Name: Mantar yaprakları mısır patojenlerinin neden olduğu enfeksiyonun canlı hücre görüntülemesi için müstakil mısır kılıfları (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2023-09-15T14:20:00.000+00:00
Duration: 6 min 12 s
Description: Öğrenin, mısır yaprak kılıfları kullanarak fungal patojenlerle etkileşimleri canlı hücre görüntüleme ile incelemeyi. Bu yöntem, bitki-patojen etkileşimlerinde yüksek tekrarlanabilirlik sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Yazarlar mali destekleri için USDA-NIFA'ya teşekkür eder (hibe numaraları 2018-67013-28489 ve 2020-70410-32901). Bu yazıda ifade edilen herhangi bir görüş, bulgu, sonuç veya öneri yalnızca yazarlara aittir ve ABD Tarım Bakanlığı'nın görüşlerini yansıtmayabilir. Brezilya'dan Sınır Tanımayan Bilim misafir öğrencisi Mayara de Silva'ya Şekil 6A ve Şekil 7D'de yer alan görüntüler için teşekkür ederiz. Ayrıca, Olympus konfokal mikroskoplarına erişim sağladığı için Kentucky Üniversitesi Bitki Patolojisi Bölümü'ne de teşekkür ederiz.

NOT: Yöntemin iş akışı Şekil 1'de gösterilmiştir.
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/65755/65755fig01.jpg"> Şekil 1: Ayrılmış mısır yaprağı kılıfları kullanılarak optimize edilmiş aşılama protokolündeki adımlar. Spor süspansiyon hazırlama, yaprak kılıfı aşılama ve canlı hücre mikroskobu için numune hazırlama sırasıyla yeşil (A), mor (B) ve turuncu (C) kutularda vurgulanmıştır. BioRender.com ile oluşturuldu. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65755/65755fig01large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
1. Bitki ve mantar materyali
<ol><li>Bitki büyümesi<ol><li>Serada (14 saat açık/27 °C ve 10 saat karanlık/22 °C) SC10 kaplarda mısır fideleri (Malzeme Tablosuna bakınız) yetiştirin (bkz. Malzeme Tablosu). Üç kısım ticari saksı toprağından (Malzeme Tablosuna bakınız) ve iki kısım buharla sterilize edilmiş üst topraktan oluşan bir büyüme ortamı kullanın.</li>
		<li>Fideleri sabahları her gün bir kez üstten sulama sistemi ile 2 dakika sulayın.</li>
		<li>Fideleri toprak seviyesinde keserek V2 aşamasında hasat edin. V2 büyüme aşamasına, fideler 5 ila 10 cm boyunda olduğunda ve iki görünür yakalı yaprağasahip olduğunda ulaşılır 21.</li>
		<li>Bitkileri nemli bir kağıt havluyla sarın ve daha sonraki işlemler için laboratuvara taşınmak üzere plastik bir torbaya koyun.</li>
	</ol></li>
	<li>Mantar kültürleri<ol><li>Depolanmış mantar silika stok kültürleriniaseptik koşullar altında yeniden etkinleştirin 22istila edilmiş silikanın yaklaşık 50 granülünü uygun bir agar ortamına serperek. Morfolojik değişiklikleri ve patojenite kaybını önlemek için, alt kültür suşları reaktivasyondan sonra 3x'ten fazla değildir. Patates dekstroz agar (PDA; Malzeme Tablosuna bakınız) rutin olarak C. graminicola kültüründe kullanılırken, yulaf ezmeli agar (OA; Malzeme Tablosuna bakınız) S. maydis için kullanılır.</li>
		<li>Mantar stoklarını kültürlemek için PDA'yı hazırlamak için, 500 mL deiyonize (DI) su içinde ticari olarak hazırlanmış 19.5 g susuz pda'yı askıya alın. OA yapmak için, ticari olarak hazırlanmış 36 g kurutulmuş OA'yı DI suda 15-30 dakika kaynatın, üç kat tülbentten süzün ve süzüntüyü DI su ile 500 mL'ye getirin. Sterilize etmek için otoklav ortamı.</li>
		<li>Transformant suşlarla çalışırken erimiş, soğutulmuş ortamı uygun bir antibiyotikle (örneğin, higromisin B, genetin) artırın. 500 mL ortamdaki nihai higromisin veya genetin konsantrasyonları sırasıyla 250 μg / mL ve 100 μg / mL'dir.</li>
		<li>Sporlanan bir miselyum gelişene kadar kültürleri en uygun koşullar altında inkübe edin. Colletotrichum graminicola ve S. maydis , sürekli floresan ışığı ve ortam nemi seviyeleri ile 23 ° C'de iyi büyür. Sporülasyon, S. maydis için aşılamadan (dai) 7 gün sonra veya C. graminicola için 14 dai gerçekleşir.</li>
	</ol></li>
</ol>2. Yaprak kılıfı aşılamaları
<ol><li>Camyünü filtre ünitesi montajı<ol><li>Kapağı ve 0.5 mL'lik bir mikrosantrifüj tüpünün konik tabanından yaklaşık 1.5 mm kesmek için ağır hizmet tipi makas veya makas kullanın (bkz.</li>
		<li>Şekil 0.5'de gösterildiği gibi, orta deliği kapatmak için kesilen tüpün içine bir parça cam yünü (yaklaşık 0.5 cm x 2 cm; Malzeme Tablosuna bakın) yerleştirin.</li>
		<li>Borosilikat cam tahrişe neden olabileceğinden cam yünü keserken eldiven giyin.</li>
	</ol></li>
	<li>Yaprak kılıf destek raflarının hazırlanması<ol><li>Eteksiz 96 oyuklu bir PCR plakasını (Malzeme Tablosuna bakın) Şekil 8A'da gösterildiği gibi altı adet iki sütunlu (2 x 3 oyuklu) destek rafına kesin.</li>
		<li>İki sütunlu rafları, kuyuların konik tabanları yukarı ve düz üst kısımları aşağı bakacak şekilde çevirin (Şekil 3B).</li>
		<li>Her bir desteği nemli filtre kağıdı içeren bir cam Petri plakasına yerleştirin ve kapakla kapatın (bkz. Bu ünite, kılıflar için küçük bir nem odası işlevi görür.</li>
	</ol></li>
	<li>Aşı hazırlama<ol><li>Her mantar suşu için, monte edilmiş bir cam yünü filtre ünitesini, Şekil 2'de gösterildiği gibi sağlam bir steril 1,5 mL mikrosantrifüj tüpüne yerleştirin. İkincisi, bir toplama tüpü olarak işlev görür.</li>
		<li>Tüpleri etiketleyin.</li>
