Name: Bitki-Mantar Etkileşiminde Pektini Tespit Etmek için Çift Boyama Yöntemi (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2022-02-04T15:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 39 s
Description: Öğrenin, bitki-mantar etkileşimlerinde pektin tespiti için çift boyama yöntemini. Hemileia vastatrix ve Cercospora coffeicola gibi patojenlerin hücre duvarı bütünlüğünü ışık mikroskobuyla inceleyin.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Yazarlar, bu çalışmanın geliştirilmesine verdiği destek için Dr. Hudson W. P. de Carvalho'ya teşekkür etmek istiyor. Yazarlar ayrıca ışık mikroskobu tesisini sağladığı için Elektron Mikroskobu Laboratuvarı ''Prof. Elliot Watanabe Kitajima'' ya minnettardır. Yazarlar, bitki materyaline lezyonlar sağladığı için Dr. Flávia Rodrigues Alves Patrício'ya teşekkür eder.

1. Tamponlama çözeltisinin ve reaktiflerin hazırlanması
<ol><li>100 mL damıtılmış suya 4.28 g sodyum kakodilat ekleyerek 2 M kakodilat tamponu hazırlayın ve pH'ı 0.2 N HCl ile 7.25'e ayarlayın.</li>
	<li>10 mL% 25 sulu glutaraldehit, 10 mL% 10 sulu formaldehit, 25 mL 2 M kakodilat tamponu ve 0.5 mL 0.5 M CaCl 226'yı karıştırarak 100 mL Karnovsky fiksatif çözeltisi hazırlayın. Damıtılmış su ile hacmi 100 mL'ye kadar yapın. NOT: Çözelti buzdolabında 6 ay boyunca saklanabilir. DİKKAT: Kakodilat tamponlama çözeltisi toksiktir; bu nedenle, fiksatif çözeltiyi bir duman davlumbazında veya açık bir alanda tutun. Çözelti buharlarını solumaktan kaçının ve kullanım sırasında eldiven giyin.</li>
	<li>Aşağıdakileri karıştırarak sulu Hoagland besin çözeltisi hazırlayın: 3 mM Ca(NO 3)2.4H 2 O, 2 mM NH 4 H 2 PO 4, 5 mM KH 2 PO 4, 2 mM MgSO 4.7H 2 O, 9.07 mM MnSO 4, 0.765 mM ZnSO 4.7H 2O, 46.4 mM H 3 BO 3, 0.09 mM Na2MoO4. H2 O, 0.01 mM CuSO 4 ve 36 mM FeSO4.7H 2O demir-EDTA (etilendiamin tetraasetik asit) olarak27.</li>
</ol>2. Bitki örnekleri ve mantar aşılama
NOT: Kahve pasından etkilenen yapraklar üzerinde yapılan deneyler için, beş adet 2 aylık Kahve arabica cv fidanıdır. Catuaí, Brezilya'nın São Paulo Eyaleti, Piracicaba, São Paulo Üniversitesi'nin Tarımda Nükleer Enerji Merkezi'nde (CENA) yetiştirildi ve bir serada tutuldu.
<ol><li>250 μmol foton s-1 m-2'nin foton akısında LED lambalar tarafından oluşturulan 12 saatlik bir fotoperiyotla 27 ± 3 ° C'de tutulan bir büyüme odasında 4 ay boyunca sulu Hoagland besin çözeltisi (pH ~ 5.5) ile doldurulmuş 500 mL plastik kaplarda kahve bitkileri yetiştirin. Hoagland besin çözeltisini 4 ay boyunca her hafta değiştirin.</li>
	<li>Referans28'de açıklanan yöntemi izleyerek beş bitkinin dört genişlemiş yaprağını abaksiyel yüzeylerine 1 x 103H. vastatrix üredosporlarla aşılayın. Aşılamadan sonra, bitkileri siyah bir plastik torba ile kaplayarak karanlıkta 48 saat saklayın. Aşılamadan 30 gün sonra lezyonları hasat edin. </li>
	<li>Coffea arabica cv'den Cercospora coffeicola'nın neden olduğu karakteristik lezyonları hasat edin. ObatÜtesisleri (koordinatlar: -22.906506126269942, -47.015075902025266) Biyoloji Enstitüsü, Campinas, São Paulo Eyaleti, Brezilya'da bulunmaktadır. Numuneyi işlemeden önce, kahve C. coffeicola conidia'nın varlığını doğrulamak için lezyonları bir stereomikroskopta analiz edin. Ardından, hastalık etiyolojisini doğrulamak için konidia ile bazı slaytlar monte edin22.</li>
</ol>3. Numune toplama, sabitleme ve dehidrasyon
<ol><li>Bir neşter ve cımbız kullanarak, lezyonun orta bölgesinde ~ 10mm2 yaprak örneği toplayın (sarı lekeler; Şekil 1) ve 30 mL Karnovsky fiksatif çözeltisine daldırın (Şekil 1 ve Şekil 2A). Sabitleme adımı buzdolabında 48 saat boyunca gerçekleşebilir.</li>
	<li>En az dört kez, yaprak dokusundaki fiksatif çözeltinin geçirgenliğini arttırmak için yaprak numunesini her biri 15 dakika boyunca bir yağ pompası kullanarak düşük bir vakuma (500-600 mBar) maruz bırakın. Bu adımı örnek döndürme ile gerçekleştirin (Şekil 1).</li>
