Name: Şeker Kamışı Kök Sistemlerini Karakterize Etmek için Çok Yönlü Fenotipleme Yaklaşımları (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2022-08-17T13:00:00.000+00:00
Duration: 9 min 21 s
Description: Keşfedin şeker kamışı kök sistemlerini karakterize etmek için çok yönlü fenotipleme yaklaşımlarını. Bu yöntem, Saccharum türlerindeki morfolojik varyasyonları ve stres yanıtlarını inceleyerek ıslah stratejilerini geliştirir.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

1. Hendek örneklemesi ile saha kazısı
<ol>
	<li>Tarlada ticari şeker kamışı melezlerini (bundan böyle "çeşitler" olarak anılacaktır), 120 cm'lik bir sıra aralığında, 90 cm'si sıralar içinde olacak şekilde, önerilen uygulama paketini (POP) izleyerek yetiştirin.</li>
	<li>Mahsulün olgunluk aşamasının sonunda, tarlada bir hendek (1,5 m derinliğinde ve 1,0 m genişliğinde) kazmak için bir ekskavatör kullanın. Sürekli su jeti ile köklere zarar vermeden kök bölgelerinden toprakların temizlenmesini sağlayın (Şekil 1).</li>
	<li>Yapışan toprak gevşediğinde, kamışı kök sistemi ile birlikte sökün ve kök sayısının, kök uzunluğunun, hacminin ve ağırlığının manuel olarak ölçülmesi için laboratuvara götürün.</li>
</ol>
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig01.jpg"> 
Şekil 1: Köklerin arazi kazısı için hendek örnekleme yöntemi. (A) Tarla boyunca kazılmış yana doğru hendek, (B) su jeti ve (C) açmanın derinliğini gösteren iç görünüm. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig01large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
2. Örnekleme hatalarını azaltmak için kök çekirdek örnekleyici
<ol>
	<li>Tarlada şeker kamışı kökü örneklemesi için yumuşak çelik (MS) malzeme kullanılarak imal edilmiş, 61 cm yüksekliğinde ve 16 cm çapında, 8 kg ağırlığında silindirik bir kök çekirdek örnekleyici kullanın. Toprağa yerleştirirken kolay nüfuz etmesini kolaylaştırmak için örnekleyicinin alt kenarında keskin bir kenar sağlayın. Örnekleyiciyi kaldırmak için üst kısma 3 cm çapında bilezikler sağlayın (Şekil 2).</li>
	<li>Tarladaki şeker kamışı çeşitlerini, iyi mahsul oluşumu ve büyümesini sağlamak için önerilen POP'u takip ederek, 120 cm sıra aralığında, sıra içinde 90 cm olacak şekilde ekilen iki tomurcuklu setlerden yetiştirin.</li>
	<li>Mahsulün olgunluk aşamasında, numune alma cihazının üst kenarını birincil sürgüne/bastona sabitleyin ve istenen toprak derinliğine (45 cm) ulaşmak için sürekli olarak çekiçleyin. Tüm toprak kütlesini örnekleyiciye kaldırın ve yapışan kökleri ayırmak için akan su altında dikkatlice yıkayın.</li>
	<li>Kökleri iyice yıkadıktan sonra, manuel ölçümle ve ayrıca referans verilen yazılımı kullanarak ilgili sayısallaştırılmış görüntüleri taramak ve analiz etmek için kökleri şeffaf tepsilere yayarak hacmi, yüzey alanını, uzunluğu ve ağırlığı kaydedin (bkz. Malzeme Tablosu).</li>
</ol>
<img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig02.jpg"> 
Şekil 2: Kök çekirdek örnekleyici. (A) Boyutlar, (B) üstten görünüm ve (C) örnekleme alanı. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig02large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
3. Farklı fenofazlarda örneklemeyi kolaylaştırmak için kök fenotipleme yapısı
<ol>
	<li>Şeker kamışı köklerinden numune almak için 4,5 m x 10,1 m boyutlarında üç bitişik bölmeden oluşan bir kök fenotipleme yapısı oluşturun ve yeraltı kök sistemini (80-100 cm derinliğe kadar) ortaya çıkarmak için yan duvarların manuel olarak sökülmesi için hükümler oluşturun (Şekil 3). Yan duvarları 1,8 m uzunluğunda, 30 cm genişliğinde ve 4 cm kalınlığında prekast plakalarla inşa edin.</li>
	<li>Yapının tarla toprağı ile doldurun ve sıkıştırın, ~ 20 cm'lik bir üst boşluk bırakın ve toprağın havalanmasını kolaylaştırmak için yeterli drenaj delikleri bırakın.</li>
	<li>Saccharum officinarum L., Saccharum spontaneum L., Saccharum barberi Jesw., Saccharum sinense Roxb. ve Saccharum robustum Brandes ve Jeswiet ex Grassl'ı içeren germplazm klonlarının tomurcuk cipslerini ekin. (bundan böyle "Saccharum spp. klonları" olarak anılacaktır) ve köklendirme ortamı içeren protraylarda 30 gün boyunca çimlenmelerine izin verin (kırmızı toprak: çiftlik gübresi: kum = 2: 2: 2: 1). İyi mahsul oluşumu ve büyümesini sağlamak için önerilen POP'u izleyerek, 90 cm'lik bir sıra aralığında, 60 cm'lik bir sıra aralığında, düzgün ve sağlıklı yerleşimleri yapıya nakledin.</li>
	<li>Biçimlendirici (ekimden 60-120 gün sonra [DAP]) ve büyük büyüme (120-150 DAP) aşamaları sırasında, prekast plakalardan yapılmış yan duvarları manuel olarak çıkarın, ardından kökleri açığa çıkarmak için su jeti sürekli olarak püskürtülür.</li>
