımını Kullanan Yeni Bir Protokol (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2021-09-04T15:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 57 s
Description: Öğrenin, MRI ile optik sinir kesit alanının nicelemesi için standartlaştırılmış yöntemleri. Fiji yazılımını kullanarak glokom hastalarında sinir bütünlüğü değerlendirmesi yapın.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Faris Haddad ve Hasan El İsa'ya video çekimi ve geliştirilmesindeki önemli katkıları için teşekkür ederiz.

Aşağıdaki çalışma Ürdün Üniversitesi Hastanesi araştırma komitesi ve kurumsal inceleme kurulu tarafından onaylanmıştır. Aşağıdaki protokol, MRI görüntülerini elde etmek için kullanılan görüntüleme tekniğini ve ardından Fiji yazılımını kullanarak görüntü işleme ve optik sinir nicelemesini açıklayacaktır.
1. MRI görüntü alımı
NOT: MR görüntü alımı, çokplaner T2 ağırlıklı yağ bastırma sırası(Malzeme Tablosu)gerçekleştirmek için 3 Tesla (3 T) MRI kullanılarak yapılmıştır.
<ol><li>Muayeneyi hastaya tam olarak açıklayın. Aşağıda hastaya belirtilmesi gereken talimatlar ve açıklamalar yer almaktadır.<ol>
<li>Hastaya kıyafet değiştirmeleri ve görüntüleme için özel bir önlük giymeleri gerektiğini açıklayın.</li>
		<li>Titanyum oksit pigmentinin elektriksel iletkenliği nedeniyle eserler üretebildiği için (özellikle 3 T'de) aşınmış göz kaleminin hastalara çıkarılmasını sağlamak.</li>
		<li>Hastanın MRI görüntülemesini yapmak için herhangi bir kontrendikasyona sahip olmadığından emin olun9:<ol>
<li>Hastaya yüz maskeleri, piercingler, yapay uzuvlar, manyetik diş implantları, serebral arter anevrizma klipsleri içerebilecek metalik malzemeleri sorun.</li>
			<li>Hastaya metalik göz içi yabancı cisimleri sorun. Bunun için hastaya uygun koruyucu ekipman olmadan kaynak yapıp yapmadıklarını sorun.</li>
			<li>Hastaya, kalp pilleri ve insülin pompaları, analjezik ilaçlar veya kemoterapi pompaları da dahil olmak üzere herhangi bir implante edilebilir cihazın MRI ile uyumsuz olabileceğini sorun. Buna ek olarak koklear implantlar/kulak implantı, implante edilebilir nörostimülasyon sistemleri, implante edilebilir nörostimülasyon sistemleri, metalik bileşenlere sahip kateterler kontrendikedir.</li>
			<li>Hastaya vücudunda kalan metalik yabancı cisim hakkında soru sorun. Buna mermiler, av tüfeği topakları ve metal şarapnel dahildir.</li>
			<li>Hastaya herhangi bir cerrahi klips veya tel dikiş, eklem protezi veya protez, alt vena kava (IVC) filtresi, oküler protez, stent veya rahim içi cihazı sorun.</li>
			<li>Hastaya son 6 haftada dövme yaptırıp yaptırmadıklarını sorun.</li>
			<li>Hastaya son sekiz hafta içinde kolonoskopi işlemi geçirip geçirmediklerini sorun.</li>
			<li>MR makinesinin kapalı alanı nedeniyle hastaya klostrofobisi olup olmadığını sorun. NOT: Vücut kitle indeksi (VKİ) yüksek olan hastalarda zorluk bulunabilir.</li>
		</ol>
</li>
		<li>Hastaya, hastanın hareketsiz kalması gereken yerde sınavın 15 dakika sürmesinin beklendiğini açıklayın.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Talimatları tamamladıktan ve hastanın sınavı tam olarak anladığından emin olduktan sonra imzalı bir onay alın.</li>
	<li>MRI görüntü alımı sırasında, hasta supine'i MRI makinesine yatırın ve görüntüleme sırasında herhangi bir kafa hareketi olmadan düz bir hedefe sabitlenin. Görme keskinliği zayıf olan hastalar için, fiksasyonu optimize etmek için bir ses uyaranı kullanın. Fiksasyon için daha kapsamlı yöntemler arasında bir gözün kapatılması, bir fiksasyon hedefinin merkezi olarak renk değiştiren bir LCD ekran şeklinde kullanılması ve oküler yağlayıcıların kullanılması yer içerir.</li>