		<li>Önce her bir plakayı 3-4 mL steril DI su ile doldurarak spor yapan kültürlerden conidia hasat edin. Bazı durumlarda koloni yüzeyinde bir sıvı tabakası oluşturmak için daha fazla su gerekebilir. Bu sistemde ıslatıcı maddelere gerek yoktur.</li>
		<li>Tüm plakayı eşit şekilde kazımak için steril bir konik uçlu havaneli ( Malzeme Tablosuna bakın) kullanarak agardaki sporları gevşetin.</li>
		<li>1 mL spor süspansiyonunu aseptik olarak bir cam yünü filtre ünitesine uygulayın ve sporların yerçekimi ile toplama tüpüne akmasına izin verin.</li>
		<li>Filtrelenmiş spor süspansiyonlarını içeren toplama tüplerini 3.500 x g'da 5 dakika santrifüjleyin. Sporlar, mikrosantrifüj tüpünün dibinde peletlenmelidir. NOT: C. graminicola sporlarının burada önerilenden daha yüksek hızlarda santrifüjlenmesi, önemli bir canlılık kaybına neden olur.</li>
		<li>Sıvıyı otoklavlanabilir bir kaba dökün, 1 mL steril DI su ekleyin ve peletlenmiş sporları yeniden süspanse etmek için hafifçe çalkalayın. Adım 2.3.6'daki gibi santrifüjleyin.</li>
		<li>Çimlenmeyi veya penetrasyonu azaltabilecek otomatik inhibitörler içerebilecek herhangi bir konidiyal matrisi çıkarmak için sporları 3x yıkayın.</li>
		<li>Üçüncü yıkamadan sonra, miktar tayini için sporları yeniden süspanse etmek için 300-500 μL steril DI su ekleyin.</li>
		<li>Spor konsantrasyonunu belirlemek için 100x büyütmede bileşik mikroskop altında bir hemositometre kullanın. Saymadan önce spor boyama gerekli değildir.</li>
		<li>Steril DI su ile 5 x 105 spor/mL süspansiyon hazırlayın. NOT: C. graminicola spor süspansiyonu, hızlı canlılık kaybından önce oda sıcaklığında 4 saatten fazla tutulamaz. Soğutma conidia canlılığı artırmaz.</li>
	</ol></li>
	<li>Kılıf aşıları<ol><li>Bitkileri mantar suşları ile aşılamadan önce ilgili biyogüvenlik uygulamalarını ve prosedürlerini kontrol edin.</li>
		<li>Kılıfın üst üste binen kenarı boyunca bir küçük resim geçirerek kılıfı V2 fidelerinin ilk gerçek yaprağından çıkarın ve sürgünden yavaşça gevşetin. Çıkarmaya çalışmadan önce kılıfı çekimin her iki tarafından gevşetin.</li>
		<li>Geri kazanılan yaprak kılıflarını 3-5 cm'lik parçalar halinde kesin. Aşılamadan önce kılıfların yüzeyini dezenfekte etmek gerekli değildir.</li>
		<li>İç (adaksiyal) epidermal tabakayı ortaya çıkarmak için her bir parçayı çok nazikçe açın.</li>
		<li>Kılıfları aşılama için hazırlarken, kurumasını önlemek için kalan eksize edilmiş kılıfları nemli bir kağıt havluyla sarılı tutun.</li>
		<li>Şekil 20'te gösterildiği gibi, kılıf parçasının ortasındaki iç yüzeye, doğrudan orta kaburganın üzerine 4 μL mantar sporu süspansiyonu yerleştirin.</li>
		<li>Aşılanmış yaprak kılıflarını, Şekil 5'te gösterildiği gibi nemli bir filtre kağıdı içeren bir cam Petri plakasının içindeki desteğe orta kaburga altta olacak şekilde yatay olarak yerleştirin.</li>
		<li>Her raf yedi adede kadar kılıf tutar. Numune hazırlama veya inkübasyon sırasında meydana gelebilecek kopya kaybını telafi etmek için suş başına en az beş kılıf aşılayın.</li>
		<li>Küçük nem odalarını nemli çimlenme kağıdıyla kaplı şeffaf bir saklama kutusuna yerleştirin (Malzeme Tablosuna bakın).</li>
		<li>Kutuyu kapakla örtün. Kutuyu 23 °C'de, mantara ve gözlemlenecek mantar gelişim aşamalarına bağlı olarak amaçlanan zaman boyunca sürekli aydınlatma ile inkübe edin. C. graminicola ile aşılanmış mısır kılıfları için zaman seyrinin bir özeti Tablo 1'de verilmiştir.</li>
		<li>Kılıflarda hastalık belirtileri/semptomları olup olmadığını her gün kontrol edin ve hem çimlenmeyi hem de filtre kağıtlarını nemli tutun. Yaprak kılıfları, aşılama yokluğunda belirgin bitki hücresi ölümü veya bozulması olmadan 6 güne kadar tutulabilir.</li>
	</ol></li>
</ol><img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/65755/65755fig02.jpg"> Şekil 2: Camyünü filtre ünitesinin hazırlanması. (A) Konik tabanı çıkarılmış mikrosantrifüj tüpü 1'in içine 0,5 cm x 0,5 cm'lik bir cam yünü top yerleştirilir. (İ.Ö.) Filtre tüpü daha sonra spor süspansiyon hazırlığı için monte edilmiş bir filtre ünitesi oluşturmak üzere mikrosantrifüj tüpü 2'ye yerleştirilir. BioRender.com ile oluşturuldu. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65755/65755fig02large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/65755/65755fig03.jpg"> Şekil 3: Eteksiz 96 oyuklu bir PCR plakasını kesme yöntemi. (A) PCR plakası altı destek rafına kesilmiş, 8 x 2 kuyucuk. Tek bir kılıf desteği örneği (B )'de gösterilmiştir. Yaprak kılıfları destek üzerine yatay olarak döşenir. BioRender.com ile oluşturuldu. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65755/65755fig03large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/65755/65755fig04.jpg"> Şekil 4: Kılıf aşılama yöntemi. Kılıf bölümünün adaksiyal yüzeyine doğrudan uygulanan tek damla aşılama. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65755/65755fig04large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
<img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/65755/65755fig05.jpg"> Şekil 5: Kılıf inkübasyon yöntemi. Aşılanmış yaprak kılıfları, nemlendirilmiş filtre kağıdı içeren bir cam Petri plakasının içindeki bir destek rafına yatay olarak yerleştirilir. <a href="https://www.jove.com/files/ftp_upload/65755/65755fig05large.jpg" target="_blank">Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.</a>
