June 30th, 2023
Burada, yarı otomatik, yüksek verimli bir tarama formatında lusiferaz bazlı bir raportör testinin kullanımı için ayrıntılı bir protokol açıklıyoruz.
Laboratuvarımdaki araştırmanın temel amacı, otofajinin ve özellikle ATG4 sistein proteanının düzenlenmesini anlamak ve bu bilgiyi, özellikle pankreas kanseri gibi hastalıklar için bu yolu hedefleyen küçük molekül inhibitörleri geliştirmek için kullanmaktır. İlaç hedeflerini ve ilaç adaylarını belirlemek için yüksek içerikli, yüksek verimli tarama teknolojileri kullanıyoruz ve ATG4 sistein proteaz ailesine odaklanıyoruz çünkü bunun çeşitli kanser türleri için çok iyi bir ilaç hedefi olduğunu düşünüyoruz. Bir süredir ATG4 ailesi üyelerini inceliyoruz.
Bu protein ailesinin ve hücrelerinin işlev bozukluğuna dair önemli keşifler yaptık. Ayrıca ATG4 ailesi üyelerinin yeni translasyon sonrası regülasyon mekanizmalarını belirledik ve şu anda kanser ve nöro dejenerasyon gibi hastalıklar için ATG4 ailelerinin küçük molekül inhibitörleri ve aktivatörleri geliştiriyoruz. Hücrelerde ATG4 proteaz aktivitesini izlemek için çok fazla test yoktur.
Bu nedenle, bu aktiviteyi izlemek için lusiferaz bazlı bir test geliştiren ilk kişilerden biriydik. Ve tahlilimiz oldukça sıra dışı çünkü salgılı, diyelim ki ifade kullanıyor, bu nedenle hücreleri lisanslamamıza gerek yok ve bu protokolü yüksek verimli tarama yöntemlerine ve laboratuvar otomasyonuna kolayca uyarlayabiliriz. Bir süredir ATG4 B protein proteazına odaklandık.
ATG4 ailesi üyelerinin nakavt hücre hatlarını oluşturduk. ATG4'ün yeni translasyon sonrası düzenleme mekanizmalarını tanımladık ve nihayetinde ATG4 B proteazını inhibe edebilecek ve hatta aktive edebilecek birkaç yeni küçük molekül bileşiği de belirledik. Gelecekte, ATG4 ailesi üyeleri üzerindeki çalışmalarımıza devam etmek istiyoruz.
Bunun şu anda bilinmeyen ve hala ortaya çıkarılmayı bekleyen çok şey olduğunu düşünüyoruz. Örneğin, bu proteinlerin nöronlardaki otofajiyi nasıl düzenlediği şu anda tam olarak anlaşılamamıştır. Ayrıca, tanımladığımız bu küçük moleküllü bileşiklerin doğrulanmasına ve potansiyel olarak nörodejeneratif hastalıklarda aktivatörleri kullanmaya odaklanmak istiyoruz.
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
Bu çalışma, otofajinin düzenlenmesine, özellikle de kanser ve nörodejeneratif hastalıklardaki ATG4 sistein proteaz ailesinin rolüne odaklanmaktadır. Araştırmacılar, ATG4 aktivitesini izlemek için bir lüsiferaz tabanlı analiz geliştirmiş ve bunu küçük molekül inhibitörlerinin tanımlanmasına yardımcı olacak şekilde yüksek verimli ekranlama için uyarlamaktadır.
High-throughput, cell-based screening for ATG4B inhibitors addresses a critical need in oncology drug discovery by enabling functional target validation of autophagy modulation. The luciferase-based assay provides a scalable, quantitative platform for identifying and triaging small molecule modulators of ATG4B, directly impacting early-stage portfolio decisions. This approach supports predictive confidence in target engagement and mechanistic de-risking for cancer and neurodegeneration pipelines.
This luciferase-based assay integrates into the discovery continuum from target validation through lead identification and preclinical evaluation of autophagy modulators.