Bu içeriği görüntülemek için JoVE aboneliğiniz gereklidir. Giriş yapın veya ücretsiz denemenizi bugün başlatın.

Yöntem makalesi

3 Boyutlu Beyin Organoidlerinde Çoklu Mitokondriyal Parametrelerin Ölçümü için Flow Sitometrik Analizin Uygulanması

1.6K görüntülenme

⸱

DOI:

10.3791/65621

⸱

4 Ağustos 2023

 ,  ,  ,  ,  , 

Bu makalede

Özet

Bu protokol, mitokondriyal hacimdeki değişiklikler, mitokondriyal solunum zinciri (MRC) kompleks alt birimlerinin miktarları ve mitokondriyal DNA (mtDNA) replikasyonu dahil olmak üzere çoklu mitokondriyal fonksiyonel parametrelerin eşzamanlı değerlendirmesi için bir akış sitometresi ve çoklu antikorların kullanılması için benzersiz bir yöntem bildirir.

Özet

Mitokondriyal disfonksiyon, birçok nörodejenerasyon tipine ortak bir birincil veya ikincil katkıda bulunur ve mitokondriyal kütle, mitokondriyal solunum zinciri (MRC) kompleksleri ve mitokondriyal DNA (mtDNA) kopya sayısındaki değişiklikler sıklıkla bu süreçlerde yer alır. İnsan kaynaklı pluripotent kök hücrelerden (iPSC'ler) türetilen insan beyni organoidleri, beynin üç boyutlu (3D) sitomimari düzenlemesini özetler ve karmaşık bir insan sisteminde hastalık mekanizmalarını inceleme ve yeni terapötikleri tarama imkanı sunar. Burada, iPSC'den türetilmiş kortikal organoidlerde çoklu mitokondriyal parametreleri ölçmek için benzersiz bir akış sitometrisi tabanlı yaklaşım bildiriyoruz. Bu rapor, iPSC'lerden kortikal beyin organoidleri üretmek, üretilen organoidlerin tek hücreli ayrışması, fiksasyon, boyama ve çoklu mitokondriyal parametreleri değerlendirmek için müteakip akış sitometrik analizi için bir protokolü detaylandırır. MRC kompleksi alt birimi NADH'ye karşı antikorlarla çift boyama: Ubikinon Oksidoredüktaz Alt Birimi B10 (NDUFB10) veya mitokondriyal transkripsiyon faktörü A (TFAM), voltaja bağlı anyon seçici kanal 1 (VDAC 1) ile birlikte mitokondri başına bu proteinlerin miktarının değerlendirilmesine izin verir. TFAM miktarı mtDNA miktarına karşılık geldiğinden, mitokondriyal içerik başına mtDNA kopyalarının sayısının dolaylı bir tahminini sağlar. Tüm bu prosedür 2-3 saat içinde tamamlanabilir. En önemlisi, mitokondriyal kütleye göre hem toplam hem de spesifik seviyeler dahil olmak üzere çoklu mitokondriyal parametrelerin eşzamanlı olarak ölçülmesine izin verir.

Giriş

Mitokondri, temel hücresel organellerdir ve adenozin trifosfat (ATP) üretiminin ana bölgesidir. Mitokondri, hücreler için enerji sağlamanın yanı sıra, hücre bilgi iletimi, hücre farklılaşması ve apoptoz dahil olmak üzere çoklu hücresel süreçlere katılır ve hücre büyümesini ve hücre döngüsünü düzenleme yeteneğine sahiptir. Parkinson hastalığı (PD)1,2, Alzheimer hastalığı (AD)3 ve amyotrofik lateral skleroz (ALS)4 dahil olmak üzere çeşitli nörodejeneratif hastalıklarda mitokondriyal fonksiyondaki değişiklikler tanımlanmıştır. Mitok....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Protokol

1. iPSC'lerin kortikal organoidlere farklılaşması

  1. Matris kaplı plakaların hazırlanması
    1. Piyasada bulunan bazal membran matrisinin şişesini gece boyunca buz üzerinde çözdürün. Soğukta 1:100'e seyreltin Advanced Dulbecco'nun Modifiye Eagle's Medium/Ham's F12 DMEM/F12 (%1 nihai konsantrasyon). Alikotlar yapın ve -20 °C'de saklayın (Malzeme Tablosuna bakınız).
    2. Membran matris çözeltisini 4 ° C'de çözün (soğuk tutun) ve gerekli sayıda kuyucuk kaplayın (6 oyuklu bir plakada bir kuyucuk için 1 mL). 37 °C'de 1 saat inkübe edin.
    3. Plakayı inkübatörden alın ve oda sıcaklı....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Sonuçlar

