LipidUNet-Machine Learning Tabanlı iPSC Kaynaklı Retinal Pigment Epiteli Kullanılarak Lipid Birikintilerinin Karakterizasyonu ve Nicelleştirilmesi Yöntemi
July 28th, 2023
Gözün retina pigment epitel tabakasını etkileyen dejeneratif göz hastalıkları monogenik ve poligenik kökenlidir. Çeşitli hastalık modelleri ve bir yazılım uygulaması olan LipidUNet, hastalık mekanizmalarını ve potansiyel terapötik müdahaleleri incelemek için geliştirilmiştir.
Bu çalışmada yaşa bağlı makro dejenerasyon patogenezini anlamayı ve potansiyel tedaviyi bulmayı amaçladık. Lipid damlacık analizi için bu yarı otomatik boru hattı, metabolizmayı ve yaşlanma hastalıklarını incelemek için sağlam bir sistem sağlar. Laboratuvarımız, lipid birikintilerinin birikimini azaltmayı amaçlayan genetik veya küçük moleküllü ekranlar kullanarak AMD tedavisi için ilaç hedefleri bulmaya odaklanmaktadır.
Genel Bakış
Bu çalışma, yaşa bağlı maküler dejenerasyonun (AMD) patogenezini araştırmakta ve potansiyel tedavi stratejilerini aramaktadır. Yarı otomatik bir işlem hattı kullanarak araştırma, AMD ile ilgili metabolik süreçleri daha iyi anlamak için lipid damlacık analizini kolaylaştırmaktadır.
Çalışmanın Temel Bileşenleri
Araştırma Alanı
- Yaşa bağlı maküler dejenerasyon (AMD)
- Retina hücrelerinde lipid metabolizması
- Göz hastalıkları için terapötik müdahaleler
Arka Plan
- AMD, retina pigment epiteli katmanını etkiler ve hem monogenik hem de poligenik kökenlere sahiptir.
- Lipid birikintilerinin birikmesi, hastalıkta önemli bir faktördür.
- LipidUNet gibi mevcut modeller ve teknolojiler, hastalık mekanizmalarını incelemeyi amaçlamaktadır.
Kullanılan Yöntemler
- Nile Red ve BODIPY boyamasını içeren floresan görüntüleme teknikleri
- LipidUNet yazılımı kullanılarak otomatik lipid damlacık analizi
- Lipid birikintilerini değerlendirmek için APOE için immünoboyama
Ana Sonuçlar
- Retinal pigment epiteli (RPE) hücrelerinin başarılı bir şekilde farklılaştırılması, öngörülebilir morfolojik değişiklikler göstermiştir.
- Görüntü işleme yoluyla lipid birikintilerinin kantitatif analizi, boyama protokollerinin etkinliğini ortaya koymuştur.
- Boyamadaki varyasyonlar, lipid birikintilerinin görselleştirilmesini iyileştirmek için optimizasyon ihtiyacını göstermektedir.
Sonuçlar
- Bu araştırma, AMD'nin arkasındaki mekanizmalar hakkında içgörüler sunmakta ve potansiyel tedavi yaklaşımlarını değerlendirmektedir.
- Kurulan metodolojiler, retina hastalıklarındaki metabolik bozuklukları anlamayı amaçlayan gelecekteki çalışmaları geliştirebilir.