	<li>Fiksasyondan sonra, yaprak numunesini her biri 5 dakika boyunca damıtılmış suda seyreltilmiş 0,5 M kakodilat tamponunda (pH 7,2) üç kez yıkayın ve daha sonra her etanol konsantrasyonunda 15 dakika boyunca derecelendirilmiş bir etanolik seriye (% 30,% 50,% 70,% 90 (2x) ve% 100 (2x)) aktarın (Şekil 1 ve Şekil 2B).</li>
</ol>4. Historesin gömme prosedürü
<ol><li>Numuneleri, üreticinin talimatlarını izleyerek üç adımda kademeli olarak glikol metakrilatına (GMA) aktarın. İlk olarak, GMA tozunu (1 g) 100 mL bazik reçine (historesin kiti; Malzeme Tablosu) manyetik ajitasyon altında ve ardından aşağıdaki adımları izleyin.<ol>
<li>Numuneleri 1:2 Çözelti A: 3 saat boyunca% 100 etanol içine batırın.</li>
		<li>Numuneleri 1:1 Çözelti A: 3 saat boyunca% 100 etanol içine daldırın.</li>
		<li>Numuneleri 2-4 gün boyunca saf bir bazik reçineye batırın. Bu adım sırasında, numuneleri 15 dakika boyunca günde en az dört kez düşük bir vakuma maruz bırakın ve ardından rotasyona tabi tutun.</li>
	</ol>
</li>
</ol>5. Polimerizasyon
NOT: Polimerizasyon işlemi 1,2 mL plastik kalıplar, bazik reçine ve sertleştirici gerektirir (ticari kitin ayrıntıları için Malzeme Tablosuna bakınız).
<ol><li>Polimerizasyon çözeltisini (Çözelti B) üretmek için 15 mL çözelti A'yı (adım 4.1) 1 mL sertleştiriciyle 2 dakika boyunca dönen bir beherde karıştırın.</li>
	<li>Plastik kalıplara 1,2 mL polimerizasyon çözeltisi (Çözelti B) koyun. Tahta bir toplama kullanarak, lezyonlu yaprak örneklerini saf bazik reçineden Çözelti B'ye aktarın (Şekil 2C). Cımbız kullanmaktan kaçının, çünkü doku ezilmesine neden olabilirler.</li>
	<li>B çözeltisi 5 dakika içinde hızla viskoz hale geldiğinden, yaprak numunelerinin plastik kalıplara dik olarak hızlı bir şekilde yönlendirildiğinden emin olun. Tek bir kalıba birden fazla lezyonlu yaprak örneği yerleştirilebilir. NOT: Birçok numuneye başvurmadan önce yukarıdaki adımı birkaç kez uygulamanız önerilir. Çok sayıda numune olduğunda, polimerizasyon süresi kalıplar arasında farklıdır ve yaprak numunelerinin dik oryantasyonunu elde etmek zor olabilir.</li>
	<li>Yaprak numunelerinin dik yönü elde edildiğinde, 30 dakika bekleyin ve ardından nemi önlemek için plastik kalıbı silika jel içeren plastik veya cam bir odaya aktarın. Polimerizasyon için 2-3 saat bekleyin.</li>
	<li>Reçine ve yaprak numunesi 2-3 saatlik süreden sonra polimerize edildikten sonra, blok tabanını bir zımpara dosyası ile zımparalayarak elde edilen bloğu plastik kalıptan ayırın. Ardından, bloğu bir tahta parçasına yapıştırın (Şekil 2D).</li>
</ol>6. Bölümleme
<ol><li>8 cm'lik çelik bıçaklarla donatılmış döner bir mikrotom kullanarak (Şekil 2E), bloğu 5 μm kalınlığında bölümlere ayırın. Bölümleri damıtılmış suyla kaplı cam slaytlara yerleştirin. Su üzerinde yüzen kesitli slaytları 40 °C'de sıcak bir plakaya aktararak kurutun ve bölümlerin cam slaytlara yapışmasını teşvik edin.</li>
	<li>Kuruduktan sonra (Şekil 2F), cam slaytları blok referans adı ve slayt numarası ile etiketleyin.</li>
</ol>7. Çift boyama işlemi
<ol><li>Bölümleri laktofenol içinde 2 mL% 5 pamuk mavisi (% 40 gliserol,% 20 fenol ve% 20 laktik asit) ile örtün ve 5 dakika boyunca 45 ° C'de sıcak bir plaka üzerinde ısıtın (Şekil 3A).</li>
	<li>Slaytı damıtılmış suyla doldurulmuş bir beherde üç kez yıkayarak fazla boyayı çıkarın (Şekil 3B-D).</li>
	<li>1 dakika boyunca suda 2 mL% 0.01 rutenyum kırmızısı olan leke (Şekil 3E).</li>
	<li>Slaytı damıtılmış suyla doldurulmuş bir beherde üç kez yıkayarak fazla boyayı çıkarın (Şekil 3F, G).</li>
	<li>Bölümlerin üzerine bir damla damıtılmış su koyun ve ışık mikroskobu analizi yapmak için bölümleri 24 mm x 60 mm'lik bir kapak kayması ile örtün.</li>
</ol>