3. Canlı hücre mikroskobu
<ol><li>Mikroskopi için numune hazırlama<ol><li>Yapışmamış sporları veya yüzeysel mantar büyümesini gidermek için kılıf parçalarını steril DI suyla nazikçe durulayın.</li>
		<li>Kılıfı, kılıf parçasının adaksiyal (iç) yüzeyi aşağı bakacak ve abaksiyal (dış) yüzey en üstte olacak şekilde temiz bir cam mikroskop lamına ( Malzeme Tablosuna bakın) yerleştirin.</li>
		<li>Kılıf uçlarından yaklaşık 1 cm kesmek için yeni bir tek kenarlı tıraş bıçağı kullanın ( Malzeme Tablosuna bakın) ve orta damarın her iki tarafındaki lamina dokusunun çoğunu çıkarın.</li>
		<li>Abaksiyal orta damardan dokuyu tıraş etmek ve aşılanan noktanın üzerindeki adaksiyal yüzeydeki epidermal tabakayı ortaya çıkarmak için tıraş bıçağını kılıfa göre 90°'lik bir açıyla tutun. Düzgün bir kalınlık sağlamaya çalışın. Yaprak kılıfları traş edildikten sonra, numuneye zarar verebileceğinden daha fazla budamak önerilmez.</li>
		<li>Tıraşlanan bölümlerin 1 cm x 1 cm'den büyük olmamasına dikkat edin. Bu işlem sırasında kılıfın ortasına bastırmaktan kaçının. Farklı spor süspansiyonları ile aşılanmış kılıflarla çalışırken, eldivenleri dezenfekte edin ve numuneler arasında tıraş bıçağını değiştirin.</li>
		<li>Temiz bir cam mikroskop lamını hazır bulundurun. Kılıf bölümünü bir kenardan kaldırın ve dikkatlice yeni bir kızağa aktarın. Kılıfın aşılanmış (adaksiyal) yüzeyi, objektif merceğe en yakın olan en üstte olmalıdır. Mantar yapılarına zarar vermemek için bölümleri nazikçe monte edin.</li>
		<li>Bölüme 60 μL steril DI su uygulayın ve 24 mm x 60 mm'lik bir cam lamel ekleyin (bkz. Hava kabarcıklarını önlemek için bunu yavaşça yapın.</li>
		<li>Mikroskopi için hazır olduğunuzda, her bir kenara küçük bir damla koyarak ve ardından damlaları bir oje fırçasıyla birleştirerek lameli şeffaf oje ile kapatın ( Malzeme Tablosuna bakın). NOT: Bu kılıf protokolü, sitolojik boyalarla, örneğin 4',6-diamidino-2-fenilindol (DAPI), nötr kırmızı veya tripan mavisi ile veya bitki hücresi canlılığını değerlendirmek için hücre plazmolizinin gözlemlenmesi için kullanılabilir. Kılıf boyama veya hücre plazmoliz deneyleri için lamel sızdırmaz hale getirmeyin.</li>
		<li>Plazmoliz deneyleri için, lamel bir kenarına hipertonik bir çözelti (0.75 M sükroz veya 1 M sodyum klorür) ekleyin ve çözeltiyi numune boyunca lamel diğer kenarına çekmek için katlanmış tüy bırakmayan bir kağıt mendil kullanın. Boyama için, leke çözeltisini uygulamak için benzer bir yöntem kullanın.</li>
	</ol></li>
	<li>Geniş alan mikroskobu<ol><li>Yaprak kılıfları mikroskop lamlarına monte edildikten sonra, 400x büyütmede geniş alan ışık mikroskobu kullanarak mantar kolonizasyonu açısından inceleyin.</li>
		<li>Mantar yapılarını ayrıntılı olarak gözlemlemek için, numunelerin daha iyi görüntü kalitesi için yağ yerine suya daldırma objektifi kullanın. Kırılma indisi uyumsuzluğundan kaynaklanan küresel sapma görüntü bozulmasına neden olabilir. Geniş alan ışık mikroskopları ve konfokal mikroskoplar için su hedefleri mevcuttur.</li>
		<li>Kılıf başına nispi kolonizasyon miktarını belirlemek için, 100x büyütmede geniş alan ışık mikroskobu kullanarak her bir mantar penetrasyon bölgesinden istila edilen mısır hücrelerinin sayısını sayın. Bu niceleme, suşları, tedavileri ve/veya gelişim aşamalarını karşılaştıran herhangi bir istatistiksel analizden önce uygun bir tarama adımıdır.</li>
	</ol></li>
	<li>Konfokal lazer tarama mikroskobu<ol><li>Transgenik mantar suşlarının gelişimi sırasında mısır dokularındaki floresan proteinleri gözlemlemek için temel görüntü elde etme parametrelerini ayarlayın. Seçilen floresan işaretleyiciye göre en iyi uyarma/emisyon ayarlarını belirleyin. NOT: Salgılanan proteinlerle oluşturulan floresan füzyonları analiz ederken 60x su hedefi tercih edilir. Modern konfokal mikroskoplar, artefaktları ve şekil sapmalarını önlemek için yüksek oranda düzeltilmiş suya daldırma hedeflerine sahiptir.</li>
		<li>Floresan proteinlerin canlı hücre görüntülemesi amaçlanıyorsa, otofloresan için kontrol olarak dönüştürülmemiş mantar suşları kullanın. Ters konfokal mikroskopta ve mCherry floresan proteini için mantar-konak dinamiklerini yakalamak için aşağıdaki görüntü toplama parametrelerini kullanın. Lazer gücünü %5'e kadar ayarlayın, ifade seviyesine bağlı olarak 450-600 yüksek voltaj (HV), 1.375 X kazanç, %3 ofset, bölüm başına beş mısır hücresine kadar analiz için 1 optik yakınlaştırma faktörü ve bireysel hif için 2-5 optik yakınlaştırma faktörü. NOT: Yüksek çözünürlüklü Z-yığını konfokal görüntüler, üç boyutlu veriler ve konakçı ile patojen arasındaki gerçek zamanlı etkileşimlerin daha iyi bir görünümünü sağlar.</li>
		<li>Salgılanan füzyon proteinlerine karşılık gelen floresan yoğunluklarının ölçülmesi için, konfokal üreticinin görüntü analiz yazılımını veya çevrimiçi olarak ücretsiz olarak indirilebilen ImageJ gibi bir görüntü işleme programını kullanın. Floresan sinyallerinin buna göre nasıl ölçüleceğine ilişkin ayrıntılar için bir kılavuza bakın.</li>
	</ol></li>
</ol>

