İşitsel Beyin Sapı Tepki Dalga Formlarının R Kullanarak Tepe Genliğinin ve Gecikmesinin Yarı Otomatik Analizi

İşitsel beyin sapı yanıtları, işitme eşiklerini belirlemek için rutin olarak toplanır. ABR dalga formu, beyin sapı aktivitesi hakkında ek bilgiler içerir, ancak daha önce birçok araştırmacı bunları manuel olarak analiz etmek zorunda kalmıştır. R komut dosyaları, ABR dalga formu analizini yarı otomatik hale getirmek için RStudio çerçevesinde R yazılımıyla birlikte çalışır.

Ücretsiz ve kullanımı kolaydır. Umudumuz, ABR dalga formunun rutin analizinin, daha sonraki çalışmaların bu bilişsel öncesi işitsel işlemin tanıdaki alaka düzeyini değerlendirmesini sağlayacağıdır. Başlamak için, işitsel beyin sapı yanıtını veya ABR kaydını ASCII dosyası olarak dışa aktarın.

IHS için, bilgisayar programını açın, ilgilendiğiniz dosyayı yükleyin ve istenen dalga formlarını bir sayfada görüntüleyin. Veri sekmesi altında, bir txt dosyası edinmek için Sayfayı ASCII olarak kaydet'i seçin. Veri dosyasını bir kimlikle uygun şekilde adlandırdıktan sonra, kimlik ve konu bilgilerini info adlı bir meta veri dosyasına kaydedin.

csv, genotip, cinsiyet, yaş veya tedavi gibi herhangi bir bilginin ID.Ayrı kimlik dosyaları olarak analiz edilecek tüm dosyalarla adımları tekrarlayın ve meta verileri elde edin. R ve RStudio programlarını ilgili web sitelerinden indirin ve yükleyin. Ardından, RStudio'nun komut penceresinde gerekli komutlarla gerekli kütüphaneleri, tidyverse, Shiny, Plotly ve Zoo dosyalarını yükleyin.

Ardından, findpeaks komut dosyalarını indirin. r ve see_trace_click. r Beyaz Laboratuvar GitHub'ından ve ilişkili dosya süresinden.csv.

Tüm ASCII dosyalarını, bilgilerini yerleştirmek için Test Klasörü adlı yeni bir klasör oluşturun. csv ve zaman.csv. Test Klasörü içinde, ASCII Klasörü adlı bir alt klasör oluşturun ve ASCII dosyalarını yerleştirin.

Findpeaks'i açın. RStudio'daki r komut dosyası, araç çubuğundaki komut dosyasının sekmesine sağ tıklayarak ayarlanmış çalışma dizinini seçin ve Test Klasörüne ayarlayın. Komut dosyası penceresinde, programı yüklemek için araç çubuğunun sağ üst tarafındaki Kaynak'ı tıklatın.

Ardından komut penceresinde, dalga formlarını bireysel ve toplu işleme modlarında analiz etmek için komutları kullanın. Komutu kullanarak belirli bir kişi için dalga formu verilerini yükleyin. Ardından, see_trace_click açılan penceresinde.

RStudio'da r komut dosyası, başlıktaki Uygulamayı Çalıştır düğmesine tıklayın ve yeni bir etkileşimli pencerenin görünmesini bekleyin. Sol üstteki kutuya, revizyon gerektiren dalga formunun ses seviyesini girin ve pencerede görüntülenen dalga formunu arayın. Herhangi bir noktadaki gecikmeyi ve genliği ortaya çıkarmak için imleci dalga formunun etrafında hareket ettirin.

Gecikme ve genlik verilerini kaydetmek için doğru tepe noktasına tıklayın ve ardından verileri csv dosyasına kopyalayıp yapıştırın. Hemen bir tepe noktasının ardından oluk verilerini kaydetmek için işlemi tekrarlayın ve oluk genliğini elektronik tablo hücresindeki tepe genliğinden çıkararak genlik ölçümünü hesaplayın. Doğrulananları aktarın.

csv dosyaları, verileri eklemek için Test Klasöründeki Peak Data adlı yeni bir alt klasöre yerleştirin. Ardından, komutu yürüterek meta verileri birleştirin. Derlenen veriler üzerinde istatistiksel analiz yapmak için, işlevi yürüterek verilerin dağılımını değerlendirmek için Shapiro-Wilk testi gibi bir normallik testi kullanın.

Shapiro-Wilk testi anlamlı değilse, veri kümesinin normal bir dağılıma sahip olduğu anlamına gelir. Bu nedenle, işlevi yürüterek verileri ANOVA gibi parametrik bir testle değerlendirin. Shapiro-Wilk testi P'nin 0.05'e eşit olduğundan küçükse, Kruskal-Wallis sıralama toplamı testini veya başka bir uygun parametrik olmayan ölçüyü kullanın.

Son olarak, komutu yürüterek ortalama dalga formlarını görüntüleyin. Genç bir F1 faresi için 75 desibel tıklama uyarıcısının dalga formu tepkisinde, zirveler ve oluklar otomatik olarak findpeaks.r ile tanımlandı. 5 ila 75 desibel arasındaki dalga formları, manuel olarak tanımlanan piklerden ve findpeak'lerden elde edilir.

r karşılaştırıldı. Ortalamalar, bir standart sapmayı temsil eden gölgeli bölge ve findpeaks tarafından elde edilen sonuçlarla ağır çizgiler olarak çizilir. r, manuel sonuçlarla güçlü bir şekilde ilişkilidir.

Bu yordamı denerken, çalışma dizinini çok önemli olduğu için ayarlamayı unutmayın. R betiği, zamanla uygulanan fare ABR'sinin gecikme pencerelerine bağlı olarak tepe noktalarını ve oluklarını belirler. csv dosyası.

Bu, diğer EEG dalga formlarını ölçmek için kullanıcılar tarafından değiştirilebilir.