<ol><li>deBary, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Research+on+the+development+of+some+parasitic+fungi%5BTitle%5D)+AND+%22Annals+of+Natural+Sciences.+Botany+and+Plant+Biology%22%5BJournal%5D)">Research on the development of some parasitic fungi.</a> Annals of Natural Sciences. Botany and Plant Biology. 20, 5(1863).</li>
<li>Mangin, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Research+on+the+Peronospores%5BTitle%5D)+AND+%22Bulletin+of+the+Natural+History+Society+of+Autun%22%5BJournal%5D)">Research on the Peronospores.</a> Bulletin of the Natural History Society of Autun. 8, 55-108 (1895).</li>
<li>Underwood, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+plant+cell+wall%3A+a+dynamic+barrier+against+pathogen+invasion%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">The plant cell wall: a dynamic barrier against pathogen invasion.</a> Frontiers in Plant Science. 3 (85), 1-6 (2012).</li>
<li>Hückelhoven, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cell+wall-associated+mechanisms+of+disease+resistance+and+susceptibility%5BTitle%5D)+AND+%22Annual+Review+of+Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Cell wall-associated mechanisms of disease resistance and susceptibility.</a> Annual Review of Phytopathology. 45, 101-127 (2007).</li>
<li>Voigt, C. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Callose-mediated+resistance+to+pathogenic+intruders+in+plant+defense-related+papillae%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Callose-mediated resistance to pathogenic intruders in plant defense-related papillae.</a> Frontiers in Plant Science. 5 (168), 1-6 (2014).</li>
<li>Chowdhury, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Differential+accumulation+of+callose%2C+arabinoxylan+and+cellulose+in+nonpenetrated+versus+penetrated+papillae+on+leaves+of+barley+infected+with+Blumeria+graminis+f.+sp.+Hordei%5BTitle%5D)+AND+%22New+Phytologist%22%5BJournal%5D)">Differential accumulation of callose, arabinoxylan and cellulose in nonpenetrated versus penetrated papillae on leaves of barley infected with Blumeria graminis f. sp. Hordei.</a> New Phytologist. 204 (3), 650-660 (2014).</li>
<li>Marques, J. P. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sugarcane+cell+wall-associated+defense+responses+to+infection+by+Sporisorium+scitamineum%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Sugarcane cell wall-associated defense responses to infection by Sporisorium scitamineum.</a> Frontiers in Plant Science. 9 (698), 1-14 (2018).</li>
<li>Caffall, K. H., Mohnen, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+structure%2C+function%2C+and+biosynthesis+of+plant+cell+wall+pectic+polysaccharides%5BTitle%5D)+AND+%22Carbohydrate+Research%22%5BJournal%5D)">The structure, function, and biosynthesis of plant cell wall pectic polysaccharides.</a> Carbohydrate Research. 344, 1879-1900 (2009).</li>
<li>Carpita, N. C., Ralph, J., McCann, M. C. The cell wall. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aCarpita%2C+NC+%22Biochemistry+and+Molecular+Biology+of+Plants.%2C+2nd+Edition%22">Biochemistry and Molecular Biology of Plants., 2nd Edition</a>. , Wiley Blackwell. New York. 45(2015).</li>
<li>Lionetti, V., Cervone, F., Bellincampi, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Methyl+esterification+of+pectin+plays+a+role+during+plant-pathogen+interactions+and+affects+plant+resistance+to+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Methyl esterification of pectin plays a role during plant-pathogen interactions and affects plant resistance to diseases.</a> Journal of Plant Physiology. 169 (16), 1623-1630 (2012).</li>
<li>Lionetti, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Pectoplate%3A+the+simultaneous+phenotyping+of+pectin+methylesterases%2C+pectinases%2C+and+oligogalacturonides+in+plants+during+biotic+stresses%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Pectoplate: the simultaneous phenotyping of pectin methylesterases, pectinases, and oligogalacturonides in plants during biotic stresses.</a> Frontiers in Plant Science. 6 (331), 1-8 (2015).</li>
<li>Lionetti, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three+pectin+methylesterase+inhibitors+protect+cell+wall+integrity+for+Arabidopsis+immunity+to+Botrytis%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Three pectin methylesterase inhibitors protect cell wall integrity for Arabidopsis immunity to Botrytis.</a> Plant Physiology. 173 (3), 1844-1863 (2017).</li>
<li>Heath, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Haustorium+sheath+formation+in+cowpea+leaves+immune+to+rust+infection%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Haustorium sheath formation in cowpea leaves immune to rust infection.</a> Phytopathology. 61, 383-388 (1971).</li>
<li>Silva, M. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coffee+resistance+to+the+main+diseases%3A+leaf+rust+and+coffee+berry+disease%5BTitle%5D)+AND+%22Brazilian+Journal+of+Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Coffee resistance to the main diseases: leaf rust and coffee berry disease.</a> Brazilian Journal of Plant Physiology. 18 (1), 119-147 (2006).</li>
<li>An, P., Li, X., Zheng, Y., Eneji, A. E., Inanaga, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Calcium+effects+on+root+cell+wall+composition+and+ion+contents+in+two+soybean+cultivars+under+salinity+stress%5BTitle%5D)+AND+%22Canadian+Journal+of+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Calcium effects on root cell wall composition and ion contents in two soybean cultivars under salinity stress.</a> Canadian Journal of Plant Science. 94 (4), 733-740 (2014).</li>
<li>Marques, J. P. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sugarcane+smut%3A+shedding+light+on+the+development+of+the+whip-shaped+sorus%5BTitle%5D)+AND+%22Annals+of+Botany%22%5BJournal%5D)">Sugarcane smut: shedding light on the development of the whip-shaped sorus.</a> Annals of Botany. 119 (5), 815-827 (2017).</li>
<li>Delaye, L., García-Guzmán, G., Heil, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Endophytes+versus+biotrophic+and+necrotrophic+pathogens-are+fungal+lifestyles+evolutionarily+stable+traits%5BTitle%5D)+AND+%22Fungal+Diversity%22%5BJournal%5D)">Endophytes versus biotrophic and necrotrophic pathogens-are fungal lifestyles evolutionarily stable traits.</a> Fungal Diversity. 60 (1), 125-135 (2013).</li>
<li>Avelino, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+coffee+rust+crises+in+Colombia+and+Central+America+%282008-2013%29%3A+impacts%2C+plausible+causes+and+proposed+solutions%5BTitle%5D)+AND+%22Food+Security%22%5BJournal%5D)">The coffee rust crises in Colombia and Central America (2008-2013): impacts, plausible causes and proposed solutions.</a> Food Security. 7, 303-321 (2015).</li>
<li>Zambolim, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Current+status+and+management+of+coffee+leaf+rust+in+Brazil%5BTitle%5D)+AND+%22Tropical+Plant+Pathology%22%5BJournal%5D)">Current status and management of coffee leaf rust in Brazil.</a> Tropical Plant Pathology. 41, 1-8 (2016).</li>
<li>Swiderska-Burek, U., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Phytopathogenic+Cercosporoidfungi-from+taxonomy+to+modern+biochemistry+and+molecular+biology%5BTitle%5D)+AND+%22International+Journal+of+Molecular+Sciences%22%5BJournal%5D)">Phytopathogenic Cercosporoidfungi-from taxonomy to modern biochemistry and molecular biology.</a> International Journal of Molecular Sciences. 21 (22), 8555(2020).</li>
<li>Andrade, C. C. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Infection+process+and+defense+response+of+two+distinct+symptoms+of+Cercospora+leaf+spot+in+coffee+leaves%5BTitle%5D)+AND+%22Phytoparasitica%22%5BJournal%5D)">Infection process and defense response of two distinct symptoms of Cercospora leaf spot in coffee leaves.</a> Phytoparasitica. 49 (7), 727-737 (2021).</li>
<li>Zambolim, L. Coffee tree diseases. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aZambolim%2C+L+%22Handbook+of+Phytopathology%3A+Diseases+of+cultivated+plants.+5th+ed%22">Handbook of Phytopathology: Diseases of cultivated plants. 5th ed</a>. , Agronômica Ceres Santana (in Portuguese). São Paulo. 810(2016).</li>