Mısır kılıfları ve mantarlar arasındaki hücresel etkileşimlerin görselleştirilmesi

<ol><li>Cheng, Y., Yao, J., Zhang, H., Huang, L., Kang, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cytological+and+molecular+analysis+of+nonhost+resistance+in+rice+to+wheat+powdery+mildew+and+leaf+rust+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22Protoplasma%22%5BJournal%5D)">Cytological and molecular analysis of nonhost resistance in rice to wheat powdery mildew and leaf rust pathogens.</a> Protoplasma. 252 (4), 1167-1179 (2015).</li>
<li>Hickey, E. L., Coffey, M. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+fine-structural+study+of+the+pea+downy+mildew+fungus+Peronospora+pisi+in+its+host+Pisum+sativum%5BTitle%5D)+AND+%22Canadian+Journal+of+Botany%22%5BJournal%5D)">A fine-structural study of the pea downy mildew fungus Peronospora pisi in its host Pisum sativum.</a> Canadian Journal of Botany. 55 (23), 2845-2858 (1977).</li>
<li>Wharton, P. S., Julian, A. M., O'Connell, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultrastructure+of+the+infection+of+Sorghum+bicolor+by+Colletotrichum+sublineolum%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Ultrastructure of the infection of Sorghum bicolor by Colletotrichum sublineolum.</a> Phytopathology. 91 (2), 149-158 (2001).</li>
<li>Latunde-Dada, A. O., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Infection+process+and+identity+of+the+hemibiotrophic+anthracnose+fungus+%28Colletotrichum+destructivum+O%27Gara%29+from+cowpea+%28Vigna+unguiculata+%28L%29+Walp.%29%5BTitle%5D)+AND+%22Mycological+Research%22%5BJournal%5D)">Infection process and identity of the hemibiotrophic anthracnose fungus (Colletotrichum destructivum O'Gara) from cowpea (Vigna unguiculata (L) Walp.).</a> Mycological Research. 100 (9), 1133-1141 (1996).</li>
<li>Bourett, T. M., Howard, R. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((In+vitro+development+of+penetration+structures+in+the+rice+blast+fungus+Magnaporthe+grisea%5BTitle%5D)+AND+%22Canadian+Journal+of+Botany%22%5BJournal%5D)">In vitro development of penetration structures in the rice blast fungus Magnaporthe grisea.</a> Canadian Journal of Botany. 68 (2), 329-342 (1990).</li>
<li>Sakamoto, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((On+the+new+method+of+sheath+inoculation+of+rice+plants+with+blast+fungus%2C+Pyricularia+oryzae+Cav.%2C+for+the+studying+of+the+disease-resistant+nature+of+the+plant%5BTitle%5D)+AND+%22Bulletin+of+the+Institute+for+Agricultural+Research%2C+T%C5%8Dhoku+University%22%5BJournal%5D)">On the new method of sheath inoculation of rice plants with blast fungus, Pyricularia oryzae Cav., for the studying of the disease-resistant nature of the plant.</a> Bulletin of the Institute for Agricultural Research, Tōhoku University. 1 (3), 120-129 (1949).</li>
<li>Buiate, E. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+comparative+genomic+analysis+of+putative+pathogenicity+genes+in+the+host-specific+sibling+species+Colletotrichum+graminicola+and+Colletotrichum+sublineola%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+genomics%22%5BJournal%5D)">A comparative genomic analysis of putative pathogenicity genes in the host-specific sibling species Colletotrichum graminicola and Colletotrichum sublineola.</a> BMC genomics. 18 (1), 1-24 (2017).</li>
<li>Kankanala, P., Czymmek, K., Valent, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Roles+for+rice+membrane+dynamics+and+plasmodesmata+during+biotrophic+invasion+by+the+blast+fungus%5BTitle%5D)+AND+%22The+Plant+Cell%22%5BJournal%5D)">Roles for rice membrane dynamics and plasmodesmata during biotrophic invasion by the blast fungus.</a> The Plant Cell. 19 (2), 706-724 (2007).</li>
<li>Khang, C. H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Translocation+of+Magnaporthe+oryzae+effectors+into+rice+cells+and+their+subsequent+cell-to-cell+movement%5BTitle%5D)+AND+%22The+Plant+Cell%22%5BJournal%5D)">Translocation of Magnaporthe oryzae effectors into rice cells and their subsequent cell-to-cell movement.</a> The Plant Cell. 22 (4), 1388-1403 (2010).</li>
<li>Mosquera, G., Giraldo, M. C., Khang, C. H., Coughlan, S., Valent, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interaction+transcriptome+analysis+identifies+Magnaporthe+oryzae+BAS1-4+as+biotrophy-associated+secreted+proteins+in+rice+blast+disease%5BTitle%5D)+AND+%22The+Plant+Cell%22%5BJournal%5D)">Interaction transcriptome analysis identifies Magnaporthe oryzae BAS1-4 as biotrophy-associated secreted proteins in rice blast disease.</a> The Plant Cell. 21 (4), 1273-1290 (2009).</li>
<li>Sakulkoo, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+single+fungal+MAP+kinase+controls+plant+cell-to-cell+invasion+by+the+rice+blast+fungus%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">A single fungal MAP kinase controls plant cell-to-cell invasion by the rice blast fungus.</a> Science. 359 (6382), 1399-1403 (2018).</li>
<li>Torres, M. F., Cuadros, D. F., Vaillancourt, L. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evidence+for+a+diffusible+factor+that+induces+susceptibility+in+the+Colletotrichum-maize+disease+interaction%5BTitle%5D)+AND+%22Molecular+Plant+Pathology%22%5BJournal%5D)">Evidence for a diffusible factor that induces susceptibility in the Colletotrichum-maize disease interaction.</a> Molecular Plant Pathology. 15 (1), 80-93 (2014).</li>
<li>Valent, B., Khang, C. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recent+advances+in+rice+blast+effector+research%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Opinion+in+Plant+Biology%22%5BJournal%5D)">Recent advances in rice blast effector research.</a> Current Opinion in Plant Biology. 13 (4), 434-441 (2010).</li>
<li>Mims, C. W., Vaillancourt, L. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ultrastructural+characterization+of+infection+and+colonization+of+maize+leaves+by+Colletotrichum+graminicola%2C+and+by+a+C.+graminicola+pathogenicity+mutant%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Ultrastructural characterization of infection and colonization of maize leaves by Colletotrichum graminicola, and by a C. graminicola pathogenicity mutant.</a> Phytopathology. 92 (7), 803-812 (2002).</li>
<li>Vargas, W. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Plant+defense+mechanisms+are+activated+during+biotrophic+and+necrotrophic+development+of+Colletotricum+graminicola+in+maize%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Plant defense mechanisms are activated during biotrophic and necrotrophic development of Colletotricum graminicola in maize.</a> Plant Physiology. 158 (3), 1342-1358 (2012).</li>
<li>Venard, C., Vaillancourt, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Colonization+of+fiber+cells+by+Colletotrichum+graminicola+in+wounded+maize+stalks%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Colonization of fiber cells by Colletotrichum graminicola in wounded maize stalks.</a> Phytopathology. 97 (4), 438-447 (2007).</li>
<li>Venard, C., Vaillancourt, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Penetration+and+colonization+of+unwounded+maize+tissues+by+the+maize+anthracnose+pathogen+Colletotrichum+graminicola+and+the+related+nonpathogen+C%5BTitle%5D)+AND+%22sublineolum.+Mycologia%22%5BJournal%5D)">Penetration and colonization of unwounded maize tissues by the maize anthracnose pathogen Colletotrichum graminicola and the related nonpathogen C.</a> sublineolum. Mycologia. 99 (3), 368-377 (2007).</li>
<li>Berruyer, R., Poussier, S., Kankanala, P., Mosquera, G., Valent, B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+and+qualitative+influence+of+inoculation+methods+on+in+planta+growth+of+rice+blast+fungus%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Quantitative and qualitative influence of inoculation methods on in planta growth of rice blast fungus.</a> Phytopathology. 96 (4), 346-355 (2006).</li>