	<li>Tüm kök sistemini sökün ve uzunluk, hacim ve ağırlığın manuel ölçümü için laboratuvara götürün ve referans verilen yazılımda karşılık gelen sayısallaştırılmış görüntüleri taramak ve analiz etmek için kökleri şeffaf tepsilere yayın (bkz. Malzeme Tablosu).</li>
	<li>Bölmelerden birinde sulamayı durdurarak kuraklık stresi uygulayın ve su basması stresini simüle etmek için toprak doygunluğunu korumak için ikinci bölmedeki drenaj deliklerini kapatın. Tarla kapasitesini korumak ve kontrol görevi görmek için üçüncü bölmeyi önerilen POP'a göre sulayın.</li>
</ol>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig03.jpg"> 
Şekil 3: Kök fenotipleme yapısı. (A) Boyutlar, (B) üç bölmeye genel bakış ve (C) bir bölmenin görünümü. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig03large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
4. Rizosfer biyolojisini incelemek için bitkilerin hidroponik kültürü
<ol>
	<li>Kök biyolojisinin daha ince ayrıntılarını incelemek için şeker kamışı yetiştirmeye elverişli, çevre kontrollü bir serada şirket içi bir hidroponik sistem üretin. Akvaryum pompaları tarafından sağlanan havalandırma ile 15 cm x 20 cm x 20 cm boyutlarındaki cam tanklara ~ 50 L modifiye Hoagland'ın besin solüsyonu (Tablo 50) ekleyin (Şekil 4).</li>
	<li>Şeker kamışı çeşitlerinin ve Saccharum spp. klonlarının tomurcuk parçalarını ekin ve kompost hindistan cevizi özü içeren tepsilerde 30 gün boyunca çimlenmelerine izin verin. Düzgün ve sağlıklı çökeltmeleri, tank başına üç çökeltme sıklığında hidroponik tanklara nakledin ve tüm kökü besin çözeltisine yerleştirmeye özen gösterin. Köklerin ışığa maruz kalmamasını sağlamak için tankları siyah bir bezle örtün. Bitkileri dik olarak desteklemek için cam tankların ağzında plastik bir ağ (20 cm x 20 cm) kullanın.</li>
	<li>Çimlenme aşamasının sonunda (60 gün), bozulmamış bitkilerin köklerini 50 mL tuzak çözeltisine (steril çift damıtılmış su) 4 saat (0800 saat ila 1200 saat) batırarak kök eksüdalarını toplayın. Toplanan çözeltiyi Whatman filtre kağıdından süzün, ardından anyon değişimi ve ardından katyon değişim reçineleri12 ile doldurulmuş cam sütunlardan geçirin. Ayrıştırılan fraksiyonları kuruyana kadar buharlaştırın ve daha sonraki işlemlere kadar -20 °C'de saklayın.</li>
	<li>İşlenmiş kök eksüda örneklerini standart protokole göre organik asitlerin12 belirlenmesi için HPLC ile ve toplam fenoliklerin 13, proteinlerin14, şekerlerin15 ve amino asitlerin16 tahmini için spektrofotometri ile analiz edin.</li>
	<li>Kök ucu pigmentasyonunu ve kök kıl yoğunluğunu kaydetmek için kök büyümesini haftalık aralıklarla izleyin. Standart protokole göre 3. ayda enzimlerin, peroksidaz17 ve süperoksit dismutaz18'in aktivitesini ve toplam fenolik içeriği19'u değerlendirin.</li>
	<li>Steril bir cerrahi bıçak kullanarak birincil kökte kök ucuna kadar uzunlamasına bir dilim uygulayarak kök yaralanmasına yanıtı değerlendirin ve değişiklikleri periyodik olarak izleyin.</li>
</ol>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always">
	<tbody>
		<tr>
			<td>Kimyasal</td>
			<td>Son konsantrasyon</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Potasyum nitrat</td>
			<td>0,608 g· L-1 Serisi</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Kalsiyum nitrat</td>
			<td>1.415 g· L-1 Serisi</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Potasyum dihidrojen fosfat</td>
			<td>0,164 g· L-1 Serisi</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Magnezyum sülfat</td>
			<td>0,560 g· L-1 Serisi</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>EDTA-ferrik monosodyum tuzu</td>
			<td>6,00 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Borik asit</td>
			<td>1,43 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Manganez klorür tetrahidrat</td>
			<td>0,91 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Çinko sülfat</td>
			<td>0.11 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Bakır suphate</td>
			<td>0,04 g·250L-1</td>
		</tr>
		<tr>
			<td>Molibdik asit</td>
			<td>0,01 g250L-1</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>
Tablo 1: Şeker kamışı hidroponik kültürü için modifiye edilmiş besin çözeltisinin bileşimi.
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/63596/63596fig04.jpg"> 
Şekil 4: Hidroponik kurulum. Kurulum (A) şeker kamışı yetiştirmek ve (B) 5 aylık mahsul için özelleştirilmiş (yalnızca fotoğraf çekmek amacıyla siyah bez çıkarılmıştır). Bu şekil Hari ve ark.9'dan değiştirilmiştir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/63596/63596fig04large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>