	<li>Hastanın MR makinesindeyken herhangi bir şeye ihtiyaç duyarsa basılabilen bir sıkma düğmesi olduğunun farkında olduğundan emin olun. Bir kafa bobini kullanılabilirken, göz bobini ve orbital bobin oftalmik görüntüleme için daha uygun olabilir.</li>
	<li>Görüntü alımı için aşağıdaki parametreleri girin: T2 ağırlıklı yağ bastırma sırası (TR = 3000 milisaniye; TE = 90 milisaniye; TE = 100; görüş alanı = 16 cm×16 cm; matris = 296*384; dilim kalınlığı = 3 mm; dilim boşluğu = 0,3 mm). Analiz edilen son görüntü, dünyanın 3 mm gerisinde eğik bir koronal görüntüydü. T2 ağırlıklı yağ bastırma dizisi genellikle optik sinir görüntüleme için kullanılırken, T2 hızlı spin eko görüntüleme de dahil olmak üzere diğer dizilerin kullanılabileceğini belirtmek önemlidir.</li>
	<li>Optik sinir ortogonalinin koronal bir kesimini (yani dik) dünyaya 3 mm posterior sinire alın. Optimum optik sinir yönü ve optik sinir küresi kavşak konumlandırması sağlamak için transversal ve eğik sagittal düzlemlerde scout görüntülerini kullanın.</li>
	<li>Bakış fiksasyonunun kalitesini optik sinirin etrafındaki CSF dağılımı ile değerlendirin, burada optik sinirin etrafına neredeyse eşit kalınlıkta eşit olarak dağıtılmalıdır.</li>
	<li>Diğer taraf için optik siniri görüntüleyen işlemi tekrarlayın.</li>
</ol>2. Görüntü analizi
<ol><li>Fiji görüntü işleme paketini (https://imagej.net/Fiji) indirin.</li>
	<li>Menü çubuğundan Dosya'yı ve ardından Aç düğmesini tıklatarak optik sinirin koronal görüntüsünü analiz için ImageJ Fiji yazılımına yükleyin. İşlenecek koronal görüntüyü seçin. Görüntü kalitesi kaybı güvenilmez görüntü analizi sonuçlarına yol açacağından, görüntüleri aktarım sırasında görüntü kalitesini kaybetmeden Fiji yazılımına aktarın.</li>
	<li>Harita ölçeğinde düz bir çizgi çizerek bir uzunluk birimi başına piksel sayısını belirterek ölçeği standartlaştırın. Ardından Çözümle menü çubuğundan Ölçeği Ayarla'yı seçin. Çizginin uzunluğunu harita ölçeğinde göründüğü gibi, uygun uzunluk birleştirmesiyle (yani çoğunlukla mm) belirtin.</li>
	<li>Görüntü menüsünü kullanarak görüntüyü gri tonlamalı bir tona dönüştürün ve Sonra Tür ve 8 bit'i seçin.</li>
	<li>Beyaz madde piksellerinin yoğunluk aralığını ölçün.<ol>
<li>Kement seçim aracını kullanma (Eklenti | Segmentasyon | Kement aracı), seçim sırasında gri madde alanını eklememeye dikkat ederek yeterli miktarda beyaz madde seçin. Yaklaşık 1000 piksellik toplam seçilmiş bir beyaz madde alanının yeterli olduğunu gördük. Seçili alanı ölçmek için Çözümle ve Ölç aracını kullanın.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Seçilen beyaz madde alanındaki piksel yoğunluğunun dağılımını gösteren Histogram aracını Analiz menüsünden gösterin. Histogramın seçili alanı değerlendirdiğinden emin olmak için Canlı kutusunu tıklatın. Histogramdaki grafik normal bir yoğunluk dağılımı göstermelidir.</li>
	<li>Beyaz madde yoğunluk aralığını aşağıdaki gibi hesaplayın: Alt sınır = ortalama yoğunluk - (3* standart sapma) Üst sınır = ortalama yoğunluk + (3* standart sapma)</li>
	<li>Görüntü menüsünden Eşik aracını ve ardından Ayarla işlevini açın. Önceki adımdan hesaplanan aralığı belirtin. Yalnızca koyu arka plan işlevini işaretleyin ve bırakma listesinden siyah beyaz ek açıklama B&W'yi belirtin, sonra Uygula'yı tıklatın. Optik disk içinde bulunan beyaz madde maskesi görünecektir.</li>
	<li>Kement seçim aracını kullanma (Eklenti | Segmentasyon | Kement aracı), optik diski temsil eden siyah alanı seçin.</li>
	<li>Çözümle menü çubuğundan Ölçü işlevini kullanın;</li>
</ol>