Şekil 1, farklılaşma sürecinin ve akış sitometrik analizi için kullanılan stratejilerin diyagramatik bir temsilini sağlar. İnsan iPSC'leri, EB'ler oluşturmak için yapışık olmayan 96 oyuklu plakalarda kültürlendi ve daha sonra tamamen büyümüş kortikal organoidler elde etmek için yapışık olmayan 6 oyuklu plakalara aktarıldı. Organoidlerin hücresel bileşimi, nöronal16 ve glial belirteçler17 ile immün boyamadan sonra konfokal mikroskopi kullanılara.......

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Tartışma

İnsan iPSC'lerinden kortikal beyin organoidleri üretmek ve bu organoidlerden izole edilen tek hücrelerde mitokondriyal parametrelerin akış sitometrik analizini gerçekleştirmek için bir protokol sunulmuştur. Organoidlerin hücresel bileşimi, nöronal ve glial hücre belirteçleri için immünohistokimyasal boyama ile konfokal mikroskopi ile doğrulandı. Anti-NDUFB10, VDAC 1 ve TFAM ile birlikte boyama akış sitometrisi tabanlı stratejinin, bir hücredeki mitokondri sayısına göre belirli kompleks I.......

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Açıklamalar

Yazarların ifşa edecek hiçbir şeyi yok.

Teşekkürler

Norveç Oslo Üniversitesi Temel Tıp Bilimleri Enstitüsü'nden Gareth John Sullivan'a bize AG05836 (RRID:CVCL_2B58) hücre hattını cömertçe sağladığı için en içten şükranlarımızı sunarız. Norveç'teki Bergen Üniversitesi'ndeki Moleküler Görüntüleme Merkezi, Akış Sitometrisi Çekirdek Tesisi'ne teşekkür ederiz. Bu çalışma aşağıdaki fonlarla desteklenmiştir: K.L, kısmen Bergen Üniversitesi Meltzers Høyskolefonds (proje numarası: 103517133) ve Gerda Meyer Nyquist Guldbrandson og Gerdt Meyer Nyquists legat (proje numarası: 103816102) tarafından desteklenmiştir. L.A.B, Norveç Araştırma Konseyi (proje numarası: 229652), Rakel og Otto Kr.Bruuns le....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Malzemeler