<ol><li>Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO). Crops and livestock products. FAOSTAT. , Available from: 
 <a target="_blank" href="http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC">http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC</a> (2019).</li>
<li>Venkatraman, T. S., Thomas, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Studies+of+sugarcane+roots+at+different+stages+of+growth%5BTitle%5D)+AND+%22Agricultural+Journal+of+India%22%5BJournal%5D)">Studies of sugarcane roots at different stages of growth.</a> Agricultural Journal of India. 23, 166-176 (1928).</li>
<li>Smith, D. M., Inman-Bamber, N. G., Thorburn, P. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Growth+and+function+of+the+sugarcane+root+system%5BTitle%5D)+AND+%22Field+Crops+Research%22%5BJournal%5D)">Growth and function of the sugarcane root system.</a> Field Crops Research. 92 (2-3), 169-183 (2005).</li>
<li>Glover, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+behaviour+of+the+root-system+of+sugarcane+at+and+after+harvest%5BTitle%5D)+AND+%22Proceedings+of+the+South+African+Sugar+Technologists+Association%22%5BJournal%5D)">The behaviour of the root-system of sugarcane at and after harvest.</a> Proceedings of the South African Sugar Technologists Association. 42, 133-135 (1968).</li>
<li>Venkatraman, T. S., Thomas, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sugarcane+root+systems%3A+Studies+in+development+and+anatomy%5BTitle%5D)+AND+%22Agricultural+Journal+of+India%22%5BJournal%5D)">Sugarcane root systems: Studies in development and anatomy.</a> Agricultural Journal of India. 17 (4), 416-418 (1922).</li>
<li>Saliendra, N. Z., Meinzer, F. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genotypic%2C+developmental+and+drought-induced+differences+in+root+hydraulic+conductance+of+contrasting+sugarcane+cultivars%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Experimental+Botany%22%5BJournal%5D)">Genotypic, developmental and drought-induced differences in root hydraulic conductance of contrasting sugarcane cultivars.</a> Journal of Experimental Botany. 43 (9), 1209-1217 (1992).</li>
<li>Gilbert, R. A., Rainbolt, C. R., Morris, D. R., Bennet, A. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphological+responses+of+sugarcane+to+long-term+flooding%5BTitle%5D)+AND+%22Agronomy+Journal%22%5BJournal%5D)">Morphological responses of sugarcane to long-term flooding.</a> Agronomy Journal. 99 (6), 1622-1628 (2007).</li>
<li>Shiotsu, F., Abe, J., Doi, T., Gau, M., Morita, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Root+morphology+and+anatomy+of+field-grown+Erianthus+arundinaceus%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Plant+Sciences%22%5BJournal%5D)">Root morphology and anatomy of field-grown Erianthus arundinaceus.</a> American Journal of Plant Sciences. 6 (1), 103-112 (2015).</li>
<li>Hari, K., Vasantha, S., Anna Durai, A., Brindha, C., Shruthi, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sugarcane+root+growth+and+development+in+hydroponics+system%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Sugarcane+Research%22%5BJournal%5D)">Sugarcane root growth and development in hydroponics system.</a> Journal of Sugarcane Research. 7 (2), 71-82 (2017).</li>
<li>Matsuoka, S., Garcia, A. A. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sugarcane+underground+organs%3A+Going+deep+for+sustainable+production%5BTitle%5D)+AND+%22Tropical+Plant+Biology%22%5BJournal%5D)">Sugarcane underground organs: Going deep for sustainable production.</a> Tropical Plant Biology. 4, 22-30 (2011).</li>
<li>Koevoets, I. T., Venema, J. H., Elzenga, J. T. M., Testerink, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Roots+withstanding+their+environment%3A+Exploiting+root+system+architecture+responses+to+abiotic+stress+to+improve+crop+tolerance%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Roots withstanding their environment: Exploiting root system architecture responses to abiotic stress to improve crop tolerance.</a> Frontiers in Plant Science. 7, 1335(2016).</li>
<li>Vengavasi, K., Pandey, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Root+exudation+index%3A+Screening+organic+acid+exudation+and+phosphorus+acquisition+efficiency+in+soybean+genotypes%5BTitle%5D)+AND+%22Crop+and+Pasture+Science%22%5BJournal%5D)">Root exudation index: Screening organic acid exudation and phosphorus acquisition efficiency in soybean genotypes.</a> Crop and Pasture Science. 67 (10), 1096-1109 (2017).</li>
<li>Bray, H. G., Thorpe, W. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+phenolic+compounds+of+interest+in+metabolism%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+of+Biochemical+Analysis%22%5BJournal%5D)">Analysis of phenolic compounds of interest in metabolism.</a> Methods of Biochemical Analysis. 1, 27-52 (1954).</li>
<li>Lowry, O. H., Rosebrough, N. J., Farr, A. L., Randall, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Protein+measurement+with+the+folin+phenol+reagent%5BTitle%5D)+AND+%22The+Journal+of+Biological+Chemistry%22%5BJournal%5D)">Protein measurement with the folin phenol reagent.</a> The Journal of Biological Chemistry. 193 (1), 265-275 (1951).</li>