<ol><li>Quigley, H. A., Broman, A. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+number+of+people+with+glaucoma+worldwide+in+2010+and+2020%5BTitle%5D)+AND+%22The+British+Journal+of+Ophthalmology%22%5BJournal%5D)">The number of people with glaucoma worldwide in 2010 and 2020.</a> The British Journal of Ophthalmology. 90 (3), 262-267 (2006).</li>
<li>Weinreb, R. N., Aung, T., Medeiros, F. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+pathophysiology+and+treatment+of+glaucoma%3A+a+review%5BTitle%5D)+AND+%22JAMA%22%5BJournal%5D)">The pathophysiology and treatment of glaucoma: a review.</a> JAMA. 311 (18), 1901-1911 (2014).</li>
<li>Overview | Glaucoma: diagnosis and management | Guidance | NICE. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://www.nice.org.uk/guidance/ng81">https://www.nice.org.uk/guidance/ng81</a> (2021).</li>
<li>Michelessi, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optic+nerve+head+and+fibre+layer+imaging+for+diagnosing+glaucoma%5BTitle%5D)+AND+%22The+Cochrane+Database+of+Systematic+Reviews%22%5BJournal%5D)">Optic nerve head and fibre layer imaging for diagnosing glaucoma.</a> The Cochrane Database of Systematic Reviews. (11), 008803(2015).</li>
<li>Ramli, N. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Novel+use+of+3T+MRI+in+assessment+of+optic+nerve+volume+in+glaucoma%5BTitle%5D)+AND+%22Graefe%27s+Archive+for+Clinical+and+Experimental+Ophthalmology%22%5BJournal%5D)">Novel use of 3T MRI in assessment of optic nerve volume in glaucoma.</a> Graefe's Archive for Clinical and Experimental Ophthalmology. 252 (6), 995-1000 (2014).</li>
<li>AlRyalat, S. A., Muhtaseb, R., Alshammari, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simulating+a+colour-blind+ophthalmologist+for+diagnosing+and+staging+diabetic+retinopathy%5BTitle%5D)+AND+%22Eye%22%5BJournal%5D)">Simulating a colour-blind ophthalmologist for diagnosing and staging diabetic retinopathy.</a> Eye. , 1-4 (2020).</li>
<li>Chang, S. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optic+Nerve+Diffusion+Tensor+Imaging+Parameters+and+Their+Correlation+With+Optic+Disc+Topography+and+Disease+Severity+in+Adult+Glaucoma+Patients+and+Controls%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Glaucoma%22%5BJournal%5D)">Optic Nerve Diffusion Tensor Imaging Parameters and Their Correlation With Optic Disc Topography and Disease Severity in Adult Glaucoma Patients and Controls.</a> Journal of Glaucoma. 23 (8), 513-520 (2014).</li>
<li>Omodaka, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Correlation+of+magnetic+resonance+imaging+optic+nerve+parameters+to+optical+coherence+tomography+and+the+visual+field+in+glaucoma%5BTitle%5D)+AND+%22Clinical+%26+Experimental+Ophthalmology%22%5BJournal%5D)">Correlation of magnetic resonance imaging optic nerve parameters to optical coherence tomography and the visual field in glaucoma.</a> Clinical & Experimental Ophthalmology. 42 (4), 360-368 (2014).</li>
<li>Ghadimi, M., Sapra, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Magnetic+Resonance+Imaging+Contraindications%5BTitle%5D)+AND+%22StatPearls%22%5BJournal%5D)">Magnetic Resonance Imaging Contraindications.</a> StatPearls. , (2021).</li>
<li>Bäuerle, J., Schuchardt, F., Schroeder, L., Egger, K., Weigel, M., Harloff, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Reproducibility+and+accuracy+of+optic+nerve+sheath+diameter+assessment+using+ultrasound+compared+to+magnetic+resonance+imaging%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Neurology%22%5BJournal%5D)">Reproducibility and accuracy of optic nerve sheath diameter assessment using ultrasound compared to magnetic resonance imaging.</a> BMC Neurology. 13 (1), 187(2013).</li>
<li>Wang, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Orbital+Cerebrospinal+Fluid+Space+in+Glaucoma%3A+The+Beijing+Intracranial+and+Intraocular+Pressure+%28iCOP%29+Study%5BTitle%5D)+AND+%22Ophthalmology%22%5BJournal%5D)">Orbital Cerebrospinal Fluid Space in Glaucoma: The Beijing Intracranial and Intraocular Pressure (iCOP) Study.</a> Ophthalmology. 119 (10), 2065-2073 (2012).</li>
<li>Weigel, M., Lagrèze, W. A., Lazzaro, A., Hennig, J., Bley, T. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fast+and+Quantitative+High-Resolution+Magnetic+Resonance+Imaging+of+the+Optic+Nerve+at+3.0+Tesla%5BTitle%5D)+AND+%22Investigative+Radiology%22%5BJournal%5D)">Fast and Quantitative High-Resolution Magnetic Resonance Imaging of the Optic Nerve at 3.0 Tesla.</a> Investigative Radiology. 41 (2), 83-86 (2006).</li>