<li>Castaño, A. J. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coffee+rust%5BTitle%5D)+AND+%22Informative+report+Cenicaf%C3%A9%22%5BJournal%5D)">Coffee rust.</a> Informative report Cenicafé. 82, 313-327 (1956).</li>
<li>Echandi, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Coffee+rust%2C+caused+by+the+fungus+Cercospora+coffeicola%5BTitle%5D)+AND+%22Turrialba%22%5BJournal%5D)">Coffee rust, caused by the fungus Cercospora coffeicola.</a> Turrialba. 9 (2), 54-67 (1959).</li>
<li>Souza, A. G. C., Rodrigues, F. A., Maffia, L. A., Mizubuti, E. S. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Infection+process+of+Cercospora+coffeicola+on+coffee+leaf%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Infection process of Cercospora coffeicola on coffee leaf.</a> Journal of Phytopathology. 159 (1), 6-11 (2011).</li>
<li>Karnovsky, M. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+formaldehyde-glutaraldehyde+fixative+of+high+osmolality+for+use+in+electron+microscopy%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Cell+Biology%22%5BJournal%5D)">A formaldehyde-glutaraldehyde fixative of high osmolality for use in electron microscopy.</a> Journal of Cell Biology. 27, 137-138 (1965).</li>
<li>Hoagland, D. R., Arnon, D. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+water-culture+method+for+growing+plants+without+soil%5BTitle%5D)+AND+%22College+of+Agriculture%2C+Agricultural+Experiment+Station%22%5BJournal%5D)">The water-culture method for growing plants without soil.</a> College of Agriculture, Agricultural Experiment Station. , University of California. Berkeley, California. 347(1950).</li>
<li>Eskes, A. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Coffee+rust%3A+epidemiology%2C+resistance+and+management%22%5BJournal%5D)">Resistance.</a> Coffee rust: epidemiology, resistance and management. 1, Boca Raton. 171(1989).</li>
<li>Silva, M. C., Nicole, M., Rijo, L., Geiger, J. P., Rodrigues, C. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cytochemical+aspects+of+the+plant-rust+fungus+interface+during+the+compatible+interaction+Coffea+arabica+%28cv.+Caturra%29-Hemileia+vastatrix+%28race+III%29%5BTitle%5D)+AND+%22International+Journal+of+Plant+Sciences%22%5BJournal%5D)">Cytochemical aspects of the plant-rust fungus interface during the compatible interaction Coffea arabica (cv. Caturra)-Hemileia vastatrix (race III).</a> International Journal of Plant Sciences. 160 (1), 79-91 (1999).</li>
<li>Alves, R. F., Marques, J. P. R., Apezzato-da-Glória, B., Spósito, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Process+of+infection+and+colonization+of+Pseudocercospora+kaki+in+persimmon+leaves%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Process of infection and colonization of Pseudocercospora kaki in persimmon leaves.</a> Journal of Phytopathology. 169 (3), 168-175 (2020).</li>
<li>Hayat, M. A. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHayat%2C+MA+%22Principles+and+Techniques+of+Electron+Microscopy%3A+Biological+Applications%2C+Vol.+1%22">Principles and Techniques of Electron Microscopy: Biological Applications, Vol. 1</a>. , International Publishing. Berkeley Heights. 564(1981).</li>
<li>Paiva, E. A. S., Pinho, S. Z., Oliveira, D. M. T. Large plant samples: how to process for GMA embedding. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aPaiva%2C+EAS+%22Light+microscopy%3A+methods+and+protocols%22">Light microscopy: methods and protocols</a>. Chiarini-Garcia, H., Melo, R. C. N. 689, Humana Press. 37-49 (2011).</li>
<li>Marques, J. P. R., Soares, M. K. M., Appezzato-da-Glória, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((New+staining+technique+for+fungal-infected+plant+tissues%5BTitle%5D)+AND+%22Turkish+Journal+of+Botany%22%5BJournal%5D)">New staining technique for fungal-infected plant tissues.</a> Turkish Journal of Botany. 37 (4), 784-787 (2013).</li>
<li>Schuller, A., Ludwig-Müller, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histological+methods+to+detect+the+clubroot+pathogen+Plasmodiophora+brassicae+during+its+complex+life+cycle%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Pathology%22%5BJournal%5D)">Histological methods to detect the clubroot pathogen Plasmodiophora brassicae during its complex life cycle.</a> Plant Pathology. 65 (8), 1223-1237 (2016).</li>
<li>Braga, Z. V., Santos, R. F., Amorim, L., Appezzato-da-Glória, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histopathological+evidence+of+concomitant+sexual+and+asexual+reproduction+of+Elsino%C3%AB+ampelina+in+grapevine+under+subtropical+climate%5BTitle%5D)+AND+%22Physiological+and+Molecular+Plant+Pathology%22%5BJournal%5D)">Histopathological evidence of concomitant sexual and asexual reproduction of Elsinoë ampelina in grapevine under subtropical climate.</a> Physiological and Molecular Plant Pathology. 111, 101517(2020).</li>
<li>Marques, J. P. R., Soares, M. K. M. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMarques%2C+JPR+%22Manual+of+Techniques+Applied+to+Plant+Histopathology%22">Manual of Techniques Applied to Plant Histopathology</a>. Piracicaba, F. E. A. L. Q. , Santana. in Portuguese 140(2021).</li>
<li>Navarro, B. L., Marques, J. P. R., Appezzato-da-Glória, B., Spósito, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Histopathology+of+Phakopsora+euvitis+on+Vitis+vinifera%5BTitle%5D)+AND+%22European+Journal+of+Plant+Pathology%22%5BJournal%5D)">Histopathology of Phakopsora euvitis on Vitis vinifera.</a> European Journal of Plant Pathology. 154, 1185-1193 (2019).</li>
<li>Chesters, C. G. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Three+methods+of+using+cotton+blue+as+a+mycological+stain%5BTitle%5D)+AND+%22Annals+of+Botany%22%5BJournal%5D)">Three methods of using cotton blue as a mycological stain.</a> Annals of Botany. 48 (3), 820-822 (1934).</li>
<li>Macedo, N. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Manual+of+Techniques+in+Plant+Histology%5BTitle%5D)+AND+%22Feira+de+Santana%3A+State+University+of+Feira+de+Santana%22%5BJournal%5D)">Manual of Techniques in Plant Histology.</a> Feira de Santana: State University of Feira de Santana. , in Portuguese 68(1997).</li>
<li>Lecker, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Preparation+of+lactophenol+cotton+blue+slide+mounts%5BTitle%5D)+AND+%22Community+Eye+Health+Journal%22%5BJournal%5D)">Preparation of lactophenol cotton blue slide mounts.</a> Community Eye Health Journal. 12 (30), 24(1999).</li>
<li>Whitakaer, F. C. S., Denison, F. C. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lactic+acid+in+wool+dyeing%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+the+Society+of+Dyers+and+Colourists%22%5BJournal%5D)">Lactic acid in wool dyeing.</a> Journal of the Society of Dyers and Colourists. 98, 103(1895).</li>
<li>Chamberlain, C. J. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aChamberlain%2C+CJ+%22Methods+in+Plant+Histology%22">Methods in Plant Histology</a>. , The University of Chicago Press. Chicago. 349(1932).</li>
<li>Sterling, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Crystal-structure+of+ruthenium+red+and+stereochemistry+of+its+pectin+stain%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Botany%22%5BJournal%5D)">Crystal-structure of ruthenium red and stereochemistry of its pectin stain.</a> American Journal of Botany. 57, 172-175 (1970).</li>
<li>Luft, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ruthenium+red+and+violet.+1.+Chemistry%2C+purification%2C+methods+of+use+for+electron+microscopy+and+mechanism+of+action%5BTitle%5D)+AND+%22The+Anatomical+Record%22%5BJournal%5D)">Ruthenium red and violet. 1. Chemistry, purification, methods of use for electron microscopy and mechanism of action.</a> The Anatomical Record. 171 (3), 347-368 (1971).</li>
<li>Buckeridge, M. S., Cavalari, A. A., Silva, G. B. D. A. Cell Wall. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aBuckeridge%2C+MS+%22Plant+Physiology%22">Plant Physiology</a>. Kerbauy, G. B. , Guanabara Koogan. Rio de Janeiro. in Portuguese 165-181 (2013).</li>
</ol>