<li>Hedge, J. E., Hofreiter, B. T. Determination of total carbohydrate by anthrone method. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aHedge%2C+JE+%22Carbohydrate+Chemistry%3A+Volume+17%22">Carbohydrate Chemistry: Volume 17</a>. , Academic Press. New York. (1962).</li>
<li>Moore, S., Stein, W. H. Polyphenol oxidase. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMoore%2C+S+%22Methods+in+Enzymology.+Vol+468%22">Methods in Enzymology. Vol 468</a>. , Academic Press. New York. (1948).</li>
<li>Malik, C. P., Singh, M. B. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMalik%2C+CP+%22Plant+Enzymology+and+Histo-enzymology%3A+A+text+manual%22">Plant Enzymology and Histo-enzymology: A text manual</a>. , Kalyani Publications. New Delhi. (1980).</li>
<li>Beauchamp, C., Fridovich, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Superoxide+dismutase%3A+Improved+assays+and+an+assay+applicable+to+acrylamide+gels%5BTitle%5D)+AND+%22Analytical+Biochemistry%22%5BJournal%5D)">Superoxide dismutase: Improved assays and an assay applicable to acrylamide gels.</a> Analytical Biochemistry. 44, 276-287 (1971).</li>
<li>Singleton, V. L., Rossi, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Colorimetry+of+total+phenolics+with+phosphomolybdic-+phosphotungstic+acid+reagents%5BTitle%5D)+AND+%22American+Journal+of+Enology+and+Viticulture%22%5BJournal%5D)">Colorimetry of total phenolics with phosphomolybdic- phosphotungstic acid reagents.</a> American Journal of Enology and Viticulture. 16, 144-158 (1965).</li>
<li>Rege, R. D., Wagle, P. V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Problems+of+sugarcane+physiology+in+the+Deccan+canal+tract.+III.+The+root-system%5BTitle%5D)+AND+%22The+Indian+Journal+of+Agricultural+Science%22%5BJournal%5D)">Problems of sugarcane physiology in the Deccan canal tract. III. The root-system.</a> The Indian Journal of Agricultural Science. 2 (3), 356-373 (1940).</li>
<li>Ryker, T. C., Edgerton, C. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Studies+on+sugar+cane+roots%5BTitle%5D)+AND+%22LSU+Agricultural+Experiment+Station+Reports%22%5BJournal%5D)">Studies on sugar cane roots.</a> LSU Agricultural Experiment Station Reports. 223, (1931).</li>
<li>Jensen, J. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Some+studies+of+root+habits+of+sugar+cane+in+Cuba%5BTitle%5D)+AND+%22The+Tropical+Plant+Research+Foundation%22%5BJournal%5D)">Some studies of root habits of sugar cane in Cuba.</a> The Tropical Plant Research Foundation. , New York. (1931).</li>
<li>Kücke, M., Schmid, H., Spiess, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comparison+of+four+methods+for+measuring+roots+of+field+crops+in+three+contrasting+soils%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Soil%22%5BJournal%5D)">A comparison of four methods for measuring roots of field crops in three contrasting soils.</a> Plant and Soil. 172 (1), 63-71 (1995).</li>
<li>Noordwijk, M., et al. Trench Profile Techniques and Core Break Methods. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aNoordwijk%2C+M+%22Root+Methods%3A+A+handbook%22">Root Methods: A handbook</a>. , Springer. Berlin, Heidelberg. (2001).</li>
<li>De Azevedo, M. C. B., Chopart, J. L., Medina, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sugarcane+root+length+density+and+distribution+from+root+intersection+counting+on+a+trench-profile%5BTitle%5D)+AND+%22Scientia+Agricola%22%5BJournal%5D)">Sugarcane root length density and distribution from root intersection counting on a trench-profile.</a> Scientia Agricola. 68 (1), 94-101 (2011).</li>
<li>Nissen, T., Rodriguez, V., Wander, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sampling+soybean+roots%3A+A+comparison+of+excavation+and+coring+methods%5BTitle%5D)+AND+%22Communications+in+Soil+Science+and+Plant+Analysis%22%5BJournal%5D)">Sampling soybean roots: A comparison of excavation and coring methods.</a> Communications in Soil Science and Plant Analysis. 39 (11-12), 1875-1883 (2008).</li>
<li>Burridge, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+analysis+of+soil+coring+strategies+to+estimate+root+depth+in+maize+%28Zea+mays%29+and+common+bean+%28Phaseolus+vulgaris%29%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Phenomics%22%5BJournal%5D)">An analysis of soil coring strategies to estimate root depth in maize (Zea mays) and common bean (Phaseolus vulgaris).</a> Plant Phenomics. 2020, 3252703(2020).</li>
<li>Schroth, G., Kolbe, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+method+of+processing+soil+core+samples+for+root+studies+by+subsampling%5BTitle%5D)+AND+%22Biology+and+Fertility+of+Soils%22%5BJournal%5D)">A method of processing soil core samples for root studies by subsampling.</a> Biology and Fertility of Soils. 18, 60-62 (1994).</li>
<li>Chandran, K., Nisha, M., Arun Kumar, R., Krishnapriya, V. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Breeding+varieties+resistant+to+waterlogging%5BTitle%5D)+AND+%22ICAR-SBI+Annual+Report+2016-17%22%5BJournal%5D)">Breeding varieties resistant to waterlogging.</a> ICAR-SBI Annual Report 2016-17. , 128(2016).</li>