<li>Yiannakas, M. C., Toosy, A. T., Raftopoulos, R. E., Kapoor, R., Miller, D. H., Wheeler-Kingshott, C. A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((MRI+Acquisition+and+Analysis+Protocol+for+In+Vivo+Intraorbital+Optic+Nerve+Segmentation+at+3T%5BTitle%5D)+AND+%22Investigative+Ophthalmology+%26+Visual+Science%22%5BJournal%5D)">MRI Acquisition and Analysis Protocol for In Vivo Intraorbital Optic Nerve Segmentation at 3T.</a> Investigative Ophthalmology & Visual Science. 54 (6), 4235-4240 (2013).</li>
<li>Al-Haddad, C. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optic+Nerve+Measurement+on+MRI+in+the+Pediatric+Population%3A+Normative+Values+and+Correlations%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Neuroradiology%22%5BJournal%5D)">Optic Nerve Measurement on MRI in the Pediatric Population: Normative Values and Correlations.</a> American Journal of Neuroradiology. 39 (2), 369-374 (2018).</li>
<li>Mncube, S. S., Goodier, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Normal+measurements+of+the+optic+nerve%2C+optic+nerve+sheath+and+optic+chiasm+in+the+adult+population%5BTitle%5D)+AND+%22South+African+Journal+of+Radiology%22%5BJournal%5D)">Normal measurements of the optic nerve, optic nerve sheath and optic chiasm in the adult population.</a> South African Journal of Radiology. 23 (1), 7(2019).</li>
<li>Nguyen, B. N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultra-High+Field+Magnetic+Resonance+Imaging+of+the+Retrobulbar+Optic+Nerve%2C+Subarachnoid+Space%2C+and+Optic+Nerve+Sheath+in+Emmetropic+and+Myopic+Eyes%5BTitle%5D)+AND+%22Translational+Vision+Science+%26+Technology%22%5BJournal%5D)">Ultra-High Field Magnetic Resonance Imaging of the Retrobulbar Optic Nerve, Subarachnoid Space, and Optic Nerve Sheath in Emmetropic and Myopic Eyes.</a> Translational Vision Science & Technology. 10 (2), (2021).</li>
<li>Lagrèze, W. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Retrobulbar+Optic+Nerve+Diameter+Measured+by+High-Speed+Magnetic+Resonance+Imaging+as+a+Biomarker+for+Axonal+Loss+in+Glaucomatous+Optic+Atrophy%5BTitle%5D)+AND+%22Investigative+Ophthalmology+%26+Visual+Science%22%5BJournal%5D)">Retrobulbar Optic Nerve Diameter Measured by High-Speed Magnetic Resonance Imaging as a Biomarker for Axonal Loss in Glaucomatous Optic Atrophy.</a> Investigative Ophthalmology & Visual Science. 50 (9), 4223-4228 (2009).</li>
<li>Nielsen, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Magnetic+Resonance+Imaging+at+3.0+Tesla+Detects+More+Lesions+in+Acute+Optic+Neuritis+Than+at+1.5+Tesla%5BTitle%5D)+AND+%22Investigative+Radiology%22%5BJournal%5D)">Magnetic Resonance Imaging at 3.0 Tesla Detects More Lesions in Acute Optic Neuritis Than at 1.5 Tesla.</a> Investigative Radiology. 41 (2), 76-82 (2006).</li>
<li>Mafee, M. F., Rapoport, M., Karimi, A., Ansari, S. A., Shah, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Orbital+and+ocular+imaging+using+3-+and+1.5-T+MR+imaging+systems%5BTitle%5D)+AND+%22Neuroimaging+Clinics+of+North+America%22%5BJournal%5D)">Orbital and ocular imaging using 3- and 1.5-T MR imaging systems.</a> Neuroimaging Clinics of North America. 15 (1), 1-21 (2005).</li>
<li>Gala, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Magnetic+resonance+imaging+of+optic+nerve%5BTitle%5D)+AND+%22The+Indian+Journal+of+Radiology+%26+Imaging%22%5BJournal%5D)">Magnetic resonance imaging of optic nerve.</a> The Indian Journal of Radiology & Imaging. 25 (4), 421-438 (2015).</li>
<li>Gao, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optic+Nerve+Cross-Sectional+Area+Measurement+with+High-Resolution%2C+Isotropic+MRI+in+Optic+Neuritis+%28P6.159%29%5BTitle%5D)+AND+%22Neurology%22%5BJournal%5D)">Optic Nerve Cross-Sectional Area Measurement with High-Resolution, Isotropic MRI in Optic Neuritis (P6.159).</a> Neurology. 84 (14), (2015).</li>
<li>Zou, H., Müller, H. J., Shi, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Non-spatial+sounds+regulate+eye+movements+and+enhance+visual+search%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Vision%22%5BJournal%5D)">Non-spatial sounds regulate eye movements and enhance visual search.</a> Journal of Vision. 12 (5), 2(2012).</li>
<li>Yang, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Connective+Tissue+Components+of+Optic+Nerve+Head+Cupping+in+Monkey+Experimental+Glaucoma+Part+1%3A+Global+Change%5BTitle%5D)+AND+%22Investigative+Ophthalmology+%26+Visual+Science%22%5BJournal%5D)">The Connective Tissue Components of Optic Nerve Head Cupping in Monkey Experimental Glaucoma Part 1: Global Change.</a> Investigative Ophthalmology & Visual Science. 56 (13), 7661-7678 (2015).</li>
<li>Mwanza, J. -C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Retinal+nerve+fibre+layer+thickness+floor+and+corresponding+functional+loss+in+glaucoma%5BTitle%5D)+AND+%22The+British+Journal+of+Ophthalmology%22%5BJournal%5D)">Retinal nerve fibre layer thickness floor and corresponding functional loss in glaucoma.</a> The British Journal of Ophthalmology. 99 (6), 732-737 (2015).</li>
</ol>