<li>Belisário, R., Robertson, A. E., Vaillancourt, L. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Maize+anthracnose+stalk+rot+in+the+genomic+era%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Disease%22%5BJournal%5D)">Maize anthracnose stalk rot in the genomic era.</a> Plant Disease. 106 (9), 2281-2298 (2022).</li>
<li>Warren, H. L., Nicholson, R. L., Ullstrup, A. J., Sharvelle, E. G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Observations+of+Colletotrichum+graminicola+on+sweet+corn+in+Indiana%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Disease+Reporter%22%5BJournal%5D)">Observations of Colletotrichum graminicola on sweet corn in Indiana.</a> Plant Disease Reporter. 57, 143-144 (1973).</li>
<li>Ritchie, S. W., Hanway, J. J., Benson, G. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((How+a+corn+plant+develops%5BTitle%5D)+AND+%22Special+Report%2C+Iowa+State+University%22%5BJournal%5D)">How a corn plant develops.</a> Special Report, Iowa State University. 48, (1986).</li>
<li>Tuite, J. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aTuite%2C+J+%22Plant+pathological+methods%3A+fungi+and+bacteria%22">Plant pathological methods: fungi and bacteria</a>. , Burgess Publishing Co. (1969).</li>
<li>Wicklow, D. T., Rogers, K. D., Dowd, P. F., Gloer, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Bioactive+metabolites+from+Stenocarpella+maydis%2C+a+stalk+and+ear+rot+pathogen+of+maize%5BTitle%5D)+AND+%22Fungal+Biology%22%5BJournal%5D)">Bioactive metabolites from Stenocarpella maydis, a stalk and ear rot pathogen of maize.</a> Fungal Biology. 115 (2), 133-142 (2011).</li>
<li>Daudi, A., O'Brien, J. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Detection+of+hydrogen+peroxide+by+DAB+staining+in+Arabidopsis+leaves%5BTitle%5D)+AND+%22Bio-protocol%22%5BJournal%5D)">Detection of hydrogen peroxide by DAB staining in Arabidopsis leaves.</a> Bio-protocol. 2 (18), e263-e263 (2012).</li>
<li>Benhamou, R. I., Jaber, Q. Z., Herzog, I. M., Roichman, Y., Fridman, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescent+tracking+of+the+endoplasmic+reticulum+in+live+pathogenic+fungal+cells%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+Chemical+Biology%22%5BJournal%5D)">Fluorescent tracking of the endoplasmic reticulum in live pathogenic fungal cells.</a> ACS Chemical Biology. 13 (12), 3325-3332 (2018).</li>
<li>Lorang, J. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((fluorescent+protein+is+lighting+up+fungal+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Applied+and+Environmental+Microbiology%22%5BJournal%5D)">fluorescent protein is lighting up fungal biology.</a> Applied and Environmental Microbiology. 67 (5), 1987-1994 (2001).</li>
<li>Liu, C. Y., Zhu, J., Xie, Z. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Visualizing+yeast+organelles+with+fluorescent+protein+markers%5BTitle%5D)+AND+%22JoVE+%28Journal+of+Visualized+Experiments%29%22%5BJournal%5D)">Visualizing yeast organelles with fluorescent protein markers.</a> JoVE (Journal of Visualized Experiments). 182, e63846(2022).</li>
<li>Westermann, B., Neupert, W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mitochondria-targeted+green+fluorescent+proteins%3A+convenient+tools+for+the+study+of+organelle+biogenesis+in+Saccharomyces+cerevisiae%5BTitle%5D)+AND+%22Yeast%22%5BJournal%5D)">Mitochondria-targeted green fluorescent proteins: convenient tools for the study of organelle biogenesis in Saccharomyces cerevisiae.</a> Yeast. 16 (15), 1421-1427 (2000).</li>
<li>Lee, A. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+ER+chaperone+and+signaling+regulator+GRP78%2FBiP+as+a+monitor+of+endoplasmic+reticulum+stress%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">The ER chaperone and signaling regulator GRP78/BiP as a monitor of endoplasmic reticulum stress.</a> Methods. 35 (4), 373-381 (2005).</li>
<li>Krishnakumar, V., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+maize+database+resource+that+captures+tissue-specific+and+subcellular-localized+gene+expression%2C+via+fluorescent+tags+and+confocal+imaging+%28Maize+Cell+Genomics+Database%29%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+and+Cell+Physiology%22%5BJournal%5D)">A maize database resource that captures tissue-specific and subcellular-localized gene expression, via fluorescent tags and confocal imaging (Maize Cell Genomics Database).</a> Plant and Cell Physiology. 56 (1), e12-e12 (2015).</li>
<li>Wu, Q., Luo, A., Zadrozny, T., Sylvester, A., Jackson, D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fluorescent+protein+marker+lines+in+maize%3A+generation+and+applications%5BTitle%5D)+AND+%22International+Journal+of+Developmental+Biology%22%5BJournal%5D)">Fluorescent protein marker lines in maize: generation and applications.</a> International Journal of Developmental Biology. 57 (6-7-8), 535-543 (2013).</li>
<li>O'Connell, R. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Lifestyle+transitions+in+plant+pathogenic+Colletotrichum+fungi+deciphered+by+genome+and+transcriptome+analyses%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Genetics%22%5BJournal%5D)">Lifestyle transitions in plant pathogenic Colletotrichum fungi deciphered by genome and transcriptome analyses.</a> Nature Genetics. 44 (9), 1060-1065 (2012).</li>
<li>Torres, M. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Colletotrichum+graminicola+mutant+deficient+in+the+establishment+of+biotrophy+reveals+early+transcriptional+events+in+the+maize+anthracnose+disease+interaction%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">A Colletotrichum graminicola mutant deficient in the establishment of biotrophy reveals early transcriptional events in the maize anthracnose disease interaction.</a> BMC Genomics. 17 (202), 1-24 (2016).</li>
<li>Andrie, R. M., Martinez, J. P., Ciuffetti, L. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+ToxA+and+ToxB+promoter-driven+fluorescent+protein+expression+vectors+for+use+in+filamentous+ascomycetes%5BTitle%5D)+AND+%22Mycologia%22%5BJournal%5D)">Development of ToxA and ToxB promoter-driven fluorescent protein expression vectors for use in filamentous ascomycetes.</a> Mycologia. 97 (5), 1152-1161 (2005).</li>
<li>Gordon, C. L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glucoamylase%3A%3A+green+fluorescent+protein+fusions+to+monitor+protein+secretion+in+Aspergillus+niger%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiology%22%5BJournal%5D)">Glucoamylase:: green fluorescent protein fusions to monitor protein secretion in Aspergillus niger.</a> Microbiology. 146 (2), 415-426 (2000).</li>
<li>Koga, H., Dohi, K., Nakayachi, O., Mori, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+novel+inoculation+method+of+Magnaporthe+grisea+for+cytological+observation+of+the+infection+process+using+intact+leaf+sheaths+of+rice+plants%5BTitle%5D)+AND+%22Physiological+and+Molecular+Plant+Pathology%22%5BJournal%5D)">A novel inoculation method of Magnaporthe grisea for cytological observation of the infection process using intact leaf sheaths of rice plants.</a> Physiological and Molecular Plant Pathology. 64 (2), 67-72 (2004).</li>
<li>Xavier, K. V., Pfeiffer, T., Parreira, D. F., Chopra, S., Vaillancourt, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Aggressiveness+of+Colletotrichum+sublineola+strains+from+Sorghum+bicolor+and+S.+halepense+to+sweet+sorghum+variety+Sugar+Drip%2C+and+their+impact+on+yield%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Disease%22%5BJournal%5D)">Aggressiveness of Colletotrichum sublineola strains from Sorghum bicolor and S. halepense to sweet sorghum variety Sugar Drip, and their impact on yield.</a> Plant Disease. 101 (9), 1578-1587 (2017).</li>
</ol>