<li>Wu, Q., Wu, J., Zheng, B., Guo, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimizing+soil-coring+strategies+to+quantify+root-length-density+distribution+in+field-grown+maize%3A+Virtual+coring+trials+using+3-D+root+architecture+models%5BTitle%5D)+AND+%22Annals+of+Botany%22%5BJournal%5D)">Optimizing soil-coring strategies to quantify root-length-density distribution in field-grown maize: Virtual coring trials using 3-D root architecture models.</a> Annals of Botany. 121 (5), 809-819 (2018).</li>
<li>Joshi, D. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+a+phenotyping+platform+for+high+throughput+screening+of+nodal+root+angle+in+sorghum%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Methods%22%5BJournal%5D)">Development of a phenotyping platform for high throughput screening of nodal root angle in sorghum.</a> Plant Methods. 13, 56(2017).</li>
<li>Koyama, T., Murakami, S., Karasawa, T., Ejiri, M., Shiono, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Complete+root+specimen+of+plants+grown+in+soil-filled+root+box%3A+Sampling%2C+measuring%2C+and+staining+method%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Methods%22%5BJournal%5D)">Complete root specimen of plants grown in soil-filled root box: Sampling, measuring, and staining method.</a> Plant Methods. 17, 97(2021).</li>
<li>Gomathi, R., Gururaja Rao, P. N., Chandran, K., Selvi, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Adaptive+responses+of+sugarcane+to+waterlogging+stress%3A+An+overview%5BTitle%5D)+AND+%22Sugar+Tech%22%5BJournal%5D)">Adaptive responses of sugarcane to waterlogging stress: An overview.</a> Sugar Tech. 17, 325-338 (2014).</li>
<li>Misra, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Morphological+assessment+of+water+stressed+sugarcane%3A+a+comparison+of+waterlogged+and+drought+affected+crop%5BTitle%5D)+AND+%22Saudi+Journal+of+Biological+Sciences%22%5BJournal%5D)">Morphological assessment of water stressed sugarcane: a comparison of waterlogged and drought affected crop.</a> Saudi Journal of Biological Sciences. 27 (5), 1228-1236 (2020).</li>
<li>Robinson, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Sugarcane+genotypes+differ+in+internal+nitrogen+use+efficiency%5BTitle%5D)+AND+%22Functional+Plant+Biology%22%5BJournal%5D)">Sugarcane genotypes differ in internal nitrogen use efficiency.</a> Functional Plant Biology. 34 (12), 1122-1129 (2007).</li>
<li>Arruda, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biological+and+morphological+traits+of+sugarcane+roots+in+relation+to+phosphorus+uptake%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Soil+Science+and+Plant+Nutrition%22%5BJournal%5D)">Biological and morphological traits of sugarcane roots in relation to phosphorus uptake.</a> Journal of Soil Science and Plant Nutrition. 16 (4), 901-915 (2016).</li>
<li>Sharma, S., Borah, P., Meena, M. K., Bindraban, P., Pandey, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+genotypic+variation+for+growth+of+rice+seedlings+under+optimized+hydroponics+medium%5BTitle%5D)+AND+%22Indian+Journal+of+Genetics+and+Plant+Breeding%22%5BJournal%5D)">Evaluation of genotypic variation for growth of rice seedlings under optimized hydroponics medium.</a> Indian Journal of Genetics and Plant Breeding. 78 (3), 292-301 (2018).</li>
<li>Soumya, P. R., Singh, D., Sharma, S., Singh, A. M., Pandey, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+diverse+wheat+%28Triticum+aestivum%29+and+triticale+%28%C3%97+Triticosecale%29+genotypes+for+low+phosphorus+stress+tolerance+in+soil+and+hydroponic+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Journal+of+Soil+Science%22%5BJournal%5D)">Evaluation of diverse wheat (Triticum aestivum) and triticale (× Triticosecale) genotypes for low phosphorus stress tolerance in soil and hydroponic conditions.</a> Journal of Soil Science. 21, 1236-1251 (2021).</li>
<li>Ganie, A. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metabolite+profiling+and+network+analysis+reveal+coordinated+changes+in+low-N+tolerant+and+low-N+sensitive+maize+genotypes+under+nitrogen+deficiency+and+restoration+conditions%5BTitle%5D)+AND+%22Plants%22%5BJournal%5D)">Metabolite profiling and network analysis reveal coordinated changes in low-N tolerant and low-N sensitive maize genotypes under nitrogen deficiency and restoration conditions.</a> Plants. 9 (11), 1459(2020).</li>
<li>Venkatraman, T. S., Thomas, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simple+contrivances+for+studying+root+development+in+agricultural+crops%5BTitle%5D)+AND+%22Agricultural+Journal+of+India%22%5BJournal%5D)">Simple contrivances for studying root development in agricultural crops.</a> Agricultural Journal of India. 18, 509-514 (1923).</li>
<li>Clark, R. T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High-throughput+two-dimensional+root+system+phenotyping+platform+facilitates+genetic+analysis+of+root+growth+and+development%5BTitle%5D)+AND+%22Plant%2C+Cell+and+Environment%22%5BJournal%5D)">High-throughput two-dimensional root system phenotyping platform facilitates genetic analysis of root growth and development.</a> Plant, Cell and Environment. 36 (2), 454-466 (2013).</li>
<li>Chopart, J. L., Rodrigues, S. R., Azevedo, M. C. B., Medina, C. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Estimating+sugarcane+root+length+density+through+root+mapping+and+orientation+modelling%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Soil%22%5BJournal%5D)">Estimating sugarcane root length density through root mapping and orientation modelling.</a> Plant and Soil. 313, 101-112 (2008).</li>