Tüm yazarlar çıkar çatışması olmadığını beyan etti.

Glokom hasta değerlendirmesi için kullanılabilecek optik sinir beyazı maddesini değerlendirmek ve ölçmek için bir protokol tanımladık. Protokol, görüntü alımı için yaygın olarak kullanılabilen görüntüleme dizilerini kullanır ve görüntü analizi için açık kaynaklı Fiji yazılımını kullanır. Daha önce optik sinir görüntüsü alımında en doğru ve yüksek oranda tekrarlanabilir olduğu tespit edilen görüntü parametrelerini standartlaştırdık, hastadan düz bir şekilde sabitlenerek sabitlenilmesini istemek, yağ bastırma dizisi ile T2...

Glokom, geri dönüşü olmayan körlüğün en yaygın nedeni olarak kabul edilen optik bir nöropatidir1. Buna rağmen, patofizyolojisi ve tanısı açısından hala yezih anlaşılmaktadır, tanıyı belirlemek için tek bir standart referans yoktur2. Ulusal Sağlık ve Bakım Mükemmelliği Enstitüsü'ne (NICE) göre, primer açık açılı glokom (POAG) tanısı, fundus sınavı veya optik tutarlılık tomografisi (OCT) görüntüleme, görsel alan değerlendirmesi ve göz içi basınç ölçümü 3dahil olmak üzere birden fazla alanın değerlendirilmesini gerektirir. Glokom tanısının arkasındaki fikir, OCT4'tenicel olarak yapılabilen ilerleyen optik nöropatinin varlığını belirlemektir. Bu bağlamda, MRI optik sinir değerlendirmesi ve beyaz madde alanının nicelemesi için de kullanılabilir5, ancak bunun klinik olarak anlamlı olması için optik sinir beyaz madde nicelemesinde kullanılan protokolün standartlaştırılması gerekir. Ayrıca, bir protokol, farklı hastalıklarda doğruluğu etkileyebilecek bir faktör olan bireyler arası varyasyonu da karşılamalıdır6.
Glokomda optik sinir değerlendirmesi, optik sinirin en ön kısmının (örneğin optik disk) değerlendirildiği OCT dahil olmak üzere oftalmik görüntüleme ile en iyi şekilde değerlendirilir. Öte yandan, optik sinir değerlendirmesi için MRG kullanımı genellikle optik sinirin retrobulbar kısmını dünya çapından çeşitli mesafelerde değerlendirir. Çeşitli çalışmalar OCT ve MRI7,8kullanılarak optik disk değerlendirmesi arasında güçlü bir korelasyon buldu. Bununla birlikte, MRG'de optik sinir değerlendirmesi ve niceliği için hala birleşik bir protokol yoktur. MRG'deki optik sinir kenarlığının ana hatları kesitsel alanını ölçmek için kullanılmıştır5. Bununla birlikte, bu yöntem deneyimli bir oranlayıcı tarafından yapılması gerektiğinden ve anahat için önemli bir zaman gerektirdiği için önemli bir oranlar arası değişkenliğe sahiptir. Mevcut projenin amacı, görüntü alımı için 3 T MRI ve görüntü işleme ve niceleme için ImageJ'in Fiji yazılımı kullanılarak optik sinir kesitsel değerlendirme ve niceleme için birleşik bir metodoloji için bir protokol sağlamaktı.

<table><tbody><tr><td>Manyetik rezonans görüntüleme (MRI) makinesi</td><td>Siemens Magnetom Verio</td><td>N / A</td><td>3T MRI tarayıcı</td></tr></tbody></table>

mrg'de optik sinir kesit alanının nicelemesi: fiji yazılımını kullanan yeni bir protokol

Quantification of Optic Nerve Cross Sectional Area on MRI: A Novel Protocol using Fiji Software

Optik sinir değerlendirmesi glokom tanı ve takibinin önemli bir yönüdür. Bu proje, görüntü alımı için 3 T MRI ve görüntü işleme nicelemesi için ImageJ'in Fiji yazılımı kullanılarak optik sinir kesitsel değerlendirme ve nicelemenin birleşik bir metodolojisi için bir protokol açıklamaktadır. Görüntü alımı, görüntüleme sırasında düz fiksasyonu sağlamak için hastanın uygun talimatlarla birlikte 3 T MR kullanılarak gerçekleştirildi. T2 ağırlıklı yağ baskılanmış dizi kullanıldı. Dünyanın 3 mm gerisinden alınan ve optik sinir eksenine dik bir koronal kesim yazılıma yüklenmelidir. Eşik fonksiyonu kullanılarak, optik sinirin beyaz madde alanı seçilir ve ölçülür, böylece bireyler arası ölçüm önyargısı ortadan kalkar. Ayrıca daha önce yayınlanan literatüre dayanarak, yaşa göre optik sinir kesit alanı için normal sınırları tanımladık. Şüpheli bir glokom hastasının optik sinirini değerlendirmek için tarif edilen protokolü kullandık. Optik sinir kesit alanının normal sınırlar içinde olduğu tespit edildi, bu da optik sinirin optik tutarlılık tomografisi ile daha da doğrulandı.

Checkup oftalmolojisi muayenesine başvuran 30 yaşındaki erkek hastanın fincandan diske oranı 0.8(Şekil 1A)idi, bu şüpheli ve glokom düşündürücü olabilir. Sinir lifi tabakası kalınlığı için optik koherens tomografisi yapıldıktan sonra sinir kalınlığının yaş için normal sınırlar içinde olduğunu gördük (Şekil 1B). Hastanın yörünge MRI'ı için planlandı, burada optik sinir değerlendirmesi için koronal bir kesim emredildi ve yukarıda belirtilen protokole göre gerçekle...