Yazarlar, rekabet eden hiçbir mali çıkarları olmadığını ve ifşa edecek hiçbir şeyleri olmadığını beyan ederler.

Burada açıklanan optimize edilmiş yaprak kılıfı aşılama yöntemi, pirinç yaprağı kılıfları6,8,36 için geliştirilmiş ve uygulanmış olan orijinal bir protokolden değiştirilmiştir. Geniş alan veya konfokal mikroskopi ile canlı bitki hücrelerinde mantar büyümesi ve gelişiminin doğrudan, ayrıntılı gözlemlerine izin verir. Protokol, mısır kolonizasyonu sırasında, uyumlu ve uyumsuz etkileşimler sırasında mantar gelişimi ve konakçı tepki...

Hücresel düzeyde mekansal ve zamansal analizler, mantar-bitki etkileşimlerinin fizyolojisini ve sitolojisini anlamak için kritik öneme sahiptir. Kimyasal olarak sabitlenmiş 1,2,3 veya temizlenmiş ve boyanmış4 yaprak dokuları ve yapay zarlar5, geçmişte yaprak patojen gelişiminin sitolojisini ve bitki-mantar etkileşimlerini araştırmak için kullanılmıştır. Bununla birlikte, canlı konakçı dokulardaki enfeksiyon olaylarının fiksasyon veya temizleme olmadan gerçek zamanlı olarak araştırılması, görüntüleme için optik olarak şeffaf örneklerin hazırlanmasıyla ilgili teknik sorunlar nedeniyle zordur.
1940'ların sonlarında, canlı pirinç epidermal hücrelerinin pirinç patlaması mantarı Magnaporthe oryza6'ya karşı direncinin parlak alan mikroskobik araştırması için müstakil bir yaprak kılıfı aşılama protokolü geliştirilmiştir. Daha yakın zamanlarda, Colletotrichum ve Magnaporthe türleri tarafından konak kolonizasyonunun ayrıntılı moleküler, fizyolojik ve sitolojik gözlemleri, bu yaprak kılıfı yönteminin modifiye edilmiş versiyonlarının floresan proteinleri eksprese eden mantar dönüştürücüleri ve epifloresan ve konfokal mikroskopi dahil olmak üzere yüksek performanslı canlı hücre görüntüleme protokolleri ile birleştirilmesiyle büyük ölçüde kolaylaştırılmıştır 7,8,9,10,11,12,13.
Bu makale, hemibiyotrofik ve nekrotrofik yaprak mantar patojenleri tarafından enfeksiyon süreçlerinin gözlemlenmesi için ayrılmış mısır yaprağı kılıfları kullanılarak optimize edilmiş bir aşılama protokolünü detaylandırmaktadır. Antraknoz yaprak yanıklığı ve sap çürüklüğünün etken maddesi olan Colletotrichum graminicola (C. graminicola) ve Diplodia yaprak yanıklığına ve sap çürümesine neden olan Stenocarpella maydis'i incelemek için özel olarak kullandık. Bununla birlikte, yöntem diğer hemibiotrofik ve nekrotrofik yaprak mantar patojenlerine uygulanabilir olmalıdır. Bu eksize edilen yaprak kılıflarında enfeksiyon ve kolonizasyon olayları sırasındaki sitolojik ve fizyolojik yanıtlar, tüm yaprak bıçaklarındakilerebenzerdir 12,14,15. Ayrıca, kılıf epidermal hücrelerinin C. graminicola tarafından hemibiyotrofik kolonizasyonu, sap öz hücrelerininkolonizasyonuna benzer 16,17. Müstakil kılıflar, mantar penetrasyonu ve kolonizasyonunun yaprak bıçaklarından veya sap özü dokularından daha fazla eşzamanlılık ve deneysel tekrarlanabilirlik gösterir14,16,17,18. Çoğu mısır çeşidi bu protokol için kullanılabilir. Bununla birlikte, kılıflarda aşırı mor pigmentlere sahip akrabalı veya melezler, pigmentler görüntülemeye müdahale ettiği için daha az uygundur. Golden Jubilee tatlı mısır, çalışmalarımız için özellikle yararlı olmuştur, çünkü işlenmemiş tohumlar ticari olarak temin edilebilir, bitkiler birçok yaprak hastalığına karşı oldukça hassastır ve serada iyi büyürler. Amerika Birleşik Devletleri'ndeki ilk antraknoz sap çürüklüğü salgınları, 1970'lerde Indiana'da tatlı mısır mahsullerinin toplam kaybına neden oldu19,20. Bu yaprak kılıfı aşılama yöntemi, canlı ve yerel olarak öldürülmüş bitki hücrelerinde mantar büyümesini ve gelişimini doğrudan gözlemlemek ve ölçmek, mantar enfeksiyonuna uyumlu/uyumsuz yanıtlarda direnç reaksiyonlarını göstermek ve aynı kılıf üzerindeki mantar suşları arasındaki etkileşimleri gerçek zamanlı olarak test etmek için uygulanabilir.