Yazarlar çıkar çatışması olmadığını beyan ederler.

Bu çalışma, biyotrofik bir patosistemde haustoriayı kapsülleyen hücre duvarlarının pektin bileşimini araştırmak için alternatif bir çift boyama histokimyasal testi sunmaktadır. Amaç ayrıca, nekrotrofik mantarı ve bunun neden olduğu hücre duvarı değişikliklerini tespit etmek için yöntemin etkinliğini göstermektir. Burada, kahve parankimi hücre duvarlarının pektini, pas mantarı Hemileia vastatrix'in hem boynunu hem de haustoriumunu kapsayabilir. Silva ve ark. ayrıca kahve-H. vastatrix pathosystem 14,29'da...

Bitkilerde hücre duvarı savunma mekanizmaları mantar enfeksiyonunu engellemek için çok önemlidir. Çalışmalar, 19.yüzyıldan bu yana hücre duvar kalınlığı ve bileşimindeki değişiklikleri bildirmiştir 1,2. Bu değişiklikler, mantarların hücreye girmesini önleyen bir papilla oluşumunu uyaran bir mantar patojeni tarafından indüklenebilir veya konakçı hücre protoplastını mantar haustoriasından izole etmek için hifleri kapsüllemek için kullanılabilir. Dinamik bir hücre duvarı bariyerinin (yani, papillalar ve tamamen kaplanmış bir haustorium) üretimi, bitki direncini arttırmak için önemlidir3. Mantarla ilişkili hastalıklar üzerine yapılan histopatolojik çalışmalar bu mekanizmaların oluşumunu araştırmış ve hücre duvarı polimerleri, selüloz, hemiselüloz (arabinoksilans) ve kalozu mantar atağına direnç mekanizmaları olarak tanımlamıştır 4,5,6,7.
Hücre duvarı, mikroorganizma saldırısına karşı ilk bariyerdir ve bitki-mantar etkileşimini bozar. Pektik polisakkaritler hücre duvarını oluşturur ve homogalakturonanların en bol polimer (kabaca% 60) olduğu ödikot bitkilerinin birincil hücrelerinde hücre duvarı bileşiminin yaklaşık% 30'unu oluşturur8. Golgi, metillenmiş veya metillenemeyen galakturonik asit zincirlerini oluşturan kompleks pektin bileşiklerini salgılar 8,9. 2012 yılından bu yana, literatür, pektin metil esterifikasyon derecesinin, mikrobiyal pektik enzimler10,11,12 tarafından enfeksiyon sırasında uyumluluğu belirlemek için kritik öneme sahip olduğuna dikkat çekmiştir. Bu nedenle, bitki-mantar patosistemlerinde pektik bileşiklerin varlığını ve dağılımını doğrulamak için protokoller gereklidir.
Papilla veya haustoria'nın kapsüllenmesini tespit etmek için çeşitli teknikler kullanılmıştır. Kullanılan referans yöntemleri sabit dokunun transmisyon elektron mikroskobu (TEM) ve canlı ve sabit dokuların ışık mikroskobudur. TEM ile ilgili olarak, çeşitli çalışmalar mantar direncinde hücre duvarı appozisyonlarının yapısal rolünü göstermiştir 13,14,15,16 ve lektinlerin ve antikorların kullanımının karbonhidrat polimerlerini bulmak için karmaşık bir yöntem olduğunu göstermiştir 16. Bununla birlikte, çalışmalar ışık mikroskobunun önemli bir yaklaşım olduğunu ve histokimyasal ve immünohistokimyasal araçların papilla ve haustorium encasement 6,7'nin bileşiminin daha iyi anlaşılmasını sağladığını göstermektedir.
Patojenik mantarlar iki ana yaşam tarzı türü gösterir: biyotrofik ve nekrotrofik. Biyotrofik mantarlar beslenmeleri için canlı hücrelere bağımlıyken, nekrotrofik mantarlar konakçı hücreleri öldürür ve daha sonra ölü dokularda yaşar17. Latin Amerika'da, Hemileia vastatrix mantarının neden olduğu kahve yaprağı pası, kahve bitkilerinde önemli bir hastalıktır18,19. Hemileia vastatrix biyotrofik bir davranış sergiler ve dirençli kahve türlerinde veya çeşitlerinde gözlenen yapısal değişiklikler arasında aşırı duyarlılık yanıtı, hücre duvarlarında kalloz, selüloz ve lignin birikimi ve hücre hipertrofisi14 bildirilmiştir. Yazarların bilgisine göre, literatür pektinin kahve pas direncindeki önemi hakkında bilgi vermemektedir. Öte yandan, cercosporiosise neden olan nekrotrofik mantarlar, pektinazlar ve poligalakturonaz20 gibi hücre duvarı bozulması ile ilişkili bir dizi enzim yoluyla pektin'i hedef alır. Cercospora coffeicola mantarının neden olduğu kahvedeki cercosporiosis de kahve bitkileri için büyük bir tehdittir21,22. Bu mantar hem yapraklarda hem de meyvelerde nekrotik lezyonlara neden olur. Penetrasyondan sonra, C. coffeicola bitki dokularını hücre içi ve hücreler arası yollar23,24,25 yoluyla kolonize eder.
Mevcut protokol, hücre duvarlarında mantar yapılarının ve pektinin varlığını araştırmaktadır. Bu protokol, konakçı tarafından mantar ile biyotrofik bir etkileşimde indüklenen pektin (pektinin poliüronik asitlerinin asidik gruplarına özgü rutenyum kırmızı boya ile boyanmış) ile ilişkili bitki tepkisini tanımlamak için yararlıdır. Ayrıca nekrotrofik mantarların pektik hücre duvarlarının bozulması üzerindeki etkisini doğrulamaya yardımcı olur. Mevcut sonuçlar, çift boyama yönteminin yapıları ve mantarların üreme evresini ayırt etmede etkili olduğunu göstermektedir.