MRI kullanarak standartlaştırılmış bir optik sinir değerlendirmesi ve niceleme yöntemi, yaygın olarak bulunan bir görüntüleme dizisi ve görüntü analizi için açık erişim yazılımı için ayrıntılı bir protokol sağladık. Bu standartlaştırılmış protokolün ardından farklı hastalar ve farklı çalışmalar arasında karşılaştırma için anlamlı veriler sağlayacaktır.

MRG'de Optik Sinir Kesit Alanının Nicelemesi: Fiji Yazılımını Kullanan Yeni Bir Protokol

Optic nerve assessment is an important aspect of glaucoma diagnosis and follow-up. This project describes a protocol for a unified methodology of optic ...

Bu protokol, MRG kullanılarak optik sinir kesit alanı değerlendirmesi için standartlaştırılmış yöntemleri tanımlamayı amaçlamaktadır. Yaygın olarak kullanılabilen görüntüleme dizisini kullanarak görüntü alımını açıklayacağız. Ayrıca açık kaynaklı özellik yazılımını kullanarak görüntü analizini açıklayacağız.Bu protokolün önemli kullanımlarından biri, optik sinir bütünlüğü hakkında değerli veriler sağlayacağı glokom hasta değerlendirmesindedir. Görüntü alma protokolü, hastaya muayenenin tam olarak açıklanmasıyla başlayacak ve aşağıdaki talimatlara uyulması gerektiği. Görüntüleme için özel bir gece elbisesine dönüşmeniz gerekecektir.Metalik malzeme taşımadığınızdan veya takmadığınızdan emin olmanız gerekir, bu bazı yüz maskeleri içerebilir. Bazı implante edilebilir cihazlar MRI görüntüleme ile uyumlu olmayabilir, bu kalp pilleri ve insülin pompaları içerebilir. Vücudunuzun içinde kalan herhangi bir metalik nesneyi hekime bildirmelisiniz.MR makinesinin kapalı alanı nedeniyle, muayene klostrofobisi olan hastalar için uygun olmayabilir. Hastanın hareketsiz kalması gereken sınava 15 dakika süre verilmesi bekleniyor. Hasta tarafından uygun bir onay formunun imzalanması gerekir.Görüntülemeden önce, hekim hastaya adımları açıklayacak ve düzgün bir şekilde yönlendirilmiş bir görüntü elde etmek için MR makinesi içinde düz bir hedefe odaklanmalarını sağlayacaktır. Daha fazla önlem açıklanır ve uygun ve rahat bir muayene sağlamak için hastaya kulaklık ve panik düğmesi gibi güvenlik cihazları sağlanır. Optik sinirin koronal bir kesimi ortogonal, yani alınacaktır.dünyaya üç milimetrelik posterior sinire dik. Transfer testeres ve eğik sagittal düzlemlerdeki scout görüntüleri, optimum optik sinir yönü ve optik sinir küre kavşak konumlandırmasını sağlamak için kullanılacaktır. Bakış fiksasyonunun kalitesine, her tarafta neredeyse eşit kalınlıkta sinirin etrafına eşit olarak dağıtılması gereken optik sinirin etrafındaki CSF dağılımı ile erişilebilir.Görüntü alımı için aşağıdaki parametreleri girin. T2 ağırlıklı yağ bastırma sekansında, TR, 3000 milisaniye. TE, 90 milisaniye.Görüş alanı, 16'ya 16 santimetre. Matrix, 296'ya 384. Dilim kalınlığı, üç milimetre.Dilim boşluğu, 0.3 milimetre. Analiz edilen son görüntü, dünyanın üç milimetre gerisinde eğik bir koronal görüntüydü. Görüntü analizi protokolü için, fiji görüntü işleme paketini imagej.net'dan indirerek başlayacağız.Web sitelerine giderek, İndirilenler, Fiji'yi seçerek ve ardından cihazınız için uygun sürümü seçerek başlayacağız. Yükledikten sonra Fiji programını başlatın. Dosya, Aç'ı seçip ardından istediğiniz koronal görüntüyü seçerek optik sinirin koronal görüntüsünü programa yükleyin.Bunu yapmamanız güvenilir olmayan görüntü analizi sonuçlarına neden olacağı için aktarım sırasında görüntü kalitesini korumanız gerektiğini lütfen unutmayın. Bir uzunluk birimi başına piksel sayısını belirterek ölçeği standartlaştırın. Bu, harita ölçeğinde düz bir çizgi çizilerek yapılabilir.Ardından Çözümle menü çubuğundan Ölçeği Ayarla'yı seçin. Uygun uzunluk birimiyle harita ölçeğinde göründüğü gibi satırın uzunluğunu belirtin. Görüntü menüsünü kullanarak görüntüyü gri ölçeğe dönüştürün, sonra Yaz'ı ve ardından 8 bit'i seçin.Beyaz