<table><tbody><tr><td>Axiocam monokrom mikroskop kamerası</td><td>ZEISS</td><td>426560-9010-000</td><td>Axioplan 2 mikroskobu ile uyumludur; canlı hücre görüntüleme için düşük okuma gürültüsü ve yüksek hız sağlar</td></tr><tr><td>Axioplan 2 epifloresan mikroskobu</td><td>ZEISS</td><td>N/A</td><td>Canlı görüntüleme ve görüntü/video çekimine izin verir&nbsp; biyolojik örneklerin&nbsp;</td></tr><tr><td>Tezgah üstü santrifüj 24 X 1,5/2 mL</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>75002431</td><td>Sorvall Legend Micro 17; maksimum hız: 13.300 rpm (17.000 x g)</td></tr><tr><td>Falcon kapaklı bakteriyolojik Petri kabı</td><td>Fisher Scientific</td><td>08-757-105</td><td>Polistiren malzeme; hidrofobik yüzey</td></tr><tr><td>Filtre kağıdı&nbsp;</td><td>Fisher Scientific</td><td>09-920-115</td><td>Petri plakası nemli odaları için Whatman grade 1</td></tr><tr><td>FV 3000 lazer taramalı konfokal mikroskop</td><td>Olympus</td><td>N/A</td><td>Mantar dönüştürücülerinin görselleştirilmesi için'&nbsp;</td></tr><tr><td>Çimlenme kağıdı</td><td>Çapa Kağıt A.Ş.</td><td>SD7615L</td><td>76 # plastik kutu nemli odalar için ağır Cam</td></tr><tr><td>Petri kapları</td><td>VWR International</td><td>75845-542</td><td>Tip 1 sınıf A, 33 genleşme borosilikat cam; komple set (kapak + alt), Petri plakası nemli odaları için</td></tr><tr><td>Cam yünü&nbsp;</td><td>Ohio Vadisi Özel Kimya&nbsp;</td><td>3350</td><td>Camyünü filtre üniteleri için</td></tr><tr><td>Hemositometre/Neubauer sayma haznesi ve kapak camı</td><td>VWR Uluslararası</td><td>15170-172</td><td>0,1 mm hazne derinliği; iki adet 0,4 mm kapak camı ile birlikte gelir</td></tr><tr><td>Mikroskop lameller</td><td>Fisher Scientific</td><td>12-553-457&nbsp;</td><td>Borosilikat cam; 100/Pk.; 22 mm uzunluk, 22 mm genişlik</td></tr><tr><td>Mısır çeşidi Golden Jubilee tohumları</td><td>West Coast Seeds Ltd., Delta, BC, Kanada</td><td>CN361</td><td>Olgunlaşır&nbsp; 95-105 gün içinde; tohum türü: F1</td></tr><tr><td>Mikrosantrifüj tüpleri & nbsp;</td><td>ABD Bilimsel&nbsp; &nbsp;</td><td>1415-2500</td><td>1.5 mL kapasiteli</td></tr><tr><td>Mikroskop lamları&nbsp;</td><td>Fisher Bilimsel</td><td>12-550-123&nbsp;</td><td>Superfrost beyaz şeritli slayt; 76 mm uzunluk, 25 mm genişlik</td></tr><tr><td>Yulaf Ezmesi Agar (OA)</td><td>VWR International</td><td>255210</td><td>Difco Yulaf Ezmesi Agar, BD; 500 g</td></tr><tr><td>Oje</td><td>Revlon</td><td>43671</td><td>Mikroskop slaytlarını sızdırmaz hale getirmek için şeffaf oje; renk 771 Şeffaf</td></tr><tr><td>Eteksiz 96 oyuklu PCR plakası</td><td>ABD Sientific</td><td>1402-9500</td><td>100 uL plaka hacmi</td></tr><tr><td>Mikrosantrifüj tüpleri için havaneli</td><td>ABD Bilimsel&nbsp;</td><td>1415-5390</td><td>Konik uç; polipropilen malzeme</td></tr><tr><td>PlanApo 60X/1,00 WLSM su hedefi&nbsp;</td><td>Olympus</td><td>1-UB933</td><td>Olympus FV 3000 konfokal mikroskop ile uyumlu</td></tr><tr><td>Patates Dekstroz Agar (PDA)</td><td>VWR International</td><td>90000-758</td><td>Difco Patates Dekstroz Medyası, BD; 500 g</td></tr><tr><td>Pro-Mix BX</td><td>Premium Bahçe Bitkileri Tedarik A.Ş.</td><td>N/A</td><td>Aşağıdakileri sağlamak üzere formüle edilmiş birinci sınıf genel amaçlı yetiştirme ortamı a&nbsp; su tutma ve uygun drenaj dengesi</td></tr><tr><td>SC10 konik tutucular&nbsp;</td><td>Sera Megastore&nbsp;</td><td>CN-SS-SC-10B</td><td>1.5 inç çapında, 8.25 inç derinliğinde ve 164 mL hacimli</td></tr><tr><td>SC10 konik tutucu tepsi</td><td>Sera Megastore&nbsp;</td><td>CN-SS-SCTR98</td><td>24 inç uzunluk x 12 inç genişlik x 6,75 inç yükseklik; 98 adede kadar SC10 koni tutucu tutar</td></tr><tr><td>Tek kenarlı tıraş bıçağı</td><td>Thermo Fisher Scientific</td><td>17-989-145</td><td>AccuTec bıçak; çelik malzeme; 38 mm uzunlukta bıçak</td></tr><tr><td>Mandallı saklama kapları/kutuları</td><td>Hedef</td><td>002-02-0405</td><td>Nemli hazne için net görüşlü saklama kutuları; dış boyutlar: 23 5/8 inç x 16 3/8 inç x 6 1/2 inç; 32 qt. kapasite</td></tr></tbody></table>

mantar yaprakları mısır patojenlerinin neden olduğu enfeksiyonun canlı hücre görüntülemesi için müstakil mısır kılıfları

Detached Maize Sheaths for Live-Cell Imaging of Infection by Fungal Foliar Maize Pathogens

Mısır yaprağı kılıflarını hemibiotrofik ve nekrotrofik yaprak patojenik mantarlarla aşılamak için bir protokolü optimize ettik. Yöntem, orijinal olarak pirinç yaprağı kılıflarına uygulanandan modifiye edilmiştir ve canlı bitki hücrelerinde mantar büyümesi ve gelişiminin doğrudan mikroskobik gözlemine izin verir. İki adet tam yaprak boğazı ile mısır fidelerinden toplanan yaprak kılıfları, 20 μL damla 5 x 105 spor/mL mantar sporu süspansiyonu ile aşılanır ve sürekli floresan ışık altında 23 °C'de nem odalarında inkübe edilir. 24-72 saat sonra, kimyasal fiksasyon veya temizleme gerektirmeden doğrudan görüntülenebilen optik olarak berrak bir numune olan tek bir epidermal hücre tabakası bırakmak için fazla doku bir tıraş bıçağıyla çıkarılır. Bitki ve mantar hücreleri deney süresince canlı kalır ve etkileşimler gerçek zamanlı olarak görselleştirilebilir. Kılıflar, enfeksiyon ve kolonizasyon sırasında konakçı ve patojen hücrelerin gelişimsel sitolojisini ve canlılığını incelemek için boyanabilir veya plazmolize tabi tutulabilir. Floresan proteinleri eksprese etmek için dönüştürülen mantar suşları, daha fazla çözünürlük için ve rekabetçi veya sinerjik etkileşimlerin değerlendirilmesini kolaylaştırmak için kılıflar üzerine aşılanabilir veya birlikte aşılanabilir. Floresan füzyon proteinlerini eksprese eden mantar suşları, plantadaki bu bireysel proteinlerin üretimini ve hedeflenmesini izlemek ve ölçmek için kullanılabilir. Aşılanmış kılıf dokuları, nükleik asitleri, proteinleri veya metabolitleri karakterize etmek için ekstrakte edilebilir. Bu kılıf tahlillerinin kullanımı, mısırda mantar patojenitesi mekanizmalarının ve ayrıca patojeniteye katkıda bulunan mantar protein efektörlerinin ve ikincil metabolitlerin ayrıntılı çalışmalarını büyük ölçüde ilerletmiştir.

Aşağıdaki örnekler, mısır yaprağı kılıfı aşılama yönteminin kullanılmasını takiben temsili sonuçları açıklamaktadır. Bu örnekler, bu optimize edilmiş tahlil ile mısır-mantar etkileşimlerinin gözlemlenmesi ve karşılaştırılmasının gerçek zamanlı olarak gerçekleştirilebileceği kolaylık, hız ve hassasiyeti göstermektedir. Canlı hücre görüntüleme ayrıca nicel bilgilerin çıkarılmasına izin vererek karşılaştırmalı moleküler, sitolojik ve fizyolojik çalışmalar için yararlı bir araç sağlar. Her başarılı başvuru için atıfta bulunu...

Bu makale, mantar bitki patojenleri ile mısır etkileşimlerinin tekrarlanabilir sitolojik, fizyolojik ve moleküler çalışmaları için ayrılmış mısır yaprağı kılıflarını kullanan optimize edilmiş bir aşılama protokolünü detaylandırmaktadır. Yaprak kılıfları, sabitlenmemiş dokularda canlı bitki ve mantar arasındaki hücresel etkileşimlerin gerçek zamanlı gözlemini kolaylaştırır.