<li>Chopart, J. L., Azevedo, M. C. B., Le Mezo, L., Marion, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Functional+relationship+between+sugarcane+root+biomass+and+length+for+cropping+system+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Sugar+Tech%22%5BJournal%5D)">Functional relationship between sugarcane root biomass and length for cropping system applications.</a> Sugar Tech. 12 (3-4), 317-321 (2010).</li>
<li>De Silva, A. L. C., De Costa, W. A. J. M., Bandara, D. M. U. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Growth+of+root+system+and+the+patterns+of+soil+moisture+utilization+in+sugarcane+under+rain-fed+and+irrigated+conditions+in+Sri+Lanka%5BTitle%5D)+AND+%22Sugar+Tech%22%5BJournal%5D)">Growth of root system and the patterns of soil moisture utilization in sugarcane under rain-fed and irrigated conditions in Sri Lanka.</a> Sugar Tech. 13 (3), 198-205 (2011).</li>
<li>Otto, R., Silva, A. P., Franco, H. C. J., Oliveira, E. C. A., Trivelin, P. C. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+soil+penetration+resistance+reduces+sugarcane+root+system+development%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+and+Tillage+Research%22%5BJournal%5D)">High soil penetration resistance reduces sugarcane root system development.</a> Soil and Tillage Research. 117, 201-210 (2011).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Boru hattı aksesuarlarına sahip havalandırma pompası</td><td>Yerel kaynaklardan satın alındı</td><td>NA</td><td>Hidroponik şeker kamışı kültürü için kullanılır</td></tr><tr><td>Borik asit</td><td>Sisco Araştırma Laboratuvarları, Hindistan</td><td>80266</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr><tr><td>Kalsiyum nitrat</td><td>Merkez Uyuşturucu Evi, Hindistan</td><td>27606</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr><tr><td>Kompostlanmış hindistan cevizi özü</td><td>Yerel kaynaklardan satın alındı</td><td>NA</td><td>Şeker kamışı setlerini çimlendirmek için kullanılır</td></tr><tr><td>bakır sülfat</td><td>Sisco Araştırma Laboratuvarları, Hindistan</td><td>38869</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr><tr><td>DEAE-selüloz</td><td>Sisco Araştırma Laboratuvarları, Hindistan</td><td>10529</td><td>Kök Eksüdalarının İşlenmesi için Anyon Değişim Reçinesi</td></tr><tr><td>EDTA-ferrik monosodyum tuzu</td><td>Sisco Araştırma Laboratuvarları, Hindistan</td><td>59389</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr><tr><td>Çiftlik bahçesi gübresi</td><td>Yerel kaynaklardan satın alındı</td><td>NA</td><td>Şeker kamışı setlerini çimlendirmek için kullanılır</td></tr><tr><td>Cam tanklar</td><td>Şirket içinde üretilmiştir</td><td>NA</td><td>Hidroponik şeker kamışı kültürü için kullanılır</td></tr><tr><td>HPLC Hakkında</td><td>Agilent Teknolojileri</td><td>1200 Sonsuzluk</td><td>Kök eksüdalarındaki organik asitlerin miktarının belirlenmesi</td></tr><tr><td>Magnezyum sülfat</td><td>Sisco Araştırma Laboratuvarları, Hindistan</td><td>29117</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr><tr><td>Manganez klorür</td><td>Sisco Araştırma Laboratuvarları, Hindistan</td><td>75113</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr><tr><td>Molibdik asit</td><td>Sisco Araştırma Laboratuvarları, Hindistan</td><td>49664</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr><tr><td>Potasyum dihidrojen fosfat</td><td>Merkez Uyuşturucu Evi, Hindistan</td><td>29608</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr><tr><td>Potasyum nitrat</td><td>Merkez Uyuşturucu Evi, Hindistan</td><td>29638</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr><tr><td>Tepsiler</td><td>Şirket içinde üretilmiştir</td><td>NA</td><td>Şeker kamışı setlerini çimlendirmek için kullanılır</td></tr><tr><td>Kırmızı toprak</td><td>Yerel kaynaklardan satın alındı</td><td>NA</td><td>Şeker kamışı setlerini çimlendirmek için kullanılır</td></tr><tr><td>Kök çekirdek örnekleyici</td><td>Şirket içinde üretilmiştir</td><td>NA</td><td>Yerinde kök örneklemesi için kullanılır</td></tr><tr><td>Kum</td><td>Yerel kaynaklardan satın alındı</td><td>NA</td><td>Şeker kamışı setlerini çimlendirmek için kullanılır</td></tr><tr><td>Seralit-120</td><td>Sisco Araştırma Laboratuvarları, Hindistan</td><td>14891</td><td>Kök eksüdalarının işlenmesi için katyon değişim reçinesi</td></tr><tr><td>Destek çerçevesi</td><td>Yerel kaynaklardan satın alındı</td><td>NA</td><td>Hidroponik şeker kamışı kültürü için kullanılır</td></tr><tr><td>Su motoru pompası</td><td>Yerel kaynaklardan satın alındı</td><td>NA</td><td>Hidroponik şeker kamışı kültürü için kullanılır</td></tr><tr><td>Whatman filtre kağıdı sınıf 1</td><td>Evrensel Bilimsel</td><td>1001090</td><td>Kök sızıntılarının işlenmesi</td></tr><tr><td>WinRhizo PRO (yazılım)</td><td>Regent Instruments Inc., Kanada</td><td>STD4800</td><td>Köklerin analizi için yazılıma sahip iki boyutlu kök tarayıcı</td></tr><tr><td>Çinko sülfat</td><td>Sisco Araştırma Laboratuvarları, Hindistan</td><td>76455</td><td>Modifiye Hoagland çözeltisinin hazırlanması</td></tr></tbody></table>