madde piksellerinin yoğunluk aralığını ölçerek, Eklenti menüsüne, Segmentasyon'a, ardından Kement seçimine giderek Kement Seçimi aracını seçin, ardından yeterli bir beyaz madde alanı seçin. Alanı genişletmek için Shift tuşunu basılı tutun ve beyaz maddeyi genişletin. İşlem sırasında herhangi bir gri maddeyi kapsamadığınızı unutmayın.Toplam seçilen alan 1000 piksel yeterlidir. Seçili alanı ölçmek için Analiz et ve ölç'e giderek 1000 piksel seçtiğinizden emin olabilirsiniz. Piksel yoğunluğunun seçilen beyaz madde alanındaki dağılımını gösteren Histogram aracını Analiz menüsünden açın.Histogramın seçili alanı değerlendirdiğinden emin olmak için Canlı kutusunu tıklatın. Histogramdaki grafik normal bir yoğunluk dağılımı göstermelidir. Beyaz madde yoğunluk aralığını aşağıdaki gibi hesaplayın, düşük sınır ortalama yoğunluk, eksi üç kat standart sapmadır.Bizim durumumuz için bu 94.372, eksi üç, 7.085 ile çarpılmış. Üst sınır ortalama yoğunluk, artı standart sapmanın üç katıdır. Bizim durumumuz için 94.372 artı üç kez 7.085.Eşik aracını açmak için Görüntü menüsüne gidin ve Ardından Ayarla'yı seçin ve Eşik'i seçin. Kümeyi seçip üst ve alt sınırı yazarak önceki adımdan hesaplanan aralığı belirtin. Bizim durumumuzda, 73 ve 115.Yalnızca Koyu Arka Plan işlevini işaretleyin ve açılan listeden siyah beyaz ek açıklamaları belirtin, B&W, ardından Uygula'yı tıklatın. Optik disk içinde bulunan beyaz madde maskesi görünecektir. Yukarıda açıklandığı gibi Eklenti menüsünden veya Hızlı Seçim menüsünden seçilebilen Kement seçim aracını kullanarak, optik diski temsil eden siyah alanı seçin.Santimetre olarak ölçülen optik diskin alanını hesaplamak için Analiz Et menü çubuğundaki ölçü işlevini kullanın. Bizim durumumuzda ise 0.069. Oftalmoloji kontrol muayenesi için başvuran 30 yaşındaki bir erkek hastanın fincandan diske oranı 0.8 idi, bu şüpheli ve glokom düşündürücü olabilir.Sinir lifi tabakası kalınlığı için optik koherens tomografisi yapıldıktan sonra sinir kalınlığının yaş için normal sınırda olduğunu gördük. Hasta, daha önce bahsedilen protokolde ayrıntılı olarak belirtildiği gibi optik sinir değerlendirmesi için koronal kesimin emredildiği bir kafa MR'ı için planlandı. Optik diskin arkasında üç milimetrelik koronal MRI kesimini elde ettik.Beyaz madde ortalama yoğunluğu 94.372, standart sapma 7.085, bu da alt sınır beyaz madde yoğunluğu aralığı, 94.372 eksi 21.255, eşittir 73.117 idi. Üst sınır, 94.372, artı 21.255, 115.627'ye eşittir. Şekil 2A koronal görüntüyü göstermektedir.Şekil 2B, hesaplanan üst ve alt sınırları kullanarak beyaz madde eşiğini uyguladıktan sonra koronal görüntüyü gösterir. Şekil 2C'de nicelik için optik sinir beyazı maddesi gösterilirken. Sol optik sinirin beyaz maddesinin kesit alanı 6.9 milimetre kareydi, bu da yaşına göre normal sınırlar içindeydi.Uzman olmayan tıp doktorlarının yüksek güvenilirlikle yürütebileceği MRI makinelerini kullanarak optik sinir değerlendirmesi ve niceleme için standartlaştırılmış bir yöntem için ayrıntılı bir protokol sağladık. Çalışma bulguları arasında karşılaştırma sağlayacak optik sinir değerlendirmesi ile ilgili çalışmalar için bu protokolün kabul edilmesini öneririz. Ayrıca, MRI görüntülerinin optik sinir nöropatisi ve glokomun ikincil nedenlerini dışlaması emredildiğinde bu protokolün kullanılmasını öneririz.

quantification-optic-nerve-cross-sectional-area-on-mri-novel-protocol

Research

JoVE Journal

Medicine

Tıp

Biz manyetik rezonans görüntüleme (MRG) ile beyin yapısı ve işlevleri aynı anda analizi için yeni bir yaklaşım açıklanmaktadır. Biz yüksek çözünürlüklü difüzyon ağırlıklı görüntüleme ve beyaz madde lif traktografi beyin yapısının değerlendirilmesi. Standart yapısal MRG aksine, bu teknikler bize doğrudan beyin ağlarının fonksiyonel özelliklerini anatomik bağlantı ilgili izin verir.