<table><tbody><tr><td>Bıçaklar DB80 HS</td><td>Leica</td><td>14035838383</td><td>Kesit</td></tr><tr><td>Kakodilat tamponu</td><td>EMS</td> <td># 11652</td><td>Fiksasyon</td></tr><tr><td>Pamuk Mavisi Laktofenol</td><td>Metaqu&iacute; mika</td><td>70SOLSIG024629</td><td>Boyama</td></tr><tr><td>Formaldehit</td><td>EMS</td> <td># 15712</td><td>Fiksasyon</td></tr><tr><td>Glutaraldehit</td><td>EMS</td> <td># 16216</td><td>Fiksasyon</td></tr><tr><td>Historesin Kiti</td><td>Technovit / EMS #</td> <td>14653</td><td></td></tr><tr><td>Sıcak plaka</td><td>Dubesser</td><td>SSCD25X30-110V</td><td>Boyama</td></tr><tr><td>Mikroskobu</td><td>Zeiss</td> <td># 490040-0030-000</td><td>Görüntü yakalama</td></tr><tr><td>Mikrotom (Leica RM 2540)</td><td>Leica</td><td>149BIO000C1 14050238005</td><td>Kesit</td></tr><tr><td>Plastik kalıplama kabı tepsisi</td><td>EMS</td><td>10176-30</td><td>Boyama</td></tr><tr><td>Rutenyum kırmızı</td><td>LABHouse</td><td>#006004</td><td>Boyama</td></tr><tr><td>Yazılımı Axion Vision</td><td>Zeiss</td> <td># 410130-0909-000</td><td>Görüntü yakalama</td></tr><tr><td>Vakum pompası</td><td>Prismatec</td><td>131 TIPO 2 VC</td><td>Fiksasyon</td></tr></tbody></table>

bitki-mantar etkileşiminde pektini tespit etmek için Çift boyama yöntemi

Double-Staining Method to Detect Pectin in Plant-Fungus Interaction

Bitki hücreleri, kendilerini mantar enfeksiyonundan korumak için kurucu veya indüklenebilir farklı yapısal mekanizmalar kullanırlar. Enkapsülasyon, mantar haustoriasını bitki hücresi protoplastından izole etmek için etkili bir indüklenebilir mekanizmadır. Tersine, hücre duvarının polimerik bileşenlerinden biri olan pektin, nekrotrofik etkileşimlerde birkaç pektolitik enzimin hedefidir. Burada, optik mikroskopi yoluyla pektin ve mantar hiflerini tespit etmek için bir protokol sunulmaktadır. Pas mantarı Hemileia vastatrix ile enfekte olmuş kahve yapraklarının hücrelerinde pektin bakımından zengin kapsüllenme ve Cercospora coffeicola tarafından indüklenen mezofil hücre duvarı modifikasyonu araştırılmıştır. Lezyonlu yaprak örnekleri Karnovsky çözeltisi ile sabitlendi, dehidre edildi ve 2-4 gün boyunca glikol metakrilat içine gömüldü. Tüm adımları, hücreler arası boşluklardaki havayı uzaklaştırmak ve gömme işlemini iyileştirmek için vakum pompalama izledi. Gömülü bloklar, suyla kaplı bir cam slayt üzerinde biriktirilen ve daha sonra 30 dakika boyunca 40 ° C'de ısıtılan 5-7 μm kalınlığında bölümlere ayrıldı. Daha sonra, slaytlar mantarı tespit etmek için laktofenolde% 5 pamuk mavisi ve pektini (pektinin poliüronik asitlerinin asidik grupları) tespit etmek için suda% 0.05 rutenyum kırmızısı ile çift boyandı. Hemileia vastatrix'in fungal haustoria'sının pektin tarafından kapsüllendiği bulundu. Kahve cercosporiosis'te mezofil hücrelerinde hücre duvarlarında çözünme görüldü ve hücreler arası hifa ve konidioforlar gözlendi. Burada sunulan yöntem, bitki-mantar etkileşiminde pektin ile ilişkili bir yanıtı tespit etmek için etkilidir.

GMA gömülü bölümdeki pamuk mavisi laktofenol boyaması, hem biyotrofik hem de nekrotrofik mantar etkileşimlerinde kahve mezofil hücreleri arasında ve içinde çeşitli mantar yapılarının varlığını ortaya koymuştur.
Biyotrofik patosistemde, çift boyama yöntemi kullanılarak boyandığında, hücre duvarları içeren Hemileia vastatrix hifleri ve yoğun protoplast içeriği hem süngerimsi hem de palisade parankimde koyu mavi renkte görünür (Şekil 4A,B). ...

Bu protokol, kahve-mantar etkileşiminde pektini tespit etmek için mikroskobik bir yöntemi açıklar.

Bitki-Mantar Etkileşiminde Pektini Tespit Etmek için Çift Boyama Yöntemi

Plant cells use different structural mechanisms, either constitutive or inducible, to defend themselves from fungal infection. Encapsulation is an ...