Mantar yaprakları mısır patojenlerinin neden olduğu enfeksiyonun canlı hücre görüntülemesi için müstakil mısır kılıfları

We have optimized a protocol to inoculate maize leaf sheaths with hemibiotrophic and necrotrophic foliar pathogenic fungi. The method is modified from one ...

Bu nedenle ekibimiz, hastalık yönetimini iyileştirmek için bitkilerdeki mantar patojenite mekanizmalarını anlamayı amaçlamaktadır. Şu anda mısır otokton mantarının, temizlik işlevinin ötesinde protein salgısını nasıl düzenlediğini araştırıyoruz. Protokolümüz, mantar kolonizasyonunun replikasyonları ve tekrarlanabilirliği arasında yüksek eşzamanlılık göstermektedir.Ayrıca, tahlillerimizle, numuneleri gerçek zamanlı olarak görüntülemeden önce temizlemeye veya sabitlemeye gerek yoktur. Yöntem, bitki-patojen etkileşimlerinde çeşitli uygulamalar sunar ve mısırda mantar patojenite mekanizmaları ve karşılaştırmalı genomik analiz üzerine ayrıntılı çalışmalara katkıda bulunmuştur.

detached-maize-sheaths-for-live-cell-imaging-infection-fungal-foliar

Research

JoVE Journal

Biology

Biyoloji

Bitki defensins patojenlere karşı bitki savunmasında önemli bir rol oynamaktadır. Etkili eylem (MOA) onların mod anlama antifungal ajanları olarak antifungal Bu peptidler kullanımı önemlidir için. Burada, Bu peptidler MOA kritik yönlerini incelemek için canlı hücre görüntüleme yöntemi açıklanmıştır.

Canlı hücre görüntüleme modları giriş ve Antifungal bitki Defensins hücre altı yerelleştirme araştırmak için mantar hücrelerinin

Tilki kuyruğu mozaik virüsünün ve şeker kamışı mozaik virüslerinin mısır fidelerine aşılanması için Agrobacterium bazlı enjeksiyon (agroinjection) protokolü sunulmaktadır. Bu şekilde aşılama viral enfeksiyona, belirteç genlerinin virüs kaynaklı gen susturmalarına ve GFP'nin viral aşırı ekspresyonuna yol açar.

Rekombinant Foxtail Mozaik Virüs ve Şeker Kamışı Mozaik Virüs Bulaşıcı Klonlar ile Enjeksiyon ile Mısır Fidelerinin Doğrudan Agroinokokülasyonu

Bu, minimum reaktifler ve ortak laboratuvar ekipmanı (temel bir akıllı telefon dahil) kullanan bir arpa yaprağı kılıfı testinin basit bir protokolüdür. Amaç, gelişmiş mikroskopi ekipmanlarına erişimi olmayan laboratuvarlarda patlama hastalığının erken enfeksiyon sürecini görselleştirmektir.

Pirinç Patlaması Hastalığının (Magnaporthe oryzae) Erken Enfeksiyon Bölgelerinin Arpa (Hordeum vulgare) Üzerinde Temel Bir Mikroskop ve Akıllı Telefon Kullanarak Görselleştirilmesi

Mısır yaprağı primordiaları derinlemesine kaplanır ve yuvarlanır, bu da onları incelemeyi zorlaştırır. Burada, floresan ve konfokal görüntüleme için enine kesitler ve açılmış mısır yaprağı primordialarının bütün montajlarını hazırlamak için yöntemler sunuyoruz.

Enine kesitler hazırlamak için geliştirilmiş yöntemler ve floresan ve konfokal görüntüleme için mısır yaprağı primordiasının bütün montajlarını açma

Erkek mısır meyositlerindeki bu immünolokalizasyon protokolü, meyoz sırasında hücrelerin üç boyutlu bütünlüğünü korur. Bu yöntem, korunmuş paraformaldehit sabit materyalde üç bağımsız antikorun hücre içi lokalizasyonunun dinamik izlenmesine olanak tanır; ayrıca DNA boyayan DAPI'ye ek olarak.

Mısır Meiositlerinde Üç Boyutlu İmmünolokalizasyon

Floresan etiketli otofaji belirteçlerin zaman atlamalı mikroskopi yüksek temporal çözünürlük ile dinamik otofaji yanıt izleme sağlar. 3 farklı renklerin bir kombinasyonu belirli Otofaji ve organel belirteçleri kullanarak, güçlü bir mekansal ve zamansal bağlamda autophagosome oluşumuna bir protein katkısı takip edebilir.

Erken Otofaji Etkinlikler Hücre Görüntüleme Canlı: Omegasomes ve Ötesi

Hematopoietik kök ve projenitör hücreler (HSPCs) ve kemik iliği niş arasındaki etkileşimin doğası tam olarak anlaşılamamıştır. Özel donanım modifikasyonları ve çok adımlı bir satın alma protokolü ex vivo görüntünün kemik iliği alanları içinde bağlantılı etiketli HSPCs, izleme etkileşimleri ve hareket için iki-foton ve konfokal mikroskopi kullanımına izin verir.

Yetişkin Fare Kalvaryal Kemik İliği içinde Hematopoietik kök hücrelerin Vivo 4-Boyutlu Takip

Penicillium chrysogenum'da açlık pedleri (merkezi bir boşluk içeren bir mikroskop lamında agaroz ve musluk suyu karışımları) kullanarak otofajiyi incelemek için uygun ve güçlü bir yöntem burada sunulmaktadır.

Otofaji Analiz<em&gt; Penicillium chrysogenum</em&gt; Floresan Mikroskopi ile Kombinasyon Açlık Pedleri kullanarak

Lateral Kök İndüklenebilir Sistemi (LRIS), lateral köklerin senkron indüksiyonuna izin verir ve Arabidopsis thaliana ve mısır için sunulmuştur.

Lateral Kök İndüklenebilir Sistemi<em&gt; Arabidopsis</em&gt; Ve Mısır

Sosyal amip Dictyostelium discoideum, yakın zamanda protein yanlış katlanması ve proteostazı incelemek için bir sistem olarak kurulmuştur. Burada, D. discoideum'da sıcaklığa bağlı protein agregasyonunu ve hücresel stres tepkisini incelemek için yeni bir görüntüleme tabanlı metodoloji açıklıyoruz.

Protein Kalite Kontrol Sistemi incelenmesi<em&gt; D. diskodeyum</em&gt; Sıcaklık kontrollü Canlı Hücre Görüntüleme kullanarak

Öğrenin, mısır yaprak kılıfları kullanarak fungal patojenlerle etkileşimleri canlı hücre görüntüleme ile incelemeyi. Bu yöntem, bitki-patojen etkileşimlerinde yüksek tekrarlanabilirlik sağlar.

Mantar yaprakları mısır patojenlerinin neden olduğu enfeksiyonun canlı hücre görüntülemesi için müstakil mısır kılıfları

Daha fazla video keşfet