FMRI ve difüzyon ağırlıklı görüntüleme ile Beyin Yapısı ve Fonksiyonu Co-analizi

Source: Flatz, W. H. et al. In Vivo Menière Hastalığı Kulaklarında ve Normal İşiten Kulaklarda Manyetik Rezonans Görüntüleme Kullanılarak İnsan Kraniyal Sinirlerinin Morfometrik Analizi. J. Vis. Exp. (2018).Bu video, kronik iç kulak rahatsızlığından muzdarip hastaların kulaklarındaki kraniyal sinir morfolojisini analiz etmek için MRG'nin kullanımını göstermektedir. Hasta üzerinde yüksek manyetik alanlı bir MRI taraması gerçekleştirmek, kraniyal sinirlerin yüksek çözünürlüklü 3D kesit...

İç Kulak Bozukluğu Olan Bir Hastada Kraniyal Sinir Morfolojisinin İn Vivo MRG Analizi

Bu video naif fare görsel projeksiyon kontrastlı MR görüntüleme ve akut optik sinir ezilme yaralanma ve kronik optik sinir dejenerasyonu ile ilişkili optik sinir dejenerasyonu tekrarlayan ve uzunlamasına in vivo çalışmalar için, bir klinik 3 T tarayıcı kullanarak, bir yöntemi göstermektedir knock-out fareler (p50 KO).

Farelerde kontrastlı MR ile optik sinir lifi Dürüstlük İn vivo

Bu yazıda albinizm ve kontroller arasında optik radyasyon (OR) bağlantısı farklılıkları incelemek için kullanılan beyaz cevher (WM) yeniden inşası için deterministik ve olasılıklı algoritmalar açıklar. olasılıklı traktografi daha yakından sinir liflerinin gerçek seyrini takip rağmen, deterministik traktografi her iki tekniğin güvenilirliğini ve tekrarlanabilirlik karşılaştırmak için çalıştırıldı.

Difüzyon tensör görüntüleme ve traktografi kullanarak İnsan Albinizmi İlköğretim Görsel Yolu&#39;ndaki Bağlantı Ölçme

Bu el yazması ile yüksek çözünürlüklü spektral etki alanı optik Koherens tomografi (SD-Ekim) fare retinanın vivo içinde görüntüleme için bir protokol açıklar. Retina ganglion hücrelerinin (RGC) peripapillary bölgede çeşitli tarama ve açıklanan yaklaşımlar miktarının üzerinde duruluyor.

Optik Koherens tomografi: Fare retina Ganglion hücreleri Vivo içinde görüntüleme

Burada, retinal dejenerasyon, glokom, diyabetik retinopati ve miyopi modellerinde retinal ve oküler yapıları in vivo olarak görselleştirmek için spektral-alan optik koherens tomografinin (SD-OCT) kullanımını açıklamaktayız.

Optik Koherens Tomografi Kullanılarak Kemirgen Modellerinde Oküler Hastalığın İn vivo Yapısal Değerlendirmeleri

Bu makalede, tüm mount retinal preparatları için iyi kurulmuş ve tekrarlanabilir bir lektin lekesi testi ve proliferatif ve proliferatif olmayan retinopatilerde sıklıkla değiştirilen vasküler parametrelerin nicel ölçümü için gerekli protokoller açıklanmaktadır.

Proliferatif Olmayan ve Proliferatif Retinopatilerle Farelerin Tüm Mount Retinalarında Vasküler Parametrelerin Nicelemesi

Tüm kafa fNIRS kapsamı ile aynı deneklerden fMRI ve fNIRS sinyallerini aynı anda toplamak için bir yöntem sunuyoruz. Protokol üç genç yetişkinle test edilmiştir ve gelişimsel çalışmalar ve klinik popülasyonlar için veri toplama için uyarlanabilir.

Tüm kafa optode dizisi ve kısa mesafeli kanallar kullanılarak fMRI ve fNIRS ölçümlerinin eş zamanlı veri toplanması

Yaygın olarak kullanılandan daha fazla görsel alan kullanarak görsel korteks işlevini haritalamak için teknikler geliştirdik. Bu yaklaşım, görme bozukluklarının ve göz hastalıklarının değerlendirilmesini geliştirme potansiyeline sahiptir.

Geniş Görüşlü Retinotopik Stimülasyon ile Görsel Korteksin Fonksiyonel Manyetik Rezonans Görüntülemesi (fMRI)

Bu protokol, farelerde oküler, beyin ve omurilik travmaları dahil olmak üzere kapalı sistem merkezi sinir sistemi (CNS) yaralanmalarını indüklemek için tasarlanmış özel bir aşırı basınçlı hava sistemini açıklar. Bu protokolün amacı, araştırmacıların benzersiz CNS travma çalışmaları için sistemi kolayca uyarlamaları ve genişletmeleri için bir çerçeve sağlamaktır.

Odak, Kapalı Sistem Merkezi Sinir Sistemi Yaralanması Sistemi

Öğrenin, MRI ile optik sinir kesit alanının nicelemesi için standartlaştırılmış yöntemleri. Fiji yazılımını kullanarak glokom hastalarında sinir bütünlüğü değerlendirmesi yapın.

MRG'de Optik Sinir Kesit Alanının Nicelemesi: Fiji Yazılımını Kullanan Yeni Bir Protokol

Daha fazla video keşfet