Bu protokol, bitki-mantar etkileşimini tanımlamayı mümkün kıldığı için önemlidir. Pektinin renklendirilmesine ek olarak, patojen hücre duvarı polimerindeki kusurları da gösterir ve mantar yapılarının tanımlanmasına izin verir. Bu basit ve karmaşık olmayan teknik, ışık mikroskobu kullanılarak gerçekleştirilebilir ve taramalı elektron mikroskobu gibi pahalı ekipmanlar gerektirmez.Ek olarak, histopatolojik çalışmalar için bitki yapılarının mükemmel bir ayrımını elde eden hızlı bir tekniktir. Bu teknik, bitki-mantar etkileşimini tanımlar. Bu nedenle, kahve pası ve cercosporiosis gibi biyotrofik ve nekrotrofik mantarların neden olduğu hastalıkları teşhis etmek için işbirliği yapmaktadır.Başlamak için, bir neşter ve cımbız kullanarak lezyonun orta bölgesinde yaklaşık 10 milimetre kare yaprak örneği toplayın ve 30 mililitre Karnovsky fiksatif çözeltisine batırın. Yaprak numunesini, yaprak dokusundaki fiksatif çözeltinin geçirgenliğini arttırmak için bir yağ pompası kullanarak 15 dakika boyunca 500 ila 600 milibarlık düşük bir vakuma maruz bırakın. Fiksasyondan sonra, yaprak numunesini damıtılmış suda seyreltilmiş 0,5 M kakodilat tamponunda her biri beş dakika boyunca üç kez yıkayın ve daha sonra her etanol konsantrasyonunda 15 dakika boyunca derecelendirilmiş bir etanolik seriye aktarın.Numuneleri yavaş yavaş glikol metakrilatına aktarmak için, manyetik ajitasyon altında bir gram glikol metakrilat tozunu 100 mililitre bazik reçine ile karıştırarak Çözelti A'yı yapın. Daha sonra, numuneleri üç saat boyunca bir ila iki Çözelti A ve% 100 etanol oranında daldırın. Numuneleri Çözelti A:% 100 etanol için bire bir oranında üç saat boyunca daldırın, ardından iki ila dört gün boyunca saf bir bazik reçineye batırın.Numuneyi 15 dakika boyunca günde en az dört kez düşük bir vakuma maruz bırakın, ardından rotasyon yapın. Polimerizasyon Çözeltisi B.Bu polimerizasyon Çözeltisi B'nin 1.2 mililitresini plastik kalıplara koyun. Tahta bir toplama kullanarak, lezyonlu yaprak örneklerini saf bazik reçineden B Çözeltisine aktarın ve doku ezilmesine neden olabileceğinden cımbız kullanmaktan kaçının.B Çözeltisi hızla viskoz hale geldiğinden, yaprak numunelerinin plastik kalıplara dik olarak hızlı bir şekilde yönlendirildiğinden emin olun. Yaprak numunelerinin dik yönü elde edildiğinde, 30 dakika bekleyin ve ardından nemi önlemek için plastik kalıbı silika jel içeren plastik veya cam bir odaya aktarın. Reçine ve yaprak numunesi iki ila üç saat sonra polimerize edildikten sonra, blok tabanını bir zımparalama dosyası ile zımparalayarak elde edilen bloğu plastik kalıptan ayırın.Ardından, bloğu bir tahta parçasına yapıştırın. Sekiz santimetre çelik bıçaklarla donatılmış döner bir mikrotom kullanarak bloğu beş mikrometre kalınlığında bölümlere ayırın. Bölümleri damıtılmış suyla kaplı cam slaytlara yerleştirin.Ardından, slaytları 40 santigrat derecede kuruması için sıcak bir plakaya aktarın ve bölümlerin cam slaytlara yapışmasını teşvik edin. Kuruduktan sonra, cam slaytları blok referans adı ve slayt numarası ile etiketleyin. Bölümleri laktofenol içinde iki mililitre% 5 pamuk mavisi ile örtün ve beş dakika boyunca 45 santigrat derecede sıcak bir plaka üzerinde ısıtın.Slaytı damıtılmış suyla doldurulmuş bir beherde üç kez yıkayarak fazla boyayı çıkarın. Bir dakika boyunca suda iki mililitre% 0.01 rutenyum kırmızısı ile lekeleyin. Slaytı damıtılmış suyla doldurulmuş bir beherde üç kez yıkayarak fazla boyayı çıkarın.Bölümlerin üzerine bir damla damıtılmış su koyun ve ışık mikroskobu analizi yapmak için bölümleri bir kapak fişi ile örtün. Çift boyama yönteminde, hücre duvarları ve yoğun protoplast içeriği içeren Hemileia vastatrix hifleri hem süngerimsi hem de palisade parankimde koyu mavi renkte göründü. Haustorium ana hücresi ve haustoria da koyu mavi bir renk sergiledi.Rutenyum kırmızısı ile karşı boyama, hücreler arası boşluklarda mantar dağılımını açıkça tanımladı. Etkileşim sırasında, Hemileia vastatrix haustorium ana hücresi konakçı hücre duvarını kırdı ve pektik bileşiklerle çevrili bir haustorial boyun geliştirdi. Haustorial boynun pektin bakımından zengin pembe-kırmızı renkli kapsüllenmesi haustorial oluşumu önleyemez.Bazı durumlarda, pektin bakımından zengin kapsülleme, haustorium'u eksik bir şekilde kapladı. Ve bazı durumlarda, haustorium tamamen kapsüllenir. Pektin bakımından zengin hücre duvarı, mantarın bulunmadığı lezyon sınırındaki bütünlüğü korur.Çift boyama yöntemi, hücreler arası hifaların varlığını gösterdi. Etkileşim bölgelerinde, pektin hücre duvarlarının çözünme nedeniyle bütünlüklerini kaybettiği görülmüştür. Adaksiyal epidermiste konidia gibi üreme yapıları bulundu.Substomatik kamarada kıvrılma yapıları olarak Cercospora coffeicola hifaları saptandı ve lezyon bölgesindeki palisade parankimi hücre duvarı lizisine uğramış gibi görünüyor. Cımbız kullanmaktan kaçının, çünkü doku ezilmesine neden olabilirler. Paslar, antraknoz, cercosporiosis, smuts ve diğer biyotrofik, hemibiyotrofik ve nekrotrofik bitki-fungal etkileşimleri üzerine daha ileri histopatolojik çalışmalar, bu tekniğin farklı patosistemlerde potansiyel kullanımını araştırmak için yapılmalıdır.

double-staining-method-to-detect-pectin-in-plant-fungus-interaction

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Bu video, bir kahve pası bitkisindeki bitki-mantar etkileşimleri sırasında pektinleri ve kitinleri görselleştirmek için rutenyum kırmızısı ve laktofenol pamuk mavisi kullanan bir çift boyama yöntemini göstermektedir. Prosedür, mantar enfeksiyonları sırasında bitki savunma mekanizmalarının anlaşılmasına yardımcı olur.