Bu makalede kullanılan malzemelerin listesi
AdŞirketKatalog numarasıYorumlar
Akış sitometrisinde
antikorlar anti-DUFB10 Alexa Fluor 405NOVUS biyolojiklerNBP2-72915AF405
anti-VDAC1 Alexa Fluor 647Santa cruz teknolojisisc-390996
anti-TFAM Alexa Fluor 488Abcamab198308
L / D sabitlenebilir yakın IR ölü hücre leke kitiYaşam teknolojileriL10119
İmmünofloran boyamada kullanılan antikorlar
anti-Tuj1Abcamab78078
anti-SOX2 Abcamab97959
anti-Alexa Unu 488Thermo Fisher ScientificA28175
anti-Alexa Unu 594Thermo Fisher ScientificA-21442
Ticari hücreler
AG05836 (RRID:CVCL_2B58)Temel Tıp Bilimleri Enstitüsü'nden Gareth John Sullivan tarafından sağlanmıştır. Oslo Üniversitesi, Norveç
Essential 8 Medium (iPSC kültür ortamı)
Essential 8 Bazal Medium Thermo Fisher ScientificA1516901
Essential 8 Takviyesi (50x) %2 (h/h)Thermo Fisher ScientificA1517101
4 &° C'de saklayın; C ve kullanmadan önce RT'ye ısıtın.
Instruments
Heracell 150i CO2 İnkübatörleriFisher Scientific, ABD
Orbital çalkalayıcılar - SSM1, SSL1Stuart Ekipmanları, İngiltere
CCD Mikroskop Kamerası Leica DFC3000 GLeica Microsystems, Almanya
Su Banyosu Jb Academy Temel Jba5 JBA5 Hibesi AletlerGrant Instruments, ABD
Sıvı aspirasyon sistemi BVC kontrolüVacuubrand, Almanya
Leica TCS SP8 STED konfokal mikroskopLeica Microsystems, Almanya
50 mL şahin tüpüSigma-AldrichCLS430828
BD LSR FortessaBD Biosciences, ABD
Flowjo Örnekleyici AnaliziFlowJo LLC, ABD
10 mL pipetSigma-AldrichSIAL1100
1, 10, 1000, 1000 mL pipetSigma-Aldrich
40 & mikro; m Cell starinerSigma-AldrichCLS431750
ultra düşük ataşman 96 oyuklu plakaS-BIOMS-9096UZ
Kontes II otomatik hücre sayacıThermo Fisher Scientific
Nöral farklılaşma ortamı  (NDM+)
DMEM/F12Yaşam teknolojileri11330032
Nörobazal ortamYaşam teknolojileri2110349
Glutamax takviyesi %1 (h/h)Yaşam teknolojileri35050
N2 takviyesi %0,5 (h/h)Yaşam teknolojileri17502-048
B27 takviyesi %1 (h/h)Hayat teknolojiler17504-044
& beta; -Merkaptoetanol 50 & mikro; MSigma-aldrichM3148
BDNF 20 ng/mLPeprotech450-02
Askorbik asit 200 ve mikro; MSigma-Aldrich A92902
4°'deki mağaza; 2 haftaya
Nöral farklılaşma ortamı eksi viatmin A (NDM-)
DMEM/F12Yaşam teknolojileri11330032
Nörobazal ortamYaşam teknolojileri2110349
Glutamax takviyesi %1 (h/h)Yaşam teknolojileri35050
N2 takviyesi %0,5 (h/ v)Yaşam teknolojileri17502-048
B27 takviyesi W/O vit. A% 1 (h / h)Yaşam teknolojileri12587010
beta; -Merkaptoetanol 50 & mikro; MSigma-aldrichM3148
Mağazası 4° 8 güne
Nöral İndüksiyon Ortamı (NIM)
DMEM/F12Yaşam teknolojileri11330032
Nakavt serum replasmanı %15 (h/h)Yaşam teknolojileri10828028
Glutamax takviyesi %1 (h/h)Yaşam teknolojileri35050
β- Merkaptoetanol 100 ve mikro; MSigma-AldrichM3148
LDN-193189 100 nMKök / Reprocell04-0074
SB431542 10 ve mikro; MTocris1614
XAV939 2 ve mikro; MSigma-AldrichX3004
mağazası 4° 10 güne
Nötralizasyon ortamı
IMDMLife teknolojileri21980032
FBS %10Sigma-Aldrich12103C
Diğer reaktifler
DPBS (Ca2+/Mg2+ içermez)Thermo Fisher Scientific14190250
Sığır Serumu AlbuminEuropa BioproductsEQBAH62-1000
AccutaseLife teknolojileriA11105-01
GeltrexLife teknolojileriA1413302
EDTALife teknolojileri15575038
İleri DMEM / F12Life teknolojileri12634010
Sinir dokusu ayrışma kitiMiltenyi biotec130-092-628
Y-27632 dihidroklorür Kaya İnhibitörüBiotechne Tocris1254
Fluoromount-G & trade; Montaj OrtamıSouthernBiotech0100-20
PFAThermo Fisher Scientific28908
kullanılan, , , , kadar C kadar C kadar C

Kaynaklar

  1. Bindoff, L. A., Birch-Machin, M., Cartlidge, N. E., Parker, W. D. Jr, Turnbull, D. M. Mitochondrial function in Parkinson's disease. The Lancet. 2 (8653), 49(1989).
  2. Gonzalez-Rodriguez, P., et al. Disruption of mitochondrial complex I induces progressive parkinsonism. Nature. 59....

Erişim kısıtlı. Bu içeriği görüntülemek için lütfen giriş yapın veya deneme sürümünü başlatın.

Yeniden basım ve izinler

Daha fazla makale keşfet

Akış SitometrisiiPSC Kaynaklı OrganoidlerMitokondriyal DisfonksiyonTek Hücre DisosiasyonuMitokondriyal KütleMRC KompleksleriTFAM BoyamasımtDNA Kopya Sayısı

Bu makale yayımlandı

Video yakında