Nesiller Arası Epigenetik Kalıtımın Analizi C. elegans Floresan Raportör ve Kromatin İmmünopresipitasyon (ChIP) Kullanılarak

Laboratuvarımızdaki araştırmalar, kromatinle ilişkili proteinlerin, histon modifikasyonlarının ve küçük RNA yolu faktörlerinin gelişim ve nesiller arası epigenetik kalıtım bağlamında birlikte nasıl çalıştığını incelemektedir. Bir GFP raportörü kullanan RNA kalıtım testi çok güçlü bir araç haline geldi. Bu protokol, solucanların hazırlanmasının, puanlanmasının ve geçirilmesinin ve tekrarlanabilir sonuçların üretilmesine yardımcı olabilecek ChIP örneklerinin hazırlanmasının nasıl standartlaştırılacağını açıklar.

Germ hattı ile eksprese edilen transgenleri incelerken karşılaşılan deneysel zorluklardan biri, hayvanın germ hattındaki etkileri izole etmektir. Şu anda ChIP için bütün hayvanları kullanıyoruz, ancak gelecekte, özellikle germ hattında kromatini incelemek için tahliller geliştirmek istiyoruz. Laboratuvarımız histon metilasyonu ve bu işaretleri tanıyan proteinler ile ilgilenmektedir.

İleriye dönük olarak, transgenlerde RNAi kalıtımı ve endojen dizilerin düzenlenmesi bağlamında bu kromatin okuyucuları ve küçük RNA yolları arasındaki etkileşimi araştırmak istiyoruz.