Çift Boyama Yöntemi: Rutenyum Kırmızısı ve Laktofenol Pamuk Mavisi Kullanarak Bitki-Mantar Etkileşimlerini Görselleştirme Tekniği

Bu videoda, mikroskopi kullanarak mantar hifleri üzerinde bakteriyel biyofilmleri büyütmek ve kalitatif olarak analiz etmek için bir yöntem açıklanmaktadır. Bakteriyel biyofilmler sıklıkla mantar yüzeylerinde oluşur ve metabolik işbirliği, rekabet veya avlanma gibi çok sayıda bakteri-mantar etkileşim sürecini içerir.

Mantar Hifleri Üzerinde Biyofilm Oluşturan Bakterileri Görselleştirmek için Numune Hazırlama Yöntemi

Bu video, bitki dokularındaki arabinogalaktan proteinlerini (AGP'ler) ve pektinleri lokalize etmek için bir immün boyama tekniğini göstermektedir. Sabit ve reçineye gömülü bitki doku kesitleri, hücre duvarındaki dokuya özgü kolokalizasyonlarını ortaya çıkarmak için AGP ve pektin spesifik birincil ve floresan ikincil antikorlar ve selüloz bağlayıcı bir floresan boya ile boyanır.

Bitki dokusunda Arabinogalaktan proteinlerinin ve pektinlerin immünolokalizasyonu

Bitki hücre duvarı bileşimi doku tipleri arasında farklılık gösterir ve lignin, selüloz, hemiselülozlar ve pektin içerebilir. Hücre tipi düzeyindeki farklılıkları görselleştirmek için çeşitli boyama teknikleri geliştirilmiştir. Bu makale, yaygın olarak kullanılan hücre duvarı boyama tekniklerinin bir derlemesidir.

Histokimyasal boyama<em&gt; Arabidopsis thaliana</em&gt; Ortaöğretim Hücre Duvar Elemanları

Hayati floresan boyalar modern mantar hücre biyolojisinde canlı hücre görüntüleme analizleri için gerekli araçlardır. Bu yazıda, filamentöz mantarlarda plazma membran dinamiği, endo-/eksositoz ve hücre duvarı morfogenezinin izlenmesi için kurulmuş ve daha az bilinen floresan boyaların uygulanması ayrıntılı olarak anlatılır.

Filamentöz Mantarların Canlı Hücre Görüntülemesi İçin Membran ve Hücre Duvarı Seçici Floresan Boyaların Uygulanması

Bu protokol, Arabinogalactan proteinlerinin ve pektinlerinin immünolokalizasyonu için bitki materyalinin hidrofilik akrilik reçineye gömülü, bölümlenmiş ve cam slaytlara monte edilmiş nasıl sabitlendiğini ayrıntılı olarak açıklar. Hücre duvarı ile ilgili epitopların spesifik antikorlarla tespit edileceğini gösteriyoruz.

Bitki Dokularının Hücre Duvarındaki Arabinogalactan Protein ve Pektinlerin Floresan İmmünolokalizasyonu

Buradaki protokol, arbusküler mikorizal kolonizasyon paternlerinin değerlendirilmesi için yöntemleri ve iki türün köklerindeki stratejiyi açıklamaktadır: Zea mays ve Festuca rubra. MycoPatt yönteminin kullanılması, parametrelerin hesaplanmasına, mikorizal yapıların dijital verilere dönüştürülmesine ve köklerdeki gerçek konumlarının haritalandırılmasına izin verir.

Festuca rubra ve Zea mays'ın Köklerinde Kolonizasyon Kalıplarını ve Mantar Stratejilerini Keşfetmek İçin Bir Araç Olarak Mikorizal Haritalar

Bu protokol, mikoheterotrofik bitki örneklerinin toplanması, sabitlenmesi ve sürdürülmesi için ayrıntılı prosedürler sağlamayı, mikorizal mantarlarla çimlenmiş bitki dokularında ve tohumlarda mantar kolonizasyonunu incelemek için tarama ve iletim elektron mikroskobu, ışık, konfokal ve floresan mikroskobu gibi farklı mikroskopi tekniklerini uygulamayı amaçlamaktadır.

Mikoheterotrofik Bitki Dokularında Mantar Kolonizasyonunu Yorumlamak ve Tohumların Simbiyotik Çimlenmesi için Mikroskopi Teknikleri

Toprağın opaklığı nedeniyle, kurucu mikroplar arasındaki etkileşimler hücresel çözünürlükle kolayca görselleştirilemez. Burada, mantar-mikrobiyal etkileşimleri araştırmak için yeni fırsatlar sunan iki mikroakışkan araç sunulmaktadır. Cihazlar çok yönlü ve kullanımı kolaydır, bu da hücresel düzeyde yüksek mekansal zamansal kontrol ve yüksek çözünürlüklü görüntüleme sağlar.

Hücresel Düzeyde Mantar-Mikrobiyal Etkileşimleri Probalamak için Mikroakışkan Araçlar

Bu makale, bitki ilişkili endofitik mantarların izolasyonu, izolatların uzun süreli korunması, morfolojik karakterizasyon ve sonraki moleküler tanımlama ve metagenomik analizler için toplam DNA ekstraksiyonu için ayrıntılı ve yeterli protokoller sağlamayı amaçlamaktadır.

Mikoheterotrofik Bitkilerde Endofitik Mantarları Tanımlamak için İzolasyon, Karakterizasyon ve Toplam DNA Ekstraksiyonu

Bu rapor, tek hücreli streptofit algi Penium margaritaceum'u kültürlemek ve deneysel olarak manipüle etmek için kullanılan temel yöntemleri açıklamaktadır. Ayrıca, monoklonal antikorlar ve diğer floresan problar ve taramalı elektron mikroskobu ile canlı hücre etiketleme dahil olmak üzere mikroskopi tabanlı görüntülemenin temel protokollerini sağlar.

Penium margaritaceum için Deneysel Tarama Protokolleri, İmmünositokimya ve Mikroskopi Tabanlı Görüntüleme Teknikleri

Öğrenin, bitki-mantar etkileşimlerinde pektin tespiti için çift boyama yöntemini. Hemileia vastatrix ve Cercospora coffeicola gibi patojenlerin hücre duvarı bütünlüğünü ışık mikroskobuyla inceleyin.

Bitki-Mantar Etkileşiminde Pektini Tespit Etmek için Çift Boyama Yöntemi

Daha fazla video keşfet