Şeker kamışı kök sistemlerini karakterize etmek için Çok yönlü fenotipleme yaklaşımları

Multipronged Phenotyping Approaches to Characterize Sugarcane Root Systems

Şeker kamışı çeşitlerinin kök morfolojik özelliklerinde varyasyon Hendek örneklemesi ile tarladan kazılan ve hidroponik bir kurulumda yetiştirilen Co 62175'teki kök sisteminin temsili görüntüleri Şekil 5A,B'de sunulmuştur. Co 62175 ve Co 99006 çeşitlerinde uzun kökler (~ 100 cm) gözlenirken, Co 99006 en yüksek kök ağırlığını (127 g · topak-1) kaydetmiştir. Kök özellikleri, Co 62175'in kümülatif kök uzunluğu, kök yüzey alanı ve kök hacmi açısınd...

Şeker Kamışı Kök Sistemlerini Karakterize Etmek için Çok Yönlü Fenotipleme Yaklaşımları

Roots are the primary conductors of water and nutrients and play a vital role in sustaining growth and yield under stressful environments. The study of ...

multipronged-phenotyping-approaches-to-characterize-sugarcane-root

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Bu protokol, ticari olarak temin edilebilen düz yataklı tarayıcı kullanılarak bir yerçekimi uyarana yanıt Arabidopsis fide görüntülerin hızla toplanması için bir işlemi tarif etmektedir. Yöntem aşağı analiz algoritmaları için mükellef yüksek çözünürlüklü görüntüleri, ucuz, yüksek hacimli yakalamak için izin verir.

Arabidopsis Kök Gravitropic Müdahale Yüksek çözünürlüklü Zaman lapsed Resim Toplama Masaüstü Tarayıcılar kullanma

Bu makalede, ana kök ve kök tüyleri tek bir optik uçağı için confines bir iki katlı mikrosıvısal platformda Arabidopsis thaliana fidan kültür gösterilmiştir. Bu platform iyi kök morfolojisi de yüksek çözünürlüklü görüntüleme gelince gerçek zamanlı optik görüntüleme için başka araçlar tarafından kullanılabilir.

Kök saç Morfoloji Arabidopsis fidan bir iki katlı mikrosıvısal platformda görüntüleme

Bir deneysel protokol toprak bitki kök sistemleri RGB ve hyperspectral görüntüleme ile yetiştirilen değerlendirilmesi için sunulmaktadır. RGB görüntü zaman serisi hyperspectral chemometric bilgilerle tarar kombinasyonu bitki kök dynamics anlayışlar en iyi duruma getirir.

RGB ve bitki fenotipleme ve fizyolojik araştırma için spektral kök görüntüleme: deneysel kurulum ve iletişim kuralları görüntüleme

Yazılım tabanlı görüntü analiz sistemi stoloniferous ve rhizomatous türlerinin morfolojisi eğitim için alternatif bir yöntem sağlar. Bu iletişim kuralı ölçüm uzunluğu ve stolons ve köksaplar izni ve örnekleri ile biyokütle büyük miktarda ve çok çeşitli türler için uygulanabilir.

Stolons ve Turfgrasses köksaplar bir dijital görüntü analiz sistemi kullanılarak ölçme

Biz x-ışını soğurma kontrast Mısır doku sıradan microcomputed tomografi taramak için uygun geliştirmek için yeni bir yöntem sağlar. CT görüntüleri baz alınarak, biz görüntü işleme iş akışları için etkili bir şekilde Mısır Vaskular demetleri mikroskobik fenotipleri ayıklamak farklı Mısır malzeme bir dizi tanıtmak.

X-ışını Microcomputed tomografi üzerinde dayalı Mısır Vaskular demetleri mikron çaplı fenotipleme teknikleri

Görselleştirme ve kök büyüme in situ ölçme son derece zordur. Biz kök gelişimi ve nükleer silahların yayılmasına karşı zaman içinde yanıt-e doğru besin zenginleştirme izlemek için özelleştirilebilir rhizobox Yöntem mevcut. Bu yöntem kök plastisite yanıt bir organik azot kaynağı olarak Mısır genotypic farklılıklar analiz etmek için kullanılır.

Kök büyüme ve yerelleştirilmiş besin kavramaları görselleştirmek için en iyi duruma getirilmiş bir Rhizobox Protokolü

Parasponia andersonii, Kenevir ailesine (Cannabaceae) ait olan ve rizobium ile birlikte azot sabitleme kökü nodülleri oluşturabilen hızlı büyüyen tropikal bir ağaçtır. Burada, Agrobacterium tumefaciens-aracılı kararlı dönüşüm ve CRISPR/Cas9 tabanlı genom düzenlemesine dayalı P. andersonii'de ters genetik analizler için ayrıntılı bir protokol açıklıyoruz.

Dönüşüm, Genom Düzenleme ve Fenotipleme Azot sabitleme Tropikal Cannabaceae Ağaç Parasponia andersonii

Buradaki protokol, arbusküler mikorizal kolonizasyon paternlerinin değerlendirilmesi için yöntemleri ve iki türün köklerindeki stratejiyi açıklamaktadır: Zea mays ve Festuca rubra. MycoPatt yönteminin kullanılması, parametrelerin hesaplanmasına, mikorizal yapıların dijital verilere dönüştürülmesine ve köklerdeki gerçek konumlarının haritalandırılmasına izin verir.

Festuca rubra ve Zea mays'ın Köklerinde Kolonizasyon Kalıplarını ve Mantar Stratejilerini Keşfetmek İçin Bir Araç Olarak Mikorizal Haritalar

Arabidopsis ve Medicago'nun kök sistem mimarisini (RSA) incelemek için basit laboratuvar araçları kullanıyoruz. Fideler ağ üzerinde hidroponik olarak yetiştirilir ve RSA'yı ortaya çıkarmak için bir sanat fırçası kullanılarak yayılır. Görüntüler tarama veya yüksek çözünürlüklü bir kamera kullanılarak alınır, daha sonra özellikleri haritalamak için ImageJ ile analiz edilir.

Bitki kök sistemi mimari özelliklerini haritalamak için basit bir protokol

Tek ve birleşik ısı, kuraklık ve su basması tedavilerine morfolojik ve fizyolojik yanıtları belirlemek için görüntü tabanlı bir fenotipleme protokolü tasarladık. Bu yaklaşım, erken, geç ve geri kazanım tepkilerinin tüm tesis düzeyinde, özellikle yer üstü kısımlarda tanımlanmasını sağladı ve birden fazla görüntüleme sensörünün kullanılması gerekliliğini vurguladı.

Patateste Tek ve Kombine Streslere Morfolojik ve Fizyolojik Tepkileri Belirlemek için Yüksek Verimli Görüntü Tabanlı Fenotipleme

Keşfedin şeker kamışı kök sistemlerini karakterize etmek için çok yönlü fenotipleme yaklaşımlarını. Bu yöntem, Saccharum türlerindeki morfolojik varyasyonları ve stres yanıtlarını inceleyerek ıslah stratejilerini geliştirir.

Şeker Kamışı Kök Sistemlerini Karakterize Etmek için Çok Yönlü Fenotipleme Yaklaşımları

Daha fazla video keşfet